Genetic structure analysis of Mauritia flexuosa natural population from the Lençóis Maranhenses region using microsatellite markers

ABSTRACT Buriti (Mauritia flexuosa L.f), a palm tree native to South America and widely distributed in Brazil, displays significant ecological, economic and biotechnological importance. However, the disorderly extractivism and environmental degradation of its endemic areas are leading to reductions in, and/or extinction of the buriti palm tree, causing ecological imbalance with significant economic losses for rural communities and genetic diversity. Consequently, populational genetic diversity studies have become relevant as a strategy for conserving the species. Therefore, this study evaluated the genetic structure of 10 populations from the Lençóis Maranhenses region, in the state of Maranhão, Brazil, using microsatellite markers. Results indicated that eight pairs displayed a high level of polymorphism in the populations evaluated (98.5 %). The genetic diversity estimations allowed for identifying 220 alleles (average of 9.5 alleles/loci), and the heterozygosity averages observed (Ho) were lower than the heterozygosity expected (He) in the population (0.16 and 0.64) and loci levels (0.15 and 0.65), respectively. The Shannon Index (I) mean value of 1.36 indicated high diversity and genotypic richness in the populations evaluated, while the population index (FST) indicated a low value (0.05) and the fixation index pertaining to individuals indicated a high value (FIS = 0.79) exhibiting a moderate population distribution structure, and pointing to greater diversity between individuals. Based on these results, populations denominated as PA and PB presented a high genetic similarity (0.219), while populations denominated as PF and PJ exhibited more distant genetic characteristics (0.519). These results can be correlated based on prioritization of conservation of this nondomesticated species, influenced by environmental characteristics, suggesting that the genetic diversity found should be conserved in a germplasm bank, and subsequently exploited in breeding programs.

Genetic structure analysis of Mauritia flexuosa natural population from the Lençóis Maranhenses region using microsatellite markers

Buriti (Mauritia flexuosa L.f), a palm tree native to South America and widely distributed in Brazil, displays significant ecological, economic and biotechnological importance. However, the disorderly extractivism and environmental degradation of its endemic areas are leading to reductions in, and/or extinction of the buriti palm tree, causing ecological imbalance with significant economic losses for rural communities and genetic diversity. Consequently, populational genetic diversity studies have become relevant as a strategy for conserving the species. Therefore, this study evaluated the genetic structure of 10 populations from the Lençóis Maranhenses region, in the state of Maranhão, Brazil, using microsatellite markers. Results indicated that eight pairs displayed a high level of polymorphism in the populations evaluated (98.5 %). The genetic diversity estimations allowed for identifying 220 alleles (average of 9.5 alleles/loci), and the heterozygosity averages observed (Ho) were lower than the heterozygosity expected (He) in the population (0.16 and 0.64) and loci levels (0.15 and 0.65), respectively. The Shannon Index (I) mean value of 1.36 indicated high diversity and genotypic richness in the populations evaluated, while the population index (FST) indicated a low value (0.05) and the fixation index pertaining to individuals indicated a high value (FIS = 0.79) exhibiting a moderate population distribution structure, and pointing to greater diversity between individuals. Based on these results, populations denominated as PA and PB presented a high genetic similarity (0.219), while populations denominated as PF and PJ exhibited more distant genetic characteristics (0.519). These results can be correlated based on prioritization of conservation of this non­domesticated species, influenced by environmental characteristics, suggesting that the genetic diversity found should be conserved in a germplasm bank, and subsequently exploited in breeding programs.(AU)

Population structuration and chromosomal features homogeneity in Parodon nasus (Characiformes: Parodontidae): A comparison between Lower and Upper Paraná River representatives

The ichthyofauna of the La Plata hydrographic basin is divided into Upper and Lower Paraná River systems due to the geographic isolation of the Sete Quedas waterfalls, currently flooded by the lake of the Itaipu dam. In Parodontidae, pairs of species, or groups of cryptic species were described between these systems. Although genetic isolation and speciation have already been proposed in other species in the group, Parodon nasus has been maintained as a valid species and distributed throughout the La Plata river basin. In this perspective, specimens of P. nasus from four different sampling sites in the Upper and Lower Paraná River systems were compared regarding the karyotypes, molecular analyzes of population biology and species delimitation to investigate their genetic and population isolation in the La Plata river basin. Despite a geographic barrier and the immense geographic distance separating the specimens sampled from the Lower Paraná River system compared to those from the Upper Paraná River, the data obtained showed P. nasus as a unique taxon. Thus, unlike other species of Parodontidae that showed diversification when comparing the groups residing in the Lower versus Upper Paraná River, P. nasus showed a population structure and a karyotypic homogeneity.(AU)

A ictiofauna do sistema hidrográfico La Plata é dividida em alto e baixo rio Paraná devido ao isolamento geográfico dos Saltos das Sete Quedas há 22 milhões de anos, atualmente inundado pelo lago da represa da Usina de Itaipu. Em Parodontidae, espécies pares ou grupos de espécies crípticas foram descritos entre esses sistemas. Contudo, embora o isolamento genético e especiação já tenham sido propostos em outras espécies do grupo, Parodon nasus tem sido mantido como espécie válida e distribuída em toda a bacia do rio La Plata. Nessa perspectiva, exemplares de P. nasus de quatro diferentes pontos de amostragem nos sistemas do alto e baixo rio Paraná foram comparados quanto ao arranjo dos cariótipos, análises moleculares de biologia populacional e delimitação de espécies, afim de investigar seu isolamento genético e populacional na bacia do rio La Plata. Apesar da barreira geográfica e imensa distância geográfica separando os exemplares amostrados no sistema baixo rio Paraná em comparação àqueles do alto rio Paraná, os dados obtidos demonstraram P. nasus como único táxon válido. Dessa forma, diferentemente de outras espécies de Parodontidae que demonstraram diversificação quando comparados grupos pares residentes no baixo e alto rio Paraná, P. nasus demonstrou estruturação populacional e homogeneidade cariotípica.(AU)

Genetic structure analysis of Mauritia flexuosa natural population from the Lençóis Maranhenses region using microsatellite markers

Buriti (Mauritia flexuosa L.f), a palm tree native to South America and widely distributed in Brazil, displays significant ecological, economic and biotechnological importance. However, the disorderly extractivism and environmental degradation of its endemic areas are leading to reductions in, and/or extinction of the buriti palm tree, causing ecological imbalance with significant economic losses for rural communities and genetic diversity. Consequently, populational genetic diversity studies have become relevant as a strategy for conserving the species. Therefore, this study evaluated the genetic structure of 10 populations from the Lençóis Maranhenses region, in the state of Maranhão, Brazil, using microsatellite markers. Results indicated that eight pairs displayed a high level of polymorphism in the populations evaluated (98.5 %). The genetic diversity estimations allowed for identifying 220 alleles (average of 9.5 alleles/loci), and the heterozygosity averages observed (Ho) were lower than the heterozygosity expected (He) in the population (0.16 and 0.64) and loci levels (0.15 and 0.65), respectively. The Shannon Index (I) mean value of 1.36 indicated high diversity and genotypic richness in the populations evaluated, while the population index (FST) indicated a low value (0.05) and the fixation index pertaining to individuals indicated a high value (FIS = 0.79) exhibiting a moderate population distribution structure, and pointing to greater diversity between individuals. Based on these results, populations denominated as PA and PB presented a high genetic similarity (0.219), while populations denominated as PF and PJ exhibited more distant genetic characteristics (0.519). These results can be correlated based on prioritization of conservation of this non–domesticated species, influenced by environmental characteristics, suggesting that the genetic diversity found should be conserved in a germplasm bank, and subsequently exploited in breeding programs.

Spatial and temporal variation in the population structure of the halftooth, Hemiodus unimaculatus, in the Tucuruí Reservoir on the lower Tocantins River in eastern Brazilian Amazonia / Estrutura populacional e variação espacial da jatuarana escama grossa Hemiodus unimaculatus na área de influência do reservatório de Tucuruí no baixo rio Tocantins, na Amazonia brasileira oriental

The present study investigated the spatiotemporal changes in the structure of the population of the halftooth, Hemiodus unimaculatus (Bloch, 1794), in the area upstream from the Tucuruí hydroelectric dam on the Tocantins River, through quarterly samples obtained in 2001, 2003, 2005 and 2007. The variation in the total length and weight of the specimens was analyzed using the Kruskal-Wallis test, with a 5% significance level, while the spatiotemporal variation in population parameters was evaluated using a cluster analysis and SIMPER. A number of changes were found in the population structure of H. unimaculatus, with an increase in population size, a shift in the proportion of juveniles and adults, and alterations of the spatial distribution of the fish. The lack of data on the species and its occurrence in the study area reinforce the need for the development of adequate management measures to avoid overfishing in the future.

O presente estudo investigou as mudanças espaço-temporais na estrutura da população da jatuarana escama grossa, Hemiodus unimaculatus (Bloch, 1794), na área a montante da hidrelétrica de Tucuruí, no rio Tocantins, através de amostras trimestrais obtidas em 2001, 2003, 2005 e 2007. A variação no comprimento total e peso dos espécimes foi analisada pelo teste de Kruskal-Wallis, com nível de significância de 5%, enquanto a variação espaço-temporal nos parâmetros populacionais foi avaliada por meio de análise de agrupamento e SIMPER. Algumas mudanças foram encontradas na estrutura populacional de H. unimaculatus com aumento do comprimento total dos indivíduos, modificação na proporção de jovens e adultos e mudanças na distribuição espaço-temporal. A falta de dados sobre a espécie e sua ocorrência na área de estudo reforçam a necessidade do desenvolvimento de medidas de manejo adequadas para evitar a sobrepesca no futuro.

Spatial and temporal variation in the population structure of the halftooth, Hemiodus unimaculatus, in the Tucuruí Reservoir on the lower Tocantins River in eastern Brazilian Amazonia / Estrutura populacional e variação espacial da jatuarana escama grossa Hemiodus unimaculatus na área de influência do reservatório de Tucuruí no baixo rio Tocantins, na Amazonia brasileira oriental

The present study investigated the spatiotemporal changes in the structure of the population of the halftooth, Hemiodus unimaculatus (Bloch, 1794), in the area upstream from the Tucuruí hydroelectric dam on the Tocantins River, through quarterly samples obtained in 2001, 2003, 2005 and 2007. The variation in the total length and weight of the specimens was analyzed using the Kruskal-Wallis test, with a 5% significance level, while the spatiotemporal variation in population parameters was evaluated using a cluster analysis and SIMPER. A number of changes were found in the population structure of H. unimaculatus, with an increase in population size, a shift in the proportion of juveniles and adults, and alterations of the spatial distribution of the fish. The lack of data on the species and its occurrence in the study area reinforce the need for the development of adequate management measures to avoid overfishing in the future.(AU)

O presente estudo investigou as mudanças espaço-temporais na estrutura da população da jatuarana escama grossa, Hemiodus unimaculatus (Bloch, 1794), na área a montante da hidrelétrica de Tucuruí, no rio Tocantins, através de amostras trimestrais obtidas em 2001, 2003, 2005 e 2007. A variação no comprimento total e peso dos espécimes foi analisada pelo teste de Kruskal-Wallis, com nível de significância de 5%, enquanto a variação espaço-temporal nos parâmetros populacionais foi avaliada por meio de análise de agrupamento e SIMPER. Algumas mudanças foram encontradas na estrutura populacional de H. unimaculatus com aumento do comprimento total dos indivíduos, modificação na proporção de jovens e adultos e mudanças na distribuição espaço-temporal. A falta de dados sobre a espécie e sua ocorrência na área de estudo reforçam a necessidade do desenvolvimento de medidas de manejo adequadas para evitar a sobrepesca no futuro.(AU)

Biologia populacional da carapeba listrada, Eugerres brasilianus (Cuvier, 1830), próximo à foz do Rio São Francisco (Brasil) / Populational biology of Brazilian mojarra Eugerres brasilianus (Cuvier, 1830) next to the São Francisco River mouth (Brazil)

Eugerres brasilianus é uma das principais espécies de peixe comerciais no Nordeste do Brasil e no baixo rio São Francisco. O objetivo deste estudo foi avaliar a estrutura populacional da espécie na região. Os peixes foram coletados mensalmente com rede de emalhe, entre maio e dezembro de 2013. De 95 indivíduos capturados, 80% eram fêmeas com comprimento padrão oscilando entre as classes de 17,0 cm e 29,0 cm. A relação peso/comprimento em fêmeas e machos durante os períodos de chuva e estiagem evidenciou crescimento do tipo alométrico negativo. Os estágios de maturação gonadal variaram de B (em maturação) a C (maduro) para as fêmeas durante o período chuvoso, indicando atividade reprodutiva, fato confirmado pelo índice gonadossomático e pelo fator de condição (K), cujos valores foram superiores nas fêmeas (p>0,05). Os resultados indicam que o desenvolvimento da espécie pode estar relacionado ao período pré-reprodutivo, pois o crescimento em comprimento foi maior que em peso.(AU)

Eugerres brasilianus is one of the main marketable species in Northeastern Brazil and in the lower São Francisco River. The objective of this study was to evaluate the population structure of this species in the region. Fish were collected monthly through gillnet from May to December 2013. About 80% of 95 individuals captured were females ranging between the classes 17.0 - 29.0 cm of standard length. The weight/length ratio in females and males during the rainy and dry seasons presented a negative allometric type of growth. Gonadal maturation stages varied from B (under maturation) to C (mature) for females during the rainy season, indicating reproductive activity, a fact confirmed by the gonadosomatic index and the condition factor K, whose values were superior in females (p> 0.05). The results indicate that the species development may be related to the prereproductive period, because the growth in length was greater than in weight.(AU)

Biologia populacional da carapeba listrada, Eugerres brasilianus (Cuvier, 1830), próximo à foz do Rio São Francisco (Brasil) / Populational biology of Brazilian mojarra Eugerres brasilianus (Cuvier, 1830) next to the São Francisco River mouth (Brazil)

Eugerres brasilianus é uma das principais espécies de peixe comerciais no Nordeste do Brasil e no baixo rio São Francisco. O objetivo deste estudo foi avaliar a estrutura populacional da espécie na região. Os peixes foram coletados mensalmente com rede de emalhe, entre maio e dezembro de 2013. De 95 indivíduos capturados, 80% eram fêmeas com comprimento padrão oscilando entre as classes de 17,0 cm e 29,0 cm. A relação peso/comprimento em fêmeas e machos durante os períodos de chuva e estiagem evidenciou crescimento do tipo alométrico negativo. Os estágios de maturação gonadal variaram de B (em maturação) a C (maduro) para as fêmeas durante o período chuvoso, indicando atividade reprodutiva, fato confirmado pelo índice gonadossomático e pelo fator de condição (K), cujos valores foram superiores nas fêmeas (p>0,05). Os resultados indicam que o desenvolvimento da espécie pode estar relacionado ao período pré-reprodutivo, pois o crescimento em comprimento foi maior que em peso.

Eugerres brasilianus is one of the main marketable species in Northeastern Brazil and in the lower São Francisco River. The objective of this study was to evaluate the population structure of this species in the region. Fish were collected monthly through gillnet from May to December 2013. About 80% of 95 individuals captured were females ranging between the classes 17.0 - 29.0 cm of standard length. The weight/length ratio in females and males during the rainy and dry seasons presented a negative allometric type of growth. Gonadal maturation stages varied from B (under maturation) to C (mature) for females during the rainy season, indicating reproductive activity, a fact confirmed by the gonadosomatic index and the condition factor K, whose values were superior in females (p> 0.05). The results indicate that the species development may be related to the prereproductive period, because the growth in length was greater than in weight.

Population structure of Macrobrachium amazonicum in two floodplain lakes of Amazonia / Estrutura populacional de Macrobrachium amazonicum em dois lagos de várzea da Amazônia

The freshwater prawn M. amazonicum is widely consumed by the traditional communities of the Amazon basin. This species is captured by traps throughout the year and particularly during the Amazon dry season, when animals are concentrated in floodplain lakes. The aim of this paper was to know the populational biology of M. amazonicum in the Macurany and Catispera lakes, both located in the city of Parintins, Amazonas, Brazil. Samples were collected monthly from September 2009 to April 2010, using regional fishing gear. Males, females and total fertility were significantly higher in Catispera lake. The largest ovigerous female was recorded for the Catispera lake (56.2 mm) and low to the Macurany lake (18.3 mm). Sexually undifferentiated individuals were captured throughout the collection period in both lakes. It was observed a higher proportion of females than males (1:2.6) in Macurany lake. The reproductive peak was in the full-flood period (December to April). It may be related to the greatest flow of river and overflowing the banks of lakes, which contribute to larvae dispersion.(AU)

Macrobrachium amazonicum é uma espécie de camarão amplamente consumida pelas comunidades tradicionais da Bacia Amazônica, sendo capturada de forma artesanal ao longo de todo ano e especialmente no período de seca amazônica, quando se concentra no interior dos lagos de várzea. O objetivo deste trabalho foi avaliar a estrutura populacional deste crustáceo nos lagos do Macurany e do Catispera, ambos situados no município de Parintins/Amazonas, a partir dos seguintes aspectos: comprimento total, razão sexual, distribuição temporal, fecundidade e período reprodutivo. Espécimes de M. amazonicum foram coletados mensalmente, de setembro de 2009 a abril de 2010, utilizando-se artes de pesca regionais (camaroeiras). Considerando os dois lagos, os tamanhos médios de machos e de fêmeas e a fecundidade total foram significativamente maiores no lago do Catispera. A maior fêmea ovígera foi registrada no lago do Catispera (56,2 mm de CT) e a menor, no lago do Macurany (18,3 mm de CT). Indivíduos sexualmente indiferenciados foram capturados ao longo de todo o período de coletas nos dois lagos. Na população estudada, verificouse maior proporção de fêmeas, sendo o maior desvio registrado no lago do Macurany (1:2,6). O período de enchente-cheia (dezembro-abril) foi identificado como o de ocorrência do pico reprodutivo desta espécie na região. Possivelmente, o momento de maior vazão do rio etransbordamento da água dos lagos favorece a dispersão das larvas.(AU)

Population structure of Macrobrachium amazonicum in two floodplain lakes of Amazonia / Estrutura populacional de Macrobrachium amazonicum em dois lagos de várzea da Amazônia

The freshwater prawn M. amazonicum is widely consumed by the traditional communities of the Amazon basin. This species is captured by traps throughout the year and particularly during the Amazon dry season, when animals are concentrated in floodplain lakes. The aim of this paper was to know the populational biology of M. amazonicum in the Macurany and Catispera lakes, both located in the city of Parintins, Amazonas, Brazil. Samples were collected monthly from September 2009 to April 2010, using regional fishing gear. Males, females and total fertility were significantly higher in Catispera lake. The largest ovigerous female was recorded for the Catispera lake (56.2 mm) and low to the Macurany lake (18.3 mm). Sexually undifferentiated individuals were captured throughout the collection period in both lakes. It was observed a higher proportion of females than males (1:2.6) in Macurany lake. The reproductive peak was in the full-flood period (December to April). It may be related to the greatest flow of river and overflowing the banks of lakes, which contribute to larvae dispersion.

Macrobrachium amazonicum é uma espécie de camarão amplamente consumida pelas comunidades tradicionais da Bacia Amazônica, sendo capturada de forma artesanal ao longo de todo ano e especialmente no período de seca amazônica, quando se concentra no interior dos lagos de várzea. O objetivo deste trabalho foi avaliar a estrutura populacional deste crustáceo nos lagos do Macurany e do Catispera, ambos situados no município de Parintins/Amazonas, a partir dos seguintes aspectos: comprimento total, razão sexual, distribuição temporal, fecundidade e período reprodutivo. Espécimes de M. amazonicum foram coletados mensalmente, de setembro de 2009 a abril de 2010, utilizando-se artes de pesca regionais (camaroeiras). Considerando os dois lagos, os tamanhos médios de machos e de fêmeas e a fecundidade total foram significativamente maiores no lago do Catispera. A maior fêmea ovígera foi registrada no lago do Catispera (56,2 mm de CT) e a menor, no lago do Macurany (18,3 mm de CT). Indivíduos sexualmente indiferenciados foram capturados ao longo de todo o período de coletas nos dois lagos. Na população estudada, verificouse maior proporção de fêmeas, sendo o maior desvio registrado no lago do Macurany (1:2,6). O período de enchente-cheia (dezembro-abril) foi identificado como o de ocorrência do pico reprodutivo desta espécie na região. Possivelmente, o momento de maior vazão do rio etransbordamento da água dos lagos favorece a dispersão das larvas.

MARCADORES MOLECULARES PARA CARACTERIZAÇÃO DA ESTRUTURA POPULACIONAL, DIVERSIDADE GENÉTICA E RELAÇÃO DE PARENTESCO EM OVINO SANTA INÊS

Objetivou-se com esse estudo caracterizar a estrutura populacional, a diversidade genética e estimar as relações de parentesco em rebanhos de ovino Santa Inês criados no Meio-Norte brasileiro, através da utilização de marcadores moleculares. Para tanto, coletou-se sangue de 257 ovinos Santa Inês de seis diferentes populações nos estados do Piauí e Maranhão. O DNA extraído foi qualificado por eletroforese em gel de agarose. Para análises com microssatélite, foram realizadas PCRs a partir de 20 loci recomendados pela FAO. As amostras amplificadas foram genotipadas por eletroforese em gel de poliacrilamida e revelação em nitrato de prata. As análises foram realizadas em diversos programas estatísticos para caracterização populacional, diversidade genética e estimação das relações de parentesco. Para as análises com SNP, o painel Ovine SNP50BeadChip foi utilizado para genotipagem dos indivíduos, sendo utilizado 47.069 SNPs para gerar a matriz de parentesco. As análises de controle de qualidade foram realizadas através do programa PREGSF90 da família deprogramas BLUPF90.No Capitulo 1, foram estimados parâmetros populacionais para análise da estrutura populacional e diversidade genética. Todos os loci apresentaram-se altamente polimórficos e com alto poder de descriminação, mostrando-se importantes para esse estudo. Os marcadores demonstraram alto potencial para inferir parentesco, apresentando probabilidade de exclusão maior que 0,74. Cinco dos seis rebanhos apresentaram desvio do equilíbrio de Hardy-Weinberg. O nível de diversidade genética apresentou uma média de 0,89 ± 0,2, mostrando que os rebanhos possuem alta variabilidade genética. Foram detectados indícios de gargalo e erosão genética, indicando que as populações estudadas apresentavam moderada diferenciação genética, com ocorrência de migração entre as fazendas. No Capitulo 2, estimou-se as relações de parentesco utilizando marcadores microssatélite e SNP. Para tanto, foram geradas matrizes de parentesco genômico dos indivíduos estudado. Com os marcadores microssatélite, a relação foi estimada através do programa coancestry pelo estimador DyadML em diferentes painéis utilizando 10, 12, 15 e 19 loci. Todos os painéis foram capazes de estimar a relação e inferir quatro categorias de parentesco, sendo irmãos completo (IC), meio irmãos (MI), pai-filho (PF) e não relacionada (NR). Contudo, à medida que diminuiu o número de marcadores aumentou a variação em torno dos valores de parentesco que é esperado para cada categoria. A matriz de parentesco gerada pelo marcador SNP apresentou valores de parentesco variando de 0 a 0,66, com média de 0,04, corroborando com os valores encontrados nos microssatélites. Além disso, a matriz de parentesco SNP apresentou-se altamente correlacionada com as matrizes geradas nos quatro painéis de microssatélite. Os resultados encontrados indicam que rebanhos Santa Inês presente na região Meio-Norte do Brasil apresenta alta variabilidade genética com moderada estruturação populacional. As estimativas de parentesco realizadas através de microssatélites foram capazes de estimar a relação entre indivíduos com confiança de 95%, indicando a aplicabilidade desse marcador para estimarem parentesco. Assim, metodologias como essas podem ser inseridas em programa de melhoramento e conservação de recursos genéticos, oferecendo ganho tanto para a espécie como para os produtores.

The focus of this study was characterizing the populational structure, genetic diversity and relatedness in flock of sheep Santa Ines living in Brazilian Middle-North, through molecular markers utilization. In order, blood was collected of 257 santa ines sheep in six different populations present in states Piaui and Maranhão. From the blood, the DNA was extracted and qualified by agarose electrophoresis gel. In addition, with extract DNA was realized essay with microsatellites, utilizing PCRs of recommend 20 loci by FAO. The samples were genotyping by polyacrylamide electrophoresis gel and revealed in silver nitrate. The analysis of data was made in several programs according to the purpose. To analyze of SNP, the panel Ovine SNP500 BreadChip was utilized to genotyper of individuals, generating a relatedness matrix using 47.069 SNP data. The analysis of quality control was realized through the program PREGSF90 of the program family BLUPF90. The Chapter 1 estimated populational parameters to analysis populational structure and genetic diversity. The analyze resulted in all loci shown highly polymorphic and high power of discrimination, the results were important to this study. The markers showed high potential to relatedness inference with exclusion probability superior 0.74. Five of six flocks demonstrated deviation from Hardy-Weinberg equilibrium. The genetic diversity level had mean of 0.89 ± 0.2, demonstrating the flock have high genetic variability. With data was detected evidences of bottlenecks and genetic eruption, indicating that populations present in this study have moderate genetic differentiation with migrations occurs between farms. In Chapter 2, was estimate the relatedness using microsatellite markers and SNP. In order, was created genomic kindship matrix of individuals. Based markers microsatellite data, the relation was estimated by coancestry program with estimator DyadML in different panels utilizing 10, 12, 15 and 19 loci. Based on results was analyzed that all panels were capable to estimate the relatedness and inference of four categories of kindship, being full-siblings (FS), half-siblings (HS), Parents-offspring (PO) and unrelated (UR). However, the reducing of markers numbers increased the variation around relatedness values in each category. The relationship matrix generated by SNP markers present variant values of 0 until 0.66, with mean of 0.04, corroborating with microsatellite values. Furthermore, the SNP kindship matrix have elevated correlation with the matrices of four microsatellite panels. The findings indicate the Santa ines flocks living in Middle-North region of Brazil present high genetic variability with moderate populational structure. The estimative of relatedness through microsatellite are able to determinate the relations between individuals with 95% of assurance, indicating the applicability of these markers to relatedness estimative. Thus, these methodologies can be insert in an improvement program and genetic resources conservation, offering benefits to the specie and productors.

Bioecologia do robalo-flexa, Centropomus undecimalis, em lagoa costeira tropical no norte do Brasil / Bioecology of common snook, Centropomus undecimalis, in a tropical lagoon at the Brazil North Coast

The aim of the study was to investigate the bioecology of the common snook Centropomus undecimalis captured in the so-called Salina lagoon, at the mangrove coast of Pará State, to determine its populational biology in conjunction to environmental conditions and variations. Samples and measurements were carried out monthly along an year using a gillnet and analyzed in terms of populational structure, including length/weight measurements and their relationships, recruitment period, condition factor and gonodal stage. Environmental parameters, especially water quality, were monitored and correlated with biological data. 344 specimens were captured and their length ranged from 3.4 to 29.6 cm, within a weight range from 0.4 to 209.31 g. Histological analysis revealed that the captured specimens were immature males. The species presented a negative alometric growth, based on weight-length relationship (WT = 0.00088 LT 2.94). The time distribution showed that the common snook is on recruitment during March, May, September/2007 and January/2008. The relative condition factor values indicate that in general the specimens presented good nutritional condition, with exception of October. Among the analyzed environmental aspects, only salinity, pH and conductivity presented substantial seasonal variations as well as extreme values. However, common snook presented a good development, proving its ecological plasticity. Furthermore, the results show that Salina lagoon is an important ecosystem to the species life-history, working as nursery area.(AU)

O objetivo deste estudo foi investigar a bioecologia do robalo-flexa, Centropomus undecimalis, capturado na lagoa Salina, nordeste do Pará, no intuito de determinar a biologia populacional da espécie, associada às condições ambientais às quais está exposta. Mensalmente, ao longo de um ano, exemplares de robalo-flexa foram capturados com rede de emalhar e então determinados a estrutura populacional em comprimento e peso, a relação peso-comprimento, o período de recrutamento, o fator de condição relativo e o estádio gonadal. Variáveis abióticas da água foram monitoradas e correlacionadas aos dados biológicos de 344 exemplares, cujo comprimento e peso total variaram de 3,4 a 29,6 cm e de 0,4 a 209,31 g, respectivamente. O robalo-flexa apresentou crescimento alométrico negativo, obtido pela relação peso-comprimento (PT = 0,00088 CT 2,94). A distribuição mensal do comprimento total demonstrou que o recrutamento do robalo-flexa na lagoa ocorreu nos meses de março, maio e setembro/2007 e janeiro/2008. Os indivíduos analisados eram machos imaturos. Os valores do fator de condição relativo indicaram que o robalo-flexa apresentou boa condição nutricional, exceto em outubro. A salinidade, condutividade e pH apresentaram variação sazonal, bem como valores extremos. Porém, o robalo-flexa apresentou bom desenvolvimento, comprovando a plasticidade ecológica da espécie. A lagoa Salina é um ecossistema importante no ciclo de vida do robalo-flexa, pois funciona como área de berçário.(AU)

Bioecologia do robalo-flexa, Centropomus undecimalis, em lagoa costeira tropical no norte do Brasil / Bioecology of common snook, Centropomus undecimalis, in a tropical lagoon at the Brazil North Coast

The aim of the study was to investigate the bioecology of the common snook Centropomus undecimalis captured in the so-called Salina lagoon, at the mangrove coast of Pará State, to determine its populational biology in conjunction to environmental conditions and variations. Samples and measurements were carried out monthly along an year using a gillnet and analyzed in terms of populational structure, including length/weight measurements and their relationships, recruitment period, condition factor and gonodal stage. Environmental parameters, especially water quality, were monitored and correlated with biological data. 344 specimens were captured and their length ranged from 3.4 to 29.6 cm, within a weight range from 0.4 to 209.31 g. Histological analysis revealed that the captured specimens were immature males. The species presented a negative alometric growth, based on weight-length relationship (WT = 0.00088 LT 2.94). The time distribution showed that the common snook is on recruitment during March, May, September/2007 and January/2008. The relative condition factor values indicate that in general the specimens presented good nutritional condition, with exception of October. Among the analyzed environmental aspects, only salinity, pH and conductivity presented substantial seasonal variations as well as extreme values. However, common snook presented a good development, proving its ecological plasticity. Furthermore, the results show that Salina lagoon is an important ecosystem to the species life-history, working as nursery area.

O objetivo deste estudo foi investigar a bioecologia do robalo-flexa, Centropomus undecimalis, capturado na lagoa Salina, nordeste do Pará, no intuito de determinar a biologia populacional da espécie, associada às condições ambientais às quais está exposta. Mensalmente, ao longo de um ano, exemplares de robalo-flexa foram capturados com rede de emalhar e então determinados a estrutura populacional em comprimento e peso, a relação peso-comprimento, o período de recrutamento, o fator de condição relativo e o estádio gonadal. Variáveis abióticas da água foram monitoradas e correlacionadas aos dados biológicos de 344 exemplares, cujo comprimento e peso total variaram de 3,4 a 29,6 cm e de 0,4 a 209,31 g, respectivamente. O robalo-flexa apresentou crescimento alométrico negativo, obtido pela relação peso-comprimento (PT = 0,00088 CT 2,94). A distribuição mensal do comprimento total demonstrou que o recrutamento do robalo-flexa na lagoa ocorreu nos meses de março, maio e setembro/2007 e janeiro/2008. Os indivíduos analisados eram machos imaturos. Os valores do fator de condição relativo indicaram que o robalo-flexa apresentou boa condição nutricional, exceto em outubro. A salinidade, condutividade e pH apresentaram variação sazonal, bem como valores extremos. Porém, o robalo-flexa apresentou bom desenvolvimento, comprovando a plasticidade ecológica da espécie. A lagoa Salina é um ecossistema importante no ciclo de vida do robalo-flexa, pois funciona como área de berçário.

Advertisement call of Dendropsophus microps (Anura: Hylidae) from two populations from southeastern Brazil

In anurans, acoustic communication is a major mechanism of pre-zygotic isolation, since it carries information about species recognition. Detailed descriptions of the acoustic properties of anuran advertisement calls provide important data to taxonomist and to the understanding of the evolution of the group. Herein we re-describe the advertisement call of the hylid frog Dendropsophus microps (Peters, 1872) after analyzing a larger sample than that of previous descriptions. We also compare the acoustic properties of the call in two populations and discuss the effect of the presence of the sister species, Dendropsophus giesleri (Mertens, 1950), a potential competitor, in one of the populations. Additionally, we provide information on calling sites and size of males. Males of D. microps emit two types of calls, which differ mainly in pulse repetition rate. Type "A" call has a mean frequency band varying from 4574 to 5452 Hz, (mean dominant frequency = 4972 Hz). Type "B" call has a mean frequency band varying from 4488 to 5417 Hz (mean dominant frequency = 4913 Hz). The calls of D. microps and D. giesleri are the only in the D. parviceps species group that have harmonic structure. The spectral properties of the call showed low intra-individual variation, being considered static, while the temporal properties were highly variable. Compared with males from the Boracéia population, males from the Ribeirão Grande population called from lower perches, and their calls had slightly lower frequency bands and significantly higher pulse rates in their type "B" calls. Inter-populational differences in acoustic properties, body size and use of calling sites could be related to selective forces associated with the presence of the sister species, a potential competitor for the population from Ribeirão Grande.

Advertisement call of Dendropsophus microps (Anura: Hylidae) from two populations from southeastern Brazil

In anurans, acoustic communication is a major mechanism of pre-zygotic isolation, since it carries information about species recognition. Detailed descriptions of the acoustic properties of anuran advertisement calls provide important data to taxonomist and to the understanding of the evolution of the group. Herein we re-describe the advertisement call of the hylid frog Dendropsophus microps (Peters, 1872) after analyzing a larger sample than that of previous descriptions. We also compare the acoustic properties of the call in two populations and discuss the effect of the presence of the sister species, Dendropsophus giesleri (Mertens, 1950), a potential competitor, in one of the populations. Additionally, we provide information on calling sites and size of males. Males of D. microps emit two types of calls, which differ mainly in pulse repetition rate. Type "A" call has a mean frequency band varying from 4574 to 5452 Hz, (mean dominant frequency = 4972 Hz). Type "B" call has a mean frequency band varying from 4488 to 5417 Hz (mean dominant frequency = 4913 Hz). The calls of D. microps and D. giesleri are the only in the D. parviceps species group that have harmonic structure. The spectral properties of the call showed low intra-individual variation, being considered static, while the temporal properties were highly variable. Compared with males from the Boracéia population, males from the Ribeirão Grande population called from lower perches, and their calls had slightly lower frequency bands and significantly higher pulse rates in their type "B" calls. Inter-populational differences in acoustic properties, body size and use of calling sites could be related to selective forces associated with the presence of the sister species, a potential competitor for the population from Ribeirão Grande.(AU)

Populational biology of three Penaeidae shrimps (Decapoda) in the Curuçá estuary on the northern coast of Brazil / Biologia populacional de camarões Penaeidae (Decapoda) no estuário de Curuçá, costa norte do Brasil

Sex ratio, population structure, and relative growth of Farfantepenaeus subtilis (Pérez-Farfante, 1967), Litopenaeus schmitti (Burkenroad, 1936), and Xiphopenaeus kroyeri (Heller, 1862) were studied in the Curuçá estuary, State of Pará, northern coast of Brazil. Samples were collected bimonthly from July 2003 to July 2004 using a wing trawl net. Each shrimp was identified and weighed, carapace length was measured, and sex was determined. We obtained 4,818 specimens of F. subtilis, 732 specimens of L. schmitti, and 608 specimens of X. kroyeri. Mean carapace length and weight were 11.95 mm and 1.29 g for F. subtilis, 15.32 mm and 3.67 g for L. schmitti, and 12.78 mm and 0.97 g for X. kroyeri, respectively. The sex proportion (males/females) was 0.8 for F. subtilis, 0.7 for L. schmitti, and 0.6 for X. kroyeri, with significant differences (P 0.05) for the three species studied. Farfantepenaeus subtilis and L. schmitti had positive allometric growth, while X. kroyeri had negative allometric growth. For F. subtilis two important recruitment periods were observed.The largest period occurred in March; and the other, less intense, began in September. For L. schmitti, recruitment occurred in July and in March. Xiphopenaeus kroyeri didnt occur in November, with recruitment in January. Results show the importance of the Curuçá estuary in the development of these shrimps,and the information obtained is important for future management plans for its capture in this area.(AU)

A razão sexual, a estrutura populacional e o crescimento relativo de Farfantepenaeus subtilis (Pérez-Farfante, 1967), Litopenaeus schmitti (Burkenroad, 1936) e Xiphopenaeus kroyeri (Heller, 1862) foram estudados no estuário de Curuçá, Estado do Pará, costa norte do Brasil. As amostras foram coletadas bimestralmente, de julho de 2003 a julho de 2004, utilizando uma rede de arrasto wing trawl. Cada camarão foi identificado, mensurado pelo seu comprimento da carapaça, pesado, e teve o sexo determinado. Foram obtidos 4.818 espécimes de F. subtilis, 732 de L. schmitti e 608 de X. kroyeri. Os valores médios dos comprimentos da carapaça e dos pesos foram 11,95 mm e 1,29 g para F. subtilis, 15,32 mm e 3,67 g para L. schmitti e 12,78 mm e 0,97 g para X. kroyeri, respectivamente. A proporção sexual (machos/fêmeas) foi de 0,8 para F. subtilis, 0,7 para L. schmitti e 0,6 para X. kroyeri, com diferenças significativas (P 0,05) para as três espécies estudadas. Farfantepenaeus subtilis e L. schmitti apresentaram crescimento alométrico positivo, enquanto X. kroyeri teve crescimento alométrico negativo. Para F. subtilis foram observados dois importantes períodos de recrutamento. O maior ocorreu em março; e o outro, menos intenso, iniciou em setembro. Para L. schmitti, o recrutamento ocorreu em julho e em março. Xiphopenaeus kroyeri foi ausente em novembro, com recrutamento em janeiro. Os resultados demonstram a importância do estuário Curuçá para o desenvolvimento desses camarões, sendo as informações obtidasimportantes para futuros planos de gestão de sua captura na área.(AU)

Populational biology of three Penaeidae shrimps (Decapoda) in the Curuçá estuary on the northern coast of Brazil / Biologia populacional de camarões Penaeidae (Decapoda) no estuário de Curuçá, costa norte do Brasil

Sex ratio, population structure, and relative growth of Farfantepenaeus subtilis (Pérez-Farfante, 1967), Litopenaeus schmitti (Burkenroad, 1936), and Xiphopenaeus kroyeri (Heller, 1862) were studied in the Curuçá estuary, State of Pará, northern coast of Brazil. Samples were collected bimonthly from July 2003 to July 2004 using a wing trawl net. Each shrimp was identified and weighed, carapace length was measured, and sex was determined. We obtained 4,818 specimens of F. subtilis, 732 specimens of L. schmitti, and 608 specimens of X. kroyeri. Mean carapace length and weight were 11.95 mm and 1.29 g for F. subtilis, 15.32 mm and 3.67 g for L. schmitti, and 12.78 mm and 0.97 g for X. kroyeri, respectively. The sex proportion (males/females) was 0.8 for F. subtilis, 0.7 for L. schmitti, and 0.6 for X. kroyeri, with significant differences (P 0.05) for the three species studied. Farfantepenaeus subtilis and L. schmitti had positive allometric growth, while X. kroyeri had negative allometric growth. For F. subtilis two important recruitment periods were observed.The largest period occurred in March; and the other, less intense, began in September. For L. schmitti, recruitment occurred in July and in March. Xiphopenaeus kroyeri didn’t occur in November, with recruitment in January. Results show the importance of the Curuçá estuary in the development of these shrimps,and the information obtained is important for future management plans for its capture in this area.

A razão sexual, a estrutura populacional e o crescimento relativo de Farfantepenaeus subtilis (Pérez-Farfante, 1967), Litopenaeus schmitti (Burkenroad, 1936) e Xiphopenaeus kroyeri (Heller, 1862) foram estudados no estuário de Curuçá, Estado do Pará, costa norte do Brasil. As amostras foram coletadas bimestralmente, de julho de 2003 a julho de 2004, utilizando uma rede de arrasto wing trawl. Cada camarão foi identificado, mensurado pelo seu comprimento da carapaça, pesado, e teve o sexo determinado. Foram obtidos 4.818 espécimes de F. subtilis, 732 de L. schmitti e 608 de X. kroyeri. Os valores médios dos comprimentos da carapaça e dos pesos foram 11,95 mm e 1,29 g para F. subtilis, 15,32 mm e 3,67 g para L. schmitti e 12,78 mm e 0,97 g para X. kroyeri, respectivamente. A proporção sexual (machos/fêmeas) foi de 0,8 para F. subtilis, 0,7 para L. schmitti e 0,6 para X. kroyeri, com diferenças significativas (P 0,05) para as três espécies estudadas. Farfantepenaeus subtilis e L. schmitti apresentaram crescimento alométrico positivo, enquanto X. kroyeri teve crescimento alométrico negativo. Para F. subtilis foram observados dois importantes períodos de recrutamento. O maior ocorreu em março; e o outro, menos intenso, iniciou em setembro. Para L. schmitti, o recrutamento ocorreu em julho e em março. Xiphopenaeus kroyeri foi ausente em novembro, com recrutamento em janeiro. Os resultados demonstram a importância do estuário Curuçá para o desenvolvimento desses camarões, sendo as informações obtidasimportantes para futuros planos de gestão de sua captura na área.

O EFEITO DE BARRAGENS HIDRELETRICAS SOBRE POPULACOES DE PEIXES DE RIOS DE AGUAS PRETAS NA AMAZONIA: UMA ABORDAGEM COM O USO DE MARCADORES BIOGEOQUIMICOS E MOLECULARES

Um efeito bastante estudado da construcao de barragens hidreletricas e a formacao de uma barreira fisica aos movimentos migratorios de especies que precisam realiza-los para completar seu ciclo de vida. Contudo, a conservacao da variabilidade genetica e da diversidade biologica das populacoes e fundamental para o funcionamento dos ecossistemas e manutencao das especies de peixes, no que concerne a sua habilidade de adaptacao e resposta as frequentes mudancas ambientais. Este estudo objetivou estudar o efeito de barragens hidreletricas sobre a dinamica de movimentos e a estrutura genetica de populacoes de peixes da Amazonia, por meio de um estudo de caso com a populacao de Cichla temensis do rio Uatuma, barrado pela Usina Hidreletrica de Balbina, e do rio Jatapu, um afluente nao impactado, para testar a hipotese central de que: O barramento do rio Uatuma formou barreira fisica e ecologica a movimentacao dos peixes e ao fluxo genico entre a populacao de C. temensis originaria do rio Uatuma. Para tanto, foram realizadas analises biogeoquimicas para entender a dinamica de movimentos dos peixes, a partir das assinaturas isotopicas de 87Sr/86Sr em otolitos, escamas e aguas, por meio da espectrometria de massa com fonte de plasma e multicoletor, com ablacao a laser para os otolitos e escamas (MC-LA-ICPMS), e analises moleculares para determinar os parametros populacionais, a partir de amostras biologicas (fragmento da nadadeira pelvica), utilizando uma ferramenta genomica por meio dos SNPs, aplicando a metodologia de RADseq. Foram analisados efetivamente 88 otolitos, 20 escamas, 78 amostras de nadadeira de C. temensis e quatro amostras de agua do rio Uatuma. A biogeoquimica nos permitiu observar os impactos diretos da fragmentacao do rio Uatuma, devido a implantacao da Usina Hidroeletrica de Balbina, sobre os padroes comportamentais relacionados aos movimentos de dispersao da populacao originaria de C. temensis do rio Uatuma, principalmente aqueles que habitam a area de influencia direta da barragem. Ja atraves da genomica, observamos que a barragem forcou uma estruturacao da populacao originaria de C. temensis, dividindo-a em dois subgrupos populacionais, um a montante e outro a jusante. Espera-se que esta pesquisa sirva de subsidios para novos estudos, visando que os recursos pesqueiros possam ser manejados adequadamente e avaliados de forma eficiente nos diagnosticos ambientais de empreendimentos hidreletricos.

A widely studied effect of the hydroelectric dams is the habitat fragmentation due the physical barrier originated by their construction. These barriers could be an obstacle to the migratory movements of fish species, which need to realize them to complete their life cycle. The most the studies were developed to understand the dams effects on these migratory species and few studies were done taking non-migratory species as target species. The conservation of populational genetic variability is fundamental to the conservation of fish species, including non-migratory ones, and, as consequence, to the maintenance of healthy ecosystems. This study evaluated the effect of the Balbina hydroelectric dam on the movement dynamics and genetic structure of the population of Cichla temensis, to answer a central question Is the Balbina hydroelectric dam on the Uatuma river a physical and ecological barrier to fish movement and gene flow among C. temensis population?. To reach this question were performed biogeochemical analyzes based on isotopic signatures of 87Sr/86Sr of otoliths, scales and waters, by mass spectrometry with plasma source and multicoletor, with laser ablation (MC-LA- ICPMS), and molecular analyzes to determine population parameters from biological samples (pelvic fin fragment) using a genomic tool using SNP's, applying the RADseq methodology. Were effectively analyzed 88 otoliths, 20 scales, 78 fin samples from C. temensis and 4 water samples from the Uatuma River. Biogeochemistry allowed us to observe the direct impacts of the fragmentation of the Uatuma river, due to the implementation of the Balbina Hydroelectric Dam, on the behavioral patterns related to the dispersal movements of the population originating from C. temensis of the Uatuma river, especially those inhabiting the area directly under dam influence. The genomics analysis showed that the dam forced a structuring of the C. temensis populations, dividing it into two populational units, one upstream and another downstream. It is hoped that this research will serve as subsidies for further studies, aiming that the fishery resources can be properly managed the environmental effects of hydroelectric projects deeply understood.

DISTRIBUIÇÃO ESPAÇO-TEMPORAL E RECRUTAMENTO DE Littoraria angulifera (LAMARCK, 1822) (MESOGASTROPODA: LITTORINIDAE) EM MANGUEZAIS NO SUL DA BAHIA

Os bioindicadores são organismos que respondem morfologicamente e fisiologicamente a estresses ambientais causados por fatores naturais e/ou por impactos antrópicos. Littoraria angulifera (Lamarck, 1822) (Gastropoda: Littorinidae) habita troncos e raízes de árvores do mangue, principalmente de Rhizophora mangle (L.), sendo a única espécie do gênero exclusivamente estuarina. Por viver nesses locais e por evidenciar respostas a estresses ambientais, o seu uso como espécie indicadora em manguezais e estuários têm sido sugerido nos últimos anos. Entretanto, há ainda muita carência de informação como sobre aspectos básicos da sua distribuição espacial nos bosques do mangue e épocas de recrutamento. Neste estudo teve-se por objetivo avaliar a distribuição espaço-temporal e o recrutamento de L. angulifera em dois manguezais do sul da Bahia, um localizado no município de Ilhéus (Estação I) e outro no município de Uruçuca (Estação II). As coletas foram feitas mensalmente entre janeiro e dezembro de 2018, sempre em maré baixa de sizígia. Foram escolhidos dois níveis no bosque, um próximo à linha d´água (Nível Inferior) e outro distante a 20 m (Nível Superior) deste, ambos no supralitoral e em cada nível foram selecionadas cinco árvores de R. mangle, de onde foram obtidos os exemplares, por busca ativa, em duas alturas a partir do solo: nível 1 (do solo até 1 m de altura) e nível 2 (de 1 a 2 m na árvore). Foi estimada a altura e o diâmetro das árvores em cada bosque. Em laboratório, os animais foram anestesiados, medidos, pesados e sexados. A proporção sexual macho: fêmea foi de aproximadamente 1: 1,4, com predomínio de fêmeas em todos os meses e nos dois locais. A abundância foi similar (p > 0,05) entre locais, entretanto os animais da Estação I apresentaram tamanho menor em relação aos da Estação II, com médias de 16,82 mm ± 5,87 (n = 2.935) e de 21,9 mm ± 5,04 na Estação II (n = 2.852), respectivamente. No primeiro local, as conchas eram também mais frágeis e quebradiças. Não ficou claro se L. angulifera ocupa preferencialmente níveis mais próximos ou mais distantes à linha d´água, entretanto, um maior número de indivíduos foi verificado na parte mais baixa das árvores, o que está provavelmente relacionado a um comportamento de ocupar locais mais sombreados, para evitar o perigo da dessecação. O estresse fisiológico causado pela suposta maior insolação na Estação I (onde as árvores eram menores e mais esparsas) explica também o menor tamanho dos animais nesse local. Recrutas foram observados exclusivamente na vegetação rasteira próxima às árvores do mangue, em praticamente todos os meses do ano, mas em maior evidência nos meses de novembro, dezembro e janeiro, indicando reprodução contínua com um pico reprodutivo no final da primavera/ início do verão. O estudo chama a atenção para a necessidade de se preservar áreas de manguezais e para reforçar o uso de L. angulifera como espécie bioindicadora.

Bioindicators are organisms that respond morphologically and physiologically to environmental stresses caused by natural factors and / or by human impacts. Littoraria angulifera (Lamarck, 1822) (Gastropoda: Littorinidae) inhabits trunks and roots of mangrove trees, mainly Rhizophora mangle (L.), being the only species of the genus exclusively estuarine. Because they live in these places and because it shows responses to environmental stresses, their use as an indicator species in mangroves and estuaries have been suggested in recent years. However, there is still much lack of information as to the basic aspects of its spatial distribution in mangrove forests and times of recruitment. The objective of this study was to evaluate the spatial and temporal distribution and recruitment of L. angulifera in two mangroves in the south of Bahia (Brazil), one located in the county of Ilhéus (Station I) and the other in the municipality of Uruçuca (Station II). The collections were made monthly between January and December of 2018, always in low tide of syzygy. Two levels were selected in the forest, one near the water line (Lower Level) and another distant at 20 m (Upper Level) of the latter, both in the supralittoral area. At each level were selected five R. mangle trees from which they were obtained the specimens, by active search, at two heights from soil: level 1 (from soil to 1 m in height) and level 2 (from 1 to 2 m in the tree). The height and diameter of the trees in each forest were estimated. In the laboratory, the animals were anesthetized, measured, weighed and sexed. The male: female sex ratio was approximately 1: 1.4, with predominance of females in all months and in both sites. The abundance was similar (p> 0.05) between sites, however the animals of Station I presented a smaller size than those of Station II, with averages of 16.82 ± 5.87 (n = 2,935) and 21.9 mm ± 5.04 in Station II (n = 2,852), respectively. In the first place, the shells were also more fragile and brittle. It was not clear whether L. angulifera preferentially occupy levels closer or more distant to the water line, however, a greater number of individuals were observed in the lower part of the trees, which is probably related to a behavior of occupying more shaded places, to avoid the danger of desiccation. The physiological stress caused by the supposedly greater sunshine in Station I (where the trees were smaller and more sparse) also explains the smaller size of the animals in that place. Recruits were observed exclusively in the undergrowth near the mangrove trees, practically every month of the year, but were more evidenced in the months of November, December and January, indicating continuous reproduction with a reproductive peak in late spring / early summer. The study draws attention to the need to preserve mangrove areas and to reinforce the use of L. angulifera as a bioindicator species.

PARÂMETROS POPULACIONAIS DA RAÇA OVINA SOMALIS BRASILEIRA

Objetivou-se descrever e analisar, por meio de informações de pedigree, a estrutura populacional dos ovinos da raça Somalis Brasileira. Dados de pedigree de 8.610 indivíduos nascidos no período de 1972 a 2015 foram analisados quanto a integralidade, intervalo médio de geração, probabilidade de origem do gene, coeficiente médio de relação, coeficiente de endogamia e índice de conservação genética utilizando o programa ENDOG 4.8. Para determinação da ocorrência ou não do efeito gargalo foi utilizada correlação de Spearman (PROC CORR do SAS, versão 9.1). Do total de indivíduos estudados, 69,12%, 55,87%, 47,74%, 41,60% e 32,52% possuíam pedigree na primeira, segunda, terceira, quarta e quinta ascendência, respectivamente. O número médio de gerações equivalentes, completas e máximas para os 44 anos estudados foi de 2,83, 2,05 e 3,84, respectivamente. A média do intervalo de gerações foi 3,46±1,82. O número de fundadores e ancestrais foram 780 e 785, respectivamente, enquanto que o número efetivo de fundadores e o número efetivo de ancestrais foram 26 e 23, respectivamente. Os oito principais ancestrais explicaram 50,66% da variabilidade genética total. O coeficiente médio de relação foi 3,94 e o coeficiente médio de endogamia 8,55. Os valores de Fis, Fit e Fst (F de Wright) foram -0,028657, 0,067157 e 0,093144, respectivamente. O índice de conservação genética variou de 1,00 a 17,43, com valor médio de 3,98, sendo que três indivíduos apresentaram valor acima de 17. Em conclusão, os indivíduos da raça Somalis Brasileira apresentam coeficientes de endogamia consideravelmente altos especialmente nas últimas duas décadas cujos valores têm se mantido acima do nível recomendável. Por outro lado, existem indivíduos portadores de alelos da maioria dos fundadores efetivos que podem ser utilizados para manutenção da diversidade genética da raça.

The aim of this study was to describe and analyze, based on pedigree information, the populational structure of the Brazilian Somalis sheep. Pedigree data from 8,610 individuals were born in the period from 1972 to 2015 analyzed to the integrality, average generation interval, gene origin probability, average relatedness coefficient, inbreeding coefficient and genetic conservation index were evaluated by using the ENDOG 4.8 program. To determine the occurrence or not of the bottleneck effect, Spearman correlation (SAS PROC CORR, version 9.1) was used. From the total of studied individuals, 69.12%, 55.87%, 47.74%, 41.60% and 32.52% had pedigree in the first, second, third, fourth and fifth ancestry, respectively. The average number of equivalent, complete and maximum generations for the 44 years studied was 2.83, 2.05 and 3.84, respectively. The average of the generation interval was 3.46 ± 1.82. The number of founders and ancestors was 780 and 785, respectively, while the effective number of founders and the effective number of ancestors were 26 and 23, respectively. The eight major ancestors explained 50.66% of the total genetic variability. The average relatedness coefficient was 3.94 and the mean inbreeding coefficient was 8.55. Fis, Fit and Fst (Wright F) values were -0.028657, 0.067157 and 0.093144, respectively. The genetic conservation index ranged from 1.00 to 17.43, with 3.98 as medium value, and three individuals presenting value above 17. In conclusion, individuals of the Brazilian Somalis sheep have considerably high inbreeding coefficients, especially in the last two decades whose values have remained above the recommended level. On the other hand, there are individuals with alleles from most of the effective founders that can be used to maintain the genetic diversity of the breed.