Death caused by covid-19 in top ten countries in Asia affected by covid-19 pandemic with special reference to Pakistan / Morte causada por covid-19 nos dez principais países da Ásia afetados pela pandemia de covid-19, com referência especial ao Paquistão

The COVID-19 is a contagious viral disease, was first emerged in Wuhan, China in December 2019 and became the whole world on alert. The mortality rate in top most countries in Asia with special reference to Pakistan has been focused. Since February 26 to September 2020 the total confirmed cases and mortality rate was measured through Wikipedia and the notable journals. Iran is the only country having highest number of deaths (5.73%) followed by Indonesia (3.77%) while Saudi Arabia shows the lowest number of deaths as 1.39%. In Pakistan the first case was confirmed in 26th February, 2020. The nCov-19 has closely related to severe acute respiratory syndrome (SARS) hence SARS COV-2 was named. This virus is responsible for more than 33.9 million deaths in over all the world as of 20th September, 2020. The number of new cases is increasing time to time. Sindh province of Pakistan has reported the highest number of cases till September, 20, 2020 as compared to other parts of the country and has the highest number of death followed by Khyber Pakhtunkhwa. Because of the person to person contact the disease is spreading rapidly. The individuals who has already infected with other diseases like cancer or diabetic etc. are vulnerable. The nCOV-19 is the most contagious due to its mode of transmission. There is still no vaccine is available for the treatment of disease caused by nCoV-2019. It is therefore the only option to control this pandemic is to adopt effective preventive measures.

A covid-19 é uma doença viral contagiosa, que surgiu pela primeira vez em Wuhan, China, em dezembro de 2019, e deixou o mundo todo em alerta. A taxa de mortalidade na maioria dos principais países da Ásia, com referência especial ao Paquistão, foi enfocada. De 26 de fevereiro a setembro de 2020, o total de casos confirmados e a taxa de mortalidade foram medidos por meio da Wikipedia e de periódicos notáveis. O Irã é o único país com maior número de mortes (5,73%), seguido pela Indonésia (3,77%), enquanto a Arábia Saudita mostra o menor número de mortes, 1,39%. No Paquistão, o primeiro caso foi confirmado em 26 de fevereiro de 2020. O nCov-19 está intimamente relacionado à síndrome respiratória aguda grave (SARS), daí o nome SARS COV-2. Esse vírus é responsável por mais de 33,9 milhões de mortes em todo o mundo em 20 de setembro de 2020. O número de novos casos está aumentando de tempos em tempos. A província de Sindh, no Paquistão, registrou o maior número de casos até 20 de setembro de 2020, em comparação com outras partes do país, e tem o maior número de mortes, seguida por Khyber Pakhtunkhwa. Por causa do contato pessoa a pessoa, a doença está se espalhando rapidamente. Indivíduos que já foram diagnosticados com outras doenças, como câncer ou diabetes, etc. são mais vulneráveis. O nCOV-19 é o mais contagioso devido ao seu modo de transmissão. Ainda não há vacina disponível para o tratamento da doença causada pelo nCoV-2019. Portanto, a única opção para controlar essa pandemia é a adoção de medidas preventivas eficazes.

Death caused by covid-19 in top ten countries in Asia affected by covid-19 pandemic with special reference to Pakistan / Morte causada por covid-19 nos dez principais países da Ásia afetados pela pandemia de covid-19, com referência especial ao Paquistão

The COVID-19 is a contagious viral disease, was first emerged in Wuhan, China in December 2019 and became the whole world on alert. The mortality rate in top most countries in Asia with special reference to Pakistan has been focused. Since February 26 to September 2020 the total confirmed cases and mortality rate was measured through Wikipedia and the notable journals. Iran is the only country having highest number of deaths (5.73%) followed by Indonesia (3.77%) while Saudi Arabia shows the lowest number of deaths as 1.39%. In Pakistan the first case was confirmed in 26th February, 2020. The nCov-19 has closely related to severe acute respiratory syndrome (SARS) hence SARS COV-2 was named. This virus is responsible for more than 33.9 million deaths in over all the world as of 20th September, 2020. The number of new cases is increasing time to time. Sindh province of Pakistan has reported the highest number of cases till September, 20, 2020 as compared to other parts of the country and has the highest number of death followed by Khyber Pakhtunkhwa. Because of the person to person contact the disease is spreading rapidly. The individuals who has already infected with other diseases like cancer or diabetic etc. are vulnerable. The nCOV-19 is the most contagious due to its mode of transmission. There is still no vaccine is available for the treatment of disease caused by nCoV-2019. It is therefore the only option to control this pandemic is to adopt effective preventive measures.(AU)

A covid-19 é uma doença viral contagiosa, que surgiu pela primeira vez em Wuhan, China, em dezembro de 2019, e deixou o mundo todo em alerta. A taxa de mortalidade na maioria dos principais países da Ásia, com referência especial ao Paquistão, foi enfocada. De 26 de fevereiro a setembro de 2020, o total de casos confirmados e a taxa de mortalidade foram medidos por meio da Wikipedia e de periódicos notáveis. O Irã é o único país com maior número de mortes (5,73%), seguido pela Indonésia (3,77%), enquanto a Arábia Saudita mostra o menor número de mortes, 1,39%. No Paquistão, o primeiro caso foi confirmado em 26 de fevereiro de 2020. O nCov-19 está intimamente relacionado à síndrome respiratória aguda grave (SARS), daí o nome SARS COV-2. Esse vírus é responsável por mais de 33,9 milhões de mortes em todo o mundo em 20 de setembro de 2020. O número de novos casos está aumentando de tempos em tempos. A província de Sindh, no Paquistão, registrou o maior número de casos até 20 de setembro de 2020, em comparação com outras partes do país, e tem o maior número de mortes, seguida por Khyber Pakhtunkhwa. Por causa do contato pessoa a pessoa, a doença está se espalhando rapidamente. Indivíduos que já foram diagnosticados com outras doenças, como câncer ou diabetes, etc. são mais vulneráveis. O nCOV-19 é o mais contagioso devido ao seu modo de transmissão. Ainda não há vacina disponível para o tratamento da doença causada pelo nCoV-2019. Portanto, a única opção para controlar essa pandemia é a adoção de medidas preventivas eficazes.(AU)

Gender-based incidence, recovery period, and mortality rate of COVID-19 among the population of district Attock, Pakistan / Incidência baseada em gênero, período de recuperação e taxa de mortalidade de COVID-19 entre a população do distrito de Attock, Paquistão

COVID-19 is reported as an extremely contagious disease with common symptoms of fever, dry cough, sore throat, and tiredness. The published literature on incidence and gender-wise prevalence of COVID-19 is scarce in Pakistan. Therefore, the present study was designed to compare the distribution, incubation period and mortality rate of COVID-19 among the male and female population of district Attock. The data were collected between 01 April 2020 and 07 December 2020 from the population of district Attock, Pakistan. A total of 22,962 individuals were screened and 843 were found positive for RT-qPCR for SARS-CoV-2. The confirmed positive cases were monitored carefully. Among the positive cases, the incidence of COVID-19 was 61.7% among males and 38.2% among females. The average recovery period of males was 18.89±7.75 days and females were 19±8.40 days from SARS-CoV-2. The overall mortality rate was 8.06%. The death rate of male patients was significantly higher (P<0.05) compared to female patients. Also, the mortality rate was higher (P<0.05) in male patients of 40-60 years of age compared to female patients of the same age group. Moreover, the mortality rate significantly increased (P<0.05) with the increase of age irrespective of gender. In conclusion, the incidence and mortality rate of COVID-19 is higher in males compared to the female population. Moreover, irrespective of gender the mortality rate was significantly lower among patients aged <40 years.

Covid-19 é relatada como uma doença extremamente contagiosa com sintomas comuns de febre, tosse seca, dor de garganta e cansaço. A literatura publicada sobre incidência e prevalência de Covid-19 com base no gênero é escassa no Paquistão. Portanto, o presente estudo teve como objetivo comparar a distribuição, o período de incubação e a taxa de mortalidade de Covid-19 entre a população masculina e feminina do distrito de Attock. Os dados foram coletados entre 1 de abril de 2020 e 7 de dezembro de 2020 da população do distrito de Attock, Paquistão. Um total de 22.962 indivíduos foi selecionado, e 843 foram considerados positivos para RT-qPCR para SARS-CoV-2. Os casos positivos confirmados foram monitorados cuidadosamente. Entre os casos positivos, a incidência de Covid-19 foi de 61,7% no sexo masculino e 38,2% no feminino. O período médio de recuperação dos homens foi de 18,89 ± 7,75 dias e das mulheres 19 ± 8,40 dias do SARS-CoV-2. A mortalidade geral foi de 8,06%. A taxa de mortalidade de pacientes do sexo masculino foi significativamente maior (P < 0,05) em comparação com pacientes do sexo feminino. Além disso, a taxa de mortalidade foi maior (P < 0,05) em pacientes do sexo masculino com 40-60 anos de idade em comparação com pacientes do sexo feminino da mesma faixa etária. Além disso, a taxa de mortalidade aumentou significativamente (P < 0,05) com o aumento da idade, independentemente do sexo. Em conclusão, a incidência e a taxa de mortalidade de Covid-19 são maiores no sexo masculino em comparação com a população feminina. E também, independentemente do sexo, a taxa de mortalidade foi significativamente menor entre os pacientes com idade < 40 anos.

Gender-based incidence, recovery period, and mortality rate of COVID-19 among the population of district Attock, Pakistan / Incidência baseada em gênero, período de recuperação e taxa de mortalidade de COVID-19 entre a população do distrito de Attock, Paquistão

COVID-19 is reported as an extremely contagious disease with common symptoms of fever, dry cough, sore throat, and tiredness. The published literature on incidence and gender-wise prevalence of COVID-19 is scarce in Pakistan. Therefore, the present study was designed to compare the distribution, incubation period and mortality rate of COVID-19 among the male and female population of district Attock. The data were collected between 01 April 2020 and 07 December 2020 from the population of district Attock, Pakistan. A total of 22,962 individuals were screened and 843 were found positive for RT-qPCR for SARS-CoV-2. The confirmed positive cases were monitored carefully. Among the positive cases, the incidence of COVID-19 was 61.7% among males and 38.2% among females. The average recovery period of males was 18.89±7.75 days and females were 19±8.40 days from SARS-CoV-2. The overall mortality rate was 8.06%. The death rate of male patients was significantly higher (P<0.05) compared to female patients. Also, the mortality rate was higher (P<0.05) in male patients of 40-60 years of age compared to female patients of the same age group. Moreover, the mortality rate significantly increased (P<0.05) with the increase of age irrespective of gender. In conclusion, the incidence and mortality rate of COVID-19 is higher in males compared to the female population. Moreover, irrespective of gender the mortality rate was significantly lower among patients aged <40 years.(AU)

Covid-19 é relatada como uma doença extremamente contagiosa com sintomas comuns de febre, tosse seca, dor de garganta e cansaço. A literatura publicada sobre incidência e prevalência de Covid-19 com base no gênero é escassa no Paquistão. Portanto, o presente estudo teve como objetivo comparar a distribuição, o período de incubação e a taxa de mortalidade de Covid-19 entre a população masculina e feminina do distrito de Attock. Os dados foram coletados entre 1 de abril de 2020 e 7 de dezembro de 2020 da população do distrito de Attock, Paquistão. Um total de 22.962 indivíduos foi selecionado, e 843 foram considerados positivos para RT-qPCR para SARS-CoV-2. Os casos positivos confirmados foram monitorados cuidadosamente. Entre os casos positivos, a incidência de Covid-19 foi de 61,7% no sexo masculino e 38,2% no feminino. O período médio de recuperação dos homens foi de 18,89 ± 7,75 dias e das mulheres 19 ± 8,40 dias do SARS-CoV-2. A mortalidade geral foi de 8,06%. A taxa de mortalidade de pacientes do sexo masculino foi significativamente maior (P < 0,05) em comparação com pacientes do sexo feminino. Além disso, a taxa de mortalidade foi maior (P < 0,05) em pacientes do sexo masculino com 40-60 anos de idade em comparação com pacientes do sexo feminino da mesma faixa etária. Além disso, a taxa de mortalidade aumentou significativamente (P < 0,05) com o aumento da idade, independentemente do sexo. Em conclusão, a incidência e a taxa de mortalidade de Covid-19 são maiores no sexo masculino em comparação com a população feminina. E também, independentemente do sexo, a taxa de mortalidade foi significativamente menor entre os pacientes com idade < 40 anos.(AU)

Taurine promotes axonal sprouting via Shh-mediated mitochondrial improvement in stroke

Purpose: Motor function is restored by axonal sprouting in ischemic stroke. Mitochondria play a crucial role in axonal sprouting. Taurine (TAU) is known to protect the brain against experimental stroke, but its role in axonal sprouting and the underlying mechanism are unclear. Methods: We evaluated the motor function of stroke mice using the rotarod test on days 7, 14, and 28. Immunocytochemistry with biotinylated dextran amine was used to detect axonal sprouting. We observed neurite outgrowth and cell apoptosis in cortical neurons under oxygen and glucose deprivation (OGD), respectively. Furthermore, we evaluated the mitochondrial function, adenosine triphosphate (ATP), mitochondrial DNA (mtDNA), peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha (PCG-1α), transcription factor A of mitochondria (TFAM), protein patched homolog 1 (PTCH1), and cellular myelocytomatosis oncogene (c-Myc). Results: TAU recovered the motor function and promoted axonal sprouting in ischemic mice. TAU restored the neuritogenesis ability of cortical neurons and reduced OGD-induced cell apoptosis. TAU also reduced reactive oxygen species, stabilized mitochondrial membrane potential, enhanced ATP and mtDNA content, increased the levels of PGC-1α, and TFAM, and restored the impaired levels of PTCH1, and c-Myc. Furthermore, these TAU-related effects could be blocked using an Shh inhibitor (cyclopamine). Conclusion: Taurine promoted axonal sprouting via Shh-mediated mitochondrial improvement in ischemic stroke.

Gender-based incidence, recovery period, and mortality rate of COVID-19 among the population of district Attock, Pakistan / Incidência baseada em gênero, período de recuperação e taxa de mortalidade de COVID-19 entre a população do distrito de Attock, Paquistão

Abstract COVID-19 is reported as an extremely contagious disease with common symptoms of fever, dry cough, sore throat, and tiredness. The published literature on incidence and gender-wise prevalence of COVID-19 is scarce in Pakistan. Therefore, the present study was designed to compare the distribution, incubation period and mortality rate of COVID-19 among the male and female population of district Attock. The data were collected between 01 April 2020 and 07 December 2020 from the population of district Attock, Pakistan. A total of 22,962 individuals were screened and 843 were found positive for RT-qPCR for SARS-CoV-2. The confirmed positive cases were monitored carefully. Among the positive cases, the incidence of COVID-19 was 61.7% among males and 38.2% among females. The average recovery period of males was 18.89±7.75 days and females were 19±8.40 days from SARS-CoV-2. The overall mortality rate was 8.06%. The death rate of male patients was significantly higher (P<0.05) compared to female patients. Also, the mortality rate was higher (P<0.05) in male patients of 40-60 years of age compared to female patients of the same age group. Moreover, the mortality rate significantly increased (P<0.05) with the increase of age irrespective of gender. In conclusion, the incidence and mortality rate of COVID-19 is higher in males compared to the female population. Moreover, irrespective of gender the mortality rate was significantly lower among patients aged <40 years.

Resumo Covid-19 é relatada como uma doença extremamente contagiosa com sintomas comuns de febre, tosse seca, dor de garganta e cansaço. A literatura publicada sobre incidência e prevalência de Covid-19 com base no gênero é escassa no Paquistão. Portanto, o presente estudo teve como objetivo comparar a distribuição, o período de incubação e a taxa de mortalidade de Covid-19 entre a população masculina e feminina do distrito de Attock. Os dados foram coletados entre 1 de abril de 2020 e 7 de dezembro de 2020 da população do distrito de Attock, Paquistão. Um total de 22.962 indivíduos foi selecionado, e 843 foram considerados positivos para RT-qPCR para SARS-CoV-2. Os casos positivos confirmados foram monitorados cuidadosamente. Entre os casos positivos, a incidência de Covid-19 foi de 61,7% no sexo masculino e 38,2% no feminino. O período médio de recuperação dos homens foi de 18,89 ± 7,75 dias e das mulheres 19 ± 8,40 dias do SARS-CoV-2. A mortalidade geral foi de 8,06%. A taxa de mortalidade de pacientes do sexo masculino foi significativamente maior (P < 0,05) em comparação com pacientes do sexo feminino. Além disso, a taxa de mortalidade foi maior (P < 0,05) em pacientes do sexo masculino com 40-60 anos de idade em comparação com pacientes do sexo feminino da mesma faixa etária. Além disso, a taxa de mortalidade aumentou significativamente (P < 0,05) com o aumento da idade, independentemente do sexo. Em conclusão, a incidência e a taxa de mortalidade de Covid-19 são maiores no sexo masculino em comparação com a população feminina. E também, independentemente do sexo, a taxa de mortalidade foi significativamente menor entre os pacientes com idade < 40 anos.

A threefold approach including quantum chemical, molecular docking and molecular dynamic studies to explore the natural compounds from Centaurea jacea as the potential inhibitors for COVID-19 / Uma abordagem tríplice incluindo química quântica, docking molecular e estudos dinâmicos moleculares para explorar os compostos naturais de Centaurea jacea como inibidores potenciais para Covid-19

Abstract In the current report, we studied the possible inhibitors of COVID-19 from bioactive constituents of Centaurea jacea using a threefold approach consisting of quantum chemical, molecular docking and molecular dynamic techniques. Centaurea jacea is a perennial herb often used in folk medicines of dermatological complaints and fever. Moreover, anticancer, antioxidant, antibacterial and antiviral properties of its bioactive compounds are also reported. The Mpro (Main proteases) was docked with different compounds of Centaurea jacea through molecular docking. All the studied compounds including apigenin, axillarin, Centaureidin, Cirsiliol, Eupatorin and Isokaempferide, show suitable binding affinities to the binding site of SARS-CoV-2 main protease with their binding energies -6.7 kcal/mol, -7.4 kcal/mol, -7.0 kcal/mol, -5.8 kcal/mol, -6.2 kcal/mol and -6.8 kcal/mol, respectively. Among all studied compounds, axillarin was found to have maximum inhibitor efficiency followed by Centaureidin, Isokaempferide, Apigenin, Eupatorin and Cirsiliol. Our results suggested that axillarin binds with the most crucial catalytic residues CYS145 and HIS41 of the Mpro, moreover axillarin shows 5 hydrogen bond interactions and 5 hydrophobic interactions with various residues of Mpro. Furthermore, the molecular dynamic calculations over 60 ns (6×106 femtosecond) time scale also shown significant insights into the binding effects of axillarin with Mpro of SARS-CoV-2 by imitating protein like aqueous environment. From molecular dynamic calculations, the RMSD and RMSF computations indicate the stability and dynamics of the best docked complex in aqueous environment. The ADME properties and toxicity prediction analysis of axillarin also recommended it as safe drug candidate. Further, in vivo and in vitro investigations are essential to ensure the anti SARS-CoV-2 activity of all bioactive compounds particularly axillarin to encourage preventive use of Centaurea jacea against COVID-19 infections.

Resumo No presente relatório, estudamos os possíveis inibidores de Covid-19 de constituintes bioativos de Centaurea jacea usando uma abordagem tripla que consiste em técnicas de química quântica, docking molecular e dinâmica molecular. Centaurea jacea é uma erva perene frequentemente usada em remédios populares de doenças dermatológicas e febre. Além disso, as propriedades anticâncer, antioxidante, antibacteriana e antiviral de seus compostos bioativos também são relatadas. A Mpro (proteases principais) foi acoplada a diferentes compostos de Centaurea jacea por meio de docking molecular. Todos os compostos estudados, incluindo apigenina, axilarina, Centaureidina, Cirsiliol, Eupatorina e Isokaempferide, mostram afinidades de ligação adequadas ao sítio de ligação da protease principal SARS-CoV-2 com suas energias de ligação -6,7 kcal / mol, -7,4 kcal / mol, - 7,0 kcal / mol, -5,8 kcal / mol, -6,2 kcal / mol e -6,8 kcal / mol, respectivamente. Dentre todos os compostos estudados, a axilarina apresentou eficiência máxima de inibidor, seguida pela Centaureidina, Isokaempferida, Apigenina, Eupatorina e Cirsiliol. Nossos resultados sugeriram que a axilarina se liga aos resíduos catalíticos mais cruciais CYS145 e HIS41 do Mpro, além disso a axilarina mostra 5 interações de ligações de hidrogênio e 5 interações hidrofóbicas com vários resíduos de Mpro. Além disso, os cálculos de dinâmica molecular em uma escala de tempo de 60 ns (6 × 106 femtossegundos) também mostraram percepções significativas sobre os efeitos de ligação da axilarina com Mpro de SARS-CoV-2 por imitação de proteínas como o ambiente aquoso. A partir de cálculos de dinâmica molecular, os cálculos RMSD e RMSF indicam a estabilidade e dinâmica do melhor complexo ancorado em ambiente aquoso. As propriedades ADME e a análise de previsão de toxicidade da axilarina também a recomendaram como um candidato a medicamento seguro. Além disso, as investigações in vivo e in vitro são essenciais para garantir a atividade anti-SARS-CoV-2 de todos os compostos bioativos, particularmente a axilarina, para encorajar o uso preventivo de Centaurea jacea contra infecções por Covid-19.

Current understanding of an Emerging Coronavirus using in silico approach: Severe Acute Respiratory Syndrome-Coronavirus-2 (SARS-CoV-2) / Compreensão atual de um coronavírus emergente usando abordagem in silico: síndrome respiratória aguda grave - coronavírus-2 (SARS-CoV-2)

Abstract Novel coronavirus (nCoV) namely "SARS-CoV-2" is being found responsible for current PANDEMIC commenced from Wuhan (China) since December 2019 and has been described with epidemiological linkage to China in about 221 countries and territories until now. In this study we have characterized the genetic lineage of SARS-CoV-2 and report the recombination within the genus and subgenus of coronaviruses. Phylogenetic relationship of thirty nine coronaviruses belonging to its four genera and five subgenera was analyzed by using the Neighbor-joining method using MEGA 6.0. Phylogenetic trees of full length genome, various proteins (spike, envelope, membrane and nucleocapsid) nucleotide sequences were constructed separately. Putative recombination was probed via RDP4. Our analysis describes that the "SARS-CoV-2" although shows great similarity to Bat-SARS-CoVs sequences through whole genome (giving sequence similarity 89%), exhibits conflicting grouping with the Bat-SARS-like coronavirus sequences (MG772933 and MG772934). Furthermore, seven recombination events were observed in SARS-CoV-2 (NC_045512) by RDP4. But not a single recombination event fulfills the high level of certainty. Recombination mostly housed in spike protein genes than rest of the genome indicating breakpoint cluster arises beyond the 95% and 99% breakpoint density intervals. Genetic similarity levels observed among "SARS-CoV-2" and Bat-SARS-CoVs advocated that the latter did not exhibit the specific variant that cause outbreak in humans, proposing a suggestion that "SARS-CoV-2" has originated possibly from bats. These genomic features and their probable association with virus characteristics along with virulence in humans require further consideration.

Resumo O novo coronavírus (nCoV), nomeadamente "SARS-CoV-2", foi considerado responsável pela pandemia atual iniciada em Wuhan (China) desde dezembro de 2019 e foi descrito com ligação epidemiológica à China em cerca de 221 países e territórios até agora. Neste estudo, caracterizamos a linhagem genética do SARS-CoV-2 e relatamos a recombinação dentro do gênero e subgênero dos coronavírus. A relação filogenética de 39 coronavírus pertencentes a seus quatro gêneros e cinco subgêneros foi analisada usando o método de Neighbour-joining usando MEGA 6.0. Árvores filogenéticas do genoma de comprimento total, várias proteínas (espícula, envelope, membrana e nucleocapsídeo), sequências de nucleotídeos foram construídas separadamente. A recombinação putativa foi testada via RDP4. Nossa análise descreve que o "SARS-CoV-2", embora mostre grande semelhança com as sequências de Bat-SARS-CoVs em todo o genoma (dando semelhança de sequência de 89%), exibe agrupamento conflitante com as sequências de coronavírus do tipo Bat-SARS (MG772933 e MG772934) Além disso, sete eventos de recombinação foram observados em SARS-CoV-2 (NC045512) por RDP4. Mas nem um único evento de recombinação preenche o alto nível de certeza. A recombinação está alojada mais em genes de proteína de pico, principalmente, do que no resto do genoma, indicando que o cluster de ponto de interrupção surge além dos intervalos de densidade de ponto de interrupção de 95% e 99%. Os níveis de similaridade genética observados entre "SARS-CoV-2" e Bat-SARS-CoVs defendem que o último não exibe a variante específica que causa surto em humanos, sugerindo que "SARS-CoV-2" tenha se originado possivelmente de morcegos. Essas características genômicas e sua provável associação com as características do vírus, juntamente com a virulência em humanos, requerem uma consideração mais aprofundada.

Death caused by covid-19 in top ten countries in Asia affected by covid-19 pandemic with special reference to Pakistan / Morte causada por covid-19 nos dez principais países da Ásia afetados pela pandemia de covid-19, com referência especial ao Paquistão

Abstract The COVID-19 is a contagious viral disease, was first emerged in Wuhan, China in December 2019 and became the whole world on alert. The mortality rate in top most countries in Asia with special reference to Pakistan has been focused. Since February 26 to September 2020 the total confirmed cases and mortality rate was measured through Wikipedia and the notable journals. Iran is the only country having highest number of deaths (5.73%) followed by Indonesia (3.77%) while Saudi Arabia shows the lowest number of deaths as 1.39%. In Pakistan the first case was confirmed in 26th February, 2020. The nCov-19 has closely related to severe acute respiratory syndrome (SARS) hence SARS COV-2 was named. This virus is responsible for more than 33.9 million deaths in over all the world as of 20th September, 2020. The number of new cases is increasing time to time. Sindh province of Pakistan has reported the highest number of cases till September, 20, 2020 as compared to other parts of the country and has the highest number of death followed by Khyber Pakhtunkhwa. Because of the person to person contact the disease is spreading rapidly. The individuals who has already infected with other diseases like cancer or diabetic etc. are vulnerable. The nCOV-19 is the most contagious due to its mode of transmission. There is still no vaccine is available for the treatment of disease caused by nCoV-2019. It is therefore the only option to control this pandemic is to adopt effective preventive measures.

Resumo A covid-19 é uma doença viral contagiosa, que surgiu pela primeira vez em Wuhan, China, em dezembro de 2019, e deixou o mundo todo em alerta. A taxa de mortalidade na maioria dos principais países da Ásia, com referência especial ao Paquistão, foi enfocada. De 26 de fevereiro a setembro de 2020, o total de casos confirmados e a taxa de mortalidade foram medidos por meio da Wikipedia e de periódicos notáveis. O Irã é o único país com maior número de mortes (5,73%), seguido pela Indonésia (3,77%), enquanto a Arábia Saudita mostra o menor número de mortes, 1,39%. No Paquistão, o primeiro caso foi confirmado em 26 de fevereiro de 2020. O nCov-19 está intimamente relacionado à síndrome respiratória aguda grave (SARS), daí o nome SARS COV-2. Esse vírus é responsável por mais de 33,9 milhões de mortes em todo o mundo em 20 de setembro de 2020. O número de novos casos está aumentando de tempos em tempos. A província de Sindh, no Paquistão, registrou o maior número de casos até 20 de setembro de 2020, em comparação com outras partes do país, e tem o maior número de mortes, seguida por Khyber Pakhtunkhwa. Por causa do contato pessoa a pessoa, a doença está se espalhando rapidamente. Indivíduos que já foram diagnosticados com outras doenças, como câncer ou diabetes, etc. são mais vulneráveis. O nCOV-19 é o mais contagioso devido ao seu modo de transmissão. Ainda não há vacina disponível para o tratamento da doença causada pelo nCoV-2019. Portanto, a única opção para controlar essa pandemia é a adoção de medidas preventivas eficazes.

Rubiadin exerts an acute and chronic anti-inflammatory effect in rodents

Abstract: Rubiadin is identified as a bioactive anthraquinone that exists in some quinone rich plants. The current research was carried out to evaluate the potential anti-inflammatory impact of Rubiadin in acute and chronic inflammation test models in rodents. The anti-inflammatory activity of Rubiadin was examined in cotton pellet-induced granuloma and carrageenan-induced edema as chronic and acute inflammation models in rats. TNF- level and histopathological changes were assessed using sampled foot tissue of rat in the acute model. Also, the IL-1 level was assessed in the chronic model. One-way ANOVA (post hoc Tukeys) analysis was used for comparing the groups. Rubiadin (0.5 mg/kg, i.p.) induced a significant reduction in TNF level and the paw edema compared to the control group in carrageenan test. Also, it was observed that the anti-inflammatory activity of Rubiadin (0.5 mg/kg, i.p.) is comparable to mefenamic acid (30 mg/kg, i.p.) as the standard drug. Rubiadin was effective in granuloma induced by cotton pellet concerning the granuloma and transudate formation amount. Rubiadins anti-inflammatory effects were associated with a significant IL-1 decrease in this model. The results suggest that Rubiadin as a natural compound can possess significant peripheral anti-inflammatory impacts.

Resumo A rubiadina é identificada como uma antraquinona bioativa que existe em algumas plantas ricas em quinonas. A presente pesquisa foi realizada para avaliar o potencial impacto anti-inflamatório da rubiadina em modelos de teste de inflamação aguda e crônica em roedores. A atividade anti-inflamatória da rubiadina foi examinada em granuloma induzido por pellet de algodão e edema induzido por carragenina como modelos de inflamação crônica e aguda em ratos. O nível de TNF- e as alterações histopatológicas foram avaliados usando amostra de tecido do pé de rato no modelo agudo. Além disso, o nível de IL-1 foi avaliado no modelo crônico. A análise ANOVA de uma via (post hoc de Tukey) foi usada para comparar os grupos. A rubiadina (0,5 mg / kg, i.p.) induziu uma redução significativa no nível de TNF e no edema da pata em comparação com o grupo de controle no teste de carragenina. Além disso, foi observado que a atividade anti-inflamatória da rubiadina (0,5 mg / kg, i.p.) é comparável ao ácido mefenâmico (30 mg/kg, i.p.) como o fármaco padrão. A rubiadina foi eficaz no granuloma induzido por pellet de algodão no que diz respeito à quantidade de granuloma e formação de transudato. Os efeitos anti-inflamatórios da rubiadina foram associados a uma redução significativa de IL-1 nesse modelo. Os resultados sugerem que a rubiadina como um composto natural pode ter impactos anti-inflamatórios periféricos significativos.

Astragaloside IV alleviates stroke-triggered early brain injury by modulating neuroinflammation and ferroptosis via the Nrf2/HO-1 signaling pathway

Purpose: Stroke is an acute cerebrovascular disease. Astragaloside IV (AS-IV) is an active ingredient extracted from Astragalus membranaceus with an established therapeutic effect on central nervous system diseases. This study examined the neuroprotective properties and possible mechanisms of AS-IV in stroke-triggered early brain injury (EBI) in a rat transient middle cerebral artery occlusion (MCAO) model. Methods: The neurological scores and brain water content were analyzed. 2,3,5-triphenyl tetrazolium chloride (TTC) staining was utilized to determine the infarct volume, neuroinflammatory cytokine levels, and ferroptosis-related genes and proteins, and neuronal damage and molecular mechanisms were evaluated by terminal deoxynucleotidyl transferase dutp nickend labeling (TUNEL) staining, western blotting, and real-time polymerase chain reaction. Results: AS-IV administration decreased the infarct volume, brain edema, neurological deficits, and inflammatory cytokines TNF-α, interleukin-1ß (IL-1ß), IL-6, and NF-κB, increased the levels of SLC7A11 and glutathione peroxidase 4 (GPX4), decreased lipid reactive oxygen species (ROS) levels, and prevented neuronal ferroptosis. Meanwhile, AS-IV triggered the Nrf2/HO-1 signaling pathway and alleviated ferroptosis due to the induction of stroke. Conclusion: Hence, the findings of this research illustrate that AS-IV administration can improve delayed ischemic neurological deficits and decrease neuronal death by modulating nuroinflammation and ferroptosis via the Nrf2/HO-1 signaling pathway.

Rubiadin exerts an acute and chronic anti-inflammatory effect in rodents / A Rubiadina exerce um efeito anti-inflamatório agudo e crônico em roedores

Rubiadin is identified as a bioactive anthraquinone that exists in some quinone rich plants. The current research was carried out to evaluate the potential anti-inflammatory impact of Rubiadin in acute and chronic inflammation test models in rodents. The anti-inflammatory activity of Rubiadin was examined in cotton pellet-induced granuloma and carrageenan-induced edema as chronic and acute inflammation models in rats. TNF-α level and histopathological changes were assessed using sampled foot tissue of rat in the acute model. Also, the IL-1β level was assessed in the chronic model. One-way ANOVA (post hoc Tukey’s) analysis was used for comparing the groups. Rubiadin (0.5 mg/kg, i.p.) induced a significant reduction in TNF α level and the paw edema compared to the control group in carrageenan test. Also, it was observed that the anti-inflammatory activity of Rubiadin (0.5 mg/kg, i.p.) is comparable to mefenamic acid (30 mg/kg, i.p.) as the standard drug. Rubiadin was effective in granuloma induced by cotton pellet concerning the granuloma and transudate formation amount. Rubiadin's anti-inflammatory effects were associated with a significant IL-1β decrease in this model. The results suggest that Rubiadin as a natural compound can possess significant peripheral anti-inflammatory impacts.

A rubiadina é identificada como uma antraquinona bioativa que existe em algumas plantas ricas em quinonas. A presente pesquisa foi realizada para avaliar o potencial impacto anti-inflamatório da rubiadina em modelos de teste de inflamação aguda e crônica em roedores. A atividade anti-inflamatória da rubiadina foi examinada em granuloma induzido por pellet de algodão e edema induzido por carragenina como modelos de inflamação crônica e aguda em ratos. O nível de TNF-α e as alterações histopatológicas foram avaliados usando amostra de tecido do pé de rato no modelo agudo. Além disso, o nível de IL-1β foi avaliado no modelo crônico. A análise ANOVA de uma via (post hoc de Tukey) foi usada para comparar os grupos. A rubiadina (0,5 mg / kg, i.p.) induziu uma redução significativa no nível de TNF α e no edema da pata em comparação com o grupo de controle no teste de carragenina. Além disso, foi observado que a atividade anti-inflamatória da rubiadina (0,5 mg / kg, i.p.) é comparável ao ácido mefenâmico (30 mg/kg, i.p.) como o fármaco padrão. A rubiadina foi eficaz no granuloma induzido por pellet de algodão no que diz respeito à quantidade de granuloma e formação de transudato. Os efeitos anti-inflamatórios da rubiadina foram associados a uma redução significativa de IL-1β nesse modelo. Os resultados sugerem que a rubiadina como um composto natural pode ter impactos anti-inflamatórios periféricos significativos.

Effects of local and remote ischemic postconditioning methods on ischemiareperfusion injury in a young animal model of acute mesenteric ischemia

Purpose: Acute mesenteric ischemia (AMI) is a condition in pediatric surgery that ranges from intestine necrosis to death. Ischemic postconditioning (IPoC) methods were developed to reduce the damage caused by revascularization. This study aimed to evaluate the efficacy of these methods in an experimental weaning rat model. Methods: Thirty-two 21-day-old Wistar rats were allocated into four groups according to the surgical procedure performed: control, ischemia-reperfusion injury (IRI), local (LIPoC) and remote IPoC (RIPoC). At euthanasia, fragments of the intestine, liver, lungs, and kidneys were submitted to histological, histomorphometric, and molecular analyses. Results: In the duodenum, intestines, and kidneys histological alterations promoted by IRI were reversed by remote postconditioning method. In the distal ileum, the histomorphometric alterations could be reversed by the postconditioning methods with more evident effects promoted by the remote method. The molecular analysis found that the levels of expression of Bax (proapoptotic) and Bcl-XL (antiapoptotic) genes in the intestine were increased by IRI. These alterations were equally reversed by the postconditioning methods, with more evident effects of the remote method. Conclusions: IPoC methods positively reduced the damage caused by IRI in weaning rats.

Rubiadin exerts an acute and chronic anti-inflammatory effect in rodents / A Rubiadina exerce um efeito anti-inflamatório agudo e crônico em roedores

Rubiadin is identified as a bioactive anthraquinone that exists in some quinone rich plants. The current research was carried out to evaluate the potential anti-inflammatory impact of Rubiadin in acute and chronic inflammation test models in rodents. The anti-inflammatory activity of Rubiadin was examined in cotton pellet-induced granuloma and carrageenan-induced edema as chronic and acute inflammation models in rats. TNF-α level and histopathological changes were assessed using sampled foot tissue of rat in the acute model. Also, the IL-1β level was assessed in the chronic model. One-way ANOVA (post hoc Tukeys) analysis was used for comparing the groups. Rubiadin (0.5 mg/kg, i.p.) induced a significant reduction in TNF α level and the paw edema compared to the control group in carrageenan test. Also, it was observed that the anti-inflammatory activity of Rubiadin (0.5 mg/kg, i.p.) is comparable to mefenamic acid (30 mg/kg, i.p.) as the standard drug. Rubiadin was effective in granuloma induced by cotton pellet concerning the granuloma and transudate formation amount. Rubiadin's anti-inflammatory effects were associated with a significant IL-1β decrease in this model. The results suggest that Rubiadin as a natural compound can possess significant peripheral anti-inflammatory impacts.(AU)

A rubiadina é identificada como uma antraquinona bioativa que existe em algumas plantas ricas em quinonas. A presente pesquisa foi realizada para avaliar o potencial impacto anti-inflamatório da rubiadina em modelos de teste de inflamação aguda e crônica em roedores. A atividade anti-inflamatória da rubiadina foi examinada em granuloma induzido por pellet de algodão e edema induzido por carragenina como modelos de inflamação crônica e aguda em ratos. O nível de TNF-α e as alterações histopatológicas foram avaliados usando amostra de tecido do pé de rato no modelo agudo. Além disso, o nível de IL-1β foi avaliado no modelo crônico. A análise ANOVA de uma via (post hoc de Tukey) foi usada para comparar os grupos. A rubiadina (0,5 mg / kg, i.p.) induziu uma redução significativa no nível de TNF α e no edema da pata em comparação com o grupo de controle no teste de carragenina. Além disso, foi observado que a atividade anti-inflamatória da rubiadina (0,5 mg / kg, i.p.) é comparável ao ácido mefenâmico (30 mg/kg, i.p.) como o fármaco padrão. A rubiadina foi eficaz no granuloma induzido por pellet de algodão no que diz respeito à quantidade de granuloma e formação de transudato. Os efeitos anti-inflamatórios da rubiadina foram associados a uma redução significativa de IL-1β nesse modelo. Os resultados sugerem que a rubiadina como um composto natural pode ter impactos anti-inflamatórios periféricos significativos.(AU)

Identification of management factors associated with glanders's occurrence in equids in Brazilian Northeast region / Identificação dos fatores de manejo associados à ocorrência do Mormo em equídeos no Nordeste do Brasil

ABSTRACT: Glanders is a contagious zoonotic infectious disease characterized by an acute or chronic condition that mainly affects equids and is caused by Burkholderia (B.) mallei. From January 2005 to December 2017, 697 farms with positive cases of this disease were registered in Brazil, with the Northeast region accounting for 61.4% (428/697) of the total number of cases. This study conducted an epidemiological study of B. mallei infections that occurred in farms in the states of Pernambuco, Paraíba, Ceará and Alagoas. For this purpose, investigative questionnaires were applied to six farms where there were outbreaks of glanders and 11 farms where there were no reports of glanders between 2017 and 2021, and statistical analysis of the factors associated with the occurrence of glanders in Northeastern Brazil was performed. Factors such as the purpose of rearing (P = 0.023), lack of information on disease transmission modes (P = 0.034), failure to carry out periodic tests for glanders diagnosis (P = 0,029), no request for glanders tests prior to the purchase of new animals periodic tests for glanders diagnosis (P = 0.029), not requiring a negative test for glanders in the acquisition of animals (P = 0.06), use of extensive breeding systems(P = 0.027), and poor stall hygiene were associated with disease occurrence (P = 0.001). Understanding the factors related to the occurrence of glanders in the Northeast Region of Brazil helps to establish management measures that minimize bacteria transmission, thereby reducing the number of cases in the region and economic losses associated with glanders.

RESUMO: O mormo é uma doença infectocontagiosa, zoonótica, de caráter agudo ou crônico, que acomete principalmente os equídeos, causado por Burkholderia (B.) mallei. De janeiro de 2005 até dezembro de 2017, 697 focos da doença foram registrados no Brasil, sendo que a região Nordeste detém 61,4% (428/697) do total de focos. Objetivou-se realizar um estudo epidemiológico da infecção por Burkholderia mallei em propriedades nos estados de Pernambuco, Paraíba, Ceará e Alagoas. Para tal foi aplicado questionário investigativo em seis fazendas onde houve caso de Mormo e 11 fazendas em que não houve relato entre 2007 e 2011 e realizada análise estatística dos fatores de manejo associados à ocorrência do Mormo no Nordeste do Brasil. Observou-se associação significativa para as seguintes variáveis: objetivo da criação (comércio, esporte e trabalho nas fazendas) (P = 0,023); ausência de informação sobre as formas de transmissão da bactéria (P = 0,034); não realização de exames periódicos para o diagnóstico do mormo (P = 0,029); exigência de exame negativo na compra de equinos (P = 0,06); utilização do sistema de criação extensivo (P = 0,027) e deficiência de higienização das baias (P = 001). Os resultados obtidos devem ser utilizados na implementação de medidas de manejo que minimizem o risco de transmissão da bactéria, reduzindo os casos da doença na região e as perdas econômicas com o mormo.

Identification of management factors associated with glanders's occurrence in equids in Brazilian Northeast region / Identificação dos fatores de manejo associados à ocorrência do Mormo em equídeos no Nordeste do Brasil

Glanders is a contagious zoonotic infectious disease characterized by an acute or chronic condition that mainly affects equids and is caused by Burkholderia (B.) mallei. From January 2005 to December 2017, 697 farms with positive cases of this disease were registered in Brazil, with the Northeast region accounting for 61.4% (428/697) of the total number of cases. This study conducted an epidemiological study of B. mallei infections that occurred in farms in the states of Pernambuco, Paraíba, Ceará and Alagoas. For this purpose, investigative questionnaires were applied to six farms where there were outbreaks of glanders and 11 farms where there were no reports of glanders between 2017 and 2021, and statistical analysis of the factors associated with the occurrence of glanders in Northeastern Brazil was performed. Factors such as the purpose of rearing (P = 0.023), lack of information on disease transmission modes (P = 0.034), failure to carry out periodic tests for glanders diagnosis (P = 0,029), no request for glanders tests prior to the purchase of new animals periodic tests for glanders diagnosis (P = 0.029), not requiring a negative test for glanders in the acquisition of animals (P = 0.06), use of extensive breeding systems(P = 0.027), and poor stall hygiene were associated with disease occurrence (P = 0.001). Understanding the factors related to the occurrence of glanders in the Northeast Region of Brazil helps to establish management measures that minimize bacteria transmission, thereby reducing the number of cases in the region and economic losses associated with glanders.

O mormo é uma doença infectocontagiosa, zoonótica, de caráter agudo ou crônico, que acomete principalmente os equídeos, causado por Burkholderia (B.) mallei. De janeiro de 2005 até dezembro de 2017, 697 focos da doença foram registrados no Brasil, sendo que a região Nordeste detém 61,4% (428/697) do total de focos. Objetivou-se realizar um estudo epidemiológico da infecção por Burkholderia mallei em propriedades nos estados de Pernambuco, Paraíba, Ceará e Alagoas. Para tal foi aplicado questionário investigativo em seis fazendas onde houve caso de Mormo e 11 fazendas em que não houve relato entre 2007 e 2011 e realizada análise estatística dos fatores de manejo associados à ocorrência do Mormo no Nordeste do Brasil. Observou-se associação significativa para as seguintes variáveis: objetivo da criação (comércio, esporte e trabalho nas fazendas) (P = 0,023); ausência de informação sobre as formas de transmissão da bactéria (P = 0,034); não realização de exames periódicos para o diagnóstico do mormo (P = 0,029); exigência de exame negativo na compra de equinos (P = 0,06); utilização do sistema de criação extensivo (P = 0,027) e deficiência de higienização das baias (P = 001). Os resultados obtidos devem ser utilizados na implementação de medidas de manejo que minimizem o risco de transmissão da bactéria, reduzindo os casos da doença na região e as perdas econômicas com o mormo.

Current understanding of an Emerging Coronavirus usingin silico approach: Severe Acute Respiratory Syndrome-Coronavirus-2 (SARS-CoV-2) / Compreensão atual de um coronavírus emergente usando abordagem in silico: síndrome respiratória aguda grave - coronavírus-2 (SARS-CoV-2)

Novel coronavirus (nCoV) namely "SARS-CoV-2" is being found responsible for current PANDEMIC commenced from Wuhan (China) since December 2019 and has been described with epidemiological linkage to China in about 221 countries and territories until now. In this study we have characterized the genetic lineage of SARS-CoV-2 and report the recombination within the genus and subgenus of coronaviruses. Phylogenetic relationship of thirty nine coronaviruses belonging to its four genera and five subgenera was analyzed by using the Neighbor-joining method using MEGA 6.0. Phylogenetic trees of full length genome, various proteins (spike, envelope, membrane and nucleocapsid) nucleotide sequences were constructed separately. Putative recombination was probed via RDP4. Our analysis describes that the "SARS-CoV-2" although shows great similarity to Bat-SARS-CoVs sequences through whole genome (giving sequence similarity 89%), exhibits conflicting grouping with the Bat-SARS-like coronavirus sequences (MG772933 and MG772934). Furthermore, seven recombination events were observed in SARS-CoV-2 (NC_045512) by RDP4. But not a single recombination event fulfills the high level of certainty. Recombination mostly housed in spike protein genes than rest of the genome indicating breakpoint cluster arises beyond the 95% and 99% breakpoint density intervals. Genetic similarity levels observed among "SARS-CoV-2" and Bat-SARS-CoVs advocated that the latter did not exhibit the specific variant that cause outbreak in humans, proposing a suggestion that "SARS-CoV-2" has originated possibly from bats. These genomic features and their probable association with virus characteristics along with virulence in humans require further consideration.

O novo coronavírus (nCoV), nomeadamente "SARS-CoV-2", foi considerado responsável pela pandemia atual iniciada em Wuhan (China) desde dezembro de 2019 e foi descrito com ligação epidemiológica à China em cerca de 221 países e territórios até agora. Neste estudo, caracterizamos a linhagem genética do SARS-CoV-2 e relatamos a recombinação dentro do gênero e subgênero dos coronavírus. A relação filogenética de 39 coronavírus pertencentes a seus quatro gêneros e cinco subgêneros foi analisada usando o método de Neighbour-joining usando MEGA 6.0. Árvores filogenéticas do genoma de comprimento total, várias proteínas (espícula, envelope, membrana e nucleocapsídeo), sequências de nucleotídeos foram construídas separadamente. A recombinação putativa foi testada via RDP4. Nossa análise descreve que o "SARS-CoV-2", embora mostre grande semelhança com as sequências de Bat-SARS-CoVs em todo o genoma (dando semelhança de sequência de 89%), exibe agrupamento conflitante com as sequências de coronavírus do tipo Bat-SARS (MG772933 e MG772934) Além disso, sete eventos de recombinação foram observados em SARS-CoV-2 (NC045512) por RDP4. Mas nem um único evento de recombinação preenche o alto nível de certeza. A recombinação está alojada mais em genes de proteína de pico, principalmente, do que no resto do genoma, indicando que o cluster de ponto de interrupção surge além dos intervalos de densidade de ponto de interrupção de 95% e 99%. Os níveis de similaridade genética observados entre "SARS-CoV-2" e Bat-SARS-CoVs defendem que o último não exibe a variante específica que causa surto em humanos, sugerindo que "SARS-CoV-2" tenha se originado possivelmente de morcegos. Essas características genômicas e sua provável associação com as características do vírus, juntamente com a virulência em humanos, requerem uma consideração mais aprofundada.

Remote ischemic preconditioning-induced late cardioprotection: possible role of melatonin-mitoKATP-H2S signaling pathway

Purpose: Remote ischemic preconditioning (RIPC) confers cardioprotection against ischemia reperfusion (IR) injury. However, the precise mechanisms involved in RIPC-induced cardioprotection are not fully explored. The present study was aimed to identify the role of melatonin in RIPC-induced late cardioprotective effects in rats and to explore the role of H2 S, TNF-α and mitoKATP in melatoninmediated effects in RIPC. Methods: Wistar rats were subjected to RIPC in which hind limb was subjected to four alternate cycles of ischemia and reperfusion of 5 min duration by using a neonatal blood pressure cuff. After 24 h of RIPC or ramelteon-induced pharmacological preconditioning, hearts were isolated and subjected to IR injury on the Langendorff apparatus. Results: RIPC and ramelteon preconditioning protected the hearts from IR injury and it was assessed by a decrease in LDH-1, cTnT and increase in left ventricular developed pressure (LVDP). RIPC increased the melatonin levels (in plasma), H2 S (in heart) and decreased TNF-α levels. The effects of RIPC were abolished in the presence of melatonin receptor blocker (luzindole), ganglionic blocker (hexamethonium) and mitochondrial KATP blocker (5-hydroxydecanoic acid). Conclusion: RIPC produce delayed cardioprotection against IR injury through the activation of neuronal pathway, which may increase the plasma melatonin levels to activate the cardioprotective signaling pathway involving the opening of mitochondrial KATP channels, decrease in TNF-α production and increase in H2 S levels. Ramelteon-induced pharmacological preconditioning may also activate the cardioprotective signaling pathway involving the opening of mitochondrial KATP channels, decrease in TNF-α production and increase in H2 S levels.

Current understanding of an Emerging Coronavirus usingin silico approach: Severe Acute Respiratory Syndrome-Coronavirus-2 (SARS-CoV-2) / Compreensão atual de um coronavírus emergente usando abordagem in silico: síndrome respiratória aguda grave - coronavírus-2 (SARS-CoV-2)

Novel coronavirus (nCoV) namely "SARS-CoV-2" is being found responsible for current PANDEMIC commenced from Wuhan (China) since December 2019 and has been described with epidemiological linkage to China in about 221 countries and territories until now. In this study we have characterized the genetic lineage of SARS-CoV-2 and report the recombination within the genus and subgenus of coronaviruses. Phylogenetic relationship of thirty nine coronaviruses belonging to its four genera and five subgenera was analyzed by using the Neighbor-joining method using MEGA 6.0. Phylogenetic trees of full length genome, various proteins (spike, envelope, membrane and nucleocapsid) nucleotide sequences were constructed separately. Putative recombination was probed via RDP4. Our analysis describes that the "SARS-CoV-2" although shows great similarity to Bat-SARS-CoVs sequences through whole genome (giving sequence similarity 89%), exhibits conflicting grouping with the Bat-SARS-like coronavirus sequences (MG772933 and MG772934). Furthermore, seven recombination events were observed in SARS-CoV-2 (NC_045512) by RDP4. But not a single recombination event fulfills the high level of certainty. Recombination mostly housed in spike protein genes than rest of the genome indicating breakpoint cluster arises beyond the 95% and 99% breakpoint density intervals. Genetic similarity levels observed among "SARS-CoV-2" and Bat-SARS-CoVs advocated that the latter did not exhibit the specific variant that cause outbreak in humans, proposing a suggestion that "SARS-CoV-2" has originated possibly from bats. These genomic features and their probable association with virus characteristics along with virulence in humans require further consideration.(AU)

O novo coronavírus (nCoV), nomeadamente "SARS-CoV-2", foi considerado responsável pela pandemia atual iniciada em Wuhan (China) desde dezembro de 2019 e foi descrito com ligação epidemiológica à China em cerca de 221 países e territórios até agora. Neste estudo, caracterizamos a linhagem genética do SARS-CoV-2 e relatamos a recombinação dentro do gênero e subgênero dos coronavírus. A relação filogenética de 39 coronavírus pertencentes a seus quatro gêneros e cinco subgêneros foi analisada usando o método de Neighbour-joining usando MEGA 6.0. Árvores filogenéticas do genoma de comprimento total, várias proteínas (espícula, envelope, membrana e nucleocapsídeo), sequências de nucleotídeos foram construídas separadamente. A recombinação putativa foi testada via RDP4. Nossa análise descreve que o "SARS-CoV-2", embora mostre grande semelhança com as sequências de Bat-SARS-CoVs em todo o genoma (dando semelhança de sequência de 89%), exibe agrupamento conflitante com as sequências de coronavírus do tipo Bat-SARS (MG772933 e MG772934) Além disso, sete eventos de recombinação foram observados em SARS-CoV-2 (NC045512) por RDP4. Mas nem um único evento de recombinação preenche o alto nível de certeza. A recombinação está alojada mais em genes de proteína de pico, principalmente, do que no resto do genoma, indicando que o cluster de ponto de interrupção surge além dos intervalos de densidade de ponto de interrupção de 95% e 99%. Os níveis de similaridade genética observados entre "SARS-CoV-2" e Bat-SARS-CoVs defendem que o último não exibe a variante específica que causa surto em humanos, sugerindo que "SARS-CoV-2" tenha se originado possivelmente de morcegos. Essas características genômicas e sua provável associação com as características do vírus, juntamente com a virulência em humanos, requerem uma consideração mais aprofundada.(AU)

A threefold approach including quantum chemical, molecular docking and molecular dynamic studies to explore the natural compounds from Centaurea jacea as the potential inhibitors for COVID-19 / Uma abordagem tríplice incluindo química quântica, docking molecular e estudos dinâmicos moleculares para explorar os compostos naturais de Centaurea jacea como inibidores potenciais para Covid-19

In the current report, we studied the possible inhibitors of COVID-19 from bioactive constituents of Centaurea jacea using a threefold approach consisting of quantum chemical, molecular docking and molecular dynamic techniques. Centaurea jacea is a perennial herb often used in folk medicines of dermatological complaints and fever. Moreover, anticancer, antioxidant, antibacterial and antiviral properties of its bioactive compounds are also reported. The Mpro (Main proteases) was docked with different compounds of Centaurea jacea through molecular docking. All the studied compounds including apigenin, axillarin, Centaureidin, Cirsiliol, Eupatorin and Isokaempferide, show suitable binding affinities to the binding site of SARS-CoV-2 main protease with their binding energies -6.7 kcal/mol, -7.4 kcal/mol, -7.0 kcal/mol, -5.8 kcal/mol, -6.2 kcal/mol and -6.8 kcal/mol, respectively. Among all studied compounds, axillarin was found to have maximum inhibitor efficiency followed by Centaureidin, Isokaempferide, Apigenin, Eupatorin and Cirsiliol. Our results suggested that axillarin binds with the most crucial catalytic residues CYS145 and HIS41 of the Mpro, moreover axillarin shows 5 hydrogen bond interactions and 5 hydrophobic interactions with various residues of Mpro. Furthermore, the molecular dynamic calculations over 60 ns (6×106 femtosecond) time scale also shown significant insights into the binding effects of axillarin with Mpro of SARS-CoV-2 by imitating protein like aqueous environment. From molecular dynamic calculations, the RMSD and RMSF computations indicate the stability and dynamics of the best docked complex in aqueous environment. The ADME properties and toxicity prediction analysis of axillarin also recommended it as safe drug candidate. Further, in vivo and in [...].

No presente relatório, estudamos os possíveis inibidores de Covid-19 de constituintes bioativos de Centaurea jacea usando uma abordagem tripla que consiste em técnicas de química quântica, docking molecular e dinâmica molecular. Centaurea jacea é uma erva perene frequentemente usada em remédios populares de doenças dermatológicas e febre. Além disso, as propriedades anticâncer, antioxidante, antibacteriana e antiviral de seus compostos bioativos também são relatadas. A Mpro (proteases principais) foi acoplada a diferentes compostos de Centaurea jacea por meio de docking molecular. Todos os compostos estudados, incluindo apigenina, axilarina, Centaureidina, Cirsiliol, Eupatorina e Isokaempferide, mostram afinidades de ligação adequadas ao sítio de ligação da protease principal SARS-CoV-2 com suas energias de ligação -6,7 kcal / mol, -7,4 kcal / mol, - 7,0 kcal / mol, -5,8 kcal / mol, -6,2 kcal / mol e -6,8 kcal / mol, respectivamente. Dentre todos os compostos estudados, a axilarina apresentou eficiência máxima de inibidor, seguida pela Centaureidina, Isokaempferida, Apigenina, Eupatorina e Cirsiliol. Nossos resultados sugeriram que a axilarina se liga aos resíduos catalíticos mais cruciais CYS145 e HIS41 do Mpro, além disso a axilarina mostra 5 interações de ligações de hidrogênio e 5 interações hidrofóbicas com vários resíduos de Mpro. Além disso, os cálculos de dinâmica molecular em uma escala de tempo de 60 ns (6 × 106 femtossegundos) também mostraram percepções significativas sobre os efeitos de ligação da axilarina com Mpro de SARS-CoV-2 por imitação de proteínas como o ambiente aquoso. A partir de cálculos de dinâmica molecular, os cálculos RMSD e RMSF indicam a estabilidade e dinâmica do melhor complexo ancorado em ambiente [...].