Does soybean sample size impact Tukey's test for non-additivity? / O tamanho de amostra em soja impacta o teste de não aditividade de Tukey?

This study analyzed the interference of sample size on Tukey's test for non-additivity and found the sample size to optimize the test for soybean grain yield. Six experiments were conducted in a completely randomized block design with either 20 or 30 cultivars and three repetitions of each treatment. Grain yield was determined per plant, totaling 9,000 sampled plants. Next, sample scenarios up to 100 plants were simulated, estimating F statistic for a degree of freedom of the error in each scenario. After that, the optimal sample size was defined via power models and maximum curvature point. Results showed the number of sampled plants per experimental unit influences the estimates of Tukey's test for non-additivity. Also, the sampling of 14 to 19 plants per experimental unit allows for maintaining the accuracy of the test.

Os objetivos deste estudo foram analisar a interferência do tamanho amostral no teste de não aditividade de Tukey e encontrar o tamanho de amostra para otimizar o teste para a produtividade de grãos em soja. Seis experimentos em delineamento de blocos ao acaso foram conduzidos com 20 ou 30 cultivares de soja em três repetições de cada tratamento. A produtividade de grãos foi definida por planta, totalizando 9.000 plantas amostradas. A seguir, foram simulados cenários amostrais de até 100 plantas, estimando a estatística F para um grau de liberdade do erro em cada cenário. Após, foi definido o tamanho amostral ótimo via modelos de potência e pontos de máxima curvatura. Os resultados mostram que o número de plantas amostradas por unidade experimental influencia as estimativas do teste de não aditividade de Tukey. Além disso, a amostragem de 14 a 19 plantas por unidade experimental possibilita manter a acurácia do teste.

Optimizing Bartlett test: a grain yield analysis in soybean / Otimizando o teste de Bartlett: uma análise da produtividade de grãos em soja

ABSTRACT: This study analyzed the response of the Bartlett test as a function of sample size and to define the optimal sample size for the test with soybean grain yield data. Six experiments were conducted in a randomized block design with 20 or 30 cultivars and three repetitions. Grain yield was determined per plant, totaling 9,000 sampled plants. Next, sample scenarios of 1, 2, ..., 100 plants were simulated and the optimal sample size was defined via maximum curvature points. The increase in sampled plants per experimental unit favors Bartlett test's precision. Also, the sampling of 17 to 20 plants per experimental unit is enough to maintain the accuracy of the test.

RESUMO: Os objetivos deste estudo foram analisar a resposta do teste de Bartlett em função do tamanho de amostra e definir o tamanho amostral ótimo para o teste com dados de produtividade de grãos de soja. Foram conduzidos seis experimentos em delineamento de blocos ao acaso com 20 ou 30 cultivares e três repetições. A produtividade de grãos foi definida por planta, totalizando 9.000 plantas amostradas. Logo, foram simulados cenários amostrais de 1, 2, ..., 100 plantas e definido o tamanho amostral ótimo via pontos de máxima curvatura. O aumento de plantas amostradas por unidade experimental favorece a precisão do teste de Bartlett. Além disso, a amostragem de 17 a 20 plantas por unidade experimental é suficiente para manter a acurácia do teste.

Sample size affects the precision of the analysis of variance in experiments with cauliflower seedlings / O tamanho de amostra afeta a precisão da análise de variância em experimentos com mudas de couve-flor

ABSTRACT: This study verified whether sample size would affect the precision of the analysis of variance in experiments with cauliflower seedlings. An experiment was carried out where the number of leaves and shoot, root and total length were measured. For each variable, resamplings with repositions were performed in sample scenarios of 1, 2, …, 100 seedlings per experimental unit, and the sample size was defined for the variance components through Schumacher models and maximum curvature points. The mean squares of the analysis of variance suffer direct interference from the number of sampled seedlings. The sampling of 16 seedlings per experimental unit is enough to estimate the analysis of variance reliably, promoting satisfactory precision gains compared to the sampling of only one seedling per experimental unit.

RESUMO: Este estudo verificou se o tamanho de amostra afetaria a precisão da análise de variância em experimentos com mudas de couve-flor. Um experimento foi conduzido onde o número de folhas, comprimento de parte aérea, raiz e total foram mensurados. Para cada variável, reamostragens com reposição foram realizadas em cenários amostrais de 1, 2, ..., 100 mudas por unidade experimental e o tamanho de amostra foi definido para os componentes de variância por meio de modelos de Schumacher e pontos de máxima curvatura. Os quadrados médios da análise de variância sofrem interferência direta do número de mudas amostradas. A amostragem de 16 mudas por unidade experimental é suficiente para estimar a análise de variância de forma confiável, promovendo satisfatórios ganhos de precisão ao comparar-se com a amostragem de apenas uma muda por unidade experimental.

The dynamics of genome size and GC contents evolution in genus Nicotiana

Abstract Hybridization and Polyploidization are most common of the phenomenon observed in plants, especially in the genus Nicotiana leading to the duplication of genome. Although genomic changes associated with these events has been studied at various levels but the genome size and GC content variation is less understood because of absence of sufficient genomic data. In this study the flow cytometry technique was used to uncover the genome size and GC contents of 46 Nicotiana species and we compared the genomic changes associated with the hybridization events along evolutionary time scale. The genome size among Nicotiana species varied between 3.28 pg and 11.88 pg whereas GC contents varied between 37.22% and 51.25%. The tetraploid species in genus Nicotiana including section Polydiclae, Repandae, Nicotiana, Rustica and Sauveolentes revealed both up and downsizing in their genome sizes when compared to the sum of genomes of their ancestral species. The genome sizes of three homoploid hybrids were found near their ancestral species. Loss of large genome sequence was observed in the evolutionary more aged species (>10 Myr) as compared to the recently evolved ones ( 0.2 Myr). The GC contents were found homogenous with a mean difference of 2.46% among the Nicotiana species. It is concluded that genome size change appeared in either direction whereas the GC contents were found more homogenous in genus Nicotiana.

Resumo A hibridização e a poliploidização são os fenômenos mais comuns observados em plantas, principalmente no gênero Nicotiana, levando à duplicação do genoma. Embora as mudanças genômicas associadas a esses eventos tenham sido estudadas em vários níveis, o tamanho do genoma e a variação do conteúdo de GC são menos compreendidos devido à ausência de dados genômicos suficientes. Neste estudo, a técnica de citometria de fluxo foi usada para descobrir o tamanho do genoma e o conteúdo de GC de 46 espécies de Nicotiana, e comparamos as mudanças genômicas associadas aos eventos de hibridização ao longo da escala de tempo evolutiva. O tamanho do genoma entre as espécies de Nicotiana variou entre 3,28 pg e 11,88 pg, enquanto os conteúdos de GC variaram entre 37,22% e 51,25%. As espécies tetraploides do gênero Nicotiana, incluindo as seções Polydiclae, Repandae, Nicotiana, Rustica e Sauveolentes, revelaram aumento e redução do tamanho do genoma quando comparados à soma dos genomas de suas espécies ancestrais. Os tamanhos do genoma de três híbridos homoploides foram encontrados perto de suas espécies ancestrais. A perda da grande sequência do genoma foi observada nas espécies evolutivas mais velhas (> 10 Myr) em comparação com as que evoluíram recentemente ( 0,2 Myr). Os teores de GC foram homogêneos com diferença média de 2,46% entre as espécies de Nicotiana. Conclui-se que a mudança no tamanho do genoma apareceu em ambas as direções, enquanto os conteúdos de GC foram encontrados mais homogêneos no gênero Nicotiana.

Does soybean sample size impact Tukey's test for non-additivity? / O tamanho de amostra em soja impacta o teste de não aditividade de Tukey?

ABSTRACT: This study analyzed the interference of sample size on Tukey's test for non-additivity and found the sample size to optimize the test for soybean grain yield. Six experiments were conducted in a completely randomized block design with either 20 or 30 cultivars and three repetitions of each treatment. Grain yield was determined per plant, totaling 9,000 sampled plants. Next, sample scenarios up to 100 plants were simulated, estimating F statistic for a degree of freedom of the error in each scenario. After that, the optimal sample size was defined via power models and maximum curvature point. Results showed the number of sampled plants per experimental unit influences the estimates of Tukey's test for non-additivity. Also, the sampling of 14 to 19 plants per experimental unit allows for maintaining the accuracy of the test.

RESUMO: Os objetivos deste estudo foram analisar a interferência do tamanho amostral no teste de não aditividade de Tukey e encontrar o tamanho de amostra para otimizar o teste para a produtividade de grãos em soja. Seis experimentos em delineamento de blocos ao acaso foram conduzidos com 20 ou 30 cultivares de soja em três repetições de cada tratamento. A produtividade de grãos foi definida por planta, totalizando 9.000 plantas amostradas. A seguir, foram simulados cenários amostrais de até 100 plantas, estimando a estatística F para um grau de liberdade do erro em cada cenário. Após, foi definido o tamanho amostral ótimo via modelos de potência e pontos de máxima curvatura. Os resultados mostram que o número de plantas amostradas por unidade experimental influencia as estimativas do teste de não aditividade de Tukey. Além disso, a amostragem de 14 a 19 plantas por unidade experimental possibilita manter a acurácia do teste.

Anthelmintic usage on the Reproductive Parameters in Captive reared Agoutis (Dasyprocta leporina) in Trinidad and Tobago, West Indies

Abstract The agouti (Dasyprocta leporina) is a rodent that is found in the Neo-tropical region. This animal is hunted for its meat but has recently been reared in captivity as a source of meat protein in rural communities. A 20-month experiment was carried out to evaluate the effect of an anthelmintic on the reproductive performance of the agouti (Dasyprocta leporina) reared in captivity. This experiment was conducted in the humid tropics of Trinidad and Tobago. Sixteen animals (15 females, 1 male) placed in each of the two treatment groups in a completely randomized study design. In treatment 1 (T1) animals were given subcutaneous injections of Endovet Ces® (Ivermectin/Praziquantel) at 0.2 mg/kg every three months. Treatment 2 (T2) was the negative control group where animals were not exposed to an anthelmintic. Reproductive data were collected at parturition which included birth weight, litter weight, litter size and gender of offspring. The results showed that there was no statistical difference (p > 0.05) between the treatment groups with respect to birth weight, litter weight, litter size and gender. However, agoutis that were dewormed had a higher birth weight (220.24 g vs 209.1 g) and litter weight (369.8 g vs 343 g). The same values were obtained for the litter size (1.7 vs 1.7) and animals that were dewormed had a higher female offspring to male offspring (2.41:1 vs 1.11:1). This experiment demonstrated that the use of an anthelmintic strategically in the management of captive reared agoutis had no statistical effect (p > 0.05) on the reproductive parameters. Therefore, these animals can be kept in captive conditions without being dewormed and produce efficiently with proper feeding and housing management.

Resumo A cutia (Dasyprocta leporina) é um roedor que se encontra na região neo-tropical. Esse animal é caçado por sua carne, mas recentemente foi criado em cativeiro como fonte de proteína de carne em comunidades rurais. Um experimento de 20 meses foi realizado para avaliar o efeito de um anti-helmíntico no desempenho reprodutivo de cutias (Dasyprocta leporina) criadas em cativeiro. Esse experimento foi conduzido nos trópicos úmidos de Trinidad e Tobago. Dezesseis animais (15 fêmeas, 1 macho) colocados em cada um dos dois grupos de tratamento em um desenho de estudo completamente randomizado. No tratamento 1 (T1) os animais receberam injeções subcutâneas de Endovet Ces® (Ivermectina / Praziquantel) na dose de 0,2 mg / kg a cada três meses. O tratamento 2 (T2) foi o grupo de controle negativo onde os animais não foram expostos a um anti-helmíntico. Os dados reprodutivos foram coletados no parto, incluindo peso ao nascer, peso da ninhada, tamanho da ninhada e sexo da prole. Os resultados mostraram que não houve diferença estatística (p > 0,05) entre os grupos de tratamento com relação ao peso ao nascer, peso da ninhada, tamanho da ninhada e sexo. No entanto, cutias desparasitadas tiveram maior peso ao nascer (220,24 g vs. 209,1 g) e peso da ninhada (369,8 g vs. 343 g). Os mesmos valores foram obtidos para o tamanho da ninhada (1,7 vs. 1,7) e os animais que foram desparasitados tiveram uma prole feminina maior do que a prole masculina (2,41: 1 vs. 1,11: 1). Esse experimento demonstrou que o uso de anti-helmíntico estrategicamente no manejo de cutias criadas em cativeiro não teve efeito estatístico (p > 0,05) sobre os parâmetros reprodutivos. Portanto, esses animais podem ser mantidos em cativeiro sem serem vermifugados e produzir de forma eficiente com alimentação adequada e manejo do alojamento.

The dynamics of genome size and GC contents evolution in genus Nicotiana / A dinâmica do tamanho do genoma e a evolução dos conteúdos de GC no gênero Nicotiana

Hybridization and Polyploidization are most common of the phenomenon observed in plants, especially in the genus Nicotiana leading to the duplication of genome. Although genomic changes associated with these events has been studied at various levels but the genome size and GC content variation is less understood because of absence of sufficient genomic data. In this study the flow cytometry technique was used to uncover the genome size and GC contents of 46 Nicotiana species and we compared the genomic changes associated with the hybridization events along evolutionary time scale. The genome size among Nicotiana species varied between 3.28 pg and 11.88 pg whereas GC contents varied between 37.22% and 51.25%. The tetraploid species in genus Nicotiana including section Polydiclae, Repandae, Nicotiana, Rustica and Sauveolentes revealed both up and downsizing in their genome sizes when compared to the sum of genomes of their ancestral species. The genome sizes of three homoploid hybrids were found near their ancestral species. Loss of large genome sequence was observed in the evolutionary more aged species (>10 Myr) as compared to the recently evolved one’s (<0.2 Myr). The GC contents were found homogenous with a mean difference of 2.46% among the Nicotiana species. It is concluded that genome size change appeared in either direction whereas the GC contents were found more homogenous in genus Nicotiana.

A hibridização e a poliploidização são os fenômenos mais comuns observados em plantas, principalmente no gênero Nicotiana, levando à duplicação do genoma. Embora as mudanças genômicas associadas a esses eventos tenham sido estudadas em vários níveis, o tamanho do genoma e a variação do conteúdo de GC são menos compreendidos devido à ausência de dados genômicos suficientes. Neste estudo, a técnica de citometria de fluxo foi usada para descobrir o tamanho do genoma e o conteúdo de GC de 46 espécies de Nicotiana, e comparamos as mudanças genômicas associadas aos eventos de hibridização ao longo da escala de tempo evolutiva. O tamanho do genoma entre as espécies de Nicotiana variou entre 3,28 pg e 11,88 pg, enquanto os conteúdos de GC variaramentre 37,22% e 51,25%. As espécies tetraploides do gênero Nicotiana, incluindo as seções Polydiclae, Repandae, Nicotiana, Rustica e Sauveolentes, revelaram aumento e redução do tamanho do genoma quando comparados à soma dos genomas de suas espécies ancestrais. Os tamanhos do genoma de três híbridos homoploides foram encontrados perto de suas espécies ancestrais. A perda da grande sequência do genoma foi observada nas espécies evolutivas mais velhas (> 10 Myr) em comparação com as que evoluíram recentemente (< 0,2 Myr). Os teores de GC foram homogêneos com diferença média de 2,46% entre as espécies de Nicotiana. Conclui-se que a mudança no tamanho do genoma apareceu em ambas as direções, enquanto os conteúdos de GC foram encontrados mais homogêneos no gênero Nicotiana.

The dynamics of genome size and GC contents evolution in genus Nicotiana / A dinâmica do tamanho do genoma e a evolução dos conteúdos de GC no gênero Nicotiana

Hybridization and Polyploidization are most common of the phenomenon observed in plants, especially in the genus Nicotiana leading to the duplication of genome. Although genomic changes associated with these events has been studied at various levels but the genome size and GC content variation is less understood because of absence of sufficient genomic data. In this study the flow cytometry technique was used to uncover the genome size and GC contents of 46 Nicotiana species and we compared the genomic changes associated with the hybridization events along evolutionary time scale. The genome size among Nicotiana species varied between 3.28 pg and 11.88 pg whereas GC contents varied between 37.22% and 51.25%. The tetraploid species in genus Nicotiana including section Polydiclae, Repandae, Nicotiana, Rustica and Sauveolentes revealed both up and downsizing in their genome sizes when compared to the sum of genomes of their ancestral species. The genome sizes of three homoploid hybrids were found near their ancestral species. Loss of large genome sequence was observed in the evolutionary more aged species (>10 Myr) as compared to the recently evolved ones (<0.2 Myr). The GC contents were found homogenous with a mean difference of 2.46% among the Nicotiana species. It is concluded that genome size change appeared in either direction whereas the GC contents were found more homogenous in genus Nicotiana.(AU)

A hibridização e a poliploidização são os fenômenos mais comuns observados em plantas, principalmente no gênero Nicotiana, levando à duplicação do genoma. Embora as mudanças genômicas associadas a esses eventos tenham sido estudadas em vários níveis, o tamanho do genoma e a variação do conteúdo de GC são menos compreendidos devido à ausência de dados genômicos suficientes. Neste estudo, a técnica de citometria de fluxo foi usada para descobrir o tamanho do genoma e o conteúdo de GC de 46 espécies de Nicotiana, e comparamos as mudanças genômicas associadas aos eventos de hibridização ao longo da escala de tempo evolutiva. O tamanho do genoma entre as espécies de Nicotiana variou entre 3,28 pg e 11,88 pg, enquanto os conteúdos de GC variaramentre 37,22% e 51,25%. As espécies tetraploides do gênero Nicotiana, incluindo as seções Polydiclae, Repandae, Nicotiana, Rustica e Sauveolentes, revelaram aumento e redução do tamanho do genoma quando comparados à soma dos genomas de suas espécies ancestrais. Os tamanhos do genoma de três híbridos homoploides foram encontrados perto de suas espécies ancestrais. A perda da grande sequência do genoma foi observada nas espécies evolutivas mais velhas (> 10 Myr) em comparação com as que evoluíram recentemente (< 0,2 Myr). Os teores de GC foram homogêneos com diferença média de 2,46% entre as espécies de Nicotiana. Conclui-se que a mudança no tamanho do genoma apareceu em ambas as direções, enquanto os conteúdos de GC foram encontrados mais homogêneos no gênero Nicotiana.(AU)

Optimal plot size in white oat with comparison of three methods / Tamanho ótimo de parcela em aveia branca com comparação de três métodos

The objective of this work was to compare three methods for estimating the optimal plot size to evaluate the fresh matter productivity of white oat (Avena sativa L.), IPR Suprema cultivar. Six uniformity trials (blank experiments) were carried out, three trials on the first sowing date (May 3, 2021) and three trials on the second sowing date (May 26, 2021). Fresh matter productivity was evaluated in 216 basic experimental units (BEU) of 1 m × 1 m (36 BEU per trial). The BEU was formed by five rows of 1.0 m in length, spaced 0.20 m apart, totaling 1.0 m2. The optimal plot size was determined using the methods of modified maximum curvature, linear response and plateau model and quadratic response and plateau model. The optimal plot size differs between the methods and decreases in the following order: quadratic response and plateau model (11.09 m2), linear response and plateau model (7.65 m2) and modified maximum curvature (4.00 m2). The optimal plot size to evaluate the fresh matter productivity of white oat is 7.65 m2 and the experimental precision stabilizes from this size on.

O objetivo deste trabalho foi comparar três métodos de estimação do tamanho ótimo de parcela para avaliar a produtividade de matéria fresca de aveia branca (Avena sativa L.), cultivar IPR Suprema. Foram conduzidos seis ensaios de uniformidade (experimentos em branco), sendo três na primeira data de semeadura (03 de maio de 2021) e três na segunda data de semeadura (26 de maio de 2021). Foi avaliada a produtividade de matéria fresca em 216 unidades experimentais básicas (UEB) de 1 m × 1 m (36 UEB por ensaio). A UEB foi formada por cinco fileiras de 1,0 m de comprimento, espaçadas 0,20 m entre fileiras, totalizando 1,0 m2. Foi determinado o tamanho ótimo de parcela por meio dos métodos da curvatura máxima modificado, do modelo linear de resposta com platô e do modelo quadrático de resposta com platô. O tamanho ótimo de parcela difere entre os métodos e decresce na seguinte ordem: modelo quadrático de resposta com platô (11,09 m2), modelo linear de resposta com platô (7,65 m2) e curvatura máxima modificado (4,00 m2). O tamanho ótimo de parcela para avaliar a produtividade de matéria fresca de aveia branca é 7,65 m2 e a precisão experimental estabiliza a partir desse tamanho.

Seleção de touros para reprodução baseada no fenótipo e DEPs / Selection of bulls for reproduction based on EPD and phenotype

A fertilidade pode ser definida como a capacidade de gerar filhos normais, o que é essencial para o progresso genético, desde que os ascendentes tenham capacidade de transmitir características que venham impactar positivamente os índices zootécnicos e econômicos. Apesar do aumento expressivo do uso de biotécnicas reprodutivas, a maior parte das fêmeas bovinas aptas à reprodução no Brasil ainda são acasaladas por meio da monta natural. Torna-se importante então, não somente, a estimativa da saúde reprodutiva do touro, mas também a avaliação da sua qualidade genética que pode ser feita, por exemplo, pelo acesso os índices dos reprodutores nos diversos programas de melhoramento genético nacional ou pela utilização de escores de avaliação visual.(AU)

Fertility can be defined as the ability to generate normal descendants, which is essential for genetic progress, as long as the ancestors have the ability to transmit characteristics that will positively impact zootechnical and economic indices. Despite the significant increase in the use of reproduction biotechniques, most bovine females capable of reproduction in Brazil are still mated through natural mating. Therefore, it becomes important not only to estimate the reproductive health of the bull, but also to evaluate its genetic quality, which can be done, for example, by accessing the indices of the bulls in the various national genetic improvement programs or by using visual assessment scores.(AU)

Optimizing Bartlett test: a grain yield analysis in soybean / Otimizando o teste de Bartlett: uma análise da produtividade de grãos em soja

This study analyzed the response of the Bartlett test as a function of sample size and to define the optimal sample size for the test with soybean grain yield data. Six experiments were conducted in a randomized block design with 20 or 30 cultivars and three repetitions. Grain yield was determined per plant, totaling 9,000 sampled plants. Next, sample scenarios of 1, 2, ..., 100 plants were simulated and the optimal sample size was defined via maximum curvature points. The increase in sampled plants per experimental unit favors Bartlett test's precision. Also, the sampling of 17 to 20 plants per experimental unit is enough to maintain the accuracy of the test.

Os objetivos deste estudo foram analisar a resposta do teste de Bartlett em função do tamanho de amostra e definir o tamanho amostral ótimo para o teste com dados de produtividade de grãos de soja. Foram conduzidos seis experimentos em delineamento de blocos ao acaso com 20 ou 30 cultivares e três repetições. A produtividade de grãos foi definida por planta, totalizando 9.000 plantas amostradas. Logo, foram simulados cenários amostrais de 1, 2, ..., 100 plantas e definido o tamanho amostral ótimo via pontos de máxima curvatura. O aumento de plantas amostradas por unidade experimental favorece a precisão do teste de Bartlett. Além disso, a amostragem de 17 a 20 plantas por unidade experimental é suficiente para manter a acurácia do teste.

The dynamics of genome size and GC contents evolution in genus Nicotiana / A dinâmica do tamanho do genoma e a evolução dos conteúdos de GC no gênero Nicotiana

Abstract Hybridization and Polyploidization are most common of the phenomenon observed in plants, especially in the genus Nicotiana leading to the duplication of genome. Although genomic changes associated with these events has been studied at various levels but the genome size and GC content variation is less understood because of absence of sufficient genomic data. In this study the flow cytometry technique was used to uncover the genome size and GC contents of 46 Nicotiana species and we compared the genomic changes associated with the hybridization events along evolutionary time scale. The genome size among Nicotiana species varied between 3.28 pg and 11.88 pg whereas GC contents varied between 37.22% and 51.25%. The tetraploid species in genus Nicotiana including section Polydiclae, Repandae, Nicotiana, Rustica and Sauveolentes revealed both up and downsizing in their genome sizes when compared to the sum of genomes of their ancestral species. The genome sizes of three homoploid hybrids were found near their ancestral species. Loss of large genome sequence was observed in the evolutionary more aged species (>10 Myr) as compared to the recently evolved one's (<0.2 Myr). The GC contents were found homogenous with a mean difference of 2.46% among the Nicotiana species. It is concluded that genome size change appeared in either direction whereas the GC contents were found more homogenous in genus Nicotiana.

Resumo A hibridização e a poliploidização são os fenômenos mais comuns observados em plantas, principalmente no gênero Nicotiana, levando à duplicação do genoma. Embora as mudanças genômicas associadas a esses eventos tenham sido estudadas em vários níveis, o tamanho do genoma e a variação do conteúdo de GC são menos compreendidos devido à ausência de dados genômicos suficientes. Neste estudo, a técnica de citometria de fluxo foi usada para descobrir o tamanho do genoma e o conteúdo de GC de 46 espécies de Nicotiana, e comparamos as mudanças genômicas associadas aos eventos de hibridização ao longo da escala de tempo evolutiva. O tamanho do genoma entre as espécies de Nicotiana variou entre 3,28 pg e 11,88 pg, enquanto os conteúdos de GC variaram entre 37,22% e 51,25%. As espécies tetraploides do gênero Nicotiana, incluindo as seções Polydiclae, Repandae, Nicotiana, Rustica e Sauveolentes, revelaram aumento e redução do tamanho do genoma quando comparados à soma dos genomas de suas espécies ancestrais. Os tamanhos do genoma de três híbridos homoploides foram encontrados perto de suas espécies ancestrais. A perda da grande sequência do genoma foi observada nas espécies evolutivas mais velhas (> 10 Myr) em comparação com as que evoluíram recentemente (< 0,2 Myr). Os teores de GC foram homogêneos com diferença média de 2,46% entre as espécies de Nicotiana. Conclui-se que a mudança no tamanho do genoma apareceu em ambas as direções, enquanto os conteúdos de GC foram encontrados mais homogêneos no gênero Nicotiana.

First constitutive heterochromatin characterization and Karyotype of white stork Ciconia ciconia (Aves: Ciconiidae)

Abstract The karyotype and constitutive heterochromatin pattern of the white stork Ciconia ciconia samples obtained from Manzala lake, Dimiaat, Egypt was described. Somatic cells of Ciconia ciconia samples have diploid number 2n= 68 chromosomes. Out of 68 chromosomes, 11 pairs including sex chromosomes were macrochromosomes and the remaining pairs were microchromosomes. Of the 11 macrochromosome pairs, no.1, 2, 4 and 5 were submetacentric and pairs no. 6, 7 and 8 were described as metacentric. In addition, the autosome pair no.3 was subtelocentric, while autosome pair no.9 was acrocentric. Also, the sex chromosome Z represents the fourth one in size and it was classified as submetacentric while, W chromosome appeared as medium size and was acrocentric. Furthermore, C-banding pattern (constitutive heterochromatin) revealed variation in their sizes and occurrence between macrochromosomes. Pairs no. 7 and 8 of autosomes exhibited unusual distribution of heterochromatin, where they appeared as entirely heterochromatic. This may be related to the origin of sex chromosomes Z and W. However, there is no sufficient evidence illustrate the appearance of entirely heterochromatic autosomes. Therefore, there is no available cytogenetic literature that describes the C-banding and karyotype of Ciconia Ciconia, so the results herein are important and may assist in cytogenetic study and evolutionary pattern of Ciconiiformes.

Resumo O cariótipo e o padrão constitutivo de heterocromatina das amostras de cegonha-branca Ciconia ciconia obtidas no lago Manzala, Dimiaat, Egito, foram descritos. As células somáticas de amostras de Ciconia ciconia possuem número diploide 2n = 68 cromossomos. Dos 68 cromossomos, 11 pares incluindo cromossomos sexuais eram macrocromossomos e os pares restantes eram microcromossomos. Dos 11 pares de macrocromossomos, os nos 1, 2, 4 e 5 eram submetacêntricos, e os pares nos 6, 7 e 8 foram descritos como metacêntricos. Além disso, o par de autossomos no 3 era subtelocêntrico, enquanto o par de autossomos no 9 era acrocêntrico. Além disso, o cromossomo sexual Z representa o quarto em tamanho e foi classificado como submetacêntrico, enquanto o cromossomo W apareceu como de tamanho médio e acrocêntrico. Além disso, o padrão de bandamento C (heterocromatina constitutiva) revelou variação em seus tamanhos e ocorrência entre macrocromossomos. Pares nos 7 e 8 dos autossomos exibiram distribuição incomum de heterocromatina, onde apareceram como totalmente heterocromáticos. Isso pode estar relacionado à origem dos cromossomos sexuais Z e W. No entanto, não há evidências suficientes para ilustrar o aparecimento de autossomos totalmente heterocromáticos. Portanto, não há literatura citogenética disponível que descreva o bandamento C e o cariótipo de Ciconia ciconia, portanto os resultados aqui apresentados são importantes e podem auxiliar no estudo citogenético e no padrão evolutivo de Ciconiiformes.

The introduction of Physa acuta (Gastropoda: Physidae) on Ilha Grande, Southeast Brazil, from initial stages to an established population / A introdução de Physa acuta Draparnaud, 1805 (Gastropoda: Physidae) na Ilha Grande, Sudeste do Brasil, desde os estágios iniciais até uma população estabelecida

Abstract This study presents a four-year follow-up of an introduced population of Physa acuta Draparnaud, 1805, from initial stages to an established population. This introduction occurred on a small impacted stream of Vila do Abraão, the main village of Ilha Grande (Angra dos Reis, Rio de Janeiro, Brazil). The population size increased during the study, and presented a relationship to environmental factors, especially with rainfall. On the initial stages of introduction prevailed the smaller specimens, but on the overall, predominated the intermediate size classes. After less than a year, P. acuta becomes established on this stream and was possibly affecting the other species found on the stream. The information presented here is useful to understand the invasion process of invasive snails, as well as directing conservation efforts.

Resumo Neste estudo é apresentado um acompanhamento de quatro anos de uma população de Physa acuta Draparnaud, 1805, desde os estágios iniciais da introdução até seu pleno estabelecimento. Esta introdução ocorreu em um pequeno riacho impactado da Vila do Abraão, o principal vilarejo da Ilha Grande (Angra dos Reis, Rio de Janeiro, Brasil). A população cresceu durante o estudo, e apresentou uma relação com os fatores ambientais, especialmente a pluviosidade. Nos estágios iniciais de introdução prevaleceram os exemplares menores, contudo no panorama geral, predominaram as classes de tamanho intermediárias. Em menos de um ano de introdução, P. acuta se estabeleceu neste riacho, e possivelmente está afetando as demais espécies encontradas no rio. A informação apresentada aqui é importante para a compreensão do processo de invasão de moluscos invasores no Brasil, assim como no direcionamento de esforços de conservação.

Genetic diversity of Shepherd dog using pedigree analysis / Diversidade genética em cães da raça Pastor Alemão utilizando análise de pedigree

ABSTRACT: The German Shepherd dog breed is the most popular breed globally and in Brazil. The study of the population structure through pedigree information is an essential tool to understand the history of the Brazilian German Shepherd dog breed. This study evaluated the status of genetic diversity and population structure of the Brazilian German Shepherd dog breed. The pedigree included a total of 77,938 animals born between 1970 and 2014. The average generation interval in this population was 3.91 years. Considering the reference population, 2,183 founders were identified. Approximately 3% of the genetic diversity of the current population (2010-2014) was lost, most of which was due to genetic drift. The effective population size was relatively small, and the pedigree showed bottlenecks indicating a loss of genetic diversity in this breed. These results indicated the need to adopt measures against the excessive increase in inbreeding and monitor effective population size to minimize genetic diversity loss.

RESUMO: A raça Pastor Alemão é uma das raças mais populares no mundo e no Brasil. O estudo da estrutura populacional por meio de informações de pedigree é uma ferramenta essencial para o entendimento da história dessa raça no Brasil. Objetivou-se com o estudo avaliar o status da diversidade genética e da estrutura populacional de cães da raça Pastor Alemão. O pedigree incluiu um total de 77.938 animais nascidos entre 1970 e 2014. O intervalo médio de geração nesta população foi de 3,91 anos. Considerando a população de referência, foram identificados 2.183 fundadores. Cerca de 3% da diversidade genética da população atual (2010-2014) foi perdida, a maior parte devido à deriva genética. O tamanho efetivo da população foi relativamente pequeno e o pedigree apresentou gargalos indicando uma perda de diversidade genética nesta raça. Esses resultados indicam a necessidade de adoção de medidas contra o aumento excessivo da endogamia e do monitoramento do tamanho efetivo da população para minimizar a perda de diversidade genética.

Anthelmintic usage on the Reproductive Parameters in Captive reared Agoutis (Dasyprocta leporina) in Trinidad and Tobago, West Indies / Uso de anti-helmíntico nos parâmetros reprodutivos em cutias criadas em cativeiro (Dasyprocta leporina) em Trinidad e Tobago, Índias Ocidentais

Abstract The agouti (Dasyprocta leporina) is a rodent that is found in the Neo-tropical region. This animal is hunted for its meat but has recently been reared in captivity as a source of meat protein in rural communities. A 20-month experiment was carried out to evaluate the effect of an anthelmintic on the reproductive performance of the agouti (Dasyprocta leporina) reared in captivity. This experiment was conducted in the humid tropics of Trinidad and Tobago. Sixteen animals (15 females, 1 male) placed in each of the two treatment groups in a completely randomized study design. In treatment 1 (T1) animals were given subcutaneous injections of Endovet Ces® (Ivermectin/Praziquantel) at 0.2 mg/kg every three months. Treatment 2 (T2) was the negative control group where animals were not exposed to an anthelmintic. Reproductive data were collected at parturition which included birth weight, litter weight, litter size and gender of offspring. The results showed that there was no statistical difference (p > 0.05) between the treatment groups with respect to birth weight, litter weight, litter size and gender. However, agoutis that were dewormed had a higher birth weight (220.24 g vs 209.1 g) and litter weight (369.8 g vs 343 g). The same values were obtained for the litter size (1.7 vs 1.7) and animals that were dewormed had a higher female offspring to male offspring (2.41:1 vs 1.11:1). This experiment demonstrated that the use of an anthelmintic strategically in the management of captive reared agoutis had no statistical effect (p > 0.05) on the reproductive parameters. Therefore, these animals can be kept in captive conditions without being dewormed and produce efficiently with proper feeding and housing management.

Resumo A cutia (Dasyprocta leporina) é um roedor que se encontra na região neo-tropical. Esse animal é caçado por sua carne, mas recentemente foi criado em cativeiro como fonte de proteína de carne em comunidades rurais. Um experimento de 20 meses foi realizado para avaliar o efeito de um anti-helmíntico no desempenho reprodutivo de cutias (Dasyprocta leporina) criadas em cativeiro. Esse experimento foi conduzido nos trópicos úmidos de Trinidad e Tobago. Dezesseis animais (15 fêmeas, 1 macho) colocados em cada um dos dois grupos de tratamento em um desenho de estudo completamente randomizado. No tratamento 1 (T1) os animais receberam injeções subcutâneas de Endovet Ces® (Ivermectina / Praziquantel) na dose de 0,2 mg / kg a cada três meses. O tratamento 2 (T2) foi o grupo de controle negativo onde os animais não foram expostos a um anti-helmíntico. Os dados reprodutivos foram coletados no parto, incluindo peso ao nascer, peso da ninhada, tamanho da ninhada e sexo da prole. Os resultados mostraram que não houve diferença estatística (p > 0,05) entre os grupos de tratamento com relação ao peso ao nascer, peso da ninhada, tamanho da ninhada e sexo. No entanto, cutias desparasitadas tiveram maior peso ao nascer (220,24 g vs. 209,1 g) e peso da ninhada (369,8 g vs. 343 g). Os mesmos valores foram obtidos para o tamanho da ninhada (1,7 vs. 1,7) e os animais que foram desparasitados tiveram uma prole feminina maior do que a prole masculina (2,41: 1 vs. 1,11: 1). Esse experimento demonstrou que o uso de anti-helmíntico estrategicamente no manejo de cutias criadas em cativeiro não teve efeito estatístico (p > 0,05) sobre os parâmetros reprodutivos. Portanto, esses animais podem ser mantidos em cativeiro sem serem vermifugados e produzir de forma eficiente com alimentação adequada e manejo do alojamento.

Dr Association of bone morphogenetic protein 15 and growth differentiation factor 9 with litter size in livestock: a review study

Litter size is one of the crucial factors in livestock production and is of high economic value, which is affected by ovulation rate, hormones, and growth factors.Growth factors play a multifaceted role in reproductive physiology. This review aims to investigate the association of bone morphogenetic protein 15 (BMP15) and growth differentiation factor 9 (GDF9)with litter size in livestock.The transforming growth factor ß(TGF-ß) superfamily includes more than 34 members; GDF9 and BMP15 are among the most significantfactors for regulating fertility and litter size in most livestock species. Ovarian follicles release BMP15 and GDF9 that are involved in the maturation of primary follicles into the basal form, proliferation of granulosa and theca cells, steroidogenesis, ovulation, and formation of the corpus luteum. Besides, these factors are highly expressed in oocytes and are necessary for female fertility and multiple ovulation in several livestock species. Animals with two inactive copies of these factors are sterile, while those with one inactive copy are fertile. Thus, the present reviewprovides valuable information on the association of BMP15 and GDF9with litter size in livestock that can be used as biological markers of multiple ovulation or for improving fertility in livestock.(AU)

Threonine-to-lysine ratio in laying hens: physiological parameters and organ weight

The objective of this study was to evaluate the effect of threonine:digestible lysine ratio in the diet on the physiological variablesand weight of organs of light laying hens. Two hundred and ten 47 week-old Dekalb White laying henswere distributed in a completely randomized design, with five levels of threonine (0.507; 0.552; 0.597; 0.642 and 0.677%) and seven replicates of six birds each. The experimental period was 10 weeks, totaling 62 days and more eight days for the animals to adapt. The physiological parameters of cloacal temperature (CT), respiratory rate (RR) and average surface temperature (AST) were recorded weekly (7:00 am, 10:00 am, 1:00 pm, 4:00 pm, and 7:00 pm); after solid and water fasting,the birds were slaughtered to assess the absolute weight of the organs. The time of day influenced (p < 0.05) the physiological parameters RR and AST, and CT showed a significant effect (p < 0.05) of increasing levels of digestible threonine. The total weight of the pancreas, proventriculus and lung showed a significant effect (p < 0.05) of the increase in the levels of digestible threonine. The respiratory rate is affected by the levels of threoninein the diet. The 0.687% level promoted hypertrophy of the pancreas, proventriculus and lung, promoting more significant activity of these organs.(AU)

Fishers' knowledge on abundance and trophic interactions of the freshwater fish Plagioscion squamosissimus (Perciformes: Sciaenidae) in two Amazonian rivers

Small-scale fisheries provide income and food security to local peoples around the world. In the Brazilian Amazon, the pescada (Plagioscion squamosissimus) is among the fishes that contributes most to catches in small-scale fisheries. Our main goal was to evaluate the abundance, size, relevance to small-scale fisheries and trophic ecology of P. squamosissimus in the Tapajós and Tocantins rivers, in the Brazilian Amazon. We combined data from fishers' local ecological knowledge (LEK) and fish sampling. We expected that fishers in the Tapajós River, less altered by anthropic changes, would cite a higher abundance, larger size and more prey and predators of P. squamosissimus. We interviewed 61 and 33 fishers and sampled fish in nine and five sites in the Tapajós and Tocantins rivers, respectively. The comparison between fishers' citations and fish sampled indicated a higher relevance of P. squamosissimus to fishers in the Tapajós River, where this fish had an average larger size and where the fishers mentioned more food items. This pattern could be partially related to the history of anthropogenic changes in the Tocantins River. These results indicated that P. squamosissimus is a generalist fish, which could be resilient to fishing and environmental pressures.(AU)

A pesca de pequena escala fornece renda e segurança alimentar para as populações locais em todo o mundo. Na Amazônia brasileira, a pescada (Plagioscion squamosissimus) está entre os peixes que mais contribuem para as capturas em pescarias de pequena escala. Nosso objetivo principal foi avaliar a abundância, tamanho, relevância para a pesca artesanal e ecologia trófica de P. squamosissimus nos rios Tapajós e Tocantins, na Amazônia brasileira. Combinamos dados do conhecimento ecológico local dos pescadores (CEL) e amostragem de peixes. Esperávamos que os pescadores do rio Tapajós, menos alterado por mudanças antrópicas, citassem maior abundância, maior tamanho e mais presas e predadores de P. squamosissimus. Entrevistamos 61 e 33 pescadores e amostramos peixes em nove e cinco locais nos rios Tapajós e Tocantins, respectivamente. A comparação entre as citações dos pescadores e os peixes amostrados indicou uma maior relevância de P. squamosissimus para os pescadores do rio Tapajós, onde este peixe teve um tamanho médio maior e onde os pescadores mencionaram mais itens alimentares. Esse padrão pode estar parcialmente relacionado ao histórico de mudanças antrópicas no rio Tocantins. Esses resultados indicaram que P. squamosissimus é um peixe generalista, que pode ser resiliente à pesca e às pressões ambientais.(AU)

Sampling sufficiency, correlation and path analysis in showy rattlebox / Suficiência amostral, correlação e análise de trilha em crotalária spectabilis

It is important to adequately size the number of plants that should be evaluated to allow precise inferences about the traits under evaluation. The study of the linear relations among traits provides important information, especially in the identification of traits for indirect selection. So, the objectives of this work were to determine the sample size (number of plants) to estimate the mean of Crotalaria spectabilis traits and investigate the relations among traits. Were randomly selected 200 and 110 plants of C. spectabilis in the experiments conducted, respectively, in 2019/2020 and 2020/2021. In these 310 plants, the following traits were evaluated: plant height, stem diameter, number of nodes, number of leaves, leaf fresh matter, stem fresh matter, shoot fresh matter, leaf dry matter, stem dry matter and shoot dry matter. The sample size was calculated to estimate the mean of these traits, based on Student's t-distribution, and the relations among traits were investigated through correlation and path analysis. To estimate the mean of these ten traits of C. spectabilis, with a maximum error of 10% of the mean and 95% confidence level, 64 plants are needed. In an experiment, to estimate the mean of each treatment with 10% precision, 64 plants per treatment must be evaluated. The number of leaves has a positive linear relation with the amount leaf, stem and shoot fresh and dry matter.

É importante dimensionar adequadamente o número de plantas que devem ser avaliadas para possibilitar inferências precisas sobre os caracteres em avaliação. O estudo das relações lineares entre caracteres fornece informações importantes, especialmente, na identificação de caracteres para seleção indireta. Assim, os objetivos deste trabalho foram determinar o tamanho de amostra (número de plantas) necessário para a estimação da média de caracteres de Crotalaria spectabilis e investigar as relações entre os caracteres. Foram selecionadas, aleatoriamente, 200 e 110 plantas de C. spectabilis, nos experimentos conduzidos, respectivamente, em 2019/2020 e 2020/2021. Nessas 310 plantas avaliaram-se os caracteres altura de planta, diâmetro de caule, número de nós, número de folhas, matéria fresca de folhas, matéria fresca de caule, matéria fresca de parte aérea, matéria seca de folhas, matéria seca de caule e matéria seca de parte aérea. Foi calculado o tamanho de amostra para a estimação da média desses caracteres, com base na distribuição t de Student e investigada a relação entre os caracteres por meio de análises de correlação e de trilha. Para a estimação da média, desses dez caracteres de C. spectabilis, com erro máximo de 10% da média e grau de confiança de 95%, são necessárias 64 plantas. Em um experimento, para a estimação da média de cada tratamento com 10% de precisão, devem ser avaliadas 64 plantas por tratamento. O número de folhas tem relação linear positiva com a quantidade de matérias fresca e seca de folhas, do caule e de parte aérea.