Antibiotic resistance and virulence factors among Escherichia coli isolates from avian organic fertilizer / Resistência a antibióticos e fatores de virulência entre isolados de Escherichia coli provenientes de fertilizante orgânico aviário

Brazilian poultry industry generates large amounts of organic waste, such as chicken litter, which is often used in agriculture. Among the bacteria present in organic fertilizer are members of the Enterobacteriaceae family, such as Escherichia coli. The aim of this study was to analyze the profile of virulence factors and antimicrobial resistance of E. coli isolates from avian organic fertilizer. A total of 47 E. coli strains were tested through Polymerase chain reaction to detect virulence genes (hlyF, iss, ompT, iutA and iroN). Fourteen antimicrobials were used to test antimicrobial susceptibility in the strains. Genes characteristic of Avian Pathogenic E. coli (APEC) were reported among the strains, with the hlyF, iss and ompT genes being the most prevalent. The isolates showed high resistance (˃50%) to tetracycline, gentamicin, cefotaxime, nitrofurantoin, trimethoprim-sulfamethoxazole and ampicillin. Multidrug resistance was reported in a great number of strains (>70%). The results showed the presence of APEC cells with virulence genes and antimicrobial resistance after 15 days of the windrowing process in poultry houses, it means this process should be improved to eliminate these cells.(AU)

A indústria avícola brasileira gera grandes quantidades de resíduos orgânicos, como a cama de frango, utilizada frequentemente na agricultura. Entre as bactérias presentes neste fertilizante orgânico estão os membros da família Enterobacteriaceae, entre eles a Escherichia coli. O objetivo deste estudo foi analisar o perfil de fatores de virulência e resistência antimicrobiana de isolados de E. coli provenientes do fertilizante orgânico aviário. Um total de 47 cepas de E. coli foram testadas por meio da reação em cadeia da polimerase para detectar genes de virulência (hlyF, iss, ompT, iutA e iroN). Quatorze antimicrobianos foram utilizados para testar a susceptibilidade antimicrobiana nos isolados. Genes característicos de E. coli Patogênica Aviária (APEC) foram encontrados entre os isolados, sendo os genes hlyF, iss e ompT os mais prevalentes. Os isolados apresentaram alta resistência (˃50%) à tetraciclina, gentamicina, cefotaxima, nitrofurantoína, trimetoprima-sulfametoxazole e ampicilina. Múltipla resistência a drogas antimicrobianas foi encontrada em grande número de isolados (>70%). Os resultados obtidos mostraram a presença de células APEC portando genes de virulência e resistência a antimicrobianos após 15 dias de processo de empilhamento nas granjas, indicando que o processo necessita de um aperfeiçoamento para eliminar estas células.(AU)

Pesquisa de bactérias gram negativas em papagaio do congo (Psittacus erithacus) mantidos em criatório comercial / Research for gram-negative bacteria in congo's parrot (Psittacus erithacus) held in commercial breeding

A microbiota intestinal de psitacídeos é constituida principalmente por bactérias Gram positivas e tem menor prevalência de Gram negativas. Embora existam poucos estudos descrevendo a microbiota destas aves, uma série de agentes bacterianos com potencial zoonótico pode ser transmitida das aves para os humanos. O objetivo deste trabalho foi pesquisar a presença de bactérias Gram negativas em um criadouro de papagaios do congo (Psittacus erithacus). Foram coletadas e analisadas amostras de fezes e de coana de 24 animais. Os resultados obtidos demonstraram a presença de bactérias Gram negativas nas fezes (45,8%) e na coana (62,5%). Foi isolado um total de 26 colônias bacterianas, com predomínio de agentes da família Enterobacteriaceae (21/26). As espécies encontradas foram Escherichia coli, Enterobacter asburiae, Klebsiella oxytoca, Citrobacter freundii, Citrobacter amolonaticus, Enterobacter cloacae, Providencia alcalifaciens, Providencia rettgeri, Citobacter koseri, Citrobacter braakii, Pseudomonas mendocina, Alcaligenes faecalis e Aeromonas caviae. Os dados deste trabalho revelaram uma elevada frequência de bactérias Gram negativas na microbiota destas aves. Estudos futuros serão realizados para avaliar a virulência e a resistência antimicrobiana, determinando o impacto potencial da presença destes agentes para a saúde dos animais e os riscos zoonóticos.

The intestinal microbiota of parrots consists mainly by Gram positive bacteria and has a lower prevalence of Gram negative. Although there are few studies describing the microbiota of these birds, many of these bacteria have a zoonotic potential and can be transmitted from birds to humans. The aim of this study was to investigate the presence of Gram negative in congo parrots (Psittacus erithacus). Fecal and coana samples collected from 24 birds were analyzed. The results showed the presence of Gram negative bacteria in feces (45.8%) and coana (62.5%). A total of 26 strains were isolated, with predominance of members of the Enterobacteriaceae family (21/26). The species identified were Escherichia coli, Enterobacter asburiae, Klebsiella oxytoca, Citrobacter freundii, Citrobacter amolonaticus, Enterobacter cloacae, Providencia alcalifaciens, Providencia rettgeri, Citobacter koseri, Citrobacter braakii, Pseudomonas mendocina, Alcaligenes faecalis and Aeromonas caviae. The data of this study revealed a high frequency of Gram negative bacteria in the microbiota of these birds. Future studies will be conducted to assess virulence and antimicrobial resistance profile, looking for the potential impact of these agents over animal health and zoonotic risks.

Pesquisa de bactérias gram negativas em papagaio do congo (Psittacus erithacus) mantidos em criatório comercial / Research for gram-negative bacteria in congo's parrot (Psittacus erithacus) held in commercial breeding

A microbiota intestinal de psitacídeos é constituida principalmente por bactérias Gram positivas e tem menor prevalência de Gram negativas. Embora existam poucos estudos descrevendo a microbiota destas aves, uma série de agentes bacterianos com potencial zoonótico pode ser transmitida das aves para os humanos. O objetivo deste trabalho foi pesquisar a presença de bactérias Gram negativas em um criadouro de papagaios do congo (Psittacus erithacus). Foram coletadas e analisadas amostras de fezes e de coana de 24 animais. Os resultados obtidos demonstraram a presença de bactérias Gram negativas nas fezes (45,8%) e na coana (62,5%). Foi isolado um total de 26 colônias bacterianas, com predomínio de agentes da família Enterobacteriaceae (21/26). As espécies encontradas foram Escherichia coli, Enterobacter asburiae, Klebsiella oxytoca, Citrobacter freundii, Citrobacter amolonaticus, Enterobacter cloacae, Providencia alcalifaciens, Providencia rettgeri, Citobacter koseri, Citrobacter braakii, Pseudomonas mendocina, Alcaligenes faecalis e Aeromonas caviae. Os dados deste trabalho revelaram uma elevada frequência de bactérias Gram negativas na microbiota destas aves. Estudos futuros serão realizados para avaliar a virulência e a resistência antimicrobiana, determinando o impacto potencial da presença destes agentes para a saúde dos animais e os riscos zoonóticos.(AU)

The intestinal microbiota of parrots consists mainly by Gram positive bacteria and has a lower prevalence of Gram negative. Although there are few studies describing the microbiota of these birds, many of these bacteria have a zoonotic potential and can be transmitted from birds to humans. The aim of this study was to investigate the presence of Gram negative in congo parrots (Psittacus erithacus). Fecal and coana samples collected from 24 birds were analyzed. The results showed the presence of Gram negative bacteria in feces (45.8%) and coana (62.5%). A total of 26 strains were isolated, with predominance of members of the Enterobacteriaceae family (21/26). The species identified were Escherichia coli, Enterobacter asburiae, Klebsiella oxytoca, Citrobacter freundii, Citrobacter amolonaticus, Enterobacter cloacae, Providencia alcalifaciens, Providencia rettgeri, Citobacter koseri, Citrobacter braakii, Pseudomonas mendocina, Alcaligenes faecalis and Aeromonas caviae. The data of this study revealed a high frequency of Gram negative bacteria in the microbiota of these birds. Future studies will be conducted to assess virulence and antimicrobial resistance profile, looking for the potential impact of these agents over animal health and zoonotic risks.(AU)

Qualidade do leite cru refrigerado coletado de unidades produtoras da Zona da Mata Alagoana

A qualidade do leite é uma das temáticas mais discutidas atualmente no cenário nacional da cadeia produtiva do leite. Com isso, o objetivo deste trabalho foi avaliar a qualidade do leite cru refrigerado e o perfil socioeconômico dos produtores de leite em unidades produtivas da zona da mata de Alagoas. A coleta de dados foi realizada nas propriedades com o auxílio de um questionário semiestruturado. Foram considerados doze parâmetros inerentes à atividade leiteira que podem influenciar na qualidade da matéria-prima, sendo: nível de produção; sistemas de produção, de ordenha e de resfriamento; mão-de-obra; assistência técnica; frequência da assistência técnica; higienização dos tetos, do resfriador e da ordenha; descontaminação dos tetos e características do ambiente de ordenha. Além disso, também foram realizadas Contagens de Células Somáticas (CCS), análise de cultura microbiológica e físico-química. As variáveis foram submetidas à análise de variância, sendo utilizado para comparação de médias o teste de Tukey a 5% de probabilidade de erro. Entre os municípios avaliados, a cidade de Cajueiro obteve os piores resultados para CCS (maiores médias) e o município de Mar Vermelho os melhores resultados para CCS (menores médias), estando em conformidade com a IN 77/2018 MAPA. A CCS foi influenciada pela quantidade de leite produzido, tipo de mão de obra e limpeza do resfriador de leite. Entre os microrganismos encontrados com maior frequência, 19,50% pertenciam à família Enterobacteriacea (14,62/75); 16,64% ao gênero Staphylococcus (12,48/75) e 15,60% ao gênero Corynebacteruim (11,7/75), evidenciando a contaminação por bactérias ambientais e oriundas da glândula mamária. Não houve diferença significativa (P<0,05) entre as cidades estudadas para a análise físico-química. Entre os produtores entrevistados, a maior parte era composta por homens, casados, com idade até 60 anos e com nível de escolaridade fundamental e médio. A raça predominante era Girolando, as propriedades apresentavam baixo nível tecnológico de produção e realizavam, em sua maioria, ordenha manual. Dentre os procedimentos de ordenha, poucos produtores realizavam a pré-imersão e pós-imersão dos tetos em solução comercial a base de iodo. Neste estudo foi possível perceber elevada contaminação por bactérias ambientais e oriundas da glândula mamária. As propriedades possuíam o perfil da agricultura familiar, onde o nível de formação impactou na limpeza do tanque de expansão. O volume de produção e o tipo de mão de obra apresentaram grande influência sobre a qualidade do leite, pois os agentes causadores de mastite encontrados nesse trabalho estavam relacionados com a mastite ambiental, sendo fatores atribuídos ao homem como fator da disseminação da contaminação.

The quality of milk is one of the most discussed topics currently on the national scene of the milk chain. Thus, the objective of this work was to evaluate the quality of chilled raw milk and the socioeconomic profile of milk producers in production units in the Alagoas forest area. Data collection was carried out on the properties with the aid of a semi-structured questionnaire. Twelve parameters were considered inherent to the activity that can deviate in the quality of the raw material, being the level of milk produced; production, milking and cooling systems; labor; technical assistance; frequency of technical assistance; hygiene of the ceilings, cooler and milking; decontamination of the ceilings and characteristics of the milking environment. In addition, somatic cell counts (CCS) and microbiological culture analysis were also performed. The variables were subjected to analysis of variance, and Tukey's test at 5% probability of error was used to compare means. The properties of the acquired municipalities, the city of Cajueiro obtained as the highest averages for CCS and the municipality of Mar Vermelho the best results for CCS, providing in accordance with IN 77/2018 - MAPA. CCS was influenced by the amount of produce, type of labor and cleaning of the milk cooler. The microorganisms most frequently found belonged to the Enterobacteriacea family 19.50% (14.62 / 75) and to the genera Staphylococcus 16.64% (12.48 / 75) and Corynebacteruim 15.60% (11.7 / 75), showing failures in milking management. Among the interviewed producers, most of them were men, married, aged up to 60 years and with elementary and secondary education. There was no significant difference P <0.05 for the cities studied for the physical-chemical analysis. The predominant breed was Girolando, the properties had a low technological level of production and performed manual milking. Among the milking procedures, few producers performed the pre-immersion and post-immersion of the teats in a commercial solution based on iodine. The volume of production and the type of labor had a great influence on the quality of the milk, since the mastitis-causing agents found in this work were related to environmental mastitis, being factors attributed to man as a factor in the spread of contamination.

Cultura e citologia qualitativa de lavado bronco-alveolar não-endoscópico em cães com histórico de pneumonia recorrente ou de difícil controle: Série de casos

Pneumonia bacteriana ou infecção do trato respiratório inferior são os termos utilizados para descrever a afecção pulmonar referida quando a virulência de bactérias patogênicas supera as defesas do organismo, levando a uma infecção importante com potencial risco à vida do paciente. Apesar de ser um diagnóstico frequente e comum na clínica médica de pequenos animais, o diagnóstico definitivo e preciso ainda é bastante complicado porque não há um exame considerado padrão ouro. A maioria dos clínicos utiliza hemograma e radiografias torácicas para basear seu diagnóstico e justificar o uso de antibióticos de forma empírica. A escolha do antimicrobiano, na maioria das vezes, é feita de forma aleatória, muitas vezes relacionada a opiniões de colegas, propagandas ou até mesmo pelo preço. No entanto, existem diversas doenças inflamatórias pulmonares que podem causar alterações radiográficas ou hematológicas que podem ser confundidas com pneumonia bacteriana que podem levar a um uso desnecessário de antibióticos e, consequentemente, uma baixa resposta terapêutica, além do risco de resistência bacteriana. O objetivo deste estudo foi avaliar, por meio de análise citológica associada à cultura e antibiograma de lavado bronco-alveolar (LBA) de cães com doença respiratória inferior, quais bactérias são mais comumente encontradas e quais antimicrobianos possuem menor taxa de resistência bacteriana, a fim de otimizar o uso empírico de antibióticos na clínica de pequenos animais quando se suspeita de pneumonia bacteriana e, nos casos de resposta inadequada ao tratamento antimicrobiano empírico, objetiva-se comprovar a presença de agente bacteriano e identificar a suscetibilidade, ou determinar se existe outra causa para as manifestações clínicas e aspectos radiográficos observados. Para isso, foi realizado um estudo retrospectivo de cães (N=12), sem predileção racial, sexual ou etária com histórico de pneumonias recorrentes ou de difícil controle, que tenham sido submetidos à coleta de material por LBA. A presença de pneumonia bacteriana foi considerada quando o LBA apresentou cultura bacteriana positiva associada à presença de bactérias intracitoplasmáticas na análise citológica. A maioria (11/12) dos cães incluídos no estudo apresentaram cultura bacteriana positiva, no entanto, apenas dois deles apresentou bactérias fagocitadas, sete apresentaram citologia sugestiva de processo inflamatório asséptico, um apresentou infecção por Candida sp associada, um apresentou processo inflamatório crônico e um foi negativo para inflamação ou infecção. Todos os cães incluídos neste estudo haviam sido tratados empiricamente com diferentes tipos de antibióticos devido à recidiva das manifestações clínicas, porém, a análise do LBA sugeriu que uma terapia baseada em imunomodulação poderia ser mais benéfica em pelo menos sete deles. Além disso, o estudo mostrou que 72% das bactérias cultivadas eram da família das Enterobacterias, e, que de todas as culturas dos lavados bronco-alveolares, 77% eram resistentes à cefalexina e 57% à amoxicilina enquanto a norfloxacina foi o antimicrobiano com menor taxa de resistência (23%). A análise microbiológica e citológica do LBA se mostrou bastante importante para melhor elucidação e compreensão das doenças pulmonares capaz de reduzir o uso discriminado de antibióticos e, consequentemente, o aparecimento de resistência bacteriana

Bacterial pneumonia or lower respiratory tract infection are commonly used terms to describe lung disease, when patogenic bacteria virulence overcome pulmonary defenses, and lead to significant infection with life threatening potential. Despite being a common diagnose in small animal practice, definitive and precise diagnose is still challenging due to the lack of a gold standard. Most clinicians make use of complete blood count and thoracic radiography as a diagnosis base, as well as to justify empirical antimicrobial choice. In most cases, antimicrobial use is made randomly, based on opinion of colleagues, advertisements or even on the cost. However, there are many inflammatory lung diseases that can cause hematological and radiographic changes which can be taken as bacterial pneumonia, and lead to unnecessary antimicrobial use, and consequente low therapeutic response, besides the risk of bacterial resistance. The aim of this study was to assess most common bactéria and lower antimicrobial resistance by means of cytological evaluation associated to culture and antimicrobial sensitivity testing of bronchoalveolar lavage (BAL) obtained from dogs with lower respiratory tract disease, in order to optimize the empirical antimicrobial use when bacterial pneumonia is suspected. Additionally, in cases of inadequate response to empirical antimicrobial treatment, we aimed to prove bacterial involvement and identify sensitivity as well as to determine whether there is another possible cause for clinical signs and radiographic findings. Therefore, a series of 12 dogs was retrospectively reviewed, based on having recurrent or persistent pneumonia besides had been submitted to bronchoalveolar lavage. Bacterial pneumonia was considered when BAL rendered positive bacterial culture associated with intracitoplasmatic bacteria findings in BAL cytology assessment. Most dogs (11/12) included in the study had a positive bacterial growth, however, only 2 presented phagocyted bacteria, 7 had asseptic inflammatory cytology process, one had Candida sp associated infection, one had chronic inflammatory process description, and one had negative culture and BAL cytology findings. Although all dogs included in the study had had diferent antimicrobial empirical use because of recurrent clinical signs, BAL analysis suggested that an immunemodulatory therapy could have been more beneficial for at least seven of the cases. Besides, the study showed that 72% of the isolated bacteria were Enterobacteriacea, and among all BAL cultures, 77% were resistant to cephalexin, and 57% resistant to amoxcillin, whilst norfloxacin was the lowest resistance rate antimicrobial (23%). BAL microbiological and cytology analysis were rendered important for pulmonary diseases elucidation and understanding, and potentially able to reduce indiscriminated antimicrobial use and, therefore, bacterial resistance contribution

Physico-chemical and microbiological characterization of ruminal fluid from gastrointestinal contents of Holstein calves in artificial fed milk conventional or fractionated / Caracterização físico-química e microbiológica do fluido ruminal e do conteúdo gastrointestinal de bezerros holandeses em aleitamento artificial convencional ou fracionado

The fractional artificial feeding has allowed provide an adequate amount of milk to calves in the first weeks of life and restrict at weaning, stimulating growth and favoring better adaptation to diets with forage and concentrates. The aim was to evaluate the ruminal characteristics and gastrointestinal microbiota of dairy calves in different feeding systems. Holstein calves were evaluated in randomly assigned to feed milk conventional that consisted of four liters of milk daily for 60 days or fractionated systems, six liters of 6º to 25º, four liters of 26º to 45º and two liters of 46º to 60º days old. At an end of the experimental period, the animals were euthanized, and approximately 15 mL of rumen, abomasum and intestine contents were collected for physicochemical and microbiological analysis to detection of fungi, protozoa and Enterobacteriaceae. Feeding systems did not influence characteristics of color, odor and viscosity of rumen fluid. The analysis of pH and quantification of Enterobacteriaceae, mycelial fungi and yeast showed no significant difference between treatments at the different sites. The Escherichia and Proteus genus were the most frequent for the gastrointestinal tract for both feed system. However, E. coli was significantly more frequent among isolates from the rumen fluid of calves in conventional feeding, which could suggest an imbalance in this ecosystem. Thus the artificial fed milk systems influenced the genus profile of Enterobacteriacea in the rumen and small intestine of calves.

O aleitamento artificial fracionado tem permitido fornecer quantidade adequada de leite aos bezerros nas primeiras semanas de vida e restringir na desmama, estimulando o melhor crescimento e adaptação a dietas com volumosos e concentrados. Objetivou-se avaliar as características ruminais e a microbiota gastrointestinal de bezerros leiteiros em diferentes sistemas de aleitamento. Foram utilizados 12 bezerros Holandeses, distribuídos aleatoriamente em dois tratamentos. No aleitamento convencional, foram fornecidos quatro litros de leite diários; no fracionado, seis litros do 6º ao 25º dia, quatro litros do 26 ao 45 e dois litros por dia do 46 ao 60 dia. Ao final do período experimental, os animais foram eutanasiados e aproximadamente 15 mL dos conteúdos do rúmen, abomaso e intestino foram coletados para análises físicas, químicas e microbiológicas para detecção de Enterobacteriaceae, fungos e protozoários. Os sistemas de aleitamento não influenciaram nas características de cor, odor e viscosidade do líquido ruminal. O pH e a quantificação de protozoários, Enterobacteriaceae, fungos micelianos e leveduriformes não apresentaram diferença significativa entre os tratamentos, nos diferentes sítios avaliados. Os gêneros Escherichia e Proteus foram os mais frequentes entre as amostras dos conteúdos avaliados, para ambos os sistemas de aleitamento. Entretanto, E. coli foisignificativamente mais frequente entre os isolados provenientes do fluido ruminal de bezerros em aleitamentoconvencional, o que poderia sugerir um desequilíbrio nesse ecossistema. Dessa forma constatou-se que os sistemas de aleitamentos influenciaram o perfil de gêneros de Enterobacteriaceae no rúmen e intestinos dos bezerros.

Physico-chemical and microbiological characterization of ruminal fluid from gastrointestinal contents of Holstein calves in artificial fed milk conventional or fractionated / Caracterização físico-química e microbiológica do fluido ruminal e do conteúdo gastrointestinal de bezerros holandeses em aleitamento artificial convencional ou fracionado

The fractional artificial feeding has allowed provide an adequate amount of milk to calves in the first weeks of life and restrict at weaning, stimulating growth and favoring better adaptation to diets with forage and concentrates. The aim was to evaluate the ruminal characteristics and gastrointestinal microbiota of dairy calves in different feeding systems. Holstein calves were evaluated in randomly assigned to feed milk conventional that consisted of four liters of milk daily for 60 days or fractionated systems, six liters of 6º to 25º, four liters of 26º to 45º and two liters of 46º to 60º days old. At an end of the experimental period, the animals were euthanized, and approximately 15 mL of rumen, abomasum and intestine contents were collected for physicochemical and microbiological analysis to detection of fungi, protozoa and Enterobacteriaceae. Feeding systems did not influence characteristics of color, odor and viscosity of rumen fluid. The analysis of pH and quantification of Enterobacteriaceae, mycelial fungi and yeast showed no significant difference between treatments at the different sites. The Escherichia and Proteus genus were the most frequent for the gastrointestinal tract for both feed system. However, E. coli was significantly more frequent among isolates from the rumen fluid of calves in conventional feeding, which could suggest an imbalance in this ecosystem. Thus the artificial fed milk systems influenced the genus profile of Enterobacteriacea in the rumen and small intestine of calves.(AU)

O aleitamento artificial fracionado tem permitido fornecer quantidade adequada de leite aos bezerros nas primeiras semanas de vida e restringir na desmama, estimulando o melhor crescimento e adaptação a dietas com volumosos e concentrados. Objetivou-se avaliar as características ruminais e a microbiota gastrointestinal de bezerros leiteiros em diferentes sistemas de aleitamento. Foram utilizados 12 bezerros Holandeses, distribuídos aleatoriamente em dois tratamentos. No aleitamento convencional, foram fornecidos quatro litros de leite diários; no fracionado, seis litros do 6º ao 25º dia, quatro litros do 26 ao 45 e dois litros por dia do 46 ao 60 dia. Ao final do período experimental, os animais foram eutanasiados e aproximadamente 15 mL dos conteúdos do rúmen, abomaso e intestino foram coletados para análises físicas, químicas e microbiológicas para detecção de Enterobacteriaceae, fungos e protozoários. Os sistemas de aleitamento não influenciaram nas características de cor, odor e viscosidade do líquido ruminal. O pH e a quantificação de protozoários, Enterobacteriaceae, fungos micelianos e leveduriformes não apresentaram diferença significativa entre os tratamentos, nos diferentes sítios avaliados. Os gêneros Escherichia e Proteus foram os mais frequentes entre as amostras dos conteúdos avaliados, para ambos os sistemas de aleitamento. Entretanto, E. coli foisignificativamente mais frequente entre os isolados provenientes do fluido ruminal de bezerros em aleitamentoconvencional, o que poderia sugerir um desequilíbrio nesse ecossistema. Dessa forma constatou-se que os sistemas de aleitamentos influenciaram o perfil de gêneros de Enterobacteriaceae no rúmen e intestinos dos bezerros.(AU)

Enterobacteriaceae: bactérias intestinalis de organismos aquáticos, um risco à saúde pública revisão de literatura / Enterobacteriaceae: intestinal bacteria of aquatic organisms, a risk to public health literature review

A aquicultura é uma boa alternativa para o incremento dos índices de consumo de proteínas de origem animal além de apresentar o potencial de promover o desenvolvimento social e econômico de um país. Contudo, o pescado pode se constituir numa importante fonte veiculadora de agentes patogênicos, responsáveis por diversas enfermidades para os consumidores finais. Durante o ciclo produtivo aquícola, em especial na ranicultura, uma grande variedade de microrganismos pode ser identificada, sem necessariamente provocar enfermidades nos animais cultivados, porém, estes podem atuar como vias de transmissão de agentes patogênicos para os consumidores finais, especialmente para os humanos. Dentre estes microorganismos, as bactérias Gram negativas, especificamente aquelas pertencentes à família Enterobacteriacea, estão envolvidas em grande parte das intoxicações de origem alimentar. Outro ponto a ser considerado, é a resistência de bactérias patogênicas a antibióticos, que constitui um grave problema nos países em desenvolvimento, devido à falha ou mesmo ausência de fiscalização e controle sobre o uso de fármacos antimicrobianos. (AU)

Aquaculture is seen as a good alternative for increasing the rates of animal protein consumption besides having the potential to promote social and economic development of a country. However, the fisheries may become a major source of disseminator pathogens responsible for several diseases for end consumers. During the aquaculture production cycle, in special frog breeding, a wide variety of microorganisms can be identified without necessarily causing disease in farmed animals; however, these can act as routes of transmission of pathogenic agents for end users, especially for humans. Gram negative bacteria, specifically those belonging to the Enterobacteriaceae family are involved in the majority of foodborne poisoning circulated in humans for fisheries. Another point to be considered is the resistance of pathogenic bacteria to antibiotics, which constitutes a serious problem in developing countries, due to failure or even lack of supervision and control over the use of antimicrobial drugs. (AU)

Enterobacteriaceae: bactérias intestinalis de organismos aquáticos, um risco à saúde pública – revisão de literatura / Enterobacteriaceae: intestinal bacteria of aquatic organisms, a risk to public health – literature review

A aquicultura é uma boa alternativa para o incremento dos índices de consumo de proteínas de origem animal além de apresentar o potencial de promover o desenvolvimento social e econômico de um país. Contudo, o pescado pode se constituir numa importante fonte veiculadora de agentes patogênicos, responsáveis por diversas enfermidades para os consumidores finais. Durante o ciclo produtivo aquícola, em especial na ranicultura, uma grande variedade de microrganismos pode ser identificada, sem necessariamente provocar enfermidades nos animais cultivados, porém, estes podem atuar como vias de transmissão de agentes patogênicos para os consumidores finais, especialmente para os humanos. Dentre estes microorganismos, as bactérias Gram negativas, especificamente aquelas pertencentes à família Enterobacteriacea, estão envolvidas em grande parte das intoxicações de origem alimentar. Outro ponto a ser considerado, é a resistência de bactérias patogênicas a antibióticos, que constitui um grave problema nos países em desenvolvimento, devido à falha ou mesmo ausência de fiscalização e controle sobre o uso de fármacos antimicrobianos.

Aquaculture is seen as a good alternative for increasing the rates of animal protein consumption besides having the potential to promote social and economic development of a country. However, the fisheries may become a major source of disseminator pathogens responsible for several diseases for end consumers. During the aquaculture production cycle, in special frog breeding, a wide variety of microorganisms can be identified without necessarily causing disease in farmed animals; however, these can act as routes of transmission of pathogenic agents for end users, especially for humans. Gram negative bacteria, specifically those belonging to the Enterobacteriaceae family are involved in the majority of foodborne poisoning circulated in humans for fisheries. Another point to be considered is the resistance of pathogenic bacteria to antibiotics, which constitutes a serious problem in developing countries, due to failure or even lack of supervision and control over the use of antimicrobial drugs.

SALMONELOSE EM REBANHO LEITEIRO BOVINO CONFINADO: Caracterização dos isolados, aspectos clínicos, epidemiológicos e resistência antimicrobiana

A salmonelose dos bovinos é uma doença primariamente entérica que pode evoluir para forma sistêmicas. É causada por bactérias gram negativas do filo das proteobactérias e família Enterobacteriacea. Os indivíduos de maior interesse são da espécie Salmonella enterica subp. enterica e é composta por 2.600 sorovariedades. A doença acomete animais de diferentes idades e é mais grave em animais jovens. O objetivo do trabalho foi estudar a distribuição da Salmonella spp. em um rebanho portador nas diferentes categorias animais, caracterizando a sua sorovariedade e o perfil de resistência antimicrobiana. O experimento foi conduzido em propriedade bovina que utiliza sistema de confinamento para criação dos animais e que possui produção diária de 29.000 litros de leite. Foram coletadas amostras de fezes de 782 animais em três momentos de cada animal e distribuídos em todas as categorias da propriedade e seguido de cultura e isolamento de Salmonella spp. com posterior avaliação dos sorotipos presentes, perfil de similaridade pelo ERIC-PCR e o perfil de resistência antimicrobiana de todos os isolados. Foram encontrados 60 isolados de Salmonella spp. sendo que 72% destes eram de S. Dublin e apresentavam grande semelhança genética entre si (ERIC-PCR). Foi observado que 85% dos isolados de Salmonella spp. eram multirresistentes, circulam pelas categorias animais da propriedade e causam doença clínica nos animais jovens

Bovine salmonellosis is a primarily enteric disease that can evolve into systemic forms. It is caused by gram negative bacteria from the phylum of the proteobacteria and Enterobacteriacea family. The individuals of greatest interest are the species Salmonella enterica subp. enterica and is composed of 2,600 serovarieties. The disease affects animals of different ages and is more severe in young animals. The objective of the work was to study the distribution of Salmonella spp. in a dairy herd with different animal categories, characterizing its serovariety and antimicrobial resistance profile. The experiment was carried out on a property that uses a confinement system to raise the animals and has a daily production of 29,000 liters of milk. Stool samples were collected from 782 animals at three times of each animal every 48h and distributed in all categories of the property and followed by culture and isolation of Salmonella spp. with subsequent evaluation of the serotypes present, similarity profile by ERIC-PCR and the antimicrobial resistance profile of all isolates. In 60 isolates of Salmonella spp., 72% of them were from S. Dublin and had great genetic similarity to each other. It was observed that 85% of Salmonella spp. they were multidrug-resistant, circulate in the animal categories of the property and cause clinical disease in young animals

Vida de prateleira de alface americana tratada com água ozonizada / Shelf life evaluation of the iceberg lettuce sanitized with ozone water

Este trabalho avaliou se a higienização de alface americana com água ozonizada, na concentração de 1,0mg L-1 por 1, 2 ou 3 minutos, seria capaz de aumentar a vida útil do produto quando armazenado a 2ºC. Foram avaliadas as populações de microrganismos aeróbios mesófilos, Enterobacteriaceae, bolores e leveduras, coliformes totais, coliformes termotolerantes e pesquisa de Salmonella sp ao longo do tempo. Imediatamente após o processamento por 3 minutos, foram obtidas reduções decimais de 4,07; 3,36; 3,20; 2,18 e 2,18 de microrganismos aeróbios mesófilos, Enterobacteriaceae, bolores e leveduras, coliformes totais, coliformes termotolerantes, respectivamente. A presença de Salmonella sp. não foi observada em nenhuma das condições estudadas. Além do efeito na inativação inicial, o processamento com ozônio melhorou a estabilidade da alface durante a estocagem, aumentando o tempo para o início do crescimento microbiano (de zero para quatro dias) e reduzindo a taxa de crescimento dos microrganismos, especialmente quando a sanitização foi realizada por 3 minutos de contato. Os resultados demonstraram que a alface tratada com água ozonizada atendeu aos parâmetros da legislação durante o período avaliado, reduzindo a contaminação inicial das alfaces (que, sem tratamento, estavam microbiologicamente impróprias para consumo pela contagem de coliformes) e mantendo essas contaminações em níveis aceitáveis por até 10 dias, sob refrigeração.(AU)

This research studied the impact of Iceberg lettuce sanitation using ozonized water at 1.0mg L-1 for 1, 2 and 3 minutes in the vegetable shelf-life at 2ºC. It was evaluated populations of aerobic mesophilic bacteria, EnterobacterIaceae, molds/yeasts, total and thermtolerants coliforms, and Salmonella sp. Immediately after 3 minutes of sanitation, decimal reductions of 4.07 (aerobic mesophilic bacteria), 3.36 (EnterobacterIacea), 3.2 (molds/yeasts), 2.18 (total coliforms) and 2.18 (thermtolerants coliforms) were reached. Salmonella sp. was not founded at any evaluated condition. Additionally to the initial reduction, the ozonization improved the lettuce stability during its shelf-life, increasing the delay for microbial growth (from zero to four days) and reducing the microbial growth rate. It occurred especially when sanitation with ozone was carried for 3 minutes of contact. The results showed that the Iceberg lettuce sanitized with ozonated water meets the Brazilian law during the evaluated period, reducing lettuce initial load (that was initially unsafe due to high count of coliforms) and keeping this contamination acceptable for 10 days under refrigeration.(AU)

PREVALÊNCIA E SUSCEPTIBILIDADE ANTIMICROBIANA DE ESCHERICHIA COLI DIARREIOGÊNICA E SALMONELLA SPP. EM EQUINOS NO MUNICÍPIO DE ARAGUAÍNA-TO.

RESUMO Os equinos possuem estreita relação com o ser humano, sendo utilizados nas mais diversas atividades. Com isso, torna-se essencial o conhecimento das afecções que acometem esta espécie e, sobretudo, as que apresentam potencial zoonótico. As bactérias da família Enterobacteriacea são gram-negativas, tendo como principais agentes Salmonella spp. e Escherichia coli, que são patógenos comuns a vários animais e ao ser humano sendo, portanto, temas de relevância em saúde pública e animal em todo o mundo. Por isso, esse estudo se mostra de suma importância para a compreensão da epidemiologia destes agentes na saúde equina e humana bem como no reconhecimento de resistência bacteriana e susceptibilidade antimicrobiana. Tendo em vista a escassez de trabalhos publicados no Brasil quanto a situação da E. coli e Salmonella spp. na espécie equina, com esse trabalho objetivou-se verificar a prevalência desses agentes em equinos da cidade Araguaína bem como verificar a susceptibilidade dos mesmos a diferentes antimicrobianos. Foram coletadas fezes da ampola retal de 72 cavalos clinicamente sadios e realizou-se isolamento bacteriano iniciando-se com enriquecimento em caldo seletivo, seguindo-se com plaqueamento em meio semi-sólido, provas bioquímicas e soroaglutinação. Após confirmação, realizou-se o teste de susceptibilidade antimicrobiana frente aos principais antibióticos utilizados na terapia humana e veterinária. A prevalência encontrada neste estudo para E.coli diarreiogênica e Salmonella spp. foi de 47,06% e 4,17%, respectivamente. Quanto à susceptibilidade antimicrobiana, a ciprofloxacina foi a mais eficiente para ambos os agentes, seguida do meropenem (E.coli) e sulfa/trimetropim (Salmonella spp.). Conclui-se que os equinos avaliados podem ser portadores assintomáticos de Salmonella spp. e albergar cepas patogênicas de E. coli e, que a identificação do agente bem como a realização do antibiograma é fundamental para a instituição de medidas profiláticas e de terapêutica adequada, respectivamente.

Equines are closely related to humans, being used in many different activities. With this, it is essential to know the affections that affect this species and, especially, those with zoonotic potential. The bacteria of the family Enterobacteriacea are gram-negative, having as main agents Salmonella spp. and Escherichia coli, which are pathogens common to several animals and to humans, and are therefore of relevance in public and animal health throughout the world. Therefore, this study is extremely important for understanding the epidemiology of these agents in equine and human health as well as in the recognition of bacterial resistance and antimicrobial susceptibility. In view of the scarcity of studies published in Brazil regarding the situation of E. coli and Salmonella spp. in the equine species, this work aimed to verify the prevalence of these agents in horses of Araguaína city as well as verify their susceptibility to different antimicrobials. Feces were collected from the rectal ampulla of 72 healthy horses and bacterial isolation was performed, starting with selective broth enrichment, followed by plating in semi-solid medium, biochemical tests and serum agglutination. After confirmation, the antimicrobial susceptibility test was carried out against the main antibiotics used in human and veterinary therapy. The prevalence found in this study for diarrheogenic E.coli and Salmonella spp. was 47.06% and 4.17%, respectively. As for antimicrobial susceptibility, ciprofloxacin was the most efficient for both agents, followed by meropenem (E.coli) and sulfa / trimetropim (Salmonella spp.). It is concluded that the horses evaluated can be asymptomatic carriers of Salmonella spp. and harbor pathogenic strains of E. coli, and that the identification of the agent as well as the performance of the antibiogram is fundamental for the institution of prophylactic measures and appropriate therapy, respectively.

RESISTÊNCIA ANTIMICROBIANA DE ENTEROBACTÉRIAS DE AVES MIGRATÓRIAS NO LITORAL PARAIBANO

RESUMO A migração é um comportamento biológico de várias espécies de aves e que pode favorecer a disseminação de microrganismos patogênicos através de longas distâncias, colocando em risco populações de outras espécies de aves, mamíferos, incluindo o homem. Muitos destes microrganismos podem ser resistentes a alguns tipos de antibióticos, sendo uma ameaça à saúde púbica. Objetivou-se com este estudo, isolar, caracterizar e avaliar o perfil de resistência de enterobactérias encontradas em espécies de maçaricos no período de invernada na Paraíba. Foram coletadas amostras cloacais das espécies Arenaria interpres, Calidris pusilla, Charadrius semipalmatus e Tringa flavipes. Foram isoladas 47 cepas de 14 gêneros bacterianos distintos para os quais foram testados 12 antibióticos; para o teste de suscetibilidade in vitro através do método Disco-difusão o maior índice de resistência (68,8%) foi observado para todos os gêneros frente ao amoxicilina+ácido clavulânico, seguido por cefoxitina (63,8%) e ampiciliana (63,8%); Das cepas bacterianas que apresentaram halo fantasma, 6 (12,76%) cepas foram resistentes ao aztreonam, 1 (2,12%) foram resistentes a ceftazidima, 1 (2,12%) para cefoxitina, e 1 (2,12%) resistentes a Cefotaxima. Portanto, é importante o monitoramento de aves silvestres, pois estas são potenciais reservatórios de microrganismos patogênicos, com isso, auxiliam na disseminação de resistência antimicrobiana.

Migration is a biological behavior of several bird species and may favor the spread of pathogenic microorganisms over long distances, putting populations of other species of birds, mammals, including humans at risk. Many of these microorganisms may be resistant to some types of antibiotics and pose a threat to public health. The objective of this study was to isolate, characterize and evaluate the resistance profile of enterobacteria found in species of tortoises in the wintering season in Paraíba. Cloacal samples of the species Arenaria interpres, Calidris pusilla, Charadrius semipalmatus and Tringa flavipes were collected. Seventeen strains were isolated from 14 different bacterial genera for which 12 antibiotics were tested; (68.8%) was observed for all genuses against amoxicillin + clavulanic acid, followed by cefoxitin (63.8%) and ampicillin (63,8%); Of the bacterial strains that presented phantom halo, 6 (12.76%) strains were resistant to aztreonam, 1 (2.12%) were resistant to ceftazidime, 1 (2.12%) to cefoxitin, and 1 (2.12% ) resistant to Cefotaxime. Therefore, it is important to monitor wild birds, as these are potential reservoirs of pathogenic microorganisms, thereby helping to disseminate antimicrobial resistance.

FATORES DE VIRULÊNCIA E RESISTÊNCIA À ANTIMICROBIANOS EM Escherichia coli E Salmonella spp. EM GRANJAS DE FRANGOS DE CORTE FORTALEZA

As bactérias Salmonella e Escherichia coli são membros da família Enterobacteriacea, micro-organismos ubíquos que podem estar presentes na cadeia produtiva de frangos de corte, causando preocupação aos órgãos de vigilância sanitária. Pela importância desses micro-organismos, na primeira fase desse trabalho, revisou-se o tema antibióticos no setor avícola reunindo-se informações sobre a descoberta e uso dos antimicrobianos, seus mecanismos de ação e de resistência, bem como os impactos dessa problemática na avicultura. Na segunda fase, objetivou-se avaliar a prevalência e resistência antimicrobiana de Salmonella sp. e Escherichia coli isoladas de frangos de corte na Região Metropolitana de Fortaleza, Brasil. De acordo com a metodologia utilizada, 95,9% das amostras foram positivas para Escherichia coli, o resultado do TSA revelou maior resistência ao sulfazotrim. Foi possível isolar Salmonella em 0,2% das amostras, as duas cepas isoladas foram sorotipificadas como Salmonella enterica subsp. enterica O:6,8. O resultado do TSA mostrou um mesmo perfil de resistência para ambas, o patógeno foi resistente a seis dentre os dez antibióticos testados (sulfazotrim, tetraciclina, ciprofloxacina, azitromicina, cloranfenicol e ceftiofur). Na terceira fase, objetivou-se detectar a presença de genes preditores de E. coli patogênica aviária e caracterizar as amostras pesquisando outros genes de APEC nas granjas de corte da Região Metropolitana de Fortaleza. Para isso, foram pesquisados por meio de reação em cadeia de polimerase cinco genes de virulência preditores de APEC (iutA, hlyF, iss, iroN e ompT) e oito outros genes de virulência (irp2, neuC, papC, cvi/cva, vat, ibeA, iucD e tsh). Do total de pools analisados, 55,0% foram positivos para quatro ou mais genes preditores de APEC. Quanto aos outros genes de virulência, a maioria dos pools analisados, 32,5% foram positivos para três genes.

Salmonella and Escherichia coli are bacteria members of the Enterobacteriaceae family. These micro-organisms are ubiquitous frequently found throughout the poultry chain of production, which raises concern for food safety authorities. Due to the importance of these micro-organisms, the first phase of this study consisted of a review on the use of antibiotics in the poultry industry. In this review, information about the discovery and use of antimicrobials, mechanisms of action and resistance, as well as the impacts of antimicrobial resistance problematic in the poultry industry were discussed. In the second phase, the prevalence and antimicrobial resistance of Salmonella sp. and Escherichia coli isolated from broiler chickens were assessed in the Metropolitan Region of Fortaleza, Brazil. According to the methodology used, 95.9% of samples were positive for E. coli and AST results revealed that the most frequent resistance was to sulfamethoxazole with trimethoprim. Salmonella was isolated in 0.2% of samples, and both strains were identified as Salmonella enterica subsp. enterica O:6,8. AST demonstrated the same resistance profile for both strains, which were resistant to six from a total of ten antibiotics tested (sulfamethoxazole with trimethoprim, tetracycline, ciprofloxacin, azithromycin, chloramphenicol and ceftiofur). In third phase, the presence of genes that predict Avian Pathogenic E. coli strains was assessed and virulence characterization was further demonstrated with other virulence genes in isolates from poultry facilities in the metropolitan region of Fortaleza. In order to do so, conventional polymerase chain reaction was used to identify five APEC predictor genes (iutA, hlyF, iss, iroN and ompT) and eight additional virulence genes (irp2, neuC, papC, cvi/cva, vat, ibeA, iucD and tsh). From the total of analyzed pools, 55% were positive for four or more APEC predictor genes. Concerning the remaining genes, most pools were positive for three genes (32.5%).

Detecção de Escherichia coli e Salmonella spp. em microbiota intestinal de Psittaciformes em fase de reabilitação para soltura / Detection of Escherichia coli and Salmonella spp. in the intestinal microbiot of Psittacifomes in rehabilitation process for wildlife reintroduction

A Escherichia coli é uma bactéria pertencente à família Enterobacteriacea que faz parte da microbiota entérica de mamíferos e de muitas espécies de aves. A Salmonella spp. também pertence à mesma família, sendo responsável por surtos de infecção alimentar em humanos e frequentemente isoladas de aves domésticas e aves silvestres. O presente estudo analisou a frequência de ambas as bactérias em Psittaciformes em processo de reabilitação para a vida livre. De 89 aves analisadas 19% estavam infectadas com E. coli e 1,12% com Salmonella spp. Realizou-se uma análise do perfil de resistência a antibióticos onde se observou a eficiência de estreptomicina, tetraciclina, trimetoprim e gentamicina sobre as amostras. As amostras de E. coli foram submetidas ao teste de Vermelho-Congo e ao teste Atividade Hemolítica, onde se observaram 70,6% de amostras positivas para o primeiro e 53% para o segundo teste.(AU)

Escherichia coli is a bacteria of the Enterobacteriacea family and it is part of the enterical microflora of mammals and of many species of birds. Salmonella spp. also belongs to the family Enterobacteriacea, it is responsible for human feed toxinfection outbreaks and usually isolated from domestic and wild birds. The present study analyzed the frequency of both agents in Psittaciformes in rehabilitation process for wildlife reintroduction. In 89 birds analyzed, 19% were infected with E. coli and 1,12% with Salmonella spp. It was carried out an analysis of the profile of antibiotic resistance in which was observed the efficiency of estreptomicin, tetraciclin, trimetoprim and gentamicin over the samples. The samples of E. coli were submitted to the Congo Red Binding test and to the Hemolisis test and 70,6% of positive samples for the first test and 53% for the second one were observed.(AU)

Verificação da contaminação em ovos provenientes dos sistemas de produção caipira e granja, comercializados no município de Ipiaú-BA / Verification of eggs contamination the production farm, marketed in the city of Ipiau-BA

o consumo de ovos in natura ou de alimentos que não sofrem cozimento constitui-se em um grande risco à saúde, pois este tipo de alimento serve como veículo a diversos patógenos, em especial coliformes termotolerantes, os principais envolvidos em casos de toxinfecção alimentar. A identificação dos micro-organismos causadores de enfermidades permite avaliar a qualidade higiênica dos ovos comercializados. A realização desta pesquisa permitiu a identificação de alguns desses patógenos no município objeto do estudo. Foi verificado que as amostras advindas do sistema caipira de produção apresentaram resultados de contaminação em 13 (54,16%), enquanto que nas amostras de granja 7 (29,16%) foram positivas. As amostras de cascas dos ovos caipiras estavam predominantemente contaminadas por Enterobacter cloacae (29,16%) e Klesiella oxytoca (12,5%). Enquanto que nas amostras de cascas dos ovos de granja os micro-organismos predominantes foram Enterobacter cloacae ( 16,66%) e Klebsiella pneumoniae (4,16%). (AU)

The consumption of eggs in natura or raw foods constitutes in a big risk to health, because this type of food serves as a vehicle to various pathogens, especially fecal coliform, the main involved in cases of food poisoning. The identification of microorganisms that causes deseases, alow assess the hygienic quality of marketed eggs. This research allowed the identification of some of these pathogens in the municipality studied. It was noted that the samples coming from the rustic production system showed contamination results in 13 (54.16%), while in the factory-farmed samples 7 (29.16%) was positives. The Samples of shells of free-range eggs were predominantly contaminated by Enterobacter cloacae (29./6%) and Klesiella oxytoca (12.5%). While in samples of shells of factory-farmed egg the microorganisms predominant were Enterobacter cloacae (J6.66%) and Klebsiella pneumoniae (4.16%). (AU)

DETECCAO E IDENTIFICACAO DE GENES ESBLs E DE RESISTENCIA AS QUINOLONAS EM ENTEROBACTERIACEA ISOLADAS DE CARNES DE FRANGO, SUINA E BOVINA DESTINADAS AO CONSUMO HUMANO

Introdução: A resistência bacteriana aos antimicrobianos é um importante problema de saúde pública, que prolonga o período de tratamento, aumenta as taxas de mortalidade e custos da assistência à saúde. Este fenômeno pode ter considerado consequência do uso indiscriminado de antimicrobianos na medicina humana e veterinária, e ao longo da cadeia produtiva de alimentos. Nos últimos anos tem sido observado o frequente isolamento de bactérias resistentes a partir de animais de produção e alimentos de origem animal. Neste contexto, têm-se destacado a resistência aos beta-lactâmicos, devido à produção de beta-lactamase de espectro estendido (ESBL) e às quinolonas pela aquisição de genes qnr que codificam proteínas que interferem na ação das quinolonas sobre a DNA-girase e a topoisomerase IV. Diversas espécies bacterianas apresentando resistência aos antimicrobianos têm sido isoladas a partir de animais de produção. Objetivo: Este estudo teve como objetivo isolar enterobactérias resistentes aos beta-lactâmicos e quinolonas e detectar os genes blaCTX-M, blaSHV, blaTEM, qnrA, qnrB, qnrS e oqxAB em Enterobacteriaceae resistentes isoladas de carnes resfriadas de frango, suína e bovina comercializadas no município de São José do Rio Preto-SP, adquiridas entre novembro de 2010 e agosto de 2012. Material e Métodos: A suscetibilidade aos antimicrobianos foi determinada por disco-difusão de acordo com as normas do CLSI. As cepas resistentes aos beta-lactâmicos e às quinolonas foram submetidas à PCR com primers específicos para a detecção destes genes e ao sequenciamento para a identificação dos mesmos. Resultados: Um total de 75 isolados apresentou resistência aos beta-lactâmicos e 125 às quinolonas. Entre estes, 6,6% blaCTX-M, 6,6% blaTEM, 16% blaSHV, 21,6% apresentaram variantes de qnr e 13,6% oqxAB. Em uma cepa de Aeromonas sobria foi detectada a coexistência dos genes qnrA e qnrS; o gene qnrB foi detectado em cinco cepas de E. coli, cinco K.pneumoniae, duas Salmonella spp. e 12 Citrobacter spp. O gene qnrB19 foi detectado em duas K. pneumoniae, duas E. coli e uma Citrobacter braakii. qnrB2 foi detectado em três K. pneumoniae. O gene qnrS1 foi detectado em uma cepa de K. pneumoniae. O sequenciamento de blaCTX-M revelou blaCTX-M-2, sendo que todas foram provenientes de amostras de carne de frango. Conclusão: Esses dados revelam que pode haver associação entre o excessivo uso de antimicrobianos em animais de produção e o isolamento de bactérias resistentes aos mesmos. A presença de bactérias resistentes aos antimicrobianos em carnes destinadas ao consumo humano consiste em um problema de saúde pública e pode afetar as relações comerciais do país, já que o Brasil é um dos maiores exportadores de carne do mundo.

Introduction: Bacterial resistance to antimicrobials is an important public health problem, which results in increased treatment period, increase in mortality and in health care costs. This phenomenon is considered a result of the indiscriminate use of antimicrobials in human and veterinary medicine, and along the food chain. In recent years, it has been observed the frequent isolation of resistant bacteria from animal production and food of animal origin. In this context, have been highlighted the resistance to beta-lactâmicos and to quinolones, the first, due to extended-spectrum beta-lactamase (ESBL) production and the second, resultant from the acquisition of qnr genes encoding proteins that interfere in quinolone action on DNA gyrase and topoisomerase IV. Several bacterial species with antimicrobial resistance have been isolated from farm animals. Objective: This study evaluated the antimicrobial susceptibility profile and the presence of resistance genes blaCTX-M, blaSHV, blaTEM, qnrA, qnrB, qnrS and oqxAB in Enterobacteriaceae isolated from meat market in the municipality of São José do Rio Preto- SP, acquired between November 2010 and August 2012. Material and Methods: The antimicrobial susceptibility was determined by disk diffusion according to CLSI. Strains resistant to beta-lactams and quinolones were submitted to PCR using specific primers for detection and sequencing of these genes for identification. Results: A total of 75 isolates were resistant to beta-lactam and 125 to quinolones. Among these, 6.6% blaCTX-M, 6.6% blaTEM, 16% blaSHV, 21.6% had qnr variants and 13.6% oqxAB. In a strain of Aeromonas sobria was detected the coexistence of qnrA and qnrS genes; the qnrB gene was detected in five strains of E. coli, five K.pneumoniae, two Salmonella spp. and 12 Citrobacter spp. The qnrB19 gene was detected in two K. pneumoniae, duas E. coli and one Citrobacter braakii. qnrB2 was detected in three K. pneumoniae. The qnrS1 gene was detected in a strain of K. pneumoniae. The sequencing blaCTX-M revealed blaCTX-M-2, all of which were derived from chicken meat samples. Conclusion: These data demonstrate there nay be association between excessive use of antimicrobials in animal production and isolation of bacteria resistant to these antimicrobials. The presence of bacteria resistant to antimicrobials in meat intended for human consumption consists in a public health problem and can affect commercials relationships of the country, since it the Brazil is one of the world's largest meat exporters.

Diagnóstico microbiológico e histopatológico de mortalidade em avestruzes (Struthio camelus) / Microbiological and histological diagnosis in mortality of ostrich (Struthio camelus)

Several young ostrich, including nestlings, with lassitude and inappetence followed by death or victim of sudden death were immediately brought to diagnosis at an Animal Health Laboratory. At necropsy, animals presented hemorrhage and altered content of the vitelline sac, and necrotic foci in the small intestine; one animal showed necrotic pleuropneumonia with psammomatosus bodies in the lung parenchyma. The cultures from different samples revealed Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa, Klebsiella pneumoniae, Serratia marcescens, Enterobacter aglomerans, and Pseudomonas mendocina. It was suggested one case of septicemia in an animal with exclusive growth of K. pneumoniae isolated from samples of small intestine, lung, and liver.(AU)

Utilização de redes neurais artificiais para a classificação da resistência a antimicrobianos e sua relação com a presença de 38 genes associados a virulência isolados de amostras de Escherichia coli provenientes de frangos de corte

A Escherichia coli patogênica aviária (APEC), pertence à família Enterobacteriacea, é responsável por vários processos patológicos nas aves, atuando como agente primário ou secundário na aerossaculite, pericardite, perihepatite, peritonite, salpingite, onfalite, celulite, entre outros. O presente estudo aborda a resistência a antimicrobianos de amostras de E. coli (APEC) de uma forma inovadora, utilizando como ferramenta as redes neurais artificiais, metodologia inserida na linha de pesquisa do CDPA (Centro de Diagnóstico e Pesquisa em Patologia Aviária). A utilização de inteligência artificial, especificamente, as redes neurais artificiais (RNAs), está sendo crescentemente empregada como ferramenta para a análise de dados não lineares e multivariados, característica comum em fenômenos biológicos. O objetivo do presente trabalho foi demonstrar que é possível predizer o uso de antimicrobianos, utilizando trinta e oito genes responsáveis por distintos fatores de virulência, oriundos das amostras de Escherichia coli isoladas de frango de corte, através das redes neurais artificiais (RNAs). Além disso, verificou-se a relação entre o índice de patogenicidade (IP) e a resistência aos quatorze antimicrobianos que fazem parte do banco de dados usado para o desenvolvimento deste estudo. Neste trabalho foram utilizados os dados disponíveis referentes a 256 amostras de E. coli isoladas de camas de aviários, lesões de celulite e quadros respiratórios de frangos de corte. Para a confecção das redes neurais artificiais as entradas escolhidas foram: os índices de patogenicidade, as lesões induzidas em pintos de um dia de idade, a caracterização dos genes associados à patogenicidade, o bioquimismo, a origem das amostras e por fim, a motilidade. As redes neurais artificiais foram criadas realizando associações entre as variáveis de entrada com o objetivo de encontrar o modelo mais ajustado. As saídas utilizadas de acordo com Salle (2009) foram o comportamento das cepas de Escherichia coli frente aos 14 antimicrobianos. Para verificar se existia diferença significativa entre as médias dos índices de patogenicidade (IP) e as amostras sensíveis e resistentes aos 14 antimicrobianos utilizados neste estudo, realizou-se análise estatística com o auxílio do software JMP® 9.0.1 (SAS Institute Inc., 2010). Os resultados obtidos demonstram que as redes neurais artificiais foram capazes de realizar a classificação correta do comportamento das amostras com amplitude de 74,22% a 98,44%, desta forma tornando possível predizer a resistência antimicrobiana da Escherichia coli, através de modelo das RNAs. A análise estatística realizada para verificar a relação entre o IP e a resistência aos 14 antimicrobianos demonstrou que estas são variáveis independentes. Ou seja, podem haver picos no IP sem alteração na resistência antimicrobiana, ou até mesmo o contrário, alterações na resistência antimicrobiana sem mudanças no IP

The avian pathogenic Escherichia coli (APEC), belongs to the family Enterobacteriacea, is responsible for various pathological processes in poultry, acting as an agent in the primary or secondary lesion such as: sacculitis, pericarditis, perihepatitis, peritonitis, salpingitis, omphalitis, cellulitis, among others. This study addresses the antimicrobial resistance of E. coli (APEC) strains in an innovative way, using tools such as artificial neural networks, methodology embedded in the CDPA´s search line (Center for Diagnostics and Research in Avian Pathology). The use of artificial intelligence, specifically artificial neural networks (RNAs), is being increasingly used as a tool for data analysis and nonlinear multivariate, common feature in biological phenomena. The objective of this study was to demonstrate that it is possible to predict the use of antimicrobials, using thirty-eight distinct genes responsible for virulence factors, derived from Escherichia coli isolates from broiler, through artificial neural networks (ANNs). Besides, it was found the relationship between pathogenicity index (PI) and resistance to fourteen antimicrobial forming part of the database used for the development of this study. In this study was used the data available for 256 samples of E. coli isolated from broiler litter, lesion of cellulitis and respiratory symptoms in broilers. To make the neural network inputs have been chosen: the indices of pathogenicity, the induced lesions in chicks at day old, characterization of genes associated with pathogenicity, biochemism, the source of samples and finally motility. Artificial neural networks have been created making associations between the input variables in order to find the best adjusted model. The outputs used according Salle (2009) was the behavior of Escherichia coli strains compared to 14 antimicrobials. To check whether there was a significant difference between the average indices for pathogenicity (IP) and the sensitive and resistant samples to 14 antimicrobials used in this study, statistical analysis was performed with the help of software JMP ® 9.0.1 (SAS Institute Inc., 2010). The results show that artificial neural networks were able of performing correct classification of the behavior of the samples with an amplitude of 74.22% to 98.44%, thereby making it possible to predict the antibiotic resistance of Escherichia coli, using ANNs model. The statistical analysis performed to assess the relationship between IP and resistance to 14 antibiotics showed that these variables are independent. That is, it can happen peaks in IP without change in antimicrobial resistance, or even the opposite, changes in antimicrobial resistance without changes in IP

Patógenos veiculados por saladas de alface servidas em restaurantes / Borne pathogens by lettuce salads served in restaurants

O objetivo deste trabalho foi avaliar a qualidade microbiológica e parasitológica de salada de alface servida em restaurantes self-services no município de Taubaté-SP. Na estação seca duas amostras (14,3 por cento) apresentaram coliformes fecais em níveis superiores ao permitido pela Vigilância Sanitária (10² NMP/g), sendo que na estação úmida seis amostras (42,9 por cento) foram positivas. A presença de Escherichia coli foi confirmada em três amostras (21,43 por cento) colhidas na estação seca e em cinco (35,7 por cento) na úmida. As enterobactérias mais freqüentes, nas duas estações, foram Enterobacter aglomerans e Klebsiella pneumoniae, respectivamente, 57,1 por cento e 50,0 por cento na seca e 71,4 por cento e 85,7 por cento, na úmida. Cryptosporidium spp. foi o parasito mais freqüente, sendo encontrado em quatro amostras (28,57 por cento) na estação úmida e em uma (7,1 por cento) na seca. Grande percentual dos restaurantes avaliados não oferecia alfaces com condições higiênicas sanitárias adequadas, sendo que a contaminação foi maior na estação úmida, podendo ser conseqüência do maior índice pluviométrico, o que torna um ambiente adequado para proliferação de patógenos, ou até mesmo pelo despreparo dos manipuladores às normas para o preparo dos alimentos.(AU)

The objective of this work was to evaluate the microbiological and parasitological quality of lettuce served self-services in restaurants. In dry station two samples (14.3%) presented fecal coliforms in levels superior to 102 NMP/g, by the way in the humid station six samples (42.9%) had been positive. It was confirmed Escherichia coli in three samples (21.4%) in the dry station and five (35.7%) in the humid one. The species of the family Enterobacteriaceae more frequent in both stations, was Enterobacter aglommerans and Klebsiella pneumoniae, respectively, 57.1% and 50.0% in dry and 71.4% and 85.7%, in the humid one. The most frequent protozoa was Cryptosporidium spp., found in four samples (28.6%) in the humid station and in one (7.1%) in dry one. Great percentage of the evaluated restaurants did not offer lettuces with adjusted sanitary hygienic conditions, the contamination was higher in the humid station, probable consequence of the high pluviometric index, that becomes an environment adjusted for proliferation of pathogens, or even though for the unpreparedness of the manipulators to the norms for the preparation of foods. (AU)