Estimation of genetic parameters for test-day milk yield in Girolando cows using a random regression model / [Estimação de parâmetros genéticos para produção de leite no dia do teste em vacas da raça Girolando utilizando modelo de regressão aleatória]

The objective of this study was to estimate the components of variance and genetic parameters of test-day milk yield in first lactation Girolando cows, using a random regression model. A total of 126,892 test-day milk yield (TDMY) records of 15,351 first-parity Holstein, Gyr, and Girolando breed cows were used, obtained from the Associação Brasileira dos Criadores de Girolando. To estimate the components of (co) variance, the additive genetic functions and permanent environmental covariance were estimated by random regression in three functions: Wilmink, Legendre Polynomials (third order) and Linear spline Polynomials (three knots). The Legendre polynomial function showed better fit quality. The genetic and permanent environment variances for TDMY ranged from 2.67 to 5.14 and from 9.31 to 12.04, respectively. Heritability estimates gradually increased from the beginning (0.13) to mid-lactation (0.19). The genetic correlations between the days of the control ranged from 0.37 to 1.00. The correlations of permanent environment followed the same trend as genetic correlations. The use of Legendre polynomials via random regression model can be considered as a good tool for estimating genetic parameters for test-day milk yield records.(AU)

O objetivo deste estudo foi estimar os componentes de variância e os parâmetros genéticos da produção de leite no dia do teste (TDMY) em vacas Girolando de primeira lactação, usando modelo de regressão aleatória. Foram utilizados 126.892 registros de produção de leite no dia controle de 15.351 vacas primíparas das raças Holandesa, Gir e Girolando, obtidas na Associação Brasileira dos Criadores de Girolando. Para estimar os componentes de (co) variância, as funções genéticas aditivas e de covariância ambiental permanente foram estimadas por regressão aleatória em três funções: Wilmink, polinômios de Legendre (terceira ordem) e polinômios splines lineares (três nós). A função polinomial de Legendre apresentou melhor qualidade de ajuste. As variâncias genéticas e de ambiente permanente para produção de leite no dia do controle variaram de 2,67 a 5,14 e de 9,31 a 12,04, respectivamente. As estimativas de herdabilidade aumentaram gradativamente do início (0,13) para o meio da lactação (0,19). As correlações genéticas entre os dias do controle variaram de 0,37 a 1,00. As correlações de ambiente permanente seguiram a mesma tendência das correlações genéticas. A utilização dos polinômios de Legendre via modelos de regressão aleatória pode ser considerada como uma boa ferramenta para estimação de parâmetros genéticos da produção de leite no dia do teste.(AU)

Covariance functions under B-spline polynomials to model Polled Nellore cattle growth / Funções de covariâncias sob polinômios B-splines para modelagem do crescimento de bovinos Nelore Mocho

B-spline functions have been used in random regression models (RRM) to model animal weight from birth to adulthood because they are less vulnerable to common difficulties of other methods. However, its application to model growth traits of Polled Nellore cattle has been little studied. Therefore, this study aimed to evaluate polynomial functions of different orders and segment numbers to model effects associated with the Polled Nellore cattle growth curve. For this purpose, we used 15,148 weight records of 3,115 animals aged between 1 and 660 days and reared in northern Brazil and born between 1995 and 2010. Random effects were modeled using B-spline polynomials. As random effects, we considered the direct and maternal genetic additives, as well as direct and maternal permanent environments. As fixed effects were included contemporary group, cow age at calving (linear and quadratic) and fourth-order Legendre polynomials to represent average growth curve. The residue was modeled by considering seven age classes. The bestfitted model was the one that considered cubic B-spline functions with four knots for direct additive genetic effects and three knots for maternal genetic, animal permanent environment, and maternal permanent environment effects (C6555). Therefore, covariance functions under B-spline polynomials are efficient and can be used to model the growth curve of Polled Nellore cattle from birth to 660 days of age.(AU)

Os modelos de regressão aleatória (MRA) aplicando funções B-spline são uma alternativa para modelar pesos do nascimento até a idade adulta dos animais, pois estas funções são menos vulneráveis as dificuldades constantemente observadas em outras metodologias. No entanto, são escassas pesquisas sobre aplicação destas funções sobre as características de crescimento em bovinos Nelore Mocho. Funções polinomiais de diferentes ordens e números de segmentos foram avaliadas na modelagem dos efeitos associados à curva de crescimento de bovinos da raça Nelore Mocho. Foram utilizados 15.148 registros de peso de 3.115 animais com idade entre 1 e 660 dias, criados na região norte do Brasil e nascidos entre 1995 e 2010. Os efeitos aleatórios foram modelados usando polinômios do tipo B-splines. Como efeitos aleatórios, foram considerados os efeitos genéticos aditivo direto e materno e os efeitos de ambientes permanentes direto e materno. Foram considerados como efeitos fixos, os grupos de contemporâneos, a idade da vaca ao parto (efeito linear e quadrático) e os polinômios de Legendre de quarta ordem, representando a curva média de crescimento. O resíduo foi modelado por meio de sete classes distribuídas segundo a idade. O modelo que considerou funções B-splines cúbicas com quatro nós para o efeito genético aditivo direto e três nós para os efeitos genético materno, ambiente permanente animal e ambiente permanente materno (C6555) foi o mais adequado. Concluiu-se que funções de covariâncias sob polinômios B-splines são eficientes e podem ser utilizados como alternativas para modelar a curva de crescimento de bovinos da raça Nelore Mocho do nascimento até 660 dias de idade.(AU)

Random regression models for the evaluation of the growth of goats of the Anglonubian breed / Modelos de regressão aleatória para avaliação do crescimento de caprinos da raça Anglonubiana

A total of 6593 weight records collected from 796 male and female Anglo-Nubian goats aged up to 130 days, offspring from 29 sires and 225 dams, were used to compare models and estimate genetic parameters throughout the growth curve by applying random regression models. Direct and maternal additive genetic effects and direct and maternal permanent environmental effects were included as random in the models. The contemporary groups were included as fixed effects and goat age at kidding was included as a covariable (linear and quadratic). The choice of the best model was based on the AIC, BIC and AICc criteria. Variance estimates of the four random effects increased as the animals aged. Direct heritability (h2) rose from 0.13 to 0.40 with age, whereas maternal heritability showed a low value. Genetic correlations of weight between closer ages were high. The most suitable random regression model to compare the fitting of random effects was that which employed the Legendre polynomials of quadratic order with homogeneous variance (3333-1).(AU)

Utilizaram-se 6593 pesos de 796 caprinos da raça Anglonubiana, coletados em machos e fêmeas com idade até 130 dias, descendentes de 29 reprodutores e 225 matrizes, com o objetivo de se compararem modelos e de se estimarem parâmetros genéticos ao longo da curva de crescimento com aplicação de modelos de regressão aleatória. Nos modelos, incluíram-se os efeitos genéticos aditivos diretos e maternos e os de ambiente permanente diretos e maternos como aleatórios; os grupos de contemporâneos foram incluídos como efeitos fixos, e a idade da cabra ao parto como covariável (linear e quadrática). A escolha do melhor modelo foi realizada pela avaliação dos critérios AIC, BIC e AICc. As estimativas de variâncias dos quatro efeitos aleatórios cresceram de acordo com o aumento da idade. A herdabilidade direta (h2) aumentou de 0,13 a 0,40 com a idade, e a materna apresentou baixo valor. As correlações genéticas do peso entre idades mais próximas foram altas. O modelo de regressão aleatório mais adequado ao se comparar o ajuste dos efeitos aleatórios foi o que empregou polinômios de Legendre de ordem quadrática com variância homogênea (3333-1).(AU)

Random regression models for the evaluation of the growth of goats of the Anglonubian breed / Modelos de regressão aleatória para avaliação do crescimento de caprinos da raça Anglonubiana

A total of 6593 weight records collected from 796 male and female Anglo-Nubian goats aged up to 130 days, offspring from 29 sires and 225 dams, were used to compare models and estimate genetic parameters throughout the growth curve by applying random regression models. Direct and maternal additive genetic effects and direct and maternal permanent environmental effects were included as random in the models. The contemporary groups were included as fixed effects and goat age at kidding was included as a covariable (linear and quadratic). The choice of the best model was based on the AIC, BIC and AICc criteria. Variance estimates of the four random effects increased as the animals aged. Direct heritability (h2) rose from 0.13 to 0.40 with age, whereas maternal heritability showed a low value. Genetic correlations of weight between closer ages were high. The most suitable random regression model to compare the fitting of random effects was that which employed the Legendre polynomials of quadratic order with homogeneous variance (3333-1).(AU)

Utilizaram-se 6593 pesos de 796 caprinos da raça Anglonubiana, coletados em machos e fêmeas com idade até 130 dias, descendentes de 29 reprodutores e 225 matrizes, com o objetivo de se compararem modelos e de se estimarem parâmetros genéticos ao longo da curva de crescimento com aplicação de modelos de regressão aleatória. Nos modelos, incluíram-se os efeitos genéticos aditivos diretos e maternos e os de ambiente permanente diretos e maternos como aleatórios; os grupos de contemporâneos foram incluídos como efeitos fixos, e a idade da cabra ao parto como covariável (linear e quadrática). A escolha do melhor modelo foi realizada pela avaliação dos critérios AIC, BIC e AICc. As estimativas de variâncias dos quatro efeitos aleatórios cresceram de acordo com o aumento da idade. A herdabilidade direta (h2) aumentou de 0,13 a 0,40 com a idade, e a materna apresentou baixo valor. As correlações genéticas do peso entre idades mais próximas foram altas. O modelo de regressão aleatório mais adequado ao se comparar o ajuste dos efeitos aleatórios foi o que empregou polinômios de Legendre de ordem quadrática com variância homogênea (3333-1).(AU)

Covariance function of Legendre polynomials for the modeling of Polled Nellore cattle growth in northern Brazil / Funções de covariâncias sob polinômios de Legendre para modelagem do crescimento de bovinos da raça Nelore Mocho da região Norte do Brasil

This study aimed to compare random regression models fitted by Legendre orthogonal polynomials and determine which best fits changes in Nellore cattle growth parameters. Age polynomial functions of different orders were evaluated using a random-effect modeling associated with a genetic study of cattle growth curves. For this purpose, weight records (15,148) were performed in Polled Nellore bovines (3,115), aged between 1 and 660 days, reared in northern Brazil and born between 1995 and 2010. The fixed effects of analytical models comprised age-matched groups, heifer calving age (linear and quadratic), and fourth-order Legendre age polynomial (cubic), depicting the mean growth curve. Besides, different order functions were considered for random effects, so that (co) variance associated with genetic effects (direct and maternal) and permanent environmental effects (animal and maternal) could be modeled. Residual variance was fitted by six heterogeneous classes throughout the analyzed period. According to AIC and BIC criteria, the model 6333 allowed the fitting of changes in variance and covariance over time (genetic and environmental). Thus, this model can be used to describe age-related changes in Polled Nellore cattle reared in northern Brazil.(AU)

Objetivou-se comparar diferentes modelos de regressão aleatória ajustados por polinômios ortogonais de Legendre com a finalidade de determinar o mais adequado para descrever mudanças nos parâmetros de avaliação do crescimento de bovinos Nelore. Funções polinomiais da idade de diferentes ordens foram avaliadas na modelagem dos efeitos aleatórios associados ao estudo genético da curva de crescimento de bovinos. Utilizaram-se 15148 registros de pesos de 3115 de bovinos Nelore Mocho, com idade entre 1 e 660 dias, criados na região norte do Brasil e nascidos entre os anos de 1995 e 2010. Os efeitos fixos incluídos nos modelos de análise foram: grupos de contemporâneos, a idade da vaca ao parto (efeito linear e quadrático) e os polinômios de Legendre da idade de quarta ordem (cúbica) para representar a curva média de crescimento. Na parte aleatória, consideraram-se funções de diferentes ordens para modelar as variâncias associadas aos efeitos genéticos aditivos direto e materno e aos efeitos de ambiente permanente do animal e da mãe. A variância residual foi ajustada por meio de seis classes heterogêneas, distribuídas ao longo do período analisado. De acordo com o valor do critério AIC e BIC o modelo com ordens 6333 (para efeitos genético direto e materno; e ambiente permanente direto e materno, respectivamente), permitiu ajustar as mudanças das variâncias e covariâncias com o tempo, podendo ser utilizado para descrever as mudanças nas variâncias com a idade dos bovinosNelore Mocho criados na região Norte do Brasil.(AU)

Growth curves and genetic parameters in Nelore animals estimated by random regression models / Curvas de crescimento e parâmetros genéticos em animais da raça Nelore estimados por modelos de regressão aleatória

The objective of this work was to estimate growth curves and genetic parameters from birth to 650 days of age of Nelore cattle raised in pasture in two production regions of the Mato Grosso do Sul State, Brazil (233,835 weight records from 47,459 cattle were analyzed). Genetic parameters were determined by random regression using Legendre orthogonal polynomials of cubic order, and age at weighing was considered in the model as a fixed effect to model the average growth trajectory. In the models, the effects of the contemporary group were considered as fixed and, as covariates, the animal age at weighing and the cow age at calving were nested in the animal age class (linear and quadratic effects), forming eight age classes. All models included the direct genetic additive, maternal genetic, and animal permanent environment as random effects, and the most appropriate model to describe the studied effects was defined according to the AIC and BIC criteria. Heritability estimates for birth weight varied between the two production regions, Campo Grande-Dourados (R1) and Alto Taquari-Bolsão (R2) and R1 (0.36 ± 0.02) and R2 (0.28 ± 0.03), and there were variations in the estimates at advanced ages. In both regions, the highest heritability values at 650 days of age were 0.47 ± 0.03 and 0.65 ± 0.02 for R1 and R2, respectively, with high heritability reflecting the high values of additive...(AU)

O objetivo do trabalho foi estimar curvas de crescimento e parâmetros genéticos, do nascimento aos 650 dias de idade de bovinos da raça Nelore criados a pasto em duas regiões de produção do estado de Mato Grosso do Sul, Brasil (Foram analisados 233 registros de peso provenientes de 47.459 animais). Os parâmetros genéticos foram determinados por meio de regressão aleatória, utilizando polinômios ortogonais de Legendre de ordem cúbica, a idade a pesagem foi considerada no modelo como efeito fixo para modelar a trajetória média de crescimento. Nos modelos, os efeitos de grupo de contemporâneos foram considerados como fixos e, como covariáveis, a idade do animal (efeitos linear e quadrático), sendo construídas oito classes etárias. Todos os modelos incluíram os efeitos genético aditivo direto, genético materno e de ambiente permanente direto como aleatórios, e o modelo mais apropriado para descrever os efeitos estudados foi definido de acordo com os critérios AIC e BIC.As estimativas de herdabilidade para peso ao nascimento foram diferentes nas duas regiões produtoras, Campo Grande-Dourados (R1), e Alto Taquari-Bolsão (R2), R1 (0,36 ± 0,02) e R2 (0,28 ± 0,03), e para as idades avançadas ocorreram variações nas estimativas. Em ambas as regiões, os maiores valores de herdabilidade foram aos 650 dias de idade, 0,47 ± 0,03 e 0,65 ± 0,02, respectivamente para R1 e R2, sendo a alta...(AU)

MODELOS DE REGRESSÃO ALEATÓRIA PARA CARACTERÍSTICA DE CRESCIMENTO EM BOVINOS DA RAÇA GUZERÁ

Abstract The aim of this study was to estimate (co)variance components and genetic parameters from birth to yearling weight (550 days of age) in Guzerá cattle, using random regression models. Data set from animals (male and female) born between 1993 and 2011 belonging to ten farms in seven Brazilian States were used. The best-fit model considering direct and maternal genetic effect and permanent environmental animal effect were adjusted by fourth, third, and second order, respectively, using orthogonal polynomials of Legendre. The higher estimated values of direct heritability were observed in birth (0.88) and yearling weight (0.70). The genetic correlations were moderate to high magnitude, remaining up even with the increase in the ages gap.

Resumo O objetivo do presente trabalho foi estimar componentes de (co)variâncias e parâmetros genéticos para características de pesos do nascimento ao sobreano (550 dias de idade) para bovinos da raça Guzerá, por meio de modelos de regressão aleatória. Os dados utilizados são de animais (machos e fêmeas) nascidos entre 1993 e 2011 e pertencentes a dez fazendas de sete estados brasileiros. O modelo de melhor ajuste considerou os efeitos genéticos aditivos diretos e maternos e os de ambiente permanente do animal ajustado usando polinômios ortogonais de Legendre de quarta, terceira e segunda ordem, respectivamente. As maiores estimativas de herdabilidade diretas foram observadas para os pesos ao nascimento (0,88) e ao sobreano (0,70). As correlações genéticas foram de moderada a alta magnitude, mantendo-se elevada mesmo com o aumento da distância entre as idades.

Random regression models for growth trait in Guzera cattle / Modelos de regressão aleatória para característica de crescimento em bovinos da raça Guzerá

The aim of this study was to estimate (co)variance components and genetic parameters from birth to yearling weight (550 days of age) in Guzerá cattle, using random regression models. Data set from animals (male and female) born between 1993 and 2011 belonging to ten farms in seven Brazilian States were used. The best-fit model considering direct and maternal genetic effect and permanent environmental animal effect were adjusted by fourth, third, and second order, respectively, using orthogonal polynomials of Legendre. The higher estimated values of direct heritability were observed in birth (0.88) and yearling weight (0.70). The genetic correlations were moderate to high magnitude, remaining up even with the increase in the ages gap.

O objetivo do presente trabalho foi estimar componentes de (co)variâncias e parâmetros genéticos para características de pesos do nascimento ao sobreano (550 dias de idade) para bovinos da raça Guzerá, por meio de modelos de regressão aleatória. Os dados utilizados são de animais (machos e fêmeas) nascidos entre 1993 e 2011 e pertencentes a dez fazendas de sete estados brasileiros. O modelo de melhor ajuste considerou os efeitos genéticos aditivos diretos e maternos e os de ambiente permanente do animal ajustado usando polinômios ortogonais de Legendre de quarta, terceira e segunda ordem, respectivamente. As maiores estimativas de herdabilidade diretas foram observadas para os pesos ao nascimento (0,88) e ao sobreano (0,70). As correlações genéticas foram de moderada a alta magnitude, mantendo-se elevada mesmo com o aumento da distância entre as idades.

Random regression models for growth trait in Guzera cattle / Modelos de regressão aleatória para característica de crescimento em bovinos da raça Guzerá

The aim of this study was to estimate (co)variance components and genetic parameters from birth to yearling weight (550 days of age) in Guzerá cattle, using random regression models. Data set from animals (male and female) born between 1993 and 2011 belonging to ten farms in seven Brazilian States were used. The best-fit model considering direct and maternal genetic effect and permanent environmental animal effect were adjusted by fourth, third, and second order, respectively, using orthogonal polynomials of Legendre. The higher estimated values of direct heritability were observed in birth (0.88) and yearling weight (0.70). The genetic correlations were moderate to high magnitude, remaining up even with the increase in the ages gap.(AU)

O objetivo do presente trabalho foi estimar componentes de (co)variâncias e parâmetros genéticos para características de pesos do nascimento ao sobreano (550 dias de idade) para bovinos da raça Guzerá, por meio de modelos de regressão aleatória. Os dados utilizados são de animais (machos e fêmeas) nascidos entre 1993 e 2011 e pertencentes a dez fazendas de sete estados brasileiros. O modelo de melhor ajuste considerou os efeitos genéticos aditivos diretos e maternos e os de ambiente permanente do animal ajustado usando polinômios ortogonais de Legendre de quarta, terceira e segunda ordem, respectivamente. As maiores estimativas de herdabilidade diretas foram observadas para os pesos ao nascimento (0,88) e ao sobreano (0,70). As correlações genéticas foram de moderada a alta magnitude, mantendo-se elevada mesmo com o aumento da distância entre as idades.(AU)

Weight evaluation of Tabapuã cattle raised in northeastern Brazil using random-regression models / Avaliação do peso de bovinos Tabapuã criados no Nordeste do Brasil utilizando-se modelos de regressão aleatória

The objective of this study is to compare random-regression models used to describe changes in evaluation parameters for growth in Tabapuã bovine raised in the Northeast of Brazilian. The M4532-5 random-regression model was found to be best for estimating the variation and heritability of growth characteristics in the animals evaluated. Estimates of direct additive genetic variance increased with age, while the maternal additive genetic variance demonstrated growth from birth to up to nearly 420 days of age. The genetic correlations between the first four characteristics were positive with moderate to large ranges. The greatest genetic correlation was observed between birth weight and at 240 days of age (0.82). The phenotypic correlation between birth weight and other characteristics was low. The M4532-5 random-regression model with 39 parameters was found to be best for describing the growth curve of the animals evaluated providing improved selection for heavier animals when performed after weaning. The interpretation of genetic parameters to predict the growth curve of cattle may allow the selection of animals to accelerate slaughter procedures.

Objetivou-se com esta pesquisa comparar diferentes modelos de regressão aleatória e determinar o mais adequado para descrever mudanças nos parâmetros de avaliação do crescimento de bovinos da raça Tabapuã criados no Nordeste brasileiro. O modelo de regressão aleatória M4532-5 foi definido como sendo o de melhor ajuste para descrição das estimativas de variância e herdabilidades das características de crescimento dos animais avaliados. As estimativas de variância genética aditiva direta aumentaram em função da idade, já as de variância genética aditiva materna mostraram crescimento do nascimento até próximo aos 420 dias. As correlações genéticas entre as quatro primeiras características foram positivas e de magnitudes moderada a alta. A maior correlação genética foi observada entre o peso ao nascer e aos 240 dias (0,82). A correlação fenotípica entre peso ao nascimento e demais características foi baixa. O modelo de regressão aleatória M4532-5 com 39 parâmetros apresentou-se como aquele de melhor ajuste para descrever a curva de crescimento dos animais avaliados. Resposta à seleção para obtenção de animais mais pesados será eficiente quando realizada em idades posteriores ao desmame. Ao se avaliar a curva de crescimento de bovinos por meio da interpretação dos parâmetros genéticos estimados, é possível selecionar animais com maior precocidade de abate.

Weight evaluation of Tabapuã cattle raised in northeastern Brazil using random-regression models / Avaliação do peso de bovinos Tabapuã criados no Nordeste do Brasil utilizando-se modelos de regressão aleatória

The objective of this study is to compare random-regression models used to describe changes in evaluation parameters for growth in Tabapuã bovine raised in the Northeast of Brazilian. The M4532-5 random-regression model was found to be best for estimating the variation and heritability of growth characteristics in the animals evaluated. Estimates of direct additive genetic variance increased with age, while the maternal additive genetic variance demonstrated growth from birth to up to nearly 420 days of age. The genetic correlations between the first four characteristics were positive with moderate to large ranges. The greatest genetic correlation was observed between birth weight and at 240 days of age (0.82). The phenotypic correlation between birth weight and other characteristics was low. The M4532-5 random-regression model with 39 parameters was found to be best for describing the growth curve of the animals evaluated providing improved selection for heavier animals when performed after weaning. The interpretation of genetic parameters to predict the growth curve of cattle may allow the selection of animals to accelerate slaughter procedures.(AU)

Objetivou-se com esta pesquisa comparar diferentes modelos de regressão aleatória e determinar o mais adequado para descrever mudanças nos parâmetros de avaliação do crescimento de bovinos da raça Tabapuã criados no Nordeste brasileiro. O modelo de regressão aleatória M4532-5 foi definido como sendo o de melhor ajuste para descrição das estimativas de variância e herdabilidades das características de crescimento dos animais avaliados. As estimativas de variância genética aditiva direta aumentaram em função da idade, já as de variância genética aditiva materna mostraram crescimento do nascimento até próximo aos 420 dias. As correlações genéticas entre as quatro primeiras características foram positivas e de magnitudes moderada a alta. A maior correlação genética foi observada entre o peso ao nascer e aos 240 dias (0,82). A correlação fenotípica entre peso ao nascimento e demais características foi baixa. O modelo de regressão aleatória M4532-5 com 39 parâmetros apresentou-se como aquele de melhor ajuste para descrever a curva de crescimento dos animais avaliados. Resposta à seleção para obtenção de animais mais pesados será eficiente quando realizada em idades posteriores ao desmame. Ao se avaliar a curva de crescimento de bovinos por meio da interpretação dos parâmetros genéticos estimados, é possível selecionar animais com maior precocidade de abate.(AU)

Random regression models using different functions to estimate genetic parameters for milk production in Holstein Friesians / Modelos de regressão aleatória usando diferentes funções para estimar parâmetros genéticos para produção de leite na raça Holandesa

The objective of this study was to compare the functions of Wilmink and Ali and Schaeffer with Legendre polynomials in random regression models using heterogeneous residual variances for modeling genetic parameters during the first lactation in the Holstein Friesian breed. Five thousand eight hundred and eighty biweekly records of test-day milk production were used. The models included the fixed effects of group of contemporaries and cow age at calving as covariable. Statistical criteria indicated that the WF.33_HE2, LEG.33_HE2, and LEG.55_HE4 functions best described the changes in the variances that occur throughout lactation. Heritability estimates using WF.33_HE2 and LEG.33_HE2 models were similar, ranging from 0.31 to 0.50. The LEG.55_HE4 model diverged from these models, with higher estimates at the beginning of lactation and lower estimates after the 16th fortnight. The LEG55_HE4, among the three better models indicated by the index, is the one with highest number of parameters (14 vs 34) and resulted in lower estimation of residual variance at the beginning and at the end of lactation, but overestimated heritability in the first fortnight and presented a greater difficulty to model genetic and permanent environment correlations among controls. Random regression models that used the Wilmink and Legendre polynomials functions with two residual variance classes appropriately described the genetic variation during lactation of Holstein Friesians reared in Rio Grande do Sul.(AU)

Objetivou-se comparar as funções de Wilmink e Ali e Schaeffer com polinômios de Legendre em modelos de regressão aleatória, utilizando variâncias residuais heterogêneas, para modelar parâmetros genéticos ao longo da primeira lactação na raça Holandesa. Foram utilizados cinco mil oitocentos e oitenta registros quinzenais de produção de leite no dia do controle. Os modelos incluíram os efeitos fixos de grupo de contemporâneos e a idade da vaca ao parto como covariável. Os critérios estatísticos apontaram as funções WF.33_HE2, LEG.33_HE2 e a LEG.55_HE4 como as melhores em descrever as mudanças nas variâncias que ocorrem ao longo da lactação. As herdabilidades estimadas pelos modelos WF.33_HE2 e LEG.33_HE2 foram semelhantes, variando de 0,31 a 0,50. O LEG.55_HE4 divergiu destes, no início da lactação, com estimativas superiores e, a partir da 16ª quinzena, com estimativas inferiores. O LEG55_HE4, entre os três melhores modelos indicados pelo índice, é o mais parametrizado (14 vs 34) e resultou em menores estimativas de variância residual no início e no final da lactação, mas superestimou a herdabilidade na primeira quinzena e apresentou maior dificuldade em modelar as correlações genéticas e de ambiente permanente entre os controles. Os modelos de regressão aleatória que usaram a função de Wilmink e Polinômios de Legendre com duas classes de variâncias residuais descreveram adequadamente a variação genética ao longo da lactação de vacas da raça Holandesa, criadas no Rio Grande do Sul.(AU)

Genetic and genomic evaluation for milk production and fatty acid traits predicted by mid-infrared (MIR) spectroscopy in Holstein dairy cattle.

A espectroscopia de infravermelho médio (MIR) é a principal ferramenta atualmente usada para acesso à dados rápidos, econômicos e de alto rendimento da composição do leite. Na última década, o perfil de ácidos graxos (FA) no leite foi predito pela MIR, permitindo a coleta de dados de qualidade do leite em nível populacional. O interesse no perfil de FA tem aumentado devido ao seu valor nutricional, propriedades tecnológicas e seu uso como biomarcador do estado da vaca. A disponibilidade desses fenótipos possibilita sua inclusão em avaliações genômicas, o que traz impactos inéditos e substanciais para a melhoria da qualidade do leite. Portanto, o objetivo geral desta tese foi realizar avaliações genéticas e genômicas para as características de produção do leite e de FA preditas via MIR usando modelo de regressão aleatória (RRM) em bovinos leiteiros. Primeiramente, foram investigadas diferentes ordens de polinômios de Legendre para modelagem de efeitos aleatórios em vacas de primeira lactação. Os polinômios de ordem três parecem ser mais parcimoniosos e suficientes para descrever as características de produção de leite e de FA ao longo dos dias em lactação. Correlações de Spearman mais baixas no início da lactação sugerem que o uso do melhor modelo parece ainda ser mais importante no caso de seleção neste período. Além disso, as melhores ordens de ajuste tendem a apresentar menor variação residual, o que pode ajudar a evitar superestimação no início da lactação. Os efeitos de ambiente permanente e de rebanho-ano de parto tiveram um alto impacto no início da lactação. As curvas de herdabilidade indicaram que à medida que a lactação progredia a proporção da variância genética aumentava para todas as características. Em uma segunda etapa, foram investigadas as potenciais implicações da seleção para as características de produção de leite sobre FA ao longo da primeira lactação por meio de RRMs bicaracterístico usando pedigree e informações genômicas. A hipótese em questão é de que a seleção para maior produção de leite diminuiria os ácidos graxos. O perfil de FA pode ser melhorado por meio de seleção indireta para produção de gordura e teores de gordura e proteína. Posteriormente, predições genômicas usando melhor predição linear não-viesada genômica em passo único (ssGBLUP) foram feitas por meio de RRM. Foi investigado o desempenho da predição genômica (em termos de confiabilidade e viés) usando abordagem ssGBLUP o qual foi comparado com a média dos pais tradicional (PA). Foram testados diferentes fatores de escala e ponderação na construção da matriz H. O ssGBLUP baseado em RRMs aumentou a confiabilidade de validação comparado ao método PA para touros jovens, mesmo quando não foi usado nenhum fator de escala e ponderação na matriz H. Além disso, a escolha de parâmetros ótimos resultou em menor viés de predição (coeficiente de regressão próximo de 1) na avaliação genômica de características de produção de leite. Todavia, GEBVs inflados ainda foram observados para os FA do leite. Os achados descritos nesta tese contribuirão para avanços na modelagem das características de produção de leite e FA em vacas Holstein da região da Valônia, sul da Bélgica, por meio da inclusão de informações genômicas. Os resultados desta pesquisa sugerem que mudanças no perfil de FA do leite podem ser alcançadas pela seleção direta ou indireta para produção e teor de gordura. Além disso, esta tese fornece os primeiros resultados sobre o impacto de diferentes métodos ssGBLUP (ou seja, diferentes fatores de escala e ponderação) baseados em RRM na predição genômica de FA do leite. Em resumo, nossos resultados demonstraram a superioridade do método ssGBLUP usando RRM na predição genômica de FA do leite e dão suporte a futuros estudos para melhorar a confiabilidade e reduzir o viés para os FA do leite.

Mid-infrared (MIR) spectroscopy is the current main tool that has been used to get access of rapid, cost-effective, and high-throughput data of milk composition. Over the last decade, milk fatty acids (FA) have been predicted by MIR, allowing to record milk quality data at the population level. Interest in milk FA profile has increasing given its nutritional value, technological properties, and its use as biomarker of the cows status. The availability of these phenotypes makes possible their inclusion in genomic evaluations, which brings unprecedent and substantial impacts to improve milk quality. Therefore, the general objective of this thesis was to perform genetic and genomic evaluations for milk production and FA traits predicted by MIR using random regression models (RRM) in dairy cattle. Firstly, it was investigated different Legendre polynomials orders to better modeling of random effects in first lactation cows. Third-order Legendre polynomials seem to be most parsimonious and sufficient to describe milk production and FA traits over days in milk. Lower Spearman correlations at the beginning of lactation suggest the optimal model appeared to be even more important in the case of selection in this period. In addition, optimal polynomial orders tend to show lower residual variation, which can help to avoid overestimation at beginning of lactation. The effects of permanent environment and herd-year of calving had a high impact on early lactation. Heritability curves indicated that as long as lactation progressed the proportion of genetic variance increased for all traits. In a second step, it was investigated the potential implications of selection for milk production traits about FA across the first lactation through bi-trait RRMs using pedigree and genomic information. Selection for higher milk yield would decrease FA. Improving the milk FA profile would seem to be an effective way by indirect selection of fat yield, fat and protein content. Subsequently, genomic predictions using the single-step genomic best linear unbiased prediction (ssGBLUP) approach were performed based on RRM. It was investigated the performance of genomic predictions (in terms of reliability and bias) using ssGBLUP approach and it was compared with the parent average (PA) method. Moreover, different scaling and weighting factors to be used in the construction of the H matrix were tested. The test-day ssGBLUP approach yielded higher validation reliability compared to PA method for young bulls, even when no scaling and weighting factors were used in the H matrix. In addition, choosing optimal parameters led to less biased prediction (regression coefficient close to 1) for genomic evaluation of milk production traits. Nonetheless, inflated GEBVs were still observed for milk FA. The findings reported in this thesis will contribute to advance on the modeling of milk production and milk FA traits in Walloon Holstein dairy cattle by inclusion of genomic information. Results from this research suggest that changes in milk FA profile can be achieved by the direct selection or indirect by selecting for fat yield and fat content. Moreover, this thesis provides the first results about the impact of different ssGBLUP methods (i.e., different scaling and weighting factors) based on RRM for genomic prediction of milk FA. In summary, our results demonstrated the superiority of ssGBLUP approach based on RRM in prediction performance of milk FA and supports further studies in order to improve reliabilities and reduce bias for milk FA.

Modelos de regressão aleatória para características de crescimento de bovinos da raça Nelore do estado de Mato Grosso / Random regression models to traits of growth in the Nellore breed in Mato Grosso state

Foram utilizados 138.976 registros de informações de pesos corporais variando de 60 a 610 dias de idade, provenientes de 27.327 animais da raça Nelore, oriundos de rebanhos do estado do Mato Grosso, com o objetivo de descrever a variabilidade genética e estimar parâmetros genéticos para o peso corporal em diferentes idades, utilizando-se modelos de regressão aleatória. O modelo empregado incluiu efeitos fixos de grupo de contemporâneos e idade da vaca ao parto como covariáveis, além de efeitos aleatórios genético aditivo direto, genético materno, ambiente permanente de animal, ambiente permanente materno e efeito de ambiente temporário. O modelo de regressão aleatória mais adequado foi o que empregou função de covariância com polinômios de quarta ordem para descrição da variabilidade de todos os efeitos e duas classes de variância residual. As estimativas de variância genética aditiva direta e de ambiente permanente de animal aumentaram com a idade dos animais. As variâncias genética materna e de ambiente permanente materno exibiram comportamento semelhante, com maiores valores na fase de aleitamento. Os coeficientes de herdabilidade estimados variam de 0,25 a 0,43, com maiores valores nas idades mais avançadas na trajetória de crescimento dos animais. Esses resultados indicaram presença de variabilidade genética suficiente para obtenção de ganho genético expressivo por meio da seleção, principalmente após desmama. Os resultados encontrados para a correlação genética aditiva direta exibiram baixas correlações entre pesos nas idades iniciais e finais, porém pesos altamente correlacionados entre idades mais próximas. As correlações genéticas estimadas entre os pesos da desmama com os pesos até 610 dias de idade foram altas e positivas e indicam que os genes responsáveis por maiores pesos nesse período, em sua maioria, são os mesmos.(AU)

In this study 138,976 records of live weight between 60 to 610 days of age, from 27,327 Nellore cattle breed, from herds in Mato Grosso State were used in order to describe the genetic variability and to estimate genetic parameters for the live weight at different ages, using random regression models. The model included the fixed effects of contemporary group and age of cow at calving as covariate, random effects of direct additive genetic, maternal genetic, animal and maternal permanent environmental and temporary environment effect. The most appropriate random regression model employed the covariance function with fourth order polynomials to describe the variability of all effects and two residual variance classes. Estimates of direct additive genetic variance and animal permanent environment increased with the age of the animals. Maternal genetic variances and maternal permanent environment exhibited similar behavior, with higher values in pre weaning. The estimated heritability coefficients ranged from 0.25 to 0.43, with higher values at older ages in the growth trajectory of the animals. These results showed the presence of sufficient genetic variability to obtain significant genetic gain through selection, especially after weaning. The results for the direct additive genetic correlation exhibited low correlations between weights in initial and final ages, however, highly correlated weights between nearest ages. Genetic correlation estimates between weaning with weights up to 610 days of age were high and positive and indicate that most of the genes responsible for higher weights in this period are the same.(AU)

Cluster analysis of breeding values for milk yield and lactation persistency in Guzerá cattle / Análises de agrupamento dos valores genéticos para produção de leite e persistência da lactação em bovinos da raça Guzerá

The aim of this study was to explore the pattern of genetic lactation curves of Guzerá cattle using cluster analysis. Test-day milk yields of 5,274 first-lactation Guzerá cows were recorded in a progeny test. A total of 34,193 monthly records were analyzed with a random regression animal model using Legendre polynomials to fit additive genetic and permanent environmental random effects and mean trends. Hierarchical and non-hierarchical cluster analyses were performed based on the EBVs for monthly test-day milk yield, peak yield, lactation persistency, and partial cumulative and 305-day yields. The heritability estimates for test-day milk yields ranged from 0.24 to 0.52. Cluster analysis identified animals in the population that belong to different groups according to milk production level and lactation persistency.(AU)

Objetivou-se neste estudo explorar o padrão das curvas de lactação genéticas de bovinos da raça Guzerá, empregando análises de agrupamento. Os 34.193 registros mensais de produção de leite foram provenientes de 5.274 vacas da raça Guzerá, participantes do teste de progênie. As análises foram realizadas com um modelo de regressão aleatória com polinômios de Legendre, composto pelos efeitos aleatórios genético aditivo, de ambiente permanente e o residual, e a curva média de lactação da população. Análise de agrupamento hierárquico e não hierárquico foram realizados com base nos VG para a produção acumulada até os 305 dias, pico e persistência da lactação, e períodos parciais da lactação. As estimativas de herdabilidade para produção de leite no dia do controle variaram entre 0,24 a 0,52. A análise de agrupamento identificou os animais da população que pertencem a diferentes grupos de acordo com o nível de produção de leite e persistência da lactação.(AU)

Reaction norms in weights at 365 days old in nellore bulls in northern Brazil / Norma de reação para pesos aos 365 dias de idade em bovinos Nelore do Brasil

Genotype by environment interaction (GxE) studies are of particular interest in Brazil because of the regional diversity of environmental effects and the wide variety of management systems. The present study evaluates GxE effects on 365 d weight (365W) of Nellore cattle raised on pasture in northern Brazil. The analysis utilized random regression techniques to model the reaction norm. Fixed effects consisted of sex, contemporary group, and the covariate of age of cow at calving. The environmental gradient, defined by the concatenation of a bull and the state in which the calf was born, was modeled by second order Legendre polynomials. Direct additive genetic and residual effects were fit as random. Results showed differences in the magnitude of expression of genotype in proportion to decreasing favorability of the environment. As the environment became more unfavorable, the correlation of breeding value to different environments decreased. The correlations between the intercept and the level slope for 365W feature were of moderate magnitude, predominantly indicating the reclassification of sires in different environments. Reaction standard model was coherent from a technical and biological view point and enabled the perception of GxE in the genetic evaluation of Nellore cattle in the states of Maranhão, Pará and Tocantins.(AU) 

No Brasil, estudos de interações genótipo x ambiente tem atraído cada vez mais atenção em programas de melhoramento devido à variedade de sistemas de produção e à diversidade ambiental. Objetivou-se avaliar o efeito da interação genótipo x ambiente sobre o peso ajustado aos 365 dias de idade de bovinos da raça Nelore criados a pasto na região norte do Brasil. As análises foram realizadas utilizando-se regressão aleatória para modelar a norma de reação. Foi considerado como efeitos fixos o sexo, os grupos de contemporâneos e como covariável a idade da vaca ao parto. A gradiente ambiental, foi definida pela concatenação entre o touro e a respectiva unidade federativa de nascimento do animal, foi modelada por meio de polinômios de Legendre de segunda ordem. Como efeito aleatório, foram considerados os efeitos genéticos aditivos diretos e residuais. Os resultados demonstraram diferenças na magnitude da expressão de seu genótipo à proporção que o ambiente tornava-se desfavorável. Ou seja, à proporção que o ambiente torna-se desfavorável, menores seriam as correlações dos valores genéticos nos diferentes ambientes. As correlações entre o intercepto e o nível de inclinação da reta para a característica P365 foram de magnitude moderada, indicando predominantemente reclassificação dos valores genéticos dos animais nos diferentes ambientes. O modelo de norma de reação foi coerente doponto técnico e biológico de visualizar na avaliação genética da população Nelore criada nos Estados do Maranhão, Pará e Tocantins, a interação genótipo ambiente.(AU)

Reaction norms in weights at 365 days old in nellore bulls in northern Brazil / Norma de reação para pesos aos 365 dias de idade em bovinos Nelore do Brasil

Genotype by environment interaction (GxE) studies are of particular interest in Brazil because of the regional diversity of environmental effects and the wide variety of management systems. The present study evaluates GxE effects on 365 d weight (365W) of Nellore cattle raised on pasture in northern Brazil. The analysis utilized random regression techniques to model the reaction norm. Fixed effects consisted of sex, contemporary group, and the covariate of age of cow at calving. The environmental gradient, defined by the concatenation of a bull and the state in which the calf was born, was modeled by second order Legendre polynomials. Direct additive genetic and residual effects were fit as random. Results showed differences in the magnitude of expression of genotype in proportion to decreasing favorability of the environment. As the environment became more unfavorable, the correlation of breeding value to different environments decreased. The correlations between the intercept and the level slope for 365W feature were of moderate magnitude, predominantly indicating the reclassification of sires in different environments. Reaction standard model was coherent from a technical and biological view point and enabled the perception of GxE in the genetic evaluation of Nellore cattle in the states of Maranhão, Pará and Tocantins.

No Brasil, estudos de interações genótipo x ambiente tem atraído cada vez mais atenção em programas de melhoramento devido à variedade de sistemas de produção e à diversidade ambiental. Objetivou-se avaliar o efeito da interação genótipo x ambiente sobre o peso ajustado aos 365 dias de idade de bovinos da raça Nelore criados a pasto na região norte do Brasil. As análises foram realizadas utilizando-se regressão aleatória para modelar a norma de reação. Foi considerado como efeitos fixos o sexo, os grupos de contemporâneos e como covariável a idade da vaca ao parto. A gradiente ambiental, foi definida pela concatenação entre o touro e a respectiva unidade federativa de nascimento do animal, foi modelada por meio de polinômios de Legendre de segunda ordem. Como efeito aleatório, foram considerados os efeitos genéticos aditivos diretos e residuais. Os resultados demonstraram diferenças na magnitude da expressão de seu genótipo à proporção que o ambiente tornava-se desfavorável. Ou seja, à proporção que o ambiente torna-se desfavorável, menores seriam as correlações dos valores genéticos nos diferentes ambientes. As correlações entre o intercepto e o nível de inclinação da reta para a característica P365 foram de magnitude moderada, indicando predominantemente reclassificação dos valores genéticos dos animais nos diferentes ambientes. O modelo de norma de reação foi coerente doponto técnico e biológico de visualizar na avaliação genética da população Nelore criada nos Estados do Maranhão, Pará e Tocantins, a interação genótipo ambiente.

Effect of age of dam on weight of calf in the genetic assessment of Zebu cattle in random regression models / Efeito da idade da vaca à pesagem da progênie na avaliação genética de bovinos Guzerá em modelos de regressão aleatória

Current analysis estimated co-variance components and genetic parameters for growth traits by random regression models taking into consideration the cows age on the weight of calves. Genealogical data and records on weights of male and female Zebu cattle, born between 1993 and 2011, were provided by the National Association of Breeders and Researchers (ANCP). Different models were compared by Akaike and Bayesian criteria. Legendres orthogonal polynomials were used to model the direct and maternal genetic effects of maternal and animal permanent environmental effects. Joint modeling of cow age at the moment their progenies were weighed resulted in more accurate estimates of co-variance components and genetics parameters. Co-variance functions of the cow age retrieved the dam effect on real performance of the progenies, reduced biases, improved parameter estimates and predicted breeding rates.(AU)

Objetivou-se com o presente trabalho estimar componentes de (co)variância e parâmetros genéticos de características de crescimento por meio de modelos de regressão aleatória considerando a idade da vaca no momento da pesagem de sua respectiva progênie. As informações foram utilizadas de genealogia e registros de pesagem de bovinos machos e fêmeas da raça Guzerá, provenientes da Associação Nacional de Criadores e Pesquisadores (ANCP), nascidos entre 1993 e 2011. Os diferentes modelos foram comparados pelo critério de informação de Akaike e o critério de informação Bayesiano de Schwarz. Utilizaram-se polinômios ortogonais de Legendre para modelar os efeitos genéticos aditivos diretos e maternal, de ambiente permanente do animal e maternal. A modelagem conjunta do efeito da idade do animal e idade da vaca no momento em que suas progênies foram pesadas resultou em estimativas de componentes de (co)variâncias e parâmetros genéticos mais precisos. A função de (co)variâncias da idade da vaca permitiu capturar o efeito que a idade da vaca apresenta sobre o desempenho fenotípico de sua progênie, reduzindo o viés e auxiliando na estimação de parâmetros e predições de valores genéticos mais confiáveis.(AU)

Effect of age of dam on weight of calf in the genetic assessment of Zebu cattle in random regression models / Efeito da idade da vaca à pesagem da progênie na avaliação genética de bovinos Guzerá em modelos de regressão aleatória

Current analysis estimated co-variance components and genetic parameters for growth traits by random regression models taking into consideration the cows age on the weight of calves. Genealogical data and records on weights of male and female Zebu cattle, born between 1993 and 2011, were provided by the National Association of Breeders and Researchers (ANCP). Different models were compared by Akaike and Bayesian criteria. Legendres orthogonal polynomials were used to model the direct and maternal genetic effects of maternal and animal permanent environmental effects. Joint modeling of cow age at the moment their progenies were weighed resulted in more accurate estimates of co-variance components and genetics parameters. Co-variance functions of the cow age retrieved the dam effect on real performance of the progenies, reduced biases, improved parameter estimates and predicted breeding rates.

Objetivou-se com o presente trabalho estimar componentes de (co)variância e parâmetros genéticos de características de crescimento por meio de modelos de regressão aleatória considerando a idade da vaca no momento da pesagem de sua respectiva progênie. As informações foram utilizadas de genealogia e registros de pesagem de bovinos machos e fêmeas da raça Guzerá, provenientes da Associação Nacional de Criadores e Pesquisadores (ANCP), nascidos entre 1993 e 2011. Os diferentes modelos foram comparados pelo critério de informação de Akaike e o critério de informação Bayesiano de Schwarz. Utilizaram-se polinômios ortogonais de Legendre para modelar os efeitos genéticos aditivos diretos e maternal, de ambiente permanente do animal e maternal. A modelagem conjunta do efeito da idade do animal e idade da vaca no momento em que suas progênies foram pesadas resultou em estimativas de componentes de (co)variâncias e parâmetros genéticos mais precisos. A função de (co)variâncias da idade da vaca permitiu capturar o efeito que a idade da vaca apresenta sobre o desempenho fenotípico de sua progênie, reduzindo o viés e auxiliando na estimação de parâmetros e predições de valores genéticos mais confiáveis.

AVALIAÇÃO GENÉTICA DE POEDEIRAS UTILIZANDO MODELOS DE REGRESSÃO ALEATÓRIA

O objetivo neste trabalho foi comparar modelos de regressão aleatória, com diferentes ordens de ajuste do polinômio de Legendre e testar diferentes estruturas do arquivo de dados na avaliação genética dos animais de uma linhagem da raça Rhode Island Red. Os registros foram provenientes do Centro Nacional de Pesquisa em Aves e Suínos da Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (CNPSA/EMBRAPA). Foram avaliados registros de produção mensal de 4.211 matrizes, da 22ª até a 61ª semana de vida da ave. Para modelar a trajetória da produção de ovos foram utilizados modelos de regressão aleatória, que diferiram na ordem de ajuste dos polinômios de Legendre para os efeitos aleatórios. Adicionalmente, a partir de uma estrutura completa, também foram avaliados seis subarquivos, com diferentes estruturas e quantidades de informações, como segue: estrutura 1 meses ímpares; estrutura 2 meses pares; estrutura 3 e 4 formadas pelos meses que melhor descreveram a curva de produção de ovos (início, pico e persistência); e estruturas 5 e 6 determinadas por análise de componentes principais, os quais foram selecionados os meses de produção responsáveis por explicar a maior parte da variação genética dos dados. Os critérios estatísticos utilizados para a escolha do modelo e estrutura foram: Informação de Akaike (AIC), Informação Bayesiano de Schwarz (BIC), Logaritmo da Função de Máxima Verossimilhança (LMV), resíduo, confiabilidade e correlações de posição de Spearman. O modelo PL24, com estimativas boas de herdabilidade (0,04 a 0,22) e correlação genética (0,28 a 0,99) foi o modelo que promoveu melhor ajuste para a produção de ovos das aves em estudo. A estrutura quatro (que considerou os meses 2, 3, 4, 5 e 10), apresentou maior confiabilidade com a estrutura completa, indicando que é possível reduzir os dados e fazer uma boa avaliação genética das aves poedeiras de uma linhagem da raça Rhode Island Red.

The objective of this work was to compare random regression models with different orders of adjustment of the Legendre polynomial and to test different structures of the data file in the genetic evaluation of the animals of the Rhode Island Red lineage breed. The records came from the Centro Nacional de Pesquisa de Suínos e Aves of the Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (CNPSA/EMBRAPA). Monthly production records of 4,211 matrices were evaluated, from the 22nd to the 61st weeks of bird life. To model the trajectory of egg production, random regression models were used, which differed in the order of adjustment of the Legendre polynomials for the random effects. Additionally, from a complete structure, six sub-files were also evaluated, with different structures and amounts of information, as follow: structure 1 - odd months; structure 2 - even months; structures 3 and 4 - formed by the months that best described the egg production curve (beginning, peak and persistence); and structures 5 and 6 - determined by principal components analysis, which were selected the months of production responsible for explaining most of the genetic variation of the data. The statistical criteria used to choose the model and structure were: Akaike Information (AIC), Bayesian Schwarz Information (BIC), Maximum Likelihood Function Logarithm (LMV), residue, reliability and Spearman's rank correlation. The model PL24, with good estimatives of heritability (0.04 to 0.22) and genetic correlation (0.28 to 0.99) was the model that promoted the best fit for the egg production of the birds under study. The structure four (which considered months 2, 3, 4, 5 and 10) presented greater reliability with the complete structure, indicating that it is possible to reduce the data and make a good genetic evaluation of laying hens of Rhode Island Red lineage breed.