Caracterização in silico dos genes envolvidos no metabolismo do nitrogênio em milho (Zea mays) / In silico characterization of genes involved in nitrogen metabolism in maize (Zea mays) / Caracterización in silico de genes implicados en el metabolismo de nitrógeno en maíz (Zea mays)

O N é o nutriente mineral requerido pelas plantas em maior quantidade e frequentemente limita o crescimento e produtividade. A partir de uma análise in silico foram identificados 26 genes envolvidos na assimilação do nitrogênio: quatro genes que codificam a enzima nitrato redutase (ZmNR), oito nitrato redutase de transporte (ZmNRT), uma nitrito redutase (ZmNRi), uma nitrito de transporte (ZmNRiT), seis glutamina sintetase (ZmGS), quatro glutamato sintase (ZmGOGAT) e duas glutamato desidrogenase (ZmGDH). A árvore filogenética foi construída onde foi possível observar a formação de cinco grupos distintos de acordo com as funções. A análise da estrutura dos genes mostrou que o número de íntrons variou de 0 a 32. A análise dos domínios conservados mostrou que a maioria dos genes identificados possuem o domínios específicos a função que desempenham na rota de assimilação do N em milho. Além disso, esses genes apresentaram padrões de expressão diferenciais em tecidos e órgãos. Os dados gerados neste trabalho forneceram subsídios para selecionar genes-candidatos para futuras análises funcionais a serem utilizados nos programas de melhoramento de milho.(AU)

Nitrogen is a mineral highly requested by plants and often limits both growth and productivity. From an in-silico analysis, a total of 26 genes were identified as being involved in nitrogen assimilation: four genes encoding nitrate reductase enzyme (ZmNR), eight encoding nitrate reductase transporters (ZmNRT), one encoding nitrite reductase (ZmNRi), one encoding nitrite transporter (ZmNRiT), six encoding glutamine synthesis (ZmGOGAT) and two encoding glutamate dehydrogenase (ZmGDH). A phylogenetic tree was generated where the formation of five distinct clusters could be observed according to gene function. Structural genes analysis showed that introns varied from 0 to 32. The analysis of conserved domains showed that most of the identified genes play a domain-specific function in the N assimilation pathway in maize. Moreover, these genes present a differential expression pattern in tissues and organs. Data from this study will provide subsidies to select candidate genes for further functional analyses in maize breeding programs.(AU)

N es el nutriente mineral requerido por las plantas en mayor cantidad y a menudo limita el crecimiento y la productividad. Desde un análisis in silico se ha identificado 26 genes implicados en la asimilación de nitrógeno: cuatro genes que codifican la enzima nitrato reductasa (ZmNR), ocho nitrato reductasa de transporte (ZmNRT), un nitrito reductasa (ZmNRi), un nitrito de transporte (ZmNRiT), seis glutamina sintetasa (ZmGS), cuatro sintasa de glutamato (ZmGOGAT) y dos glutamato deshidrogenasa (ZmGDH). El árbol filogenético se ha construido donde ha sido posible observar la formación de cinco grupos distintos de acuerdo con sus funciones. El análisis de la estructura de los genes ha mostrado que el número de intrones ha variado de 0 a 32. El análisis de los dominios conservados mostró que la mayoría de los genes identificados poseen dominios específicos a la función que desempeñan en la ruta de asimilación de N en maíz. Además, esos genes mostraron patrones de expresión diferenciales en tejidos y órganos. Los datos generados en este estudio proporcionan subvenciones para la selección de genes candidatos para posterior análisis funcional, para ser utilizados en programas de mejoramiento de maíz.(AU)

Caracterização in silico dos genes envolvidos no metabolismo do nitrogênio em milho (Zea mays) / In silico characterization of genes involved in nitrogen metabolism in maize (Zea mays) / Caracterización in silico de genes implicados en el metabolismo de nitrógeno en maíz (Zea mays)

O N é o nutriente mineral requerido pelas plantas em maior quantidade e frequentemente limita o crescimento e produtividade. A partir de uma análise in silico foram identificados 26 genes envolvidos na assimilação do nitrogênio: quatro genes que codificam a enzima nitrato redutase (ZmNR), oito nitrato redutase de transporte (ZmNRT), uma nitrito redutase (ZmNRi), uma nitrito de transporte (ZmNRiT), seis glutamina sintetase (ZmGS), quatro glutamato sintase (ZmGOGAT) e duas glutamato desidrogenase (ZmGDH). A árvore filogenética foi construída onde foi possível observar a formação de cinco grupos distintos de acordo com as funções. A análise da estrutura dos genes mostrou que o número de íntrons variou de 0 a 32. A análise dos domínios conservados mostrou que a maioria dos genes identificados possuem o domínios específicos a função que desempenham na rota de assimilação do N em milho. Além disso, esses genes apresentaram padrões de expressão diferenciais em tecidos e órgãos. Os dados gerados neste trabalho forneceram subsídios para selecionar genes-candidatos para futuras análises funcionais a serem utilizados nos programas de melhoramento de milho.

Nitrogen is a mineral highly requested by plants and often limits both growth and productivity. From an in-silico analysis, a total of 26 genes were identified as being involved in nitrogen assimilation: four genes encoding nitrate reductase enzyme (ZmNR), eight encoding nitrate reductase transporters (ZmNRT), one encoding nitrite reductase (ZmNRi), one encoding nitrite transporter (ZmNRiT), six encoding glutamine synthesis (ZmGOGAT) and two encoding glutamate dehydrogenase (ZmGDH). A phylogenetic tree was generated where the formation of five distinct clusters could be observed according to gene function. Structural genes analysis showed that introns varied from 0 to 32. The analysis of conserved domains showed that most of the identified genes play a domain-specific function in the N assimilation pathway in maize. Moreover, these genes present a differential expression pattern in tissues and organs. Data from this study will provide subsidies to select candidate genes for further functional analyses in maize breeding programs.

N es el nutriente mineral requerido por las plantas en mayor cantidad y a menudo limita el crecimiento y la productividad. Desde un análisis in silico se ha identificado 26 genes implicados en la asimilación de nitrógeno: cuatro genes que codifican la enzima nitrato reductasa (ZmNR), ocho nitrato reductasa de transporte (ZmNRT), un nitrito reductasa (ZmNRi), un nitrito de transporte (ZmNRiT), seis glutamina sintetasa (ZmGS), cuatro sintasa de glutamato (ZmGOGAT) y dos glutamato deshidrogenasa (ZmGDH). El árbol filogenético se ha construido donde ha sido posible observar la formación de cinco grupos distintos de acuerdo con sus funciones. El análisis de la estructura de los genes ha mostrado que el número de intrones ha variado de 0 a 32. El análisis de los dominios conservados mostró que la mayoría de los genes identificados poseen dominios específicos a la función que desempeñan en la ruta de asimilación de N en maíz. Además, esos genes mostraron patrones de expresión diferenciales en tejidos y órganos. Los datos generados en este estudio proporcionan subvenciones para la selección de genes candidatos para posterior análisis funcional, para ser utilizados en programas de mejoramiento de maíz.

Crecimiento inicial de Palo de Rosa (Aniba rosaeodora Ducke) en distintos ambientes de fertilidad

Los estudios de requerimientos nutricionales son de gran importancia para identificar aquellos más importantes en el desarrollo fisiológico y crecimiento de plántulas. Con el objetivo de evaluar las exigencias nutricionales y los efectos de la omisión de macronutrientes en el crecimiento de plántulas de Aniba rosaeodora; se realizó un experimento en el vivero del INPA-Amazonas-Brasil teniendo como substrato un suelo Podozolico Rojo de baja disponibilidad de nutrientes. Se utilizaron 8 tratamientos bajo la técnica del nutriente faltante: Control (Suelo con macronutrientes), Suelo natural, y la omisión de un macronutriente por vez (-N, -P, -K, -Ca, -Mg, -S). Se evaluaron las siguientes características: tasa de crecimiento relativo (TCR), Tasa de asimilación neta (TAN), peso de la materia seca de la parte aérea (MSPA) y de las raíces (MSR), contenido de nutrientes en las hojas, concluyendo que el N, Mg y Ca, demostraron ser limitantes al crecimiento en suelo con pequeña disponibilidad; Las plántulas de A. rosaeodora presentaron un bajo requerimiento nutricional para el P, K y S. La omisión de Ca y N perjudica TCR de la especie. Los elementos más importantes para la MSPA fueron el Ca y el Mg; actuando el Mg más en el área foliar; por otro lado la omisión de azufre favorece la absorción de macronutrientes (N, P, K, Ca, Mg).

Studies of nutritional requirements are of great importance for identifying the most important nutrients in physiologic development and seedling growth. A greenhouse pot experiment was conducted at INPA to evaluate the mineral nutritional demands and the effects of macronutrient omission in the plant growth of Aniba rosaeodora Ducke. The following treatments were used: Complete (fertilization with N, P, K, Ca, Mg, S, B and Zn), Standard (nature soil), Complete without N, Complete without P, Complete without K, Complete without Ca, Complete without Mg, and Complete without S. An Ultisoil with low nutrient availability was used as a substratum. The following characteristics were evaluated, relative growth rate (RGR), net assimilation rate (NAR), plant height, diameter, dry matter production of the aerial part (DMPAP) and amount of nutrient in the dry matter of leaves. We concluded from the results that: low availability of N, Ca and Mg constraints the growth of the Aniba rosaeodora plants. Seedlings of A. rosaeodora required little P, K and S. The omission of Ca and N harmed the RGR of the species. The most important elements for DMPAP were Ca and Mg; the Mg acting more in the leaf area; on the other hand, the omission of sulfur favored the macronutrient absorption (N, P, K, Ca, Mg).

Crecimiento inicial de Palo de Rosa (Aniba rosaeodora Ducke) en distintos ambientes de fertilidad / Growth of initial Rosewood (Aniba rosaeodora Ducke) in different environnement of fertility

Los estudios de requerimientos nutricionales son de gran importancia para identificar aquellos más importantes en el desarrollo fisiológico y crecimiento de plántulas. Con el objetivo de evaluar las exigencias nutricionales y los efectos de la omisión de macronutrientes en el crecimiento de plántulas de Aniba rosaeodora; se realizó un experimento en el vivero del INPA-Amazonas-Brasil teniendo como substrato un suelo Podozolico Rojo de baja disponibilidad de nutrientes. Se utilizaron 8 tratamientos bajo la técnica del nutriente faltante: Control (Suelo con macronutrientes), Suelo natural, y la omisión de un macronutriente por vez (-N, -P, -K, -Ca, -Mg, -S). Se evaluaron las siguientes características: tasa de crecimiento relativo (TCR), Tasa de asimilación neta (TAN), peso de la materia seca de la parte aérea (MSPA) y de las raíces (MSR), contenido de nutrientes en las hojas, concluyendo que el N, Mg y Ca, demostraron ser limitantes al crecimiento en suelo con pequeña disponibilidad; Las plántulas de A. rosaeodora presentaron un bajo requerimiento nutricional para el P, K y S. La omisión de Ca y N perjudica TCR de la especie. Los elementos más importantes para la MSPA fueron el Ca y el Mg; actuando el Mg más en el área foliar; por otro lado la omisión de azufre favorece la absorción de macronutrientes (N, P, K, Ca, Mg).

Studies of nutritional requirements are of great importance for identifying the most important nutrients in physiologic development and seedling growth. A greenhouse pot experiment was conducted at INPA to evaluate the mineral nutritional demands and the effects of macronutrient omission in the plant growth of Aniba rosaeodora Ducke. The following treatments were used: Complete (fertilization with N, P, K, Ca, Mg, S, B and Zn), Standard (nature soil), Complete without N, Complete without P, Complete without K, Complete without Ca, Complete without Mg, and Complete without S. An Ultisoil with low nutrient availability was used as a substratum. The following characteristics were evaluated, relative growth rate (RGR), net assimilation rate (NAR), plant height, diameter, dry matter production of the aerial part (DMPAP) and amount of nutrient in the dry matter of leaves. We concluded from the results that: low availability of N, Ca and Mg constraints the growth of the Aniba rosaeodora plants. Seedlings of A. rosaeodora required little P, K and S. The omission of Ca and N harmed the RGR of the species. The most important elements for DMPAP were Ca and Mg; the Mg acting more in the leaf area; on the other hand, the omission of sulfur favored the macronutrient absorption (N, P, K, Ca, Mg).

Research on Cryptococcus neoformans and Candida spp. in the excretas of captive psittacisittacines and passeriformes / Pesquisa de Cryptococcus neoformans e Candida spp. em excretas de psitacídeos e passeriformes cativos / Investigación de Cryptococcus neoformans y Candida spp. en excretas de psittacidae y psittaciformes cautivos

As leveduras podem causar diversas doenças no homem e animais. Nas aves, as leveduras estão envolvidas principalmente em lesões no trato respiratório e digestório. Entre as leveduras patogênicas, Cryptococcus neoformans vem se destacando pela alta prevalência de criptococose humana em pacientes imunodeprimidos. Assim, os objetivos deste estudo foram identificar C. neoformans e outras leveduras patogênicas na cloaca e coana de passeriformes e psitaciformes e em excretas coletadas do fundo de gaiolas de aviários. Foram obtidas 29 amostras de 15 aves manifestando algum sinal respiratório, provenientes do Ambulatório de Animais Selvagens da UFPR (n=6) e da Clínica Veterinária Vida Livre (n= 23). As amostras foram semeadas em Ágar Sabouraud e Ágar Níger e mantidas a 300 C por até 30 dias. Todas as colônias foram analisadas quanto à macro e micromorfologia. Para aquelas identificadas como leveduras, foram realizadas as provas bioquímicas: assimilação de carbono e nitrogênio e formação de tubo germinativo para identificação de Candida albicans. As amostras de excreta dos aviários (n=8) foram misturadas com solução fisiológica contendo antibiótico e o sobrenadante foi semeado em Ágar Níger. Nenhuma amostra das aves apresentou resultado positivo para C. neoformans, porém identificaram-se amostras positivas para C. albicans (duas amostras de coana), C. famata (uma amostra de coana) e C. tropicalis (uma amostra de coana). As excretas foram negativas para C. neoformans. Portanto, apesar de não ter sido isolado C. neoformans, outras leveduras patogênicas foram isoladas, demonstrando a importância dessas aves como possíveis veiculadoras de doenças para humanos.(AU)

The yeasts can cause many diseases in man and animals. On birds, the yeasts are involved mainly in respiratory and digestive tract lesions. Among pathogenic yeast, Cryptococcus neoformans is an important cause of human cryptococcisis associated with immunocompromised states. The purpose of this study is to identify the occurrence of C. neoformans and other pathogenic yeasts in cloacae and choana from passeriformes and psittacines as well as in excretas from poultry cages. Twenty nine samples from fifteen birds showing some respiratory symptom, from Veterinary Hospital of UFPR (n = 6) and Vida Livre Veterinary Clinic (n = 23), were collected . The samples were spread in Sabouraud dextrose Agar and Staib medium and kept at 30°C and observed for 30 days. All colonies were analyzed with respect to its micro and macromorphology. Biochemical assays were conducted for samples presenting yeasts: carbon and nitrogen assimilation profile and germ tube for Candida albicans identification. Samples from birdsextracts (n = 8) were diluted in sterile saline solution with antibiotic and the supernatant was inoculated in spread on Niger seed agar. All samples were negative for Cryptococcus neoformans, however, C. albicans (two samples from choana), C. famata (one sample from choana) and C. tropicalis (choana) were found. Excretas from bird cages were negative to C. neoformans. Results suggested that birds harbor various pathogenic species of yeast, but not C. neoformans, and the result showed potential danger to carry diseases to humans.(AU)

Las levaduras pueden causar diversas enfermedades en el hombre y animales. En las aves, las levaduras están involucradas principalmente en lesiones en el tracto respiratorio y digestivo. Entre las levaduras patogénicas, Cryptococcus neoformans viene destacándose por la alta incidencia de cryptococcus humana en pacientes inmune deprimidos. Así, el objetivo de este estudio fueron identificar C. neoformans y otras levaduras patogénicas en la cloaca y coana de psittacidae y psittaciformes y en excretas colectadas de las jaulas de pajareras. Fueron obtenidas 29 muestras de quince (15) aves manifestando algún señal respiratorio, provenientes del Ambulatorio de Animales Salvajes de la UFPR (n=6) y de la Clínica Veterinaria Vida Livre (n= 23). Las muestras fueron sembradas en Ágar Sabouraud y Ágar Níger y mantenidas a 30 0 C hasta 30 días. Todas las colonias fueron analizadas cuanto a la macro y micromorfología. Para aquellas identificadas como levaduras, fueron realizadas las pruebas bioquímicas: asimilación de carbono y nitrógeno, y formación de tubo germinativo para identificación de Candida albicans. Las muestras de excreta de los pajareros (n=8) fueron mezcladas con solución fisiológica conteniendo antibiótico y el sobrenadante fue sembrado en Ágar Níger. Ninguna muestra de las aves presentó resultado positivo para C. neoformans, pero se identificaron muestras positivas para C. albicans (dos muestras de coana), C. famata (una muestra de coana) y C. tropicalis (una nuestra de coana). Las excretas fueron negativas para C. neoformans. Por lo tanto, a pesar de no haber sido aislado C. neoformans, otras levaduras patogénicas fueron aisladas, demostrando que esas aves son posibles transmisoras de enfermedades para los seres humanos.(AU)