Resistance determinants of emerging pathogens isolated from an intensive care unit as a parameter of population health conditions of the Legal Amazon microregion / Determinantes de resistência a patógenos emergentes isolados de uma unidade de terapia intensiva como parâmetro das condições de saúde da população da microrregião da Amazônia Legal

Bacteria responsible for causing infections are common in hospital environments, water, soil, and food products. The infection risk is intensified by the absence of public sanitation, poor quality of life, and food scarcity. These external factors promote the dissemination of pathogens by direct contamination or biofilm formation. In this work, we identified bacterial isolates obtained from intensive care units in the southern region of Tocantins, Brazil. We compared matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) techniques and 16S ribosomal ribonucleic acid (rRNA) molecular analysis; we also performed phenotypic characterization. Fifty-six isolates characterized using morphotinctorial tests were classified as gram-positive (80.4%; n = 45) and gram-negative (19.6%; n = 11) and were resistant to several antibiotic classes; notably, we identified the blaOXA-23 resistance gene in the ILH10 isolate. Microbial identification using MALDI-TOF MS resulted in the identification of Sphingomonas paucimobilis and Bacillus circulans. 16S rRNA sequencing revealed four isolates belonging to the genera Bacillus and Acinetobacter. The similarity was superior to 99% for Acinetobacter schindleri in the Basic Local Alignment Search Tool (BLAST), grouped in the clade superior to 90%. Several strains isolated from intensive care units (ICU) were resistant to various antibiotic classes. These techniques allowed for the identification of several microorganisms of importance in public health, enabling improvements in human infection control and proving the quality of inputs, food, and water.

As bactérias responsáveis por causar infecções são comuns em ambientes hospitalares, água, solo e produtos alimentícios. O risco de infecção é intensificado pela ausência de saneamento público, má qualidade de vida e escassez de alimentos. Esses fatores externos promovem a disseminação de patógenos por contaminação direta ou formação de biofilme. Neste trabalho, identificamos isolados bacterianos obtidos de unidades de terapia intensiva na região sul do Tocantins, Brasil. Comparamos técnicas de espectrometria de massa de tempo de voo com ionização por dessorção a laser assistida por matriz (MALDI-TOF MS) e análise molecular de ácido ribonucleico ribossômico 16S (rRNA); também realizamos caracterização fenotípica. Cinquenta e seis isolados caracterizados por testes morfotintoriais foram classificados como gram-positivos (80,3%; n = 45) e gram-negativos (19,6%; n = 11) e foram resistentes a várias classes de antibióticos; notavelmente, identificamos o gene de resistência blaOXA-23 no isolado de ILH10. A identificação microbiana usando MALDI-TOF MS resultou na identificação de Sphingomonas paucimobilis e Bacillus circulans. O sequenciamento do 16S rRNA revelou quatro isolados pertencentes aos gêneros Bacillus e Acinetobacter. A similaridade foi superior a 99% para Acinetobacter schindleri no BLAST, agrupado no clado superior a 90%. Várias cepas isoladas de ICU foram resistentes a várias classes de antibióticos. Essas técnicas permitiram a identificação de diversos microrganismos de importância em saúde pública, possibilitando melhorias no controle de infecções humanas e comprovando a qualidade dos insumos, alimentos e água.

Antibacterials and behaviors adopted by milk producers in Goiás, Brazil / Antibacterianos e condutas adotadas por produtores de leite em Goiás, Brasil

Milk and its derivatives are rich in nutrients and widely consumed by the population. However, the presence of chemical residues is frequent in these products. This study aimed to carry out a diagnosis of the use of antibacterials and evaluate the knowledge about these drugs and behaviors adopted by dairy producers in Goiás, Brazil. A total of 286 dairy farms in 36 municipalities in the State were visited and interviews were conducted with the owner or auxiliary workforce. The questions addressed the production parameters of the property and the use of antibacterials. The answers were presented in percentages and graphs. Statistical analysis was performed using Pearson's chi-square test at a 5% significance level. Only 26.2% of the producers used antibacterials indicated by veterinarians and all producers (100%) disposed of milk with residues inappropriately. Tetracycline and penicillin were the most used among the 21 cited active principles. Enteritis (22.1%), cattle tick fever (21.1%), and mastitis (19.4%) were the main diseases treated with antibacterials. A total of 37.4% of respondents were unable to distinguish antibacterials from other drugs. Moreover, the more specialized the farm, the greater the veterinary assistance and the greater the care for antibacterial treatments. Most respondents (51.7%) had incomplete elementary education. These results provide important information about how rural producers in the State of Goiás use antibacterials and serve as a basis for future interventions. The need for greater access by producers to veterinary services in Goiás is evident to reduce the unnecessary and inappropriate use of antibacterials.(AU)

O leite e seus derivados são ricos em nutrientes e largamente consumidos pela população. Contudo, a presença de resíduos de substâncias químicas é frequente nesses produtos. Esse estudo objetivou realizar um diagnóstico sobre o uso de antibacterianos, avaliar o conhecimento sobre esses fármacos e condutas adotadas por produtores de leite em Goiás, Brasil. Foram visitadas 286 propriedades leiteiras em 36 municípios do estado, onde foram realizadas entrevistas com o proprietário ou mão de obra auxiliar. As perguntas abordavam parâmetros produtivos da propriedade e uso de antibacterianos. As respostas foram apresentadas em porcentagem e gráficos. A análise estatística foi realizada pelo teste de qui-quadrado de Pearson ao nível de significância de 5%. Apenas 26,2% dos produtores utilizavam antibacterianos indicados por veterinários e todos (100%) descartavam o leite com resíduos de forma inadequada. Dentre os 21 princípios ativos citados, os mais utilizados foram as tetraciclinas e penicilinas. As principais doenças tratadas com antibacterianos foram enterite (22,1%), tristeza parasitária bovina (21,1%) e mastite (19,4%). Observou-se que 37,4% dos entrevistados não souberam distinguir antibacterianos de outros medicamentos. Verificou-se que quanto mais especializada é a fazenda, maior é a assistência veterinária e maiores os cuidados para tratamentos com antibacterianos. A maioria dos entrevistados (51,7%) apresentava ensino fundamental incompleto. Esses resultados fornecem informações importantes sobre como os produtores rurais do estado de Goiás utilizam antibacterianos e servem como base para intervenções futuras. É evidente a necessidade de maior acesso dos produtores a serviços veterinários em Goiás, a fim de reduzir o uso desnecessário e inadequado de antibacterianos.(AU)

Molecular analysis of Panton-Valentine Leucocidin (pvl) gene among MRSA and MSSA isolates / Análise molecular do gene Panton-Valentine Leucocidin (pvl) entre isolados de MRSA e MSSA

The present study was conducted in order to determine the frequency of pvl gene among the pathogenic and healthy population isolates of Methicillin Resistant Staphylococcus aureus (MRSA) and Methicillin Sensitive Staphylococcus aureus (MSSA). For this purpose, nasal swab samples were collected from the healthy individuals (to be used as controls, all the samples were collected irrespective of the sex and age factors), the pathogenic samples were collected from different patients suffering from skin &soft tissue infections caused by S. aureus (to be used as test samples).Both of these population samples were analyzed for the presence of pvl gene. S.aureus were identified through conventional microbiological identification procedures. In the case of normal samples, 70 nasal swabs were collected and only 33 (47%) proved to be S. aureus while 20 pathogenic samples were collected and all (100%) were cleared as S. aureus. For further distribution of samples into MRSA and MSSA, antibiotic susceptibility pattern was checked by using the standard protocols of Kirby-Bauer disc diffusion method. Two antibiotic discs Oxacillin (OX: 1ug) and cefoxitin (FOX: 30ug) were used. Among healthy population, MRSA was found to be 79% (n=26) and MSSA were present as 21% (n= 7). Among pathogenic strains 100% MRSA was detected where n= 20. Detection of pvl gene among the MRSA and MSSA isolates was done by using the uniplex PCR followed by gel electrophoresis. MRSA and MSSA of normal healthy population carried 49% and 7% pvl gene respectively. While, pathogenic MRSA samples carried 46% pvl gene among them. Potentially alarming percentage of pvl gene is present among the normal healthy individuals which indicates a future threat and a major health concern.

O presente estudo almejou determinar a frequência do gene PVL entre os isolados patogênicos e saudáveis da população de Staphylococcus aureus resistente à meticilina (MRSA) e Staphylococcus aureus sensível à meticilina (MSSA). Para este propósito, amostras de swab nasal foram coletadas de indivíduos saudáveis (utilizadas como controle, todas as amostras foram coletadas independentemente do sexo e idade), e de diferentes pacientes com infecções de pele e tecidos moles causadas por S. aureus (utilizadas como amostras de teste). Ambas as amostras populacionais foram analisadas quanto à presença do gene PVL. S.aureus foram identificados através de procedimentos convencionais de identificação microbiológica. No caso de amostras normais, 70 swabs nasais foram coletados e apenas 33 (47%) provaram ser S. aureus, enquanto 20 amostras patogênicas foram coletadas e todas (100%) foram eliminadas como S. aureus. Para distribuição posterior de amostras em MRSA e MSSA, o padrão de suscetibilidade a antibióticos foi verificado a partir dos protocolos padrão do método de difusão de disco de Kirby-Bauer. Foram utilizados dois discos de antibióticos Oxacilina (OX: 1ug) e cefoxitina (FOX: 30ug). Entre a população saudável, MRSA foi encontrado em 79% (n = 26) e MSSA estava presente em 21% (n = 7). Entre as cepas patogênicas, 100% de MRSA foi detectado onde n = 20. A detecção do gene PVL entre os isolados de MRSA e MSSA foi feita usando a PCR uniplex seguida de eletroforese em gel. MRSA e MSSA da população saudável normal carregavam 49% e 7% do gene PVL, respectivamente. Enquanto as amostras patogênicas de MRSA carregavam 46% do gene PVL entre elas. Uma porcentagem potencialmente alarmante do gene PVL foi detectada entre os indivíduos saudáveis normais, o que indica uma ameaça futura e um grande problema de saúde.

Clinical and epidemiological features and impact of life habits in canine atopic dermatitis in Fortaleza, Brazil / Achados clínicos e epidemiológicos e impacto do estilo de vida na dermatite atópica canina em Fortaleza/Brasil

Canine atopic dermatitis (cAD) is a worldwide allergic skin disease. The affected dog population can show different clinical patterns according to geographic region, and a lack of studies in Brazil is observed. Therefore, the aim of the present study was to assess the clinical and epidemiological data of cAD in dogs treated in a private clinical practice in Fortaleza, a city located in the Northeast Region of Brazil. cAD was diagnosed in 35% of dogs, being Shih-tzu and Poodle the most affected breeds. Paws and ears were frequently injured sites. Almost 50% of atopic dogs were diagnosed with superficial pyoderma and 36% with cutaneous malasseziosis. Atopic dogs with outdoor habits were less likely to develop cutaneous malassezial infection, and with routine ear, cleaning habits were less likely to develop bacterial otitis externa. In conclusion, canine atopic dermatitis is a prevalent disease in private clinical practice in Fortaleza, and lifestyle habits can be considered a risk factor for cutaneous malasseziosis infection and bacterial otitis externa in atopic dogs.

A dermatite atópica canina (DAC) é uma doença alérgica cutânea de ocorrência mundial. A população canina acometida pode apresentar diferentes padrões clínicos de acordo com a região geográfica e observa-se uma carência de estudos no Brasil. Portanto, o objetivo do presente estudo é avaliar os dados clínicos e epidemiológicos da DAC em cães atendidos em uma clínica privada em Fortaleza, cidade localizada na Região Nordeste do Brasil. A DAC foi diagnosticada em 35% dos cães, sendo Shih-tzu e Poodle as raças mais acometidas. As patas e as orelhas foram locais frequentemente afetados. Quase 50% dos cães atópicos foram diagnosticados com piodermite superficial e 36% com malasseziose cutânea. Cães atópicos com hábitos ao ar livre foram menos propensos a desenvolver malasseziose cutânea e com hábitos rotineiros de limpeza auricular foram menos propensos a desenvolver otite externa bacteriana. Em conclusão, a dermatite atópica canina é uma doença prevalente na prática clínica privada em Fortaleza e os hábitos de vida podem ser considerados como um fator de risco para infecção por malasseziose cutânea e otite externa bacteriana em cães atópicos.

Detection of beta-lactamase-producing Enterobacteriaceae in a veterinary hospital environment / Detecção de Enterobactérias produtoras de beta-lactamases em ambiente hospitalar veterinário

Due to the strong selective pressure resulting from the misuse of antibiotics, the natural process of bacterial resistance has been accelerated, leading to the increasingly constant appearance of multiresistant isolates. The high number of multi-resistant bacteria is a one health problem. Enterobacteriaceae are usually commensal bacteria of the gastrointestinal tract. However, they can cause infections, and the most important resistance characteristic among them is the production of ß-lactamases. This study aimed to identify ESBL-producing Enterobacteriaceae of types of TEM, SHV, and the CTX-Mgroups. To isolate the enterobacteria, swabs were collected by swiping objects that had contact with the patients and professionals, and the water of the hospital environment. Ten collections were carried out, yielding 306 samples, from which 118 enterobacteria were identified: Escherichia coli, Enterobacter spp., Klebsiella spp., Proteus mirabilis, Serratiaspp., and Citrobacter spp. Isolates. The genes TEM and CTX-M, for the production of ß-lactamases, were detected in 12.7% of the 118 enterobacterial isolates. It is very important to know the bacterial population circulating in the veterinary hospital environment and its resistance to antimicrobials so that professionals can take appropriate measures to minimize the risks of transmission, especially from cages and consultation tables. In addition, the correct control of the microbiological quality of the supply water, as well as environmental cleaning procedures, are essential to prevent the transmission of these microorganisms.(AU)

Devido à grande pressão seletiva decorrente do uso indevido de antibióticos, tem se acelerado o processo natural de resistência das bactérias, levando ao aparecimento cada vez mais constante de isolados multirresistentes. O elevado número de bactérias multirresistentes identificadas é um problema da saúde única. As enterobactérias são bactérias geralmente comensais do trato gastrointestinal, entretanto podem causar infecções, e a característica de resistência mais importante entre elas é a produção de ß-lactamases. Buscando caracterizar melhor os microrganismos circulantes e potencialmente causadores de infecções em ambiente hospitalar veterinário, este estudo objetivou identificar as enterobactérias produtoras de ESBL do tipo TEM, SHV e os cinco grupos de CTX-M presentes em isolados circulantes em hospital veterinário. Foi realizada coleta de suabes de arrasto de objetos que entram em contato com os pacientes e com os profissionais que ali trabalham, bem como de água, para a identificação das enterobactérias. Foram realizadas 10 coletas, obtendo-se 306 amostras, dessas, 118 enterobactérias foram identificadas: Escherichia coli, Enterobacter, Klebsiella, Proteus mirabilis, Serratia e Citrobacter. Dentre as enterobactérias identificadas, alguns isolados possuíam genes para a produção de ß-lactamases, do tipo TEM e CTX-M. É de grande importância conhecer a população bacteriana circulante no ambiente hospitalar veterinário, e a sua resistência aos antimicrobianos, para que os profissionais possam tomar medidas apropriadas para minimizar os riscos de transmissão, principalmente a partir de gaiolas e mesas de atendimento. Além disso, o correto controle da qualidade microbiológica da água de abastecimento, bem como dos procedimentos de higienização do ambiente, são fundamentais para evitar a transmissão destes microrganismos.(AU)

Microbial source tracking and antimicrobial resistance in one river system of a rural community in Bahia, Brazil / Rastreamento de fontes microbianas e resistência antimicrobiana em um sistema fluvial de uma comunidade rural da Bahia, Brasil

Use of antibiotics inevitably leads to antimicrobial resistance. Selection for resistance occurs primarily within the gut of humans and animals as well as in the environment through natural resistance and residual antibiotics in streams and soil. We evaluated antimicrobial resistance in Gram negative bacteria from a river system in a rural community in Bahia, Brazil. Water was collected from the Jiquiriçá and Brejões rivers and the piped water supply. Additionally, stools were collected from a random sample of residents, cows, pigs and horses near the river. The samples were screened for bacteria resistant to ciprofloxacin, cefotaxime, and meropenem and identified biochemically at the genus and species levels. Microbial source tracking demonstrated that ruminant and human fecal contamination increased as the rivers neared the village center and decreased after the last residence. Antibiotic bacteria were identified from all samples (n = 32). No bacteria were resistant to carbapenems, but the majority of the enterobacteria were resistant to ciprofloxacin, even though this class of antibiotics is not commonly used in food animals in this region. Considering these facts, together with the pattern of human fecal contamination, a human source was considered most likely for these resistant isolates.

O uso de antibióticos inevitavelmente leva à resistência antimicrobiana. A seleção para resistência antimicrobiana ocorre principalmente no intestino de seres humanos e animais, bem como no meio ambiente, através da resistência natural e resíduos de antibióticos nos esgotos e no solo. Avaliamos a resistência antimicrobiana em bactérias Gram-negativas de um sistema fluvial em uma comunidade rural da Bahia, Brasil. A água foi coletada nos rios Jiquiriçá e Brejões e no abastecimento de água encanada. Além disso, foram coletadas amostras randomizadas de fezes de moradores, vacas, porcos e cavalos próximos ao rio. As amostras foram triadas para bactérias resistentes à ciprofloxacina, cefotaxima e meropenem e identificadas bioquimicamente nos níveis de gênero e espécie. O rastreamento de fontes microbianas demonstrou que a contaminação fecal de ruminantes e humanos aumentou à medida que os rios se aproximavam do centro da vila e diminuía após a última residência. Bactérias resistentes a antibióticos foram identificadas em todas as amostras (n = 32). Nenhuma bactéria demonstrou ser resistente aos carbapenêmicos testados, contudo, foi encontrado enterobactérias resistentes à ciprofloxacina, ainda que essa classe de antibióticos não seja comumente usada na medicina veterinária dos animais dessa região. Considerando esses fatos, juntamente com o padrão de contaminação fecal avaliado, a fonte de contaminação humana foi considerada a mais provável na interação desses isolados resistentes.

Pseudomonas aeruginosa associated pulmonary infections and in vitro amplification virulent rhamnolipid (rhlR) gene / Infecções pulmonares associadas a Pseudomonas aeruginosa e gene ramnolipídeo virulento (rhlR) da amplificação in vitro

Background: Pseudomonas aeruginosa is a common opportunistic pathogenic bacterium with the ability to develop a strong communication pathway by quorum sensing system and different virulent factors. Among the various important secretions of P. aeruginosa rhamnolipid is important biological detergent, believed to be involved in the development of the biofilm and intercellular communication. It readily dissolves the lung surfactants that are then easily catalyzed by the phospholipases and in this way is involved in the acute pulmonary infection. Objective: research work was designed to investigate virulence and gene associated with virulence in P. aeruginosa responsible for pulmonary infections. Methods: In current study polymerase chain reaction (PCR) was used for the detection of the rhlR (rhamnolipid encoding) gene of isolated strains. A number of assays were performed that ensured its virulent behavior. Disc diffusion method was used to check its antibiotic resistance. Isolated strains were resistant to a number of antibiotics applied. Result: It was found that males are more prone to respiratory infections as compared to females. Male members with age of 44-58 and 59-73 are at a higher risk, while females with age of 44-58 are also at a risk of pulmonary infections. Antibiotic resistance was observed by measuringzone of inhibition in strains GCU-SG-M4, GCU-SG-M3, GCU-SG-M5, GCU-SG-M2, GCU-SG-M1 and GCU-SG-M6. GCU-SG-M2 was resistant to fluconazole (FLU), clarithromycin (CLR), cefixime (CFM) and Penicillin (P10). No zone of inhibition was observed. But it showed unusual diffused zone around the Ak and MEM antibiotic discs. rhl R gene and 16s rRNA gene were characterized and analyzed. Conclusion: Findings from current study would help[...].

Antecedentes: Pseudomonas aeruginosa é uma bactéria patogênica oportunista comum, com a capacidade de desenvolver uma forte via de comunicação pelo sistema de detecção de quorum e diferentes fatores virulentos. Entre as várias secreções importantes de P. aeruginosa rhamnolipid, há um importante detergente biológico, que se acredita estar envolvido no desenvolvimento do biofilme e na comunicação intercelular. Dissolve rapidamente os surfactantes pulmonares que são facilmente catalisados pelas fosfolipases e, dessa maneira, estão envolvidos na infecção pulmonar aguda. Objetivo: O trabalho de pesquisa foi desenhado para investigar a virulência e o gene associado à virulência em P. aeruginosa responsável por infecções pulmonares. Métodos: No presente estudo, a reação em cadeia da polimerase (PCR) foi utilizada para a detecção do gene rhlR (codificação ramnolipídeo) de cepas isoladas. Foram realizados vários ensaios que garantiram seu comportamento virulento. O método de difusão em disco foi utilizado para verificar sua resistência a antibióticos. As estirpes isoladas foram resistentes a vários antibióticos aplicados. Resultado: Verificou-se que os homens são mais propensos a infecções respiratórias em comparação às mulheres. Membros do sexo masculino com idade entre 44 e 58 e 59 e 73 anos correm maior risco, enquanto mulheres com idade entre 44 e 58 anos também correm risco de infecções pulmonares. A resistência aos antibióticos foi observada medindo a zona de inibição nas cepas GCU-SG-M4, GCU-SG-M3, GCU-SG-M5, GCU-SG-M2, GCU-SG-M1 e GCU-SG-M6. O GCU-SG-M2 foi resistente ao fluconazol (FLU), claritromicina (CLR), cefixima (CFM) e penicilina (P10). Nenhuma zona de inibição foi observada. Mas se notou uma zona difusa incomum ao redor dos discos antibióticos Ak e MEM. Os genes rhl R e 16s rRNA foram caracterizados e analisados. Conclusão: As conclusões do presente estudo ajudariam a aumentar a conscientização sobre a resistência a antibióticos de, [...].

Pseudomonas aeruginosa associated pulmonary infections and in vitro amplification virulent rhamnolipid (rhlR) gene / Infecções pulmonares associadas a Pseudomonas aeruginosa e gene ramnolipídeo virulento (rhlR) da amplificação in vitro

Background: Pseudomonas aeruginosa is a common opportunistic pathogenic bacterium with the ability to develop a strong communication pathway by quorum sensing system and different virulent factors. Among the various important secretions of P. aeruginosa rhamnolipid is important biological detergent, believed to be involved in the development of the biofilm and intercellular communication. It readily dissolves the lung surfactants that are then easily catalyzed by the phospholipases and in this way is involved in the acute pulmonary infection. Objective: research work was designed to investigate virulence and gene associated with virulence in P. aeruginosa responsible for pulmonary infections. Methods: In current study polymerase chain reaction (PCR) was used for the detection of the rhlR (rhamnolipid encoding) gene of isolated strains. A number of assays were performed that ensured its virulent behavior. Disc diffusion method was used to check its antibiotic resistance. Isolated strains were resistant to a number of antibiotics applied. Result: It was found that males are more prone to respiratory infections as compared to females. Male members with age of 44-58 and 59-73 are at a higher risk, while females with age of 44-58 are also at a risk of pulmonary infections. Antibiotic resistance was observed by measuringzone of inhibition in strains GCU-SG-M4, GCU-SG-M3, GCU-SG-M5, GCU-SG-M2, GCU-SG-M1 and GCU-SG-M6. GCU-SG-M2 was resistant to fluconazole (FLU), clarithromycin (CLR), cefixime (CFM) and Penicillin (P10). No zone of inhibition was observed. But it showed unusual diffused zone around the Ak and MEM antibiotic discs. rhl R gene and 16s rRNA gene were characterized and analyzed. Conclusion: Findings from current study would help[...].(AU)

Antecedentes: Pseudomonas aeruginosa é uma bactéria patogênica oportunista comum, com a capacidade de desenvolver uma forte via de comunicação pelo sistema de detecção de quorum e diferentes fatores virulentos. Entre as várias secreções importantes de P. aeruginosa rhamnolipid, há um importante detergente biológico, que se acredita estar envolvido no desenvolvimento do biofilme e na comunicação intercelular. Dissolve rapidamente os surfactantes pulmonares que são facilmente catalisados pelas fosfolipases e, dessa maneira, estão envolvidos na infecção pulmonar aguda. Objetivo: O trabalho de pesquisa foi desenhado para investigar a virulência e o gene associado à virulência em P. aeruginosa responsável por infecções pulmonares. Métodos: No presente estudo, a reação em cadeia da polimerase (PCR) foi utilizada para a detecção do gene rhlR (codificação ramnolipídeo) de cepas isoladas. Foram realizados vários ensaios que garantiram seu comportamento virulento. O método de difusão em disco foi utilizado para verificar sua resistência a antibióticos. As estirpes isoladas foram resistentes a vários antibióticos aplicados. Resultado: Verificou-se que os homens são mais propensos a infecções respiratórias em comparação às mulheres. Membros do sexo masculino com idade entre 44 e 58 e 59 e 73 anos correm maior risco, enquanto mulheres com idade entre 44 e 58 anos também correm risco de infecções pulmonares. A resistência aos antibióticos foi observada medindo a zona de inibição nas cepas GCU-SG-M4, GCU-SG-M3, GCU-SG-M5, GCU-SG-M2, GCU-SG-M1 e GCU-SG-M6. O GCU-SG-M2 foi resistente ao fluconazol (FLU), claritromicina (CLR), cefixima (CFM) e penicilina (P10). Nenhuma zona de inibição foi observada. Mas se notou uma zona difusa incomum ao redor dos discos antibióticos Ak e MEM. Os genes rhl R e 16s rRNA foram caracterizados e analisados. Conclusão: As conclusões do presente estudo ajudariam a aumentar a conscientização sobre a resistência a antibióticos de, [...].(AU)

Metagenomic study of the communities of bacterial endophytes in the desert plant Senna Italica and their role in abiotic stress resistance in the plant / Estudo metagenômico das comunidades de endófitos bacterianos na planta do deserto Senna Italica e seu papel na resistência ao estresse abiótico na planta

Plant leaves and roots are home to diverse communities of bacteria, which play a significant role in plant health and growth. Although one of the most unfriendly environments for plant growth is deserts, desert plants can influence their surrounding microbial population and choose favorable bacteria that encourage their growth under these severe circumstances. Senna italica is known for its excellent medicinal values as a traditional medical plant, but little is known about its associated endophytic bacterial community under extreme conditions. In the present study, metagenomic sequencing of 16S rRNA was used to report the diversity of endophytic bacterial communities associated with the leaves and roots of the desert medicinal plant Senna italica that was collected from the Asfan region in northeast Jeddah, Saudi Arabia. Analyses of the 16S rRNA sequences at the taxonomic phylum level revealed that bacterial communities in the roots and leaves samples belonged to five phyla, including Cyanobacteria, Proteobacteria, Actinobacteria, Firmicutes, and unclassified phyla. Results indicated that the most common phyla were Cyanobacteria/Chloroplast and Actinobacteria. Analysis of the 16S rRNA sequences at the taxonomic phylum level revealed that bacterial communities in the roots and leaves samples belonged to twelve genera at the taxonomic genus level. The most abundant ones were highlighted for further analysis, including Okibacterium and Streptomyces found in Actinobacteria, which were the dominant genus in roots samples. However, Streptophyta found in Cyanobacteria/Chloroplast was the dominant genus in leaf samples. Metagenomic analysis of medicinal plants leads to identifying novel organisms or genes that may have a role in abiotic stress resistance in the plant. The study of endophytic microbiome taxonomic, phylogenetic, and functional diversity will better know innovative candidates that may be selected as biological agents to enhance agricultural and industrial processes, especially for crop desert agricultural improvement.

As folhas e raízes das plantas abrigam diversas comunidades de bactérias, que desempenham um papel significativo na saúde e no crescimento das plantas. Embora um dos ambientes mais hostis para o crescimento de plantas sejam os desertos, as plantas do deserto podem influenciar a população microbiana circundante e escolher bactérias favoráveis ​​que encorajem seu crescimento sob essas circunstâncias severas. Senna italica é conhecida por seus excelentes valores medicinais como planta medicinal tradicional, mas pouco se sabe sobre sua comunidade bacteriana endofítica associada em condições extremas. No presente estudo, o sequenciamento metagenômico de 16S rRNA foi usado para relatar a diversidade de comunidades bacterianas endofíticas associadas às folhas e raízes da planta medicinal do deserto Senna italica que foi coletada na região de Asfan no nordeste de Jeddah, Arábia Saudita. Análises das sequências de rRNA 16S no nível taxonômico do filo revelaram que as comunidades bacterianas nas amostras de raízes e folhas pertenciam a cinco filos, incluindo Cyanobacteria, Proteobacteria, Actinobacteria, Firmicutes e filos não classificados. Os resultados indicaram que os filos mais comuns foram Cyanobacteria/Cloroplast e Actinobacteria. A análise das sequências de rRNA 16S no nível taxonômico do filo revelou que as comunidades bacterianas nas amostras de raízes e folhas pertenciam a doze gêneros no nível taxonômico de gênero. Os mais abundantes foram destacados para análise posterior, incluindo Okibacterium e Streptomyces encontrados em Actinobacteria, que foram os gêneros dominantes nas amostras de raízes. No entanto, Streptophyta encontrado em Cyanobacteria/Chloroplast foi o gênero dominante nas amostras de folhas. A análise metagenômica de plantas medicinais leva à identificação de novos organismos ou genes que podem ter um papel na resistência ao estresse abiótico na planta. O estudo da diversidade taxonômica, filogenética e funcional do microbioma endofítico conhecerá melhor os candidatos inovadores que podem ser selecionados como agentes biológicos para melhorar os processos agrícolas e industriais, especialmente para o melhoramento agrícola do deserto.

Avaliação da flutuação populacional epifítica de Pseudomonasmarginalis pv.marginalise sua relação com a severidade da queima-bacteriana do alho / Evaluation of epiphytic population floating of Pseudomonas marginalis pv. marginalis and relationship with the severity of bacterial blight of garlic

A cultura do alho é afetada pela queima-bacteriana causada por Pseudomomas marginalis pv. marginalis(Pmm). Com o objetivo de avaliar a relação da flutuação populacional epifítica de Pmm com a severidade da doença, bulbilhos do cultivar “Chonan” foram inoculados com a bactéria diferenciadora mutante a rifampicina (Pmmrf) e semeados a campo. A severidade foi avaliada semanalmente em 100 plantas ao acaso e a população epifítica de Pmmrf das folhas foi diluída em série e depositada em meio de cultura com rifampicina. Após a incubação a 28°C por 48 horas, as colônias de Pmmrfforam contadas. Os dados foram submetidos à correlação de Pearson e avaliada a sua significância pelo teste. A severidade da doença e a população epifítica iniciaram a partir da sétima semana. A severidade final atingiu 67 e 74% no ciclo de 2019 e 2020 respectivamente. A população epifítica quando atingiu a ordem de 105e 106 em cada ano, manteve-se estável até o final do ciclo da cultura. A correlação foi de 0,688 e 0,521 para cada ano, indicando uma correlação moderada e significativa entre a severidade da doença e a população bacteriana. Este trabalho servirá de base epidemiológica e para elaboração de um sistema de previsão para manejo da doença na cultura.

The garlic crop is affected by the bacterial blight caused by Pseudomomas marginalispv. marginalis(Pmm). Here, we evaluate the relationship between the epiphytic population fluctuation of Pmm and the severity of the disease. Cloves of the “Chonan” cultivar were inoculated with the mutant differentiating bacteria rifampicin (Pmmrf). After, they were then sown in the field. The severity was evaluated weekly over 100 random plants and the epiphytic population of Pmmrffrom the leaves was serially diluted and deposited in culture medium containing rifampicin. After incubation at 28 ° C for 48 hours, Pmmrfcolonies were counted. The data were submitted to Pearson's correlation, and its significance was also evaluated. The severity of the disease and the epiphytic population started from the seventh week. The final severity reached 67 and 74% in the 2019 and 2020 cycles, respectively. However, when the epiphytic population reached 105and 106each year, it remained stable until the end of the culture cycle. The Pearson's correlation achieves the 0.688 and 0.521 scores for both selected periods, indicating a moderate and significant correlation between the severity of the disease and the bacterial population. This research helps to elaborate epidemiological protocols and for the elaboration of forecasting systems.

Avaliação da flutuação populacional epifítica de Pseudomonasmarginalis pv.marginalise sua relação com a severidade da queima-bacteriana do alho / Evaluation of epiphytic population floating of Pseudomonas marginalis pv. marginalis and relationship with the severity of bacterial blight of garlic

A cultura do alho é afetada pela queima-bacteriana causada por Pseudomomas marginalis pv. marginalis(Pmm). Com o objetivo de avaliar a relação da flutuação populacional epifítica de Pmm com a severidade da doença, bulbilhos do cultivar “Chonan” foram inoculados com a bactéria diferenciadora mutante a rifampicina (Pmmrf) e semeados a campo. A severidade foi avaliada semanalmente em 100 plantas ao acaso e a população epifítica de Pmmrf das folhas foi diluída em série e depositada em meio de cultura com rifampicina. Após a incubação a 28°C por 48 horas, as colônias de Pmmrfforam contadas. Os dados foram submetidos à correlação de Pearson e avaliada a sua significância pelo teste. A severidade da doença e a população epifítica iniciaram a partir da sétima semana. A severidade final atingiu 67 e 74% no ciclo de 2019 e 2020 respectivamente. A população epifítica quando atingiu a ordem de 105e 106 em cada ano, manteve-se estável até o final do ciclo da cultura. A correlação foi de 0,688 e 0,521 para cada ano, indicando uma correlação moderada e significativa entre a severidade da doença e a população bacteriana. Este trabalho servirá de base epidemiológica e para elaboração de um sistema de previsão para manejo da doença na cultura.(AU)

The garlic crop is affected by the bacterial blight caused by Pseudomomas marginalispv. marginalis(Pmm). Here, we evaluate the relationship between the epiphytic population fluctuation of Pmm and the severity of the disease. Cloves of the “Chonan” cultivar were inoculated with the mutant differentiating bacteria rifampicin (Pmmrf). After, they were then sown in the field. The severity was evaluated weekly over 100 random plants and the epiphytic population of Pmmrffrom the leaves was serially diluted and deposited in culture medium containing rifampicin. After incubation at 28 ° C for 48 hours, Pmmrfcolonies were counted. The data were submitted to Pearson's correlation, and its significance was also evaluated. The severity of the disease and the epiphytic population started from the seventh week. The final severity reached 67 and 74% in the 2019 and 2020 cycles, respectively. However, when the epiphytic population reached 105and 106each year, it remained stable until the end of the culture cycle. The Pearson's correlation achieves the 0.688 and 0.521 scores for both selected periods, indicating a moderate and significant correlation between the severity of the disease and the bacterial population. This research helps to elaborate epidemiological protocols and for the elaboration of forecasting systems.(AU)

Antimicrobial effect of bothropstoxin-i in broilers / Atividade antimicrobiana da bothropstoxin-i em frangos de corte

Bacterial resistance is a sanitary issue explained by indiscriminate use of nonprescription drugs, and antimicrobial use in food production for growth promotion. Bothropstoxin-I (BthTx-I) is a phospholipase A2 (PLA2) from Bothrops jararacussu venom, which has a known antimicrobial effect. The goal of this study was the unprecedented evaluation of in vivo antimicrobial activity of BthTx-I in broilers. Microbiological, biochemical, and histological parameters were determined using 84 21-day old broilers that were kept in cages with four birds each at a density of 625 cm2/broiler. The experiment was randomized by three treatments with seven repetitions of four broilers each that lasted seven days. The treatments were: 1) bacitracin zinc diet; 2) PLA2-BthTx-I; 3) without additives. The data obtained from the studied variables was subjected to analysis of variance and an F-test at the 5% significance level. Averages of each variable in each treatment were compared by Tukey’s test. Broiler bacterial cloacal counts showed that BthTx-I decreased the microbial population without reducing body weight, intestinal morphology, or liver or kidney histopathological damage. The toxin showed in vivo activity, being an alternative for better performance in the production of broiler chickens, because it acted by decreasing the microbial load of potentially pathogenic bacteria in the intestinal(AU)

A resistência bacteriana é uma questão sanitária, explicada pelo uso indiscriminado de medicamentos sem receita médica e pelo uso de antimicrobianos na produção de alimentos para promover o crescimento. Bothropstoxin-I (BthTx-I) é uma fosfolipase A2 (PLA2) obtida do veneno da Bothrops jararacussu. A PLA2 do veneno de cobra tem efeito antimicrobiano conhecido. Objetivou-se com este estudo avaliar sem precedentes a atividade antimicrobiana in vivo de BthTx-I em frangos de corte. Os parâmetros microbiológicos, bioquímicos e histológicos foram realizados em 84 frangos de corte com 21 dias de idade mantidos em gaiolas com quatro animais cada e densidade de 625 cm2/frango. O experimento foi dividido em três tratamentos com sete repetições de quatro frangos cada um, com duração de sete dias. Os tratamentos foram: 1) dieta com bacitracina de zinco; 2) PLA2-BthTx-I; 3) sem aditivos. Os dados obtidos das variáveis estudadas foram submetidos à análise de variância e teste F ao nível de significância de 5%. As médias dos tratamentos em cada variável foram comparadas pelo teste de Tukey. A contagem cloacal bacteriana de frangos de corte mostrou que o BthTx-I diminuiu a população microbiana sem comprometer o peso corporal, a morfologia intestinal ou causar danos histopatológico no fígado e rins. Concluiu-se que a toxina apresentou atividade in vivo, sendo uma alternativa para um melhor desempenho na produção de frangos de corte, pois agiu diminuindo a carga microbiana de bactérias potencialmente patogênicas na microbiota intestinal das aves e não causou danos musculares, hepáticos ou renais na dosagem avaliada.(AU)

Antimicrobial effect of bothropstoxin-i in broilers / Atividade antimicrobiana da bothropstoxin-i em frangos de corte

Bacterial resistance is a sanitary issue explained by indiscriminate use of nonprescription drugs, and antimicrobial use in food production for growth promotion. Bothropstoxin-I (BthTx-I) is a phospholipase A2 (PLA2) from Bothrops jararacussu venom, which has a known antimicrobial effect. The goal of this study was the unprecedented evaluation of in vivo antimicrobial activity of BthTx-I in broilers. Microbiological, biochemical, and histological parameters were determined using 84 21-day old broilers that were kept in cages with four birds each at a density of 625 cm2/broiler. The experiment was randomized by three treatments with seven repetitions of four broilers each that lasted seven days. The treatments were: 1) bacitracin zinc diet; 2) PLA2-BthTx-I; 3) without additives. The data obtained from the studied variables was subjected to analysis of variance and an F-test at the 5% significance level. Averages of each variable in each treatment were compared by Tukey’s test. Broiler bacterial cloacal counts showed that BthTx-I decreased the microbial population without reducing body weight, intestinal morphology, or liver or kidney histopathological damage. The toxin showed in vivo activity, being an alternative for better performance in the production of broiler chickens, because it acted by decreasing the microbial load of potentially pathogenic bacteria in the intestinal

A resistência bacteriana é uma questão sanitária, explicada pelo uso indiscriminado de medicamentos sem receita médica e pelo uso de antimicrobianos na produção de alimentos para promover o crescimento. Bothropstoxin-I (BthTx-I) é uma fosfolipase A2 (PLA2) obtida do veneno da Bothrops jararacussu. A PLA2 do veneno de cobra tem efeito antimicrobiano conhecido. Objetivou-se com este estudo avaliar sem precedentes a atividade antimicrobiana in vivo de BthTx-I em frangos de corte. Os parâmetros microbiológicos, bioquímicos e histológicos foram realizados em 84 frangos de corte com 21 dias de idade mantidos em gaiolas com quatro animais cada e densidade de 625 cm2/frango. O experimento foi dividido em três tratamentos com sete repetições de quatro frangos cada um, com duração de sete dias. Os tratamentos foram: 1) dieta com bacitracina de zinco; 2) PLA2-BthTx-I; 3) sem aditivos. Os dados obtidos das variáveis estudadas foram submetidos à análise de variância e teste F ao nível de significância de 5%. As médias dos tratamentos em cada variável foram comparadas pelo teste de Tukey. A contagem cloacal bacteriana de frangos de corte mostrou que o BthTx-I diminuiu a população microbiana sem comprometer o peso corporal, a morfologia intestinal ou causar danos histopatológico no fígado e rins. Concluiu-se que a toxina apresentou atividade in vivo, sendo uma alternativa para um melhor desempenho na produção de frangos de corte, pois agiu diminuindo a carga microbiana de bactérias potencialmente patogênicas na microbiota intestinal das aves e não causou danos musculares, hepáticos ou renais na dosagem avaliada.

Soroepidemiological survey of chlamydia abortus infection in bovine in the State of Pernambuco, Brazil / Inquérito soroepidemiológico da infecção por chlamydia abortus em bovinos no Estado de Pernambuco, Brasil

The objective of this study was to conduct a seroepidemiological survey of Chlamydia abortus infection in dairy cattle herds. A total of 303 blood serum samples were collected from 24 property in Vale do Ipanema microregion in the state of Pernambuco, Brazil. For the diagnosis of C. abortus infection, a commercial enzyme immunoassay kit (ELISA) was used. A prevalence of 34.0% (103/303; 95% CI: 28.7%-39.7%) of infected animals was identified. In 79.8% (19/24) of the properties, at least one infected animal was detected. The risk factors identified were: semi-intensive system (OR = 3.47, p ≤ 0.000), extensive system (OR = 8.14; p ≤ 0.000), supply of water in troughs and directly at the fountain (OR = 2.29, p = 0.002), pasture rent (OR = 1.72, p = 0.041), use of artificial insemination (AI) (OR = 3.07, p = 0.002), and use of AI associated with natural mount (OR = 2.22, p = 0.003). The occurrence of C. abortus infection in dairy cattle in the state of Pernambuco, Brazil, was recorded for the first time. It is concluded that the infection by this agent is present in the analyzed herds and that hygienic and sanitary management measures based on the identified risk factors should be implemented to avoid reproductive losses and losses to the producers.(AU)

Objetivou-se realizar um inquérito soroepidemiológico da infecção por Chlamydia abortus em rebanhos bovinos leiteiros. Foram coletadas 303 amostras de soro sanguíneo de bovinos procedentes de 24 propriedades da microrregião do Vale do Ipanema no estado de Pernambuco, Brasil. Para o diagnóstico da infecção por C. abortus, utilizou-se kit comercial de ensaio imunoenzimático (ELISA). Foi identificada uma prevalência de 34,0% (103/303; IC 95% - 28,7% - 39,7%) de animais positivos. Em 79,8% (19/24) das propriedades foi detectado pelo menos um animal positivo. Os fatores de risco identificados foram: sistema semi-intensivo (OR = 3,47; p= < 0,000), sistema extensivo (OR = 8,14; p = < 0,000); fornecimento de água em cochos e diretamente na fonte (OR = 2,29; p = 0,002); aluguel de pasto (OR = 1,72; p = 0,041); uso de inseminação artificial (IA) (OR = 3,07; p = 0,002) e uso de IA associado à monta natural (OR = 2,22; p = 0,003). Registra-se, pela primeira vez, a ocorrência da infecção por C. abortus em bovinos no estado de Pernambuco, Brasil. Conclui-se que a infecção por esse agente está presente nos rebanhos analisados e que medidas de manejo higiênico-sanitário baseadas nos fatores de risco identificados devem ser implementadas com o intuito de evitar perdas reprodutivas e prejuízos para os produtores.(AU)

Investigation of Listeria monocytogenes, Salmonella enterica and Yersinia enterocolitica in pig carcasses in Southern Brazil / Pesquisa de Listeria monocytogenes, Salmonella enterica and Yersinia enterocolitica em carcaças de suínos no sul do Brasil

The intensification of pig production and advances in the sanitary control of herds profoundly changed the profile of risk attributed to pork consumption. In the actual scenario, most microorganisms related to macroscopic lesions observed in the post mortem inspection are not transmitted by food, while foodborne bacteria of importance to consumer health do not cause macroscopic lesions. In Brazil, the "Ministério da Agricultura, Pecuária e Abastecimento" requested a scientific opinion on the prioritizing of pathogens potentially transmitted by unprocessed pork. After conducting a qualitative risk assessment, only Salmonella enterica was classified as of high risk to consumers. The present study was part of the validation step of the risk assessment and aimed to investigate the frequency of S. enterica, Yersinia enterocolitica and Listeria monocytogenes and hygienic-sanitary indicators in pig carcasses of pigs rose under intensive production and slaughtered under the Federal Inspection System in three slaughterhouses located in Southern Brazil. Additionally, the antimicrobial resistance profile of the isolated pathogens was also investigated. A total of 378 carcasses were sampled by superficial sponges before the chilling step in three slaughterhouses. Samples were investigated for the presence of the three aforementioned pathogens and subjected to enumeration of Colony Formation Units (log CFU.cm-1) of total aerobic mesophiles (TAM) and Enterobacteriaceae. Salmonella strains were tested by disc diffusion test for resistance to eleven antimicrobials. There were significantly statistical differences (p<0.0001) on the median counts of both indicators between the slaughterhouses. The median of TAM was very close for Slaughterhouses A and B: 1.573 log CFU.cm-1 and 1.6014 log CFU.cm-1, respectively. While in Slaughterhouse C, a higher TAM median was detected (2.216 log CFU.cm-1). A similar profile was observed regarding to Enterobacteriaceae, and medians were calculated as follow: -0.426 log CFU.cm-1 in Slaughterhouse A; 0.2163 log CFU.cm-1 in B; and 0.633 log CFU.cm-1 in C. Regarding the pathogens investigated, L. monocytogenes was not detected and only one carcass from Slaughterhouse C was positive for Y. enterocolitica. Thus, the results suggest a very low prevalence of L. monocytogenes and Y. enterocolitica in the sampled population. A total of 65 (17.2%) carcasses were positive for S. enterica, with a difference in frequencies between slaughterhouses and slaughter days. The prevalence of Salmonella positive carcasses was higher in the Slaughterhouse C (25.4%; CI 95% 19-32%) in comparison with A (9.5%; CI 95% 9-14%) and B (18.3%; CI 95% 12-24%). There was no significantly statistical association between Enterobacteriaceae counts and Salmonella isolation on carcass surface (p=0.69). The slaughtering day, nested within the slaughterhouse, explains 31.3% of Salmonella prevalence variability. S. Typhimurium (38.1%) was the most prevalent, followed by S. Infantis (30.1%). Among the 61 Salmonella strains tested for resistance to antimicrobials, 18 (31.6%) were full-susceptible. No strain displayed resistance to azithromycin, ceftazidime, cefotaxime and meropenem. The highest resistance frequency was displayed to tetracycline (54.1%), followed by ampicillin (50.82%), nalidixic acid (42.62%) and chloramphenicol (42.62). Multi-resistance was detected in 52.54% of the, strains. In conclusion, S. enterica is more prevalent in pre-chill pig carcasses than Y. enterocolitica and L. monocytogenes and thus should be prioritized in monitoring and control programs at slaughter. Salmonella serovars varied among slaughterhouses and present significant differences in their resistance to antimicrobials. Slaughterhouses that present higher medians of TAM or Enterobacteriaceae in a monitoring period may have higher S. enterica prevalences as well. However, there is a high variation of S. enterica prevalence among slaughter days, which cannot be always related to the hygienic indicators counts observed on a given day.(AU)

A intensificação da produção de suínos e os avanços no controle sanitário dos rebanhos alterou de forma importante o perfil de risco do consumo de carne suína. No cenário atual, a maioria dos microrganismos causadores de lesões macroscópicas detectáveis na inspeção post mortem não são transmissíveis por alimentos, enquanto bactérias de importância como causadoras de doenças transmitidas por alimentos não causam lesões macroscópicas. No Brasil, o Ministério da Agricultura, Pecuária e Abastecimento solicitou uma opinião científica sobre a priorização de patógenos potencialmente transmitidos pela carne suína in natura. Após conduzir uma avaliação de risco qualitativa, apenas Salmonella enterica foi classificada como de alto risco para o consumidor. O presente estudo foi parte da etapa de validação da avaliação de risco e objetivou: investigar a frequência de S. enterica, Yersinia enterocolitica e Listeria. monocytogenes; e enumerar indicadores higiênico-sanitários em carcaças de suínos abatidos sob inspeção federal em frigoríficos dedicados ao abate de suínos sob sistema intensivo de criação no sul do Brasil. Além disso, o perfil de resistência a antimicrobianos dos patógenos isolados foi investigado. A superfície de um total de 378 carcaças foi amostrada por esponjas, na etapa de pré-resfriamento em três matadouros frigoríficos (A, B, C). As amostras foram investigadas quanto à presença dos três patógenos acima mencionados e quanto à enumeração de Unidades Formadoras de Colônia (log UFC.cm-1) de mesófilos aeróbios totais (MAT) e Enterobacteriaceae. As cepas isoladas de Salmonella foram testadas quanto à resistência a onze antimicrobianos pela técnica de disco difusão. As medianas de contagem de ambos os indicadores apresentaram diferença significativa (p<0,0001) entre matadouros-frigoríficos. A mediana de MAT foi bastante próxima para A e B (1,573 log UFC.cm-1 e 1,6014 log UFC.cm-1, respectivamente), enquanto em C uma mediana de MAT mais elevada foi determinada (2,216 log CFU.cm-1). Um perfil semelhante foi observado em relação a Enterobacteriaceae, sendo as medianas calculadas para A, B e C, respectivamente: -0,426 log CFU.cm-1; 0,2163 log UFC.cm-1; e 0,633 log UFC.cm-1. Em relação aos patógenos investigados, L. monocytogenes não foi detectada e apenas uma carcaça, do Matadouro C, foi positiva para Y. enterocolitica. Portanto, os resultados sugerem uma prevalência muito baixa desses patógenos na população amostrada. Em um total de 65 (17,2%) carcaças houve isolamento de S. enterica, com diferença nas frequências observadas entre matadouros e dias de abate. A prevalência de carcaças positivas para S. enterica foi maior no Matadouro C (25,4%; IC95% 19-32%) em comparação com A (9,5%; IC95% 9-14%) e B (18,3%; IC95% 12-24%). Não houve associação estatística entre o número de Enterobacteriaceae e o isolamento de S. enterica na superfície das carcaças (p=0,69). O dia de abate agrupado por frigorífico explica 31,3% da variação na prevalência de Salmonella. O sorovar mais frequente de S. enterica foi Typhimurium (38,1%) seguido de S. Infantis (30,1%). Entre as 61 cepas de S. enterica testadas quanto à resistência a antimicrobianos, 18 (31,6%) foram totalmente suscetíveis aos antimicrobianos testados. Nenhuma cepa apresentou resistência a azitromicina, ceftazidima, cefotaxima e meropenem. As maiores frequências de resistência foram demonstradas contra tetraciclina (54,1%), ampicilina (50,8%), ácido nalidíxico (42,62%) e cloranfenicol (42,62%). Em 52,54% das cepas foi detectada multi-resistência. Em conclusão, S. enterica é mais prevalente em carcaças suínas no pré-resfriamento do que Y. enterocolitica e L. monocytogenes. Portanto, S. enterica deve ser priorizada em programas de monitoramento e controle ao abate. Os sorovares de Salmonella variam entre matadouros e apresentam diferenças significativas na resistência a antimicrobianos. Matadouros de suínos que apresentam medianas de MAT e Enterobacteriaceae num período de monitoramento podem apresentar também prevalências mais de altas de presença de S. enterica. Entretanto, há uma alta variabilidade na frequência de S. enterica entre dias de abate, e nem sempre há relação entre essa frequência e a contagem de indicadores higiênico-sanitários determinados num determinado dia.(AU)

Survival of Pseudomonas marginalis pv. marginalis in garlic cloves / Sobrevivência de Pseudomonas marginalis pv. marginalis em bulbilhos de alho

Bacterial soft rot of garlic caused by Pseudomonas marginalis pv. marginalis is one of the crops main leaf diseases, and little is known about its dynamics of survival in the clove. Accordingly, this study set out to determine this bacteriums survival in the clove with and without asepsis during storage. Garlic cloves of the Chonan cultivar were inoculated with an isolated rifampicin-resistant mutant of P. marginalis pv. marginalis to distinguish them from other bacteria and were transplanted in the field. The population present in the clove was evaluated at the end of the crop cycle and then on a monthly basis until the sixth month in storage. To quantify the bacterial population, three replications were conducted with ten grams each of cloves with and without asepsis by sodium hypochlorite for three minutes. Serial dilution was then used for isolation, followed by plating in a King B culture medium with rifampicin for selective isolation of the bacterium. After 48 hours of incubation at 28 ºC, the colonies were counted on a monthly basis to analyze their survival in the clove. The results indicate that the bacterium is unable to survive in cloves subjected to asepsis during storage, but it can survive without asepsis for up to three months.

A queima-bacteriana-do-alho causada por Pseudomonas marginalis pv. marginalis é uma das principais doenças foliares da cultura e pouco se conhece de sua dinâmica de sobrevivência no bulbilho. Dentro deste aspecto, o objetivo deste trabalho foi avaliar a sobrevivência desta bactéria no bulbilho com e sem assepsia durante o armazenamento. Bulbilhos de alho do cultivar Chonan foram inoculados com isolado mutante a rifampicina de P. marginalis pv. marginalis para diferenciar de outras bactérias e foram transplantados a campo. Ao final do ciclo da cultura foi avaliada a população presente no bulbilho e mensalmente até o sexto mês de armazenamento. Para quantificação da população bacteriana foram realizadas três repetições composta de dez gramas cada de bulbilhos sem e com assepsia com hipoclorito de sódio por três minutos, seguida do isolamento pela técnica de diluição seriada seguida de plaqueamento em meio de cultura King-B com rifampicina para isolamento seletivo da bactéria. Após incubação de 48 horas a 28 ºC, as colônias foram contadas para analisar mensalmente a sua sobrevivência no bulbilho. Mediante aos resultados obtidos, a bactéria não tem capacidade de sobreviver nos bulbilhos submetidos à assepsia durante o armazenamento, mas consegue sobreviver sem assepsia por até três meses.

Quantification of biogenic amines in fabrication steps of Gorgonzola-type cheese / Quantificação de aminas biogênicas nas etapas de fabricação do queijo tipo Gorgonzola

During the Gorgonzola-type cheese preparation there are proteolysis and lipolysis which may be influenced by the type of starter culture chosen. Six manufacturing steps were selected to identify which of them is most suitable for biogenic amines (BA) formation (1- milk, 2- lactic acid bacterial culture and fungus addition, 3- curd, 4- dry salting, 5- maturation at 30 days and maturation at 60 days); perform research on enterobacteria; accomplish the research of BA-producing bacteria (BAPB); detect and quantify the most abundant BA (putrescine, cadaverine, tyramine, histamine, spermidine and spermine) in the six steps of Gorgonzola cheese production and in bacterial isolates using high performance liquid chromatography and UV-Vis SPD/10AV detector and define if the presence of enterobacteria and BAPB would be correlated with BA production in this cheese. The bacterial culture used increased its log population by 7 log cycles and reached its highest level in batch 2 during cheese maturation. There was a decrease in the enterobacterial population in 2 log cycles after 60 days of maturation in batch 1. Tyramine was the BA with the highest concentration 306.32 mg.Kg-1 quantified in step 6 (60 days maturation) in batch 1. Criterion is requiered in bacterial starter culture selection because it is a quality determinant factor in relation to BA production and more rigor in raw material selection.

Durante a elaboração do queijo tipo Gorgonzola ocorre proteólise a partir das bactérias e dos fungos adicionados ao leite que podem levar a formação de aminas biogênicas (AB) neste tipo de queijo. Portanto, no presente estudo foi feito o acompanhamento com coleta de amostras em seis etapas na fabricação deste queijo paraidentificar em qual delas haveria maior formação de aminas biogênicas (AB). As amostras coletadas em três diferentes lotes foram o leite cru (1), leite pasteurizado adicionado de cultura de bactérias ácido-láticas (2), massa coalhada (3), queijo após a etapa de salga seca (4), queijo após 30 dias de maturação (5) e queijo após 60 dias de maturação (6). Também foram realizadas a pesquisa de enterobactérias e bactérias ácido-láticas com característica capacidade de descarboxilação de aminoácidos e produção de aminas biogênicas (BPAB); detecção e quantificação da AB mais abundante (putrescina, cadaverina, tiramina, histamina, espermidina e espermina) nas seis etapas de fabricação do queijo tipo Gorgonzola e nos isolados bacterianos utilizando cromatografia líquida de alta eficiência e detector UV-Vis SPD/10AV e a verificação se a presença de enterobactérias e BPAB estariam correlacionadas com a produção de AB nesse queijo. A cultura bacteriana utilizada cresceu aumentando em sete ciclos logarítmicos sua população e alcançou seu maior nível no lote 2 na etapa de maturação do queijo. Houve diminuição da população enterobactérias em 2 ciclos logarítmicos após 60 dias de maturação no lote 1. A tiramina foi a AB com concentração mais elevada 306,32 mg.Kg-1 quantificada na etapa 6 (60 dias de maturação) no lote 1. É necessário dar mais atenção em duas etapas na elaboração dos queijos: mais critério na seleção da cultura bacteriana iniciadora por ser um fator determinante na qualidade em relação à produção de AB e mais rigor na seleção da matéria-prima.Palavras chaves: cromatografia, cultura iniciadora, detector SPD/10AV UV­Vis, maturação, tiramina.

Survival of Pseudomonas marginalis pv. marginalis in garlic cloves / Sobrevivência de Pseudomonas marginalis pv. marginalis em bulbilhos de alho

Bacterial soft rot of garlic caused by Pseudomonas marginalis pv. marginalis is one of the crops main leaf diseases, and little is known about its dynamics of survival in the clove. Accordingly, this study set out to determine this bacteriums survival in the clove with and without asepsis during storage. Garlic cloves of the Chonan cultivar were inoculated with an isolated rifampicin-resistant mutant of P. marginalis pv. marginalis to distinguish them from other bacteria and were transplanted in the field. The population present in the clove was evaluated at the end of the crop cycle and then on a monthly basis until the sixth month in storage. To quantify the bacterial population, three replications were conducted with ten grams each of cloves with and without asepsis by sodium hypochlorite for three minutes. Serial dilution was then used for isolation, followed by plating in a King B culture medium with rifampicin for selective isolation of the bacterium. After 48 hours of incubation at 28 ºC, the colonies were counted on a monthly basis to analyze their survival in the clove. The results indicate that the bacterium is unable to survive in cloves subjected to asepsis during storage, but it can survive without asepsis for up to three months.(AU)

A queima-bacteriana-do-alho causada por Pseudomonas marginalis pv. marginalis é uma das principais doenças foliares da cultura e pouco se conhece de sua dinâmica de sobrevivência no bulbilho. Dentro deste aspecto, o objetivo deste trabalho foi avaliar a sobrevivência desta bactéria no bulbilho com e sem assepsia durante o armazenamento. Bulbilhos de alho do cultivar Chonan foram inoculados com isolado mutante a rifampicina de P. marginalis pv. marginalis para diferenciar de outras bactérias e foram transplantados a campo. Ao final do ciclo da cultura foi avaliada a população presente no bulbilho e mensalmente até o sexto mês de armazenamento. Para quantificação da população bacteriana foram realizadas três repetições composta de dez gramas cada de bulbilhos sem e com assepsia com hipoclorito de sódio por três minutos, seguida do isolamento pela técnica de diluição seriada seguida de plaqueamento em meio de cultura King-B com rifampicina para isolamento seletivo da bactéria. Após incubação de 48 horas a 28 ºC, as colônias foram contadas para analisar mensalmente a sua sobrevivência no bulbilho. Mediante aos resultados obtidos, a bactéria não tem capacidade de sobreviver nos bulbilhos submetidos à assepsia durante o armazenamento, mas consegue sobreviver sem assepsia por até três meses.(AU)

Survival assessment of Salmonella enterica in inoculated pork salami / Avaliação da sobrevivência de Salmonella enterica inoculada em salame de carne suína

Pork salami is an embedded, cured and ripened product commonly consumed in Brazil, and the presence of Salmonella enterica has already been reported in this product. During its preparation, the microbiological safety depends on the meat quality, addition of ingredients with antimicrobial activity, hygiene during processing, pH and water activity (Aw) reduction during maturation. In Brazil, the maturation protocol has not been determined in food regulation; therefore, the objectives of this study were (a) to identify the fermentation and drying phases during salami maturation; (b) to test the survival of S. enterica during salami processing; and (c) to compare xylose lysine deoxycholate (XLD) and thin agar layer (TAL) agar for recovering Salmonella. The salami samples were prepared with a cocktail of S. enterica strains, fermented at 30°C and dried at 20°C with controlled relative humidity (RH). Periodic sampling for S. enterica quantification and Aw and pH analyses were performed during maturation, and curves were constructed. Fermentation occurred during the first 66 hours, and the pH decreased while the population of S. enterica increased over the first 21 hours. The drying step was able to reduce the bacterial population by approximately 5 log CFU after 875 hours, reaching an Aw of less than 0.78. However, elimination of S. enterica was not achieved. For Salmonella recovery, TAL agar was more efficient than XLD agar.(AU)

O salame de carne suína é um produto embutido, curado e maturado comumente consumido no Brasil no qual a presença de Salmonella enterica tem sido relatada. Durante a sua elaboração, a segurança microbiológica depende da qualidade da carne, adição de ingredientes com atividade antimicrobiana, higiene durante a produção, redução de pH e atividade de água (Aw) durante a sua maturação. O protocolo de maturação ainda não está determinado na legislação brasileira; portanto o estudo objetivou: (a) identificar as fases de fermentação e dessecação durante a maturação de salame; (b) testar a sobrevivência de S. enterica durante o processamento de salame e (c) comparar os meios de cultura xilose lisina dextrose (XLD) e thin agar layer (TAL) para recuperação de células do referido microorganismo. Os salames foram elaborados com um coquetel de S. enterica e submetidos à fermentação em 30ºC e secagem a 20ºC com umidade relativa (UR) controlada. Amostragens periódicas para quantificação de S. enterica, análises de Aw e pH foram realizadas durante a maturação e as curvas foram construídas. A fermentação ocorreu nas primeiras 66 horas, quando houve queda do pH do salame; entretanto S. enterica aumentou sua população nas primeiras 21 horas. A etapa de dessecação foi capaz de reduzir aproximadamente 5 log UFC da população bacteriana em 875 horas, alcançando Aw menor que 0,78, mas não foi capaz de eliminar o micro-organismo do alimento. Para enumeração do micro-organismo, o meio sólido TAL foi mais eficiente na recuperação das células submetidas à maturação quando comparado ao ágar XLD comumente utilizado.(AU)

Population parameters as a way to evaluate the risk of attack of Aphis craccivora (Hemiptera: Aphididae) on cowpea / Parâmetros populacionais como forma de avaliar os riscos de ataque de Aphis craccivora (Hemiptera: Aphididae) em feijão-caupi

The objective of this research was to develop fertility life tables in order to estimate the population parameters of black aphid (Aphis craccivora Koch) in cowpea (Vigna unguiculata) varieties, aiming to propose a risk scale for its use. The experiment consisted of six treatments and six replicates (five varieties plus the cultivar VITA 7 as a susceptible control). A cohort was formed with six adult females distributed in six replicates of each genotype, and the insects were observed daily. Based on the data, fertility life tables were drawn for each variety and the population parameters were estimated. The different values of the finite growth rate (λ) were considered to propose a risk scale for the use of the genotypes. The results obtained give the dimension of the variability of V. unguiculata in respect to the character, resistance to A. craccivora, with antibiosis as the main mechanism of resistance. Considering all the results, the varieties studied can be classified according to their suitability as a plant favorable to the development of the black aphid as follows: VITA 7 > CE-13 > CE-51 > CE-08 = CE-07. The proposal of a risk scale for the use of V. unguiculata genotypes against the A. craccivora population, based on the finite growth rate (λ) values, was adequate to discriminate the varieties studied.(AU)

Objetivou-se nesta pesquisa elaborar tabelas de vida de fertilidade com o intuito de estimar os parâmetros populacionais de pulgão-preto (Aphis craccivora Koch) em variedades de feijão-caupi (Vigna unguiculata), visando propor uma escala de risco para o seu uso. O experimento constituiu-se em seis tratamentos (cinco variedades mais o cultivar VITA 7 como padrão de suscetibilidade) com seis repetições. Formou-se uma coorte com seis fêmeas adultas distribuídas em cada genótipo, sendo todos os indivíduos observados diariamente. De posse dos dados, foram elaboradas tabelas de vida de fertilidade para cada variedade e estimados os parâmetros populacionais. Para propor uma escala de risco de uso de genótipos, ponderou-se sob os diferentes valores da razão finita de crescimento (λ). Os resultados obtidos dão a dimensão da variabilidade de V. unguiculata com relação ao caráter da resistência a A. craccivora, sendo a antibiose o principal mecanismo de resistência associado. Considerando-se todos os resultados, foi possível hierarquizar as variedades estudadas segundo sua aptidão como planta favorável ao desenvolvimento ao pulgão-preto conforme segue: VITA 7 >> CE-13 > CE-51 > CE-08 = CE-07. A proposta de uma escala de risco do uso de genótipos de V. unguiculata frente à população de A. craccivora, baseada nos valores da razão finita de crescimento (λ), foi adequada para discriminar as variedades estudadas.(AU)