Behavioral repertoire of the Brazilian spiny-rats, Trinomys setosus and Clyomys laticeps: different levels of sociality

Abstract Behavior is a useful trait for comparative studies that provide the comprehension of phylogenetic relationships among species. Here, we present a description of two spiny-rats species behavioral repertoire, Clyomys laticeps and Trinomys setosus (Rodentia: Echimyidae). The affiliative and agonistic behavioral patterns were sampled during a three-year study of captive populations of wild animals. Observational data were collected in two phases under different arrangements of individuals in groups. We also compare the behavioral traits of T. setosus and C. laticeps with the known behavioral patterns of Trinomys yonenagae. We add categories to the previous descriptions of T. setosus and a standard ethogram for C. laticeps. Trinomys setosus showed a visual and vocal display we called foot-trembling, which was not described in this form and function for other species studied until now. We discuss the differences in their sociality levels and similarities and differences among behavior patterns and repertoires.

Resumo O comportamento é uma característica útil para estudos comparativos que fornecem a compreensão das relações filogenéticas entre as espécies. Apresentamos aqui uma descrição do repertório comportamental de duas espécies de ratos-de-espinho Clyomys laticeps and Trinomys setosus (Rodentia: Echimyidae). Os padrões comportamentais afiliativos e agonísticos foram amostrados durante um estudo de três anos em populações de animais silvestres em cativeiro. Os dados foram coletados em duas fases sob diferentes arranjos de indivíduos em grupos sociais. Comparamos as características comportamentais de T. setosus e C. laticeps com as da espécie mais conhecida, T. yonenagae. Adicionamos categorias às descrições anteriores de T. setosus, e um etograma padrão para C. laticeps. Trinomys setosus mostrou uma exibição visual e vocal que chamamos de saltitar, que não foi descrito nesta forma e função para outras espécies do gênero estudado até agora. Discutimos diferenças nos níveis de socialidade e similaridades e diferenças entre os padrões comportamentais e repertórios.

The influence of primer choice on archaeal phylogenetic analyses based on 16S rRNA gene PCR

Abstract Polymerase chain reaction (PCR) assays targeting 16S rRNA genes followed by DNA sequencing are still important tools to characterize microbial communities present in environmental samples. However, despite the crescent number of deposited archaeal DNA sequences in databases, until now we do not have a clear picture of the effectiveness and specificity of the universal primers widely used to describe archaeal communities from different natural habitats. Therefore, in this study, we compared the phylogenetic profile obtained when Cerrado lake sediment DNA samples were submitted to 16S rDNA PCR employing three Archaea-specific primer sets commonly used. Our findings reveal that specificity of primers differed depending on the source of the analyzed DNA. Furthermore, archaeal communities revealed by each primer pair varied greatly, indicating that 16S rRNA gene primer choice affects the community profile obtained, with differences in both taxon detection and operational taxonomic unit (OTU) estimates.

Resumo A amplificação de genes que codificam o rRNA 16S por reação em cadeia da polimerase (PCR) e o seu subsequente sequenciamento consistem em uma ferramenta importante na caracterização de comunidades microbianas presentes em amostras ambientais. No entanto, apesar do crescente número de sequências de DNA de Archaea depositadas em bancos de dados, a especificidade e efetividade dos iniciadores de PCR descritos como universais e amplamente utilizados na descrição desse grupo ainda não está clara. Neste estudo foram comparados os perfis filogenéticos de comunidades de arqueias obtidos a partir amostras de DNA de sedimentos lacustres do Cerrado submetidas a ensaios de PCR empregando três pares de iniciadores específicos para Archaea, comumente utilizados neste tipo de estudo. Nossos resultados indicam que as comunidades de arqueias detectadas com cada par de iniciadores apresentaram grande variação filogenética, sugerindo que a escolha de iniciadores dirigidos ao gene de rRNA 16S tem efeito significativo no perfil da comunidade descrita, com diferenças tanto em relação aos táxons detectados, como nas estimativas de unidades taxonômicas operacionais (OTU).

Gonadal characterization of the Amazonian fish Serrapinnus kriegi (Characidae: Cheirodontinae)

Abstract The knowledge of the testicular and ovarian morphology of a particular fish species is of paramount importance. Such analyze enables the development of studies and techniques aiming the improvement of their reproduction, management, commercialization and even their conservation. This study performed the ovarian and testicular characterization of the ornamental Amazon fish Serrapinnus kriegi. A total of three males and three females had their gonads analyzed by optical microscopy. Females present ovaries filled with oocytes in asynchronous development, indicating partial spawning in the species. Moreover, the micropyle and micropilar cell formation was observed in primary growing oocytes, representing a precocious oocyte development; and the zona radiata in the final vitellogenic oocytes is thicker than other related species, evidencing the development of a better protection to the embryos in function of the waters turbulence that characterize it spawning sites in the Amazonian streams. The male specimens present anastomosed tubular testes with unrestricted spermatogonia spread along the entire seminiferous tubules. The present data elucidate the dynamic of spermatogenesis and oogenesis of an ornamental Amazonian species, through the description of the male and female germ cells development.

Resumo O conhecimento da morfologia testicular e ovariana de uma determinada espécie de peixe é de suma importância, pois através destas análises é possível o desenvolvimento de estudos e técnicas visando o melhoramento de sua reprodução, manejo e comercialização e até mesmo auxiliar em sua conservação. Este estudo realizou a caracterização ovariana e testicular do peixe Amazônico ornamental Serrapinnus kriegi. Um total de três machos e três fêmeas tiveram suas gônadas analisadas através de microscopia óptica. As fêmeas apresentam ovários preenchidos por oócitos em desenvolvimento assincrônico, indicando desova parcelada da espécie. Além disso, observou-se a formação de micrópila e célula micropilar em oócitos em crescimento primário, representando o desenvolvimento precoce do oócito; a zona radiata nos oócitos vitelogênicos finais é mais espessa em comparação a outras espécies relacionadas, evidenciando o desenvolvimento de uma melhor proteção aos embriões, em função das águas turbulentas que caracterizam seu local de desova nos córregos amazônicos. Os machos apresentam testículos do tipo tubular anastomosado com espermatogônias irrestritas, espalhadas por todo o túbulo seminífero. Os dados apresentados elucidam a dinâmica da espermatogênese e oogênese de uma espécie de peixe ornamental amazônica, por meio da descrição das células germinativas masculinas e femininas.

Description of Pudica wandiquei n. sp. (Heligmonellidae: Pudicinae), a nematode found infecting Proechimys simonsi (Rodentia: Echimyidae) in the Brazilian Amazon / Descrição de Pudica wandiquei n. sp. (Heligmonellidae: Pudicinae), nematódeo encontrado infectando Proechimys simonsi (Rodentia: Echimyidae) na Amazônia brasileira

Abstract A new species of nematode parasite of the subfamily Pudicinae (Heligmosomoidea: Heligmonellidae) is described from the small intestine of Proechimys simonsi (Rodentia: Echimyidae) from the locality of Nova Cintra in the municpality of Rodrigues Alves, Acre state, Brazil. The genus Pudica includes 15 species parasites of Neotropical rodents of the families Caviidae, Ctenomyidae, Dasyproctidae, Echimyidae, Erethizontidae, and Myocastoridae. Four species of this nematode were found parasitizing three different species rodents of the genus Proechimys in the Amazon biome. Pudica wandiquei n. sp. can be differentiated from all other Pudica species by the distance between the ends of rays 6 and 8 and the 1-3-1 pattern of the caudal bursa in both lobes.

Resumo Uma nova espécie de nematódeo da subfamília Pudicinae (Heligmosomoidea: Heligmonellidae) é descrito parasitando o intestino delgado de Proechimys simonsi (Rodentia: Echimyidae) em Nova Cintra, município de Rodrigues Alves, Estado do Acre, Brasil. O gênero Pudica inclui 15 espécies parasitas de roedores Neotropicais das famílias: Caviidae, Ctenomyidae, Dasyproctidae, Echimyidae, Erethizontidae e Myocastoridae. Destas, quatro espécies de nematódeos foram encontradas parasitando três diferentes espécies do roedor Proechimys no bioma Amazônia. Pudica wandiquei n. sp. é diferente das outras espécies de Pudica pela distância entre os raios 6 e 8 e pelo tipo da bolsa caudal, que é 1-3-1 em ambos os lados.

Phylogeny and ultrastructure of Myxobolus rangeli n. sp. (Myxozoa, Bivalvulida), a histozoic parasite in Siluriformes fish from the Amazon region / Filogenia e ultraestrutura de Myxobolus rangeli n. sp. (Myxozoa, Bivalvulida), um parasita histozóico em peixes Siluriformes da região amazônica

A new species of Myxobolus parasitizing the arterial bulb and cardiac musculature of the freshwater fish Pimelodus ornatus Kner, 1858, from the Arari river in the municipality of Cachoeira do Arari, island of Marajó, Pará, Brazil, was described. In the present study, the observed prevalence of myxozoan parasites in the heart tissue of the hosts was 20% (6/30). The myxozoans observed had mature biconvex spores, slightly rounded, an anterior end with two pyriform polar capsules and a posterior end with very evident sporoplasm, measuring 8 ± 0.2 μmin length. The spore width was 5.8 ± 0.4 μm, with a thickness of 3.4 ± 0.2μm. The length of the polar capsules was 3.6 ± 0.3 μm and the width was 1.2 ± 0.2μm, with 6 to 7 turns of the polar filament. The divergences observed, regarding the morphometric and genetic structure of SSU rDNA, in relation to other Myxobolidae already described in the literature, confirm the description of the new species Myxobolus rangeli n. sp.(AU)

Descrição de uma nova espécie de Myxobolus que parasita o bulbo arterial e a musculatura cardíaca do peixe de água doce Pimelodus ornatus Kner, 1858, do rio Arari, no município de Cachoeira do Arari, ilha de Marajó, Pará, Brasil. No presente estudo, a prevalência observada de parasitas mixozoários no tecido cardíaco dos hospedeiros foi de 20% (6/30). Os mixozoários observados apresentavam esporos maduros biconvexos, levemente arredondados, extremidade anterior com duas cápsulas polares piriformes e extremidade posterior com esporoplasma bem evidente, medindo 8 ± 0,2 μm de comprimento. A largura do esporo foi de 5,8 ± 0,4 μm, com espessura de 3,4 ± 0,2 μm. O comprimento das cápsulas polares foi de 3,6 ± 0,3 μm e a largura foi de 1,2 ± 0,2 μm, com 6 a 7 voltas do filamento polar. As divergências observadas, quanto à estrutura morfométrica e genética de SSU rDNA, em relação a outros Myxobolidae já descritos na literatura, confirmam a descrição da nova espécie Myxobolus rangeli n. sp.(AU)

Behavioral repertoire of the Brazilian spiny-rats, Trinomys setosus and Clyomys laticeps: different levels of sociality / Repertório comportamental dos ratos espinhos brasileiros, Trinomys setosus e Clyomys laticeps: diferentes níveis de socialidade

Behavior is a useful trait for comparative studies that provide the comprehension of phylogenetic relationships among species. Here, we present a description of two spiny-rats species' behavioral repertoire, Clyomys laticeps and Trinomys setosus (Rodentia: Echimyidae). The affiliative and agonistic behavioral patterns were sampled during a three-year study of captive populations of wild animals. Observational data were collected in two phases under different arrangements of individuals in groups. We also compare the behavioral traits of T. setosus and C. laticeps with the known behavioral patterns of Trinomys yonenagae. We add categories to the previous descriptions of T. setosus and a standard ethogram for C. laticeps. Trinomys setosus showed a visual and vocal display we called foot-trembling, which was not described in this form and function for other species studied until now. We discuss the differences in their sociality levels and similarities and differences among behavior patterns and repertoires.

O comportamento é uma característica útil para estudos comparativos que fornecem a compreensão das relações filogenéticas entre as espécies. Apresentamos aqui uma descrição do repertório comportamental de duas espécies de ratos-de-espinho Clyomys laticeps and Trinomys setosus (Rodentia: Echimyidae). Os padrões comportamentais afiliativos e agonísticos foram amostrados durante um estudo de três anos em populações de animais silvestres em cativeiro. Os dados foram coletados em duas fases sob diferentes arranjos de indivíduos em grupos sociais. Comparamos as características comportamentais de T. setosus e C. laticeps com as da espécie mais conhecida, T. yonenagae. Adicionamos categorias às descrições anteriores de T. setosus, e um etograma padrão para C. laticeps. Trinomys setosus mostrou uma exibição visual e vocal que chamamos de saltitar, que não foi descrito nesta forma e função para outras espécies do gênero estudado até agora. Discutimos diferenças nos níveis de socialidade e similaridades e diferenças entre os padrões comportamentais e repertórios.

Caracterização, aptidão agrícola e capacidade de uso de um Argissolo Vermelho-Amarelo Eutrófico abrúptico: Estudo de caso em Itapetinga-BA / Characterization, agricultural aptitude and use capacity of 'Argissolo Vermelho-Amarelo Eutrófico abrúptico: a case study in Itapetinga -BA

No município de Itapetinga,90% das terras são ocupadas com pecuária e os Argissolos são os solos mais comuns. A pequena capacidade protetora das pastagens e também o adensamento dos rebanhos, tem causado severa compactação no solo, que se torna preocupante.Diante disso, os objetivos da pesquisa foram: i) caracterizar morfológica, física e quimicamente um Argissolo Vermelho-Amarelo; ii) indicar a aptidão agrícola e capacidade de uso. Realizou-se a caracterização morfológica do solo e coletaram-se amostras dos horizontes para caracterização física equímica. Fisicamente determinou-se a granulometria e argila dispersa em água (ADA). Quimicamente foram analisados os cátions trocáveis do complexo sortivo (Ca2+, Mg2+Na+, K+, Al3+e H+), pH, carbono, nitrogênio total e fósforo disponível,bem como, óxidos Al2O3e Fe2O3 por ataque sulfúrico. Os sistemas de Avaliação de Aptidão Agrícola das Terras e de Capacidade de Uso foram as metodologias utilizadas para essas classificações. A descrição morfológica e dados analíticos permitiram classificar o solo como Argissolo Vermelho-Amarelo Eutrófico abrúptico. Quanto à aptidão agrícola e capacidade de uso, o solo foi classificado como 1abC e IV E-3, respectivamente. Conclui-se que o uso atual está inadequado, recomendando-sepastagens perenes associadas a práticas conservacionistas que evitem a erosão do solo. O caráter abrúptico, aliado à compactação provocada pela pecuária extensiva, agrava ainda mais a perda da capacidade produtiva desse solo, condição representativa para a microrregião de Itapetinga, onde a maiorparte do seu território é coberto por Argissolos Vermelho-Amarelos Eutróficos, sendo cerca de 41%.(AU)

The livestock agriculture fromItapetinga are in area ofArgissolos. Themanagement of livestock has caused compaction. Thus, the purpose of the study was: i) describe the morphological, Chemical, and physical of the Argissolo Vermelho-Amarelo; ii) classify your agricultural aptitude and use capacity. The morphological characterization was described: depth, color, structure, texture, consistency, and transition. The physical analysis was: texture and clay dispersed in water. The Chemical analysis determined the cations (Ca2+, Mg2+ Na+, K+, Al3+ e H+), pH, carbon, nitrogen and phosphorus. The oxides Al2O3and Fe2O3were determined. The "Sistema de Avaliação de Aptidão Agrícola das Terras" and "Sistema de Capacidade de Uso" were used for classification. The soil was classified with Argissolo Vermelho-Amarelo Eutrófico abrúptico. Your aptitude has been graded as 1abC and IV E-3 to use capacity. Therefore, the use of soil is incorrect, because the perennial pasture with practices against erosion is the correct form of use. The abrupt characterwith compaction by the animals result in losses of the productive capacity of the soil.This is reality of the microregion of Itapetingabecausemost ofthe territory is in area of Argissolos Vermelho-Amarelos Eutróficos, totaling 41% of the total area.(AU)

Gonadal characterization of the Amazonian fish Serrapinnus kriegi (Characidae: Cheirodontinae) / Caracterização gonadal do peixe Amazônico Serrapinnus kriegi (Characidae: Cheirodontinae)

Abstract The knowledge of the testicular and ovarian morphology of a particular fish species is of paramount importance. Such analyze enables the development of studies and techniques aiming the improvement of their reproduction, management, commercialization and even their conservation. This study performed the ovarian and testicular characterization of the ornamental Amazon fish Serrapinnus kriegi. A total of three males and three females had their gonads analyzed by optical microscopy. Females present ovaries filled with oocytes in asynchronous development, indicating partial spawning in the species. Moreover, the micropyle and micropilar cell formation was observed in primary growing oocytes, representing a precocious oocyte development; and the zona radiata in the final vitellogenic oocytes is thicker than other related species, evidencing the development of a better protection to the embryos in function of the waters' turbulence that characterize it spawning sites in the Amazonian streams. The male specimens' present anastomosed tubular testes with unrestricted spermatogonia spread along the entire seminiferous tubules. The present data elucidate the dynamic of spermatogenesis and oogenesis of an ornamental Amazonian species, through the description of the male and female germ cells development.

Resumo O conhecimento da morfologia testicular e ovariana de uma determinada espécie de peixe é de suma importância, pois através destas análises é possível o desenvolvimento de estudos e técnicas visando o melhoramento de sua reprodução, manejo e comercialização e até mesmo auxiliar em sua conservação. Este estudo realizou a caracterização ovariana e testicular do peixe Amazônico ornamental Serrapinnus kriegi. Um total de três machos e três fêmeas tiveram suas gônadas analisadas através de microscopia óptica. As fêmeas apresentam ovários preenchidos por oócitos em desenvolvimento assincrônico, indicando desova parcelada da espécie. Além disso, observou-se a formação de micrópila e célula micropilar em oócitos em crescimento primário, representando o desenvolvimento precoce do oócito; a zona radiata nos oócitos vitelogênicos finais é mais espessa em comparação a outras espécies relacionadas, evidenciando o desenvolvimento de uma melhor proteção aos embriões, em função das águas turbulentas que caracterizam seu local de desova nos córregos amazônicos. Os machos apresentam testículos do tipo tubular anastomosado com espermatogônias irrestritas, espalhadas por todo o túbulo seminífero. Os dados apresentados elucidam a dinâmica da espermatogênese e oogênese de uma espécie de peixe ornamental amazônica, por meio da descrição das células germinativas masculinas e femininas.

Redescription and expansion of the geographic distribution of Phenacorhamdia nigrolineata (Siluriformes: Heptapteridae)

Phenacorhamdia nigrolineata is redescribed, and the expansion of its geographic distribution is presented based on abundant new records. Morphological analysis, meristic comparison and osteological description were performed. No one autapomorphy was identified for P. nigrolineata, but the species is identified by an exclusive combination of characters of coloration of the body, morphometric and meristic data (snout length, maxillary and outer mental barbels length; number of vertebrae). A discussion of its geographic distribution, coloration pattern of the body, the putative relationships among some species of the genus, and its conservation status are presented.(AU)

Phenacorhamdia nigrolineata é redescrita e a expansão de sua distribuição geográfica é apresentada com base em abundantes novos registros. Foram realizadas análises morfológicas, comparação merística e descrição osteológica. Nenhuma autapomorfia foi identificada para P. nigrolineata, mas a espécie é identificada por uma combinação exclusiva de caracteres de colorido do corpo, dados morfométricos e merísticos (comprimento do focinho, comprimento dos barbilhões maxilares e mentais externos; número de vértebras). Uma discussão dessa distribuição geográfica, padrão de coloração do corpo, as supostas relações entre algumas espécies do gênero e seu estado de conservação são apresentados.(AU)

Behavioral repertoire of the Brazilian spiny-rats, Trinomys setosus and Clyomys laticeps: different levels of sociality / Repertório comportamental dos ratos espinhos brasileiros, Trinomys setosus e Clyomys laticeps: diferentes níveis de socialidade

Behavior is a useful trait for comparative studies that provide the comprehension of phylogenetic relationships among species. Here, we present a description of two spiny-rats species' behavioral repertoire, Clyomys laticeps and Trinomys setosus (Rodentia: Echimyidae). The affiliative and agonistic behavioral patterns were sampled during a three-year study of captive populations of wild animals. Observational data were collected in two phases under different arrangements of individuals in groups. We also compare the behavioral traits of T. setosus and C. laticeps with the known behavioral patterns of Trinomys yonenagae. We add categories to the previous descriptions of T. setosus and a standard ethogram for C. laticeps. Trinomys setosus showed a visual and vocal display we called foot-trembling, which was not described in this form and function for other species studied until now. We discuss the differences in their sociality levels and similarities and differences among behavior patterns and repertoires.(AU)

O comportamento é uma característica útil para estudos comparativos que fornecem a compreensão das relações filogenéticas entre as espécies. Apresentamos aqui uma descrição do repertório comportamental de duas espécies de ratos-de-espinho Clyomys laticeps and Trinomys setosus (Rodentia: Echimyidae). Os padrões comportamentais afiliativos e agonísticos foram amostrados durante um estudo de três anos em populações de animais silvestres em cativeiro. Os dados foram coletados em duas fases sob diferentes arranjos de indivíduos em grupos sociais. Comparamos as características comportamentais de T. setosus e C. laticeps com as da espécie mais conhecida, T. yonenagae. Adicionamos categorias às descrições anteriores de T. setosus, e um etograma padrão para C. laticeps. Trinomys setosus mostrou uma exibição visual e vocal que chamamos de saltitar, que não foi descrito nesta forma e função para outras espécies do gênero estudado até agora. Discutimos diferenças nos níveis de socialidade e similaridades e diferenças entre os padrões comportamentais e repertórios.(AU)

Perfil profissional e técnico dos fiscais de inspeção sanitária do RS relacionado à cisticercose bovina / Professional and technical profile health inspection inpectors in RS related to bovine cysticercosis

A cisticercose bovina é responsável por elevados prejuízos na cadeia produtiva da carne, estando relacionada a uma das principais enfermidades transmitidas por alimentos. O objetivo deste trabalho é conhecer o perfil de Médicos Veterinários atuantes no sistema de inspeção oficial sobre questões ligadas à inspeção sanitária de carcaças bovinas e ao complexo teníase-cisticercose, bem como a sua interpretação da legislação (Decreto n o 9013/2017) relacionada à cisticercose. No período de junho a julho de 2020 foi realizado um levantamento sob forma de questionário a médicos veterinários que trabalhavam na inspeção do Estado do Rio Grande do Sul sobre questões ligadas a carcaças bovinas e ao complexo teníasecisticercose. Foram entrevistados 58 médicos veterinários que atuam no Sistema de Inspeção Estadual (SIE), em relação à legislação. Desses, 46,55% não consideram a legislação aplicada aos casos de cisticercose clara e de fácil interpretação. Sobre a rotina de inspeção, 25% não realizam treinamento de reciclagem e 6,90% dos fiscais não monitoram as atividades dos seus auxiliares durante a rotina de inspeção dos sítios pré-determinados. Sobre o método de inspeção, 70,69% afirmam ser insuficiente a pesquisa de cisticercos realizada na linha de abate para garantir a sanidade da carcaça. A decisão de liberar a carcaça com apenas um cisticerco calcificado após inspeção completa é considerada errada por 55,17%. De acordo com a interpretação dos Médicos Veterinários, observou-se que a legislação vigente deve ser questionada e que os estudos contribuem para uma melhora da qualidade do sistema de Inspeção Estadual nos produtos de origem animal.(AU)

Bovine cysticercosis is responsible for high losses in the meat production chain, being related to one of the main diseases transmitted by food. The objective of this work is to know the profile of Veterinarians in the official inspection system on issues related to the health notification of bovine carcasses and the taeniasis-cysticercosis complex and their interpretation of the legislation (Decree No. 9013/2017) related to cysticercosis. From June to July 2020, a survey was carried out in the form of care for veterinarians who attended surveillance in the State of Rio Grande do Sul on issues related to bovine carcasses and the taeniasis-cysticercosis complex. There were 58 veterinarians who work in the State Inspection System (SIE), in relation to legislation, 46.55% of doctors do not consider the legislation applied to cases of cysticercosis clear and easy to interpret. About the maintenance routine, 25% did not call for refresher training and 6.90% of the inspectors do not monitor the activities of their assistants during the maintenance routine of the predetermined sites. Regarding the method of protection, 70.69% claim that the survey of cysticerci carried out on the slaughter line is insufficient to guarantee the health of the carcass. The decision to release the carcass with only one calcified cysticercus after complete verification is considered wrong by 55.17%. According to the interpretation of the Veterinarians, it was observed that the current legislation must be questioned and that the studies obeyed to improve the quality of the State Inspection system in products of animal origin.(AU)

Gonadal characterization of the Amazonian fish Serrapinnus kriegi (Characidae: Cheirodontinae) / Caracterização gonadal do peixe Amazônico Serrapinnus kriegi (Characidae: Cheirodontinae)

The knowledge of the testicular and ovarian morphology of a particular fish species is of paramount importance. Such analyze enables the development of studies and techniques aiming the improvement of their reproduction, management, commercialization and even their conservation. This study performed the ovarian and testicular characterization of the ornamental Amazon fish Serrapinnus kriegi. A total of three males and three females had their gonads analyzed by optical microscopy. Females present ovaries filled with oocytes in asynchronous development, indicating partial spawning in the species. Moreover, the micropyle and micropilar cell formation was observed in primary growing oocytes, representing a precocious oocyte development; and the zona radiata in the final vitellogenic oocytes is thicker than other related species, evidencing the development of a better protection to the embryos in function of the waters’ turbulence that characterize it spawning sites in the Amazonian streams. The male specimens’ present anastomosed tubular testes with unrestricted spermatogonia spread along the entire seminiferous tubules. The present data elucidate the dynamic of spermatogenesis and oogenesis of an ornamental Amazonian species, through the description of the male and female germ cells development.

O conhecimento da morfologia testicular e ovariana de uma determinada espécie de peixe é de suma importância, pois através destas análises é possível o desenvolvimento de estudos e técnicas visando o melhoramento de sua reprodução, manejo e comercialização e até mesmo auxiliar em sua conservação. Este estudo realizou a caracterização ovariana e testicular do peixe Amazônico ornamental Serrapinnus kriegi. Um total de três machos e três fêmeas tiveram suas gônadas analisadas através de microscopia óptica. As fêmeas apresentam ovários preenchidos por oócitos em desenvolvimento assincrônico, indicando desova parcelada da espécie. Além disso, observou-se a formação de micrópila e célula micropilar em oócitos em crescimento primário, representando o desenvolvimento precoce do oócito; a zona radiata nos oócitos vitelogênicos finais é mais espessa em comparação a outras espécies relacionadas, evidenciando o desenvolvimento de uma melhor proteção aos embriões, em função das águas turbulentas que caracterizam seu local de desova nos córregos amazônicos. Os machos apresentam testículos do tipo tubular anastomosado com espermatogônias irrestritas, espalhadas por todo o túbulo seminífero. Os dados apresentados elucidam a dinâmica da espermatogênese e oogênese de uma espécie de peixe ornamental amazônica, por meio da descrição das células germinativas masculinas e femininas.

Gastroesophageal tube of the Iguana iguana (Iguanidae): histological description, histochemical and immunohistochemical analysis of 5-HT and SS cells / Tubo gastroesofágico da Iguana iguana (Iguanidae): descrição histológica, histoquímica e análise imunohistoquímica de células 5-HT e SS

Abstract The work aims were to describe the histological and histochemical structure of the gastroesophageal tube of Iguana iguana and verify the occurrence and distribution of immunoreactive serotonin (5-HT) and somatostatin (SS) cells. Fragments of the gastrointestinal tract (GIT) of five iguanas were which underwent standard histological and immunohistochemistry technique. Immunoreactive cells for 5-HT and SS were quantified using the STEPanizer. The oesophagus has ciliated columnar pseudostratified epithelium with staining Alcian blue (AB) + and goblet cells highly reactive to periodic acid Schiff (PAS). In the cervical oesophagus, the numerical density of 5-HT cells per unit area (QA [5-HT cells]/µm2) was 4.6x10-2 ± 2.0 and celomatic oesophagus presented QA = 4.0x10-2 ± 1.0. The epithelium of the stomach is simple columnar, PAS and AB +. The cranial and middle regions of the stomach presented (QA [5-HT cells]/µm2) = 6.18x10-2 ± 3.2 and the caudal region, QA = 0.6x10-2 ± 0.2. The SS cells were only observed in the caudal stomach, with numerical density (QA [SS cells]/µm2) = 1.4x10-2 ± 0.9 In I. iguana, variation was observed in terms of the distribution of mucus secretions and the pattern of occurrence of serotonin and somatostatin-secreting enteroendocrine cells in the TGI, which possibly will result in an interspecific adaptive response.

Resumo Os objetivos do trabalho foram descrever a estrutura histológica e histoquímica do tubo gastroesofágico da Iguana iguana e verificar a ocorrência e distribuição de células serotonina (5-HT) e somatostatina (SS) imunorreativas. Fragmentos do trato gastrointestinal (TGI) de cinco iguanas foram submetidos à técnica histológica e imunohistoquímica padrão. As células imunorreativas para 5-HT e SS foram quantificadas usando o STEPanizer. O esôfago apresenta epitélio pseudoestratificado colunar ciliado Alcian blue (AB) positivo, com células caliciformes altamente reativas ao ácido periódico de Schiff (PAS). No esôfago cervical, a densidade numérica de células 5-HT por unidade de área (QA [células 5-HT] / µm2) foi de 4.6x10-2 ± 2.0 e o esôfago celomático apresentou QA = 4.0x10-2 ± 1.0. O epitélio do estômago é colunar simples, PAS e AB positivo. As regiões cranial e média do estômago apresentaram (QA [células 5-HT] / µm2) = 6.18x10-2 ± 3.2 e a região caudal, QA = 0.6x10-2 ± 0.2. As células SS foram observadas apenas no estômago caudal, com densidade numérica (QA [células SS] / µm2) = 1.4x10-2 ± 0.9. Em I. iguana, foi observada variações em termos da distribuição das secreções de muco e padrão de ocorrência das células enteroendócrinas secretoras de serotonina e somatostatina no TGI, o que possivelmente reflete uma resposta adaptativa interespecifica.

A new Poptella from the rio Xingu basin, Brazil (Characiformes: Characidae)

A new species of Poptella is described from the rio Xingu basin, Pará and Mato Grosso states, Brazil. The new species is distinguished from all congeners by having a greater number of scales around the caudal peduncle (15­18 vs. 13­14). Furthermore, this species can be easily distinguished from P. brevispina, P. longipinnis, and P. fuscata by the lower number of branched rays in the dorsal fin (9 vs. 10­11). The description of new taxon represents the third species of the genus Poptella described in the last five years.(AU)

Uma nova espécie de Poptella é descrita da bacia do rio Xingu, estados do Pará e Mato Grosso, Brasil. A nova espécie é distinguida de todas as espécies congêneres por apresentar maior número de escamas ao redor do pedúnculo caudal (15­18 vs. 13­14). Além disso, esta espécie pode ser facilmente distinguida de P. brevispina P. longipinnis e P. fuscata pelo menor número de raios ramificados na nadadeira dorsal (9 vs.10-11). A descrição do novo táxon representa a terceira espécie do gênero Poptella descrita nos últimos cinco anos.(AU)

Morada Nova lambs' meat production potential description through morphometric evaluation / Descrição do potencial de produção de carne de cordeiros Morada Nova por meio da avaliação morfométrica

Morada Nova breed has a low effective herd, and its white variety is in risk of extinction. The selection of individuals based on breed standard without correlation with productive aptitude is predominant today. We believe that the best way to rescue this valuable genetic resource is to describe its productive potential for commercial use. Thus, this study described the meat production potential of Morada Nova lambs through morphological and zoometric data, performance and carcass characteristics. Twenty-four non-castrated male lambs from two genetic groups were used: Morada Nova red (MNR) and crossbreed Morada Nova (red x Morada Nova white-MNF1) distributed in a completely randomized design. Univariate and multivariate analysis were used. The yields of commercial cuts and the physicochemical characteristics and qualitative measurements of the carcass were similar between the genetic groups. Seven of the 28 characteristics of the carcass were greater in MNF1 lambs. The chest height, rump height and anamorphosis index showed to be important variables in the choice of MN lambs with meat production potential. Based on factor and hierarchical cluster analysis, the Morada Nova beef morphometric index (MNBMI) was created. Both of groups have high thoracic development, ability to produce meat, weight gain, feeding efficiency and breathing capacity, infusing greater rusticity and adaptability; however, the application and validation of the developed index showed superiority for meat production in the crossed lambs. Thus, the MNF1 lambs are a sustainable option for sheep production in drylands.

A raça Morada Nova possui um baixo rebanho efetivo, e sua variedade branca está em risco de extinção. A seleção de indivíduos com base no padrão racial sem correlação com a aptidão produtiva é predominante até hoje. Acreditamos que a melhor forma de resgatar esse valioso recurso genético é descrever seu potencial produtivo para uso comercial. Assim, este estudo teve como objetivo descrever o potencial de produção de carne de cordeiros Morada Nova por meio de dados morfológicos e zoométricos, desempenho e características de carcaça. Foram utilizados 24 cordeiros machos não castrados de dois grupos genéticos: Morada Nova Vermelho (MNV) e mestiços Morada Nova (vermelho x Morada Nova branco-MNF1) distribuídos em delineamento inteiramente casualizado. Análises univariadas e multivariadas foram utilizadas. Os rendimentos dos cortes comerciais e as características físico-químicas e medidas qualitativas da carcaça foram semelhantes entre os grupos genéticos. Sete, das 28 características da carcaça, foram maiores nos cordeiros MNF1. A altura do peito, altura da garupa e índice de anamorfose mostraram-se variáveis ​​importantes na escolha de cordeiros MN com potencial de produção de carne. Com base na análise fatorial e hierárquica de agrupamento, foi elaborado o índice morfométrico da carne da raça Morada Nova (IMCMN). Ambos os grupos apresentam alto desenvolvimento torácico, capacidade de produção de carne, ganho de peso, eficiência alimentar e capacidade respiratória, infundindo maior rusticidade e adaptabilidade, porém, a aplicação e validação do índice desenvolvido mostrou superioridade para produção de carne nos cordeiros cruzados. Assim, os cordeiros MNF1 são uma opção sustentável para a produção ovina em terras áridas.

Anatomical characterization of black wattle wood for the pulp and paper production / Caracterização anatômica do lenho de acácia-negra para produção de celulose e papel

The growing worldwide demand in the pulp market has fostered research that evaluates alternative fiber sources with specific characteristics that attend the needs of the consumer market, with a view to add value to the final product and reduce production costs. Acacia mearnsii De Wild wood is a by-product of the extraction of tannin from the trunk bark, used for firewood, charcoal and pellets. However, its wood is still poorly studied, especially its anatomical characteristics, which can provide important information about its industrial potential. This study evaluated the anatomical characteristics of Acacia mearnsii wood for the production of pulp and paper. Ten trees at approximately seven years old were cut down, five from the seed production area (SPA) and five from the clonal population area (CPA). From each tree, one trunk disc was sectioned at the diameter at breast height (DBH), resulting in 10 (ten) wood samples. From each disc, a sapwood specimen was made oriented in the tangential longitudinal, radial longitudinal and transversal planes, for later obtaining the anatomical cuts and the macerates. The anatomical description of the wood followed the recommendations of the International Association of Wood Anatomists-IAWA. From the dimensions of the fibers, their quality evaluation ratios for the production of pulp and paper were calculated. Results obtained from the anatomical characterization allowed to conclude that the Acacia mearnsii woods from SPA and CPA are indicated as a source of raw material for the pulp and paper production.

A crescente demanda mundial do mercado de polpa celulósica tem fomentado pesquisas que avaliem fontes de fibras alternativas com características específicas que atendam às necessidades do mercado consumidor, visando agregar valor ao produto final e reduzir os custos de produção. No estado do Rio Grande do Sul, Brasil, o lenho de Acacia mearnsii De Wild é considerado um subproduto da extração de tanino da casca do tronco, utilizada como lenha, carvão e pellets. No entanto, ainda é pouco estudado, em especial suas características anatômicas, as quais podem fornecer informações importantes sobre suas potencialidades industriais. O presente estudo teve como objetivo avaliar as características anatômicas do lenho de Acacia mearnsii para a produção de celulose e papel. Foram coletadas dez árvores com aproximadamente sete anos de idade, sendo cinco provenientes da área de produção de sementes (APS) e cinco da área de povoamento clonal (APC). De cada árvore, foi seccionado um disco do tronco na altura do DAP, resultando em dez amostras de lenho. De cada disco, foi confeccionado um corpo de prova do alburno, orientado nos planos longitudinal tangencial, longitudinal radial e transversal, para posterior obtenção dos cortes anatômicos e dos macerados. A descrição anatômica do lenho seguiu as recomendações da Associação Internacional de Anatomistas da Madeira-IAWA. A partir das dimensões das fibras, foram calculados os seus índices de avaliação da qualidade para a produção de celulose e papel. Os resultados obtidos da caracterização anatômica permitiram concluir que os lenhos de Acacia mearnsii provenientes de APS e APC são indicados como matérias-primas para a produção de celulose e papel.

Gonadal characterization of the Amazonian fish Serrapinnus kriegi (Characidae: Cheirodontinae) / Caracterização gonadal do peixe Amazônico Serrapinnus kriegi (Characidae: Cheirodontinae)

The knowledge of the testicular and ovarian morphology of a particular fish species is of paramount importance. Such analyze enables the development of studies and techniques aiming the improvement of their reproduction, management, commercialization and even their conservation. This study performed the ovarian and testicular characterization of the ornamental Amazon fish Serrapinnus kriegi. A total of three males and three females had their gonads analyzed by optical microscopy. Females present ovaries filled with oocytes in asynchronous development, indicating partial spawning in the species. Moreover, the micropyle and micropilar cell formation was observed in primary growing oocytes, representing a precocious oocyte development; and the zona radiata in the final vitellogenic oocytes is thicker than other related species, evidencing the development of a better protection to the embryos in function of the waters turbulence that characterize it spawning sites in the Amazonian streams. The male specimens present anastomosed tubular testes with unrestricted spermatogonia spread along the entire seminiferous tubules. The present data elucidate the dynamic of spermatogenesis and oogenesis of an ornamental Amazonian species, through the description of the male and female germ cells development.(AU)

O conhecimento da morfologia testicular e ovariana de uma determinada espécie de peixe é de suma importância, pois através destas análises é possível o desenvolvimento de estudos e técnicas visando o melhoramento de sua reprodução, manejo e comercialização e até mesmo auxiliar em sua conservação. Este estudo realizou a caracterização ovariana e testicular do peixe Amazônico ornamental Serrapinnus kriegi. Um total de três machos e três fêmeas tiveram suas gônadas analisadas através de microscopia óptica. As fêmeas apresentam ovários preenchidos por oócitos em desenvolvimento assincrônico, indicando desova parcelada da espécie. Além disso, observou-se a formação de micrópila e célula micropilar em oócitos em crescimento primário, representando o desenvolvimento precoce do oócito; a zona radiata nos oócitos vitelogênicos finais é mais espessa em comparação a outras espécies relacionadas, evidenciando o desenvolvimento de uma melhor proteção aos embriões, em função das águas turbulentas que caracterizam seu local de desova nos córregos amazônicos. Os machos apresentam testículos do tipo tubular anastomosado com espermatogônias irrestritas, espalhadas por todo o túbulo seminífero. Os dados apresentados elucidam a dinâmica da espermatogênese e oogênese de uma espécie de peixe ornamental amazônica, por meio da descrição das células germinativas masculinas e femininas.(AU)

Description of Pudica wandiquei n sp (Heligmonellidae: Pudicinae), a nematode found infecting Proechimys simonsi (Rodentia: Echimyidae) in the Brazilian Amazon / Descrição de Pudica wandiquei n sp (Heligmonellidae: Pudicinae), nematódeo encontrado infectando Proechimys simonsi (Rodentia: Echimyidae) na Amazônia brasileira

A new species of nematode parasite of the subfamily Pudicinae (Heligmosomoidea: Heligmonellidae) is described from the small intestine of Proechimys simonsi (Rodentia: Echimyidae) from the locality of Nova Cintra in the municpality of Rodrigues Alves, Acre state, Brazil. The genus Pudica includes 15 species parasites of Neotropical rodents of the families Caviidae, Ctenomyidae, Dasyproctidae, Echimyidae, Erethizontidae, and Myocastoridae. Four species of this nematode were found parasitizing three different species rodents of the genus Proechimys in the Amazon biome. Pudica wandiquei n. sp. can be differentiated from all other Pudica species by the distance between the ends of rays 6 and 8 and the 1-3-1 pattern of the caudal bursa in both lobes.

Uma nova espécie de nematódeo da subfamília Pudicinae (Heligmosomoidea: Heligmonellidae) é descrito parasitando o intestino delgado de Proechimys simonsi (Rodentia: Echimyidae) em Nova Cintra, município de Rodrigues Alves, Estado do Acre, Brasil. O gênero Pudica inclui 15 espécies parasitas de roedores Neotropicais das famílias: Caviidae, Ctenomyidae, Dasyproctidae, Echimyidae, Erethizontidae e Myocastoridae. Destas, quatro espécies de nematódeos foram encontradas parasitando três diferentes espécies do roedor Proechimys no bioma Amazônia. Pudica wandiquei n. sp. é diferente das outras espécies de Pudica pela distância entre os raios 6 e 8 e pelo tipo da bolsa caudal, que é 1-3-1 em ambos os lados.

The influence of primer choice on archaeal phylogenetic analyses based on 16S rRNA gene PCR / A influência da escolha de iniciadores na filogenia de Archaea em ensaios de PCR para o gene rRNA 16S

Polymerase chain reaction (PCR) assays targeting 16S rRNA genes followed by DNA sequencing are still important tools to characterize microbial communities present in environmental samples. However, despite the crescent number of deposited archaeal DNA sequences in databases, until now we do not have a clear picture of the effectiveness and specificity of the universal primers widely used to describe archaeal communities from different natural habitats. Therefore, in this study, we compared the phylogenetic profile obtained when Cerrado lake sediment DNA samples were submitted to 16S rDNA PCR employing three Archaea-specific primer sets commonly used. Our findings reveal that specificity of primers differed depending on the source of the analyzed DNA. Furthermore, archaeal communities revealed by each primer pair varied greatly, indicating that 16S rRNA gene primer choice affects the community profile obtained, with differences in both taxon detection and operational taxonomic unit (OTU) estimates.

A amplificação de genes que codificam o rRNA 16S por reação em cadeia da polimerase (PCR) e o seu sub sequentesequenciamento consistem em uma ferramenta importante na caracterização de comunidades microbianas presentes em amostras ambientais. No entanto, apesar do crescente número de sequências de DNA de Archaea depositadas em bancos de dados, a especificidade e efetividade dos iniciadores de PCR descritos como universais e amplamente utilizados na descrição desse grupo ainda não está clara. Neste estudo foram comparados os perfis filogenéticos de comunidades de arqueias obtidos a partir amostras de DNA de sedimentos lacustres do Cerrado submetidas a ensaios de PCR empregando três pares de iniciadores específicos para Archaea, comumente utilizados neste tipo de estudo. Nossos resultados indicam que as comunidades de arqueias detectadas com cada par de iniciadores apresentaram grande variação filogenética, sugerindo que a escolha de iniciadores dirigidos ao gene de rRNA 16S tem efeito significativo no perfil da comunidade descrita, com diferenças tanto em relação aos táxons detectados, como nas estimativas de unidades taxonômicas operacionais (OTU).

First molecular description of autochthonous urban cases of canine visceral leishmaniasis in the city of Belém, Pará, Brazil / Primeira descrição molecular de casos autóctones urbanos de leishmaniose visceral canina na cidade de Belém, Pará, Brasil

Leishmaniasis is an anthropozoonosis transmitted by vectors, with dogs being the main domestic reservoirs. Brazil is one of the countries most affected by this disease, and it has been described in humans and dogs in every region in the country. In the northern region leishmaniasis cases in humans have been described in more than 100 municipalities in the State, including the capital, Belém. This study involves two cases of canine visceral leishmaniasis in which the animals developed clinical signs compatible with the disease in urban areas in Belém, the Pará state capital. The diagnosis was confirmed via polymerase chain reaction (PCR) to detect SSUr-rDNA and kDNA of Leishmania sp. and Leishmania infantum, respectively. In one of the cases the animal died and in the other the animal underwent treatment with medicines prescribed for dogs. Through this treatment, parasitemia in the second animal has been kept under control and is being monitored through molecular tests. Previously, no canine cases had been notified from urban neighborhoods in the city of Belém, but only on the island of Cotijuba, at a distance of 29 kilometers from the city. Cases of canine and human leishmaniasis have been recorded close to the capital, Belém, which has areas of conserved vegetation and where the presence of disease vectors has been described. Thus, as has been done in several other Brazilian cities, this study uses clinical and laboratory findings to confirm the presence of autochthonous cases of canine visceral leishmaniasis in the city of Belém.

A leishmaniose é uma antropozoonose transmitida por vetores, sendo os cães os principais reservatórios domésticos. O Brasil é um dos países mais acometidos por esta doença, sendo descrita em humanos e cães em todas as regiões do país. Na região norte casos de leishmaniose em humanos foram descritos em mais de 100 municípios do Estado, incluindo a capital, Belém. Este estudo envolve dois casos de leishmaniose visceral canina em que os animais desenvolveram sinais clínicos compatíveis com a doença em áreas urbanas de Belém, capital do estado do Pará. O diagnóstico foi confirmado pela reação em cadeia da polimerase (PCR) para detectar o SSUr-rDNA e kDNA de Leishmania sp e Leishmania infantum, respectivamente. Em um dos casos o animal veio a óbito e no outro o animal foi submetido a tratamento com medicamentos prescritos para cães. Por meio desse tratamento, a parasitemia no segundo animal foi mantida sob controle e está sendo monitorada por meio de testes moleculares. Anteriormente, nenhum caso canino havia sido notificado em bairros urbanos da cidade de Belém, apenas na ilha de Cotijuba, distante 29 quilômetros da cidade. Casos de leishmaniose canina e humana foram registrados próximo à capital, Belém, que possui áreas de vegetação conservada e onde foi descrita a presença de vetores de doenças. Assim, como tem sido registrado em várias outras cidades brasileiras, este estudo utiliza achados clínicos e laboratoriais para confirmar a presença de casos autóctones de leishmaniose visceral canina na cidade de Belém.