Iron and zinc mycelial bioaccumulation in Agaricus subrufescens strains / Bioacumulação micelial de ferro e zinco em linhagens de Agaricus subrufescens

Agaricus subrufescens, a basidiomycete native to Brazil, is worldwide cultivated due to its medicinal properties. This fungus is capable of bioaccumulating metals in the mycelial biomass when cultured in the presence of them; however, this capacity is little explored for functional food production. This study aimed to evaluate the amount of iron or zinc bioaccumulated in the vegetative mycelium of sixteen strains of A. subrufescens. Mycelia were grown in malt extract agar added with 50 mg/L of iron or with 7.5 mg/L of zinc. The metal bioaccumulation in the mycelial biomass was strain-dependent. In general, metal can inhibit or stimulate the mycelial growth ranging from -81 to +78% for iron and from -86 to +100% for zinc. The highest bioaccumulated iron and zinc concentrations in the mycelial biomass was 2,595.65 mg/kg and 1,655.83 mg/kg, respectively and occurred in the U4-4 strain. The supplementation of mycelial biomass using iron or zinc is an alternative to develop food supplements, that can be used both in the human and animal diet and in the prevention of diseases.

Agaricus subrufescens, basidiomiceto nativo do Brasil, é cultivado mundialmente devido aos seus aspectos medicinais. Este fungo tem capacidade de bioacumulação de metais na biomassa micelial, no entanto, esta propriedade é pouco explorada para a produção de alimentos funcionais. O objetivo deste trabalho foi avaliar a quantidade de ferro ou zinco bioacumulada no micélio vegetativo de diversas linhagens de Agaricus subrufescens. Foram utilizadas 16 linhagens de A. subrufescens da coleção de culturas da Universidade Paranaense. O crescimento da biomassa micelial e a bioacumulação de ferro e zinco foram avaliados em micélio crescido em ágar extrato de malte adicionado de 50 mg L-1 de ferro ou 7,5 mg L-1 de zinco. A bioacumulação dos metais na biomassa micelial foi linhagem dependente. De forma geral, os metais podem inibir ou estimular o crescimento com variação entre de -81 a +78% para o ferro e de -86 a +100% para o zinco. A maior concentração de ferro na biomassa foi para o ferro de 2595,65 mg kg-1 e para o zinco de 1655,83 mg kg-1, ambos para a linhagem U4-4. O enriquecimento da biomassa micelial com ferro e/ou zinco é uma alternativa ao desenvolvimento de novos alimentos ou suplementos alimentares fonte de ferro e zinco de origem não-animal.

Iron and zinc mycelial bioaccumulation in Agaricus subrufescens strains / Bioacumulação micelial de ferro e zinco em linhagens de Agaricus subrufescens

Agaricus subrufescens, a basidiomycete native to Brazil, is worldwide cultivated due to its medicinal properties. This fungus is capable of bioaccumulating metals in the mycelial biomass when cultured in the presence of them; however, this capacity is little explored for functional food production. This study aimed to evaluate the amount of iron or zinc bioaccumulated in the vegetative mycelium of sixteen strains of A. subrufescens. Mycelia were grown in malt extract agar added with 50 mg/L of iron or with 7.5 mg/L of zinc. The metal bioaccumulation in the mycelial biomass was strain-dependent. In general, metal can inhibit or stimulate the mycelial growth ranging from -81 to +78% for iron and from -86 to +100% for zinc. The highest bioaccumulated iron and zinc concentrations in the mycelial biomass was 2,595.65 mg/kg and 1,655.83 mg/kg, respectively and occurred in the U4-4 strain. The supplementation of mycelial biomass using iron or zinc is an alternative to develop food supplements, that can be used both in the human and animal diet and in the prevention of diseases.(AU)

Agaricus subrufescens, basidiomiceto nativo do Brasil, é cultivado mundialmente devido aos seus aspectos medicinais. Este fungo tem capacidade de bioacumulação de metais na biomassa micelial, no entanto, esta propriedade é pouco explorada para a produção de alimentos funcionais. O objetivo deste trabalho foi avaliar a quantidade de ferro ou zinco bioacumulada no micélio vegetativo de diversas linhagens de Agaricus subrufescens. Foram utilizadas 16 linhagens de A. subrufescens da coleção de culturas da Universidade Paranaense. O crescimento da biomassa micelial e a bioacumulação de ferro e zinco foram avaliados em micélio crescido em ágar extrato de malte adicionado de 50 mg L-1 de ferro ou 7,5 mg L-1 de zinco. A bioacumulação dos metais na biomassa micelial foi linhagem dependente. De forma geral, os metais podem inibir ou estimular o crescimento com variação entre de -81 a +78% para o ferro e de -86 a +100% para o zinco. A maior concentração de ferro na biomassa foi para o ferro de 2595,65 mg kg-1 e para o zinco de 1655,83 mg kg-1, ambos para a linhagem U4-4. O enriquecimento da biomassa micelial com ferro e/ou zinco é uma alternativa ao desenvolvimento de novos alimentos ou suplementos alimentares fonte de ferro e zinco de origem não-animal.(AU)

Padronização de multiplex PCR para detecção de dermatófitos em pelos e crostas de cães e gatos / Standardization of a PCR multiplex for the detection of dermatophytes in dogs and cats fur and crusts

Objetivou-se padronizar uma reação do tipo multiplex PCR (mPCR) para detectar Microsporum canis, Microsporum gypseum e o complexo Trichophyton mentagrophytes em amostras de pelos e/ou crostas de cães e gatos. 250 amostras de pelos e/ou crostas de cães e gatos foram analisadas por meio de exame direto e cultura, o DNA das mesmas foi extraído para mPCR. Primers foram desenhados e como controle positivo da reação utilizou-se o DNA extraído de colônias de M. canis (URM 6273), M. gypseum (URM 6921) e T. mentagrophytes (URM 6211), provenientes da Coleção de Culturas (Micoteca URM), Departamento de Micologia, Centro de Ciências Biológicas da Universidade Federal de Pernambuco (CCB/UFPE). Como controles negativos de reação, utilizou-se água destilada esterilizada e DNA extraído de Alternaria sp. para verificar a especificidade dos primers. Do total de amostras analisadas, 15 (6%) foram identificadas, em cultura, como dermatófitos, e destas, 10 foram M. canis, três M. gypseum e dois T. mentagrophytes (complexo). Destas 15 amostras positivas, 11 (73,3%) foram detectadas por meio da mPCR. Além destas, seis outras, negativas em cultura, foram identificadas como M. gypseum. Verificou-se uma boa concordância entre os resultados da cultura e mPCR (Kappa: 0,66). O protocolo padronizado neste estudo pode ser utilizado como um método de triagem, por apresentar uma sensibilidade maior que a da cultura, usado paralelamente aos exames de rotina, permitindo um diagnóstico em menor tempo.(AU)

The aim of this study was to standardize a multiplex PCR (mPCR) reaction to detect Microsporum canis, Microsporum gypseum and the Trichophyton mentagrophytes complex in dog and cat fur and/or crusts. 250 fur and/or crusts samples from dogs and cats were analyzed by direct examination and culture, DNA from them was extracted for mPCR. Primers were designed and the DNA extracted from colonies of M. canis (URM 6273), M. gypseum (URM 6921) and T. mentagrophytes (URM 6211) from the Collection of Cultures - URM Micoteca - Department of Mycology, Biological Sciences Center of the Federal University of Pernambuco (CCB / UFPE). As negative controls, sterile distilled water and DNA extracted from Alternaria sp., were used to verify the specificity of the primers. Of the total samples analyzed, 15 (6%) were identified in culture as dermatophytes, and of these, 10 were M. canis, three M. gypseum and two T. mentagrophytes (complex). Of these 15 positive samples, 11 (73.3%) were detected by mPCR. Besides these, six others, negative in culture, were identified as M. gypseum. There was good agreement between culture results and mPCR (Kappa: 0.66). The protocol standardized in this study can be used as a screening method, because it has a sensitivity greater than that of the culture, used in parallel to the routine exams, allowing a diagnosis in a shorter time.(AU)

Padronização de multiplex PCR para detecção de dermatófitos em pelos e crostas de cães e gatos / Standardization of a PCR multiplex for the detection of dermatophytes in dogs and cats fur and crusts

Objetivou-se padronizar uma reação do tipo multiplex PCR (mPCR) para detectar Microsporum canis, Microsporum gypseum e o complexo Trichophyton mentagrophytes em amostras de pelos e/ou crostas de cães e gatos. 250 amostras de pelos e/ou crostas de cães e gatos foram analisadas por meio de exame direto e cultura, o DNA das mesmas foi extraído para mPCR. Primers foram desenhados e como controle positivo da reação utilizou-se o DNA extraído de colônias de M. canis (URM 6273), M. gypseum (URM 6921) e T. mentagrophytes (URM 6211), provenientes da Coleção de Culturas (Micoteca URM), Departamento de Micologia, Centro de Ciências Biológicas da Universidade Federal de Pernambuco (CCB/UFPE). Como controles negativos de reação, utilizou-se água destilada esterilizada e DNA extraído de Alternaria sp. para verificar a especificidade dos primers. Do total de amostras analisadas, 15 (6%) foram identificadas, em cultura, como dermatófitos, e destas, 10 foram M. canis, três M. gypseum e dois T. mentagrophytes (complexo). Destas 15 amostras positivas, 11 (73,3%) foram detectadas por meio da mPCR. Além destas, seis outras, negativas em cultura, foram identificadas como M. gypseum. Verificou-se uma boa concordância entre os resultados da cultura e mPCR (Kappa: 0,66). O protocolo padronizado neste estudo pode ser utilizado como um método de triagem, por apresentar uma sensibilidade maior que a da cultura, usado paralelamente aos exames de rotina, permitindo um diagnóstico em menor tempo.(AU)

The aim of this study was to standardize a multiplex PCR (mPCR) reaction to detect Microsporum canis, Microsporum gypseum and the Trichophyton mentagrophytes complex in dog and cat fur and/or crusts. 250 fur and/or crusts samples from dogs and cats were analyzed by direct examination and culture, DNA from them was extracted for mPCR. Primers were designed and the DNA extracted from colonies of M. canis (URM 6273), M. gypseum (URM 6921) and T. mentagrophytes (URM 6211) from the Collection of Cultures - URM Micoteca - Department of Mycology, Biological Sciences Center of the Federal University of Pernambuco (CCB / UFPE). As negative controls, sterile distilled water and DNA extracted from Alternaria sp., were used to verify the specificity of the primers. Of the total samples analyzed, 15 (6%) were identified in culture as dermatophytes, and of these, 10 were M. canis, three M. gypseum and two T. mentagrophytes (complex). Of these 15 positive samples, 11 (73.3%) were detected by mPCR. Besides these, six others, negative in culture, were identified as M. gypseum. There was good agreement between culture results and mPCR (Kappa: 0.66). The protocol standardized in this study can be used as a screening method, because it has a sensitivity greater than that of the culture, used in parallel to the routine exams, allowing a diagnosis in a shorter time.(AU)

Diferenciação de bactérias do gênero Pseudomonas patogênicas ao cafeeiro por técnicas serológicas / Differentiation of bacteria of the genus Pseudomonas pathogenic to coffee by serological techniques

Há várias bactérias que causam problemas para o cafeeiro, incluindo Pseudomonas cichorii, P. syringae pv. garcae, P. syringae pv. tabaci, Burkholderia andropogonis e Xylella fastidiosa, todas elas já descritas no Brasil. Tentativas de diferenciar essas bactérias por testes serológicos de dupla difusão em ágar (dda), com antissoros produzidos contra células íntegras de P. s. pv. garcae, mostraram reações cruzadas, principalmente entre P. s. pv. garcae e P. s. pv. tabaci. Dessa forma, foram produzidos antissoros contra P. s. pv. garcae (linhagem patotipo IBSBF-248 - Coleção de Culturas de Fitobactérias do Instituto Biológico - IBSBF), obtidos por meio de imunizações de coelhos com antígenos de proteínas do complexo proteico da membrana (CPM). Esses antissoros foram testados por dupla difusão em agarose (dda) contra diversas formas de antígenos extraídos de P. cichorii, P. s. pv. garcae e P. s. pv. tabaci [células autoclavadas, células tratadas com formol, exopolissacarídeos (EPS), glicoproteínas (GP) da cápsula bacteriana, proteínas de membrana e suspensão bacteriana (SB) em NaCl 0,85%]. Os resultados mostraram que, dependendo do antígeno e do meio suporte da dupla difusão (com ou sem MgCl2 e/ou azul de tripano), os antissoros reagem somente com P. s. pv. garcae. Desse modo, esses antígenos podem ser usados para a rápida diagnose da mancha aureolada do cafeeiro nos testes de dda.

Some bacterial diseases have been described causing problems in coffee, whose causal agents are Pseudomonas cichorii, P. syringae pv. garcae, P. s. pv. tabaci and Burkholderia andropogonis, all of them also occurring in Brazil. Attempts to differentiate these bacteria by double diffusion agar (dda) technique with antisera produced against whole cells of P. s. pv. garcae showed cross-reactions, especially among P. s. pv. garcae and P. s. pv. tabaci. Thus, antisera were produced against P. s. pv. garcae (pathotype strain IBSBF-248 - Phytobacteria Culture Collection of Instituto Biológico - IBSBF), using rabbit immunizations with antigens of the protein complex of membranes. These antisera were tested against different kind of antigens (autoclaved cells, cells treated with formaldehyde, capsule polysaccharides, glycoproteins, bacterial membrane proteins and bacterial suspension in 0.85% NaCl) extracted from P. cichorii, P. s. pv. garcae and P. s. pv. tabaci. The results showed that depending on the kind of antigen and the medium used in the double diffusion test (with or without MgCl2 and/or trypan blue), the antiserum reacted only with P. s. pv. garcae. Thus, these antigens may be used as an auxiliary tool in the rapid diagnosis of bacterial halo blight of coffee in the double diffusion test.

Diferenciação de bactérias do gênero Pseudomonas patogênicas ao cafeeiro por técnicas serológicas / Differentiation of bacteria of the genus Pseudomonas pathogenic to coffee by serological techniques

Há várias bactérias que causam problemas para o cafeeiro, incluindo Pseudomonas cichorii, P. syringae pv. garcae, P. syringae pv. tabaci, Burkholderia andropogonis e Xylella fastidiosa, todas elas já descritas no Brasil. Tentativas de diferenciar essas bactérias por testes serológicos de dupla difusão em ágar (dda), com antissoros produzidos contra células íntegras de P. s. pv. garcae, mostraram reações cruzadas, principalmente entre P. s. pv. garcae e P. s. pv. tabaci. Dessa forma, foram produzidos antissoros contra P. s. pv. garcae (linhagem patotipo IBSBF-248 - Coleção de Culturas de Fitobactérias do Instituto Biológico - IBSBF), obtidos por meio de imunizações de coelhos com antígenos de proteínas do complexo proteico da membrana (CPM). Esses antissoros foram testados por dupla difusão em agarose (dda) contra diversas formas de antígenos extraídos de P. cichorii, P. s. pv. garcae e P. s. pv. tabaci [células autoclavadas, células tratadas com formol, exopolissacarídeos (EPS), glicoproteínas (GP) da cápsula bacteriana, proteínas de membrana e suspensão bacteriana (SB) em NaCl 0,85%]. Os resultados mostraram que, dependendo do antígeno e do meio suporte da dupla difusão (com ou sem MgCl2 e/ou azul de tripano), os antissoros reagem somente com P. s. pv. garcae. Desse modo, esses antígenos podem ser usados para a rápida diagnose da mancha aureolada do cafeeiro nos testes de dda.(AU)

Some bacterial diseases have been described causing problems in coffee, whose causal agents are Pseudomonas cichorii, P. syringae pv. garcae, P. s. pv. tabaci and Burkholderia andropogonis, all of them also occurring in Brazil. Attempts to differentiate these bacteria by double diffusion agar (dda) technique with antisera produced against whole cells of P. s. pv. garcae showed cross-reactions, especially among P. s. pv. garcae and P. s. pv. tabaci. Thus, antisera were produced against P. s. pv. garcae (pathotype strain IBSBF-248 - Phytobacteria Culture Collection of Instituto Biológico - IBSBF), using rabbit immunizations with antigens of the protein complex of membranes. These antisera were tested against different kind of antigens (autoclaved cells, cells treated with formaldehyde, capsule polysaccharides, glycoproteins, bacterial membrane proteins and bacterial suspension in 0.85% NaCl) extracted from P. cichorii, P. s. pv. garcae and P. s. pv. tabaci. The results showed that depending on the kind of antigen and the medium used in the double diffusion test (with or without MgCl2 and/or trypan blue), the antiserum reacted only with P. s. pv. garcae. Thus, these antigens may be used as an auxiliary tool in the rapid diagnosis of bacterial halo blight of coffee in the double diffusion test.(AU)

Diferenciação de bactérias do gênero Pseudomonas patogênicas ao cafeeiro por técnicas serológicas / Differentiation of bacteria of the genus Pseudomonas pathogenic to coffee by serological techniques

Há várias bactérias que causam problemas para o cafeeiro, incluindo Pseudomonas cichorii, P. syringae pv. garcae, P. syringae pv. tabaci, Burkholderia andropogonis e Xylella fastidiosa, todas elas já descritas no Brasil. Tentativas de diferenciar essas bactérias por testes serológicos de dupla difusão em ágar (dda), com antissoros produzidos contra células íntegras de P. s. pv. garcae, mostraram reações cruzadas, principalmente entre P. s. pv. garcae e P. s. pv. tabaci. Dessa forma, foram produzidos antissoros contra P. s. pv. garcae (linhagem patotipo IBSBF-248 - Coleção de Culturas de Fitobactérias do Instituto Biológico - IBSBF), obtidos por meio de imunizações de coelhos com antígenos de proteínas do complexo proteico da membrana (CPM). Esses antissoros foram testados por dupla difusão em agarose (dda) contra diversas formas de antígenos extraídos de P. cichorii, P. s. pv. garcae e P. s. pv. tabaci [células autoclavadas, células tratadas com formol, exopolissacarídeos (EPS), glicoproteínas (GP) da cápsula bacteriana, proteínas de membrana e suspensão bacteriana (SB) em NaCl 0,85%]. Os resultados mostraram que, dependendo do antígeno e do meio suporte da dupla difusão (com ou sem MgCl2 e/ou azul de tripano), os antissoros reagem somente com P. s. pv. garcae. Desse modo, esses antígenos podem ser usados para a rápida diagnose da mancha aureolada do cafeeiro nos testes de dda.(AU)

Some bacterial diseases have been described causing problems in coffee, whose causal agents are Pseudomonas cichorii, P. syringae pv. garcae, P. s. pv. tabaci and Burkholderia andropogonis, all of them also occurring in Brazil. Attempts to differentiate these bacteria by double diffusion agar (dda) technique with antisera produced against whole cells of P. s. pv. garcae showed cross-reactions, especially among P. s. pv. garcae and P. s. pv. tabaci. Thus, antisera were produced against P. s. pv. garcae (pathotype strain IBSBF-248 - Phytobacteria Culture Collection of Instituto Biológico - IBSBF), using rabbit immunizations with antigens of the protein complex of membranes. These antisera were tested against different kind of antigens (autoclaved cells, cells treated with formaldehyde, capsule polysaccharides, glycoproteins, bacterial membrane proteins and bacterial suspension in 0.85% NaCl) extracted from P. cichorii, P. s. pv. garcae and P. s. pv. tabaci. The results showed that depending on the kind of antigen and the medium used in the double diffusion test (with or without MgCl2 and/or trypan blue), the antiserum reacted only with P. s. pv. garcae. Thus, these antigens may be used as an auxiliary tool in the rapid diagnosis of bacterial halo blight of coffee in the double diffusion test.(AU)

Xanthomonas fuscans subsp. fuscans causing wilt symptoms in bean plants (Phaseolus vulgaris) in Brazil

Common and fuscous blights of bean are diseases widely distributed in the world. The most commonly observed symptoms are spots on leaves, stems, pods and seeds. In December 2009, bean plants cv. Uirapuru showing symptoms of wilt similar to those induced by Curtobacterium flaccumfaciens pv. flaccumfaciens were observed in a commercial crop located in the county of Itararé, State of São Paulo, Brazil. The plants were at the last cycle stage with mature pods and these symptoms were noted in the majority of the growing area. Optical microscopic observations of discolored vascular tissue from diseased stems revealed the presence of bacterial masses oozed from infected tissue, indicating that the disease was caused by bacterial pathogen. Isolations on nutrient agar showed circular, convex, yellow colonies with smooth edges. The causal bacterium was Gramnegative and produced a dark brown pigment in culture medium. Biochemical, cultural and physiological tests confirmed its identity as Xanthomonas fuscans subsp. fuscans(syn. Xanthomonas campestris pv. phaseolivar. fuscans"). The pathogenicity of the isolates was confirmed by artificial inoculations. Systemic infection has been reported in the literature but these kinds of symptoms are not currently observed in Brazilian fields. Bacterial strains were deposited on the Phytobacteria Culture Collection of Instituto Biológico (IBSBF - www.biologico.sp.gov.br/bacterias/php) under accession numbers 2813 and 3028.

O crestamento bacteriano comum do feijoeiro é uma doença amplamente distribuída no mundo e os sintomas comumente observados sáo manchas nas folhas, hastes, vagens e sementes. Em dezembro de 2009, plantas de feijoeiro cv. Uirapuru com sintomas de murcha similares aos produzidos por Curtobacterium flaccumfaciens pv. flaccumfaciens foram observadas em campos comerciais localizados no município de Itararé, estado de São Paulo, Brasil. As plantas encontravam-se no final do ciclo, com as vagens já formadas. Os sintomas foram notados em quase a totalidade da área cultivada. Observações ao microscópio óptico de fragmentos de tecido do sistema vascular das hastes de plantas doentes evidenciaram intenso fluxo bacteriano, confirmando tratar-se de doença bacteriana. Isolamentos realizados em meio nutriente ágar produziram colônias de coloração amarelada, brilhantes, convexas, lisas. A bactéria agente causal era Gram-negativa e produtora de pigmento marrom escuro em meio de cultura. Testes bioquímicos, culturais e fisiológicos confirmaram sua identidade como Xanthomonas fuscans subsp. fuscans (sin. Xanthomonas campestris pv. phaseoli var. fuscans"). A patogenicidade dos isolados foi confirmada por inoculações artificiais em mudas de feijão cv. Carioca e os reisolamentos efetuados resultaram em colônias semelhantes às originais. Embora descrita na literatura, a infecção sistêmica não é usualmente observada nos plantios de feijoeiro em nosso país. Linhagens bacterianas encontram-se depositadas na Coleção de Culturas do Instituto Biológico (IBSBF) sob os números 2813 e 3028.

Xanthomonas fuscans subsp. fuscans causing wilt symptoms in bean plants (Phaseolus vulgaris) in Brazil

Common and fuscous blights of bean are diseases widely distributed in the world. The most commonly observed symptoms are spots on leaves, stems, pods and seeds. In December 2009, bean plants cv. Uirapuru showing symptoms of wilt similar to those induced by Curtobacterium flaccumfaciens pv. flaccumfaciens were observed in a commercial crop located in the county of Itararé, State of São Paulo, Brazil. The plants were at the last cycle stage with mature pods and these symptoms were noted in the majority of the growing area. Optical microscopic observations of discolored vascular tissue from diseased stems revealed the presence of bacterial masses oozed from infected tissue, indicating that the disease was caused by bacterial pathogen. Isolations on nutrient agar showed circular, convex, yellow colonies with smooth edges. The causal bacterium was Gramnegative and produced a dark brown pigment in culture medium. Biochemical, cultural and physiological tests confirmed its identity as Xanthomonas fuscans subsp. fuscans(syn. Xanthomonas campestris pv. phaseolivar. fuscans"). The pathogenicity of the isolates was confirmed by artificial inoculations. Systemic infection has been reported in the literature but these kinds of symptoms are not currently observed in Brazilian fields. Bacterial strains were deposited on the Phytobacteria Culture Collection of Instituto Biológico (IBSBF - www.biologico.sp.gov.br/bacterias/php) under accession numbers 2813 and 3028.

O crestamento bacteriano comum do feijoeiro é uma doença amplamente distribuída no mundo e os sintomas comumente observados sáo manchas nas folhas, hastes, vagens e sementes. Em dezembro de 2009, plantas de feijoeiro cv. Uirapuru com sintomas de murcha similares aos produzidos por Curtobacterium flaccumfaciens pv. flaccumfaciens foram observadas em campos comerciais localizados no município de Itararé, estado de São Paulo, Brasil. As plantas encontravam-se no final do ciclo, com as vagens já formadas. Os sintomas foram notados em quase a totalidade da área cultivada. Observações ao microscópio óptico de fragmentos de tecido do sistema vascular das hastes de plantas doentes evidenciaram intenso fluxo bacteriano, confirmando tratar-se de doença bacteriana. Isolamentos realizados em meio nutriente ágar produziram colônias de coloração amarelada, brilhantes, convexas, lisas. A bactéria agente causal era Gram-negativa e produtora de pigmento marrom escuro em meio de cultura. Testes bioquímicos, culturais e fisiológicos confirmaram sua identidade como Xanthomonas fuscans subsp. fuscans (sin. Xanthomonas campestris pv. phaseoli var. fuscans"). A patogenicidade dos isolados foi confirmada por inoculações artificiais em mudas de feijão cv. Carioca e os reisolamentos efetuados resultaram em colônias semelhantes às originais. Embora descrita na literatura, a infecção sistêmica não é usualmente observada nos plantios de feijoeiro em nosso país. Linhagens bacterianas encontram-se depositadas na Coleção de Culturas do Instituto Biológico (IBSBF) sob os números 2813 e 3028.

RELAÇÃO FILOGENÉTICA, VIRULÊNCIA E RESISTÊNCIA AOS ANTIMICROBIANOS DE Salmonella spp ISOLADAS DE ALIMENTOS E PACIENTES CLÍNICOS: INTERFACE ENTRE SEGURANÇA ALIMENTAR E SAÚDE PÚBLICA

A salmonelose é uma das doenças transmitidas por alimentos mais prevalentes no mundo, com impacto na economia e saúde pública. Dentre os vários sorovares, destacamos S. Typhimirum por ser um dos mais envolvidos em surtos de origem alimentar e S. Heidelberg por ser um sorovar emergente associado a surtos humanos. A tese foi dividida em três capítulos. O primeiro, considerações gerais, relata os temas gerais e considerados importantes para contextualização do leitor sobre o que foi abordado nos capítulos seguintes. As cepas analisadas nos capítulos II e III foram isoladas de alimentos e pacientes humanos em diversos estados do Brasil entre 2011 e 2017, provenientes da coleção de culturas de Enteropatógenos Bacterianos do Instituto Oswaldo Cruz (IOC/FIOCRUZ-RJ), que também forneceu as informações sobre a sua origem. No segundo capítulo foram avaliadas 43 cepas de S. Typhimurium quanto a presença de genes de virulência (sefA, invA, agfA, avrA, lpfA, sivH, hilA, spvC, sopE) e genes associados a resistência aos antimicrobianos (qnrS e qnrA fluoroquinolonas; blaTEM e blaSHV - -lactâmicos) pela técnica de PCR. A concentração inibitória mínima (CIM) determinou a resistência fenotípica às classes de antimicrobianos consideradas importantes: meropenem: lactâmicos/ carbapenêmicos; colistina: polimixinas; ciprofloxacina: fluoroquinolonas; ceftriaxona: -lactâmicos/cefalosporinas de 3ª geração. Os resultados da PCR e CIM foram utilizados para construção de perfis de virulência e resistência. A disseminação e associação dos perfis de resistência e virulência foram discutidas após a genotipagem pela técnica do Pulsed Field Gel Electrophoresis (PFGE). No terceiro capítulo foram analisadas 36 cepas de S. Heidelberg, com objetivos e metodologia idênticas às do capítulo II, adicionado do sequenciamento do genoma completo de duas cepas filogeneticamente distintas realizado pelo Illumina HiSeq 2500, com o intuito de identificar o potencial virulento, de resistência, dificuldades de tratamento e risco a saúde pública.

Salmonellosis is one of the most prevalent foodborne diseases in the world, with an impact on the economy and public health. Among the various serovars, we highlight S. Typhimirum for being one of the most involved in food-borne outbreaks and S. Heidelberg for being an emerging serovar associated with human outbreaks. The thesis was divided into three chapters. The first, general considerations, reports the general themes considered important for the reader's contextualization of what was discussed in the following chapters. The strains analyzed in chapters II and III were isolated from food and human patients in several states of Brazil, between 2011 and 2017, from the collection of Bacterial Enteropathogens cultures of the Oswaldo Cruz Institute (IOC / FIOCRUZ-RJ), which also provided the information about its origin. In the second chapter, 43 strains of S. Typhimurium were evaluated for the presence of virulence genes (sefA, invA, agfA, avrA, lpfA, sivH, hilA, spvC, sopE) and genes associated with antimicrobial resistance (qnrS and qnrA - fluoroquinolones; blaTEM and blaSHV - -lactams) by the PCR technique. The minimum inhibitory concentration (MIC) determined the phenotypic resistance to the classes of antimicrobials considered important: meropenem: lactam / carbapenem; colistin: polymyxins; ciprofloxacin: fluoroquinolones; ceftriaxone: -lactams / 3rd generation cephalosporins. The PCR and CIM results were used to build virulence and resistance profiles. The dissemination and association of resistance and virulence profiles were discussed after genotyping using the Pulsed Field Gel Electrophoresis (PFGE) technique. In the third chapter, 36 strains of S. Heidelberg were analyzed, with objectives and methodology identical to those of chapter II, added by the sequencing of the complete genome of two phylogenetically distinct strains carried out by Illumina HiSeq 2500, in order to identify the virulent, resistance potential, treatment difficulties and public health risk.

Xanthomonas fuscans subsp. fuscans causing wilt symptoms in bean plants (Phaseolus vulgaris) in Brazil / Xanthomonas fuscans subsp. fuscans causando sintomas de murcha em feijoeiro (Phaseolus vulgaris) no Brasil

Common and fuscous blights of bean are diseases widely distributed in the world. The most commonly observed symptoms are spots on leaves, stems, pods and seeds. In December 2009, bean plants cv. Uirapuru showing symptoms of wilt similar to those induced by Curtobacterium flaccumfaciens pv. flaccumfaciens were observed in a commercial crop located in the county of Itararé, State of São Paulo, Brazil. The plants were at the last cycle stage with mature pods and these symptoms were noted in the majority of the growing area. Optical microscopic observations of discolored vascular tissue from diseased stems revealed the presence of bacterial masses oozed from infected tissue, indicating that the disease was caused by bacterial pathogen. Isolations on nutrient agar showed circular, convex, yellow colonies with smooth edges. The causal bacterium was Gramnegative and produced a dark brown pigment in culture medium. Biochemical, cultural and physiological tests confirmed its identity as Xanthomonas fuscans subsp. fuscans(syn. Xanthomonas campestris pv. phaseoli"var. fuscans"). The pathogenicity of the isolates was confirmed by artificial inoculations. Systemic infection has been reported in the literature but these kinds of symptoms are not currently observed in Brazilian fields. Bacterial strains were deposited on the Phytobacteria Culture Collection of Instituto Biológico (IBSBF - www.biologico.sp.gov.br/bacterias/php) under accession numbers 2813 and 3028.(AU)

O crestamento bacteriano comum do feijoeiro é uma doença amplamente distribuída no mundo e os sintomas comumente observados são manchas nas folhas, hastes, vagens e sementes. Em dezembro de 2009, plantas de feijoeiro cv. Uirapuru com sintomas de murcha similares aos produzidos por Curtobacterium flaccumfaciens pv. flaccumfaciens foram observadas em campos comerciais localizados no município de Itararé, estado de São Paulo, Brasil. As plantas encontravam-se no final do ciclo, com as vagens já formadas. Os sintomas foram notados em quase a totalidade da área cultivada. Observações ao microscópio óptico de fragmentos de tecido do sistema vascular das hastes de plantas doentes evidenciaram intenso fluxo bacteriano, confirmando tratar-se de doença bacteriana. Isolamentos realizados em meio nutriente ágar produziram colônias de coloração amarelada, brilhantes, convexas, lisas. A bactéria agente causal era Gram-negativa e produtora de pigmento marrom escuro em meio de cultura. Testes bioquímicos, culturais e fisiológicos confirmaram sua identidade como Xanthomonas fuscans subsp. fuscans (sin. Xanthomonas campestris pv. phaseoli "var. fuscans"). A patogenicidade dos isolados foi confirmada por inoculações artificiais em mudas de feijão cv. Carioca e os reisolamentos efetuados resultaram em colônias semelhantes às originais. Embora descrita na literatura, a infecção sistêmica não é usualmente observada nos plantios de feijoeiro em nosso país. Linhagens bacterianas encontram-se depositadas na Coleção de Culturas do Instituto Biológico (IBSBF) sob os números 2813 e 3028.(AU)

Xanthomonas fuscans subsp. fuscans causing wilt symptoms in bean plants (Phaseolus vulgaris) in Brazil / Xanthomonas fuscans subsp. fuscans causando sintomas de murcha em feijoeiro (Phaseolus vulgaris) no Brasil

Common and fuscous blights of bean are diseases widely distributed in the world. The most commonly observed symptoms are spots on leaves, stems, pods and seeds. In December 2009, bean plants cv. Uirapuru showing symptoms of wilt similar to those induced by Curtobacterium flaccumfaciens pv. flaccumfaciens were observed in a commercial crop located in the county of Itarar;, State of S;o Paulo, Brazil. The plants were at the last cycle stage with mature pods and these symptoms were noted in the majority of the growing area. Optical microscopic observations of discolored vascular tissue from diseased stems revealed the presence of bacterial masses oozed from infected tissue, indicating that the disease was caused by bacterial pathogen. Isolations on nutrient agar showed circular, convex, yellow colonies with smooth edges. The causal bacterium was Gramnegative and produced a dark brown pigment in culture medium. Biochemical, cultural and physiological tests confirmed its identity as Xanthomonas fuscans subsp. fuscans (syn. Xanthomonas campestris pv. phaseoli 0;var. fuscans"). The pathogenicity of the isolates was confirmed by artificial inoculations. Systemic infection has been reported in the literature but these kinds of symptoms are not currently observed in Brazilian fields. Bacterial strains were deposited on the Phytobacteria Culture Collection of Instituto Biológico (IBSBF - www.biologico.sp.gov.br/bacterias/php) under accession numbers 2813 and 3028.

O crestamento bacteriano comum do feijoeiro é uma doença amplamente distribuída no mundo e os sintomas comumente observados sáo manchas nas folhas, hastes, vagens e sementes. Em dezembro de 2009, plantas de feijoeiro cv. Uirapuru com sintomas de murcha similares aos produzidos por Curtobacterium flaccumfaciens pv.flaccumfaciens foram observadas em campos comerciais localizados no município de Itararé, estado de São Paulo, Brasil. As plantas encontravam-se no final do ciclo, com as vagens já formadas. Os sintomas foram notados em quase a totalidade da área cultivada. Observações ao microscópio óptico de fragmentos de tecido do sistema vascular das hastes de plantas doentes evidenciaram intenso fluxo bacteriano, confirmando tratar-se de doença bacteriana. Isolamentos realizados em meio nutriente ágar produziram colônias de coloração amarelada, brilhantes, convexas, lisas. A bactéria agente causal era Gram-negativa e produtora de pigmento marrom escuro em meio de cultura. Testes bioquímicos, culturais e fisiológicos confirmaram sua identidade como Xanthomonas fuscans subsp.fuscans (sin. Xanthomonas campestris pv. phaseoli var. fuscans"). A patogenicidade dos isolados foi confirmada por inoculações artificiais em mudas de feijão cv. Carioca e os reisolamentos efetuados resultaram em colônias semelhantes às originais. Embora descrita na literatura, a infecção sistêmica não é usualmente observada nos plantios de feijoeiro em nosso país. Linhagens bacterianas encontram-se depositadas na Coleção de Culturas do Instituto Biológico (IBSBF) sob os números 2813 e 3028.

Xanthomonas fuscans subsp. fuscans causing wilt symptoms in bean plants (Phaseolus vulgaris) in Brazil / Xanthomonas fuscans subsp. fuscans causando sintomas de murcha em feijoeiro (Phaseolus vulgaris) no Brasil

Common and fuscous blights of bean are diseases widely distributed in the world. The most commonly observed symptoms are spots on leaves, stems, pods and seeds. In December 2009, bean plants cv. Uirapuru showing symptoms of wilt similar to those induced by Curtobacterium flaccumfaciens pv. flaccumfaciens were observed in a commercial crop located in the county of Itarar;, State of S;o Paulo, Brazil. The plants were at the last cycle stage with mature pods and these symptoms were noted in the majority of the growing area. Optical microscopic observations of discolored vascular tissue from diseased stems revealed the presence of bacterial masses oozed from infected tissue, indicating that the disease was caused by bacterial pathogen. Isolations on nutrient agar showed circular, convex, yellow colonies with smooth edges. The causal bacterium was Gramnegative and produced a dark brown pigment in culture medium. Biochemical, cultural and physiological tests confirmed its identity as Xanthomonas fuscans subsp. fuscans (syn. Xanthomonas campestris pv. phaseoli 0;var. fuscans"). The pathogenicity of the isolates was confirmed by artificial inoculations. Systemic infection has been reported in the literature but these kinds of symptoms are not currently observed in Brazilian fields. Bacterial strains were deposited on the Phytobacteria Culture Collection of Instituto Biológico (IBSBF - www.biologico.sp.gov.br/bacterias/php) under accession numbers 2813 and 3028.(AU)

O crestamento bacteriano comum do feijoeiro é uma doença amplamente distribuída no mundo e os sintomas comumente observados sáo manchas nas folhas, hastes, vagens e sementes. Em dezembro de 2009, plantas de feijoeiro cv. Uirapuru com sintomas de murcha similares aos produzidos por Curtobacterium flaccumfaciens pv.flaccumfaciens foram observadas em campos comerciais localizados no município de Itararé, estado de São Paulo, Brasil. As plantas encontravam-se no final do ciclo, com as vagens já formadas. Os sintomas foram notados em quase a totalidade da área cultivada. Observações ao microscópio óptico de fragmentos de tecido do sistema vascular das hastes de plantas doentes evidenciaram intenso fluxo bacteriano, confirmando tratar-se de doença bacteriana. Isolamentos realizados em meio nutriente ágar produziram colônias de coloração amarelada, brilhantes, convexas, lisas. A bactéria agente causal era Gram-negativa e produtora de pigmento marrom escuro em meio de cultura. Testes bioquímicos, culturais e fisiológicos confirmaram sua identidade como Xanthomonas fuscans subsp.fuscans (sin. Xanthomonas campestris pv. phaseoli var. fuscans"). A patogenicidade dos isolados foi confirmada por inoculações artificiais em mudas de feijão cv. Carioca e os reisolamentos efetuados resultaram em colônias semelhantes às originais. Embora descrita na literatura, a infecção sistêmica não é usualmente observada nos plantios de feijoeiro em nosso país. Linhagens bacterianas encontram-se depositadas na Coleção de Culturas do Instituto Biológico (IBSBF) sob os números 2813 e 3028.(AU)

ANÁLISE GENÉTICA E DESENVOLVIMENTO DE UM MÉTODO DE DIAGNÓSTICO, BASEADO EM PCR, PARA DETECÇÃO DE Cyniclomyces guttulatus EM FEZES DE CÃES

O significado das infecções fúngicas dos animais tem sido amplamente ignorado por muitos veterinários. No entanto, problemas recentes de doenças fúngicas de destaque, por exemplo, a esporotricose de felinos e humanos no Brasil e a criptococose zoonótica em todo o mundo, demonstraram a necessidade de reverter essa tendência negativa há muito estabelecida. A levedura ascomicética Cyniclomyces guttulatus é a única espécie atualmente incluída no gênero Cyniclomyces. Tradicionalmente, era vista como um componente comensal da microbiota intestinal de coelhos e outros herbívoros. O aumento do interesse em C. guttulatus se desenvolveu com base em relatos da Europa, Ásia, América do Norte e Brasil, sugerindo que C. guttulatus representava um patógeno emergente e / ou oportunista de cães, onde sua presença em números elevados, estava ligada a sinais clínicos, incluindo diarreia, gastroenterite e colangiohepatite. No entanto, pesquisas recentes conduzidas na Holanda e nos Estados Unidos argumentaram que a presença dessa levedura em cães que sofrem de doença gastrintestinal é provavelmente mais circunstancial e não tem relevância clínica. O diagnóstico de C. guttulatus em fezes e / ou em material clínico é realizado principalmente usando análises microscópicas e microbiológicas baseadas em cultura. Em uma minoria de estudos, a identificação definitiva das colônias da levedura foi feita usando amplificação por reação em cadeia da polimerase (PCR) e sequenciamento de um fragmento do gene 26S rDNA (codifica a subunidade maior do RNA ribossomal). O presente estudo relata o desenvolvimento de métodos moleculares inovadores para detecção e caracterização de culturas de leveduras e para a detecção e caracterização independente de cultura de C. guttulatus diretamente de fezes de cães. A disponibilidade dos ensaios servirá para reduzir as dúvidas sobre a validade dos diagnósticos morfológicos e pode reduzir o tempo para confirmação do diagnóstico molecular em até 48 horas, ao invés do prazo atual de 7 a 10 dias. A genotipagem de uma coleção de isolados de porquinhos-da-índia (n = 1), coelhos (n = 20) e cães (n = 8) utilizou amplificação por PCR e sequenciamento de fragmentos das sequências que codificam as subunidades maior (26S) e menor (18S) do DNA ribossomal, as subunidades RPB1 e RPB2 do gene que codifica a RNA polimerase II, o citocromo oxidase II e as regiões espaçadoras internas transcritas (ITS). Alinhamentos de sequências e avaliações da similaridade de nucleotídeos para a maioria das sequências serviram para apoiar dados de estudos anteriores que sugeriram a possível existência de duas espécies de Cyniclomyces. Curiosamente, o uso da região ITS indicou que pode haver pelo menos três espécies de Cyniclomyces. Conclui-se que a identificação das novas espécies de Cyniclomyces questiona grande parte dos dados produzidos até o momento em relação à patogenicidade desse organismo. Prevê-se que os resultados deste trabalho sirvam para estimular uma expansão do estudo do gênero Cyniclomyces e, como tal, contribuam significativamente para a compreensão do seu papel na saúde dos cães

Many veterinary scientists have largely overlooked the significance of fungal infections in animals. However, recent high-profile fungal disease problems e.g. sporotrichosis of felines and humans in Brazil and zoonotic cryptococcosis worldwide, have demonstrated the need to revert this long-established negative trend. The ascomycete yeast Cyniclomyces guttulatusis is the only species currently included in the genus Cyniclomyces. Traditionally, it was viewed as a commensal component of the gut microbiota of rabbits and other herbivores. Increased interest in C. guttulatus developed based on reports from Europe, Asia, North America and Brazil suggesting that C. guttulatus represented an emerging and/or opportunistic pathogen in dogs, where its presence, in large numbers, was linked to clinical signs including diarrhea, gastroenteritis and cholangiohepatitis. However, recent investigations conducted in The Netherlands and the United States have argued that the presence of this yeast in dogs suffering gastrointestinal disease is most likely circumstantial and is not of clinical relevance. Diagnosis of C. guttulatus in feces and/or in clinical material is conducted primarily using microscopic and microbiological, culture-based analyses. In a minority of studies, definitive identification of yeast colonies was made using polymerase chain reaction (PCR) amplification and sequencing of a fragment of the universal yeast gene 26S (encodes for the large subunit of ribosomal RNA). The current study reports the development of innovative, molecular methods for the detection and characterization of yeast cultures and for the culture-independent detection and characterization of C. guttulatus directly from canine feces. The availability of the assays will serve to reduce doubt over the validity of morphological diagnostics and can reduce the time for a confirmed molecular diagnosis to 48 hours, rather than the actual timescale of 7-10 days. Genotyping of a collection of isolates from guinea pigs (n=1), rabbits (n= 20) and dogs (n=8), used PCR-based amplification and sequencing of fragments of the sequences encoding the large (26S) and small (18S) subunits of ribosomal rDNA, the subunits RPB1 and RPB2 of the gene encoding RNA polymerase II, Cytochrome oxidase II and the internal transcribed spacer (ITS) regions of the nuclear ribosomal RNA gene cluster. Sequence alignments and evaluations of nucleotide similarity for most sequences, served to support data from earlier studies, which had suggested the possible existence of two species of Cyniclomyces. Intriguingly, the use of the ITS region indicated that there may exist at least three species of Cyniclomyces. The identification of the new species of Cyniclomyces calls into question much of the data produced until now in relation to the pathogenicity of this organism. It is envisaged that the findings of this research will serve to stimulate an expansion in the study of the genus Cyniclomyces, and as such will make significant contributions to our comprehension of its role in canine health.

Produção e caracterização parcial de proteases a partir de Mucor hiemalis URM3773 / Production and partial characterization of proteases from Mucor hiemalis URM3773

Foi avaliada a produção de proteases por 11 espécies fúngicas pertencentes aos gêneros Mucor, Rhizomucor e Absidia, obtidas da Coleção de Culturas URM do Departamento de Micologia-UFPE, Brasil. A melhor espécie produtora foi Mucor hiemalis URM3773 (1,689 U mL-1). A metodologia de planejamento Plackett-Burman foi empregada para selecionar o parâmetro mais efetivo para a produção de proteases através de 11 componentes do meio, incluindo: concentração do filtrado de soja, glicose, período de incubação, extrato de levedura, triptona, pH, aeração, rotação, NH4Cl, MgSO4 e K2HPO4. A variável significante sobre a variável-resposta, atividade proteásica específica, foi a concentração do filtrado de soja. O extrato enzimático bruto apresentou atividade ótima ao pH 7,5 a 50ºC. A enzima foi estável em uma ampla variação de pH de 5,88,0 em tampão fosfato 0,1M e termicamente estável a uma variação de 40- 70C, durante 180 minutos. Os íons FeSO4, NaCl, MnCl2, MgCl2 e KCl estimularam a atividade proteásica, enquanto que o íon ZnCl2 inibiu 2,27% da atividade. O inibidor de proteases que teve maior ação foi o ácido iodoacético a 1mM. Os resultados obtidos indicam que a enzima estudada tem grande potencial de aplicação industrial.(AU)

The current study evaluated the proteases production from 11 fungal species belonging to the genera Mucor, Rhizomucor and Absidia. The species were obtained from the Collection of Cultures URM at the Mycology Department-UFPE, Brazil. The best producing species was Mucor hiemalis URM 3773 (1.689 U mL-1). Plackett-Burman design methodology was employed to select the most effective parameter for protease production out of 11 medium components, including: concentration of filtrate soybean, glucose, incubation period, yeast extract, tryptone, pH, aeration, rotation, NH4Cl, MgSO4 and K2HPO4. Filtrated soybean concentration was the significant variable over the response variable, which was the specific protease activity. The crude enzyme extract showed optimal activity in pH 7.5 and at 50ºC. The enzyme was stable within a wide pH range from 5.8 to 8.0, in the phosphate buffer 0.1M and in stable temperature variation of 40-70ºC, for 180 minutes. The ions FeSO4, NaCl, MnCl2, MgCl2 and KCl stimulated the protease activity, whereas ZnCl2 ion inhibited the activity in 2.27%. Iodoacetic acid at 1mM was the proteases inhibitor that presented greater action.The results indicate that the studied enzyme have great potential for industrial application.(AU)

ISOLAMENTO, CARACTERIZAÇÃO MOLECULAR E SOROEPIDEMIOLÓGICA DA Leptospira spp. EM SUÍNOS ABATIDOS NO ESTADO DE SÃO PAULO

A carne suína é a proteína de origem animal mais produzida e consumida no mundo, sendo o Brasil o quarto no ranking de produção e exportação mundial, com perspectivas de crescimento. Devido à proximidade homem-animal deste seguimento, é fundamental que se conheça a sanidade dos suínos, e entre as diversas doenças deve-se destacar a leptospirose, uma importante zoonose de caráter ocupacional que atinge vários elos da cadeia produtiva, como: funcionários da granja, médicos veterinários, magarefes e a população em geral. O trabalho teve como objetivo geral realizar isolamento, caracterização molecular e soroepidemiológica da Leptospira spp. em suínos abatidos no Estado de São Paulo e como objetivos específicos identificar a variabilidade genética de forma acurada e determinar as sorovariedades presentes. Foram analisadas 1.284 amostras de sangue, 980 amostras de urina e 74 rins de suínos adultos, clinicamente saudáveis, oriundos de granjas das regiões Centro-Oeste, Sudeste e Sul, abatidos em 3 matadouros-frigoríficos localizados na Mesorregião de Ribeirão Preto no Estado de São Paulo, no ano de 2016. Para o diagnóstico sorológico foi utilizada a técnica de soroaglutinação microscópica com uma coleção de antígenos de 38 sorovares. As amostras de urina e rim foram semeadas em meios de cultivo, e os isolados foram confirmados e caracterizados pelas técnicas de sorogrupagem, PCR (gene lipL32), VNTR e sequenciamento nucleotídico dos genes rrs e secY, e os resultados obtidos foram utilizados para elaborar árvores filogenéticas. Pela técnica de isolamento foi possível ter êxito em 5 culturas, de amostras de tecido renal e urina de suínos, nomeadas Unesp01, Unesp02, Unesp03, Unesp04 e Unesp05, sendo encontradas leptospiras das especies L. interrogans e L. santarosai, dos sorogrupos: Icterohaemorrhagiae (Unesp01 e Unesp05), Autumnalis (unesp02 e Unesp04) e Sejroe (Unesp03). No sequenciamento nucleotídico dos genes rrs (16S) e secY, as amostras Unesp01, Unesp02, Unesp04 e Unesp05 demonstraram 100% de similaridade com a sequência de Leptospira interrogans, e a amostra Unesp03 demostrou 99% de similaridade com a sequência da espécie L. santarosai. Na sorologia, observou-se 46,57% (598/1.284) de sororreagentes a pelo menos uma das 38 sorovariedades de Leptospira spp. utilizadas, apresentando reatividade a 86,84% (33/38) dos sorovares utilizados da coleção de antígenos. A caracterização sorológica e molecular é fundamental para a compreensão da epidemiologia da infecção por este importante agente etiológico. O isolamento propicia material para uma ampla variedade de análises e a possibilidade da utilização do isolado como parte da coleção de antígenos para os testes sorológicos, enquanto a sorologia dá subsídios em estudos em que não há disponibilidade de tempo ou amostra ideal para o isolamento. Os resultados do trabalho demonstram a circulação do agente nas granjas de suínos, condição de risco para os trabalhadores da cadeia produtiva da carne e para a saúde pública em uma visão geral.

Pork is the most widely consumed animal protein in the world, Brazil being the fourth largest producer and exporter in the world, with growth prospects. Due to the man-animal proximity of this follow-up, it is essential to know the sanity of the swines, and among the various diseases should be highlighted leptospirosis, an important occupational zoonosis that reaches several links in the production chain, such as: Farm employees, veterinarians, doctors and the population in general. The objective of this study was to isolate and characterize molecular and seroepidemiologically the Leptospira spp. in swine slaughtered in the State of São Paulo, and as specific objectives to identify the genetic variability in an accurate way and determine the serovarities present. A total of 1,284 blood samples, 980 urine samples and 74 kidneys, of clinically healthy adult swine, from Central-West, Southeast and South swine farms, slaughtered in three slaughterhouses located in the Meso-region of Ribeirão Preto, State of São Paulo, in the year 2016, were analyzed. For the serological diagnosis, the microscopic sero-agglutination technique was used with a collection of antigens of 38 serovars. Urine and kidney samples were seeded in culture media and the isolates were confirmed and characterized by serogrouping, PCR (lipL32 gene), VNTR, and nucleotide sequencing of the rrs and secY genes, and the results obtained were used to elaborate phylogenetic trees. The isolates were identified in five culture: Unesp01, Unesp02, Unesp03, Unesp04 and Unesp05, and leptospiras of the L. interrogans and L. santarosai species of the serogroups: Icterohaemorrhagiae (Unesp01 and Unesp05), Autumnalis (unesp02 and Unesp04) and Sejroe (Unesp03). In the nucleotide sequencing of the rrs and secY gene, the Unesp01, Unesp02, Unesp04 and Unesp05 samples demonstrated 100% similarity to the Leptospira interrogans sequence, and the Unesp03 sample demonstrated 99% similarity to the L. santarosai sequence. In serology, 46.57% (598/1,284) were seroreactors, observed in at least one of the 38 serovars of Leptospira spp. used, presenting reactivity to 86.84% (33/38) of the serovars used in the antigen collection. Serological and molecular characterization is fundamental for the understanding of the epidemiology of infection by this important etiological agent. The isolation provides material for a wide variety of analyzes and the possibility of using it as part of the collection of antigens for the serological tests, while the serology gives subsidies in surveys in studies where there is no time availability or ideal sample for isolation. The results of the work show the circulation of the agent in the pig farms, a risk condition for workers in the meat production chain and for public health in an overview.

Resistência de bactérias ácido-láticas a bacteriófagos provenientes de unidades de processamento de queijo Coalho

The objectives of this research were to isolate bacteriophages from milk samples, whey and Coalho cheese and to evaluate the resistance of strains of Lactobacillus paracasei from the Collection of Microorganisms of Interest for the Tropical Agroindustry, belonging to Embrapa Tropical Agroindustry, to isolate phages. The strains resistance to specific L. paracasei phages from the collection of the Instituto de Lactología Industrial - INLAIN (Santa Fe, Argentina) was also evaluated. Samples for phage isolation were from four Coalho cheese processing units, two artisanal and two industrial, localized in the state of Ceará. Spot test was employed for bacteriophages isolation, while the culture phage resistance was evaluated by the acid production and turbidity tests. The strains were resistant both to phages isolated from Coalho cheese processing units and phages from collection of INLAIN. The results showed that lactic cultures evaluated here were resistant to bacteriophages and they can be used in the composition of lactic cultures specifically for Coalho cheese manufacture from pasteurized milk.

Este trabalho teve como objetivos isolar bacteriófagos de amostras de leite, soro e queijo de Coalho e avaliar a resistência de cepas de Lactobacillus paracasei, pertencentes à Coleção de Micro-organismos de Interesse para a Agroindústria Tropical da Embrapa Agroindústria Tropical, aos fagos isolados. Posteriormente, a resistência destas cepas a fagos específicos para L. paracasei, da Coleção do Instituto de Lactología Industrial - INLAIN (Santa Fe, Argentina), também foi avaliada. As amostras para isolamento dos fagos foram obtidas em quatro unidades de processamento de queijo de Coalho, sendo duas artesanais e duas industriais, localizadas no Estado do Ceará. Para o isolamento dos bacteriófagos, foi empregado o teste de lise celular (spot), enquanto que a resistência das culturas aos fagos foi avaliada pelos testes de capacidade de produção de ácido e avaliação da turbidez. As cepas avaliadas foram resistentes aos bacteriófagos provenientes das unidades de processamento de queijo de Coalho e aos bacteriófagos da Coleção do INLAIN. Os resultados obtidos indicaram que as culturas láticas testadas, resistentes aos bacteriófagos, podem ser utilizadas na composição de fermento lático destinado à elaboração de queijo de Coalho, a partir de leite pasteurizado.

Resistência de bactérias ácido-láticas a bacteriófagos provenientes de unidades de processamento de queijo Coalho

The objectives of this research were to isolate bacteriophages from milk samples, whey and Coalho cheese and to evaluate the resistance of strains of Lactobacillus paracasei from the Collection of Microorganisms of Interest for the Tropical Agroindustry, belonging to Embrapa Tropical Agroindustry, to isolate phages. The strains resistance to specific L. paracasei phages from the collection of the Instituto de Lactología Industrial - INLAIN (Santa Fe, Argentina) was also evaluated. Samples for phage isolation were from four Coalho cheese processing units, two artisanal and two industrial, localized in the state of Ceará. Spot test was employed for bacteriophages isolation, while the culture phage resistance was evaluated by the acid production and turbidity tests. The strains were resistant both to phages isolated from Coalho cheese processing units and phages from collection of INLAIN. The results showed that lactic cultures evaluated here were resistant to bacteriophages and they can be used in the composition of lactic cultures specifically for Coalho cheese manufacture from pasteurized milk.

Este trabalho teve como objetivos isolar bacteriófagos de amostras de leite, soro e queijo de Coalho e avaliar a resistência de cepas de Lactobacillus paracasei, pertencentes à Coleção de Micro-organismos de Interesse para a Agroindústria Tropical da Embrapa Agroindústria Tropical, aos fagos isolados. Posteriormente, a resistência destas cepas a fagos específicos para L. paracasei, da Coleção do Instituto de Lactología Industrial - INLAIN (Santa Fe, Argentina), também foi avaliada. As amostras para isolamento dos fagos foram obtidas em quatro unidades de processamento de queijo de Coalho, sendo duas artesanais e duas industriais, localizadas no Estado do Ceará. Para o isolamento dos bacteriófagos, foi empregado o teste de lise celular (spot), enquanto que a resistência das culturas aos fagos foi avaliada pelos testes de capacidade de produção de ácido e avaliação da turbidez. As cepas avaliadas foram resistentes aos bacteriófagos provenientes das unidades de processamento de queijo de Coalho e aos bacteriófagos da Coleção do INLAIN. Os resultados obtidos indicaram que as culturas láticas testadas, resistentes aos bacteriófagos, podem ser utilizadas na composição de fermento lático destinado à elaboração de queijo de Coalho, a partir de leite pasteurizado.

DESENVOLVIMENTO DE UMA MULTIPLEX PCR PARA IDENTIFICAÇÃO DAS PRINCIPAIS ESPÉCIES DE DERMATÓFITOS QUE ACOMETEM CÃES E GATOS

Objetivou-se neste estudo padronizar uma reação do tipo multiplex PCR (mPCR) para detectar Microsporum canis, Microsporum gypseum e o complexo Trichophyton mentagrophytes em amostras de pelos e/ou crostas de cães e gatos. Foram analisadas 250 amostras por meio de exame direto e cultura; o DNA destas mesmas amostras foi extraído utilizando-se o kit de extração DNeasy Blood & Tissue (QIAGEN®, Hilden - Germany). Para a PCR foram desenhados primers para as espécies M. canis, M. gypseum e T. mentagrophytes e como controle positivo da reação utilizou-se o DNA extraído de colônias de M. canis (URM 6273), M. gypseum (URM 6921) e T. mentagrophytes (URM 6211), provenientes da Coleção de Culturas da Micoteca do Departamento de Micologia do Centro de Ciências Biológicas da Universidade Federal de Pernambuco. Padronizou-se uma PCR para detecção de M. canis e uma mPCR para detecção de M. canis, M. gypseum e o complexo T. mentagrophytes. Os protocolos padronizados neste estudo, a partir de primers desenhados, apresentaram boa sensibilidade e alta especificidade na detecção de M. canis, M. gypseum e T. mentagrophytes diretamente de amostras de pelos e/ou crostas de cães e gatos, viabilizando um diagnóstico mais rápido e específico, podendo ser empregados na rotina laboratorial como métodos para agilizar a detecção dos agentes estudados.

The aim of this study was to standardize a multiplex PCR (mPCR) reaction to detect Microsporum canis, Microsporum gypseum and the Trichophyton mentagrophytes complex in fur and/or crusts samples of dogs and cats. 250 samples were analyzed by direct examination and culture; The DNA from these samples was extracted using the DNeasy Blood & Tissue extraction kit (QIAGEN®, Hilden-Germany). For the PCR, primers were designed for the M. canis, M. gypseum and T. mentagrophytes species and the DNA extracted from colonies of M. canis (URM 6273), M. gypseum (URM 6921) and T. mentagrophytes (URM 6211) from the Collection of Cultures of the Micoteca of the Mycology Department of the Biological Sciences Center of the Federal University of Pernambuco, were utilized as positive controls. A PCR for the detection of M. canis and an mPCR for the detection of M. canis, M. gypseum and the T. mentagrophytes complex was standardized. The protocols standardized in this study, from drawn primers, showed good sensitivity and high specificity in the detection of M. canis, M. gypseum and T. mentagrophytes directly from samples of fur and/or crusts of dogs and cats, making possible a faster and specificity in the results, can be used in the laboratory routine as methods capable of speeding the detection of the agents in question.

Avaliação de um Sistema de Banco de Dados para Coleção de Fungos de Referência / Evaluation of a Database System for Reference Fungi Collection

De acordo com o Guia para Operação de Centros de Recursos Biológicos da Organização para Cooperação e Desenvolvimento Econômico (OCDE), os Centros de Recursos Biológicos devem dispor os dados descritivos do e sua origem ao Global Biological Resource Center Network. Essa deliberação ratifica a preocupação da validação de ferramentas utilizadas no tratamento de dados pelas coleções e laboratórios prestadores de serviços no escopo indireto de suas rotinas, visando à qualidade. A avaliação do Sistema de Banco de Dados da Coleção de Culturas de Fungos de Referência (INFOGER_FUNGOS), do Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde (INCQS), de acordo com a norma ISO/IEC nº 17.025:2005, estabelece um marco na qualidade e integridade das informações, economizando tempo na elaboração das estruturas do sistema permitindo ao profissional diretamente envolvido com a coleção e suas particularidades seja seu administrador. Este trabalho teve como objetivo demonstrar um método de avaliação de um sistema de gerenciamento de dados no cumprimento de sua finalidade atingindo níveis de qualidade satisfatórios. Ele servirá de modelo para avaliações de sistemas utilizados em coleções de micro-organismos dentro das normas da Qualidade e Acreditação de seus serviços e produtos, e colaborar no estabelecimento de padrão de dados baseado em experiências brasileiras, adaptado e estendido a modelos existentes. (AU)