Glycogen synthase kinase-3 (GSK-3) a magic enzyme: it’s role in diabetes mellitus and glucose homeostasis, interactions with fluroquionlones. A mini-review / Glicogênio sintase quinase-3 (GSK-3), uma enzima mágica: seu papel no diabetes mellitus e na homeostase da glicose: interações com fluoroquinolonas. Uma mini-revisão

Diabetes mellitus (DM) is a non-communicable disease throughout the world in which there is persistently high blood glucose level from the normal range. The diabetes and insulin resistance are mainly responsible for the morbidities and mortalities of humans in the world. This disease is mainly regulated by various enzymes and hormones among which Glycogen synthase kinase-3 (GSK-3) is a principle enzyme and insulin is the key hormone regulating it. The GSK-3, that is the key enzyme is normally showing its actions by various mechanisms that include its phosphorylation, formation of protein complexes, and other cellular distribution and thus it control and directly affects cellular morphology, its growth, mobility and apoptosis of the cell. Disturbances in the action of GSK-3 enzyme may leads to various disease conditions that include insulin resistance leading to diabetes, neurological disease like Alzheimer’s disease and cancer. Fluoroquinolones are the most common class of drugs that shows dysglycemic effects via interacting with GSK-3 enzyme. Therefore, it is the need of the day to properly understand functions and mechanisms of GSK-3, especially its role in glucose homeostasis via effects on glycogen synthase.

O diabetes mellitus (DM) é uma doença não transmissível em todo o mundo, na qual existe nível glicêmico persistentemente alto em relação à normalidade. O diabetes e a resistência à insulina são os principais responsáveis pelas morbidades e mortalidades de humanos no mundo. Essa doença é regulada principalmente por várias enzimas e hormônios, entre os quais a glicogênio sintase quinase-3 (GSK-3) é uma enzima principal e a insulina é o principal hormônio que a regula. A GSK-3, que é a enzima-chave, normalmente mostra suas ações por vários mecanismos que incluem sua fosforilação, formação de complexos de proteínas e outras distribuições celulares e, portanto, controla e afeta diretamente a morfologia celular, seu crescimento, mobilidade e apoptose do célula. Perturbações na ação da enzima GSK-3 podem levar a várias condições de doença que incluem resistência à insulina que leva ao diabetes, doenças neurológicas como a doença de Alzheimer e câncer. As fluoroquinolonas são a classe mais comum de drogas que apresentam efeitos disglicêmicos por meio da interação com a enzima GSK-3. Portanto, é necessário hoje em dia compreender adequadamente as funções e mecanismos da GSK-3, principalmente seu papel na homeostase da glicose via efeitos na glicogênio sintase.

Glycogen synthase kinase-3 (GSK-3) a magic enzyme: its role in diabetes mellitus and glucose homeostasis, interactions with fluroquionlones. A mini-review / Glicogênio sintase quinase-3 (GSK-3), uma enzima mágica: seu papel no diabetes mellitus e na homeostase da glicose: interações com fluoroquinolonas. Uma mini-revisão

Diabetes mellitus (DM) is a non-communicable disease throughout the world in which there is persistently high blood glucose level from the normal range. The diabetes and insulin resistance are mainly responsible for the morbidities and mortalities of humans in the world. This disease is mainly regulated by various enzymes and hormones among which Glycogen synthase kinase-3 (GSK-3) is a principle enzyme and insulin is the key hormone regulating it. The GSK-3, that is the key enzyme is normally showing its actions by various mechanisms that include its phosphorylation, formation of protein complexes, and other cellular distribution and thus it control and directly affects cellular morphology, its growth, mobility and apoptosis of the cell. Disturbances in the action of GSK-3 enzyme may leads to various disease conditions that include insulin resistance leading to diabetes, neurological disease like Alzheimers disease and cancer. Fluoroquinolones are the most common class of drugs that shows dysglycemic effects via interacting with GSK-3 enzyme. Therefore, it is the need of the day to properly understand functions and mechanisms of GSK-3, especially its role in glucose homeostasis via effects on glycogen synthase.(AU)

O diabetes mellitus (DM) é uma doença não transmissível em todo o mundo, na qual existe nível glicêmico persistentemente alto em relação à normalidade. O diabetes e a resistência à insulina são os principais responsáveis pelas morbidades e mortalidades de humanos no mundo. Essa doença é regulada principalmente por várias enzimas e hormônios, entre os quais a glicogênio sintase quinase-3 (GSK-3) é uma enzima principal e a insulina é o principal hormônio que a regula. A GSK-3, que é a enzima-chave, normalmente mostra suas ações por vários mecanismos que incluem sua fosforilação, formação de complexos de proteínas e outras distribuições celulares e, portanto, controla e afeta diretamente a morfologia celular, seu crescimento, mobilidade e apoptose do célula. Perturbações na ação da enzima GSK-3 podem levar a várias condições de doença que incluem resistência à insulina que leva ao diabetes, doenças neurológicas como a doença de Alzheimer e câncer. As fluoroquinolonas são a classe mais comum de drogas que apresentam efeitos disglicêmicos por meio da interação com a enzima GSK-3. Portanto, é necessário hoje em dia compreender adequadamente as funções e mecanismos da GSK-3, principalmente seu papel na homeostase da glicose via efeitos na glicogênio sintase.(AU)

Glycogen synthase kinase-3 (GSK-3) a magic enzyme: its role in diabetes mellitus and glucose homeostasis, interactions with fluroquionlones. A mini-review

Abstract Diabetes mellitus (DM) is a non-communicable disease throughout the world in which there is persistently high blood glucose level from the normal range. The diabetes and insulin resistance are mainly responsible for the morbidities and mortalities of humans in the world. This disease is mainly regulated by various enzymes and hormones among which Glycogen synthase kinase-3 (GSK-3) is a principle enzyme and insulin is the key hormone regulating it. The GSK-3, that is the key enzyme is normally showing its actions by various mechanisms that include its phosphorylation, formation of protein complexes, and other cellular distribution and thus it control and directly affects cellular morphology, its growth, mobility and apoptosis of the cell. Disturbances in the action of GSK-3 enzyme may leads to various disease conditions that include insulin resistance leading to diabetes, neurological disease like Alzheimers disease and cancer. Fluoroquinolones are the most common class of drugs that shows dysglycemic effects via interacting with GSK-3 enzyme. Therefore, it is the need of the day to properly understand functions and mechanisms of GSK-3, especially its role in glucose homeostasis via effects on glycogen synthase.

Resumo O diabetes mellitus (DM) é uma doença não transmissível em todo o mundo, na qual existe nível glicêmico persistentemente alto em relação à normalidade. O diabetes e a resistência à insulina são os principais responsáveis pelas morbidades e mortalidades de humanos no mundo. Essa doença é regulada principalmente por várias enzimas e hormônios, entre os quais a glicogênio sintase quinase-3 (GSK-3) é uma enzima principal e a insulina é o principal hormônio que a regula. A GSK-3, que é a enzima-chave, normalmente mostra suas ações por vários mecanismos que incluem sua fosforilação, formação de complexos de proteínas e outras distribuições celulares e, portanto, controla e afeta diretamente a morfologia celular, seu crescimento, mobilidade e apoptose do célula. Perturbações na ação da enzima GSK-3 podem levar a várias condições de doença que incluem resistência à insulina que leva ao diabetes, doenças neurológicas como a doença de Alzheimer e câncer. As fluoroquinolonas são a classe mais comum de drogas que apresentam efeitos disglicêmicos por meio da interação com a enzima GSK-3. Portanto, é necessário hoje em dia compreender adequadamente as funções e mecanismos da GSK-3, principalmente seu papel na homeostase da glicose via efeitos na glicogênio sintase.

Glycogen synthase kinase-3 (GSK-3) a magic enzyme: it's role in diabetes mellitus and glucose homeostasis, interactions with fluroquionlones. A mini-review / Glicogênio sintase quinase-3 (GSK-3), uma enzima mágica: seu papel no diabetes mellitus e na homeostase da glicose: interações com fluoroquinolonas. Uma mini-revisão

Abstract Diabetes mellitus (DM) is a non-communicable disease throughout the world in which there is persistently high blood glucose level from the normal range. The diabetes and insulin resistance are mainly responsible for the morbidities and mortalities of humans in the world. This disease is mainly regulated by various enzymes and hormones among which Glycogen synthase kinase-3 (GSK-3) is a principle enzyme and insulin is the key hormone regulating it. The GSK-3, that is the key enzyme is normally showing its actions by various mechanisms that include its phosphorylation, formation of protein complexes, and other cellular distribution and thus it control and directly affects cellular morphology, its growth, mobility and apoptosis of the cell. Disturbances in the action of GSK-3 enzyme may leads to various disease conditions that include insulin resistance leading to diabetes, neurological disease like Alzheimer's disease and cancer. Fluoroquinolones are the most common class of drugs that shows dysglycemic effects via interacting with GSK-3 enzyme. Therefore, it is the need of the day to properly understand functions and mechanisms of GSK-3, especially its role in glucose homeostasis via effects on glycogen synthase.

Resumo O diabetes mellitus (DM) é uma doença não transmissível em todo o mundo, na qual existe nível glicêmico persistentemente alto em relação à normalidade. O diabetes e a resistência à insulina são os principais responsáveis ​​pelas morbidades e mortalidades de humanos no mundo. Essa doença é regulada principalmente por várias enzimas e hormônios, entre os quais a glicogênio sintase quinase-3 (GSK-3) é uma enzima principal e a insulina é o principal hormônio que a regula. A GSK-3, que é a enzima-chave, normalmente mostra suas ações por vários mecanismos que incluem sua fosforilação, formação de complexos de proteínas e outras distribuições celulares e, portanto, controla e afeta diretamente a morfologia celular, seu crescimento, mobilidade e apoptose do célula. Perturbações na ação da enzima GSK-3 podem levar a várias condições de doença que incluem resistência à insulina que leva ao diabetes, doenças neurológicas como a doença de Alzheimer e câncer. As fluoroquinolonas são a classe mais comum de drogas que apresentam efeitos disglicêmicos por meio da interação com a enzima GSK-3. Portanto, é necessário hoje em dia compreender adequadamente as funções e mecanismos da GSK-3, principalmente seu papel na homeostase da glicose via efeitos na glicogênio sintase.

Temporal association between antibiotic use and resistance in Gram-negative bacteria

Abstract The -lactam/lactamase inhibitors (BLBLIs) combination drugs are considered an effective alternative to carbapenems. However, there is a growing concern that the increased use of BLBLIs may lead to increased resistance. This study determined the temporal association between the consumption of BLBLI and the antimicrobial resistance in Gram-negative bacteria. In this retrospective study, electronic data on the Gram-negative bacterial isolates, including A. baumannii, P. aeruginosa, E. coli, and K. pneumoniae from in-patients and susceptibility testing results were retrieved from the medical records of the clinical laboratory. A linear regression and cross-correlation analysis were performed on the acquired data. Increasing trends (p 0.05) in the consumption of BIBLI and carbapenem with a median use of 27.68 and 34.46 DDD/1000 PD per quarter were observed, respectively. A decreased trend (p=0.023) in the consumption of fluoroquinolones with a median use of 29.13 DDD/1000 PD per quarter was observed. The resistance rate of K. pneumoniae was synchronized with the BIBLI and carbapenem consumptions with a correlation coefficient of 0.893 (p=0.012) and 0.951 (p=0.016), respectively. The cross-correlation analysis against the consumption of BIBLI and meropenem resistant K. pneumoniae was peaked at 0-quarter lag (r=951, p=0.016). There was an increasing trend in the consumption of BLBLI and carbapenems. The increasing trend in the rates of resistance to piperacillin/tazobactam, in line with the increasing consumption of BLBLI, suggests that BLBLI has to be used with caution and cannot be directly considered as a long-term alternative to carbapenems.

Resumo Os medicamentos combinados de -lactâmicos / inibidores da lactamase (BLBLIs) são considerados uma alternativa eficaz aos carbapenêmicos. No entanto, existe uma preocupação crescente de que o aumento do uso de BLBLIs pode levar ao aumento da resistência. Este estudo determinou a associação temporal entre o consumo de BLBLI e a resistência antimicrobiana em bactérias gram-negativas. Neste estudo retrospectivo, os dados eletrônicos sobre as bactérias gram-negativas isoladas, incluindo A. baumannii, P. aeruginosa, E. coli e K. pneumoniae de pacientes internados e os resultados dos testes de suscetibilidade foram recuperados dos registros médicos do laboratório clínico. Uma regressão linear e análise de correlação cruzada foram realizadas nos dados adquiridos. Foram observadas tendências crescentes (p 0,05) no consumo de BIBLI e carbapenem com uma mediana de uso de 27,68 e 34,46 DDD/1000 PD por trimestre, respectivamente. Foi observada uma tendência de diminuição (p = 0,023) no consumo de fluoroquinolonas com uma mediana de uso de 29,13 DDD/1000 PD por trimestre. A taxa de resistência de K. pneumoniae foi sincronizada com os consumos de BIBLI e carbapenem com coeficiente de correlação de 0,893 (p = 0,012) e 0,951 (p = 0,016), respectivamente. A análise de correlação cruzada contra o consumo de BIBLI e K. pneumoniae resistente ao meropenem atingiu o pico no intervalo de 0 quarto (r = 951, p = 0,016). Houve uma tendência de aumento no consumo de BLBLI e carbapenêmicos. A tendência crescente nas taxas de resistência a piperacilina/tazobactam, em linha com o consumo crescente de BLBLI, sugere que BLBLI deve ser usado com cautela e não pode ser considerado diretamente como alternativa de longo prazo aos carbapenêmicos.

Temporal association between antibiotic use and resistance in Gram-negative bacteria / Associação temporal entre o uso de antibióticos e resistência em bactérias gram-negativas

The β-lactam/lactamase inhibitors (BLBLIs) combination drugs are considered an effective alternative to carbapenems. However, there is a growing concern that the increased use of BLBLIs may lead to increased resistance. This study determined the temporal association between the consumption of BLBLI and the antimicrobial resistance in Gram-negative bacteria. In this retrospective study, electronic data on the Gram-negative bacterial isolates, including A. baumannii, P. aeruginosa, E. coli, and K. pneumoniae from in-patients and susceptibility testing results were retrieved from the medical records of the clinical laboratory. A linear regression and cross-correlation analysis were performed on the acquired data. Increasing trends (p<0.05) in the consumption of BIBLI and carbapenem with a median use of 27.68 and 34.46 DDD/1000 PD per quarter were observed, respectively. A decreased trend (p=0.023) in the consumption of fluoroquinolones with a median use of 29.13 DDD/1000 PD per quarter was observed. The resistance rate of K. pneumoniae was synchronized with the BIBLI and carbapenem consumptions with a correlation coefficient of 0.893 (p=0.012) and 0.951 (p=0.016), respectively. The cross-correlation analysis against the consumption of BIBLI and meropenem resistant K. pneumoniae was peaked at 0-quarter lag (r=951, p=0.016). There was an increasing trend in the consumption of BLBLI and carbapenems. The increasing trend in the rates of resistance to piperacillin/tazobactam, in line with the increasing consumption of BLBLI, suggests that BLBLI has to be used with caution and cannot be directly considered as a long-term alternative to carbapenems.

Os medicamentos combinados de β-lactâmicos / inibidores da lactamase (BLBLIs) são considerados uma alternativa eficaz aos carbapenêmicos. No entanto, existe uma preocupação crescente de que o aumento do uso de BLBLIs pode levar ao aumento da resistência. Este estudo determinou a associação temporal entre o consumo de BLBLI e a resistência antimicrobiana em bactérias gram-negativas. Neste estudo retrospectivo, os dados eletrônicos sobre as bactérias gram-negativas isoladas, incluindo A. baumannii, P. aeruginosa, E. coli e K. pneumoniae de pacientes internados e os resultados dos testes de suscetibilidade foram recuperados dos registros médicos do laboratório clínico. Uma regressão linear e análise de correlação cruzada foram realizadas nos dados adquiridos. Foram observadas tendências crescentes (p < 0,05) no consumo de BIBLI e carbapenem com uma mediana de uso de 27,68 e 34,46 DDD/1000 PD por trimestre, respectivamente. Foi observada uma tendência de diminuição (p = 0,023) no consumo de fluoroquinolonas com uma mediana de uso de 29,13 DDD/1000 PD por trimestre. A taxa de resistência de K. pneumoniae foi sincronizada com os consumos de BIBLI e carbapenem com coeficiente de correlação de 0,893 (p = 0,012) e 0,951 (p = 0,016), respectivamente. A análise de correlação cruzada contra o consumo de BIBLI e K. pneumoniae resistente ao meropenem atingiu o pico no intervalo de 0 quarto (r = 951, p = 0,016). Houve uma tendência de aumento no consumo de BLBLI e carbapenêmicos. A tendência crescente nas taxas de resistência a piperacilina/tazobactam, em linha com o consumo crescente de BLBLI, sugere que BLBLI deve ser usado com cautela e não pode ser considerado diretamente como alternativa de longo prazo aos carbapenêmicos.

Temporal association between antibiotic use and resistance in Gram-negative bacteria / Associação temporal entre o uso de antibióticos e resistência em bactérias gram-negativas

The β-lactam/lactamase inhibitors (BLBLIs) combination drugs are considered an effective alternative to carbapenems. However, there is a growing concern that the increased use of BLBLIs may lead to increased resistance. This study determined the temporal association between the consumption of BLBLI and the antimicrobial resistance in Gram-negative bacteria. In this retrospective study, electronic data on the Gram-negative bacterial isolates, including A. baumannii, P. aeruginosa, E. coli, and K. pneumoniae from in-patients and susceptibility testing results were retrieved from the medical records of the clinical laboratory. A linear regression and cross-correlation analysis were performed on the acquired data. Increasing trends (p<0.05) in the consumption of BIBLI and carbapenem with a median use of 27.68 and 34.46 DDD/1000 PD per quarter were observed, respectively. A decreased trend (p=0.023) in the consumption of fluoroquinolones with a median use of 29.13 DDD/1000 PD per quarter was observed. The resistance rate of K. pneumoniae was synchronized with the BIBLI and carbapenem consumptions with a correlation coefficient of 0.893 (p=0.012) and 0.951 (p=0.016), respectively. The cross-correlation analysis against the consumption of BIBLI and meropenem resistant K. pneumoniae was peaked at 0-quarter lag (r=951, p=0.016). There was an increasing trend in the consumption of BLBLI and carbapenems. The increasing trend in the rates of resistance to piperacillin/tazobactam, in line with the increasing consumption of BLBLI, suggests that BLBLI has to be used with caution and cannot be directly considered as a long-term alternative to carbapenems.(AU)

Os medicamentos combinados de β-lactâmicos / inibidores da lactamase (BLBLIs) são considerados uma alternativa eficaz aos carbapenêmicos. No entanto, existe uma preocupação crescente de que o aumento do uso de BLBLIs pode levar ao aumento da resistência. Este estudo determinou a associação temporal entre o consumo de BLBLI e a resistência antimicrobiana em bactérias gram-negativas. Neste estudo retrospectivo, os dados eletrônicos sobre as bactérias gram-negativas isoladas, incluindo A. baumannii, P. aeruginosa, E. coli e K. pneumoniae de pacientes internados e os resultados dos testes de suscetibilidade foram recuperados dos registros médicos do laboratório clínico. Uma regressão linear e análise de correlação cruzada foram realizadas nos dados adquiridos. Foram observadas tendências crescentes (p < 0,05) no consumo de BIBLI e carbapenem com uma mediana de uso de 27,68 e 34,46 DDD/1000 PD por trimestre, respectivamente. Foi observada uma tendência de diminuição (p = 0,023) no consumo de fluoroquinolonas com uma mediana de uso de 29,13 DDD/1000 PD por trimestre. A taxa de resistência de K. pneumoniae foi sincronizada com os consumos de BIBLI e carbapenem com coeficiente de correlação de 0,893 (p = 0,012) e 0,951 (p = 0,016), respectivamente. A análise de correlação cruzada contra o consumo de BIBLI e K. pneumoniae resistente ao meropenem atingiu o pico no intervalo de 0 quarto (r = 951, p = 0,016). Houve uma tendência de aumento no consumo de BLBLI e carbapenêmicos. A tendência crescente nas taxas de resistência a piperacilina/tazobactam, em linha com o consumo crescente de BLBLI, sugere que BLBLI deve ser usado com cautela e não pode ser considerado diretamente como alternativa de longo prazo aos carbapenêmicos.(AU)

Temporal association between antibiotic use and resistance in Gram-negative bacteria / Associação temporal entre o uso de antibióticos e resistência em bactérias gram-negativas

Abstract The β-lactam/lactamase inhibitors (BLBLIs) combination drugs are considered an effective alternative to carbapenems. However, there is a growing concern that the increased use of BLBLIs may lead to increased resistance. This study determined the temporal association between the consumption of BLBLI and the antimicrobial resistance in Gram-negative bacteria. In this retrospective study, electronic data on the Gram-negative bacterial isolates, including A. baumannii, P. aeruginosa, E. coli, and K. pneumoniae from in-patients and susceptibility testing results were retrieved from the medical records of the clinical laboratory. A linear regression and cross-correlation analysis were performed on the acquired data. Increasing trends (p<0.05) in the consumption of BIBLI and carbapenem with a median use of 27.68 and 34.46 DDD/1000 PD per quarter were observed, respectively. A decreased trend (p=0.023) in the consumption of fluoroquinolones with a median use of 29.13 DDD/1000 PD per quarter was observed. The resistance rate of K. pneumoniae was synchronized with the BIBLI and carbapenem consumptions with a correlation coefficient of 0.893 (p=0.012) and 0.951 (p=0.016), respectively. The cross-correlation analysis against the consumption of BIBLI and meropenem resistant K. pneumoniae was peaked at 0-quarter lag (r=951, p=0.016). There was an increasing trend in the consumption of BLBLI and carbapenems. The increasing trend in the rates of resistance to piperacillin/tazobactam, in line with the increasing consumption of BLBLI, suggests that BLBLI has to be used with caution and cannot be directly considered as a long-term alternative to carbapenems.

Resumo Os medicamentos combinados de β-lactâmicos / inibidores da lactamase (BLBLIs) são considerados uma alternativa eficaz aos carbapenêmicos. No entanto, existe uma preocupação crescente de que o aumento do uso de BLBLIs pode levar ao aumento da resistência. Este estudo determinou a associação temporal entre o consumo de BLBLI e a resistência antimicrobiana em bactérias gram-negativas. Neste estudo retrospectivo, os dados eletrônicos sobre as bactérias gram-negativas isoladas, incluindo A. baumannii, P. aeruginosa, E. coli e K. pneumoniae de pacientes internados e os resultados dos testes de suscetibilidade foram recuperados dos registros médicos do laboratório clínico. Uma regressão linear e análise de correlação cruzada foram realizadas nos dados adquiridos. Foram observadas tendências crescentes (p < 0,05) no consumo de BIBLI e carbapenem com uma mediana de uso de 27,68 e 34,46 DDD/1000 PD por trimestre, respectivamente. Foi observada uma tendência de diminuição (p = 0,023) no consumo de fluoroquinolonas com uma mediana de uso de 29,13 DDD/1000 PD por trimestre. A taxa de resistência de K. pneumoniae foi sincronizada com os consumos de BIBLI e carbapenem com coeficiente de correlação de 0,893 (p = 0,012) e 0,951 (p = 0,016), respectivamente. A análise de correlação cruzada contra o consumo de BIBLI e K. pneumoniae resistente ao meropenem atingiu o pico no intervalo de 0 quarto (r = 951, p = 0,016). Houve uma tendência de aumento no consumo de BLBLI e carbapenêmicos. A tendência crescente nas taxas de resistência a piperacilina/tazobactam, em linha com o consumo crescente de BLBLI, sugere que BLBLI deve ser usado com cautela e não pode ser considerado diretamente como alternativa de longo prazo aos carbapenêmicos.

Phenotypic and molecular characterization of fluoroquinolone resistant Pseudomonas aeruginosa isolates in Palestine / Caracterização fenotípica e molecular de isolados de Pseudomonas aeruginosa resistentes a fluoroquinolonas na Palestina

Fluoroquinolones are important antimicrobial agents for the treatment of Pseudomonas infections. A total of 11 isolates of P. aeruginosa were collected from different clinical samples from different medical centers in the North West Bank-Palestine during 2017. In this study, resistance to fluoroquinolones and secretions of β-lactamases were detected by phenotypic methods, while presence of β-lactamase gene sequences and other virulence factors were detected by PCR technique. PCR product for gyrA, parC and parE genes were sequenced for further analyses. The phylogenetic analyses, population diversity indices and haplotypes determination were conducted using computer programs MEGA version 6, DnaSP 5.1001 and median-joining algorithm in the program Network 5, respectively. Results of this study showed that the MIC for ciprofloxacin and norfloxacin had a range of 32-256 µg/ml. In addition, all isolates carried either exoT or exoT and exoY genes, different β-lactamase genes and 82% of these isolates harbored class 1 integrons. Analyses of the gyrA, parC and parE sequences were found to be polymorphic, had high haplotype diversity (0.945-0.982), low nucleotide diversity (0.01225-0.02001) and number of haplotypes were 9 for each gyrA and parE genes and 10 haplotypes for parC gene. The founder haplotypes being Hap-1 (18%), Hap-2 (27.3%) and Hap-6 (9.1%) for gyrA, parC and parE genes, respectively. Two of ParE haplotypes were detected as indel haplotypes. The Median-joining- (MJ) networks constructed from haplotypes of these genes showed a star-like expansion. The neutrality tests (Tajima’s D test and Fu’s Fs test) for these genes showed negative values. Palestinian fluoroquinolone resistant P. aeruginosa strains showed high MIC level for fluoroquinolones, β-lactamase producers, carried type III secretion exotoxin-encoding genes, most of them [...].

Fluoroquinolonas são agentes antimicrobianos importantes para o tratamento de infecções por Pseudomonas. Um total de 11 bacilos isolados de P. aeruginosa foram coletados de diferentes amostras clínicas provenientes de diferentes centros médicos na Cisjordânia-Palestina durante o ano de 2017. Neste estudo, resistência a fluoroquinolonas e secreções de β-lactamases foram detectadas por métodos fenotípicos, enquanto a presença de sequências do gene β-lactamase e outros fatores de virulência foram detectados pela técnica de PCR (Proteína C-reativa). O produto de PCR para os genes gyrA, parC e parE foram sequenciados para análises posteriores. As análises filogenéticas, os índices de diversidade populacional e a determinação de haplótipos foram realizados utilizando os softwares MEGA versão 6, DnaSP 5.1001 e o algoritmo de junção de mediana do programa Network 5, respectivamente. Os resultados deste estudo mostraram que a MIC para ciprofloxacina e norfloxacina tinha um intervalo de 32-256 µg/ml. Além disso, todos os bacilos isolados carregavam genes exoT ou exoT e exoY, genes de β-lactamase diferentes e 82% desses isolados continham integrons de classe 1. As análises das sequências gyrA, parC e parE foram consideradas polimórficas, com alta diversidade de haplótipos (0,945-0,982), baixa diversidade de nucleotídeos (0,01225-0,02001) e o número de haplótipos foi de 9 para cada gene de gyrA e parE e 10 haplótipos para o gene parC. Os haplótipos fundadores são Hap-1 (18%), Hap-2 (27,3%) e Hap-6 (9,1%) para os genes gyrA, parC e parE, respectivamente. Dois dos haplótipos parE foram detectados como haplótipos InDel. As redes Median-joining (MJ) construídas a partir de haplótipos desses genes mostraram uma expansão semelhante à de uma estrela. Os testes de neutralidade (teste D de Tajima e teste Fs de Fu) para esses genes apresentaram valores negativos. As cepas palestinas de P. aeruginosa resistentes a fluoroquinolonas mostraram alto nível de MIC para [...].

Phenotypic and molecular characterization of fluoroquinolone resistant Pseudomonas aeruginosa isolates in Palestine / Caracterização fenotípica e molecular de isolados de Pseudomonas aeruginosa resistentes a fluoroquinolonas na Palestina

Fluoroquinolones are important antimicrobial agents for the treatment of Pseudomonas infections. A total of 11 isolates of P. aeruginosa were collected from different clinical samples from different medical centers in the North West Bank-Palestine during 2017. In this study, resistance to fluoroquinolones and secretions of β-lactamases were detected by phenotypic methods, while presence of β-lactamase gene sequences and other virulence factors were detected by PCR technique. PCR product for gyrA, parC and parE genes were sequenced for further analyses. The phylogenetic analyses, population diversity indices and haplotypes determination were conducted using computer programs MEGA version 6, DnaSP 5.1001 and median-joining algorithm in the program Network 5, respectively. Results of this study showed that the MIC for ciprofloxacin and norfloxacin had a range of 32-256 µg/ml. In addition, all isolates carried either exoT or exoT and exoY genes, different β-lactamase genes and 82% of these isolates harbored class 1 integrons. Analyses of the gyrA, parC and parE sequences were found to be polymorphic, had high haplotype diversity (0.945-0.982), low nucleotide diversity (0.01225-0.02001) and number of haplotypes were 9 for each gyrA and parE genes and 10 haplotypes for parC gene. The founder haplotypes being Hap-1 (18%), Hap-2 (27.3%) and Hap-6 (9.1%) for gyrA, parC and parE genes, respectively. Two of ParE haplotypes were detected as indel haplotypes. The Median-joining- (MJ) networks constructed from haplotypes of these genes showed a star-like expansion. The neutrality tests (Tajimas D test and Fus Fs test) for these genes showed negative values. Palestinian fluoroquinolone resistant P. aeruginosa strains showed high MIC level for fluoroquinolones, β-lactamase producers, carried type III secretion exotoxin-encoding genes, most of them [...].(AU)

Fluoroquinolonas são agentes antimicrobianos importantes para o tratamento de infecções por Pseudomonas. Um total de 11 bacilos isolados de P. aeruginosa foram coletados de diferentes amostras clínicas provenientes de diferentes centros médicos na Cisjordânia-Palestina durante o ano de 2017. Neste estudo, resistência a fluoroquinolonas e secreções de β-lactamases foram detectadas por métodos fenotípicos, enquanto a presença de sequências do gene β-lactamase e outros fatores de virulência foram detectados pela técnica de PCR (Proteína C-reativa). O produto de PCR para os genes gyrA, parC e parE foram sequenciados para análises posteriores. As análises filogenéticas, os índices de diversidade populacional e a determinação de haplótipos foram realizados utilizando os softwares MEGA versão 6, DnaSP 5.1001 e o algoritmo de junção de mediana do programa Network 5, respectivamente. Os resultados deste estudo mostraram que a MIC para ciprofloxacina e norfloxacina tinha um intervalo de 32-256 µg/ml. Além disso, todos os bacilos isolados carregavam genes exoT ou exoT e exoY, genes de β-lactamase diferentes e 82% desses isolados continham integrons de classe 1. As análises das sequências gyrA, parC e parE foram consideradas polimórficas, com alta diversidade de haplótipos (0,945-0,982), baixa diversidade de nucleotídeos (0,01225-0,02001) e o número de haplótipos foi de 9 para cada gene de gyrA e parE e 10 haplótipos para o gene parC. Os haplótipos fundadores são Hap-1 (18%), Hap-2 (27,3%) e Hap-6 (9,1%) para os genes gyrA, parC e parE, respectivamente. Dois dos haplótipos parE foram detectados como haplótipos InDel. As redes Median-joining (MJ) construídas a partir de haplótipos desses genes mostraram uma expansão semelhante à de uma estrela. Os testes de neutralidade (teste D de Tajima e teste Fs de Fu) para esses genes apresentaram valores negativos. As cepas palestinas de P. aeruginosa resistentes a fluoroquinolonas mostraram alto nível de MIC para [...].(AU)

Streptococcus spp. in equines - infection and antimicrobial susceptibility profiles

Background: Empirical antimicrobial prescribing is commonly used in equine veterinary. Therefore, professionals can obtain information about antimicrobial susceptibility profile of the bacterial strains based on veterinary literature. Considering equine infections, Streptococcus spp. are important pathogens that can cause serious damage in horses. Therefore, the aim of this study was to describe the antimicrobial susceptibility testing (AST) and infection profiles of Streptococcus spp. strains isolated from equines with infectious diseases subjected to microbiological analysis. Materials, Methods & Results: Veterinarians sent 13 samples and culture in Blood and MacConkey Agar were performed. After the incubation period, suspected colonies, which showed significative growth, were analyzed by Gram-staining, biochemical tests, and subjected to confirmatory identification in Matrix Assisted Laser Desorption Ionization Time of Flight Mass Spectrometry. In vitro AST analysis were performed by disc diffusion method, in accordance with the veterinarians' request. The antimicrobials tested in this study were: ceftiofur, gentamicin, ampicillin, enrofloxacin, amikacin, penicillin, trimethoprim-sulfamethoxazole, ciprofloxacin, doxycycline, vancomycin and metronidazole. The samples included uterine exudate, hock fistula, osteosynthesis exudate, exudate from the guttural pouch, and were originated from animals located in different and distant geographical regions in the cities of Porto Alegre, Pelotas, and Bagé, Rio Grande do Sul, Brazil. Streptococcus dysgalactiae, Streptococcus equi and Streptococcus thoraltensis were the Streptococcus species identified in the samples. S. dysgalactiae was the mainly species found in the uterus samples, while S. thoraltensis, an unusual Streptococcus species, was identified as etiological agent of endometritis in 2 of the analyzed animals. On the other hand, S. equi was found in both the guttural pouch, representing the etiological agent of the strangle case, and in the osteosynthesis exudate, as infectious agent of post-osteosynthesis surgery. The majority of streptococci strains were susceptible to ceftiofur drug. Amikacin and ciprofloxacin, however, were the drugs for which the strains were mainly resistant according to the results. Discussion: The present study provided the AST and infection profile of Streptococcus species related to equine infectious diseases. S. dysgalactiae is considered an unusual bacterium isolated from horses that can be related to endometritis, S. equi is the causative agent of strangles, and S. thoraltensis is unusual in equines. Generally, the observed susceptibility to ceftiofur of the strains analyzed was in agreement with previous results reported in the literature. However, ceftiofur is a third-generation cephalosporin and is considered a critically important antibiotic for human health and its use in veterinary medicine should be cautious. Considering the resistance profile found, Streptococcus spp. can be intrinsically resistant to low drug concentrations of aminoglycosides. Moreover, the emergence and spread of fluoroquinolones resistance may also be due to the acquisition of resistance via horizontal gene transfer. Therefore, the present study described both infection and antimicrobial susceptibility patterns of Streptococcus strains related to equine infectious diseases. Considering the findings, the results found in this study might contribute to the decision-making by veterinarians to further equine treatments.

Therapeutic efficacy of marbofloxacin and ceftiofur in feedlot steers with bovine respiratory disease complex / Eficácia terapêutica da marbofloxacina e ceftiofur em bovinos confinados com complexo doença respiratória de bovinos

Treatment of the bovine respiratory disease complex (BRDC) can elicit high bacterial resistance and stress to steers in a feedlot. Therefore, the present study aimed to evaluate three therapeutic protocols with long-acting antibiotics against BRDC naturally acquired in steers finished in feedlot. In a total of 80 animals finished in a feedlot, 18 steers showed clinical signs compatible with BRDC (mucopurulent nasal secretion, lung auscultation alteration, leukocytosis, and decrease of dry matter intake). These animals were randomly treated: marbofloxacin in a single dose (M1), marbofloxacin in two doses (M2), or ceftiofur in a single dose (C1) on Day 0. The clinical score of pneumonia, hemogram, daily food intake, and body weight were analyzed during 7 days. On slaughter day (Day 100), the body weight and frequency of lungs with pneumonia was evaluated. On Day 7, M2 showed absence of pneumonia, and M1 and C1 still showed a clinical score of mild pneumonia (P = 0.01). On day 2 and day 3 M2 showed a higher dry matter intake than others treatments (P = 0.05). C1 showed a lower body weight than others group on day 1 and 2 (P = 0.05). The C1 and M1 showed a higher pneumonia frequency than M2 (P = 0.02). The M2 slaughter weight was numerically higher than the other treatments. We conclude the marbofloxacin in two doses eliminated the pneumonia ́s clinical symptoms and allowed the animals to return the productivity earlier than other protocols.

Tendo em vista a alta resistência bacteriana e o estresse que o tratamento do complexo doença respiratória dos bovinos (CDRB) pode trazer para novilhos terminados em confinamento, o presente trabalho teve por objetivo avaliar quais dos três protocolos terapêuticos com fármacos de longa ação apresentaria maior eficácia contra o CDRB naturalmente adquirida. Entre 80 animais terminados em confinamento, 18 garrotes apresentaram sinais clínicos compatíveis CDRB (secreção mucopurulenta nasal, alteração em ausculta pulmonar, leucocitose e diminuição de consumo alimentar). Estes animais foram aleatoriamente tratados com: marbofloxacina em dose única (M1), marbofloxacina em duas doses (M2) ou ceftiofur em dose única (C1) no dia 0. Escore clínico de pneumonia, hemograma, consumo alimentar e o peso corporal dos animais foi avaliado durante 7 dias. No dia do abate (dia 100), o peso e frequência de lesões histopatológicas de pneumonia foram avaliadas. No dia 7, os animais do M2 apresentaram ausência de pneumonia enquanto que os animais M1 e C1 ainda apresentavam escore clinico de pneumonia moderada (P = 0.01). Nos dias 2 e 3, o consumo alimentar diário foi maior em M2 que os outros tratamentos (P = 0.05), e o peso corporal de C1 foi menor que os outros grupos em D1 e 2 (P = 0.05). C1 e M1 apresentaram maior frequência de pneumonia no dia do abate que os demais grupos (P = 0.02). O peso ao abate do M2 foi numericamente maior que os demais grupos. Conclui-se que a marbofloxacina em duas doses foi mais precoce na eliminação dos sinais clínicos e no retorno a produtividade.

Phenotypic and molecular characterization of fluoroquinolone resistant Pseudomonas aeruginosa isolates in Palestine / Caracterização fenotípica e molecular de isolados de Pseudomonas aeruginosa resistentes a fluoroquinolonas na Palestina

Fluoroquinolones are important antimicrobial agents for the treatment of Pseudomonas infections. A total of 11 isolates of P. aeruginosa were collected from different clinical samples from different medical centers in the North West Bank-Palestine during 2017. In this study, resistance to fluoroquinolones and secretions of ß-lactamases were detected by phenotypic methods, while presence of ß-lactamase gene sequences and other virulence factors were detected by PCR technique. PCR product for gyrA, parC and parE genes were sequenced for further analyses. The phylogenetic analyses, population diversity indices and haplotypes determination were conducted using computer programs MEGA version 6, DnaSP 5.1001 and median-joining algorithm in the program Network 5, respectively. Results of this study showed that the MIC for ciprofloxacin and norfloxacin had a range of 32-256 µg/ml. In addition, all isolates carried either exoT or exoT and exoY genes, different ß-lactamase genes and 82% of these isolates harbored class 1 integrons. Analyses of the gyrA, parC and parE sequences were found to be polymorphic, had high haplotype diversity (0.945-0.982), low nucleotide diversity (0.01225-0.02001) and number of haplotypes were 9 for each gyrA and parE genes and 10 haplotypes for parC gene. The founder haplotypes being Hap-1 (18%), Hap-2 (27.3%) and Hap-6 (9.1%) for gyrA, parC and parE genes, respectively. Two of ParE haplotypes were detected as indel haplotypes. The Median-joining- (MJ) networks constructed from haplotypes of these genes showed a star-like expansion. The neutrality tests (Tajima's D test and Fu's Fs test) for these genes showed negative values. Palestinian fluoroquinolone resistant P. aeruginosa strains showed high MIC level for fluoroquinolones, ß-lactamase producers, carried type III secretion exotoxin-encoding genes, most of them had integrase I gene and had high level of mutations in QRDR regions in gyrA, parC and parE genes. All these factors may play an important role in the invasiveness of these strains and make them difficult to treat. Isolation of these strains from different medical centers, indicate the need for a strict application of infection control measures in Medical centers in the North West Bank-Palestine that aim to reduce expense and damage caused by P. aeruginosa infections. Molecular analyses showed that Palestinian fluoroquinolone resistant P. aeruginosa haplotypes are not genetically differentiated; however, more mutations may exist in these strains.

Fluoroquinolonas são agentes antimicrobianos importantes para o tratamento de infecções por Pseudomonas. Um total de 11 bacilos isolados de P. aeruginosa foram coletados de diferentes amostras clínicas provenientes de diferentes centros médicos na Cisjordânia-Palestina durante o ano de 2017. Neste estudo, resistência a fluoroquinolonas e secreções de ß-lactamases foram detectadas por métodos fenotípicos, enquanto a presença de sequências do gene ß-lactamase e outros fatores de virulência foram detectados pela técnica de PCR (Proteína C-reativa). O produto de PCR para os genes gyrA, parC e parE foram sequenciados para análises posteriores. As análises filogenéticas, os índices de diversidade populacional e a determinação de haplótipos foram realizados utilizando os softwares MEGA versão 6, DnaSP 5.1001 e o algoritmo de junção de mediana do programa Network 5, respectivamente. Os resultados deste estudo mostraram que a MIC para ciprofloxacina e norfloxacina tinha um intervalo de 32-256 µg/ml. Além disso, todos os bacilos isolados carregavam genes exoT ou exoT e exoY, genes de ß-lactamase diferentes e 82% desses isolados continham integrons de classe 1. As análises das sequências gyrA, parC e parE foram consideradas polimórficas, com alta diversidade de haplótipos (0,945-0,982), baixa diversidade de nucleotídeos (0,01225-0,02001) e o número de haplótipos foi de 9 para cada gene de gyrA e parE e 10 haplótipos para o gene parC. Os haplótipos fundadores são Hap-1 (18%), Hap-2 (27,3%) e Hap-6 (9,1%) para os genes gyrA, parC e parE, respectivamente. Dois dos haplótipos parE foram detectados como haplótipos InDel. As redes Median-joining (MJ) construídas a partir de haplótipos desses genes mostraram uma expansão semelhante à de uma estrela. Os testes de neutralidade (teste D de Tajima e teste Fs de Fu) para esses genes apresentaram valores negativos. As cepas palestinas de P. aeruginosa resistentes a fluoroquinolonas mostraram alto nível de MIC para fluoroquinolonas, produtores de ß-lactamase, genes codificadores de exotoxina de secreção tipo III, a maioria deles tinha o gene integrase I e tinha alto nível de mutações nas regiões QRDR nos genes gyrA, parC e parE. Todos esses fatores podem desempenhar um papel importante na invasão dessas cepas e torná-las difíceis de tratar. O isolamento dessas cepas em diferentes centros médicos, indica a necessidade de uma aplicação estrita de medidas de controle de infecção em centros médicos da Cisjordânia-Palestina que visam reduzir despesas e danos causados por infecções por P. aeruginosa. As análises moleculares mostraram que os haplótipos de P. aeruginosa resistentes à fluoroquinolona palestina não são geneticamente diferenciados; no entanto, mais mutações podem existir nessas cepas.

Phenotypic and molecular characterization of fluoroquinolone resistant Pseudomonas aeruginosa isolates in Palestine

Abstract Fluoroquinolones are important antimicrobial agents for the treatment of Pseudomonas infections. A total of 11 isolates of P. aeruginosa were collected from different clinical samples from different medical centers in the North West Bank-Palestine during 2017. In this study, resistance to fluoroquinolones and secretions of -lactamases were detected by phenotypic methods, while presence of -lactamase gene sequences and other virulence factors were detected by PCR technique. PCR product for gyrA, parC and parE genes were sequenced for further analyses. The phylogenetic analyses, population diversity indices and haplotypes determination were conducted using computer programs MEGA version 6, DnaSP 5.1001 and median-joining algorithm in the program Network 5, respectively. Results of this study showed that the MIC for ciprofloxacin and norfloxacin had a range of 32-256 µg/ml. In addition, all isolates carried either exoT or exoT and exoY genes, different -lactamase genes and 82% of these isolates harbored class 1 integrons. Analyses of the gyrA, parC and parE sequences were found to be polymorphic, had high haplotype diversity (0.945-0.982), low nucleotide diversity (0.01225-0.02001) and number of haplotypes were 9 for each gyrA and parE genes and 10 haplotypes for parC gene. The founder haplotypes being Hap-1 (18%), Hap-2 (27.3%) and Hap-6 (9.1%) for gyrA, parC and parE genes, respectively. Two of ParE haplotypes were detected as indel haplotypes. The Median-joining- (MJ) networks constructed from haplotypes of these genes showed a star-like expansion. The neutrality tests (Tajimas D test and Fus Fs test) for these genes showed negative values. Palestinian fluoroquinolone resistant P. aeruginosa strains showed high MIC level for fluoroquinolones, -lactamase producers, carried type III secretion exotoxin-encoding genes, most of them had integrase I gene and had high level of mutations in QRDR regions in gyrA, parC and parE genes. All these factors may play an important role in the invasiveness of these strains and make them difficult to treat. Isolation of these strains from different medical centers, indicate the need for a strict application of infection control measures in Medical centers in the North West Bank-Palestine that aim to reduce expense and damage caused by P. aeruginosa infections. Molecular analyses showed that Palestinian fluoroquinolone resistant P. aeruginosa haplotypes are not genetically differentiated; however, more mutations may exist in these strains.

Resumo Fluoroquinolonas são agentes antimicrobianos importantes para o tratamento de infecções por Pseudomonas. Um total de 11 bacilos isolados de P. aeruginosa foram coletados de diferentes amostras clínicas provenientes de diferentes centros médicos na Cisjordânia-Palestina durante o ano de 2017. Neste estudo, resistência a fluoroquinolonas e secreções de -lactamases foram detectadas por métodos fenotípicos, enquanto a presença de sequências do gene -lactamase e outros fatores de virulência foram detectados pela técnica de PCR (Proteína C-reativa). O produto de PCR para os genes gyrA, parC e parE foram sequenciados para análises posteriores. As análises filogenéticas, os índices de diversidade populacional e a determinação de haplótipos foram realizados utilizando os softwares MEGA versão 6, DnaSP 5.1001 e o algoritmo de junção de mediana do programa Network 5, respectivamente. Os resultados deste estudo mostraram que a MIC para ciprofloxacina e norfloxacina tinha um intervalo de 32-256 µg/ml. Além disso, todos os bacilos isolados carregavam genes exoT ou exoT e exoY, genes de -lactamase diferentes e 82% desses isolados continham integrons de classe 1. As análises das sequências gyrA, parC e parE foram consideradas polimórficas, com alta diversidade de haplótipos (0,945-0,982), baixa diversidade de nucleotídeos (0,01225-0,02001) e o número de haplótipos foi de 9 para cada gene de gyrA e parE e 10 haplótipos para o gene parC. Os haplótipos fundadores são Hap-1 (18%), Hap-2 (27,3%) e Hap-6 (9,1%) para os genes gyrA, parC e parE, respectivamente. Dois dos haplótipos parE foram detectados como haplótipos InDel. As redes Median-joining (MJ) construídas a partir de haplótipos desses genes mostraram uma expansão semelhante à de uma estrela. Os testes de neutralidade (teste D de Tajima e teste Fs de Fu) para esses genes apresentaram valores negativos. As cepas palestinas de P. aeruginosa resistentes a fluoroquinolonas mostraram alto nível de MIC para fluoroquinolonas, produtores de -lactamase, genes codificadores de exotoxina de secreção tipo III, a maioria deles tinha o gene integrase I e tinha alto nível de mutações nas regiões QRDR nos genes gyrA, parC e parE. Todos esses fatores podem desempenhar um papel importante na invasão dessas cepas e torná-las difíceis de tratar. O isolamento dessas cepas em diferentes centros médicos, indica a necessidade de uma aplicação estrita de medidas de controle de infecção em centros médicos da Cisjordânia-Palestina que visam reduzir despesas e danos causados por infecções por P. aeruginosa. As análises moleculares mostraram que os haplótipos de P. aeruginosa resistentes à fluoroquinolona palestina não são geneticamente diferenciados; no entanto, mais mutações podem existir nessas cepas.

Antimicrobial resistance profile of bacteria isolated from canine and feline samples at the Preventive Veterinary Laboratory of the Federal University of Rio Grande do Sul (UFRGS) - Brazil

Background: Antimicrobial resistance (AMR) is a major global health threat. In small animals such as dogs and cats, antimicrobials are most commonly prescribed for skin and genitourinary diseases; therefore, the AMR of bacteria involved in these infections should be monitored. In addition, the results of antimicrobial susceptibility testing (AST) may be interpreted as a local epidemiological history of AMR. The Preventive Veterinary Medicine Laboratory (PVML) received clinical samples from dogs and cats for bacterial isolation and AST. Thus, this study aimed to assess the AMR of bacteria isolated from the samples of dogs and cats received at the Preventive Veterinary Medicine Laboratory (PVML). Materials, Methods & Results: Data from bacteriological examinations performed at the PVML of the Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS) during 5 years were analyzed. Skin and ear canal samples were inoculated in 5% sheep blood agar, and urine samples were streaked on CHROMagar™ orientation. After incubation at 36±1°C for up to 72 h, identification and AST were performed according to routine protocols. Of 1,534 samples submitted to the PVML, 1,086 (70.8%) were collected from dogs and 29.2% from feline patients. Otological swabs (n = 533, 49.1%) were the most frequent samples from dogs, while cat urine samples (n = 384, 84.8%) predominated by far. Considering the canine samples, no bacterial growth (NBG) was observed in 443 (40.8%) samples, while only one colony type was noted in 516 (47.5%) samples. Gram-positive bacteria (n = 298) were more frequent than gram-negative bacteria (n = 77) in the skin. In urine samples, gram-negative bacteria (n = 94) were isolated more frequently than gram-positive bacteria (n = 47). In feline samples, a high number of NBG (n = 308, 68%) was observed. Gram-positive (n = 22) was predominant in comparison to gram-negative bacteria (n = 9) in cultures from the ear and skin swabs. Enterococcus spp. and Escherichia coli were the most frequently identified bacteria in urine samples. Among the Staphylococcus sp. strains of any origin, AMR frequency varied from 4.22% (amikacin) to 50.70% (sulfa/trimethoprim). Enterococcus spp. showed AMR frequencies from 12.5% (amoxicillin/clavulanic acid) to 62.06% (enrofloxacin). Among the gram-negative genera, E. coli presented AMR frequencies from 10.20% (gentamicin) to 60.0% (neomycin). The frequency of AMR was stable over time, and a profile of much higher resistance to fluoroquinolones in comparison to beta-lactams was observed. Discussion: The recurrence of skin and urinary infections implies the need for frequent treatment with antibiotics, which exerts selection pressure for resistance and multidrug resistance. In this study, the frequency of multidrug resistance was low, and the resistance to the tested antimicrobials showed high variation. However, a trend of high resistance to the fluoroquinolone group was observed in contrast to the low resistance to beta-lactams. This trend was consistent among the isolated bacteria, regardless of the type of sample or origin. The overprescription of fluoroquinolones in small animal practices has been widely documented in several countries. However, this class of antimicrobials, is highly prioritized for the treatment of infections in humans. Therefore, the selection of resistant strains has gained special emphasis, especially when considering the possibility of the transmission of resistant bacteria between pets and humans. In summary, the results of bacteriological tests conducted at the PVML-Universidade Federal do Rio Grande do Sul confirmed that ubiquitous bacteria predominate in clinical samples of dogs and cats. The high frequency of resistance to the fluoroquinolone group, while a predominance of susceptible strains in the first-choice drugs such as amoxicillin/clavulanic acid, may indicate excessive and empirical use of the second-choice drugs in clinical practice.

Frequency of pathogens in routine bacteriological diagnosis in fish and their antimicrobial resistance / Frequência de patógenos na rotina de diagnóstico bacteriológico em peixes e sua resistência a antimicrobianos

Aquaculture is one of the sectors of animal husbandry with the fastest growth rate. However, the increase in the sector's production chain without proper management can result in factors that favor the development of diseases, especially infectious diseases caused by bacteria. Many factors, such as agriculture or industry resides, improper use of antibiotics in animals or humans, have contributed to increased environmental pressure and the appearance of antibiotic-resistant bacteria, while residues from these drugs can remain in the carcasses and in water a risk to public and environmental health. From that, we identified the bacterial genus/species and their bacterial resistance to antibiotics from samples received from fish disease outbreaks for bacteriosis diagnosis between January 2017 and October 2020. Isolated bacteria were subjected to the Kirby and Bauer sensitivity test for five classes of antibiotics (penicillins, fluoroquinolones, aminoglycosides, amphenicols, and tetracyclines). Of the 181 analyzed outbreaks, 232 bacteria were isolated, including Streptococcus spp., Aeromonas spp., Edwardsiella spp., Plesiomonas shigelloides, Pseudomonas aeruginosa, Chromobacterium violaceum, Flavobacterium spp., Citrobacter spp., Enterococcus spp., Vibrio spp., Enterobacter spp., Chryseobacterium meningosepticum. Of the 232 bacteria, 40 strains were classified as multidrug resistant (MDR), with Plesiomonas shigelloides, Aeromonas spp., and Edwardsiella spp. representing more than half of this number (22/total). With several bacteria demonstrating resistance to Brazilian aquaculture-legalized drugs (tetracycline and florfenicol), it is mandatory to research, not only for alternatives to the use of antibiotics, but also for other drugs effective against the main circulating bacterial pathogens. In addition, vigilance over the occurrence of resistant bacteria is necessary, considering the appearance of zoonotic bacteria with multi-resistant characteristics, becoming a public health concern.(AU)

Aquicultura é um dos setores da produção animal com o mais rápido crescimento. Muitos fatores, como resíduos industriais e/ou de agricultura e o uso indevido de antibióticos em animais ou humanos têm contribuído para aumentar a pressão ambiental e o aparecimento de bactérias resistentes a antibióticos contribuindo para os resíduos dessas drogas permanecerem nas carcaças e na água, o que é um risco para a saúde pública / ambiental. A partir disso, foram identificados o gênero / espécie de bactérias e sua resistência bacteriana aos antibióticos de amostras recebidas de surtos de doenças em peixes para diagnóstico bacteriológico no período entre janeiro de 2017 e outubro de 2020. As bactérias isoladas foram submetidas ao teste de sensibilidade de Kirby e Bauer para cinco classes de antibióticos (penicilinas, fluoroquinolonas, aminoglicosídeos, anfenicóis e tetraciclinas). Nos 181 surtos analisados, 232 bactérias foram isoladas, sendo estas Streptococcus spp., Aeromonas spp., Edwardsiella spp., Plesiomonas shigelloides, Pseudomonas aeruginosa, Chromobacterium violaceum, Flavobacterium spp., Citrobacter spp., Enterococcus spp., Vibrio spp., Enterobacter spp., Chryseobacterium meningosepticum dentre outras. Destas 232 bactérias, 40 cepas foram classificadas como multirresistentes (MDR), com Plesiomonas shigelloides, Aeromonas spp. e Edwardsiella spp. representando mais da metade destas (22 / total). Com várias bactérias demonstrando resistência aos medicamentos legalizados na aquicultura brasileira (tetraciclina e florfenicol), torna-se obrigatória a pesquisa, não apenas de alternativas ao uso de antibióticos, mas também de outros medicamentos eficazes contra os principais patógenos circulantes. Além disso, a vigilância sobre a ocorrência de cepas resistentes é necessária levando-se em consideração o aparecimento de bactérias zoonóticas com essa característica, tornando-se um ponto de interesse à saúde pública.(AU)

Characterization of Enterococcus spp. isolated from a fish farming environment in southern Brazil / Caracterização de Enterococcus spp. isolado de um ambiente de piscicultura no sul do Brasil

The aim of present study is to characterize the resistance and virulence profile of enterococci isolated from aquaculture excavated ponds and masonry tanks (6 samples) in southern Brazil. Samples were cultured in selective medium, 10 colonies were randomly selected from each sample, which were identified by MALDI-TOF and tested against 13 antimicrobials. The presence of resistance (tetL, tetM, tetS, ermB and msrC) and virulence (ace, esp, agg, cylA and gelE) genes were determined by PCR. A total of 79 enterococci were identified, and Entecococcus faecalis (44.3%) and E. casseliflavus (36.7%) were the most prevalent species isolated. Sixty-five strains (82.3%) were resistant to at least one of the antimicrobials tested, whereas 27 (34.2%) strains were multiresistant. The overall percentages of antimicrobial resistant isolates were: 58.2% to rifampicin, 40.5% to fluoroquinolones, 36.7% to erythromycin and 30.4% to tetracycline. The tetL and tetM genes were found in 57.7% of the tetracycline-resistant strains; and msrC in 31.01% of erythromycin-resistant strains. The most frequently detected virulence factors were ace and gelE genes. Although limited to a single farm, these data suggest that aquaculture may be a reservoir of resistant and virulent enterococci. This study is the first step towards enhancing our understandingof distribution, resistance and virulence profile in enterococci isolated from fish farming environments in the south Brazil.(AU)

O objetivo do estudo apresentado é caracterizar o perfil de resistência e virulência de enterococos isolados de viveiros escavados e tanques de alvenaria (6 amostras) de uma pisicultura no Sul do Brasil. As amostras foram cultivadas em meio seletivo, 10 colônias foram selecionadas aleatoriamente de cada amostra, que foram identificadas por MALDI-TOF e testadas contra 13 antimicrobianos. A presença de genes de resistência (tetL, tetM, tetS, ermB e msrC) e virulência (ace, esp, agg, cylA e gelE) foi determinada por PCR. Foram identificados 79 enterococos, sendo Entecococcus faecalis (44,3%) e E. casseliflavus (36,7%) as espécies mais frequentes isoladas. Sessenta e cinco cepas (82,3%) eram resistentes a pelo menos um dos antimicrobianos testados, enquanto 27 (34,2%) eram multirresistentes. As porcentagens gerais de isolados resistentes a antimicrobianos foram: 58,2% para rifampicina, 40,5% para fluoroquinolonas, 36,7% para eritromicina e 30,4% para tetraciclina. Os genes tetL e tetM foram encontrados em 57,7% das cepas resistentes à tetraciclina; e msrC em 31,01% das cepas resistentes à eritromicina. Os fatores de virulência mais comumente detectados foram ace e gelE. Embora limitados a uma única fazenda, esses dados indicam que a aquicultura pode ser uma fonte de enterococos resistentes e virulentos. Este estudo é o primeiro passo para melhorar nosso entendimento da distribuição, resistência e perfil de virulência em enterococos isolados de ambientes de piscicultura no sul do Brasil.(AU)

Detection of resistance genes in pyometra isolated bacteria in bitches / Detecção de genes de resistência em bactérias isoladas de piometra em cadelas

Pyometra has several immunological and molecular changes that are responsible for uterine inflammation and the disease may or may not have infections. This study aimed to isolate and identify bacteria in the uterine content of bitches with pyometra, to analyze the susceptibility profile to antibiotics, detect ß-lactamase enzyme production by phenotypic tests, and resistance genes to ß-lactams. Eighteen samples of uterine content were collected by aspiration puncture. The samples were inoculated in bacteriological media and identified by biochemical tests. Subsequently, antibiogram tests, screening for detection of ß-lactamases, and Real-Time PCR for detection of resistance genes was performed. Escherichia coli, Klebsiella spp., Enterobacter aerogenes, Citrobacter spp., Staphylococcus spp., and Streptococcus spp. were identified in the analyzed samples of uterine content. In the antibiogram test, 90.5% of the isolates showed resistance to at least one antibiotic, and of these, 36.8% were considered MDR, with three Staphylococcus spp., three E. coli, and one Klebsiellaspp. Concerning bacterial resistance to the groups of antibiotics tested, 38.1% of the isolates were resistant to at least one type of ß-lactam, 33.3% to tetracycline, 19.0% to aminoglycosides, and 14.3% to fluoroquinolones, macrolides, and trimethoprim-sulfamethoxazole. In the phenotypic test to detect ß-lactamase production, E. coli samples were negative and Klebsiella spp. was positive for the production of AmpC, which presented the blaCMY, blaSPM, and blaSIM genes. Bacteria that are resistant to antibiotics represent a great challenge and laboratory support is therefore essential, without which therapeutic success decreases and death may be inevitable.(AU)

A piometra apresenta diversas alterações imunológicas e moleculares que são responsáveis pela inflamação uterina, e a doença pode ser infecciosa ou não. O objetivo deste estudo foi isolar e identificar bactérias no conteúdo uterino de cadelas com piometra, analisar o perfil de suscetibilidade aos antibióticos, detectar a produção de enzimas ß-lactamase por testes fenotípicos e genes de resistência aos ß-lactâmicos. Dezoito amostras de conteúdo uterino foram coletadas por punção aspirativa. As amostras foram inoculadas em meio bacteriológico e identificadas por testes bioquímicos. Posteriormente, foram realizados testes de antibiograma, triagem para detecção de ß-lactamases e PCR em tempo real para detecção de genes de resistência. Escherichia coli, Klebsiella spp., Enterobacter aerogenes, Citrobacter spp., Staphylococcus spp. e Streptococcus spp. foram identificados nas amostras de conteúdo uterino analisadas. No teste de antibiograma, 90,5% dos isolados apresentaram resistência a pelo menos um antibiótico, e destes, 36,8% foram considerados MR, sendo três Staphylococcus spp., três E. coli e uma Klebsiella spp. Sobre a resistência bacteriana aos grupos de antibióticos testados, 38,1% dos isolados foram resistentes a pelo menos um tipo de ß-lactâmico, 33,3% à tetraciclina, 19,0% aos aminoglicosídeos e 14,3% às fluorquinolonas, macrolídeos e trimetoprim-sulfametoxazol. No teste fenotípico para detecção da produção de ß-lactamase, as amostras de E. coli foram negativas, e Klebsiella spp. foi positiva para a produção de AmpC, que apresentou os genes blaCMY, blaSPM e blaSIM. As bactérias resistentes aos antibióticos representam um grande desafio e, portanto, o suporte laboratorial é essencial, sem o qual o sucesso terapêutico diminui e a morte pode ser inevitável.(AU)

Detection of resistance genes in pyometra isolated bacteria in bitches / Detecção de genes de resistência em bactérias isoladas de piometra em cadelas

Pyometra has several immunological and molecular changes that are responsible for uterine inflammation and the disease may or may not have infections. This study aimed to isolate and identify bacteria in the uterine content of bitches with pyometra, to analyze the susceptibility profile to antibiotics, detect ß-lactamase enzyme production by phenotypic tests, and resistance genes to ß-lactams. Eighteen samples of uterine content were collected by aspiration puncture. The samples were inoculated in bacteriological media and identified by biochemical tests. Subsequently, antibiogram tests, screening for detection of ß-lactamases, and Real-Time PCR for detection of resistance genes was performed. Escherichia coli, Klebsiella spp., Enterobacter aerogenes, Citrobacter spp., Staphylococcus spp., and Streptococcus spp. were identified in the analyzed samples of uterine content. In the antibiogram test, 90.5% of the isolates showed resistance to at least one antibiotic, and of these, 36.8% were considered MDR, with three Staphylococcus spp., three E. coli, and one Klebsiellaspp. Concerning bacterial resistance to the groups of antibiotics tested, 38.1% of the isolates were resistant to at least one type of ß-lactam, 33.3% to tetracycline, 19.0% to aminoglycosides, and 14.3% to fluoroquinolones, macrolides, and trimethoprim-sulfamethoxazole. In the phenotypic test to detect ß-lactamase production, E. coli samples were negative and Klebsiella spp. was positive for the production of AmpC, which presented the blaCMY, blaSPM, and blaSIM genes. Bacteria that are resistant to antibiotics represent a great challenge and laboratory support is therefore essential, without which therapeutic success decreases and death may be inevitable.(AU)

A piometra apresenta diversas alterações imunológicas e moleculares que são responsáveis pela inflamação uterina, e a doença pode ser infecciosa ou não. O objetivo deste estudo foi isolar e identificar bactérias no conteúdo uterino de cadelas com piometra, analisar o perfil de suscetibilidade aos antibióticos, detectar a produção de enzimas ß-lactamase por testes fenotípicos e genes de resistência aos ß-lactâmicos. Dezoito amostras de conteúdo uterino foram coletadas por punção aspirativa. As amostras foram inoculadas em meio bacteriológico e identificadas por testes bioquímicos. Posteriormente, foram realizados testes de antibiograma, triagem para detecção de ß-lactamases e PCR em tempo real para detecção de genes de resistência. Escherichia coli, Klebsiella spp., Enterobacter aerogenes, Citrobacter spp., Staphylococcus spp. e Streptococcus spp. foram identificados nas amostras de conteúdo uterino analisadas. No teste de antibiograma, 90,5% dos isolados apresentaram resistência a pelo menos um antibiótico, e destes, 36,8% foram considerados MR, sendo três Staphylococcus spp., três E. coli e uma Klebsiella spp. Sobre a resistência bacteriana aos grupos de antibióticos testados, 38,1% dos isolados foram resistentes a pelo menos um tipo de ß-lactâmico, 33,3% à tetraciclina, 19,0% aos aminoglicosídeos e 14,3% às fluorquinolonas, macrolídeos e trimetoprim-sulfametoxazol. No teste fenotípico para detecção da produção de ß-lactamase, as amostras de E. coli foram negativas, e Klebsiella spp. foi positiva para a produção de AmpC, que apresentou os genes blaCMY, blaSPM e blaSIM. As bactérias resistentes aos antibióticos representam um grande desafio e, portanto, o suporte laboratorial é essencial, sem o qual o sucesso terapêutico diminui e a morte pode ser inevitável.(AU)

Frequency of pathogens in routine bacteriological diagnosis in fish and their antimicrobial resistance / Frequência de patógenos na rotina de diagnóstico bacteriológico em peixes e sua resistência a antimicrobianos

Aquaculture is one of the sectors of animal husbandry with the fastest growth rate. However, the increase in the sector's production chain without proper management can result in factors that favor the development of diseases, especially infectious diseases caused by bacteria. Many factors, such as agriculture or industry resides, improper use of antibiotics in animals or humans, have contributed to increased environmental pressure and the appearance of antibiotic-resistant bacteria, while residues from these drugs can remain in the carcasses and in water a risk to public and environmental health. From that, we identified the bacterial genus/species and their bacterial resistance to antibiotics from samples received from fish disease outbreaks for bacteriosis diagnosis between January 2017 and October 2020. Isolated bacteria were subjected to the Kirby and Bauer sensitivity test for five classes of antibiotics (penicillins, fluoroquinolones, aminoglycosides, amphenicols, and tetracyclines). Of the 181 analyzed outbreaks, 232 bacteria were isolated, including Streptococcus spp., Aeromonas spp., Edwardsiella spp., Plesiomonas shigelloides, Pseudomonas aeruginosa, Chromobacterium violaceum, Flavobacterium spp., Citrobacter spp., Enterococcus spp., Vibrio spp., Enterobacter spp., Chryseobacterium meningosepticum. Of the 232 bacteria, 40 strains were classified as multidrug resistant (MDR), with Plesiomonas shigelloides, Aeromonas spp., and Edwardsiella spp. representing more than half of this number (22/total). With several bacteria demonstrating resistance to Brazilian aquaculture-legalized drugs (tetracycline and florfenicol), it is mandatory to research, not only for alternatives to the use of antibiotics, but also for other [...].

Aquicultura é um dos setores da produção animal com o mais rápido crescimento. Muitos fatores, como resíduos industriais e/ou de agricultura e o uso indevido de antibióticos em animais ou humanos têmc ontribuído para aumentar a pressão ambiental e o aparecimento de bactérias resistentes a antibióticos contribuindo para os resíduos dessas drogas permanecerem nas carcaças e na água, o que é um risco para a saúde pública / ambiental. A partir disso, foram identificados o gênero / espécie de bactérias e sua resistência bacteriana aos antibióticos de amostras recebidas de surtos de doenças em peixes para diagnóstico bacteriológico no período entre janeiro de 2017 e outubro de 2020. As bactérias isoladas foram submetidas ao teste de sensibilidade de Kirby e Bauer para cinco classes de antibióticos (penicilinas, fluoroquinolonas, aminoglicosídeos, anfenicóis e tetraciclinas). Nos 181 surtos analisados, 232 bactérias foram isoladas, sendo estas Streptococcus spp., Aeromonas spp., Edwardsiella spp., Plesiomonas shigelloides, Pseudomonas aeruginosa, Chromobacterium violaceum, Flavobacterium spp.,Citrobacter spp., Enterococcus spp., Vibrio spp., Enterobacter spp., Chryseobacterium meningosepticum dentre outras. Destas 232 bactérias, 40 cepas foram classificadas como multirresistentes (MDR), com Plesiomonas shigelloides, Aeromonas spp. e Edwardsiella spp. representando mais da metade destas (22 / total). Com várias bactérias demonstrando resistência aos medicamentos legalizados na aquicultura brasileira (tetraciclina e florfenicol), torna-se obrigatória a pesquisa, não apenas de alternativas ao uso de antibióticos, mas também de outros medicamentos eficazes contra os principais patógenos circulantes. Além disso, a vigilância sobre a ocorrência de cepas resistentes é necessária levando-se em consideração o aparecimento de bactérias zoonóticas com essa característica, tornando-se um ponto de interesse à saúde pública.