Genetic diversity of Shepherd dog using pedigree analysis / Diversidade genética em cães da raça Pastor Alemão utilizando análise de pedigree

ABSTRACT: The German Shepherd dog breed is the most popular breed globally and in Brazil. The study of the population structure through pedigree information is an essential tool to understand the history of the Brazilian German Shepherd dog breed. This study evaluated the status of genetic diversity and population structure of the Brazilian German Shepherd dog breed. The pedigree included a total of 77,938 animals born between 1970 and 2014. The average generation interval in this population was 3.91 years. Considering the reference population, 2,183 founders were identified. Approximately 3% of the genetic diversity of the current population (2010-2014) was lost, most of which was due to genetic drift. The effective population size was relatively small, and the pedigree showed bottlenecks indicating a loss of genetic diversity in this breed. These results indicated the need to adopt measures against the excessive increase in inbreeding and monitor effective population size to minimize genetic diversity loss.

RESUMO: A raça Pastor Alemão é uma das raças mais populares no mundo e no Brasil. O estudo da estrutura populacional por meio de informações de pedigree é uma ferramenta essencial para o entendimento da história dessa raça no Brasil. Objetivou-se com o estudo avaliar o status da diversidade genética e da estrutura populacional de cães da raça Pastor Alemão. O pedigree incluiu um total de 77.938 animais nascidos entre 1970 e 2014. O intervalo médio de geração nesta população foi de 3,91 anos. Considerando a população de referência, foram identificados 2.183 fundadores. Cerca de 3% da diversidade genética da população atual (2010-2014) foi perdida, a maior parte devido à deriva genética. O tamanho efetivo da população foi relativamente pequeno e o pedigree apresentou gargalos indicando uma perda de diversidade genética nesta raça. Esses resultados indicam a necessidade de adoção de medidas contra o aumento excessivo da endogamia e do monitoramento do tamanho efetivo da população para minimizar a perda de diversidade genética.

Genetic diversity of Shepherd dog using pedigree analysis / Diversidade genética em cães da raça Pastor Alemão utilizando análise de pedigree

The German Shepherd dog breed is the most popular breed globally and in Brazil. The study of the population structure through pedigree information is an essential tool to understand the history of the Brazilian German Shepherd dog breed. This study evaluated the status of genetic diversity and population structure of the Brazilian German Shepherd dog breed. The pedigree included a total of 77,938 animals born between 1970 and 2014. The average generation interval in this population was 3.91 years. Considering the reference population, 2,183 founders were identified. Approximately 3% of the genetic diversity of the current population (2010-2014) was lost, most of which was due to genetic drift. The effective population size was relatively small, and the pedigree showed bottlenecks indicating a loss of genetic diversity in this breed. These results indicated the need to adopt measures against the excessive increase in inbreeding and monitor effective population size to minimize genetic diversity loss.

A raça Pastor Alemão é uma das raças mais populares no mundo e no Brasil. O estudo da estrutura populacional por meio de informações de pedigree é uma ferramenta essencial para o entendimento da história dessa raça no Brasil. Objetivou-se com o estudo avaliar o status da diversidade genética e da estrutura populacional de cães da raça Pastor Alemão. O pedigree incluiu um total de 77.938 animais nascidos entre 1970 e 2014. O intervalo médio de geração nesta população foi de 3,91 anos. Considerando a população de referência, foram identificados 2.183 fundadores. Cerca de 3% da diversidade genética da população atual (2010-2014) foi perdida, a maior parte devido à deriva genética. O tamanho efetivo da população foi relativamente pequeno e o pedigree apresentou gargalos indicando uma perda de diversidade genética nesta raça. Esses resultados indicam a necessidade de adoção de medidas contra o aumento excessivo da endogamia e do monitoramento do tamanho efetivo da população para minimizar a perda de diversidade genética.

Management of roe deer population (Capreolus capreolus L. ) in Serbia / Gestão da população de cabrito-montês (Capreolus capreolus L. ) na Sérvia

The research was conducted during the 2018/19 hunting year at three hunting grounds: "Barajevska reka" - "Takovo" and "Jadar". The average density of Roe deer in hunting grounds varied from 48.67 to 74 individuals per 1,000 ha of hunting-productive area. However, when observing the number of individuals per 1,000 ha of total hunting area, the density varies from 16.07 individuals to 34.72 individuals. The determined gender ratio at the hunting ground "Jadar" was (M: F = 1: 0.93). At the hunting ground "Takovo", the gender ratio was (M: F = 1: 1.22), while at the hunting ground "Barajevska reka" the ratio was (M: F = 1: 1.59). The average fertility of Roe deer was 1.67 embryos per individual, or 1.75 embryos per pregnant female. Depending on the study area, the real growth varied from 0.54 to 0.73 fawns per female. Loss in Roe deer are caused mostly by biotic factors. The determined average age of shot individuals varied depending on the hunting ground from 3.53 to 5.24 years. The current state of Roe deer populations in Serbia varies between analyzed hunting grounds, but the overall situation is quite unsatisfactory, especially in terms of density, gender ratio and age structure of culled individuals.

A pesquisa foi realizada durante o ano de caça de 2018/19 nos três locais de caça: "Barajevska reka" - "Takovo" e "Jadar". A densidade média de cabrito-montês em áreas de caça variou de 48,67 a 74 indivíduos por 1.000 ha de área produtiva de caça. Entretanto, ao observar o número de indivíduos por 1.000 ha de área total de caça, a densidade varia de 16,07 indivíduos a 34,72 indivíduos. A razão de gênero determinada no terreno de caça "Jadar" foi (M: F = 1: 0,93). No terreno de caça "Takovo", a proporção de gêneros era (M: F = 1: 1,22), enquanto no terreno de caça "Barajevska reka" (M: F = 1: 1,59). A fertilidade média do cervo Roe era de 1,67 embriões por indivíduo, ou 1,75 embriões por fêmea grávida. Dependendo da área de estudo, o crescimento real variou de 0,54 a 0,73 fulvos por fêmea. As perdas em cabrito-montês são causadas principalmente por fatores bióticos. A idade média determinada dos indivíduos abatidos variou de 3,53 a 5,24 anos, dependendo do terreno de caça. O estado atual das populações de cabrito-montês na Sérvia varia entre os locais de caça analisados, mas a situação geral é bastante insatisfatória, especialmente em termos de densidade, proporção de gênero e estrutura etária dos indivíduos abatidos.

Genetic relationships of the Yucatan black hairless pig with Iberian breeds using single nucleotide polymorfisms / Relações genéticas de porcos pretos calvos de Yucatán com raças ibéricas usando Polimorfismo de nucleotídeos isolados

To conduct ex-situ creole pig conservation programs, it is essential to determine which breeding animals will be used, preferentially those with a more significant Iberian genetic component to preserve their origin. This study used a Yucatan black hairless pigs (YBHP) subpopulation to estimate its genetic diversity and population structure. One hundred four adult pigs were selected for the absence of hair, black skin (without spots), black hoof, and straight snout. The porcine-GGP-50K chip was used for SNP genotyping in YBHP, and information on Iberian and Yucatán hairless pigs from the United States (USYU) was taken from databases. All analysis was performed using PLINK v1.9 and v2.1 software. Inbreeding and fixation index values were lower in YBHP, with high observed heterozygosity and allogamy index values, which agree with those obtained in the populations of Canarias and Chato Murciano. According to the clusters generated by the "Genome-Wide Identity by State" analysis, four groups were identified, one of which included pigs from Guadyerbas, USYU, and YBHP. Between populations, YBHP was closely related to the hairless pigs from Guadyerbas, USYU, and Canarias. Principal component analysis showed the same result. According to the results obtained from the runs of homozygosity investigation, aimed to get pools consensus of regions of overlapping, 119 SNPs associated with genes and biological processes were identified. The BMP7 and NSUN2 genes were associated with epithelial cell differentiation, morphogenesis, and epithelial development. For nutrient metabolism: energy, the HADHA, PPARA, ADD1/SREBF1, and FAT 1genes were identified.(AU)

Para realizar programas de conservação ex-situ de suínos crioulos, é importante determinar quais animais serão criados, preferencialmente aqueles com maior componente de genética ibérica, para preservar sua origem. Uma subpopulação de porco preto calvo de Yucatán (YBHP) foi usada para estimar sua diversidade genética e estrutura populacional. Um total de 104 suínos adultos foram selecionados levando-se em consideração características como ausência de pelos, pele preta (sem manchas), casco preto e focinho reto. O painel GGP-50K foi utilizado para a genotipagem dos SNPs em animais YBHP, e informações de porcos sem pelos ibéricos e de Yucatán dos Estados Unidos (USYU) foram retiradas de bancos de dados. Todas as análises foram realizadas com o software PLINK v1.9 e v2.1. Os valores dos índices de endogamia e fixação foram menores em YBHP, com altos valores de índice de heterozigosidade e alogamia observados, que concordam com os obtidos nas populações de Canárias e Chato Murciano. De acordo com os clusters gerados pela análise "Genoma-Wide Identity By State", quatro grupos foram identificados, um dos quais incluiu porcos de Guadyerbas, USYU e YBHP. Entre as populações, YBHP estava intimamente relacionado com os porcos sem pelo de Guadyerbas, USYU e Canárias. A análise de componentes principais mostrou o mesmo resultado. De acordo com os resultados obtidos nas corridas de investigação de homozigose, visando obter consenso de pools de regiões de sobreposição, foram identificados 119 SNPs associados a genes e processos biológicos. Os genes BMP7 e NSUN2 foram associados à diferenciação de células epiteliais, morfogênese e desenvolvimento epitelial. Para metabolismo de nutrientes: energia, os genes HADHA, PPARA, ADD1/SREBF1 e FAT1 foram identificados.(AU)

Cobertura de polietileno e fontes de adubo podem reduzir bicho-mineiro e ácaro-vermelho em cafeeiro? / Can polyethylene cover and fertilizer sources reduce leaf miner and red mite in coffee?

A cafeicultura vem crescendo cada vez mais no Brasil e, diante disso, tecnologias são desenvolvidas constantemente para obtenção de maiores produtividades. Nesse contexto, vem sendo estudado o efeito do mulching de polietileno e fontes de adubo na cafeicultura. O objetivodesse trabalho foi avaliar a incidência de bicho-mineiro e ácaro-vermelho em cafeeiro em função do uso do mulchingde polietileno e adubos (liberação controlada e convencional). A pesquisa foi realizada na área experimental da Universidade Federalde Uberlândia ­CampusMonte Carmelo, Minas Gerais, com a cultivar de Coffea arabicaIPR 100, com delineamento em blocos casualizados e quatro repetições. Foram testados os seguintes tratamentos: T1 -mulchingdupla face branco/preto com adubo convencional; T2 ­mulchingdupla face branco/preto com adubo de liberação controlada; T3 ­mulchingdupla face prata/preto com adubo convencional; T4 ­mulchingdupla face prata/preto com adubo de liberação controlada; T5 ­Sem mulchingcom adubo convencional; T6 ­Sem mulchingcom adubo de liberação controlada. As avaliações ocorreram quinzenalmente de julho de 2020 a dezembro de 2020, mediante a constatação da presença ou ausência de ácaro-vermelho e de lagartas de bicho-mineiro. Os picos de densidade populacional para bicho-mineiro ocorreram no período de julho a outubro de 2020, e para ácaro-vermelho no mês de agosto, devido à baixa umidade relativa do ar e precipitação. Assim, conclui-se que a utilização do mulchingdupla face prata/preto proporcionou maior atratividade do bicho-mineiro-do-cafeeiro. Já as fontes de adubo não influenciaram na probabilidade de ocorrência deste inseto-praga. Além disso, os adubos convencionais, bem como os de liberação controlada, e a ausência/presença de coberturas do solo, não influenciaram na incidência deácaro-vermelho em cafeeiros da região do Cerrado Mineiro.(AU)

Coffee crop has been growing increasingly in Brazil and, in view of this, technologies are constantly being developedto obtain greater productivity. In this context, the effect of polyethylene mulchingas a source of fertilizer on coffee production has been studied. The objective of this work was to evaluate the incidence of leaf miner and red mite in coffee as a function of the use of polyethylene mulching and controlled and conventional release fertilizer. The research was carried out in the experimental area of the Federal University of Uberlândia -Campus Monte Carmelo, Minas Gerais, with the cultivar IPR 100, in arandomized block design with four blocks. The following treatments were tested: T1 -double-faced white/black mulchingwith conventional fertilizer; T2 ­white/black double-sided mulchingwith controlled release fertilizer; T3 ­double-sided silver/black mulchingwith conventional fertilizer; T4 ­silver/black double-sided mulchingwith controlled release fertilizer; T5 ­No mulchingwith conventional fertilizer; T6 ­No mulchingwith controlledreleasefertilizer. The evaluations took place fortnightly from July 2020 to December 2020, upon verification of the presence or absence of leaf miner and red mite caterpillars. Population density peaks for leaf miner occurred from July to October 2020, and for red mite in August, due to low relative humidity and precipitation. Thus, it is concluded that the use of double-sided silver/black mulching provided greater attractiveness to the coffee leaf miner. The fertilizer sources did not influence the probability of occurrence of this insect pest. In addition, conventional fertilizers, as well as those of controlled release, and the absence/presence of soil coverings, did not influence the incidence of red mite in coffee trees in the Cerrado Mineiro region.(AU)

Demography and spatial distribution of a threatened species from the Atlantic Forest in southern Brazil: differences between urban and rural remnants / Demografia e distribuição espacial de uma espécie ameaçada da Floresta Atlântica no sul do Brasil: diferenças entre remanescentes urbano e rural

Logging and agricultural exploitation have led to the degradation of Araucaria Forest remnants and the alteration of its last preserved patches. This forest typology contains many endangered plant species, as is the case of the tree Oreopanax fulvus Marchal. To support conservation of this species and understand how different landscape matrices can influence its populations, we evaluated the demographic structure and spatial distribution of O. fulvus in two Araucaria Forest remnants in Paraná state. We delimited two plots (urban and rural population), each with 1 ha, subdivided them into 100 subplots (10 x 10 m), and recorded diameter at ground level (DGL), height, and coordinates of two post-germinative developmental stage of individuals. In each subplot, we measured slope, luminosity, and canopy height. We used Ripley's K function analysis to describe distribution patterns of the species and the spatial relationship between mature and juvenile trees. We performed correlations between abundance and environmental and structural variables of the O. fulvus populations. Abundance varied between remnants, from 183 individuals/ha (12 mature and 171 juvenile) to 1306 individuals/ha (10 and 1296). The remnants varied in abundance and plant frequency. The species showed an investment in seedling banks. Most juvenile had DGL up to 3.0 cm and height up to 1.0 m and presented aggregated spatial distribution, while adults had random distribution. In the rural population juvenile abundance were correlated with canopy height (positively) and distance to mature trees (negatively). The slope was correlated for both sites, but oppositely, indicating that other factors might have interfered in the regeneration abundance. The urban remnant showed a high abundance of this endangered species, calling attention for potential studies in urban arborization, management and conservation of these remnants.

A exploração madeireira e agrícola levou à degradação dos fragmentos de Floresta com Araucária e à alteração de seus últimos fragmentos preservados. Esta tipologia florestal contém muitas espécies de plantas ameaçadas, como é o caso de Oreopanax fulvus Marchal. Para apoiar a conservação desta espécie e entender como diferentes matrizes da paisagem podem influenciar suas populações, avaliamos a estrutura demográfica e a distribuição espacial de O. fulvus em dois remanescentes de Floresta com Araucária no estado do Paraná. Delimitamos duas parcelas (população urbana e rural), cada uma com 1 ha, subdivididas em 100 subparcelas (10 x 10 m), registrando-se o diâmetro ao nível do solo (DGL), a altura e as coordenadas de dois estágios de desenvolvimento pós-germinativo de indivíduos. Em cada subparcela, medimos declividade, luminosidade e altura do dossel. Utilizamos função K de Ripley para descrever os padrões espaciais da espécie e a relação espacial entre árvores maduras e juvenis. Realizamos análise de correlação entre a abundância e as variáveis ambientais e estruturais das populações de O. fulvus. A abundância variou entre os remanescentes, de 183 indivíduos/ha (12 maduros e 171 juvenis) a 1306 indivíduos/ha (10 e 1296). Os remanescentes apresentaram variações na abundância e frequência de indivíduos. A espécie demonstrou investimento na formação de banco de plântulas. A maioria dos juvenis tinha DGL até 3,0 cm e altura até 1,0 m e apresentaram distribuição espacial agregada, enquanto os adultos tiveram distribuição aleatória. Na população rural a abundância de juvenis foi correlacionada com altura do dossel (positivamente) e com a distância de árvores maduras (negativamente). A declividade foi correlacionada em ambos os locais, mas de forma oposta, indicando que outros fatores podem ter interferido na abundância da regeneração. O remanescente urbano mostrou elevada abundância desta espécie ameaçada, demonstrando um potencial para estudos de arborização urbana, manejo e conservação destes remanescentes.

Markets and commercialization channels in the central region of Rio Grande do Sul: relevant factors for fruit and vegetable producers / Mercados e canais de comercialização na região central do Rio Grande do Sul: fatores relevantes para os produtores de frutas e hortaliças

This article presents statistical analysis that verified the diversity of markets and marketing channels used by family farmers in the central region of Rio Grande do Sul/ Brazil, examining the occurrence of variables associated with the number of channels accessed. The non-probabilistic sample included 129 family farmers who produce fruits and vegetables in four municipalities in the Central Region of Rio Grande do Sul, Brazil, in the years 2019-2021. Nonparametric tests and bivariate statistical analysis were used, considering the significance level (≤) of 0.05. There was an average number of 2.4 channels in the Local and Conventional Markets, and 3.1 for the Local/Territorial and Public/Institutional Markets. However, a maximum of three channels is used in 75% of establishments. There was a low negative correlation between the mean age of the family farmers and the degree of diversification of the channels used to market the products and a positive correlation between infrastructure and diversificationof channels adopted and,family work and diversification. Finally, a dependency relationship was reported between the number of public policies accessed and the diversification of channels.

Este artigo apresenta análise estatística que visa verificar a diversidade de mercados e canais de comercialização utilizados pelos agricultores familiares na Região Central do Rio Grande do Sul, Brasil, examinando a ocorrência de variáveis associadas ao número de canais acessados. A amostra não probabilística incluiu 129 agricultores familiares que produzem frutas e hortaliças em quatro municípios da Região Central do Rio Grande do Sul nos anos 2019-2021. Foram utilizados testes não paramétricos e análise estatística bivariada, considerando o nível de significância (≤) de 0,05. Houve um número médio de 2,4 canais nos Mercados Local e Convencional, e 3,1 para os Mercados Local/Territorial e Público/Institucional. No entanto, um máximo de três canais é utilizado em 75% dos estabelecimentos. Houve baixa correlação negativa entre a idade média dos agricultores e o grau de diversificação dos canais utilizados para comercialização dos produtos e uma correlação positiva entre infraestrutura, e a diversificação dos canais adotados e mão-de-obra familiar e diversificação. Por fim, descobriu-se uma relação de dependência entre o número de políticas públicas acessadas e a diversificação de canais.

Genetic diversity of Mycoplasma hyopneumoniae in finishing pigs in Minas Gerais / Diversidade de cepas de Mycoplasma hyopneumoniae em suínos em terminação brasileiros

Mycoplasma hyopneumoniae is one of the most challenging respiratory pathogens involved with swine pneumonia worldwide, responsible for a chronic infection with high morbidity, which predisposes secondary bacterial infections in growing and finishing pigs. Advances in diagnostic techniques allowed identification of genetic characteristics associated with high antigenic and proteomic variability among bacterial strains. This study aimed to evaluate the genetic diversity of M. hyopneumoniae strains in lungs with pneumonic lesions obtained from 52 pig farms located in Minas Gerais, one of the largest swine production states in Brazil. Genotyping was performed using multilocus variable number of tandem repeat (VNTR) analysis (MLVA), targeting two loci encoding P97 and P146 adhesins VNTR. The results showed that this agent is widely disseminated in pig farms and there is a high polymorphism of M. hyopneumoniae variants circulating in the state of Minas Gerais. Different M. hyopneumoniae genotypes are randomly distributed in several regions of the state, with no specific geographic population structure pattern. M. hyopneumoniae association with viral agents was sporadic (3.17% with Influenza A and 1.9% with PCV2).

Mycoplasma hyopneumoniae é um dos patógenos respiratórios mais desafiadores envolvidos com pneumonia suína em todo o mundo. É responsável por uma infecção crônica de alta morbidade, que predispõe a infecções bacterianas secundárias nas fases de crescimento e terminação. Avanços nas técnicas diagnósticas permitiram a identificação de características genéticas do agente, associadas à alta variabilidade antigênica e proteômica entre cepas. Este estudo teve como objetivo examinar a ocorrência e diversidade genética de cepas de M. hyopneumoniae em pulmões com lesões pneumônicas em 52 granjas de suínos no estado de Minas Gerais, um dos maiores estados produtores de suínos do Brasil. A genotipagem foi realizada utilizando a técnica de "multilocus variable number of tandem repeat analysis" (VTNR/MLVA), usando dois loci que codificam VNTR das adesinas P97 e P146. Os resultados mostraram que esse agente está amplamente disseminado em granjas de suínos e que existe alto polimorfismo das variantes de M. hyopneumoniae circulando no estado de Minas Gerais. Diferentes genótipos de M. hyopneumoniae estão distribuídos aleatoriamente em várias regiões do estado, sem um padrão de estrutura populacional e geográfica específico. Associação de M. hyopneumoniae e agentes virais foi esporádica (3,17% com Influenza A e 1,9% com PCV2).

Structure and genetic variability of the mexican Sardo Negro breed / Análise da estrutura e variabilidade genética da raça Sardo Negro do México

This study analyzed the Sardo Negro breed pedigree (41,521 animals registered from 1958 to 2019) to determine its structure, evolution, and genetic variability (GV). The population genetic parameters evaluated were effective number of founders (fe) and ancestors (fa), pedigree integrity, additive genetic relationship (AGR); number of complete generations (NCG), maximum generations traced (NMGT), and equivalent complete generations (NECG); effective population size (Ne), inbreeding coefficient (F), and generation interval (GI). The average GI was 7.45 years. A total of 7,804 founders and 4,856 ancestors were identified for a fe of 185 and a fa of 97. The average and maximum values of NCG, NECG, and NMGT were 1.6 and 5.0, 2.5 and 6.5, 4.3 and 12, with Ne estimates of 15.9, 25.9, and 69.0, respectively. The increase in F, linked to Ne, ranged from 0.72% to 3.1% per generation. The average values for F and AGR were 3.6% and 1.0%, respectively. The proportion of inbred individuals was 32.0%, with F values ranging from 0.01 to 62.2% and an average of 11.3%. The rate of inbred population was 1.3% per year. The annual rate of AGR was 0.04%. For the continuity and projection of the breed, the evolution of F as a function of Ne and the possible implications of the selection schemes must be considered. The genetic variability sustained over time results from the Ne.

Os objetivos deste estudo foram analisar o pedigree (41.521 registros de 1958 a 2019) da raça Sardo Negro para avaliar a estrutura, evolução e variabilidade genética (VG) da população. Os parâmetros genéticos populacionais utilizados foram: número efetivo de fundadores (fe) e ancestrais (fa); integridade do pedigree; relação genética aditiva (RGA); número de gerações completas (NGC), máximo plotado (NGT) e equivalentes (NGE); tamanho efetivo (Ne); consanguinidade (F); intervalo geracional (IG). O IG médio foi de 7,45 anos. Foram identificados 7.804 fundadores e 4.856 ancestrais, para fe 185 e 97 na fa. As médias e máximas para NGC, NGE e NGT foram 1,6 e 5,0, 2,5 e 6,5, 4,3 e 12, com estimativas de Ne 15,9, 25,9 e 69,0, respectivamente. O aumento de F, vinculado ao Ne, ficou na faixa de 0,72% a 3,1% por geração. A média para F 3,6% e 1,0% em RGA; a proporção de consanguíneos foi de 32,0%, com F na faixa de 0,01 a 62,2% e média de 11,3%. A taxa da população consanguínea foi de 1,3% ao ano. No RGA, a taxa ao ano era de 0,04%. Para a continuidade e projeção da raça, deve-se considerar a evolução de F em função de Ne e as possíveis implicações dos esquemas de seleção. A variabilidade genética sustentada ao longo do tempo resulta do Ne.

Population dynamics and seasonality of Euspilotus (Hesperosaprinus) azureus Sahlberg (Coleoptera: Histeridae: Saprininae) / Dinâmica populacional e sazonalidade de Euspilotus (Hesperosaprinus) azureus Sahlberg (Coleoptera: Histeridae: Saprininae)

The effect of climatic conditions on the structure of populations has been perceived for different orders of insects and families of beetles. Here we described the population dynamics of Euspilotus azureus (Sahlberg, 1823) and determined its relationship with climatic variables. The specimens were collected monthly for one year in an area of Seasonal Semideciduous Forest, in Viçosa, Brazil. The seasonality of the population and of sexes was estimated through the absolute frequency of occurrence (AF) and the percentage frequency of occurrence (FO%) of the population and each sex, which were determined monthly. To test whether the changes in monthly AF of the population and of each sex are correlated with climatic variables, Spearman correlation tests were performed. To identify whether there are temporal fluctuations in the sex ratio, considering months and seasons, and within each season, we performed Chi-square tests. A total of 3,126 individuals (1,009 females and 2,117 males) were collected. The population had the highest abundance in spring and summer, and the lowest in autumn and winter. The highest AF and FO were found in December and January, and the lowest in June and July. The sex ratio of the population did not differ in the months of the year, but in the spring there was a marked predominance of males. For E. azureus, the temporal fluctuation in abundance of the population and in the sex ratio is related to the climatic variables of maximum temperature, humidity, and precipitation. Climatic variables, especially the temperature, provided a greater abundance of the population in the hottest and rainiest periods of the year for inducing reproductive activity and altering the population's sex ratio.

O efeito das condições climáticas na estrutura das populações tem sido percebido para diferentes ordens de insetos e famílias de besouros. Nós descrevemos a dinâmica populacional temporal de Euspilotus azureus (Sahlberg, 1823) e determinamos sua relação com as variáveis climáticas. Os espécimes foram coletados durante um ano em uma área de Floresta Semidecidual Sazonal, em Viçosa, Brasil. A sazonalidade da população e dos sexos foi estimada através da frequência de ocorrência absoluta (FA) e da frequência de ocorrência percentual (FO%) da população, as quais foram determinadas mensalmente. Para testar se as mudanças mensais na FA da população e de cada sexo estão correlacionadas com as variáveis climáticas, testes de correlação de Spearman foram realizados. Para identificar se há oscilações temporais na razão sexual considerando meses e estações, e dentro de cada estação, foram realizados testes de Qui-quadrado. Um total de 3.126 indivíduos (1.009 fêmeas e 2.117 machos) foram coletados. A população teve maior abundância na primavera e verão, e menor no outono e inverno. As maiores FA e FO foram em dezembro e janeiro, e a menores em junho e julho. A razão sexual da população não diferiu nos meses do ano, mas na primavera houve uma predominância marcante de machos. Para E. azureus, a flutuação temporal na abundância da população e na razão sexual é explicada pelas variáveis climáticas de temperatura máxima, umidade e precipitação. As variáveis climáticas, especialmente a temperatura, propiciaram uma maior abundância da população nos períodos os mais quentes e chuvosos do ano por induzirem a atividade reprodutiva e a alterar da razão sexual da população.

Reproductive pattern and population dynamics of Anchovia surinamensis in a seasonal floodplain lake of the Amazon basin / Padrão reprodutivo e dinâmica populacional daAnchovia surinamensis em um lago de várzea sazonal da bacia Amazônica

The Surinam anchovy (Anchovia surinamensis) is a small fish of commercial and ecological interest in the Amazon basin. To understand the reproductive and population dynamics of this species, in 2019 and 2020, experimental fisheries were carried out during periods of flood and low water in the Cujubim Lake in Porto Velho (Rondônia, Brazil). This study aimed to analyze the seasonal pattern (flood and low water) for the reproductive period and the population dynamics of the Surinam anchovy in this region, which resulted in the collection of 870 individuals. The specimens showed mean lengths (Ls) of 6.85 ± 0.51 cm to 9.01 ± 2.56 cm and mean weight (Wt) of 5.8 ± 3.37 g to 6.6 ±2.72 g between low and flood water periods, respectively. The growth parameters for this species (Wt = 0.0226*Ls2,6635; Natural mortality, M = 1.66 year-1; Growth rate, k = 0.70 year-1; Asymptotic length, L∞ = 16.53 cm; Theoretical maximum weight, W∞ = 42.83 g) and the quantity of individuals in mature stages during periods of flood and low water were also evaluated. The mean values of Gonado-somatic index - GSI (5.41 and 4.96 between females and males) and animal welfare index, Kn (1.009 and 1.010 between low and flood water periods) did not show significant differences. All the population growth information presented, added to the values of physicochemical parameters of the water (which were suitable for tropical fish) indicates that the Surinam anchovy population is governed by hydrological seasonality and is well adapted to the floodplain lake where it colonizes and reproduces.

A sardinha-do-gato (Anchovia surinamensis) é um peixe de pequeno porte de interesse comercial e ecológico da bacia Amazônica. Para entender a dinâmica reprodutiva e populacional dessa espécie, foram rea-lizadas pescarias experimentais nos períodos de seca e cheia nos anos de 2019 e 2020, no lago Cujubim in Porto Velho (Rondônia, Brasil). Este estudo teve como objetivo analisar o padrão sazonal (seca e cheia) para o período reprodutivo e a dinâmica populacional da A. surinamensis nessa região, que resultou na coleta de 870 indivíduos. Os exemplares exibiram medias de comprimentos (Cp) de 6,85 ± 0,51 cm a 9,01 ± 2,56 cm e peso (Pt) de 5,8 ± 3,37 g a 6,6 ± 2,72 g entre os períodos de seca e cheia, respectivamen-te. Os parâmetros de crescimento do estoque para esta espécie (Pt = 0,0226*Cp2,6635; Mortalidade natural, M = 1,66 ano-1; Taxa de crescimento, k = 0,70 ano-1; Comprimento assintótico, L∞= 16,53 cm; Peso máximo teórico, W∞ = 42,83 g) e o quantitativo de indivíduos em estádios maduros durante os períodos de seca e cheia também foram avaliados. As médias dos valores do Índice gonadossomático - IGS (5,41 e 4,96 entre fêmeas e machos) e do Índice de bem-estar animal, Kn (1,009 e 1,010 entre a cheia e a seca), não apresentaram diferenças significativas. Portanto, todas as informações de crescimento populacional apresentadas, somadas aos valores dos parâmetros físico-químicos da água (que permaneceram adequados para peixes tropicais) indicam que a população da sardinha-do-gato é regida pela sazonalidade hidrológica e está bem adaptada ao lago de várzea onde colonizam e se reproduzem.

Ecological aspects of Rhinoclemmys punctularia punctularia (Testudines: Geoemydidae) in two localities in northern Brazil / Aspectos ecológicos de Rhinoclemmys punctularia punctularia (Testudines: Geoemydidae) em duas localidades no norte do Brasil

Rhinoclemmys punctularia punctularia is the only turtle of the family Geoemydidae with part of its range in Brazil. The species is semi-aquatic and widely distributed across the Amazon basin but is still poorly studied. We evaluated aspects of the population structure, habitat use, seasonal activity, and diet of the species during one year, from the beginning of the rainy season to the end of the dry season, in two headwater localities in the Tocantins and Tapajós river basins, in the state of Pará, Brazil. We captured 45 individuals, 14 in the Tocantins basin and 31 in the Tapajós basin. The size-class frequency distributions of captured individuals did not differ between the two samples. The turtles were most frequently captured in first-order streams, followed by lentic (third-order dammed streams) and second-order streams. The capture rate did not vary significantly between sampling periods (start and peak of the rainy season; start and end of the dry season). The trapping effort to capture a single individual was much higher in the Tapajós basin (1,215 trap-hours) than in the Tocantins basin (136 trap-hours). Overall, the low capture rates confirm the secretive nature of the species in Amazonia and its apparent rarity. The individuals analyzed in this study consumed mainly plants.(AU)

Rhinoclemmys punctularia punctularia é o único quelônio da família Geoemydidae com parte de sua distribuição no Brasil. A espécie é semi-aquática e amplamente distribuída na bacia amazônica, mas ainda é pouco estudada. Avaliamos aspectos da estrutura populacional, uso do habitat, atividade sazonal e dieta da espécie ao longo de um ano, desde o início da estação chuvosa até o final da estação seca, em duas localidades de cabeceira nas bacias dos rios Tocantins e Tapajós, no estado do Pará, Brasil. Capturamos 45 indivíduos: 14 na bacia do Tocantins e 31 na bacia do Tapajós. A distribuição de frequências por classe de tamanho dos indivíduos capturados não diferiu entre as duas amostras. Os quelônios foram mais frequentemente capturados em riachos de primeira ordem, seguidos por riachos lênticos (riachos de terceira ordem represados) e de segunda ordem. A taxa de captura não variou significativamente entre os períodos de amostragem (início e pico da estação chuvosa; início e fim da estação seca). O esforço de armadilhagem para capturar um único indivíduo foi muito maior na bacia do Tapajós (1.215 horas-armadilha) do que na bacia do Tocantins (136 horas-armadilha). No geral, as baixas taxas de captura confirmam a natureza discreta da espécie na Amazônia e sua aparente raridade. Os indivíduos analisados neste estudo consumiram principalmente plantas.(AU)

Estrutura populacional de Talitroides topitotum (Crustacea: Amphipoda: Talitridae) em Santa Maria, região central do Rio Grande do Sul, Brasil / Population structure of Talitroides topitotum (Crustacea: Amphipoda: Talitridae) from Santa Maria, central region of Rio Grande do Sul State, Brazil

Tallitroides topitotum (Burt, 1934) (Talitridae) is one of the representatives of Amphipoda that has adapted to terrestrial environment. This research aimed to describe the population structure of this talitrid in the morphometric and reproductive aspects. The study was carried out in the central region of Rio Grande do Sul, Brazil, from June 2020 to May 2021. The talitrids were monthly collected with pitfalls exposed for 48 hours and they were sexed, photographed, and measured (body length, cephalic length, and marsupium length ­ in millimeters). Ovigerous females had their eggs counted and measured. In addition, we correlated the size data and the sampling latitudes of T. topitotum from previous and present studies. A total of 492 individuals were collected, from which 62 were ovigerous females, 188 non-ovigerous females, and 242 juveniles. No male was sampled. There was a significant correlation between body and head lengths and body and marsupium lengths in ovigerous females. We found no correlation between morphometric data and female fertility. Although not significant, there was a positive correlation between the size of talitrids and the latitude of occurrence. Body size can be inferred from head size, and marsupium size from body size, as both are strongly correlated. The absence of relationship between body size and fecundity may be related to environmental factors that can affect the talitrid reproduction. A clear relationship between the mean body size of T. topitotum and the latitude of their occurrence can be obtained with more studies conducted with a large sampling.

Talitroides topitotum (Burt, 1934) (Talitridae) é um dos representantes de Amphipoda que se adaptaram ao ambiente terrestre. O objetivo desta pesquisa foi avaliar a estrutura populacional deste talitrídeo e correlacionar entre si dados morfométricos e aspectos reprodutivos da população. O estudo foi realizado na região central do Rio Grande do Sul, Brasil, entre junho de 2020 e maio de 2021. Para tal, foram coletados mensalmente espécimes com o auxílio de armadilhas de queda (pitfalls), que ficaram expostos durante 48 horas no campo. Os animais foram sexados, fotografados e medidos (comprimento corporal, comprimento cefálico e comprimento do marsúpio ­ em milímetros). As fêmeas ovígeras tiveram todos os seus ovos contados e medidos. Além disso, foram comparados os tamanhos máximos e latitudes de estudos populacionais realizados com a espécie. No total foram coletados 492 indivíduos, dos quais 62 eram fêmeas ovígeras, 188 não-ovígeras e 242 juvenis. Nenhum macho foi amostrado. Houve correlação significativa entre o comprimento corporal e cefálico e o comprimento corporal e de marsúpio nas fêmeas ovígeras. Não houve correlação entre os dados morfométricos e a fecundidade das fêmeas. Na análise de correlação entre tamanho dos talitrídeos e latitude houve correlação positiva, embora não significativa. O tamanho corporal pode ser inferido a partir do tamanho cefálico, bem como o do marsúpio a partir do corporal, pois ambos estão fortemente correlacionados. O fato de não haver relação entre tamanho e fecundidade pode estar relacionado a fatores ambientais, já que os mesmos podem afetar a reprodução do grupo. No que diz respeito à relação entre tamanho e latitude, mais estudos devem ser conduzidos com uma amostra maior, a fim de que seja verificada se a relação é significativa ou não.

Temporal genetic structure of a stock of Prochilodus lineatus (Characiformes: Prochilodontidae) in the Mogi-Guaçu River ecosystem, São Paulo, Brazil

Prochilodus lineatus is a species of migratory fish widely distributed in the Paraná River basin, found mainly in the Grande, Pardo and Mogi-Guaçu rivers located in a well-developed region of the state of São Paulo. This study analyzes the genetic diversity and population structure in shoals of P. lineatus based on temporal analysis of specimens sampled over the years 2003, 2005, 2006, 2009, 2010, and 2015 in the Mogi-Guaçu River, São Paulo, at the region of Cachoeira de Emas. Genetic analysis performed using the D-Loop and seven microsatellite marker revealed significant genetic variability in all sampled groups. Moderate levels of structuring between groups were identified with the microsatellite markers (Fst = 0.14), while the mitochondrial marker did not reveal patterns of genetic structuring (Fst = 0.01). The genetic variability fluctuated over time, characterizing patterns of structuring among the analyzed samples. The occurrence of environmental alterations resulting in increased mortality rates, as well as changes in the water level in the ecosystem, among other factors, could determine changes in the reproductive behavior of species. The lack of favorable environmental conditions for reproduction in the basin, as reflected by tests of population bottlenecks, could have resulted in the differentiation of populations of P. lineatus over time.(AU)

Prochilodus lineatus é uma espécie de peixe migratório amplamente distribuído na bacia do rio Paraná, principalmente nos rios Grande, Pardo e Mogi-Guaçu localizados em uma região bem desenvolvida do estado de São Paulo. Este estudo analisou a diversidade genética e a estrutura populacional em cardumes de P. lineatus com base na análise temporal de espécimes amostrados ao longo dos anos de 2003, 2005, 2006, 2009, 2010 e 2015 na Cachoeira de Emas no rio Mogi-Guaçu, São Paulo, Brasil. A análise genética realizada com o marcador D-Loop e sete microssatélites revelou variabilidade genética significativa em todos os grupos amostrados. Níveis moderados de estruturação entre os grupos foram identificados com os marcadores microssatélites (Fst = 0.14), enquanto o marcador mitocondrial não revelou padrões de estruturação genética (Fst = 0.01). A variabilidade genética identificada no estoque oscilou ao longo do tempo, caracterizando padrões de estruturação entre as amostras analisadas. A ocorrência de alterações ambientais resultando em aumento das taxas de mortalidade, bem como mudanças no nível de água no ecossistema, entre outros fatores, podem determinar mudanças no comportamento reprodutivo das espécies. A falta de condições ambientais favoráveis para a reprodução na bacia, pode ter resultado na diferenciação das populações de P. lineatus ao longo do tempo.(AU)

Assessment of population knowledge about breeding and management of dogs and cats / Avaliação do conhecimento populacional sobre criação e manejo de cães e gatos

The relationship between man and animal has narrowed over the years, causing them to be considered as family members. However, not all owners are aware of the correct ways of raising animals. The objective of this research was to evaluate the level of population knowledge on the ways of handling and breeding dogs and cats. The present work consists of the application of an online questionnaire to the population of Patrocínio-MG. The questionnaire included objective questions about the owner's personal data, animal data, types of care, management and prevention of diseases. The percentage values obtained in each question were compared using the chi-square test at 5% signiÞ cance. A total of 345 dog and cat owners, residents of the city of Patrocínio -MG, participated in the research. Most of the interviewees are up to 25 years old, have secondary education and have a salary range of one minimum wage. This population has greater preference for breeding dogs, with deÞ ned breeds, adults, preferably fed wit dry feed. The owners provide multiple antiviral and rabies vaccination in animals from puppies with a booster dose annually, and deworming being carried out periodically. It is concluded that the population knows about the types of care and management of dogs and cats, providing them with the basic care needed.(AU)

A relação entre homem e animal tem se estreitado no decorrer dos anos, fazendo com que os mesmos sejam considerados como membros das famílias. Porém, nem todos os owneres tem conhecimento sobre as formas corretas de criação dos animais. Objetivou-se com essa pesquisa avaliar o nível de conhecimento populacional sobre as formas de manejo e criação de cães e gatos. O presente trabalho consiste na aplicação de um questionário online para a população de Patrocínio-MG. O questionário contemplou questões objetivas sobre dados pessoais do owner, dados do animal, formas de cuidado, manejo e prevenção de doenças. Os valores percentuais obtidos em cada questão foram comparados pelo teste de qui-quadrado a 5% de signiÞ cância. Participaram da pesquisa 345 owneres de cães e gatos, residentes da cidade de Patrocínio-MG. A maior parte dos entrevistados possuem até 25 anos, ensino médio e faixa salarial de um salário mínimo. Tal população apresenta maior preferência pela criação de cães, com raça deÞ nida, adultos, sendo a ração seca o alimento preferivelmente fornecido aos animais. Os owneres realizam vacinação antiviral múltipla e antirrábica nos animais desde Þ lhotes com dose reforço anualmente, sendo a vermifugação realizada periodicamente. Conclui-se com o presente trabalho que a população conhecimento sobre as formas de cuidado e manejo de cães e gatos, realizando os cuidados básicos necessários para os mesmos.(AU)

Recent dispersal and diversification within the clingfish genus Acyrtus (Actinopterygii: Gobiesocidae), with the description of a new western Atlantic species

The genus Acyrtus (Gobiesocidae) is represented by four valid species distributed in the western Atlantic, and a recently described fifth species from the eastern Pacific. Here, we describe a new species endemic to Trindade Island, Brazil, and provide the first phylogenetic inference for the genus including all representatives. The new species can be distinguished from all its congeners by meristic and morphometric characters, as well as genetic differences. It presents low genetic diversity and, contrarily to other Trindade Island endemic fishes, shows no evidence of recent population growth. Our phylogeny reveals cryptic species and the paraphyletic nature of Acyrtus, which included Arcos nudus (western Atlantic) in a clade that separated from Arcos erythrops (tropical eastern Pacific) around 20 Mya. The three species found in the Brazilian Province, including one that remains undescribed, form a monophyletic clade which colonized the western South Atlantic around 2.6 Mya. Our study suggests that Arcos nudus should be placed in Acyrtus, and that the relationships among the closely-related Gobiesocidae genera Acyrtus (mostly from the Atlantic Ocean) and Arcos (from the Pacific Ocean) need further investigation.(AU)

O gênero Acyrtus (Gobiesocidae) é representado por quatro espécies válidas encontradas no Atlântico ocidental e uma recentemente descrita do Pacífico oriental. Aqui descrevemos uma nova espécie endêmica da Ilha da Trindade, Brasil, e apresentamos a primeira inferência filogenética para o gênero incluindo todos os representantes. A nova espécie pode ser distinguida de suas congêneres por caracteres merísticos e morfométricos, bem como por diferenças genéticas. A espécie apresenta baixa diversidade genética, entretanto, diferentemente de outras espécies endêmicas da Ilha da Trindade, não mostra evidência de expansão populacional recente. A filogenia obtida revelou a existência de espécies crípticas e a natureza parafilética de Acyrtus, o qual inclui Arcos nudus (do Atlântico ocidental), e que é separado de Arcos erythrops (do Pacifico tropical oriental) por cerca de 20 milhões de anos. As três espécies encontradas no Brasil, incluindo uma ainda não descrita, formam um clado monofilético que colonizou o Atlântico Sul ocidental há cerca de 2,6 milhões de anos. Nosso estudo sugere que Arcos nudus deva ser alocado no gênero Acyrtus, e que as relações entre os gêneros Acyrtus (em maioria do Oceano Atlântico) e Arcos (do Oceano Pacífico) precisam ser estudadas em mais detalhes.(AU)

Genetic variability of Guzerat cattle raised in northern Brazil, based on pedigree analysis / [Variabilidade genética do gado Guzerat criado no norte do Brasil, com base na análise do pedigree]

Genealogical data comprised 45,711 animals born between 1901 and 2016, with 48,127 animals in the pedigree file. Population structure was analyzed in terms of pedigree completeness, individual inbreeding coefficient (F), generation interval (L), rate of inbreeding (ΔF), effective population size (Ne), effective number of founders (ff), and effective number of ancestors (fa). The herd initially consisted of 13 bulls and 14 cows, and there were variations in the number of selected bulls and cows throughout the analyzed period, with 2,575 bulls, 13,691 cows, and 45,711 births recorded at the end of 2016. In total, 48.81% of the cows had only one progeny. Most dams (47.59%) were between three and seven years old, with a mean L in the population of 7.9 years. According to the results, 52.75% of the cows, 44.92% of the bulls, and 63.71% of the calves of the Guzerat breed in the northern region of Brazil showed some degree of inbreeding, with small-magnitude coefficients (0.56, 0.83, and 0.71% for cows, bulls, and calves, respectively). This fluctuation did not hinder the genetic evolution of the herd in the region. The effective population size does not seem to compromise the maintenance of genetic variability in the breed.

Os dados genealógicos compreenderam 45.711 animais nascidos entre 1901 e 2016, com 48.127 animais no arquivo de pedigree. A estrutura populacional foi analisada em termos de completude de pedigree, coeficiente de endogamia individual (F), intervalo de geração (L), taxa de endogamia (ΔF), tamanho efetivo da população (Ne), número efetivo de fundadores (ff) e número efetivo de ancestrais (fa). O rebanho consistia inicialmente de 13 touros e 14 vacas, e houve variações no número de touros e vacas selecionados ao longo do período analisado, com 2.575 touros, 13.691 vacas e 45.711 nascimentos registrados no final de 2016. No total, 48,81% das vacas tiveram apenas uma progênie. A maioria das barragens (47,59%) tinha entre três e sete anos, com média de L na população de 7,9 anos. De acordo com os resultados, 52,75% das vacas, 44,92% dos touros e 63,71% dos bezerros da raça Guzerá na região Norte do Brasil apresentaram algum grau de endogamia, com coeficientes de pequena magnitude (0,56, 0,83 e 0,71% para vacas, touros e bezerros, respectivamente). Essa flutuação não impediu a evolução genética do rebanho na região. O tamanho efetivo da população não parece comprometer a manutenção da variabilidade genética na raça.

Genetic diversity analysis in dairy cows of Nariño, southwestern Colombia / Análise da diversidade genética em vacas leiteiras de Nariño, sudoeste da Colômbia

In Colombia, different dairy breeds were introduced from Europe and the United States, which underwent different crossing and selection processes that generated specific qualities or differences and which likely have their own genomic structure. To characterize genetic diversity, population structure, and admixture, we used genotypes from 23,182 autosomal single nucleotide polymorphisms (SNPs) of 130 animals representing four dairy cattle breed groups from Nariño. In addition, we merged genotypes from 43,043 autosomal SNPs, from 137 animals from the Decker database (Decker et al., 2014) (DRYAD doi:10.5061/dryad.th092). After the quality control process of pruning the merged dataset, we were left with 7,475 autosomal SNPs shared by both databases of Nariño (127 samples) and Decker (135 samples). Genetic diversity levels were moderate in all breeds (average observed heterozygosity = 0.40). Based on the fixation index values, we conclude that Brahman individuals were more differentiated than the taurine breeds (-0.374 to 0.076 for Brown Swiss). Pairs between taurine breeds showed low genetic differentiation (0.011-0.479). Principal component analysis revealed that in both the Nariño and Decker databases, the taurine formed the most compact cluster compared with other breeds known not to share the same ancestry, and Jersey, Brown Swiss, and Normand individuals exhibited high similarity with Holstein individuals. Hierarchical cluster analysis with Admixture revealed that Brahman, Jersey, Normand, and Holstein from the Decker databases most of which were clustered together with the dairy breeds of the Nariño highland tropics are not able to create different groups, thus having greater similarity with each other. This can be explained by the crosses made by farmers to increase milk production volume, always based on the Holstein breed with semen of bulls from America and Canada. Detrimental impacts due to intensive selection might cause some specific traits from the region to be fixed in the offspring, which can influence their adaptive capacity to the highland tropics.

Na Colômbia foram introduzidas diferentes raças leiteiras trazidas da Europa e dos Estados Unidos, que passaram por diferentes processos de cruzamento e seleção, gerando o desenvolvimento de características ou diferenças específicas nas raças bovinas e provavelmente, exibem sua própria estrutura genômica. Para caracterizar a diversidade genética e estrutura populacional foram utilizados genótipos de 23.182 polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) autossômicos de 130 animais, representando quatro grupos de raças de gado leiteiro de Nariño. Além disso, juntamos genótipos de 43.043 SNPs autossômicos, de 137 animais do banco de dados Decker (Decker et al., 2014) (DRYAD doi:10.5061/dryad.th092). Após o processo de controle de qualidade, o conjunto de dados misto ficou com 7.475 SNPs autossômicos compartilhados em ambos os bancos de dados de Nariño (127 amostras) e Decker (135 amostras). Os níveis de diversidade genética foram moderados em todas as raças (heterozigose média observada = 0,40). Com base nos valores do índice de fixação, concluímos que os indivíduos Brahman (zebuínos) foram mais diferenciados em comparação às raças taurinas (-0,374 a 0,076 para Pardo Suíço). Pares entre as raças taurinas apresentaram baixa diferenciação genética (0,011 ­ 0,479). O resultado dos componentes principais mostra que nos dois bancos de dados, Nariño e Decker, os taurinos formaram o cluster mais compacto em comparação com outras raças conhecidas por não compartilharem a mesma ancestralidade; indivíduos Jersey, Pardo Suíço e Normando denotaram alta similaridade com indivíduos Holandeses. A análise de agrupamento hierárquico com Admixture mostrou que Brahman, Jersey, Normando e Holandês da base de dados Decker, a maioria deles também agrupados com as raças leiteiras do alto trópico de Nariño, não são capazes de criar grupos diferentes, portanto, mostram maior semelhança entre eles. Isso pode ser explicado devido aos cruzamentos feitos pelos pecuaristas para aumentar o volume de produção de leite, sempre tendo como base a raça Holandesa com sêmen de touros da América e Canadá. Impactos prejudiciais, devido à seleção intensiva, podem fazer com que algumas características específicas da região sejam fixadas na prole e isso pode influenciar a sua capacidade adaptativa aos trópicos altos.

Phenotypic and molecular characterization of fluoroquinolone resistant Pseudomonas aeruginosa isolates in Palestine / Caracterização fenotípica e molecular de isolados de Pseudomonas aeruginosa resistentes a fluoroquinolonas na Palestina

Fluoroquinolones are important antimicrobial agents for the treatment of Pseudomonas infections. A total of 11 isolates of P. aeruginosa were collected from different clinical samples from different medical centers in the North West Bank-Palestine during 2017. In this study, resistance to fluoroquinolones and secretions of ß-lactamases were detected by phenotypic methods, while presence of ß-lactamase gene sequences and other virulence factors were detected by PCR technique. PCR product for gyrA, parC and parE genes were sequenced for further analyses. The phylogenetic analyses, population diversity indices and haplotypes determination were conducted using computer programs MEGA version 6, DnaSP 5.1001 and median-joining algorithm in the program Network 5, respectively. Results of this study showed that the MIC for ciprofloxacin and norfloxacin had a range of 32-256 µg/ml. In addition, all isolates carried either exoT or exoT and exoY genes, different ß-lactamase genes and 82% of these isolates harbored class 1 integrons. Analyses of the gyrA, parC and parE sequences were found to be polymorphic, had high haplotype diversity (0.945-0.982), low nucleotide diversity (0.01225-0.02001) and number of haplotypes were 9 for each gyrA and parE genes and 10 haplotypes for parC gene. The founder haplotypes being Hap-1 (18%), Hap-2 (27.3%) and Hap-6 (9.1%) for gyrA, parC and parE genes, respectively. Two of ParE haplotypes were detected as indel haplotypes. The Median-joining- (MJ) networks constructed from haplotypes of these genes showed a star-like expansion. The neutrality tests (Tajima's D test and Fu's Fs test) for these genes showed negative values. Palestinian fluoroquinolone resistant P. aeruginosa strains showed high MIC level for fluoroquinolones, ß-lactamase producers, carried type III secretion exotoxin-encoding genes, most of them had integrase I gene and had high level of mutations in QRDR regions in gyrA, parC and parE genes. All these factors may play an important role in the invasiveness of these strains and make them difficult to treat. Isolation of these strains from different medical centers, indicate the need for a strict application of infection control measures in Medical centers in the North West Bank-Palestine that aim to reduce expense and damage caused by P. aeruginosa infections. Molecular analyses showed that Palestinian fluoroquinolone resistant P. aeruginosa haplotypes are not genetically differentiated; however, more mutations may exist in these strains.

Fluoroquinolonas são agentes antimicrobianos importantes para o tratamento de infecções por Pseudomonas. Um total de 11 bacilos isolados de P. aeruginosa foram coletados de diferentes amostras clínicas provenientes de diferentes centros médicos na Cisjordânia-Palestina durante o ano de 2017. Neste estudo, resistência a fluoroquinolonas e secreções de ß-lactamases foram detectadas por métodos fenotípicos, enquanto a presença de sequências do gene ß-lactamase e outros fatores de virulência foram detectados pela técnica de PCR (Proteína C-reativa). O produto de PCR para os genes gyrA, parC e parE foram sequenciados para análises posteriores. As análises filogenéticas, os índices de diversidade populacional e a determinação de haplótipos foram realizados utilizando os softwares MEGA versão 6, DnaSP 5.1001 e o algoritmo de junção de mediana do programa Network 5, respectivamente. Os resultados deste estudo mostraram que a MIC para ciprofloxacina e norfloxacina tinha um intervalo de 32-256 µg/ml. Além disso, todos os bacilos isolados carregavam genes exoT ou exoT e exoY, genes de ß-lactamase diferentes e 82% desses isolados continham integrons de classe 1. As análises das sequências gyrA, parC e parE foram consideradas polimórficas, com alta diversidade de haplótipos (0,945-0,982), baixa diversidade de nucleotídeos (0,01225-0,02001) e o número de haplótipos foi de 9 para cada gene de gyrA e parE e 10 haplótipos para o gene parC. Os haplótipos fundadores são Hap-1 (18%), Hap-2 (27,3%) e Hap-6 (9,1%) para os genes gyrA, parC e parE, respectivamente. Dois dos haplótipos parE foram detectados como haplótipos InDel. As redes Median-joining (MJ) construídas a partir de haplótipos desses genes mostraram uma expansão semelhante à de uma estrela. Os testes de neutralidade (teste D de Tajima e teste Fs de Fu) para esses genes apresentaram valores negativos. As cepas palestinas de P. aeruginosa resistentes a fluoroquinolonas mostraram alto nível de MIC para fluoroquinolonas, produtores de ß-lactamase, genes codificadores de exotoxina de secreção tipo III, a maioria deles tinha o gene integrase I e tinha alto nível de mutações nas regiões QRDR nos genes gyrA, parC e parE. Todos esses fatores podem desempenhar um papel importante na invasão dessas cepas e torná-las difíceis de tratar. O isolamento dessas cepas em diferentes centros médicos, indica a necessidade de uma aplicação estrita de medidas de controle de infecção em centros médicos da Cisjordânia-Palestina que visam reduzir despesas e danos causados por infecções por P. aeruginosa. As análises moleculares mostraram que os haplótipos de P. aeruginosa resistentes à fluoroquinolona palestina não são geneticamente diferenciados; no entanto, mais mutações podem existir nessas cepas.

Avaliação da influência de fatores hidroclimáticos sobre a estrutura populacional de Podocnemis expansa (Testudines: Podocnemididae) no Rio Formoso, sudeste da Amazônia brasileira

ABSTRACT Evaluation of the influence of hydroclimatic factors on the population structure of Podocnemis expansa (Testudines: Podocnemididae) in Formoso River, southeastern Brazilian Amazon. It is essential to have more knowledge about the population ecology of Amazonian chelonian species in order to recover and maintain the natural stocks of these reptiles. This study assessed the influence of hydroclimatic factors on population parameters and the body condition of Podocnemis expansa (Schweigger, 1812) in a specific region of Formoso River, in the southeast of Brazilian Amazon rainforest, where there is an intense use of surface water for irrigation of agricultural crops. The fieldwork took place in three campaigns carried out between the end of July and the beginning of August in the years 2016, 2017 and 2018, with a total sample effort of 205 hours. The individuals were captured using the methods of net trawling, hook fishing and waiting net; and the hydroclimatic data obtained from the website of the Agência Nacional de Águas - ANA. A total of 466 specimens were captured and tagged, being 47 adult males, 76 adult females and 343 juveniles, demonstrating a population composed mostly of juveniles (73.60%) and with a deviated functional sex ratio for females (0.62:1). The reduction in the number of individuals of larger sizes and better body conditions were associated, respectively, with higher river flow average in the dry season and an increase in flow during the rainy period. Future long-term studies are necessary to deepen the knowledge about how hydroclimatic factors and agricultural activities developed in the region affect the demography of the species.

RESUMO O aumento do conhecimento sobre a ecologia populacional das espécies de quelônios amazônicos é essencial para a recuperação e manutenção dos estoques naturais desses répteis. Neste estudo foi avaliada a influência de fatores hidroclimáticos sobre parâmetros populacionais e a condição corporal de Podocnemis expansa (Schweigger, 1812) em um trecho do Rio Formoso, sudeste da Amazônia brasileira, caracterizado pelo intenso uso das águas superficiais na irrigação de culturas agrícolas. O trabalho de campo ocorreu em três campanhas realizadas entre o final de julho e início de agosto dos anos de 2016, 2017 e 2018, totalizando um esforço amostral de 205 horas. Os indivíduos foram capturados por meio dos métodos de arrasto de rede, pesca com anzol e rede de espera; e os dados hidroclimáticos obtidos no site da Agência Nacional das Águas - ANA. Um total de 466 espécimes foi capturado e marcado, incluindo 47 machos adultos, 76 fêmeas adultas e 343 juvenis- revelando-se uma população composta predominantemente por juvenis (73,60%) e com razão sexual funcional desviada para as fêmeas (0,62:1). A redução no número de indivíduos das classes de tamanhos maiores e melhores condições corporais estiveram associadas, respectivamente, a uma maior vazão média do rio na estação seca e ao aumento da vazão no período chuvoso. Estudos futuros de longo prazo devem buscar aprofundar os conhecimentos sobre como fatores hidroclimáticos e as atividades agrícolas desenvolvidas na região afetam a demografia da espécie.