Expression analysis of transcription factors in sugarcane during cold stress / Análise de expressão de fatores de transcrição em cana-de-açúcar sob estresse por frio

Abstract Transcription factors (TF) are a wide class of genes in plants, and these can regulate the expression of other genes in response to various environmental stresses (biotic and abiotic). In the current study, transcription factor activity in sugarcane was examined during cold stress. Initially, RNA transcript reads of two sugarcane cultivars (ROC22 and GT08-1108) under cold stress were downloaded from SRA NCBI database. The reads were aligned into a reference genome and the differential expression analyses were performed with the R/Bioconductor edgeR package. Based on our analyses in the ROC22 cultivar, 963 TF genes were significantly upregulated under cold stress among a total of 5649 upregulated genes, while 293 TF genes were downregulated among a total of 3,289 downregulated genes. In the GT08-1108 cultivar, 974 TF genes were identified among 5,649 upregulated genes and 283 TF genes were found among 3,289 downregulated genes. Most transcription factors were annotated with GO categories related to protein binding, transcription factor binding, DNA-sequence-specific binding, transcription factor complex, transcription factor activity in RNA polymerase II, the activity of nucleic acid binding transcription factor, transcription corepressor activity, sequence-specific regulatory region, the activity of transcription factor of RNA polymerase II, transcription factor cofactor activity, transcription factor activity from plastid promoter, transcription factor activity from RNA polymerase I promoter, polymerase II and RNA polymerase III. The findings of above results will help to identify differentially expressed transcription factors during cold stress. It also provides a comprehensive analysis of the regulation of the transcription activity of many genes. Therefore, this study provides the molecular basis for improving cold tolerance in sugarcane and other economically important grasses.

Resumo Fatores de transcrição (FT) são uma ampla classe de genes em plantas e podem regular a expressão de outros genes em resposta a vários estresses ambientais (estresses bióticos e abióticos). No presente estudo, a atividade do fator de transcrição na cana-de-açúcar foi examinada durante o estresse pelo frio. Inicialmente, as leituras de transcrição de RNA de duas cultivares de cana-de-açúcar (ROC22 e GT08-1108) sob estresse frio foram baixadas do banco de dados SRA NCBI. As leituras foram alinhadas em um genoma de referência e as análises de expressão diferencial foram realizadas com o pacote R / Bioconductor edgeR. Com base em nossas análises no cultivar ROC22, 963 genes TF foram significativamente regulados positivamente sob estresse pelo frio entre um total de 5.649 genes regulados positivamente, enquanto 293 genes TF foram regulados negativamente entre um total de 3.289 genes regulados negativamente. No cultivar GT08-1108, 974 genes TF foram identificados entre 5.649 genes regulados positivamente e 283 genes TF foram encontrados entre 3.289 genes regulados negativamente. Os fatores de transcrição, em sua maioria, foram anotados com categorias GO relacionadas à ligação de proteína, ligação de fator de transcrição, ligação específica de sequência de DNA, complexo de fator de transcrição, atividade de fator de transcrição em RNA polimerase II, atividade de fator de transcrição de ligação de ácido nucleico, atividade de corepressor de transcrição, sequência específica da região reguladora, atividade do fator de transcrição da RNA polimerase II, atividade do cofator do fator de transcrição, atividade do fator de transcrição do promotor do plastídio, atividade do fator de transcrição do promotor da RNA polimerase I, polimerase II e RNA polimerase III. As descobertas dos resultados acima ajudarão a identificar fatores de transcrição expressos diferencialmente durante o estresse pelo frio. Ele também fornece uma análise abrangente da regulação da atividade de transcrição de muitos genes. Portanto, este estudo fornece base molecular para melhorar a tolerância ao frio em cana-de-açúcar e outras gramíneas economicamente importantes.

Cumulative effect of different acute stressors on physiological and hormonal responses and milk yield in lactating Saanen goats / Efeito cumulativo de diferentes estressores agudos sobre as respostas fisiológicas, hormonais e produção de leite de cabras Saanen em lactação

This study addresses the hypothesis that acute stress can cumulatively cause a decrease in milk yield in Saanen goats. In fact, dairy animals are subject to several environmental and management challenges that may cause acute stress during the same lactation. However, the cumulative effect of acute stress on milk yield remains unclear. Thus, the objective of this study was to evaluate the effects of different acute stressors on milk yield and milk quality in goats. Thirty Saanen goats were either maintained on their usual routine and comfort conditions (control group) or subjected to different environmental stressors (heat stress, adrenocorticotropic hormone [ACTH] administration, hoof care, and rain). These stressful challenges were performed sequentially, one challenge per day, on four consecutive days to evaluate the influence of the challenge on milk yield and milk quality. The acute stress imposed on goats caused significant changes in respiratory rate, rectal temperature, cortisol, insulin, triiodothyronine, insulin-like growth factor 1, and glucose concentrations when compared to the control group. Although these acute-stress-triggered physiological responses are fundamental to restoring homeostasis, the cumulative effects of different imposed challenges caused a change in hormone release, an increase in somatic cell count (SCC), and a decrease in milk yield. In this context, the results of this study indicate that farmers should avoid concurrently subjecting goats to management and environmental challenges that can induce acute stress because these stressors have a negative and cumulative impact on SCC and milk yield.(AU)

Este estudo aborda a hipótese de que o estresse agudo pode causar cumulativamente uma diminuição na produção de leite de cabras Saanen. De fato, os animais leiteiros estão sujeitos a vários desafios ambientais e de manejo que podem causar estresse agudo durante a mesma lactação. No entanto, o efeito cumulativo do estresse agudo na produção de leite ainda não está claro. Assim, o objetivo deste estudo foi avaliar os efeitos de diferentes estressores agudos na produção e qualidade de leite de cabras Saanen. Trinta cabras Saanen foram mantidas em sua rotina habitual e condições de conforto (grupo controle) ou submetidas a diferentes estressores ambientais (estresse por calor, administração de hormônio adrenocorticotrófico [ACTH], cuidados com os cascos e chuva). Esses desafios estressantes foram realizados sequencialmente, um desafio por dia, em quatro dias consecutivos para avaliar a influência do desafio na produção e qualidade do leite. O estresse agudo imposto as cabras causou alterações significativas na frequência respiratória, temperatura retal, cortisol, insulina, triiodotironina, fator de crescimento semelhante à insulina 1 e concentrações de glicose quando comparado ao grupo controle. Embora essas respostas fisiológicas desencadeadas pelo estresse agudo sejam fundamentais para restaurar a homeostase, os efeitos cumulativos de diferentes desafios impostos causaram uma mudança na liberação de hormônios, um aumento na contagem de células somáticas (CCS) e uma diminuição na produção de leite. Neste contexto, os resultados deste estudo indicam que os produtores devem evitar submeter as cabras concomitantemente a desafios de manejo e ambientais que possam induzir estresse agudo, pois esses estressores têm impacto negativo e cumulativo na CCS e na produção de leite.(AU)

Effects of 48-hour feed deprivation on acute-phase response in horses / Efeitos da privação alimentar de 48 horas na resposta de fase aguda em cavalos

The objective of this study was to evaluate the effect of feed restriction on acute-phase response in horses. Twenty horses were deprived of food for 48 h and others 12 animals (control) had free access to water and hay. They were closely monitored and examined, and blood samples were taken at the beginning (0) of the study and 6, 12, 18, 24, 30, 36, 42 and 48 hours afterward. Data were submitted to two-way analysis of variance with repeated measures and statistical significance was P ≤ 0.05. The horses tolerated feed restriction without serious clinical complications. Feed restriction induced an increase in the acute-phase response by elevating serum concentrations of α2-macroglobulin (24-38 h), ceruloplasmin (36-48 h), α1-antitrypsin (30-48 h), α1-acid glycoprotein (42-48 h) and haptoglobin (42-48 h). Nutrient deprivation raised the levels of circulating cortisol, which acts on the innate immune system, which then induces the acute-phase response. In conclusion, food restriction is a physical stressor for horses, capable of inducing an acute-phase protein reaction, characterized by increased production of α2-macroglobulin, ceruloplasmin, α1- antitrypsin, α1-acid glycoprotein and haptoglobin.

O objetivo deste estudo foi avaliar o efeito da restrição alimentar na resposta de fase aguda em equinos. Vinte cavalos foram submetidos à restrição alimentar por 48 h enquanto outros 12 animais (controle) tiveram livre acesso à água e alimento. Os animais foram monitorados, examinados e amostras de sangue foram coletadas no início (0) do estudo e com 6, 12, 18, 24, 30, 36, 42 e 48 horas de restrição alimentar. Os dados foram submetidos à análise de variância bidirecional com medidas repetidas e a significância estatística foi P ≤ 0,05. Os cavalos toleraram a restrição alimentar sem complicações clínicas relevantes. A restrição alimentar induziu uma resposta de fase aguda caracterizada pela elevação das concentrações séricas de α2-macroglobulina (24-38 h), ceruloplasmina (36-48 h), α1-antitripsina (30-48 h), α1-glicoproteína ácida (42-48 h) e haptoglobina (42-48 h). A privação de nutrientes eleva os níveis de cortisol circulante, que atua no sistema imunológico inato o qual, então induz a resposta de fase aguda. Em conclusão, a restrição alimentar é um fator estressor físico para equinos, capaz de induzir uma reação proteica de fase aguda, caracterizada pelo aumento na produção de α2-macroglobulina, ceruloplasmina, α1-antitripsina, α1-glicoproteína ácida e haptoglobina.

Evaluation of water stress and co-inoculation of Azospirillum brasilense and Rhizobium tropici in beans (Phaseolus vulgaris l) / Avaliação do estratégio de água e co-inoculação de Azospirillum brasilense e Rhizobium tropici in beans (Phaseolus vulgaris l) / Evaluación del estrés hídrico y la coinoculación de Azospirillum brasilense y Rhizobium tropici en frijoles (Phaseolus vulgaris l)

Climate change has caused major changes in abiotic factors, with water stress as the greatest threat to agricultural production. The measures aimed at alleviating the problems caused by this limiting production factor have occurred through the adoption of sustainable strategies, especially microbial biotechnology, which uses the interactions between the microorganism and the plant, ensuring productive quality and inducing plant resistance to stresses biotic and abiotic. The objective of the present work was to evaluate the biological nitrogen fixation and the development of bean seedlings, with co-inoculation of two types of inoculants, which were subjected to water stress by different pot capacities. The experiment was conducted in a greenhouse, at Universidade Paranaense - UNIPAR, from April to June 2019. The experimental design was completely randomized (DIC), with 5 replications, 16 treatments and 80 experimental units. The cultivar used was SCS Riqueza. The parameters evaluated were pot capacity (25%, 50%, 75% and 90%); small, large and total nodules, shoot and root length, dry and fresh weight, total carbon and nitrogen. The evaluation of the morphological parameters of the bean seedlings indicated that the co- inoculation technique promoted beneficial effects for the dry mass parameters of shoot, nodule and root. The analysis of the percentage of carbon and nitrogen in the tissues of the seedlings provided an increase in the concentration of these elements in treatments that involved co-inoculation (Azospirillum brasilensis and Rhizobium tropici) with pot capacities of 25 and 75% (CV), demonstrating that the association of microorganisms is beneficial in the limiting water situation.(AU)

A mudança climática tem causado grandes mudanças nos fatores abióticos, sendo o estresse hídrico a maior ameaça à produção agrícola. As medidas destinadas a aliviar os problemas causados por este fator limitante de produção ocorreram através da adoção de estratégias sustentáveis, especialmente a biotecnologia microbiana, que utiliza as interações entre o microorganismo e a planta, garantindo a qualidade produtiva e induzindo a resistência da planta ao estresse biótico e abiótico. O objetivo do presente trabalho foi avaliar a fixação biológica de nitrogênio e o desenvolvimento de mudas de feijão, com co-inoculação de dois tipos de inoculantes, que foram submetidos ao estresse hídrico por diferentes capacidades de vaso. A experiência foi realizada em uma estufa, na Universidade Paranaense - UNIPAR, de abril a junho de 2019. O projeto experimental foi completamente randomizado (DIC), com 5 réplicas, 16 tratamentos e 80 unidades experimentais. A cultivar utilizada foi a SCS Riqueza. Os parâmetros avaliados foram a capacidade do vaso (25%, 50%, 75% e 90%); nódulos pequenos, grandes e totais, comprimento do rebento e da raiz, peso seco e fresco, carbono total e nitrogênio. A avaliação dos parâmetros morfológicos das mudas de feijão indicou que a técnica de co-inoculação promoveu efeitos benéficos para os parâmetros de massa seca do turião, nódulo e raiz. A análise da porcentagem de carbono e nitrogênio nos tecidos das mudas proporcionou um aumento na concentração destes elementos nos tratamentos que envolveram a co-inoculação (Azospirillum brasilensis e Rhizobium tropici) com capacidades de vaso de 25 e 75% (CV), demonstrando que a associação de microorganismos é benéfica na situação limite da água.(AU)

El cambio climático ha provocado importantes cambios en los factores abióticos, siendo el estrés hídrico la mayor amenaza para la producción agrícola. Las medidas encaminadas a paliar los problemas causados por este factor limitante de la producción se han producido mediante la adopción de estrategias sostenibles, especialmente la biotecnología microbiana, que utiliza las interacciones entre el microorganismo y la planta, asegurando la calidad productiva e induciendo la resistencia de la planta a los estreses bióticos y abióticos. El objetivo del presente trabajo fue evaluar la fijación biológica de nitrógeno y el desarrollo de plántulas de frijol, con la co-inoculación de dos tipos de inoculantes, que fueron sometidos a estrés hídrico por diferentes capacidades de maceta. El experimento se realizó en un invernadero, en la Universidade Paranaense - UNIPAR, de abril a junio de 2019. El diseño experimental fue completamente al azar (DIC), con 5 repeticiones, 16 tratamientos y 80 unidades experimentales. El cultivar utilizado fue SCS Riqueza. Los parámetros evaluados fueron capacidad de maceta (25%, 50%, 75% y 90%); nódulos pequeños, grandes y totales, longitud de brotes y raíces, peso seco y fresco, carbono y nitrógeno total. La evaluación de los parámetros morfológicos de las plántulas de frijol indicó que la técnica de coinoculación promovió efectos beneficiosos para los parámetros de masa seca de brotes, nódulos y raíces. El análisis del porcentaje de carbono y nitrógeno en los tejidos de las plántulas proporcionó un aumento en la concentración de estos elementos en los tratamientos que involucraron la coinoculación (Azospirillum brasilensis y Rhizobium tropici) con capacidades de maceta de 25 y 75% (CV), demostrando que la asociación de microorganismos es beneficiosa en la situación de agua limitante.(AU)

Influência da dificuldade de inseminação, temperamento e cortisol plasmático sobre a taxa de concepção de vacas e novilhas da raça Nelore inseminadas em tempo fixo / Influence of difficulty of insemination, temperament and plasma cortisol on conception rate of Nelore cows and heifers in timed AI

O objetivo do presente experimento foi avaliar efeito do estresse e da dificuldade de inseminação (DifIA) sobre a taxa de concepção (TC) de vacas (n=93) e novilhas (n= 72) Nelore submetidas à IATF. No D9, anotou-se nota de temperamento (NTe) e tempo da saída do brete (TSB) de todos os animais e coletou-se sangue das novilhas. No dia da IATF (D11), anotou-se NTe, TSB, DifIA e tempo de IA. A TC foi 36% para vacas e 46% para novilhas (P>0,05). Não foi observado efeito de Nte sobre TC (P>0,05). Porém, houve tendência para maior (P<0,10) TC nos animais que não apresentaram dificuldade de inseminação (DifIA1; TP=42%) em comparação aos animais com moderada ou alta dificuldade (DifIA2+DifIA3; TP=27%). Foi observado menor (P<0,05) tempo de IA para animais DifIA1 (17:31±06:02s) que animais DifIA2-3 (30:10±15:45s). Novilhas com maiores (P<0,05) níveis de cortisol apresentaram maior NTe (P<0,05). Entretanto, TC (59%) das novilhas menos reativas (cortisol=4,12±1,12ng/mL; NTe=3,2±0,6) não diferiu da TC (41%; P>0,05) das mais agitadas (cortisol=7,76±1,33ng/mL; NTe=3,82±0,79). Concluiu-se que avaliações de temperamento se relacionaram com nível de estresse, embora esses parâmetros não tenham afetado a TC deste trabalho. A maior dificuldade e/ou tempo necessário para se completar a IA demonstrou ser um potencial fator para a redução da fertilidade na IATF.(AU)

The objective was to evaluate the influence of stress and difficulty of insemination (DifIA) on conception rate (CR) of Nellore cows (n= 93) and heifers (n= 72) in Timed-AI. On D9, temperament (NTe) and time for chute exit (TSB) were recorded for all animals, and blood samples were colected from heifers. On the day of Timed-AI (D11), NTe, TSB, DifIA and time for AI were recorded. For cows, CR was 36% and for heifers 46% (P> 0.05). No effect (P> 0.05) of NTe was observed on CR. However, a tendency (P< 0,10) for higher CR was observed in animals with no difficulty for insemination (DifIA1; CR=42%) compared to animals that presented moderate or high difficulty (DifIA2+DifIA3, CR=27%). Time required for AI was lower (P< 0.05) in animals DifIA1 (17:31±06:02sec) than in animals DifIA2-3 (30:10±15:45sec). Heifers with greater (P< 0.05) cortisol levels presented higher Nte (P< 0.05). However, CR (59%) of less reactive heifers (cortisol=4,12±1,12ng/mL; NTe=3,2±0,6) did not differ from CR (41%; P> 0.05) of stressed animals (cortisol=7,76±1,33ng/mL; NTe=3,82±0,79). It was concluded that assessments of temperament were related to stress level, although these parameters did not affect the CR of this study. However, the higher difficulty and/or time to complete AI showed to be a potential factor for reducing fertility after timed-AI.(AU)

Influência da dificuldade de inseminação, temperamento e cortisol plasmático sobre a taxa de concepção de vacas e novilhas da raça Nelore inseminadas em tempo fixo / Influence of difficulty of insemination, temperament and plasma cortisol on conception rate of Nelore cows and heifers in timed AI

O objetivo do presente experimento foi avaliar efeito do estresse e da dificuldade de inseminação (DifIA) sobre a taxa de concepção (TC) de vacas (n=93) e novilhas (n= 72) Nelore submetidas à IATF. No D9, anotou-se nota de temperamento (NTe) e tempo da saída do brete (TSB) de todos os animais e coletou-se sangue das novilhas. No dia da IATF (D11), anotou-se NTe, TSB, DifIA e tempo de IA. A TC foi 36% para vacas e 46% para novilhas (P>0,05). Não foi observado efeito de Nte sobre TC (P>0,05). Porém, houve tendência para maior (P<0,10) TC nos animais que não apresentaram dificuldade de inseminação (DifIA1; TP=42%) em comparação aos animais com moderada ou alta dificuldade (DifIA2+DifIA3; TP=27%). Foi observado menor (P<0,05) tempo de IA para animais DifIA1 (17:31±06:02s) que animais DifIA2-3 (30:10±15:45s). Novilhas com maiores (P<0,05) níveis de cortisol apresentaram maior NTe (P<0,05). Entretanto, TC (59%) das novilhas menos reativas (cortisol=4,12±1,12ng/mL; NTe=3,2±0,6) não diferiu da TC (41%; P>0,05) das mais agitadas (cortisol=7,76±1,33ng/mL; NTe=3,82±0,79). Concluiu-se que avaliações de temperamento se relacionaram com nível de estresse, embora esses parâmetros não tenham afetado a TC deste trabalho. A maior dificuldade e/ou tempo necessário para se completar a IA demonstrou ser um potencial fator para a redução da fertilidade na IATF.(AU)

The objective was to evaluate the influence of stress and difficulty of insemination (DifIA) on conception rate (CR) of Nellore cows (n= 93) and heifers (n= 72) in Timed-AI. On D9, temperament (NTe) and time for chute exit (TSB) were recorded for all animals, and blood samples were colected from heifers. On the day of Timed-AI (D11), NTe, TSB, DifIA and time for AI were recorded. For cows, CR was 36% and for heifers 46% (P> 0.05). No effect (P> 0.05) of NTe was observed on CR. However, a tendency (P< 0,10) for higher CR was observed in animals with no difficulty for insemination (DifIA1; CR=42%) compared to animals that presented moderate or high difficulty (DifIA2+DifIA3, CR=27%). Time required for AI was lower (P< 0.05) in animals DifIA1 (17:31±06:02sec) than in animals DifIA2-3 (30:10±15:45sec). Heifers with greater (P< 0.05) cortisol levels presented higher Nte (P< 0.05). However, CR (59%) of less reactive heifers (cortisol=4,12±1,12ng/mL; NTe=3,2±0,6) did not differ from CR (41%; P> 0.05) of stressed animals (cortisol=7,76±1,33ng/mL; NTe=3,82±0,79). It was concluded that assessments of temperament were related to stress level, although these parameters did not affect the CR of this study. However, the higher difficulty and/or time to complete AI showed to be a potential factor for reducing fertility after timed-AI.(AU)

Screening and analysis on the differentially expression genes between diploid and autotetraploid watermelon by using of digital gene expression profile / Triagem e análise da expressão diferencial dos genes entre melancia diplóide e autotetraplóide através do perfil de expressão gênica digital

Synthetic polyploids are key breeding materials for watermelon. Compared with diploid watermelon, the tetraploid watermelon often exhibit wide phenotypic differences and differential gene expression. Digital gene expression (DGE) profile technique was performed in this study to present gene expression patterns in an autotetraploid and its progenitor diploid watermelon, and deferentially expressed genes (DEGs) related to the abiotic and biotic stress were also addressed. Altogether, 4,985 DEGs were obtained in the autotetraploid against its progenitor diploid, and 66.02% DEGs is up-regulated. GO analysis shows that these DEGs mainly distributed in metabolic process, cell and catalytic activity. KEGG analysis revealed that these DEGs mainly cover metabolic pathways, secondary metabolites and ribosome. Moreover, 134 tolerance related DEGs were identified which cover osmotic adjustment substance, protective enzymes/protein, signaling proteins and pathogenesis-related proteins. This study present the differential expression of stress related genes and global gene expression patterns at background level in autotetraploid watermelons. These new evidences could supplement the molecular theoretical basis for the better resistance after the genome doubling in the gourd family.(AU)

Poliploides sintéticos são materias fundamentais para melhoramento genético da melancia. Comparativamente ao seu homólogo diploide, a melancia tetraploide apresenta amplas diferenças genotípica e fenotípica e diferença de expressão gênica. A expressão gênica digital ou DGE (digital gene expression) foi utilizada neste estudo para representar o perfil de expressão gênica da melancia autotetraploide e seu progenitor diploide e a expressão diferencial de genes relacionados ao estresse biótico e abiótico. Os resultados mostraram que 4.985 DEGs foram observados no organismo autotetraploide, sendo que, deste total, 66.02%foram supra-regulados. A análise de ontologia gênica (GO) mostrou que estes DEGs estão relacionados principalmente com processos metabólicas, célula e atividade catalítica, abrangendo de acordo com a análise de genes e genoma (KEGG) rotas metabólicas, metabolismo secundário e ribossomos. Além disso, 134 genes de defesa foram identificados, abrangendo substâncias de ajuste osmótico, enzimas/proteínas de proteção, proteínas sinalizadoras e proteínas relacionadas à patogênese. Este estudo mostrou a expressão diferencial de genes relacionados ao estresse e o perfil global de expressão gênica de melancia autotetraploide, estes resultados podem complementar, a nível molecular, o entendimento do fator resistência após a duplicação do genoma em cucurbitáceas.(AU)

Fauna parasitária e relação parasito-hospedeiro de tambaquis criados na região do Baixo São Francisco, nordeste do Brasil / Parasitic fauna and parasite-host relationship of tambaqui reared in São Francisco river basin, Brazilian northeast

Este trabalho teve como objetivo avaliar a fauna parasitária de tambaquis na região do Baixo São Francisco-AL/SE-Brasil e correlacionar os índices de prevalência e intensidade média com fatores bióticos e abióticos. Foram coletados 252 espécimes para análise parasitológica de 10 pisciculturas. Os parasitos foram contabilizados, identificados, e determinaram-se os índices de prevalência e intensidade média, que foram correlacionados com fatores bióticos e abióticos. Dos peixes coletados, 65,5% estavam parasitados por pelo menos um táxon. Foram encontrados 10 táxons: Monogeneas, Ichthyophthirius multifiliis, tricodinídeos, Piscinoodinium pillulare, Ichthyobodo sp., Dolops carvalhoi, Lernaea cyprinacea, Procamallanus (Spirocamallanus) inopinatus, Henneguya sp. e Myxobolus sp. As maiores prevalências foram encontradas para Monogeneas (49,2%) e Myxobolus sp. (31,5%). Correlações negativas entre prevalência e fatores bióticos (peso e comprimento) foram observadas para Monogeneas (r2= -0,49; r2= -0,43), Myxobolus sp. (r²= -0,46; r²= -0,39) e Henneguya sp. (r²= -0,41; r²= -0,39). O fator abiótico temperatura apresentou correlação negativa com as prevalências de Lernaea cyprinacea (r= -0,39) e tricodinídeos (r= -0,33), enquanto a condutividade elétrica apresentou correlação positiva (r= 0,40) com a prevalência de tricodinídeos. Conclui-se que a fauna parasitária dos tambaquis cultivados na região do Baixo São Francisco é diversificada e com a carga parasitária dependente da qualidade de água e do estágio de desenvolvimento dos peixes.(AU)

This study investigated the parasitic fauna of tambaquis reared in lower Sao Francisco region-Al/SE-Brazil correlating parasitic indices to abiotic and biotic factors. A total of 252 specimens of tambaqui were collected in ten fish farms for parasitological analysis. The parasites were counted, identified and the parasitological indices were determined and correlated to biotic and abiotic factors. Of all collected fish, 65,5 % were parasitized by at least one taxon. Ten taxa were found: Monogeneans, Ichthyophthirius multifiliis, trichodinids Piscinoodinium pillulare, Ichthyobodo sp, Dolops carvalhoi, Lernaea cyprinacea, Procamallanus (Spirocamallanus) inopinatus, Henneguya sp. and Myxobolus sp. The higher prevalences were found to monogeneans (49.2%) and Myxobolus sp. (31.5%). Negative correlation of prevalence and biotic factor (weight and length) were observed to monogeneans (r 2 = -0.49, r 2 = -0.43), Myxobolus sp (r²= -0.46; r²= -0.39) and Henneguya sp (r²= -0.41; r²= -0.39). Abiotic factor of temperature presented a negative correlation to prevalence of Lernaea cyprinacea and trichodinids (r= -0.39 e r= -0.33, respectively) and the electric conductivity presented positive correlation to trichodinids (r= 0.40). It was concluded that parasitic fauna of tambaquis cultured in Lower São Francisco region is diversified and the parasitic load dependent on water parameters and fish growth.(AU)

Fauna parasitária e relação parasito-hospedeiro de tambaquis criados na região do Baixo São Francisco, nordeste do Brasil / Parasitic fauna and parasite-host relationship of tambaqui reared in São Francisco river basin, Brazilian northeast

Este trabalho teve como objetivo avaliar a fauna parasitária de tambaquis na região do Baixo São Francisco-AL/SE-Brasil e correlacionar os índices de prevalência e intensidade média com fatores bióticos e abióticos. Foram coletados 252 espécimes para análise parasitológica de 10 pisciculturas. Os parasitos foram contabilizados, identificados, e determinaram-se os índices de prevalência e intensidade média, que foram correlacionados com fatores bióticos e abióticos. Dos peixes coletados, 65,5% estavam parasitados por pelo menos um táxon. Foram encontrados 10 táxons: Monogeneas, Ichthyophthirius multifiliis, tricodinídeos, Piscinoodinium pillulare, Ichthyobodo sp., Dolops carvalhoi, Lernaea cyprinacea, Procamallanus (Spirocamallanus) inopinatus, Henneguya sp. e Myxobolus sp. As maiores prevalências foram encontradas para Monogeneas (49,2%) e Myxobolus sp. (31,5%). Correlações negativas entre prevalência e fatores bióticos (peso e comprimento) foram observadas para Monogeneas (r2= -0,49; r2= -0,43), Myxobolus sp. (r²= -0,46; r²= -0,39) e Henneguya sp. (r²= -0,41; r²= -0,39). O fator abiótico temperatura apresentou correlação negativa com as prevalências de Lernaea cyprinacea (r= -0,39) e tricodinídeos (r= -0,33), enquanto a condutividade elétrica apresentou correlação positiva (r= 0,40) com a prevalência de tricodinídeos. Conclui-se que a fauna parasitária dos tambaquis cultivados na região do Baixo São Francisco é diversificada e com a carga parasitária dependente da qualidade de água e do estágio de desenvolvimento dos peixes.(AU)

This study investigated the parasitic fauna of tambaquis reared in lower Sao Francisco region-Al/SE-Brazil correlating parasitic indices to abiotic and biotic factors. A total of 252 specimens of tambaqui were collected in ten fish farms for parasitological analysis. The parasites were counted, identified and the parasitological indices were determined and correlated to biotic and abiotic factors. Of all collected fish, 65,5 % were parasitized by at least one taxon. Ten taxa were found: Monogeneans, Ichthyophthirius multifiliis, trichodinids Piscinoodinium pillulare, Ichthyobodo sp, Dolops carvalhoi, Lernaea cyprinacea, Procamallanus (Spirocamallanus) inopinatus, Henneguya sp. and Myxobolus sp. The higher prevalences were found to monogeneans (49.2%) and Myxobolus sp. (31.5%). Negative correlation of prevalence and biotic factor (weight and length) were observed to monogeneans (r 2 = -0.49, r 2 = -0.43), Myxobolus sp (r²= -0.46; r²= -0.39) and Henneguya sp (r²= -0.41; r²= -0.39). Abiotic factor of temperature presented a negative correlation to prevalence of Lernaea cyprinacea and trichodinids (r= -0.39 e r= -0.33, respectively) and the electric conductivity presented positive correlation to trichodinids (r= 0.40). It was concluded that parasitic fauna of tambaquis cultured in Lower São Francisco region is diversified and the parasitic load dependent on water parameters and fish growth.(AU)

Metabolic status of dairy cows grouped by anabolic and catabolic indicators of metabolic stress in early lactation

Background: Early lactation is period followed by changed metabolism in organism of the cow. This is the consequence of negativ energy balance, metabolic stress and milk production. Early lactation is characterised by high lipide catabolism (high NEFA) and low anabolic capacity (low insulin and IGF-I concentration). The aim of this study is to examine differences in metabolic adaptation of cows in early lactation (eight weeks after calving) in accordance to anabolic (insulin, IGF-I) and catabolic (NEFA) indicators in first week after calving.Materials, Methods & Results: The experiment included 50 Holstein-Friesian cows. Blood samples were collected in first, second, fourth and eight week after calving by venepunction of v.coccigea. Based on median value of indicator, cows were significantly (P < 0.001) classified in two groups: cows under metabolic stress (indicators of anabolism below the median Me-: indicators of catabolism above the medianMe+) and cows in control group (indicators of anabolism above the median Me+: indicators of catabolism under median Me-). Following criteria for comparison were given: based on classification of cows according to one indicator of metabolic load (insulinMe-:insulinMe+; IGF-IMe-:IGF-IMe+ and NEFAMe-:NEFA Me+); based on classification of cows according to combination of two indicators (insulinMe-+NEFAMe+: insulinMe++NEFAMe- and IGF-IMe-+NEFAMe+:IGF-IMe++NEFAMe-). Cows loaded with metabolic stress showed significan difference in metabolic adaptation in relation to control group (P < 0.05 or P < 0.01): higher values of STH, BHB (criteria were insulin, IGF-I, NEFA, insulin+NEFA, IGF-I+NEFA), higher values of bilirubin, AST, ALT, GGT, AP (criteria NEFA and IGF-I+NEFA) and MDA (criteria NEFA) and lower levels of glucose, total proteins, albumin (criteria IGF-I, NEFA, IGF-I+NEFA and body condition (criteria insulin, IGF-I, NEFA, insulin+ NEFA, IGF-I+ NEFA) were noted.[...]

Metabolic status of dairy cows grouped by anabolic and catabolic indicators of metabolic stress in early lactation

Background: Early lactation is period followed by changed metabolism in organism of the cow. This is the consequence of negativ energy balance, metabolic stress and milk production. Early lactation is characterised by high lipide catabolism (high NEFA) and low anabolic capacity (low insulin and IGF-I concentration). The aim of this study is to examine differences in metabolic adaptation of cows in early lactation (eight weeks after calving) in accordance to anabolic (insulin, IGF-I) and catabolic (NEFA) indicators in first week after calving.Materials, Methods & Results: The experiment included 50 Holstein-Friesian cows. Blood samples were collected in first, second, fourth and eight week after calving by venepunction of v.coccigea. Based on median value of indicator, cows were significantly (P < 0.001) classified in two groups: cows under metabolic stress (indicators of anabolism below the median Me-: indicators of catabolism above the medianMe+) and cows in control group (indicators of anabolism above the median Me+: indicators of catabolism under median Me-). Following criteria for comparison were given: based on classification of cows according to one indicator of metabolic load (insulinMe-:insulinMe+; IGF-IMe-:IGF-IMe+ and NEFAMe-:NEFA Me+); based on classification of cows according to combination of two indicators (insulinMe-+NEFAMe+: insulinMe++NEFAMe- and IGF-IMe-+NEFAMe+:IGF-IMe++NEFAMe-). Cows loaded with metabolic stress showed significan difference in metabolic adaptation in relation to control group (P < 0.05 or P < 0.01): higher values of STH, BHB (criteria were insulin, IGF-I, NEFA, insulin+NEFA, IGF-I+NEFA), higher values of bilirubin, AST, ALT, GGT, AP (criteria NEFA and IGF-I+NEFA) and MDA (criteria NEFA) and lower levels of glucose, total proteins, albumin (criteria IGF-I, NEFA, IGF-I+NEFA and body condition (criteria insulin, IGF-I, NEFA, insulin+ NEFA, IGF-I+ NEFA) were noted.[...](AU)

Screening and analysis on the differentially expression genes between diploid and autotetraploid watermelon by using of digital gene expression profile

Abstract Synthetic polyploids are key breeding materials for watermelon. Compared with diploid watermelon, the tetraploid watermelon often exhibit wide phenotypic differences and differential gene expression. Digital gene expression (DGE) profile technique was performed in this study to present gene expression patterns in an autotetraploid and its progenitor diploid watermelon, and deferentially expressed genes (DEGs) related to the abiotic and biotic stress were also addressed. Altogether, 4,985 DEGs were obtained in the autotetraploid against its progenitor diploid, and 66.02% DEGs is up-regulated. GO analysis shows that these DEGs mainly distributed in metabolic process, cell and catalytic activity. KEGG analysis revealed that these DEGs mainly cover metabolic pathways, secondary metabolites and ribosome. Moreover, 134 tolerance related DEGs were identified which cover osmotic adjustment substance, protective enzymes/protein, signaling proteins and pathogenesis-related proteins. This study present the differential expression of stress related genes and global gene expression patterns at background level in autotetraploid watermelons. These new evidences could supplement the molecular theoretical basis for the better resistance after the genome doubling in the gourd family.

Resumo Poliploides sintéticos são materias fundamentais para melhoramento genético da melancia. Comparativamente ao seu homólogo diploide, a melancia tetraploide apresenta amplas diferenças genotípica e fenotípica e diferença de expressão gênica. A expressão gênica digital ou DGE (digital gene expression) foi utilizada neste estudo para representar o perfil de expressão gênica da melancia autotetraploide e seu progenitor diploide e a expressão diferencial de genes relacionados ao estresse biótico e abiótico. Os resultados mostraram que 4.985 DEGs foram observados no organismo autotetraploide, sendo que, deste total, 66.02%foram supra-regulados. A análise de ontologia gênica (GO) mostrou que estes DEGs estão relacionados principalmente com processos metabólicas, célula e atividade catalítica, abrangendo de acordo com a análise de genes e genoma (KEGG) rotas metabólicas, metabolismo secundário e ribossomos. Além disso, 134 genes de defesa foram identificados, abrangendo substâncias de ajuste osmótico, enzimas/proteínas de proteção, proteínas sinalizadoras e proteínas relacionadas à patogênese. Este estudo mostrou a expressão diferencial de genes relacionados ao estresse e o perfil global de expressão gênica de melancia autotetraploide, estes resultados podem complementar, a nível molecular, o entendimento do fator resistência após a duplicação do genoma em cucurbitáceas.

Abiotic factors drives floristic variations of ferns metacommunity in an Atlantic Forest remnant / Fatores abióticos regulam as variações florísticas na metacomunidade de samambaias em um remanescente de Floresta Atlântica

We analyzed floristic variations in ferns metacommunity at the local scale and their relationship with abiotic factors in an Atlantic Forest remnant of northeastern Brazil. Floristic and environmental variations were accessed on ten plots of 10 × 20 m. We performed cluster analyses, based on Bray-Curtis dissimilarity index to establish the floristic relationship. The influence of abiotic factors: luminosity, temperature, relative air humidity and relative soil moisture was evaluated from a redundancy analysis. We found 24 species belonging to 20 genera and 12 families. The ferns flora showed high floristic heterogeneity (>75% for most of the plots associations). The ferns metacommunity was structured along an abiotic gradient modulated by temperature, luminosity, and relative soil moisture.(AU)

Analisamos as variações florísticas na metacomunidade de samambaias em escala local e sua relação com fatores abióticos em um remanescente de Floresta Atlântica no Nordeste do Brasil. Variações florísticas e ambientais foram acessadas a partir de dez parcelas de 10 × 20 m. Realizamos análises de cluster, baseado no índice de similaridade de Bray-Curtis para estabelecer relações florísticas. A influência de fatores abióticos: luminosidade, temperatura, umidade relativa do ar e umidade relativa do solo foram avaliadas a partir da análise de redundância. Encontramos 24 espécies pertencentes a 20 gêneros e 12 famílias. A flora de samambaias exibiu uma elevada heterogeneidade florística (>75% para a maioria das associações entre plots). Observou-se que a metacomunidade de samambaias estava estruturada ao longo de um gradiente abiótico modulado pela temperatura, luminosidade e umidade relativa do solo.(AU)

The use of biomarkers for assessing effects of pollutant stress on fish species from a tropical river in Southeastern Brazil / O uso de biomarcadores para avaliar efeitos de estresses de poluentes sobre espécies depeixes em um rio tropical no sudeste do Brasil

Biomarkers are measurements within an organism that respond to environmental effects and are used as tools in bioassessment programs since they reflect physiological changes induced by exposure to pollutants. The hepatosomatic index (HSI) and the condition factor (CF) in three fish species Geophagus brasiliensis, Hypostomus affinis and Hypostomus auroguttatus were used to assess effects of pollutant stress in a tropical river during two seasons (dry and wet). Fish from the least disturbed sites had the lowest condition factor (CF) and the lowest HSI, whereas those from sites near pollutant discharges had the highest CF and HSI. Higher HSI and lower CF occurred during the dry season. It is suggested that species adapted to stressful conditions take advantage on food availability from organic loads or unoccupied niches by lesser tolerant species, increasing CF. We concluded that higher HSI values were directly associated with environmental stress whereas the higher CF values are related to availability of food resources derived from organic loads or other sources. CF and HSI are simple and cost-effective, thus suitable as routine screening tools in pollution monitoring, but caution should be taken in relating changes in physiological measurements and any specific pollutant to prevent misinterpretation.(AU)

Biomarcadores são medidas dentro de um organismo que respondem a efeitos ambientais e sãoutilizadas em programas de bioavaliação, já que refletem alterações fisiológicas induzidas pela exposição apoluentes. O índice hepatossomático (IHS) e o fator de condição (FC) das espécies Geophagus brasiliensis,Hypostomus affinis e Hypostomus auroguttatus foram calculados em um rio tropical durante duas estações (secae cheia). Peixes de locais menos alterados apresentaram menores FC e IHS, enquanto os de locais próximosde descargas de poluentes apresentaram maiores FC e IHS. Maiores IHS e menores FC ocorreram durantea estação seca, comparados com a estação chuvosa. É sugerido que espécies adaptadas às condiçõesestressantes levam vantagem da disponibilidade de alimentos próxima às descargas orgânicas ou nichos nãoocupados por espécies menos tolerantes, aumentado o FC. Os valores mais elevados do IHS foramdiretamente associados ao estresse ambiental, enquanto os valores mais elevados FC estão relacionados coma disponibilidade de recursos alimentares derivados de descargas orgânicas ou outras fontes. FC e IHS sãosimples e de baixo custo, portanto, adequados como ferramentas no controle da poluição, mas cuidadosdevem ser tomados ao relacionar suas mudanças às medições fisiológicas ou a qualquer poluente específicopara evitar efeitos de interferência.(AU)

Candidate genes for performance in horses, including monocarboxylate transporters / Genes candidatos para desempenho em equinos, incluindo transportadores de monocarboxilatos

Some horse breeds are highly selected for athletic activities. The athletic potential of each animal can be measured by its performance in sports. High athletic performance depends on the animal capacity to produce energy through aerobic and anaerobic metabolic pathways, among other factors. Transmembrane proteins called monocarboxylate transporters, mainly the isoform 1 (MCT1) and its ancillary protein CD147, can help the organism to adapt to physiological stress caused by physical exercise, transporting lactate and H+ ions. Horse breeds are selected for different purposes so we might expect differences in the amount of those proteins and in the genotypic frequencies for genes that play a significant role in the performance of the animals. The study of MCT1 and CD147 gene polymorphisms, which can affect the formation of the proteins and transport of lactate and H+, can provide enough information to be used for selection of athletic horses increasingly resistant to intense exercise. Two other candidate genes, the PDK4 and DMRT3, have been associated with athletic potential and indicated as possible markers for performance in horses. The oxidation of fatty acids is highly effective in generating ATP and is controlled by the expression of PDK4 (pyruvate dehydrogenase kinase, isozyme 4) in skeletal muscle during and after exercise. The doublesex and mab-3 related transcription factor 3 (DMRT3) gene encodes an important transcription factor in the setting of spinal cord circuits controlling movement in vertebrates and may be associated with gait performance in horses. This review describes how the monocarboxylate transporters work during physical exercise in athletic horses and the influence of polymorphisms in candidate genes for athletic performance in horses.(AU)

Algumas raças de equinos são altamente selecionadas para atividades desportivas. O potencial atlético de cada animal pode ser medido pelo seu desempenho nas competições equestres. Um alto potencial atlético depende, entre outros fatores, da capacidade do animal de produzir energia através dos metabolismos aeróbio e anaeróbio. As proteínas transmembrana chamadas transportadores de monoxarboxilato, principalmente a isoforma 1 (MCT1) e sua proteína auxiliar CD147, podem ajudam o organismo a se adaptar ao estresse fisiológico causado pelo exercício físico, transportando íons lactato e H+. Algumas raças de equinos são selecionadas para diferentes objetivos, portanto é provável que existam diferenças nas quantidades de transportadores monocarboxilatos e na frequência genotípica dos seus respectivos genes. O estudo de polimorfismos nos genes das proteínas MCT1 e CD147, afetando a sua formação e o transporte dos íons lactato e H+, podem fornecer informações suficientes para a seleção de equinos com capacidade de serem altamente treinados e resistentes a intensos exercícios. Dois outros genes candidatos que têm sido relacionados com potencial atlético e utilizados como possíveis marcadores para desempenho em equinos são o PDK4 e o DMRT3. A oxidação de ácidos graxos é altamente efetiva para produção de ATP e é controlada pela expressão do gene PDK4 (pyruvate dehydrogenase kinase, isozyme 4) no musculo esquelético durante e após do exercício físico. O gene DMRT3 (doublesex and mab-3 related transcription factor 3) codifica um importante fator de transcrição no controle dos movimentos em vertebrados e pode ser associado com a marcha em algumas raças de equinos. Esta revisão descreve como agem os transportadores de monocarboxilatos durante o exercício físico em equinos atletas e qual a influência de alguns polimorfismos em genes candidatos para o desempenho atlético em equinos.(AU)

Candidate genes for performance in horses, including monocarboxylate transporters / Genes candidatos para desempenho em equinos, incluindo transportadores de monocarboxilatos

Some horse breeds are highly selected for athletic activities. The athletic potential of each animal can be measured by its performance in sports. High athletic performance depends on the animal capacity to produce energy through aerobic and anaerobic metabolic pathways, among other factors. Transmembrane proteins called monocarboxylate transporters, mainly the isoform 1 (MCT1) and its ancillary protein CD147, can help the organism to adapt to physiological stress caused by physical exercise, transporting lactate and H+ ions. Horse breeds are selected for different purposes so we might expect differences in the amount of those proteins and in the genotypic frequencies for genes that play a significant role in the performance of the animals. The study of MCT1 and CD147 gene polymorphisms, which can affect the formation of the proteins and transport of lactate and H+, can provide enough information to be used for selection of athletic horses increasingly resistant to intense exercise. Two other candidate genes, the PDK4 and DMRT3, have been associated with athletic potential and indicated as possible markers for performance in horses. The oxidation of fatty acids is highly effective in generating ATP and is controlled by the expression of PDK4 (pyruvate dehydrogenase kinase, isozyme 4) in skeletal muscle during and after exercise. The doublesex and mab-3 related transcription factor 3 (DMRT3) gene encodes an important transcription factor in the setting of spinal cord circuits controlling movement in vertebrates and may be associated with gait performance in horses. This review describes how the monocarboxylate transporters work during physical exercise in athletic horses and the influence of polymorphisms in candidate genes for athletic performance in horses.(AU)

Algumas raças de equinos são altamente selecionadas para atividades desportivas. O potencial atlético de cada animal pode ser medido pelo seu desempenho nas competições equestres. Um alto potencial atlético depende, entre outros fatores, da capacidade do animal de produzir energia através dos metabolismos aeróbio e anaeróbio. As proteínas transmembrana chamadas transportadores de monoxarboxilato, principalmente a isoforma 1 (MCT1) e sua proteína auxiliar CD147, podem ajudam o organismo a se adaptar ao estresse fisiológico causado pelo exercício físico, transportando íons lactato e H+. Algumas raças de equinos são selecionadas para diferentes objetivos, portanto é provável que existam diferenças nas quantidades de transportadores monocarboxilatos e na frequência genotípica dos seus respectivos genes. O estudo de polimorfismos nos genes das proteínas MCT1 e CD147, afetando a sua formação e o transporte dos íons lactato e H+, podem fornecer informações suficientes para a seleção de equinos com capacidade de serem altamente treinados e resistentes a intensos exercícios. Dois outros genes candidatos que têm sido relacionados com potencial atlético e utilizados como possíveis marcadores para desempenho em equinos são o PDK4 e o DMRT3. A oxidação de ácidos graxos é altamente efetiva para produção de ATP e é controlada pela expressão do gene PDK4 (pyruvate dehydrogenase kinase, isozyme 4) no musculo esquelético durante e após do exercício físico. O gene DMRT3 (doublesex and mab-3 related transcription factor 3) codifica um importante fator de transcrição no controle dos movimentos em vertebrados e pode ser associado com a marcha em algumas raças de equinos. Esta revisão descreve como agem os transportadores de monocarboxilatos durante o exercício físico em equinos atletas e qual a influência de alguns polimorfismos em genes candidatos para o desempenho atlético em equinos.(AU)

Screening and analysis on the differentially expression genes between diploid and autotetraploid watermelon by using of digital gene expression profile

Abstract Synthetic polyploids are key breeding materials for watermelon. Compared with diploid watermelon, the tetraploid watermelon often exhibit wide phenotypic differences and differential gene expression. Digital gene expression (DGE) profile technique was performed in this study to present gene expression patterns in an autotetraploid and its progenitor diploid watermelon, and deferentially expressed genes (DEGs) related to the abiotic and biotic stress were also addressed. Altogether, 4,985 DEGs were obtained in the autotetraploid against its progenitor diploid, and 66.02% DEGs is up-regulated. GO analysis shows that these DEGs mainly distributed in metabolic process, cell and catalytic activity. KEGG analysis revealed that these DEGs mainly cover metabolic pathways, secondary metabolites and ribosome. Moreover, 134 tolerance related DEGs were identified which cover osmotic adjustment substance, protective enzymes/protein, signaling proteins and pathogenesis-related proteins. This study present the differential expression of stress related genes and global gene expression patterns at background level in autotetraploid watermelons. These new evidences could supplement the molecular theoretical basis for the better resistance after the genome doubling in the gourd family.

Resumo Poliploides sintéticos são materias fundamentais para melhoramento genético da melancia. Comparativamente ao seu homólogo diploide, a melancia tetraploide apresenta amplas diferenças genotípica e fenotípica e diferença de expressão gênica. A expressão gênica digital ou DGE (digital gene expression) foi utilizada neste estudo para representar o perfil de expressão gênica da melancia autotetraploide e seu progenitor diploide e a expressão diferencial de genes relacionados ao estresse biótico e abiótico. Os resultados mostraram que 4.985 DEGs foram observados no organismo autotetraploide, sendo que, deste total, 66.02%foram supra-regulados. A análise de ontologia gênica (GO) mostrou que estes DEGs estão relacionados principalmente com processos metabólicas, célula e atividade catalítica, abrangendo de acordo com a análise de genes e genoma (KEGG) rotas metabólicas, metabolismo secundário e ribossomos. Além disso, 134 genes de defesa foram identificados, abrangendo substâncias de ajuste osmótico, enzimas/proteínas de proteção, proteínas sinalizadoras e proteínas relacionadas à patogênese. Este estudo mostrou a expressão diferencial de genes relacionados ao estresse e o perfil global de expressão gênica de melancia autotetraploide, estes resultados podem complementar, a nível molecular, o entendimento do fator resistência após a duplicação do genoma em cucurbitáceas.

Influence of temperature and photoperiod on the germination of Senegalia bahiensis seeds / Influência da temperatura e fotoperíodo na germinação de sementes de Senegalia bahiensis

Senegalia bahiensis (Fabaceae family, Mimosoideae subfamily) is typical of an anthropic environment, and thus tolerates high levels of disturbance, which supports its use in restoration planting. However, widespread use and marketing of S. bahiensis seeds requires seed quality control, for which there is a dearth of protocols. The aim of the present study was to evaluate the influence of temperature and photoperiod on the germination of Senegalia bahiensis seeds from different matrix trees. Seeds were collected from fruits of 15 matrix trees in the municipality of Castro Alves, Bahia, Brazil. Two assays were performed, one for each parameter tested. The experimental design of both assays was completely randomized in a factorial design, and included three replicates of 25 seeds. The design of the first assay was 15 (matrix trees) × 3 (conditions – 25°C, 30°C and alternating temperatures between 25 and 30°C) and the design of the second assay was 14 (matrix trees) × 3 (conditions – 8 or 12 hours of light, or continuous light). The percentage of germination of normal seedlings, germination speed index, mean root length based on total seed number, shoot length, root length and total length were determined. The Tukey’s test was used to compare mean values. The S. bahiensis matrix trees used in this study have different requirements in terms of temperature and photoperiod for seed germination. According to our findings, combining a temperature of 30°C and an 8 h period of light conveys the most suitable conditions to conduct germination tests for most matrix trees.

O espinheiro-branco (Senegalia bahiensis) é árvore típica de ambientes antrópicos, tolerando altos níveis de perturbação, o que a torna adequada para plantio de restauração. Contudo, seu amplo uso e comercialização dependem de haver controle de qualidade, mas não há protocolos para isto. O objetivo do presente estudo foi avaliar a influência da temperatura e fotoperíodo na germinação de diferentes matrizes de Senegalia bahiensis. As sementes foram colhidas de frutos de 15 árvores matrizes, no município de Castro Bahia. Foram instalados dois experimentos, um para cada fator abiótico testado. O delineamento experimental para ambos os ensaios foi inteiramente casualizado, em esquema fatorial, com três repetições de 25 sementes, sendo o primeiro experimento de 15 (matrizes) ×3 (25°C, 30°C e alternada 25°-30°C) e o segundo de 14 (matrizes) × 3 (8 h, 12 horas de luz e contínua). Foi determinado o percentual de germinação de plântulas normais, índice de velocidade de germinação, comprimento médio de raiz com base no número total de sementes, comprimento da parte aérea, raiz e total. Foi utilizado o teste de Tukey para comparação de médias. As matrizes de S. bahiensis, utilizadas neste estudo, diferem quanto as exigências dos fatores testados na germinação. Assim, a 30°C sob 8 h de luz é a condição mais indicada para condução de testes de germinação para a maioria das matrizes.

Influence of temperature and photoperiod on the germination of Senegalia bahiensis seeds / Influência da temperatura e fotoperíodo na germinação de sementes de Senegalia bahiensis

Senegalia bahiensis (Fabaceae family, Mimosoideae subfamily) is typical of an anthropic environment, and thus tolerates high levels of disturbance, which supports its use in restoration planting. However, widespread use and marketing of S. bahiensis seeds requires seed quality control, for which there is a dearth of protocols. The aim of the present study was to evaluate the influence of temperature and photoperiod on the germination of Senegalia bahiensis seeds from different matrix trees. Seeds were collected from fruits of 15 matrix trees in the municipality of Castro Alves, Bahia, Brazil. Two assays were performed, one for each parameter tested. The experimental design of both assays was completely randomized in a factorial design, and included three replicates of 25 seeds. The design of the first assay was 15 (matrix trees) × 3 (conditions 25°C, 30°C and alternating temperatures between 25 and 30°C) and the design of the second assay was 14 (matrix trees) × 3 (conditions 8 or 12 hours of light, or continuous light). The percentage of germination of normal seedlings, germination speed index, mean root length based on total seed number, shoot length, root length and total length were determined. The Tukeys test was used to compare mean values. The S. bahiensis matrix trees used in this study have different requirements in terms of temperature and photoperiod for seed germination. According to our findings, combining a temperature of 30°C and an 8 h period of light conveys the most suitable conditions to conduct germination tests for most matrix trees.(AU)

O espinheiro-branco (Senegalia bahiensis) é árvore típica de ambientes antrópicos, tolerando altos níveis de perturbação, o que a torna adequada para plantio de restauração. Contudo, seu amplo uso e comercialização dependem de haver controle de qualidade, mas não há protocolos para isto. O objetivo do presente estudo foi avaliar a influência da temperatura e fotoperíodo na germinação de diferentes matrizes de Senegalia bahiensis. As sementes foram colhidas de frutos de 15 árvores matrizes, no município de Castro Bahia. Foram instalados dois experimentos, um para cada fator abiótico testado. O delineamento experimental para ambos os ensaios foi inteiramente casualizado, em esquema fatorial, com três repetições de 25 sementes, sendo o primeiro experimento de 15 (matrizes) ×3 (25°C, 30°C e alternada 25°-30°C) e o segundo de 14 (matrizes) × 3 (8 h, 12 horas de luz e contínua). Foi determinado o percentual de germinação de plântulas normais, índice de velocidade de germinação, comprimento médio de raiz com base no número total de sementes, comprimento da parte aérea, raiz e total. Foi utilizado o teste de Tukey para comparação de médias. As matrizes de S. bahiensis, utilizadas neste estudo, diferem quanto as exigências dos fatores testados na germinação. Assim, a 30°C sob 8 h de luz é a condição mais indicada para condução de testes de germinação para a maioria das matrizes.(AU)

Composição e distribuição de conchas de moluscos límnicos no Parque SESC Baía das Pedras, Pantanal de Poconé, Mato Grosso / Composition and distribution of shells of limnic mollusks in SESC Baía das Pedras Park, Pantanal, Poconé, Mato Grosso

A riqueza, abundância e similaridade na composição de moluscos em diferentes corpos d’água no Parque Baía das Pedras, Pantanal de Poconé foi avaliada a partir de registros de conchas de indivíduos mortos durante o período de estiagem.Conchas de sete espécies de moluscos foram coletadas manualmente no perímetro de 19 corpos d’água (cinco poças remanescentes de Corixo, 12 Caixas de Empréstimo e duas Baías). A distância entre os corpos d’água e a área total de cada corpo d’água foram utilizadas como variáveis explicativas para a riqueza e distribuição de moluscos. As matrizes de dissimilaridade na composição e abundância de espécies (Bray Curtis) e de distância geográfica (Distância Euclidiana) entre os pontos demonstraram uma distribuição heterogênea para as espécies. A análise de ordenação da abundância e riqueza de moluscos em função das variáveis ambientais (área, profundidade e temperatura), não indicou presença de gradiente ambiental para as populações estudadas. Contudo, essas variáveis correlacionadas influenciam na riqueza (maior no Corixo) e abundância (r²=0,444 e p =0,028) de espécies nos corpos d’água, o que indica a prevalência de fatores locais na composição e um efeito do tamanho do sistema aquático na mortalidade de moluscos. Conchas são bons testemunhos para explicar a estruturação de comunidades de moluscos em sistemas aquáticos temporários, fornecendo dados sobre a composição e riqueza de espécies, porém, não são eficazes para explicar as relações desta comunidade com o meio abiótico como determinantes de um padrão de distribuição.

The richness, abundance and similarity of the mollusks’ composition in different freshwater bodies at Baía das Pedras Park, Pantanal Poconé were evaluated from the records of empty shells during the dry season. We collected seven species of mollusks at the perimeter of 19 water bodies (five in puddles of temporary streams, 12 loan boxes and two lakes). The distance between the water bodies and the total area of each one were used as explanatory variables for the richness and distribution of mollusks. The matrix of dissimilarity in the composition and abundance of species (Bray Curtis) and geographic distance (Euclidean distance) between points showed a heterogeneous distribution for the species. Ordination analysis of the abundance and richness of mollusks as a function of environmental variables (area, depth and temperature) no indicated the presence of environmental gradient of the populations studied. However, these variables correlated influence on richness (higher in Corixo) and abundance (r² = 0.444 and p = 0.028) of species in water bodies, which indicates the prevalence of local factors in the composition and an effect of the size of the aquatic system in the mortality of mollusks. Shells are good evidence to explain the structure of mollusk communities in temporary aquatic systems, providing data on the composition and species richness, but are not effective to explain the relationships between community and environmental variables as determining of distribution.