Genetic divergence between genotypes for male and female broilers / Divergência genética entre genótipos de frangos de corte machos e fêmeas

The aim of this study was to verify the genetic divergence amongst three broiler genotype, from both sexes, by means of a multivariate performance analysis and carcass traits. Nine hundred and ninety sexed, one-day chicks were utilized; belonged to the following genetic groups: Cobb 500, Hubbard Flex, and Ross 308. The study evaluated the daily average weight gain, the daily average ration consumption, feed conversion, body weight, weight and performance for breast, and carcass over the period from 1 to 35, and from 1 to 42 days of age. Performance of the genetic groups was evaluated by means of multivariate analysis of variance and by Fisher's linear discriminant function, using Roy's largest eigenvalue and Roy's union-intersection test for multiple comparisons. The genetic divergence study was carried out through the analysis of canonical variables and through Tocher method. Female animals from Cobb 500, Hubbard Flex, and Ross 308 genetic groups presented different canonical averages from males of the same groups. First two canonical variables explained 88.10% of variation between genetic groups. Genetic divergence between the evaluated groups allowed formation of two clusters with the following genotypes: Cluster 1 - Cobb 500, Hubbard Flex and Ross 308 females; Cluster 2 - Cobb 500, Hubbard Flex and Ross 308 males.(AU)

Objetivou-se com este estudo verificar a divergência genética entre três genótipos de frangos de corte, de ambos os sexos, utilizando o desempenho e as características de carcaça por meio da análise multivariada. Utilizaram-se 990 pintos de um dia, sexados, dos seguintes grupos genéticos: Cobb 500, Hubbard Flex, e Ross 308. Avaliaram-se as seguintes variáveis: ganho em peso médio diário, consumo de ração médio diário, conversão alimentar, peso corporal, peso e rendimento do peito e da carcaça, nos períodos: 1 a 35 dias e 1 a 42 dias de idade. O desempenho dos grupos genéticos foi avaliado por meio da Análise de Variância Multivariada e da função discriminante linear de Fisher, usando os testes do maior autovalor de Roy e da união-interseção de Roy para as comparações múltiplas. O estudo da divergência genética foi feito por meio da análise por variáveis canônicas e pelo método de otimização de Tocher. As fêmeas dos grupos genéticos Cobb 500, Hubbard Flex e Ross 308 apresentaram médias canônicas diferentes dos machos desses mesmos genótipos. As duas primeiras variáveis canônicas explicaram 88,10% da variação entre os grupos genéticos. A divergência genética entre os grupos genéticos avaliados permitiu a formação de dois grupos com os seguintes genótipos: grupo 1 - Fêmeas Cobb 500, Hubbard Flex e Ross 308; e grupo 2 - Machos Cobb 500, Hubbard Flex e Ross 308.(AU)

ANÁLISE DOS COMPONENTES PRINCIPAIS PARA CARACTERÍSTICAS DE DESEMPENHO E CARCAÇA DE OVINOS MESTIÇOS SUFFOLK

Analisar correlações simples e a análise dos componentes principais, a fim de associar o desempenho das carcaças de ovinos mestiços Suffolk terminados em confinamento. Foram utilizados 61 ovinos machos mestiços (Suffolk), não castrados e abatidos com média de 44,18 kg. Os componentes analisados foram: peso de abate (PA), comprimento externo da carcaça (CEC), largura da garupa (LG), perímetro da garupa (PG), largura torácica (LT), profundidade torácica (PT), perímetro de perna (PP) e peso da carcaça quente (PCQ). Para determinar os coeficientes de associação entre todas as características envolvidas no estudo, foi utilizada a correlação linear de Pearson considerando uma associação significativa ao nível de 5% (P <0,05). Os componentes principais foram utilizados com a finalidade de transformar variáveis associadas em um novo grupo de variáveis não correlacionadas e, assim, verificar quais dados representam a maior parte da variação fenotípica, reduzindo a dimensão dos mesmos. Essas novas variáveis não correlacionadas são relatadas em ordem decrescente em relação ao número de variação atribuída a elas. As correlações lineares entre o desempenho e as características das carcaças variaram de -0,15 (PP com relação a LG) à 0,63 (PA com relação ao PCQ). Observou-se com a análise de cluster que dois grandes grupos foram formados pela distância euclidiana no método de Ward devido à maior razoabilidade entre si. O primeiro grupo apresentou as características: PP, PA, PCQ e CEC; o segundo grupo foi composto pelas características: PG, PT, LT e LG. Através da análise multivariada foi possível extrair quatro componentes principais que, juntos, explicaram 78,35% da variação total dos dados, com autovalor superior a 0,70. Por meio do primeiro componente principal (PC1 = 38,94%), para descartar descritores redundantes ou não discriminantes, quatro características (PA, PCQ, LT e CEC) foram selecionadas e consideradas mais importantes na descrição da variabilidade dos dados estudados. O PA foi a variável selecionável para representar as demais características da carcaça, devido ao seu maior poder discriminatório. Além disso, essa característica pode ser considerada mais fácil para mensuração sendo mais econômica para o criador.

To analyze simple correlations and of the mains components, in order to associate the performance mixed-race Suffolk sheep carcass finished in confinement. 61 male mixed-race sheep (Suffolk), non-castrated, were used, slaughtered with average of 44,18 Kg. The analyzed components were: slaughter weight (PA), external carcass length (CEC), croup width (LG), croup perimeter (PG), chest width (LT), thoracic depth (PT), leg perimeter (PP) and hot carcass weight (PCQ). To determinate the association coefficients between all characteristics involved in this study, Pearson linear correlation was used, considering a significative association at 5% level (P < 0,05). The main components were utilized with the goal to transform associated variables into a new group of non-corelated variables, and so, verify which data represent the most phenotypical variation part, reducing the dimension between them. These new non-corelated variables are reported in crescent order in relation to the variation number attributed to them. The linear correlations between performance and carcass characteristics vary from -0,15 (PP in relation to PG) to 0,63 (PA in relation to PCQ). It was observed in the cluster analysis that two major groups were formed by the Euclidian distance in the ward method due to a greater reasonableness of each other. The first group presented the characteristics of: PP, PA, PCQ and CEC; the second group was composed by the characteristics of: PG, PT, LT and LG. Through multivariate analysis it was able to extract four main components that, together, explains 78,35% of all data variation, with self-worth superior to 0,7. Through the first main component (PC1= 38,94%), to discard redundant descriptors or non-discriminants, four characteristics (PA, PCQ, LT and CEC) were selected and considered more important to describe the variability of the studied data. The PA was the variable selectable to represent the other characteristics of carcass, due to its bigger discriminant power. Besides that, this characteristic can be considered easier to measure being more economic to the breeder.

Divergência genética entre codornas de corte para características de produção / Genetic divergence between meat type quails for performance traits

Objetivou-se verificar a divergência genética entre linhagens de codornas de corte e seus cruzamentos para as características de desempenho através da análise multivariada. Foram utilizadas quatro linhagens de codornas de corte em um sistema de cruzamentos dialélicos completos, proporcionando a formação de 16 grupos de progênies, sendo quatro parentais puros: L1, L2, L3 e L4; seis grupos genéticos mestiços F1: G12, G13, G14, G23, G24 e G34; e seis grupos genéticos mestiços F1 recíprocos. Foram avaliadas as seguintes variáveis: peso corporal médio ao nascimento, aos 28, aos 35 e aos 42 dias de idade; o consumo médio de dieta do nascimento aos 35 e aos 42 dias de idade; a conversão alimentar do nascimento aos 35 e aos 42 dias de idade; e o ganho em peso do nascimento aos 35 e aos 42 dias de idade. O desempenho dos grupos genéticos foi avaliado por meio da análise de variância multivariada e a primeira variável canônica, usando os testes do maior autovalor de Roy e da união-interseção de Roy para as comparações múltiplas. O estudo da divergência genética foi feito por meio da análise por variáveis canônicas e pelo método de otimização de Tocher. As três primeiras variáveis canônicas explicaram 88,82% da variação entre os grupos genéticos. A divergência genética entre os grupos genéticos avaliados permitiu a formação de quatro grupos: 1 - L1, G12, G23, G21 e G41; 2 - G13 e G31; 3 - L4 e G43; 4 - G32; 5 - G14 e G24; 6 - G42 e 7 - L2, L3 e G34, identificando a L4 como a linhagem que mais influiu na formação de novo grupos.(AU)

The objective was to evaluate the genetic divergence between lineages of quail and their crosses to the performance characteristics through multivariate analysis. Four lines of quails were used in a complete diallel system, provided training to 16 groups of progenies, four parental pure: L1, L2, L3 and L4; six genetic groups crossbred F1: G12, G13, G14, G23, G24 and G34; and six reciprocal F1 crossbred genetic groups. The variables were evaluated: mean body weight at birth, at 28, at 35 and 42 days of age; the average consumption of diet from birth to 35 and 42 days of age; feed conversion birth at 35 and 42 days of age; and the weight gain from birth to 35 and 42 days of age. The performance of genetic groups was assessed by multivariate analysis of variance and the first canonical variable, using the tests of the largest eigenvalue of Roy and Roy union-intersection for multiple comparisons. The study of genetic diversity was done by canonical variate analysis and by the optimization method of Tocher. The first three canonical variables explained 88.82% of the genetic variation between groups. The genetic divergence between the analyzed genetic groups allowed the formation of four groups: 1 - L1, G12, G23, G21 and G41; 2 - G13 and G31; 3 - L4 and G43; 4 - G32; 5 - G14 and G24; 6 - G42 and 7 - L2, L3, identifing L4 G34 as the lineage that most influenced the formation of new groups.(AU)

Divergência genética entre genótipos de frangos tipo caipira / Genetic divergence between genotypes of alternative strain of broiler chickens

Objetivou-se com este trabalho verificar a divergência genética entre sete genótipos de frangos tipo caipira da linhagem Redbro utilizando as características de desempenho por meio de técnicas de análise multivariada. Foram utilizados 840 pintos de um dia, machos, distribuídos em delineamento inteiramente ao acaso, dos seguintes genótipos: Caboclo, Carijó, Colorpak, Gigante Negro, Pesadão Vermelho, Pescoço Pelado e Tricolor. Após a consistência dos dados, foram avaliadas as seguintes variáveis: ganho em peso médio diário, consumo de ração médio diário e conversão alimentar, para os períodos: 1 a 28, 1 a 56, 1 a 70 e 1 a 84 dias de idade; peso corporal ao nascimento, aos 28, 56, 70 e aos 84 dias de idade. O desempenho dos genótipos foi avaliado por meio da análise de variância multivariada e da função discriminante linear de Fisher, usando os testes do maior autovalor de Roy e da união-interseção de Roy para as comparações múltiplas. O estudo da divergência genética foi feito por meio da análise por variáveis canônicas e pelo método de otimização de Tocher. Os genótipos Caboclo e Gigante Negro apresentaram médias canônicas diferentes dos demais genótipos. As duas primeiras variáveis canônicas explicaram 97,41% da variação entre os genótipos. A divergência genética entre os genótipos avaliados permitiu a formação de quatro grupos com os seguintes genótipos: grupo 1 - Colorpak; grupo 2 - Pesadão Vermelho e Pescoço Pelado; grupo 3 - Carijó e Tricolor; e grupo 4 - Caboclo e Gigante Negro.(AU)

The aim of this study was to evaluate the genetic divergence among seven genotypes of alternative strain of broiler chickens of the Redbro strain using the performance characteristics using multivariate analysis. We used 840 day old male chicks, distributed in a completely randomized design, with the following genotypes: Caboclo, Carijó, Colorpak, Gigante Negro, Pesadão Vermelho, Pescoço Pelado and Tricolor. After the consistency of the data, the following variables were analyzed: average daily gain, average daily feed intake and feed conversion for the periods: 1 to 28, 1 to 56, 1 to 70 and 1 to 84 days of age, body weight at birth, at 28, 56, 70 and at 84 days old. The performance of genotypes was assessed by multivariate analysis of variance and Fisher's linear discriminant function, using the tests of the largest eigenvalue of Roy and the Roy union-intersection for multiple comparisons. The study of genetic diversity was done by canonical variate analysis and the method of Tocher. The genotypes Caboclo and Gigante Negro had different canonical averages from the other genotypes. The first two canonical variables accounted for 97.41% of the variation among genotypes. The genetic divergence between the genotypes allowed the formation of four groups with the following genotypes: group 1 - Colorpak, group 2 - Pesadão Vermelho and Pescoço Pelado; group 3 - Carijó and Tricolor, and group 4 - Caboclo and Gigante Negro.(AU)

Caracterização zoométrica de novilhas remanescentes da raça Pantaneira / Morphological characterization of heifers remaining from Pantaneira breed

Esse trabalho apresenta valores médios, erros padrão e correlações de Pearson de 10 medidas lineares (alturas de cernelha, garupa e tórax; perímetros da canela e torácico; comprimentos da garupa e corporal; abertura de ísquio; largura da garupa; e peso corpóreo) de 14 novilhas Pantaneiras, bem como uma análise multivariada por meio de análise de componentes principais (PCA) para reduzir quantidade de variáveis passíveis de serem mantidas e utilizadas em seleção, por apresentar maior contribuição para variação total. Os animais, com idade de 36 meses, não prenhes, pertencem ao Núcleo de Bovinos Pantaneiros de Aquidauana, da Universidade Estadual de Mato Grosso do Sul. As novilhas apresentaram medidas próximas aos bovinos de pequeno porte, como as raças Jersey e Sindi, com peso médio de 375±10Kg. O peso corpóreo apresentou correlação de magnitude moderada e significativa (P 0,05) com as alturas de cernelha (55%) e garupa (69%) e com o comprimento corporal (59%); e alta com perímetro torácico (82%). Nesse sentido, ao escolher exemplares mais altos, compridos e com maior garupa e circunferência torácica, certamente se estará selecionando animais mais pesados. Com base no peso das medidas, foram necessários apenas 4 PCA com autovalor mínimo de 1,0, acumulando 83,95% da variância acumulada. Extraiu-se 1 característica com maior peso em cada PCA, passível de ser mantida em estudos futuros ou em programas de seleção, havendo redução de 60%; sendo assim, indicam-se as medidas de altura e largura de garupa, perímetro torácico e comprimento corporal, como sendo essenciais para a escolha de animais fenotipicamente superiores.

This paper exhibit average values, standard error and Pearson correlations of 10 linear measurements (withers, rump and thorax height; shin and thoracic perimeters; rump and body lengths; opening of ischium; breadth of the rump, and body weight) of 14 heifers Pantaneira breed, as well as a multivariate analysis using principal component analysis (PCA) to reduce the amount of variables that can be kept and used in selection, due to a higher contribution to the total variation. The animals, with 36 months, not pregnant, belong to Nucleus of Cattle Pantaneiros of Aquidauana, University State of Mato Grosso do Sul. The heifers presented measures near the small sized cattle, such as Sindhi and Jersey breeds, with weight of 375±9.95kg. The body weight showed a moderate correlation and significant (P 0.05) with withers (55%) and rump heights (69%) and body length (59%), and high thoracic perimeter (82%). Therefore, by choosing the highest exemplary, of longer and greater rump and thoracic circumference, certainly will be selected the heavier animals. Based on the weight of the measures were needed only 4 PCA with minimum autovalue of 1.0, reaching 83.95% of the cumulative variance. It was extracted 1 characteristic with the highest weight in each PCA, which may be maintained in future studies or screening programs, with a reduction of 60%, thus, indicating the measurements of height and breadth of the rump, thoracic perimeters and length body as being essential to select of animals phenotypically superior.

Caracterização zoométrica de novilhas remanescentes da raça Pantaneira / Morphological characterization of heifers remaining from Pantaneira breed

Esse trabalho apresenta valores médios, erros padrão e correlações de Pearson de 10 medidas lineares (alturas de cernelha, garupa e tórax; perímetros da canela e torácico; comprimentos da garupa e corporal; abertura de ísquio; largura da garupa; e peso corpóreo) de 14 novilhas Pantaneiras, bem como uma análise multivariada por meio de análise de componentes principais (PCA) para reduzir quantidade de variáveis passíveis de serem mantidas e utilizadas em seleção, por apresentar maior contribuição para variação total. Os animais, com idade de 36 meses, não prenhes, pertencem ao Núcleo de Bovinos Pantaneiros de Aquidauana, da Universidade Estadual de Mato Grosso do Sul. As novilhas apresentaram medidas próximas aos bovinos de pequeno porte, como as raças Jersey e Sindi, com peso médio de 375±10Kg. O peso corpóreo apresentou correlação de magnitude moderada e significativa (P 0,05) com as alturas de cernelha (55%) e garupa (69%) e com o comprimento corporal (59%); e alta com perímetro torácico (82%). Nesse sentido, ao escolher exemplares mais altos, compridos e com maior garupa e circunferência torácica, certamente se estará selecionando animais mais pesados. Com base no peso das medidas, foram necessários apenas 4 PCA com autovalor mínimo de 1,0, acumulando 83,95% da variância acumulada. Extraiu-se 1 característica com maior peso em cada PCA, passível de ser mantida em estudos futuros ou em programas de seleção, havendo redução de 60%; sendo assim, indicam-se as medidas de altura e largura de garupa, perímetro torácico e comprimento corporal, como sendo essenciais para a escolha de animais fenotipicamente superiores.(AU)

This paper exhibit average values, standard error and Pearson correlations of 10 linear measurements (withers, rump and thorax height; shin and thoracic perimeters; rump and body lengths; opening of ischium; breadth of the rump, and body weight) of 14 heifers Pantaneira breed, as well as a multivariate analysis using principal component analysis (PCA) to reduce the amount of variables that can be kept and used in selection, due to a higher contribution to the total variation. The animals, with 36 months, not pregnant, belong to Nucleus of Cattle Pantaneiros of Aquidauana, University State of Mato Grosso do Sul. The heifers presented measures near the small sized cattle, such as Sindhi and Jersey breeds, with weight of 375±9.95kg. The body weight showed a moderate correlation and significant (P 0.05) with withers (55%) and rump heights (69%) and body length (59%), and high thoracic perimeter (82%). Therefore, by choosing the highest exemplary, of longer and greater rump and thoracic circumference, certainly will be selected the heavier animals. Based on the weight of the measures were needed only 4 PCA with minimum autovalue of 1.0, reaching 83.95% of the cumulative variance. It was extracted 1 characteristic with the highest weight in each PCA, which may be maintained in future studies or screening programs, with a reduction of 60%, thus, indicating the measurements of height and breadth of the rump, thoracic perimeters and length body as being essential to select of animals phenotypically superior.(AU)

Seleção de características morfofuncionais de cavalos da raça Mangalarga Marchador por meio da análise de componentes principais / Identification of morphofunctional traits in Mangalarga Marchador horse using principal component analysis

Dados de 14.288 animais da raça Mangalarga Marchador, nascidos de 1990 a 2005, foram utilizados para avaliar a redução da dimensionalidade do espaço multivariado para características morfofuncionais, por meio da análise de componentes principais. Foram consideradas as características: altura na cernelha, altura na garupa, comprimento da cabeça, comprimento do pescoço, comprimento do dorso, comprimento da garupa, comprimento da espádua, comprimento do corpo, largura da cabeça, largura das ancas, perímetro do tórax, perímetro da canela e a pontuação da marcha. Para tais características, obtiveram-se sete componentes principais, a partir da matriz de correlação, que apresentaram variância inferior a 0,7 (autovalor inferior a 0,7). Isso sugere sete variáveis para descarte, por apresentarem maiores coeficientes de ponderação, em valor absoluto, a partir do último componente principal. A razão para isso é que variáveis altamente correlacionadas com os componentes de menor variância representam variação praticamente insignificante. Com base nesses resultados, recomendam-se as seguintes características para serem mantidas em trabalhos futuros com esta base de dados: pontuação da marcha, altura na garupa, comprimento do dorso, comprimento da garupa, largura da cabeça e perímetro da canela.(AU)

Records from 14,288 animals of the Mangalarga Marchador breed, born from 1990 to 2005, were used to discard morphofunctional traits in a principal component analysis. The following traits were used: height at withers, height at croup, lengths of head, neck, back, croup, hip length and body, widths of head, hip width, thorax perimeter, cannon bone circumference and gait score. For the traits considered it was observed that 7 principal components showed variation lower than 0.7; suggesting that seven variables could be discarded. The reason is that when variable are highly correlated with the principal components of smaller variance, their variation is practically insignificant. Based on those results the recommendation is to maintain the following traits for future research with this database: gait score, height at croup, length of back, length of croup, width of head and cannon bone circumference.(AU)

Avaliação de características de desempenho e de carcaça de codornas de corte por meio da análise de componentes principais / Evaluation of production and carcass traits of meat - type quails by principal components analysis

Foram utilizados dados de 288 codornas de corte (Coturnix coturnix coturnix) para avaliar a possibilidade de resumir a informação contida no complexo de variáveis originais, eliminando-se variáveis inexpressivas por meio da técnica de componentes principais. Foram registrados o peso vivo (PVIVO) e pesos do peito (PPEITO), das coxas (PCOXA), da gordura abdominal (GA), das vísceras comestíveis (fígado, moela e coração) (FIG, MOELA e CORA) e da carcaça eviscerada (PCEVIS). As carcaças foram secas e trituradas para a avaliação do teor matéria seca (MS), gordura (GORD) e proteína bruta (PB). Dos 11 componentes principais, sete (63,6 por cento) apresentaram variância menor que 0,7 (autovalor inferior a 0,7), sendo sugeridas para descarte, respectivamente, em ordem de menor importância, para explicar a variação total das seguintes variáveis: PCEVIS, PPEITO, PCOXA, CORA, FIG MOELA e GORD. Com base nos resultados, recomenda-se manter as seguintes variáveis em experimentos futuros: PVIVO, MS, PB e GA.(AU)

Records on 288 meat type quails (Coturnix coturnix coturnix) were used to identify independent and informative variables by eliminating inexpressive variables by means of principal component analysis. The following performance traits were recorded: live body weight (LBW), eviscerated carcass weight (CW), whole leg weight (WLW), breast weight (BW), abdominal fat pad weight (FW), and giblets weight (liver, gizzard, and heart) (LIW, GW, and HW). The carcasses were also dried and grounded to evaluate dry matter (DM), fat (FA,T) and crude protein (CP) contents. Out of 11 principal components, seven (63.6 percent) showed variance lower than 0.7 (eigenvalue lower than 0.7). The following traits were discarded because they showed inexpressive contribuitions for the total variation: CW, BW, WLW, HW, LIW, GW, and FAT. Based on the results, it is recommended to record the following variables in future experiments: LBW, DM, CP, and FW.(AU)

Estudo de características de produção de matrizes de corte por meio da análise de componentes principais / Study of meat-type chickens production traits by principal components analysis

Avaliou-se o descarte de variáveis de produção, em análises de componentes principais, de três linhagens de matrizes de corte do Programa de Melhoramento Genético da Universidade Federal de Viçosa, utilizando informações de 270 aves, sendo 90 de cada linhagem. As características analisadas foram dias para postura do primeiro ovo (DPPO), taxa de postura da 22ª a 56ª semana (TP), peso médio individual na 32ª (PMI1), na 40ª (PMI2), na 48ª (PMI3), na 56ª (PMI4) e na 64ª semana (PMI5) e peso médio do ovo, obtido pela média da pesagem de três ovos na 32ª (PMO1), na 40ª (PMO2), na 48ª (PMO3), na 56ª (PMO4) e na 64ª semana (PMO5). Dos 12 componentes principais, sete apresentaram variância menor do que 0,7 (autovalor menor do que 0,7), sugerindo-se sete variáveis para descarte. As variáveis descartadas foram aquelas que apresentaram maiores coeficientes, em valor absoluto, a partir do último componente principal. Observou-se correlação linear simples e significativa entre as variáveis descartadas e as não descartadas, que indica redundância de variáveis, razão do descarte. Recomendam-se as variáveis: DPPO, TP, PM14, PMO1 e PMO4 para o estudo de características da produção de matrizes de frango de corte por meio da análise de componentes principais.(AU)

Records of 270 meat-type chickens from three lines, 90 of each one, were used to discard variables in a principal component analysis. Data were obtained from meat-type chicken lines of the genetic breeding program of the Universidade Federal de Viçosa. The following traits were evaluated: days at first egg (DFE), egg production rate (EPR) from 22nd to 56th week, body weights at 32nd (BW1), 40th (BW2), 48th (BW3), 56th (BW4), and 64th weeks of age (BW5), and average of three egg weights, at 32nd (EW1), 40th (EW2), 48th (EW3), 56th (EW4) and at 64th weeks (EW5). From the 12 principal components, seven showed variance lower than 0,7 (eigenvalue lower than 0,7), suggesting seven variables to be discarded. Variables which showed the highest coefficients, in absolute value, in the last principal component were discarded. Highly correlated variables with the smaller principal components variance explain a small part of the whole variation. In addition, discarded variables in function of the significant simple linear correlation with the nondiscorded variable, were considered redundants. The variables DFE, EPR, BW4, EW1, and EW4 are recommended for principal component analysis of broiler matrix.(AU)

Distribution-free multiple imputation in an interaction matrix through singular value decomposition

Some techniques of multivariate statistical analysis can only be conducted on a complete data matrix, but the process of data collection often misses some elements. Imputation is a technique by which the missing elements are replaced by plausible values, so that a valid analysis can be performed on the completed data set. A multiple imputation method is proposed based on a modification to the singular value decomposition (SVD) method for single imputation, developed by Krzanowski. The method was evaluated on a genotype × environment (G × E) interaction matrix obtained from a randomized blocks experiment on Eucalyptus grandis grown in multienvironments. Values of E. grandis heights in the G × E complete interaction matrix were deleted randomly at three different rates (5%, 10%, 30%) and were then imputed by the proposed methodology. The results were assessed by means of a general measure of performance (Tacc), and showed a small bias when compared to the original data. However, bias values were greater than the variability of imputations relative to their mean, indicating a smaller accuracy of the proposed method in relation to its precision. The proposed methodology uses the maximum amount of available information, does not have any restrictions regarding the pattern or mechanism of the missing values, and is free of assumptions on the data distribution or structure.

Algumas técnicas de análise estatística multivariada só podem ser realizadas com uma matriz de dados completa, porém o processo de coleta dos dados freqüentemente leva a uma matriz com dados ausentes. A imputação é uma técnica, na qual os dados ausentes são preenchidos com valores plausíveis, para uma posterior análise na matriz completa. Neste trabalho, nós propomos um método de imputação múltipla, baseado no método da decomposição por valores singulares (DVS) para imputação simples, desenvolvido por Krzanowski, e avaliado numa matriz de interação genótipos × ambientes (G × E), proveniente de um ensaio com o delineamento aleatorizado em blocos em multiambientes com genótipos de Eucalyptus grandis. Valores da altura de E. grandis da matriz completa de interação G × E foram retirados aleatoriamente em três diferentes proporções (5%, 10%, 30%), os quais foram imputados valores dados pelo método proposto. Os resultados obtidos por meio da medida geral de exatidão ou acurácia (Tacc) mostraram um viés pequeno, em relação aos valores originais. No entanto, seus valores foram maiores do que a variabilidade dos valores imputados em relação à sua média, indicando uma exatidão ou acurácia menor do método proposto em relação à sua precisão. A metodologia proposta utiliza o maior número de informação disponível, não possui qualquer restrição quanto ao padrão e mecanismo de ausência de dados e é livre de suposição sobre a distribuição ou estrutura dos dados.

Distribution-free multiple imputation in an interaction matrix through singular value decomposition

Some techniques of multivariate statistical analysis can only be conducted on a complete data matrix, but the process of data collection often misses some elements. Imputation is a technique by which the missing elements are replaced by plausible values, so that a valid analysis can be performed on the completed data set. A multiple imputation method is proposed based on a modification to the singular value decomposition (SVD) method for single imputation, developed by Krzanowski. The method was evaluated on a genotype × environment (G × E) interaction matrix obtained from a randomized blocks experiment on Eucalyptus grandis grown in multienvironments. Values of E. grandis heights in the G × E complete interaction matrix were deleted randomly at three different rates (5%, 10%, 30%) and were then imputed by the proposed methodology. The results were assessed by means of a general measure of performance (Tacc), and showed a small bias when compared to the original data. However, bias values were greater than the variability of imputations relative to their mean, indicating a smaller accuracy of the proposed method in relation to its precision. The proposed methodology uses the maximum amount of available information, does not have any restrictions regarding the pattern or mechanism of the missing values, and is free of assumptions on the data distribution or structure.

Algumas técnicas de análise estatística multivariada só podem ser realizadas com uma matriz de dados completa, porém o processo de coleta dos dados freqüentemente leva a uma matriz com dados ausentes. A imputação é uma técnica, na qual os dados ausentes são preenchidos com valores plausíveis, para uma posterior análise na matriz completa. Neste trabalho, nós propomos um método de imputação múltipla, baseado no método da decomposição por valores singulares (DVS) para imputação simples, desenvolvido por Krzanowski, e avaliado numa matriz de interação genótipos × ambientes (G × E), proveniente de um ensaio com o delineamento aleatorizado em blocos em multiambientes com genótipos de Eucalyptus grandis. Valores da altura de E. grandis da matriz completa de interação G × E foram retirados aleatoriamente em três diferentes proporções (5%, 10%, 30%), os quais foram imputados valores dados pelo método proposto. Os resultados obtidos por meio da medida geral de exatidão ou acurácia (Tacc) mostraram um viés pequeno, em relação aos valores originais. No entanto, seus valores foram maiores do que a variabilidade dos valores imputados em relação à sua média, indicando uma exatidão ou acurácia menor do método proposto em relação à sua precisão. A metodologia proposta utiliza o maior número de informação disponível, não possui qualquer restrição quanto ao padrão e mecanismo de ausência de dados e é livre de suposição sobre a distribuição ou estrutura dos dados.

Análise de variância multivariada na avaliação de grupos genéticos de matrizes de frangos de corte

The performance of two broiler breeder lines developed by UFV (M1 and F1), in relation to two commercial marks (C1 and C2), were studied by multivariate analysis methods using the test of the largest eigenvalue of Roy, and by means of Union-Intersection test of Roy for multiple comparisons. The following economic traits were analyzed: age at sexual maturity (IMS), egg number (NO), egg weight (PO) and body weight (PM) in three periods of the productive life of the bird,: initial (25th to 32nd week of age), medium (48th to 56th week of age) and total (25th to 62nd week of age). The genotype effect was significant by Roy test. No significant genotype differences for IMS, as well as for NO were observed in the three periods. Significant genotype difference for PO was observed in the initial and medium periods, and no significant difference was observed in the total period. However significant genotype difference for PM was observed only in the initial period.

Por meio de métodos de análise multivariada avaliou-se o desempenho de matrizes de frangos de corte desenvolvidas na UFV (M1 e F1) em relação a duas marcas de mercado (C1 e C2), usando o teste do maior autovalor de Roy e o teste da união-interseção de Roy para as comparações múltiplas. Quatro características de importância econômica foram avaliadas: idade à maturidade sexual (IMS), número de ovos (NO), peso do ovo (PO) e peso das matrizes (PM) em três períodos da vida produtiva das aves, inicial (25ª a 32ª semana de idade), médio (48ª a 56ª semana de idade) e total (25ª a 62ª semana de idade). Pelo teste de Roy constatou-se efeito significativo do genótipo sobre as características estudadas. O teste de médias não detectou diferença significativa entre genótipos para IMS e para NO nos três períodos. Diferença significativa entre genótipos para PO foi verificada apenas nos dois períodos inicial e médio e para PM apenas no período inicial.

Estudo da divergência genética entre raças suínas utilizando técnicas de análise multivariada

Performance and genetic divergence among Duroc, Landrace and Large White breeds, using multivariate techniques were studied. Birth litter size, weaning litter size, birth litter weight, weaning litter weight, average weight gain from birth to weaning and mortality rate from birth to weaning were included in the study. Breed performance was evaluated by multivariate analysis of variance and discriminant linear function of Fisher, using tests of Roy greatest root and Roy union-intersection for multiple comparison. The study of genetic divergence was made by means of canonical variable analyses. Landrace and Large White breeds presented, in general, better performance than Duroc breed in the studied traits, and the three breeds had similar birth litter size. Landrace and Large White breeds were genetically similar but had higher genetic divergence related to Duroc breed.

Avaliação do desempenho e divergência genética entre três raças suínas, Duroc, Landrace e Large White, foram realizadas utilizando-se técnicas de análise multivariada. Foram incluídas no estudo seis características reprodutivas: tamanho da leitegada ao nascimento (TLN), tamanho da leitegada ao desmame (TLD), peso da leitegada ao nascimento (PLN), peso da leitegada ao desmame corrigido para os 21 dias de idade (PL21), ganho de peso médio do nascimento ao desmame (GPM) e taxa de mortalidade do nascimento ao desmame (TM). O desempenho das raças foi avaliado por meio da análise de variância multivariada e da função discriminante linear de Fisher usando os testes do maior autovalor de Roy e da união-interseção de Roy para as comparações múltiplas. O estudo da divergência genética foi feito por meio da análise de variáveis canônicas. As raças Landrace e Large White apresentaram, de modo geral, melhor desempenho que a raça Duroc nas características estudadas. As três raças apresentaram desempenho semelhante na característica tamanho da leitegada ao nascimento. As raças Landrace e Large White foram geneticamente semelhantes porém apresentaram alta divergência genética em relação à raça Duroc.

Estudo da divergência genética entre seis linhas de aves Legorne utilizando técnicas de análise multivariada / Genetic divergence study among six Leghorn lines by multivariate analysis

A divergência genética entre seis linhas de aves Legorne (L1, L2, L3, L4, L5 e L6), desenvolvidas pela UFV, foi avaliada utilizando análise de variáveis canônicas e o método de agrupamento de Tocher. Foram incluídas no estudo oito características: peso corporal na 40ª semana (PC40), na 48ª semana (PC48), na 56ª semana (PC56); peso do ovo na 40ª semana (PO40), na 44ª semana (PO44), na 52a semana (PO52), na 60ª semana (PO60) e taxa de postura da 40ª a 62ª semana (TP). Foi observada diferença entre as linhas quanto às características estudadas. A linha L4 mostrou-se divergente das demais, apresentando a menor média canônica, e foi alocada em grupo distinto das outras pelo teste de Tocher. O desempenho das diferentes linhas foi também avaliado por meio da análise de variância multivariada, usando o teste do maior autovalor de Roy, e por meio do teste de Roy para comparações múltiplas. Verificou-se divergência genética entre as linhas da UFV, sendo PC40 a característica que mais contribuiu para a divergência.(AU)

Genetic divergence among six Leghorn lines (L1, L2, L3, L4, L5 e L6), developed by Universidade Federal de Viçosa, Brazil, was evaluated using canonical variate analysis and grouping method of Tocher. Eight traits were used: body weight at 40 weeks, at 48 weeks, at 56 weeks; egg weight at 40 weeks, at 44 weeks, at 52 weeks, at 60 weeks and laying ratio from 40 to 62 weeks of age. Significant differences were observed among lines for the studied traits. The line L4 was divergent in comparison with the other ones, showed the smallest canonical mean and was allocated in a different group. The performance of different genetic groups was also evaluated by multivariate analysis of variance, using Roy test of the largest eigenvalue and the Roy principle for multiple comparisons. Genetic divergence among UFV's lines was observed and body weight at 40 weeks was the trait that more contributed for this divergence.(AU)

Estudo da divergência genética entre linhagem de matrizes de frangos de corte por meio de análise multivariada / Study on genetic divergence among broilers lines by multivariate analysis

A divergência genética entre quatro linhas de matrizes de frango de corte (L1, L2, L3 e L4) foi estudada usando métodos de análise multivariada. Foram avaliadas quatro características de importância econômica, em três períodos (inicial, médio e total): idade ao primeiro ovo, número de ovos, peso médio do ovo e peso corporal da matriz. O estudo da divergência genética entre as linhas foi feito por meio da análise de variância multivariada, análise de agrupamento usando a distância generalizada de Mahalanobis e o método de otimização de Tocher, e análise por meio de variáveis canônicas. Verificaram-se diferenças significativas pelo teste do maior autovalor de Roy entre os vetores de médias das linhas avaliadas nos três períodos. A análise de agrupamento nos períodos inicial (L1 e L2; L3 e L4) e médio (L2 e L4; L1 e L3) agrupou os quatro genótipos em três grupos, No período total os genótipos foram agrupados em apenas dois grupos (L2, L3, L4 e L1). Na análise por meio de variáveis canônicas verificou-se que as duas primeiras variáveis canônicas explicaram mais de 96 por cento da variação total nos três períodos, o que possibilitou representar o comportamento dos genótipos em um gráfico de dispersão bidimensional. Observou-se que a divergência genética diminuiu quando se considerou o período total de produção.(AU)

Genetic divergence among broiler lines (L1, L2, L3 and L4) was studied by multivariate analysis. Four economic important traits were evaluated in three periods (initial, medium and total): age at first egg, egg number, average egg weight and body weight. The study of the genetic divergence among lines included the following techniques:Multivariate analysis of variance, cluster analysis using Mahalanobis generalized distance and Tocher optimization method, and canonical variables analysis. Significant difference was obtained by the larget Roy eigenvalue test. The cluster analysis of traits in the initial (L1 and L2; L3 and L4) and medium (L2 and L4; L1 and L3) periods grouped the four genotypes in three groups, and in total period the genotypes were grouped in two groups (L2, L3, L4 and L1). Canonical variables analysis showed that the first two canonical variables accounted for more than 96% of the total variation in the three periods. This allowed to represent the performance of genotypes in a bidimensional dispersion graph. In the total period of production study the genetic divergence was lower.(AU)

Assessment of ichthyofaunal diversity of family Cyprinidae in River Panjkora Dir, Khyber Pakhtunkhwa, Pakistan / Avaliação da diversidade ictiofaunística da família Cyprinidae no rio Panjkora Dir, Khyber Pakhtunkhwa, Paquistão

The study explores the Ichthyofaunal diversity of freshwater Cyprinidae fish in the Panjkora River of Dir, Khyber Pakhtunkhwa, Pakistan. A total of 911 fish samples were collected from 5 different sites along the river and identified using standard identification keys. Out of the 911 fish samples, 204 were related to family Cyprinidae, having 4 sub families, i.e Cyprininae representing 3 species i.e Carassius auratus, Cyprinus carpio, Cyprinus watsoni, Danioninae representing 6 species i.e Barilius modestus, Barilius vagra, Barilius pakistanicus, Amblypharangodon mola, Salmophasia punjabensis, Rasbora daniconius, Labeoninae representing 5 species i.e Tor putitora, Crossocheilus diplocheilus, Gara gotyla, Labeo rohita, Labeo diplocheilus, and Barbinae representing 6 species i.e Puntius ticto, Puntius sophore, Puntius chonchonius, Schizothorax esocinus, Schizothorax labiatus and Schizothorax plagiostomus. This study adds 6 new species i.e Amblypharangodon mola, Salmophasia punjabensis, Labeo rohita, Labeo diplocheilus, Puntius chonchonius and Rasbora daniconius for the 1st time which are not reported earlier. EXCEL 2019 and XLSTAT were used for principal components analysis to study richness and correlation of fish diversity. Eigenvalues obtained from Sheringal to Zulam are 3.72, 0.511, 0.37, 0.29 and 0.09 respectively. The higher eigenvalue of Sheringal site shows higher diversity. Water quality study shows that the mean values of water temperature was 16.8°C, pH 7.08, total hardness134.6 mg/L, alkalinity 89.3 mg/L, Nitrate 5.93 mg/L, Chlorine 0.87 mg/L, Nitrite0.02 mg/L and Copper 0.04 mg/L, Iron 0.07 mg/L, Lead 0.002 mg/L. The physicochemical parameters of river Panjkora during the study time remained within the permissible limits as prescribed by the WHO (2005). Gut analysis revealed the presence of algae, nymphs insect's larvae, macroinvertebrates and protozoans.

O presente estudo explora a diversidade ictiofaunística de peixes Cyprinidae de água doce no rio Panjkora de Dir, Khyber Pakhtoonkhwa, Paquistão. Um total de 911 amostras de peixes foram coletadas em 5 locais diferentes ao longo do rio e identificadas usando chaves de identificação padrão. Das 911 amostras de peixes, 204 eram relacionadas à família Cyprinidae, com 4 subfamílias, ou seja, Cyprininae representando 3 espécies, isto é, Carassius auratus, Cyprinus carpio, Cyprinus watsoni, Danioninae, representando 6 espécies, ou seja, Barilius modestus, Barilius vagra, Barilius pakistanicus, Amblypharangodon mola, Salmophasia punjabensis, Rasbora daniconius, Labeoninae representando 5 espécies, ou seja, Tor putitora, Crossocheilus diplocheilus, Gara gotyla, Labeo rohita, Labeo diplocheilus e Barbinae, representando 6 espécies, ou seja, Puntius ticto, Puntius sophore, Puntius chonchonius, Schizothorax esocinus, Schizothorax labiatus e Schizothorax plagio estoma. Este estudo adiciona 6 novas espécies, como Amblypharangodon mola, Salmophasia punjabensis, Labeo rohita, Labeo diplocheilus, Puntius chonchonius e Rasbora daniconius pela primeira vez, que não foram relatadas anteriormente. EXCEL 2019 e XLSTAT foram usados para análise de componentes principais para estudar a riqueza e correlação da diversidade de peixes. Os autovalores obtidos de Sheringal a Zulam são 3,72, 0,511, 0,37, 0,29 e 0,09, respectivamente. O autovalor mais alto do site Sheringal mostra maior diversidade. O estudo da qualidade da água mostra que os valores médios da temperatura da água foram 16,8 °C, pH 7,08, dureza total 134,6 mg/L, alcalinidade 89,3 mg/L, Nitrato 5,93 mg/L, Cloro 0,87 mg/L, Nitrito 0,02 mg/ L e Cobre 0,04 mg/L, Ferro 0,07 mg/L, Chumbo 0,002 mg/L. Os parâmetros físico-químicos do rio Panjkora durante o tempo de estudo permaneceram nos limites permitidos conforme prescrito pela OMS (2005). A análise intestinal revelou a presença de algas, ninfas, larvas de insetos, macroinvertebrados e protozoários.

Padrão de crescimento, parâmetros de desempenho e divergência genética de genótipos de frangos tipo caipira

VELOSO, Rogério de Carvalho. Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri, julho de 2012. 64p. Padrão de crescimento, parâmetros de desempenho e divergência genética de genótipos de frangos tipo caipira. Orientador: Aldrin Vieira Pires. Co-orientador: Rodolpho de Almeida Torres Filho. Dissertação (Mestrado em Zootecnia). Objetivou-se com este trabalho comparar o padrão de crescimento, avaliar o desempenho, as características de carcaça e, verificar a divergência genética por meio de técnicas de análise multivariada de diferentes genótipos de aves tipo caipira. Foram utilizados 840 pintos de um dia, machos, distribuídos em delineamento inteiramente casualizado, dos seguintes genótipos: Caboclo, Carijó, Colorpak, Gigante Negro, Pesadão Vermelho, Pescoço Pelado e Tricolor. Para a determinação das curvas de crescimento do peso corporal das aves, os dados coletados foram avaliados a partir dos modelos não-lineares: Brody, Gompertz, Logístico, Richards e von Bertalanffy. Foi empregado o “proc nlin” do SAS, utilizando o método interativo de Gauss-Newton. Os critérios utilizados para escolha do modelo de melhor ajuste da curva de crescimento foram o coeficiente de determinação, o desvio padrão assintótico, o desvio médio absoluto dos resíduos e o índice assintótico. O estudo do crescimento relativo dos cortes foi realizado mediante o modelo da equação alométrica de Huxley. As características de desempenho (conversão alimentar, ganho em peso médio diário, consumo de ração médio diário) foram avaliadas em quatro períodos: 1 a 28, 1 a 56, 1 a 70 e 1 a 84 dias de idade. As características de carcaça (peso e rendimento de carcaça, peito e pernas) foram obtidas a partir do abate de 2 aves por boxe, aos 85 dias de idade. O peso corporal foi medido ao nascimento, 14, 28, 42, 56, 70 e 84 dias de idade. As análises estatísticas foram realizadas utilizando-se o “proc glm” do SAS. O desempenho dos genótipos também foi avaliado por meio da análise de variância multivariada e da função discriminante linear de Fisher, usando os testes do maior autovalor de Roy e da união-interseção de Roy para as comparações múltiplas. O estudo da divergência genética foi feito por meio da análise por variáveis canônicas e pelo método de otimização de Tocher. Apenas as equações propostas por Gompertz, von Bertalanffy e Logístico atingiram a convergência, sendo que o modelo de von Bertalanffy o mais adequado para descrever o crescimento das aves. Todos os genótipos apresentaram crescimento alométrico tardio, indicando que o crescimento do peito é lento em relação à carcaça. Verificou-se que em todos os períodos, as aves do genótipo Colorpak apresentaram maior peso corporal, consumo de ração médio diário, ganho em peso médio diário e conversão alimentar. Entretanto, os genótipos Caboclo e Gigante Negro apresentaram os piores desempenhos. Quanto ao rendimento de cortes pode ser observado que o genótipo Tricolor diferiu estatisticamente somente do Colorpak o para o rendimento de pernas. Para o rendimento de peito o Carijó e o Pesadão Vermelho diferiu estatisticamente dos genótipos Caboclo e Gigante Negro, não diferindo dos demais. As duas primeiras variáveis canônicas explicaram 97,41% da variação entre os genótipos. A escolha do genótipo para criação deve ser feita de acordo com o interesse de mercado, pois há diferenças no desempenho e no rendimento de carcaça e dos cortes. A divergência genética entre os genótipos avaliados permitiu a formação de quatro grupos com