Genotypic selection of pre-clultivars of carioca and early carioca beans for the Agreste-Sertão of Pernambuco, Brazil / Seleção genotípica de pré-cultivares de feijão carioca e carioca precoce para o Agreste-Sertão de Pernambuco, Brasil

Genotype x environment interactions represent a major challenge in identifying and selecting genotypes responsive to different climate and soil conditions. This research evaluated and selected pre-cultivars of carioca bean and early carioca bean based on adaptability, stability, and grain yield. In the 2014 crop season, two regional competition trials were conducted in the state of Pernambuco: carioca beans (14 genotypes in Arcoverde, Belém de São Francisco, Caruaru and São João) and early carioca beans (11 genotypes in Araripina, Arcoverde, and Caruaru) and, in the 2015 crop season, with early carioca beans (11 genotypes in Araripina, Arcoverde, and Brejão). Parameters were estimated by mixed models, and the selection was performed using the Harmonic Mean of Relative Performance of Genetic Values (HMRPGV) method following three strategies: i) selection based on predicted genetic value with no interaction; ii) selection according to predicted genetic value considering each location; and iii) simultaneous selection for grain yield, adaptability, and stability. The environments influenced the phenotypic expression of the carioca and early carioca bean genotypes, representing a specific adaptation. The genotypes BRS Notável, BRS Estilo and BRS Pérola, of carioca beans, and CNFC 15875, BRS Notável and CNFC 15630, of early carioca beans, had the best results in the environments tested, regarding, simultaneously, adaptability to different soil and climate conditions, performance stability, and grain yield.

A interação genótipo x ambiente representa um grande desafio na identificação e seleção de genótipos responsivos às diversas condições de clima e solo. O objetivo deste trabalho foi avaliar e selecionar pré-cultivares de feijão carioca e feijão carioca precoce com base na adaptabilidade, estabilidade e produtividade de grãos. Na safra 2014 foram conduzidos dois ensaios regionais de competição no estado de Pernambuco: feijão carioca (14 genótipos em Arcoverde, Belém de São Francisco, Caruaru e São João) e feijão carioca precoce (11 genótipos em Araripina, Arcoverde e Caruaru) e na safra de 2015 com feijão carioca precoce (11 genótipos, em Araripina, Arcoverde e Brejão). Os parâmetros foram estimados por meio de modelos mistos e a seleção foi realizada pelo método da Média Harmônica do Desempenho Relativo dos Valores Genéticos (MHPRVG), adotando-se três estratégias: i) seleção com base no valor genético predito, sem interação; ii) seleção com base no valor genético predito, considerando cada local; iii) seleção simultânea quanto à produtividade de grãos, adaptabilidade e estabilidade. Observou-se que os ambientes influenciaram na expressão fenotípica dos genótipos de feijão carioca e carioca precoce, configurando adaptação específica. Os genótipos BRS Notável, BRS Estilo e BRS Pérola, de feijão carioca, e CNFC 15875, BRS Notável e CNFC 15630, de feijão carioca precoce, apresentaram os melhores desempenhos nos ambientes testados, considerando-se, simultaneamente, a adaptabilidade a diferentes condições edafoclimáticas, estabilidade de desempenho e produtividade de grãos

DGAT and LEP gene polymorphisms and their association with carcass characteristics and the lipid profile of meat from Nellore cattle / Polimorfismo dos genes DGAT e LEP e sua associação com características de carcaça e perfil lipídico da carne de bovinos nelore

The objective of this study was to evaluate the association of polymorphisms in the diacylglycerol acyltransferase (DGAT) and leptin (LEP) genes with the performance, carcass characteristics, meat quality, and lipid profile of Nellore cattle. A total of 100 intact male Nelore cattle were used to analyze the performance, carcass, physicochemical and centesimal composition, and fatty acid profile of beef. To identify the polymorphisms, the PCR­single-strand conformation polymorphism (SSCP) technique was applied to genomic DNA extracted from muscle tissue. The SSCP technique revealed the presence of four band patterns for the DGAT gene (AC, AD, AE and BB) with five alleles (A, B, C, D and E). For the LEP gene, five band patterns (AA, AB, AC, BB and BC) with three alleles (A, B and C) were observed. For the LEP gene, the AB genotype was associated with higher backfat thickness and ribs weight, while the BB genotype was associated with lower ribs yield; higher hindquarter yield was associated with AC and BB genotypes. Higher contents of C17:0, C18:0 and lower contents of C18:2ω6C, total polyunsaturated fatty acids, total ω6 and ratio of polyunsaturated and saturated fatty acids (PUFA/SFA) were verified for the AC genotype of the LEP gene. The AC and AA genotypes of the LEP gene were associated with higher means of C15:0 and C18:1ω9t. For the DGAT gene, the highest C24:0 content was associated with the AE genotype and the lowest with the AD and BB genotypes. Polymorphisms in the DGAT and LEP genes influence carcass parameters and the lipid profile of the meat of Nellore cattle.

Objetivou-se com este estudo avaliar a associação do polimorfismo dos genes da Diacilglicerol Aciltransferase (DGAT) e Leptina ­ (LEP) em relação ao desempenho, características de carcaça, qualidade de carne e perfil lipídico de bovinos Nelore. Para o estudo, foram utilizados um total de 100 bovinos nelores machos inteiros e avaliado os parâmetros de desempenho, composição da carcaça, composição físico-química, centesimal e perfil lipídico da carne. Para identificação dos polimorfismos foi utilizada a técnica de PCR-SSCP a partir da extração do DNA genômico do tecido muscular. A técnica de SSCP revelou a presença de quatro padrões de banda para o gene DGAT (AC, AD, AE e BB) com cinco alelos (A, B, C, D e E) e, para o gene LEP foram verificados cinco padrões de bandas (AA, AB, AC, BB e BC) com três alelos (A, B e C). Para o gene LEP, o genótipo AB foi associado a maior espessura de gordura subcutânea e peso do corte ponta de agulha, enquanto o genótipo BB foi associado a menor rendimento do corte ponta de agulha; maior rendimento do corte traseiro foi associado aos genótipos AC e BB. Maiores teores de C17:0, C18:0 e menores de C18: 2ω6C, total de ácidos graxos poli-insaturados, total de ω6 e a relação de ácidos graxos poli-insaturados e saturados (POL/SAT) foram verificados para o genótipo AC do gene LEP. Os genótipos AC e AA do gene LEP foram associados a maiores médias de C15:0 e C18:1ω9t. Para o gene DGAT, os maiores teores de C24:0 foram associados o genótipo AE e o menores aos genótipos AD e BB. A ocorrência de polimorfismo nos genes DGAT e LEP revelaram influência destes sobre parâmetros de carcaça e perfil lipídico da carne de bovinos Nelore.

Distinct carbapenems susceptibility profiles in isogenic isolates of Klebsiella pneumoniae presenting Ompk36 disruption and expression of down-regulated blaKPC-2 / Perfis distintos de suscetibilidade a carbapenêmicos em isolados isogênicos de Klebsiella pneumoniae apresentando interrupção de Ompk36 e expressão de blaKPC-2 negativamente regulada

The isolation of multidrug-resistant Klebsiella pneumoniae in hospitals is a major public health threat, increasing patient hospitalization costs, morbidity and mortality. Therefore, this work investigated the resistance mechanisms that produced different carbapenems susceptibility profiles in two isogenic strains of K. pneumoniae isolated from the same patient in a public hospital in Recife, Pernambuco. The genes that encode the main porins in K. pneumoniae, ompK35 and ompK36, and several beta-lactamase genes were analyzed. The expression of these genes was evaluated by quantitative real time PCR (polymerase chain reaction) with reverse transcriptase (RT-qPCR). SDS-PAGE (sodium dodecyl sulphate­polyacrylamide gel electrophoresis) was performed to analyze the outer membrane proteins. The analysis of the ompK36 genetic environment disclosed an IS903 insertion sequence disrupting this gene in the ertapenem resistant isolate (KPN133). The blaKPC-2 gene showed down-regulated expression in both isolates. Our findings show that changes in porins, especially OmpK36, are more determinant to carbapenems susceptibility profile of bacterial isolates than variations in blaKPC gene expression.

O isolamento de Klebsiella pneumoniae multirresistente em hospitais é uma grande ameaça à saúde pública, aumentando os custos de internação, morbidade e mortalidade dos pacientes. Portanto, este trabalho investigou os mecanismos de resistência que produziram diferentes perfis de suscetibilidade aos carbapenêmicos em duas cepas isogênicas de K. pneumoniae isoladas do mesmo paciente em um hospital público em Recife, Pernambuco. Foram analisados ​​os genes que codificam as principais porinas em K. pneumoniae, ompK35 e ompK36, e diversos genes de beta-lactamases. A expressão desses genes foi avaliada por PCR (reação em cadeia da polimerase quantitativa em tempo real) com transcriptase reversa (RT-qPCR). SDS-PAGE (dodecil sulfato de sódio-poliacrilamida gel eletroforese) foi realizada para analisar as proteínas da membrana externa. A análise do ambiente genético ompK36 revelou uma sequência de inserção IS903 interrompendo este gene no isolado resistente ao ertapenem (KPN133). O gene blaKPC-2 apresentou expressão negativamente regulada em ambos os isolados. Nossos achados mostram que alterações nas porinas, especialmente OmpK36, são mais determinantes no perfil de suscetibilidade aos carbapenêmicos de isolados bacterianos do que variações na expressão do gene blaKPC.

Revision of some mensural measurements, food preference, and haematological parameters in breeding pairs of blue rock pigeon, Columba livia sampled from punjab Pakistan / Revisão de algumas medidas mensurais, preferência alimentar e parâmetros hematológicos em pares de criação de pombo blue rock (Columba livia), amostragem de punjab, Paquistão

Abstract The present study describes the haematological profile, feeding preference, and comparison of morphometric characters of blue rock pigeon (Columba livia) breeding pairs. For this purpose, 25 pairs (25 samples per sex) were sampled through Mist nets from district Okara and Bahawalnagar, Punjab, Pakistan. Birds were then anaesthetized with a combination of ketamine HCL (10 mg/kg) and diazepam (0.2 mg/kg) and subjected to morphometric measurements. 5µL blood also was taken from the jugular vein of each anaesthetized bird for haematological analysis. Few pairs were also dissected to remove gastrointestinal tracts (GITs) for food preferences. Results revealed that there are no significant differences in the haematological parameters and feeding preference of breeding pairs of Columba livia. The gut analysis further revealed, the major portion of gut contents consisted of pea and corn in most of the pairs. Regarding the mensural measurements, significant differences were recorded in the body weight, length of the longest primary feather, and chest circumference, whereas the rest of the studied parameters remain nonsignificant between sexes. So, it is concluded that apart from 3 morphometric parameters (body weight, length of longest primary feather and chest circumference), both sexes are alike in term of morphometry, haematology and food preference.

Resumo O presente estudo descreve o perfil hematológico, a preferência alimentar e a comparação de caracteres morfométricos de casais reprodutores de pombo-rocha (Columba livia). Para tanto, 25 pares (25 amostras por sexo) foram amostrados por meio de redes de névoa do distrito de Okara e Bahawalnagar, Punjab, Paquistão. As aves foram então anestesiadas com uma combinação de cetamina HCL (10 mg/kg) e diazepam (0,2 mg/kg) e submetidas a medidas morfométricas; 5 µL de sangue também foram retirados da veia jugular de cada ave anestesiada para análise hematológica. Poucos pares também foram dissecados para remover o trato gastrointestinal (GITs) para preferências alimentares. Os resultados revelaram que não há diferenças significativas nos parâmetros hematológicos e na preferência alimentar dos casais reprodutores de Columba livia. A análise intestinal revelou ainda que a maior parte do conteúdo intestinal consistia em ervilha e milho na maioria dos pares. Em relação às medidas mensurais, foram registradas diferenças significativas no peso corporal, comprimento da pena primária mais longa e circunferência torácica, enquanto os demais parâmetros estudados permanecem não significativos entre os sexos. Assim, conclui-se que além de três parâmetros morfométricos (peso corporal, comprimento da pena primária mais longa e circunferência torácica), ambos os sexos são semelhantes em termos de morfometria, hematologia e preferência alimentar.

Comparação de métodos de sexagem em filhotes de serpentes da espécie Python brongersmai / Comparing methods of sex identification in Python brongersmai snakelets

Com a ascensão de animais exóticos no mercado pet, observou-se a necessidade de maiores estudos nesta área. Este estudo teve como objetivo comparar diferentes métodos de sexagem em filhotes de serpentes da espécie Python brongersmai (Bloody Python), sendo utilizados 14 filhotes com aproximadamente 1 ano e 9 meses de vida, oriundos do Criadouro Comercial de Fauna Silvestre e Exótica ­ CCF, autorização de manejo N° 414064, localizado no município de Cornélio Procópio ­ PR. Foi utilizado a introdução da probe metálica de sexagem para contagem de escamas, mensurações do Comprimento Rostro-Cloacal (CRC), Comprimento Pós-Cloacal (CPC), Comprimento Total (CT); avaliação ultrassonográfica dos órgãos reprodutivos e perfil genético (DNA), indicando a fidedignidade de cada um. Observou-se uma eficácia de 100% na determinação do sexo através das amostras de DNA, enquanto a sexagem a partir da contagem de escamas via probe metálica e o dimorfismo sexual por mensurações corporais permitiram apenas uma classificação sexual prévia, sofrendo variações quando comparadas, mostrando-se como métodos inconclusivos. Já a ultrassonografia não foi eficaz para o processo de sexagem em serpentes filhotes de até aproximadamente 1 ano e 9 meses de idade da espécie Python brongersmai.(AU)

With the increment of exotic animal's trade in the pet business, the necessity of more studies in this area was observed. This study aimed at comparing different methods of sex identification in Python brongersmai snakelets (Bloody Python), using 14 baby snakes aged 1 year and 9 months approximately, from commercial breeding of wild and exotic fauna, situated in Cornélio Procópio ­ PR. Methods used were the probing technique introduction, measurement of snout-vent length, post-vent length, total length; ultrasound evaluation of reproductive organs and genetic profile exam (DNA samples), denoting the veracity of each one. A 100% efficacy was observed in the study of sexual determination through DNA samples, while the other methods were shown to be inconclusive, whilst the sexing scale count via the probing technique introduction and sexual dimorphism by bodily measurements permitted only a previous sexual classification, suffering variations when compared, showing to be inconclusive methods. The ultrasound evaluation was not efficient for the sexing process in snakelets aged approximately 1 year and 9 months in Python brongersmai.(AU)

Molecular profiling of bacterial blight resistance in Malaysian rice cultivars / Perfil molecular da resistência à ferrugem bacteriana em cultivares de arroz da Malásia

Bacteria blight is one of the most serious bacterial diseases of rice worldwide. The identification of genetic potential against bacterial blight in the existing rice resources is a prerequisite to develop multigenic resistance to combat the threat of climate change. This investigation was conducted to evaluate alleles variation in 38 Malaysian cultivars using thirteen Simple Sequences Repeats markers and one Sequence Tagged Sites (STS) marker which were reported to be linked with the resistance to bacterial blight. Based on molecular data, a dendrogram was constructed which classified the rice cultivars into seven major clusters at 0.0, 0.28 and 0.3 of similarity coefficient. Cluster 5 was the largest group comprised of ten rice cultivars where multiple genes were identified. However, xa13 could not be detected in the current rice germplasm, whereas xa2 was detected in 25 cultivars. Molecular analysis revealed that Malaysian rice cultivars possess multigenic resistance.

A ferrugem bacteriana é uma das doenças bacterianas mais graves do arroz em todo o mundo. A identificação do potencial genético contra a ferrugem bacteriana nos recursos de arroz existentes é um pré-requisito para desenvolver resistência multigênica no combate à ameaça da mudança climática. Esta investigação foi conduzida para avaliar a variação de alelos em 38 cultivares da Malásia usando 13 marcadores Simple Sequences Repeats (SSR) e 1 marcador Sequence Tagged Sites (STS), que foram relatados como associados à resistência à ferrugem bacteriana. Com base em dados moleculares, foi construído um dendrograma que classificou as cultivares de arroz em sete grandes agrupamentos a 0,0, 0,28 e 0,3 de coeficiente de similaridade. O Cluster 5 foi o maior grupo composto por 10 cultivares de arroz, no qual múltiplos genes foram identificados. No entanto, xa13 não pôde ser detectado no germoplasma atual de arroz, enquanto xa2 foi detectado em 25 cultivares. A análise molecular revelou que as cultivares de arroz da Malásia possuem resistência multigênica.

Effect of mineral-energy supplementation on the performance of young bulls from different genetic groups on pasture / Efeito da suplementação energética-mineral no desempenho de tourinhos de diferentes grupos genéticos recriados a pasto

The aim of this study was to evaluate the performance of young bulls from three genetic groups, ½ Brangus x ½ Nellore (BRN), Nellore (NEL) and ½ Canchim x ½ Nellore (CAN), reared on pasture and supplemented with mineral (MS) or energy-mineral (MES) supplement. Eighty-one bulls, with a mean age of 12 months and mean body weight of 252 ± 33 kg were used. The experiment was conducted in a 3x2 factorial completely randomized design. Each genetic group was subdivided into six experimental plots, three received MS and three received MES. Animals were managed in a rotational stocking system in a Tifton 85 grass pasture. The consumption of MS was similar between the genetic groups with an average of 0.073 kg animal-1 day-1, whereas the consumption of MES was higher for BRN, 2.10 kg animal-1 day-1, followed by CAN, with 1.57 kg animal-1 day-1, and lower for NEL, with 1.28 kg animal-1 day-1. The average daily weight gain (ADG) was greater for animals that received MES compared to those that were given MS. For animals that received MS, the BRN group had ADG of 0.64 kg animal-1, while the NEL and CAN groups were similar with a mean of 0.46 kg animal-1. For animals that received MES, the CAN group had higher ADG, 0.97 kg animal-1, while the NEL and BRN groups were similar, with an average of 0.86 kg animal-1. Blood levels of total protein, albumin, creatinine, glucose and cholesterol did not change depending on the types of supplements used or between genetic groups. Higher serum urea levels were observed in NEL and CAN animals that received MS. Serum aspartate aminotransferase levels were higher in BRN and CAN animals that received MES. Gains in rump height, height at the withers, body length, rump width and chest perimeter were greater in animals that received MES. Mostly, the gains in morphometric measurements were greater for crossbred animals than for the NEL group. The supply of mineral-energy supplement in Tifton 85 grass pasture during the rainy season is recommended only for Nellore and ½ Canchim x ½ Nellore young bulls. Crossbred young bulls show greater gains in morphometric measurements than Nellore young bulls during rearing.(AU)

Objetivou-se com este estudo avaliar o desempenho de tourinhos de três grupos genéticos, ½ Brangus x ½ Nelore (BRN), Nelore (NEL) e ½ Canchim x ½ Nelore (CAN), recriados à pasto e suplementados com mineral (SM) ou energético-mineral (SEM). Foram utilizados 81 tourinhos, com idade média de 12 meses e peso corporal médio de 252 ± 33 kg. O experimento foi conduzido em delineamento inteiramente ao acaso em esquema fatorial 3x2. Cada grupo genético foi subdividido em seis parcelas experimentais, em que três delas receberam SM e três receberam SEM. Os animais foram manejados em sistema de lotação rotacionada em pasto de capim Tifton 85. O consumo de SM foi semelhante entre os grupos genéticos com média de 0,073 kg animal-1 dia-1, já o consumo de SEM foi maior para o BRN com 2,10 kg animal-1 dia-1, seguido pelo CAN com 1,57 kg animal-1 dia-1 e menor para o NEL com 1,28 kg animal-1 dia-1. O ganho de peso médio diário (GMD) foi maior para os animais que receberam SEM em relação aos que receberam SM. Para os animais que receberam SM, o grupo BRN apresentou GMD de 0,64 kg animal-1, enquanto os grupos NEL e CAN foram semelhantes com média de 0,46 kg animal-1. Para os animais que receberam SEM o grupo CAN apresentou maior GMD com 0,97 kg animal-1, enquanto os grupos NEL e BRN foram semelhantes com média de 0,86 kg animal-1. Os níveis sanguíneos de proteína total, albumina, creatinina, glicose e colesterol não foram alterados em função dos tipos de suplementos utilizados ou entre os grupos genéticos. Maiores níveis séricos de ureia foram observados nos animais NEL e CAN que receberam SM. Os níveis séricos de aspartato aminotransferase foram maiores em animais BRN e CAN que receberam SEM. Os ganhos de altura de garupa, altura de cernelha, comprimento, largura de garupa, perímetro torácico e largura de peito foram maiores em animais que receberam SEM. Em sua maioria, os ganhos de medidas morfométricas foram maiores para os animais mestiços do que para o NEL. O fornecimento de suplemento energético-mineral em pasto de capim Tifton 85 durante o período das águas é recomendado apenas para tourinhos Nelore e ½ Canchim x ½ Nelore. Tourinhos mestiços apresentam maiores ganhos em medidas morfométricas que tourinhos Nelore durante a recria.(AU)

Estimation of genetic parameters for weaning and yearling weights in a composite population used to form the Purunã breed

We aimed to evaluate the effects of sex and the linear and quadratic components of age of dam at calving, as well as apply a mixed model including maternal effect for the genetic evaluation of weaning (WW) and yearling (YW) weights. The phenotypic database was composed by Charolais, Caracu, Aberdeen Angus, and Canchim purebred and crossbred animals. Single-trait analyses were performed using models that included the maternal effect for WW and YW traits, and a model ignoring this effect on YW (YWNM). The Deviance Information Criterion (DIC), model posterior probabilities (MPP), accuracy of breeding values (ACC), and Spearman's rank correlation were applied to compare the models including and ignoring the maternal effect on YW. Sex and age of dam at calving had significant effects on WW and YW. The direct heritability estimates were 0.21±0.03 and 0.05±0.02, and the maternal heritabilities were 0.11±0.02 and 0.02±0.01 for WW and YW, respectively. The heritabilities estimated for YW may have been influenced by the several genetic groups in the population and by used conventional animal model, which may not have been the better fit model to evaluate YW in this population. The DIC, MPP, and ACC values indicated that YW outperformed the YWNM model, but the rank correlation and percentages of individuals selected in common suggested that the best animals would be selected independently of the model chosen.

Biochemical characterization for determination of genetic distances among different indigenous chickpea (Cicer arietinum L. ) varieties of north-west Pakistan / Caracterização bioquímica para determinação de distâncias genéticas entre diferentes variedades indígenas de grão-de-bico (Cicer arietinum L. ) do noroeste do Paquistão

Genetic distances among different chickpea varieties and evaluation of their free amino acid profiles were determined on the basis of Sodium dodecyle sulphate polyacrylamide gels electrophoresis (SDS-PAGE). Total soluble proteins were resolved on 10% SDS Polyacrylamide gel. Low variability in tested varieties was observed. Dendogram based on electrophoretic data clustered the genotypes into 2 groups. The results showed that the average protein content of all the varieties was 26.01% within the range 22.8% for Thal-2006 to 34.06% Sheenghar-2000 of dry seed weight. On the basis of total protein content Bittal-98, Dasht and Sheen Ghar-2000, Karak-3 and CM-98, Paidar -91 and Fakhr-e-Thal, C-44, Balaksar and KK-1showed similar concentrations for protein contents among each other but showed variation from the rest of the varieties. Different proteins were separated on the basis of changes in their molecular weights by means of Sodium Dodecyl Sulphate Polyacrylamide Gel Electrophoresis (SDS-PAGE). Dasht, CM-98, and Sheen Ghar showed 100% similarity. Balaksar and Fakhr-e- Thal, KK-2 and Chattan and KC-98, KK-1 and Lawaghar were 100% similar among each other but showed variation from the rest of the accessions. The overall dendrogram showed high and low level of variation among the accessions. The concentration of free amino acids varied among the 16 chickpea varieties. A significant difference of both essential and non-essential amino acids was found among the chickpea cultivars. The total concentration of essential amino acid was recorded 40.81 g/100 g protein while non-essential was recorded 59.18343 g/100 g protein in the given cultivars. The highest concentration of essential amino acids was found in C-44 followed by KK-2, KK-1 and Fakhr E Tal while the lowest concentration was recorded in Cm-98, Paidar-91 and Sheen Ghar-2000 respectively. Cultivars TAL-2006, Chattan and Karak-3 showed maximum concentration of both essential and endogenous amino acids. In conclusion; for broadening the genetic pools in breeding programs or to search for exotic characters, for instance new disease resistance alleles, accession with low similarity coefficients (Lawaghar and Battal-98) may be utilized. Furthermore the information acquired from this study could be used to device a proficient breeding approach intended at improving nutritional as well as broadening the genetic base of this essential food crop of Pakistan.(AU)

As distâncias genéticas entre as diferentes variedades de grão-de-bico e a avaliação de seus perfis de aminoácidos livres foram determinadas com base na eletroforese em gel de poliacrilamida com dodecil sulfato de sódio (SDS-PAGE). As proteínas solúveis totais foram resolvidas em SDS-PAGE a 10%. Foi observada baixa variabilidade nas variedades testadas. O dendrograma fundamentado em dados eletroforéticos agrupou os genótipos em dois grupos. Os resultados mostraram que o teor médio de proteínas de todas as variedades foi de 26,01%, na faixa de 22,8% para Thal-2006 a 34,06% para Sheenghar-2000 do peso de sementes secas. Com base no conteúdo total de proteínas, Bittal-98, Dasht, Sheen Ghar-2000, Karak-3, CM-98, Paidar-91, Fakhr-e-Thal, C-44, Balaksar e KK-1 apresentaram concentrações semelhantes para o conteúdo de proteínas entre si, mas tiveram variação quanto ao restante das variedades. Diferentes proteínas foram separadas com base nas alterações de seus pesos moleculares por meio de eletroforese em gel de poliacrilamida com dodecil sulfato de sódio (SDS-PAGE). Dasht, CM-98 e Sheen Ghar mostraram 100% de similaridade. Balaksar, Fakhr-e-Thal, KK-2, Chattan e KC-98, KK-1 e Lawaghar foram 100% semelhantes entre si, mas apresentaram variação em relação ao restante dos acessos. O dendrograma geral mostrou alto e baixo nível de variação entre os acessos. A concentração de aminoácidos livres variou entre as 16 variedades de grão-de-bico. Foi encontrada uma diferença significativa entre os aminoácidos essenciais e não essenciais nas cultivares de grão-de-bico. A concentração total de aminoácidos essenciais foi registrada em 40,81 g / 100 g de proteína, enquanto a não essencial foi registrada em 59,18343 g / 100 g de proteína nas cultivares. A maior concentração de aminoácidos essenciais foi encontrada em C-44, seguida de KK-2, KK-1 e Fakhr-e-Thal, enquanto a menor concentração foi registrada em CM-98, Paidar-91 e Sheen Ghar-2000. As cultivares TAL-2006, Chattan e Karak-3 apresentaram concentração máxima de aminoácidos essenciais e endógenos. Em conclusão, para ampliar os pools genéticos em programas de melhoramento ou procurar caracteres exóticos, por exemplo, novos alelos de resistência a doenças, pode ser utilizada a adesão com baixos coeficientes de similaridade (Lawaghar e Battal-98). Além disso, as informações adquiridas neste estudo poderiam ser usadas para criar uma abordagem de criação eficiente, com o objetivo de melhorar a nutrição e ampliar a base genética dessa cultura alimentar essencial do Paquistão.(AU)

Resizing the productive characteristics of meat-type quail through principal component analysis / Redimensionamento das características produtivas de codornas de corte por meio da análise de componentes principais

This study aimed to establish criteria for eliminating redundant variables, to know the magnitude of the data relationship, and to provide information that helps researchers in the use of the technique to analyze and interpret production data and egg quality. The data used in this work was obtained from four successive generations of the quail lineage developed by the Department of Animal Science of the Federal University of Pelotas. The characteristics were measured from the 42nd day of age, when the egg production period began, until 126 days of production, obtaining three 28 day periods (cycles) in the four successive generations, totaling 545 females. Of the twelve original variables, only seven demonstrated potential to be maintained in future experiments, representing a 42% exclusion. The main philosophy of this study was the analysis of the studied variables and made possible the understanding of the relationship and the correlations.(AU)

O objetivo do presente trabalho foi estabelecer critérios para eliminação de variáveis redundantes, conhecer a magnitude das relações dos dados, além de fornecer informações que auxiliem pesquisadores na utilização da técnica para analisar e interpretar dados de produção e qualidade de ovos de codornas. Os dados utilizados neste trabalho são provenientes de quatro gerações sucessivas da linhagem de codornas de corte desenvolvida pelo Departamento de Zootecnia da Universidade Federal de Pelotas. As características foram mensuradas do 42º dia de idade até o 126º dia de produção, totalizando 545 fêmeas. Das 12 variáveis originais analisadas, apenas sete demonstraram potencial para serem mantidas em experimentos futuros, representando uma exclusão de 42%. A análise de componentes principais foi efetiva para a redução das variáveis estudadas e possibilitou a compreensão da relação e correlação dessas.(au)

Resizing the productive characteristics of meat-type quail through principal component analysis / Redimensionamento das características produtivas de codornas de corte por meio da análise de componentes principais

This study aimed to establish criteria for eliminating redundant variables, to know the magnitude of the data relationship, and to provide information that helps researchers in the use of the technique to analyze and interpret production data and egg quality. The data used in this work was obtained from four successive generations of the quail lineage developed by the Department of Animal Science of the Federal University of Pelotas. The characteristics were measured from the 42nd day of age, when the egg production period began, until 126 days of production, obtaining three 28 day periods (cycles) in the four successive generations, totaling 545 females. Of the twelve original variables, only seven demonstrated potential to be maintained in future experiments, representing a 42% exclusion. The main philosophy of this study was the analysis of the studied variables and made possible the understanding of the relationship and the correlations.(AU)

O objetivo do presente trabalho foi estabelecer critérios para eliminação de variáveis redundantes, conhecer a magnitude das relações dos dados, além de fornecer informações que auxiliem pesquisadores na utilização da técnica para analisar e interpretar dados de produção e qualidade de ovos de codornas. Os dados utilizados neste trabalho são provenientes de quatro gerações sucessivas da linhagem de codornas de corte desenvolvida pelo Departamento de Zootecnia da Universidade Federal de Pelotas. As características foram mensuradas do 42º dia de idade até o 126º dia de produção, totalizando 545 fêmeas. Das 12 variáveis originais analisadas, apenas sete demonstraram potencial para serem mantidas em experimentos futuros, representando uma exclusão de 42%. A análise de componentes principais foi efetiva para a redução das variáveis estudadas e possibilitou a compreensão da relação e correlação dessas.(au)

Random regression models for the evaluation of the growth of goats of the Anglonubian breed / Modelos de regressão aleatória para avaliação do crescimento de caprinos da raça Anglonubiana

A total of 6593 weight records collected from 796 male and female Anglo-Nubian goats aged up to 130 days, offspring from 29 sires and 225 dams, were used to compare models and estimate genetic parameters throughout the growth curve by applying random regression models. Direct and maternal additive genetic effects and direct and maternal permanent environmental effects were included as random in the models. The contemporary groups were included as fixed effects and goat age at kidding was included as a covariable (linear and quadratic). The choice of the best model was based on the AIC, BIC and AICc criteria. Variance estimates of the four random effects increased as the animals aged. Direct heritability (h2) rose from 0.13 to 0.40 with age, whereas maternal heritability showed a low value. Genetic correlations of weight between closer ages were high. The most suitable random regression model to compare the fitting of random effects was that which employed the Legendre polynomials of quadratic order with homogeneous variance (3333-1).(AU)

Utilizaram-se 6593 pesos de 796 caprinos da raça Anglonubiana, coletados em machos e fêmeas com idade até 130 dias, descendentes de 29 reprodutores e 225 matrizes, com o objetivo de se compararem modelos e de se estimarem parâmetros genéticos ao longo da curva de crescimento com aplicação de modelos de regressão aleatória. Nos modelos, incluíram-se os efeitos genéticos aditivos diretos e maternos e os de ambiente permanente diretos e maternos como aleatórios; os grupos de contemporâneos foram incluídos como efeitos fixos, e a idade da cabra ao parto como covariável (linear e quadrática). A escolha do melhor modelo foi realizada pela avaliação dos critérios AIC, BIC e AICc. As estimativas de variâncias dos quatro efeitos aleatórios cresceram de acordo com o aumento da idade. A herdabilidade direta (h2) aumentou de 0,13 a 0,40 com a idade, e a materna apresentou baixo valor. As correlações genéticas do peso entre idades mais próximas foram altas. O modelo de regressão aleatório mais adequado ao se comparar o ajuste dos efeitos aleatórios foi o que empregou polinômios de Legendre de ordem quadrática com variância homogênea (3333-1).(AU)

Random regression models for the evaluation of the growth of goats of the Anglonubian breed / Modelos de regressão aleatória para avaliação do crescimento de caprinos da raça Anglonubiana

A total of 6593 weight records collected from 796 male and female Anglo-Nubian goats aged up to 130 days, offspring from 29 sires and 225 dams, were used to compare models and estimate genetic parameters throughout the growth curve by applying random regression models. Direct and maternal additive genetic effects and direct and maternal permanent environmental effects were included as random in the models. The contemporary groups were included as fixed effects and goat age at kidding was included as a covariable (linear and quadratic). The choice of the best model was based on the AIC, BIC and AICc criteria. Variance estimates of the four random effects increased as the animals aged. Direct heritability (h2) rose from 0.13 to 0.40 with age, whereas maternal heritability showed a low value. Genetic correlations of weight between closer ages were high. The most suitable random regression model to compare the fitting of random effects was that which employed the Legendre polynomials of quadratic order with homogeneous variance (3333-1).(AU)

Utilizaram-se 6593 pesos de 796 caprinos da raça Anglonubiana, coletados em machos e fêmeas com idade até 130 dias, descendentes de 29 reprodutores e 225 matrizes, com o objetivo de se compararem modelos e de se estimarem parâmetros genéticos ao longo da curva de crescimento com aplicação de modelos de regressão aleatória. Nos modelos, incluíram-se os efeitos genéticos aditivos diretos e maternos e os de ambiente permanente diretos e maternos como aleatórios; os grupos de contemporâneos foram incluídos como efeitos fixos, e a idade da cabra ao parto como covariável (linear e quadrática). A escolha do melhor modelo foi realizada pela avaliação dos critérios AIC, BIC e AICc. As estimativas de variâncias dos quatro efeitos aleatórios cresceram de acordo com o aumento da idade. A herdabilidade direta (h2) aumentou de 0,13 a 0,40 com a idade, e a materna apresentou baixo valor. As correlações genéticas do peso entre idades mais próximas foram altas. O modelo de regressão aleatório mais adequado ao se comparar o ajuste dos efeitos aleatórios foi o que empregou polinômios de Legendre de ordem quadrática com variância homogênea (3333-1).(AU)

Quality of meat from Santa Ines sheep with different biotypes and slaughtering weights / Qualidade da carne de ovinos Santa Inês de diferentes biótipos e pesos de abate

The Santa Inês breed is of great importance for the lamb production chain in Brazil. The adaptive and reproductive characteristics of this breed favor its use in future breeding programs for the production of sheep for slaughter in northeastern Brazil. This study evaluated the carcass characteristics, physical parameters, chemical composition and determination of the fatty acid profile of the lambs of the traditional and modern biotypes, slaughtered at 32 kg and 34 kg. Thirty-six Santa Inês lambs were used, with an average age of 180 days and initial weight of 16 kg in a completely randomized design, with a faecal spruce 2x2 (two biotypes and two slaughtering weights). The data were submitted to analysis of variance and averages were compared by the test F α = 0.05 using SAS GLM, (2011) - Statistical Analysis System, version 9.3.Biotypes and slaughter weight did not influence the physical parameters and the fatty acid profile of the meat. Centesimal composition of meat was influenced by treatments, with the larger contents of meat moisture for the traditional biotype slaughtered at 32 kg, and higher content of ash, protein and fat present in the meat for the modern biotype slaughtered at 34 kg. Santa Inês animals that if frame Modern biotype presents potential for meat production with high nutritional value, due to higher protein content, low fat content and satisfactory amount of oleic, palmitic, stearic, linoleic fatty acids, as well as a great relationship between polyunsaturated acids and saturated.(AU)

A raça Santa Inês é de grande importância para a cadeia de produção de cordeiros no Brasil. As características adaptativas e reprodutivas desta raça favorecem seu uso em futuros programas de melhoramento genético para a produção de ovinos para abate, no nordeste do Brasil. Este estudo avaliou características de carcaça, parâmetros físicos, a composição química e determinação do perfil de ácidos graxos da carne de cordeiros dos biótipos Tradicional e Moderno, abatidos com 32 kg e 34 kg. Foram utilizados 36 cordeiros Santa Inês, não-castrados, com idade média de 180 dias e peso inicial de 16 kg em delineamento inteiramente casualisado, com arranjo fatorial 2x2 (dois biotipos e dois pesos de abate). As dados foram submetidos a análise de variância e as médias foram comparadas pelo teste F a α = 0,05 com o uso de GLM do SAS, (2011) - Statistical Analysis System, versão 9.3. Os biótipos e o peso de abate não influenciaram os parâmetros físicos e o perfil dos ácídos graxo da carne. Já a composição centesimal da carne foi influenciada pelos tratamentos, com os maiores teores de umidade na carne para o biótipo tradicional e abatidos aos 32 kg, e maior teor de cinza, proteína e gordura presente na carne para o biótipo moderno abatido aos 34 kg. Os animais da raça Santa Inês que se enquadram no biótipo Moderno apresentam potencial para produção de carne com alto valor nutricional, devido ao maior teor de proteínas, baixo teor de gordura e quantidade satisfatória de ácidos graxos oléico, palmítico, esteárico e linoleico, além de uma ótima relação entre ácidos poliinsaturados e saturados.(AU)

Quality of meat from Santa Ines sheep with different biotypes and slaughtering weights / Qualidade da carne de ovinos Santa Inês de diferentes biótipos e pesos de abate

The Santa Inês breed is of great importance for the lamb production chain in Brazil. The adaptive and reproductive characteristics of this breed favor its use in future breeding programs for the production of sheep for slaughter in northeastern Brazil. This study evaluated the carcass characteristics, physical parameters, chemical composition and determination of the fatty acid profile of the lambs of the traditional and modern biotypes, slaughtered at 32 kg and 34 kg. Thirty-six Santa Inês lambs were used, with an average age of 180 days and initial weight of 16 kg in a completely randomized design, with a faecal spruce 2x2 (two biotypes and two slaughtering weights). The data were submitted to analysis of variance and averages were compared by the test F α = 0.05 using SAS GLM, (2011) - Statistical Analysis System, version 9.3.Biotypes and slaughter weight did not influence the physical parameters and the fatty acid profile of the meat. Centesimal composition of meat was influenced by treatments, with the larger contents of meat moisture for the traditional biotype slaughtered at 32 kg, and higher content of ash, protein and fat present in the meat for the modern biotype slaughtered at 34 kg. Santa Inês animals that if frame Modern biotype presents potential for meat production with high nutritional value, due to higher protein content, low fat content and satisfactory amount of oleic, palmitic, stearic, linoleic fatty acids, as well as a great relationship between polyunsaturated acids and saturated.

A raça Santa Inês é de grande importância para a cadeia de produção de cordeiros no Brasil. As características adaptativas e reprodutivas desta raça favorecem seu uso em futuros programas de melhoramento genético para a produção de ovinos para abate, no nordeste do Brasil. Este estudo avaliou características de carcaça, parâmetros físicos, a composição química e determinação do perfil de ácidos graxos da carne de cordeiros dos biótipos Tradicional e Moderno, abatidos com 32 kg e 34 kg. Foram utilizados 36 cordeiros Santa Inês, não-castrados, com idade média de 180 dias e peso inicial de 16 kg em delineamento inteiramente casualisado, com arranjo fatorial 2x2 (dois biotipos e dois pesos de abate). As dados foram submetidos a análise de variância e as médias foram comparadas pelo teste F a α = 0,05 com o uso de GLM do SAS, (2011) - Statistical Analysis System, versão 9.3. Os biótipos e o peso de abate não influenciaram os parâmetros físicos e o perfil dos ácídos graxo da carne. Já a composição centesimal da carne foi influenciada pelos tratamentos, com os maiores teores de umidade na carne para o biótipo tradicional e abatidos aos 32 kg, e maior teor de cinza, proteína e gordura presente na carne para o biótipo moderno abatido aos 34 kg. Os animais da raça Santa Inês que se enquadram no biótipo Moderno apresentam potencial para produção de carne com alto valor nutricional, devido ao maior teor de proteínas, baixo teor de gordura e quantidade satisfatória de ácidos graxos oléico, palmítico, esteárico e linoleico, além de uma ótima relação entre ácidos poliinsaturados e saturados.

Biochemical characterization for determination of genetic distances among different indigenous chickpea (Cicer arietinum L.) varieties of North-West Pakistan

Abstract Genetic distances among different chickpea varieties and evaluation of their free amino acid profiles were determined on the basis of Sodium dodecyle sulphate polyacrylamide gels electrophoresis (SDS-PAGE). Total soluble proteins were resolved on 10% SDS Polyacrylamide gel. Low variability in tested varieties was observed. Dendogram based on electrophoretic data clustered the genotypes into 2 groups. The results showed that the average protein content of all the varieties was 26.01% within the range 22.8% for Thal-2006 to 34.06% Sheenghar-2000 of dry seed weight. On the basis of total protein content Bittal-98, Dasht and Sheen Ghar-2000, Karak-3 and CM-98, Paidar -91 and Fakhr-e-Thal, C-44, Balaksar and KK-1showed similar concentrations for protein contents among each other but showed variation from the rest of the varieties. Different proteins were separated on the basis of changes in their molecular weights by means of Sodium Dodecyl Sulphate Polyacrylamide Gel Electrophoresis (SDS-PAGE). Dasht, CM-98, and Sheen Ghar showed 100% similarity. Balaksar and Fakhr-e- Thal, KK-2 and Chattan and KC-98, KK-1 and Lawaghar were 100% similar among each other but showed variation from the rest of the accessions. The overall dendrogram showed high and low level of variation among the accessions. The concentration of free amino acids varied among the 16 chickpea varieties. A significant difference of both essential and non-essential amino acids was found among the chickpea cultivars. The total concentration of essential amino acid was recorded 40.81 g/100 g protein while non-essential was recorded 59.18343 g/100 g protein in the given cultivars. The highest concentration of essential amino acids was found in C-44 followed by KK-2, KK-1 and Fakhr E Tal while the lowest concentration was recorded in Cm-98, Paidar-91 and Sheen Ghar-2000 respectively. Cultivars TAL-2006, Chattan and Karak-3 showed maximum concentration of both essential and endogenous amino acids. In conclusion; for broadening the genetic pools in breeding programs or to search for exotic characters, for instance new disease resistance alleles, accession with low similarity coefficients (Lawaghar and Battal-98) may be utilized. Furthermore the information acquired from this study could be used to device a proficient breeding approach intended at improving nutritional as well as broadening the genetic base of this essential food crop of Pakistan.

Resumo As distâncias genéticas entre as diferentes variedades de grão-de-bico e a avaliação de seus perfis de aminoácidos livres foram determinadas com base na eletroforese em gel de poliacrilamida com dodecil sulfato de sódio (SDS-PAGE). As proteínas solúveis totais foram resolvidas em SDS-PAGE a 10%. Foi observada baixa variabilidade nas variedades testadas. O dendrograma fundamentado em dados eletroforéticos agrupou os genótipos em dois grupos. Os resultados mostraram que o teor médio de proteínas de todas as variedades foi de 26,01%, na faixa de 22,8% para Thal-2006 a 34,06% para Sheenghar-2000 do peso de sementes secas. Com base no conteúdo total de proteínas, Bittal-98, Dasht, Sheen Ghar-2000, Karak-3, CM-98, Paidar-91, Fakhr-e-Thal, C-44, Balaksar e KK-1 apresentaram concentrações semelhantes para o conteúdo de proteínas entre si, mas tiveram variação quanto ao restante das variedades. Diferentes proteínas foram separadas com base nas alterações de seus pesos moleculares por meio de eletroforese em gel de poliacrilamida com dodecil sulfato de sódio (SDS-PAGE). Dasht, CM-98 e Sheen Ghar mostraram 100% de similaridade. Balaksar, Fakhr-e-Thal, KK-2, Chattan e KC-98, KK-1 e Lawaghar foram 100% semelhantes entre si, mas apresentaram variação em relação ao restante dos acessos. O dendrograma geral mostrou alto e baixo nível de variação entre os acessos. A concentração de aminoácidos livres variou entre as 16 variedades de grão-de-bico. Foi encontrada uma diferença significativa entre os aminoácidos essenciais e não essenciais nas cultivares de grão-de-bico. A concentração total de aminoácidos essenciais foi registrada em 40,81 g / 100 g de proteína, enquanto a não essencial foi registrada em 59,18343 g / 100 g de proteína nas cultivares. A maior concentração de aminoácidos essenciais foi encontrada em C-44, seguida de KK-2, KK-1 e Fakhr-e-Thal, enquanto a menor concentração foi registrada em CM-98, Paidar-91 e Sheen Ghar-2000. As cultivares TAL-2006, Chattan e Karak-3 apresentaram concentração máxima de aminoácidos essenciais e endógenos. Em conclusão, para ampliar os pools genéticos em programas de melhoramento ou procurar caracteres exóticos, por exemplo, novos alelos de resistência a doenças, pode ser utilizada a adesão com baixos coeficientes de similaridade (Lawaghar e Battal-98). Além disso, as informações adquiridas neste estudo poderiam ser usadas para criar uma abordagem de criação eficiente, com o objetivo de melhorar a nutrição e ampliar a base genética dessa cultura alimentar essencial do Paquistão.

Screening and analysis on the differentially expression genes between diploid and autotetraploid watermelon by using of digital gene expression profile / Triagem e análise da expressão diferencial dos genes entre melancia diplóide e autotetraplóide através do perfil de expressão gênica digital

Synthetic polyploids are key breeding materials for watermelon. Compared with diploid watermelon, the tetraploid watermelon often exhibit wide phenotypic differences and differential gene expression. Digital gene expression (DGE) profile technique was performed in this study to present gene expression patterns in an autotetraploid and its progenitor diploid watermelon, and deferentially expressed genes (DEGs) related to the abiotic and biotic stress were also addressed. Altogether, 4,985 DEGs were obtained in the autotetraploid against its progenitor diploid, and 66.02% DEGs is up-regulated. GO analysis shows that these DEGs mainly distributed in metabolic process, cell and catalytic activity. KEGG analysis revealed that these DEGs mainly cover metabolic pathways, secondary metabolites and ribosome. Moreover, 134 tolerance related DEGs were identified which cover osmotic adjustment substance, protective enzymes/protein, signaling proteins and pathogenesis-related proteins. This study present the differential expression of stress related genes and global gene expression patterns at background level in autotetraploid watermelons. These new evidences could supplement the molecular theoretical basis for the better resistance after the genome doubling in the gourd family.(AU)

Poliploides sintéticos são materias fundamentais para melhoramento genético da melancia. Comparativamente ao seu homólogo diploide, a melancia tetraploide apresenta amplas diferenças genotípica e fenotípica e diferença de expressão gênica. A expressão gênica digital ou DGE (digital gene expression) foi utilizada neste estudo para representar o perfil de expressão gênica da melancia autotetraploide e seu progenitor diploide e a expressão diferencial de genes relacionados ao estresse biótico e abiótico. Os resultados mostraram que 4.985 DEGs foram observados no organismo autotetraploide, sendo que, deste total, 66.02%foram supra-regulados. A análise de ontologia gênica (GO) mostrou que estes DEGs estão relacionados principalmente com processos metabólicas, célula e atividade catalítica, abrangendo de acordo com a análise de genes e genoma (KEGG) rotas metabólicas, metabolismo secundário e ribossomos. Além disso, 134 genes de defesa foram identificados, abrangendo substâncias de ajuste osmótico, enzimas/proteínas de proteção, proteínas sinalizadoras e proteínas relacionadas à patogênese. Este estudo mostrou a expressão diferencial de genes relacionados ao estresse e o perfil global de expressão gênica de melancia autotetraploide, estes resultados podem complementar, a nível molecular, o entendimento do fator resistência após a duplicação do genoma em cucurbitáceas.(AU)

The polymorphisms of genes associated with the profile of fatty acids of sheep / Os polimorfismos de genes associados ao perfil de ácidos graxos de ovinos

The present study aimed to evaluate the occurrence of polymorphisms in Diacylglycerol acyltransferase (DGTA-1 and 2), Fatty acid synthase (FASN), Stearoyl-CoA desaturase (SCD) genes and the Thioesterase domain of FASN (TE-FASN) gene that may be related to the lipid profile. In the experiment, a total of 84 sheep from different genetic groups were used. For the evaluation of the polymorphism of the genes, PCR-Single Strand Conformation Polymorphism (SSCP) technique and subsequent sequencing were used. In DGAT-2 gene, four genotypes were identified with the presence of 6 polymorphisms, with two (c.229T> C; c.255T> C) that resulted into the exchange of phenylalanine by leucine. In FASN gene, two genotypes were identified. In TE-FASN gene, three genotypes and 17 polymorphisms were identified. DGAT-1 and SCD genes did not reveal the occurrence of polymorphism. There was difference in relation to C14: 0, C18: 0 fatty acids and Δ9-desaturase C18 for DGAT-2 gene and of C18: 2ω6t for TE-FASN. There were differences among the genetic groups for C10: 0, C12: 0, C17: 0, C18: 2ω6t, C18: 3ω3, C20: 2, total of ω3, ω3/ω6 and atherogenicity index. There is occurrence of polymorphism of DGAT-2 and TE-FASN genes and these should be further studied in sheep since they revealed influence of the genotypes on the fatty acid profile.(AU)

O presente estudo teve o objetivo de avaliar a ocorrência de polimorfismos nos genes Diacilglicerol aciltransferase (DGTA1 e 2), Ácido graxo sintase (FASN), Estearoil-CoA dessaturase (SCD) e o Domínio da tioesterase do gene FASN (TE-FASN), que possam estar relacionados ao perfil lipídico. No experimento, foram utilizados um total de 84 ovinos de diferentes grupos genéticos. Para avaliação do polimorfismo dos genes, foi utilizada a técnica de polimorfismo de conformação de cadeia simples (PCR-SSCP) e posterior sequenciamento. No gene DGAT-2, foram identificados quatro genótipos com a presença de seis polimorfismos, com dois (c.229T>C; c.255T>C) que resultaram na troca da fenilalanina por leucina. No gene FASN, foram identificados dois genótipos. No gene TE-FASN, foram identificados três genótipos e 17 polimorfismos. Os genes DGAT-1 e SCD não revelaram a ocorrência de polimorfismo. Houve diferença em relação aos ácidos graxos C14:0, C18:0 e ∆9-desaturaseC18 para o gene DGAT-2 e de C18:2ω6t para TE-FASN. Houve diferença entre os grupos genéticos para C10:0, C12:0, C17:0, C18:2ω6t, C18:3ω3, C20:2, total de ω3, ω3/ω6 e índice de aterogenicidade. Há ocorrência de polimorfismo dos genes DGAT-2 e TE-FASN, e estes devem ser mais estudados em ovinos, pois revelaram influência dos genótipos sobre o perfil de ácidos graxos.(AU)

The polymorphisms of genes associated with the profile of fatty acids of sheep / Os polimorfismos de genes associados ao perfil de ácidos graxos de ovinos

The present study aimed to evaluate the occurrence of polymorphisms in Diacylglycerol acyltransferase (DGTA-1 and 2), Fatty acid synthase (FASN), Stearoyl-CoA desaturase (SCD) genes and the Thioesterase domain of FASN (TE-FASN) gene that may be related to the lipid profile. In the experiment, a total of 84 sheep from different genetic groups were used. For the evaluation of the polymorphism of the genes, PCR-Single Strand Conformation Polymorphism (SSCP) technique and subsequent sequencing were used. In DGAT-2 gene, four genotypes were identified with the presence of 6 polymorphisms, with two (c.229T> C; c.255T> C) that resulted into the exchange of phenylalanine by leucine. In FASN gene, two genotypes were identified. In TE-FASN gene, three genotypes and 17 polymorphisms were identified. DGAT-1 and SCD genes did not reveal the occurrence of polymorphism. There was difference in relation to C14: 0, C18: 0 fatty acids and Δ9-desaturase C18 for DGAT-2 gene and of C18: 2ω6t for TE-FASN. There were differences among the genetic groups for C10: 0, C12: 0, C17: 0, C18: 2ω6t, C18: 3ω3, C20: 2, total of ω3, ω3/ω6 and atherogenicity index. There is occurrence of polymorphism of DGAT-2 and TE-FASN genes and these should be further studied in sheep since they revealed influence of the genotypes on the fatty acid profile.(AU)

O presente estudo teve o objetivo de avaliar a ocorrência de polimorfismos nos genes Diacilglicerol aciltransferase (DGTA1 e 2), Ácido graxo sintase (FASN), Estearoil-CoA dessaturase (SCD) e o Domínio da tioesterase do gene FASN (TE-FASN), que possam estar relacionados ao perfil lipídico. No experimento, foram utilizados um total de 84 ovinos de diferentes grupos genéticos. Para avaliação do polimorfismo dos genes, foi utilizada a técnica de polimorfismo de conformação de cadeia simples (PCR-SSCP) e posterior sequenciamento. No gene DGAT-2, foram identificados quatro genótipos com a presença de seis polimorfismos, com dois (c.229T>C; c.255T>C) que resultaram na troca da fenilalanina por leucina. No gene FASN, foram identificados dois genótipos. No gene TE-FASN, foram identificados três genótipos e 17 polimorfismos. Os genes DGAT-1 e SCD não revelaram a ocorrência de polimorfismo. Houve diferença em relação aos ácidos graxos C14:0, C18:0 e ∆9-desaturaseC18 para o gene DGAT-2 e de C18:2ω6t para TE-FASN. Houve diferença entre os grupos genéticos para C10:0, C12:0, C17:0, C18:2ω6t, C18:3ω3, C20:2, total de ω3, ω3/ω6 e índice de aterogenicidade. Há ocorrência de polimorfismo dos genes DGAT-2 e TE-FASN, e estes devem ser mais estudados em ovinos, pois revelaram influência dos genótipos sobre o perfil de ácidos graxos.(AU)

Predicting breeding value of body weight at 6-month age using Artificial Neural Networks in Kermani sheep breed

The present study aimed to apply artificial neural networks to predict the breeding values of body weight in 6-month age of Kermani sheep. For this purpose, records of 867 lambs including lamb sex, dam age, birth weight, weaning weight, age at 3-month (3 months old), age at 6-month (6 months old) and body weight at 3 months of age were used. Firstly, genetic parameters of the animals were estimated using ASReml software. The data was then pre-processed for using in MATLAB software. After initial experiments on the appropriate neural network architecture for body weight at 6-month age, two networks were examined. A feed-forward back propagation multilayer perceptron (MLP) algorithm was used and 70% of all data used as training data, 15% as testing data and 15% as validating data, to prevent over-fitting of the artificial neural network. Results showed that the both networks capable to predict breeding values for body weight at 6 month-age in Kermani sheep. It can be concluded that artificial neural network has a good ability to predict growth traits in Kermani sheep with an acceptable speed and accuracy. Therefore, this network, instead of commonly-used procedures can be used to estimate the breeding values for productive and reproductive traits in domestic animals.(AU)