Current understanding of an Emerging Coronavirus using in silico approach: Severe Acute Respiratory Syndrome-Coronavirus-2 (SARS-CoV-2)

Abstract Novel coronavirus (nCoV) namely SARS-CoV-2 is being found responsible for current PANDEMIC commenced from Wuhan (China) since December 2019 and has been described with epidemiological linkage to China in about 221 countries and territories until now. In this study we have characterized the genetic lineage of SARS-CoV-2 and report the recombination within the genus and subgenus of coronaviruses. Phylogenetic relationship of thirty nine coronaviruses belonging to its four genera and five subgenera was analyzed by using the Neighbor-joining method using MEGA 6.0. Phylogenetic trees of full length genome, various proteins (spike, envelope, membrane and nucleocapsid) nucleotide sequences were constructed separately. Putative recombination was probed via RDP4. Our analysis describes that the SARS-CoV-2 although shows great similarity to Bat-SARS-CoVs sequences through whole genome (giving sequence similarity 89%), exhibits conflicting grouping with the Bat-SARS-like coronavirus sequences (MG772933 and MG772934). Furthermore, seven recombination events were observed in SARS-CoV-2 (NC_045512) by RDP4. But not a single recombination event fulfills the high level of certainty. Recombination mostly housed in spike protein genes than rest of the genome indicating breakpoint cluster arises beyond the 95% and 99% breakpoint density intervals. Genetic similarity levels observed among SARS-CoV-2 and Bat-SARS-CoVs advocated that the latter did not exhibit the specific variant that cause outbreak in humans, proposing a suggestion that SARS-CoV-2 has originated possibly from bats. These genomic features and their probable association with virus characteristics along with virulence in humans require further consideration.

Resumo O novo coronavírus (nCoV), nomeadamente SARS-CoV-2, foi considerado responsável pela pandemia atual iniciada em Wuhan (China) desde dezembro de 2019 e foi descrito com ligação epidemiológica à China em cerca de 221 países e territórios até agora. Neste estudo, caracterizamos a linhagem genética do SARS-CoV-2 e relatamos a recombinação dentro do gênero e subgênero dos coronavírus. A relação filogenética de 39 coronavírus pertencentes a seus quatro gêneros e cinco subgêneros foi analisada usando o método de Neighbour-joining usando MEGA 6.0. Árvores filogenéticas do genoma de comprimento total, várias proteínas (espícula, envelope, membrana e nucleocapsídeo), sequências de nucleotídeos foram construídas separadamente. A recombinação putativa foi testada via RDP4. Nossa análise descreve que o SARS-CoV-2, embora mostre grande semelhança com as sequências de Bat-SARS-CoVs em todo o genoma (dando semelhança de sequência de 89%), exibe agrupamento conflitante com as sequências de coronavírus do tipo Bat-SARS (MG772933 e MG772934) Além disso, sete eventos de recombinação foram observados em SARS-CoV-2 (NC045512) por RDP4. Mas nem um único evento de recombinação preenche o alto nível de certeza. A recombinação está alojada mais em genes de proteína de pico, principalmente, do que no resto do genoma, indicando que o cluster de ponto de interrupção surge além dos intervalos de densidade de ponto de interrupção de 95% e 99%. Os níveis de similaridade genética observados entre SARS-CoV-2 e Bat-SARS-CoVs defendem que o último não exibe a variante específica que causa surto em humanos, sugerindo que SARS-CoV-2 tenha se originado possivelmente de morcegos. Essas características genômicas e sua provável associação com as características do vírus, juntamente com a virulência em humanos, requerem uma consideração mais aprofundada.

Fowl Aviadenovirus E associated with hepatitis-hydropericardium syndrome in broiler breeders / Síndrome da hepatite-hidropericárdio por Aviadenovirus e em reprodutores de corte

ABSTRACT: Fowl aviadenovirus (FAdV) is an important pathogen in the global poultry industry and the etiology of inclusion body hepatitis-hydropericardium syndrome (HHS) in chickens. Since the 1990s, several outbreaks of HHS have occurred in poultry producing areas, including South America. The coinfection of FAdV and chicken anemia virus (CAV) may markedly impact the incidence of HHS. This study describes an outbreak of HHS in coinfection with CAV in industrial broiler breeders and characterizes the FAdV isolate. The three-week-old male broiler breeders had pale bone marrow, enlarged and yellowish liver, splenomegaly, and atrophied thymus; one chicken was also found with hydropericardium. Virus isolation was performed in SPF chicken embryos of liver and thymus. Tissues of the naturally infected chickens and the inoculated embryos were evaluated by PCR and histopathology. All affected chickens and inoculated embryos were positive for FAdV and CAV. The inoculated embryos had enlarged, greenish and hemorrhagic livers, and 30% died within 7 days of inoculation. Phylogenetic analysis of the FAdV isolate hexon gene partial sequence enabled grouping with E species. The E species has recently become a relevant species in several countries. The association of FAdV with CAV in breeders is of further concern due to both being capable of vertical transmission. Within the last decade, a worldwide upsurge of HHS in broiler breeders owing to failed biosecurity has occurred. In this episode, the failure on biosecurity may have enabled challenge with both FAdV and CAV, with pathological synergism. The CAV-impaired adaptive immunity may have benefited the FAdV infection.

RESUMO: Adenovírus aviário (FAdV) é um importante patógeno na indústria avícola global e a etiologia da síndrome da hepatite por corpúsculo de inclusão-hidropericárdio (SHH) em galinhas. Desde a década de 1990, vários surtos de SHH foram descritos em todas as áreas de produção de aves, incluindo na América do Sul, e a coinfecção entre FAdV e vírus da anemia das galinhas (CAV) pode ser agravante para todos os aspectos da SHH. Objetiva-se descrever um surto de SHH em matrizes de frangos corte, caracterizar a estirpe de FAdV envolvida e destacar a coinfecção com CAV. Foram avaliados machos reprodutores de corte com três semanas de idade, com medula óssea pálida, fígado aumentado e amarelado e esplenomegalia, timo atrofiado e um com hidropericárdio. Fígado e timo foram coletados para isolamento do vírus em embriões de galinhas SPF, PCR e histopatologia. Todas as aves acometidas e embriões inoculados foram positivos para FAdV e CAV. Os embriões inoculados tiveram óbito de 30% em até sete dias após a inoculação e alterações hepáticas por fígados esverdeados e aumentados. A análise filogenética de FAdV com base em parte da sequência do gene que codifica a proteína hexon revelou identidade com a espécie E, que se tornou disseminada em vários países. A coinfecção de FAdV e CAV resulta em maior intensidade de lesões, maior morbidade e mortalidade e em reprodutores tem alta relevância epidemiológica, em razão da transmissão vertical de ambos e da ampla distribuição geográfica das progênies infectadas. Na última década, ocorreu um aumento mundial na ocorrência de SHH em frangos de corte relacionado a falhas em biosseguridade, especialmente em reprodutores, condição que pode ter ocorrido neste episódio. A presença de FAdV e CAV em reprodutores é motivo para preocupação por reflexos negativos à imunidade e viabilidade das progênies.

Fowl Aviadenovirus E associated with hepatitis-hydropericardium syndrome in broiler breeders / Síndrome da hepatite-hidropericárdio por Aviadenovirus e em reprodutores de corte

Fowl aviadenovirus (FAdV) is an important pathogen in the global poultry industry and the etiology of inclusion body hepatitis-hydropericardium syndrome (HHS) in chickens. Since the 1990s, several outbreaks of HHS have occurred in poultry producing areas, including South America. The coinfection of FAdV and chicken anemia virus (CAV) may markedly impact the incidence of HHS. This study describes an outbreak of HHS in coinfection with CAV in industrial broiler breeders and characterizes the FAdV isolate. The three-week-old male broiler breeders had pale bone marrow, enlarged and yellowish liver, splenomegaly, and atrophied thymus; one chicken was also found with hydropericardium. Virus isolation was performed in SPF chicken embryos of liver and thymus. Tissues of the naturally infected chickens and the inoculated embryos were evaluated by PCR and histopathology. All affected chickens and inoculated embryos were positive for FAdV and CAV. The inoculated embryos had enlarged, greenish and hemorrhagic livers, and 30% died within 7 days of inoculation. Phylogenetic analysis of the FAdV isolate hexon gene partial sequence enabled grouping with E species. The E species has recently become a relevant species in several countries. The association of FAdV with CAV in breeders is of further concern due to both being capable of vertical transmission. Within the last decade, a worldwide upsurge of HHS in broiler breeders owing to failed biosecurity has occurred. In this episode, the failure on biosecurity may have enabled challenge with both FAdV and CAV, with pathological synergism. The CAV-impaired adaptive immunity may have benefited the FAdV infection.

Adenovírus aviário (FAdV) é um importante patógeno na indústria avícola global e a etiologia da síndrome da hepatite por corpúsculo de inclusão-hidropericárdio (SHH) em galinhas. Desde a década de 1990, vários surtos de SHH foram descritos em todas as áreas de produção de aves, incluindo na América do Sul, e a coinfecção entre FAdV e vírus da anemia das galinhas (CAV) pode ser agravante para todos os aspectos da SHH. Objetiva-se descrever um surto de SHH em matrizes de frangos corte, caracterizar a estirpe de FAdV envolvida e destacar a coinfecção com CAV. Foram avaliados machos reprodutores de corte com três semanas de idade, com medula óssea pálida, fígado aumentado e amarelado e esplenomegalia, timo atrofiado e um com hidropericárdio. Fígado e timo foram coletados para isolamento do vírus em embriões de galinhas SPF, PCR e histopatologia. Todas as aves acometidas e embriões inoculados foram positivos para FAdV e CAV. Os embriões inoculados tiveram óbito de 30% em até sete dias após a inoculação e alterações hepáticas por fígados esverdeados e aumentados. A análise filogenética de FAdV com base em parte da sequência do gene que codifica a proteína hexon revelou identidade com a espécie E, que se tornou disseminada em vários países. A coinfecção de FAdV e CAV resulta em maior intensidade de lesões, maior morbidade e mortalidade e em reprodutores tem alta relevância epidemiológica, em razão da transmissão vertical de ambos e da ampla distribuição geográfica das progênies infectadas. Na última década, ocorreu um aumento mundial na ocorrência de SHH em frangos de corte relacionado a falhas em biosseguridade, especialmente em reprodutores, condição que pode ter ocorrido neste episódio. A presença de FAdV e CAV em reprodutores é motivo para preocupação por reflexos negativos à imunidade e viabilidade das progênies.

Current understanding of an Emerging Coronavirus usingin silico approach: Severe Acute Respiratory Syndrome-Coronavirus-2 (SARS-CoV-2) / Compreensão atual de um coronavírus emergente usando abordagem in silico: síndrome respiratória aguda grave - coronavírus-2 (SARS-CoV-2)

Novel coronavirus (nCoV) namely "SARS-CoV-2" is being found responsible for current PANDEMIC commenced from Wuhan (China) since December 2019 and has been described with epidemiological linkage to China in about 221 countries and territories until now. In this study we have characterized the genetic lineage of SARS-CoV-2 and report the recombination within the genus and subgenus of coronaviruses. Phylogenetic relationship of thirty nine coronaviruses belonging to its four genera and five subgenera was analyzed by using the Neighbor-joining method using MEGA 6.0. Phylogenetic trees of full length genome, various proteins (spike, envelope, membrane and nucleocapsid) nucleotide sequences were constructed separately. Putative recombination was probed via RDP4. Our analysis describes that the "SARS-CoV-2" although shows great similarity to Bat-SARS-CoVs sequences through whole genome (giving sequence similarity 89%), exhibits conflicting grouping with the Bat-SARS-like coronavirus sequences (MG772933 and MG772934). Furthermore, seven recombination events were observed in SARS-CoV-2 (NC_045512) by RDP4. But not a single recombination event fulfills the high level of certainty. Recombination mostly housed in spike protein genes than rest of the genome indicating breakpoint cluster arises beyond the 95% and 99% breakpoint density intervals. Genetic similarity levels observed among "SARS-CoV-2" and Bat-SARS-CoVs advocated that the latter did not exhibit the specific variant that cause outbreak in humans, proposing a suggestion that "SARS-CoV-2" has originated possibly from bats. These genomic features and their probable association with virus characteristics along with virulence in humans require further consideration.

O novo coronavírus (nCoV), nomeadamente "SARS-CoV-2", foi considerado responsável pela pandemia atual iniciada em Wuhan (China) desde dezembro de 2019 e foi descrito com ligação epidemiológica à China em cerca de 221 países e territórios até agora. Neste estudo, caracterizamos a linhagem genética do SARS-CoV-2 e relatamos a recombinação dentro do gênero e subgênero dos coronavírus. A relação filogenética de 39 coronavírus pertencentes a seus quatro gêneros e cinco subgêneros foi analisada usando o método de Neighbour-joining usando MEGA 6.0. Árvores filogenéticas do genoma de comprimento total, várias proteínas (espícula, envelope, membrana e nucleocapsídeo), sequências de nucleotídeos foram construídas separadamente. A recombinação putativa foi testada via RDP4. Nossa análise descreve que o "SARS-CoV-2", embora mostre grande semelhança com as sequências de Bat-SARS-CoVs em todo o genoma (dando semelhança de sequência de 89%), exibe agrupamento conflitante com as sequências de coronavírus do tipo Bat-SARS (MG772933 e MG772934) Além disso, sete eventos de recombinação foram observados em SARS-CoV-2 (NC045512) por RDP4. Mas nem um único evento de recombinação preenche o alto nível de certeza. A recombinação está alojada mais em genes de proteína de pico, principalmente, do que no resto do genoma, indicando que o cluster de ponto de interrupção surge além dos intervalos de densidade de ponto de interrupção de 95% e 99%. Os níveis de similaridade genética observados entre "SARS-CoV-2" e Bat-SARS-CoVs defendem que o último não exibe a variante específica que causa surto em humanos, sugerindo que "SARS-CoV-2" tenha se originado possivelmente de morcegos. Essas características genômicas e sua provável associação com as características do vírus, juntamente com a virulência em humanos, requerem uma consideração mais aprofundada.

Current understanding of an Emerging Coronavirus usingin silico approach: Severe Acute Respiratory Syndrome-Coronavirus-2 (SARS-CoV-2) / Compreensão atual de um coronavírus emergente usando abordagem in silico: síndrome respiratória aguda grave - coronavírus-2 (SARS-CoV-2)

Novel coronavirus (nCoV) namely "SARS-CoV-2" is being found responsible for current PANDEMIC commenced from Wuhan (China) since December 2019 and has been described with epidemiological linkage to China in about 221 countries and territories until now. In this study we have characterized the genetic lineage of SARS-CoV-2 and report the recombination within the genus and subgenus of coronaviruses. Phylogenetic relationship of thirty nine coronaviruses belonging to its four genera and five subgenera was analyzed by using the Neighbor-joining method using MEGA 6.0. Phylogenetic trees of full length genome, various proteins (spike, envelope, membrane and nucleocapsid) nucleotide sequences were constructed separately. Putative recombination was probed via RDP4. Our analysis describes that the "SARS-CoV-2" although shows great similarity to Bat-SARS-CoVs sequences through whole genome (giving sequence similarity 89%), exhibits conflicting grouping with the Bat-SARS-like coronavirus sequences (MG772933 and MG772934). Furthermore, seven recombination events were observed in SARS-CoV-2 (NC_045512) by RDP4. But not a single recombination event fulfills the high level of certainty. Recombination mostly housed in spike protein genes than rest of the genome indicating breakpoint cluster arises beyond the 95% and 99% breakpoint density intervals. Genetic similarity levels observed among "SARS-CoV-2" and Bat-SARS-CoVs advocated that the latter did not exhibit the specific variant that cause outbreak in humans, proposing a suggestion that "SARS-CoV-2" has originated possibly from bats. These genomic features and their probable association with virus characteristics along with virulence in humans require further consideration.(AU)

O novo coronavírus (nCoV), nomeadamente "SARS-CoV-2", foi considerado responsável pela pandemia atual iniciada em Wuhan (China) desde dezembro de 2019 e foi descrito com ligação epidemiológica à China em cerca de 221 países e territórios até agora. Neste estudo, caracterizamos a linhagem genética do SARS-CoV-2 e relatamos a recombinação dentro do gênero e subgênero dos coronavírus. A relação filogenética de 39 coronavírus pertencentes a seus quatro gêneros e cinco subgêneros foi analisada usando o método de Neighbour-joining usando MEGA 6.0. Árvores filogenéticas do genoma de comprimento total, várias proteínas (espícula, envelope, membrana e nucleocapsídeo), sequências de nucleotídeos foram construídas separadamente. A recombinação putativa foi testada via RDP4. Nossa análise descreve que o "SARS-CoV-2", embora mostre grande semelhança com as sequências de Bat-SARS-CoVs em todo o genoma (dando semelhança de sequência de 89%), exibe agrupamento conflitante com as sequências de coronavírus do tipo Bat-SARS (MG772933 e MG772934) Além disso, sete eventos de recombinação foram observados em SARS-CoV-2 (NC045512) por RDP4. Mas nem um único evento de recombinação preenche o alto nível de certeza. A recombinação está alojada mais em genes de proteína de pico, principalmente, do que no resto do genoma, indicando que o cluster de ponto de interrupção surge além dos intervalos de densidade de ponto de interrupção de 95% e 99%. Os níveis de similaridade genética observados entre "SARS-CoV-2" e Bat-SARS-CoVs defendem que o último não exibe a variante específica que causa surto em humanos, sugerindo que "SARS-CoV-2" tenha se originado possivelmente de morcegos. Essas características genômicas e sua provável associação com as características do vírus, juntamente com a virulência em humanos, requerem uma consideração mais aprofundada.(AU)

Current understanding of an Emerging Coronavirus using in silico approach: Severe Acute Respiratory Syndrome-Coronavirus-2 (SARS-CoV-2) / Compreensão atual de um coronavírus emergente usando abordagem in silico: síndrome respiratória aguda grave - coronavírus-2 (SARS-CoV-2)

Abstract Novel coronavirus (nCoV) namely "SARS-CoV-2" is being found responsible for current PANDEMIC commenced from Wuhan (China) since December 2019 and has been described with epidemiological linkage to China in about 221 countries and territories until now. In this study we have characterized the genetic lineage of SARS-CoV-2 and report the recombination within the genus and subgenus of coronaviruses. Phylogenetic relationship of thirty nine coronaviruses belonging to its four genera and five subgenera was analyzed by using the Neighbor-joining method using MEGA 6.0. Phylogenetic trees of full length genome, various proteins (spike, envelope, membrane and nucleocapsid) nucleotide sequences were constructed separately. Putative recombination was probed via RDP4. Our analysis describes that the "SARS-CoV-2" although shows great similarity to Bat-SARS-CoVs sequences through whole genome (giving sequence similarity 89%), exhibits conflicting grouping with the Bat-SARS-like coronavirus sequences (MG772933 and MG772934). Furthermore, seven recombination events were observed in SARS-CoV-2 (NC_045512) by RDP4. But not a single recombination event fulfills the high level of certainty. Recombination mostly housed in spike protein genes than rest of the genome indicating breakpoint cluster arises beyond the 95% and 99% breakpoint density intervals. Genetic similarity levels observed among "SARS-CoV-2" and Bat-SARS-CoVs advocated that the latter did not exhibit the specific variant that cause outbreak in humans, proposing a suggestion that "SARS-CoV-2" has originated possibly from bats. These genomic features and their probable association with virus characteristics along with virulence in humans require further consideration.

Resumo O novo coronavírus (nCoV), nomeadamente "SARS-CoV-2", foi considerado responsável pela pandemia atual iniciada em Wuhan (China) desde dezembro de 2019 e foi descrito com ligação epidemiológica à China em cerca de 221 países e territórios até agora. Neste estudo, caracterizamos a linhagem genética do SARS-CoV-2 e relatamos a recombinação dentro do gênero e subgênero dos coronavírus. A relação filogenética de 39 coronavírus pertencentes a seus quatro gêneros e cinco subgêneros foi analisada usando o método de Neighbour-joining usando MEGA 6.0. Árvores filogenéticas do genoma de comprimento total, várias proteínas (espícula, envelope, membrana e nucleocapsídeo), sequências de nucleotídeos foram construídas separadamente. A recombinação putativa foi testada via RDP4. Nossa análise descreve que o "SARS-CoV-2", embora mostre grande semelhança com as sequências de Bat-SARS-CoVs em todo o genoma (dando semelhança de sequência de 89%), exibe agrupamento conflitante com as sequências de coronavírus do tipo Bat-SARS (MG772933 e MG772934) Além disso, sete eventos de recombinação foram observados em SARS-CoV-2 (NC045512) por RDP4. Mas nem um único evento de recombinação preenche o alto nível de certeza. A recombinação está alojada mais em genes de proteína de pico, principalmente, do que no resto do genoma, indicando que o cluster de ponto de interrupção surge além dos intervalos de densidade de ponto de interrupção de 95% e 99%. Os níveis de similaridade genética observados entre "SARS-CoV-2" e Bat-SARS-CoVs defendem que o último não exibe a variante específica que causa surto em humanos, sugerindo que "SARS-CoV-2" tenha se originado possivelmente de morcegos. Essas características genômicas e sua provável associação com as características do vírus, juntamente com a virulência em humanos, requerem uma consideração mais aprofundada.

Characterization and genetic diversity in Paspalum notatum Flügge accessions: Morphological and geographical distance

The objective of this work was to describe morphology and grouping of Paspalum notatum accessions, based on multicategorical data which discards the redundant variables for quantification of genetic diversity. We also tested the hypothesis that geographical distance was correlated with morphological divergence. In our study, multivariate analyzes successfully demonstrated the geographic and morphological variability of the P. notatum accessions characterized. Many of these evaluated accessions can be included in future genetic improvement programs. Based on two methodologies for discarding variables, it was possible to identify the potentially important morphological characteristics from genetic diversity studies and characterize new accessions aimed at improving forage and seed production. The methodologies used to discard variables are biometric tools that can be used successfully in future plant breeding programs, especially when a large number of traits and accessions are being evaluated. Although significant, geographic distance had a low association with morphological traits. This indicated the need to use other characteristics, such as forage and seed yield, in addition to molecular analysis. Our analyzes showed genetic variability in P. notatum for all the characteristics studied.(AU)

Effect of Citrus Flavonoid on Storage Time and Meat Quality of Pharaoh Quail (Coturnix Pharaoh)

This study investigates the effects of Hesperidin added to quail ration at different rates on some microbiological and physicochemical, lipid peroxidation, and lipid profiles in thigh meat. The current study had a duration of 35 days and used Pharaoh quails (Coturnix Pharaoh). The grouping was done in three treatment groups: Control, HES500, and HES1000 (each group was divided into five subgroups), and 0, 500, and 1000 mg/kg of Hesperidin was added to the basal diet of the groups, respectively. Adding Hesperidin and storage time affected the pH parameter in meat. It affected colour parameters depending upon the added Hesperidin (p<0.05). There was a significant difference in the number of total mesophilic aerobic bacteria (TMAB) in comparison with the control group according to the storage time (p<0.05). Palmitic, α-linolenic, oleic acid, eicosapentaenoic, and docosahexaenoic acids, which are among the individual fatty acids, differed between the control, HES500 and HES1000 groups (p<0.05). Hesperidin addition reduced lipid peroxidation on the 3rd, 5th, and 7th days of storage (p<0.05). Consequently, in direct proportion to the hypothesis at the beginning of the study, it was specified that adding Hesperidin reduced its concentration on lipid oxidation and had a positive effect on meat quality in terms of colour parameters.(AU)

Spatio-temporal dynamics of milk production in Brazil / Dinâmica espaço-temporal da produção de leite no Brasil

The milk production chain has relevance for the Brazilian economy, generating jobs and income. In addition, milk production, because of family-based farms, has an important social function. However, milk production is spatially heterogeneous in Brazil, especially due to the different technological patterns of production. In this context, the objective of this study was to verify the spatio-temporal distribution and dynamics of milk production in Brazil. For this purpose, milk production in Brazil in 2000 and 2016 was analyzed. The Brazilian microregions that specialize in milk production were identified using location quotient (LQ). An exploratory analysis of spatial data and Moran's I were used to measure spatial autocorrelation among regions. Finally, principal component analysis (PCA) was used to assess the grouping relationships of variables as a function of the regions that specialize in milk production. Between 2000 and 2016, there was a decrease in the number of microregions that specialize in milk production. Thus, in 2016, approximately 20% of the microregions and over 22% of Brazilian municipalities specialized in milk production. The microregions and municipalities that specialize in milk production were concentrated mainly in the states of Minas Gerais and Goiás and in the Southern region of Brazil. There was an increase in milk productivity in all regions of the country, especially in those regions where production was concentrated. The formation of high-high clusters was found in the most productive regions of the country, i.e., in the South and Southeast, where the effects of technological spillover were observed, and the formation of low-low clusters was observed in the less productive regions, i.e., in the North and Northeast. Two main components were formed. The first component aggregated variables related to milk production in volume, and the second component aggregated variables inherent to productivity. It was possible to verify the recent growth in milk production and productivity in the country as well as to demonstrate the heterogeneity in production. Although there was a decrease in the number of microregions and municipalities that specialize in milk production, there was a concentration and increase in milk production and productivity in Brazil.(AU)

A cadeia produtiva do leite possui relevância para a economia brasileira, gerando empregos e renda. Além disso, a produção de leite, em razão da produção familiar, exerce importante função social. No entanto, a produção de leite é espacialmente heterogênea no país, sobretudo pelos diferentes padrões tecnológicos de produção. Nesse contexto, o objetivo deste estudo foi verificar a distribuição e a dinâmica espaçotemporal da produção de leite no Brasil. Para isso, foram utilizados, acerca da produção de leite no país nos anos de 2000 e 2016. Por meio do Quociente Locacional (QL), foram identificadas as microrregiões brasileiras especializadas na produção de leite. Foi realizada Análise Exploratória de Dados Espaciais (AEDE) e do I de Moran, para medir a autocorrelação espacial entre as regiões. Por fim, foi empregada a Análise de Componentes Principais (ACP), para verificar as relações de agrupamento das variáveis, em função das regiões especializadas na produção de leite. Foi identificada queda no número de microrregiões especializadas na produção de leite entre 2000 e 2016, Assim, em 2016, cerca de 20% das microrregiões e pouco mais de 22% dos municípios do Brasil eram especializados na produção de leite. As microrregiões e municípios especializados na produção de leite estão concentrados, principalmente, nos estados de Minas Gerais e Goiás e na região Sul do Brasil. Houve aumento da produtividade de leite em todas as regiões do país, principalmente naquelas onde há concentração na produção. Constatou-se a formação de clusters Alto-Alto nas regiões mais produtivas do país, ou seja, a Sul e a Sudeste, onde se observa os efeitos do transbordamento tecnológico, bem como a formação de clusters baixo-baixo nas regiões menos produtivas, a Norte e a Nordeste. Foram formados dois componentes principais. O primeiro componente agregou variáveis relacionadas com a produção de leite em volume, enquanto o segundo componente relacionou variáveis inerentes a produtividade. Foi possível verificar o crescimento recente da produção e da produtividade de leite no país, bem como evidenciar a heterogeneidade na produção. Verificou-se que embora tenha ocorrido queda no número de microrregiões e municípios especializados na produção de leite, houve concentração e aumento na produção e produtividade de leite no Brasil.(AU)

High rDNA polymorphisms in Astyanax lacustris (Characiformes: Characidae): new insights about the cryptic diversity in A. bimaculatus species complex with emphasis on the Paraná River basin

This study aimed to identify species of Astyanax bimaculatus group from four Itaipu Reservoir tributaries (Paraná River Basin) by cytogenetics and molecular markers (COI) to investigate the possible occurrence of cryptic diversity in part of this basin. The four populations showed only one karyotype formula and simple AgNORs. FISH with 18S rDNA probe showed a high variation, and 5S rDNA probes evidenced simple sites in most of the specimens, although multiple sites are present in two specimens. The variations of 5S and 18S cistrons generated 13 cytotypes. The molecular data did not reveal cryptic diversity in the populations; however, its grouping with 82 sequences from other stretches of the Paraná River Basin originated three haplogroups (distances of 3.12% and 8.82%) and 33 haplotypes were identified. DNA Barcode suggests that cytogenetic variations represent a high polymorphism degree, and it identified the analyzed specimens as Astyanax lacustris, which confirms the morphological identification. Our data suggest that the cryptic diversity of this group in the tributaries of the Paraná River Basin is different than the proposed by the synonymizations of A. altiparanae and A. asuncionensis to A. lacustris. This study reinforces the importance of integrative cytogenetics and molecular methods for taxonomy.(AU)

Este trabalho teve como objetivo identificar espécies do complexo Astyanax bimaculatus de quatro afluentes do reservatório de Itaipu (bacia do Rio Paraná) por métodos citogenéticos e moleculares (COI), investigando a possibilidade de ocorrência de diversidade críptica em parte desta bacia. As quatro populações apresentaram apenas uma fórmula cariotípica e AgNORs simples. A FISH com rDNA 18S apresentou alto grau de variação e as sondas de rDNA 5S evidenciaram sítios simples na maioria dos exemplares, embora sítios múltiplos tenham sido evidenciados em dois espécimes. As variações dos cistrons 5S e 18S geraram 13 citótipos. Os dados moleculares não revelaram diversidade críptica nas populações, entretanto, seu agrupamento com 82 sequências de outros trechos da mesma bacia formou três haplogrupos (distâncias de 3,12% e 8,82%) e gerou 33 haplótipos. O DNA Barcode sugere que as variações citogenéticas representam um alto grau de polimorfismo e identificou os espécimes analisados como Astyanax lacustris, confirmando a identificação por caracteres morfológicos. Nossos dados sugerem que a diversidade críptica do grupo nos afluentes da bacia do Rio Paraná é diferente do proposto pelas sinonimizações de A. altiparanae e A. asuncionensis para A. lacustris, reforçando a importância da integração de métodos citogenéticos e moleculares para a taxonomia.(AU)

Genetic diversity and heterotic grouping of sorghum lines using SNP markers

Sorghum breeding programs are based predominantly on developing homozygous lines to produce single cross hybrids, frequently with relatively narrow genetic bases. The adoption of complementary strategies, such as genetic diversity study, enables a broader vision of the genetic structure of the breeding germplasm. The purpose of this study was to evaluate the genetic diversity of sorghum breeding lines using structure analysis, principal components (PC) and clustering analyses. A total of 160 sorghum lines were genotyped with 29,649 SNP markers generated by genotyping-by-sequencing (GBS). The PC and clustering analyses consistently divided the R (restorer) and B (maintainer) lines based on their pedigree, generating four groups. Thirty-two B and 21 R lines were used to generate 121 single-cross hybrids, whose performances were compared based on the diversity clustering of each parental line. The genetic divergence of B and R lines indicated a potential for increasing heterotic response in the development of hybrids. The genetic distance was correlated to heterosis, allowing for the use of markers to create heterotic groups in sorghum.(AU)

Genetic diversity and heterotic grouping of sorghum lines using SNP markers

Sorghum breeding programs are based predominantly on developing homozygous lines to produce single cross hybrids, frequently with relatively narrow genetic bases. The adoption of complementary strategies, such as genetic diversity study, enables a broader vision of the genetic structure of the breeding germplasm. The purpose of this study was to evaluate the genetic diversity of sorghum breeding lines using structure analysis, principal components (PC) and clustering analyses. A total of 160 sorghum lines were genotyped with 29,649 SNP markers generated by genotyping-by-sequencing (GBS). The PC and clustering analyses consistently divided the R (restorer) and B (maintainer) lines based on their pedigree, generating four groups. Thirty-two B and 21 R lines were used to generate 121 single-cross hybrids, whose performances were compared based on the diversity clustering of each parental line. The genetic divergence of B and R lines indicated a potential for increasing heterotic response in the development of hybrids. The genetic distance was correlated to heterosis, allowing for the use of markers to create heterotic groups in sorghum.

Validation of soil quality index in soil using bioindicator plant / Validação do índice da qualidade do solo com planta bioindicadora

Soils provide a broad set of vital ecosystem services and sustains the production of food and fibers, balancing the ecosystem. Thus, from the perspective of soil quality, it is defined as an ability to balance within the ecosystem to sustain biological productivity, promoting the health of plants and animals, being evaluated by traditional indicators as physical, chemical and biological indicators, so the present work aims to estimate the soil quality index using multivariate models using soil biological attributes and validation with growth variables of the bioindicator plant. The study was developed in the agricultural area in P. Prudente, SP, the points collected were georeferenced, collections in depth of 0 -20 cm, microbiological analysis, microbial carbon and nitrogen biomass, dehydrogenase, respiration and microbial coefficient, having a bioindicator plant curly lettuce (Lucy Brown) as a validator of the soil. The results were discovered using the PCA model for the identification of autos vectors and autos values, grouping and identifying their collinearities, linear regression, r-pearson validation and cluster heuristic analysis. The microbial attributes and the bioindicator plant discriminated the agricultural areas evaluated with establishment and validation of SQI. The metabolic coefficient and N of the microbial biomass dissipation of the highest covariance values by multivariate analysis. The reforestation area with native species (SQI0.782%) and the livestock crop integration system (SQI0.765%) were evaluated as areas with better soil quality.

O solo fornece o conjunto de serviços ambientais vitaise dinâmico que condiciona e sustenta a produção de alimentos e fibras, balanceando o ecossistema, dessa forma, sob a ótica da qualidade do solo é definida como a capacidade de se equilibrar dentro do ecossistema para sustentar a produtividade biológica, promovendo a saúde das plantas e animais, sendo avaliada pelos indicadores tradicionais como indicadores físicos, químicos e biológicos, assim o presente trabalho tem como objetivo estimar índice qualidade do solo com uso de modelos multivariados utilizando-se de atributos biológicos do solo e validação com variáveis de crescimento da planta bioindicadora. O estudo foi desenvolvido na área agrícola da universidade do Oeste Paulista, campus II, os pontos coletados foram georreferenciados, coletatos em profundidade de 0 –20 cm, realizado as análises microbiológicas, biomassa microbiana do carbono e nitrogênio, desidrogenase, respiração e coeficiente microbiano, tendo a planta bioindicadora alface crespa (Lucy Brown) como validador do solo. Os resultados foram submetidos ao modelo de PCA para a identificação dos autos vetores e autos valores agrupando e identificando suas colinearidades, regressão linear, validação r-pearson e análise heurística de cluster. Os atributos microbianos e a planta bioindicadora discriminaram as áreas agrícolas avaliadas com atribuição e validação de SQI. O coeficiente metabólico e N da biomassa microbiana apresentaram os maiores valores de covariância pela análise multivariada. A área de reflorestamentocom espécies nativas (SQI0,782%) e o sistema de integração lavoura pecuária (SQI0,765%) foram consideradas as áreas com melhor qualidade de solo.

Validation of soil quality index in soil using bioindicator plant / Validação do índice da qualidade do solo com planta bioindicadora

Soils provide a broad set of vital ecosystem services and sustains the production of food and fibers, balancing the ecosystem. Thus, from the perspective of soil quality, it is defined as an ability to balance within the ecosystem to sustain biological productivity, promoting the health of plants and animals, being evaluated by traditional indicators as physical, chemical and biological indicators, so the present work aims to estimate the soil quality index using multivariate models using soil biological attributes and validation with growth variables of the bioindicator plant. The study was developed in the agricultural area in P. Prudente, SP, the points collected were georeferenced, collections in depth of 0 -20 cm, microbiological analysis, microbial carbon and nitrogen biomass, dehydrogenase, respiration and microbial coefficient, having a bioindicator plant curly lettuce (Lucy Brown) as a validator of the soil. The results were discovered using the PCA model for the identification of autos vectors and autos values, grouping and identifying their collinearities, linear regression, r-pearson validation and cluster heuristic analysis. The microbial attributes and the bioindicator plant discriminated the agricultural areas evaluated with establishment and validation of SQI. The metabolic coefficient and N of the microbial biomass dissipation of the highest covariance values by multivariate analysis. The reforestation area with native species (SQI0.782%) and the livestock crop integration system (SQI0.765%) were evaluated as areas with better soil quality.(AU)

O solo fornece o conjunto de serviços ambientais vitaise dinâmico que condiciona e sustenta a produção de alimentos e fibras, balanceando o ecossistema, dessa forma, sob a ótica da qualidade do solo é definida como a capacidade de se equilibrar dentro do ecossistema para sustentar a produtividade biológica, promovendo a saúde das plantas e animais, sendo avaliada pelos indicadores tradicionais como indicadores físicos, químicos e biológicos, assim o presente trabalho tem como objetivo estimar índice qualidade do solo com uso de modelos multivariados utilizando-se de atributos biológicos do solo e validação com variáveis de crescimento da planta bioindicadora. O estudo foi desenvolvido na área agrícola da universidade do Oeste Paulista, campus II, os pontos coletados foram georreferenciados, coletatos em profundidade de 0 –20 cm, realizado as análises microbiológicas, biomassa microbiana do carbono e nitrogênio, desidrogenase, respiração e coeficiente microbiano, tendo a planta bioindicadora alface crespa (Lucy Brown) como validador do solo. Os resultados foram submetidos ao modelo de PCA para a identificação dos autos vetores e autos valores agrupando e identificando suas colinearidades, regressão linear, validação r-pearson e análise heurística de cluster. Os atributos microbianos e a planta bioindicadora discriminaram as áreas agrícolas avaliadas com atribuição e validação de SQI. O coeficiente metabólico e N da biomassa microbiana apresentaram os maiores valores de covariância pela análise multivariada. A área de reflorestamentocom espécies nativas (SQI0,782%) e o sistema de integração lavoura pecuária (SQI0,765%) foram consideradas as áreas com melhor qualidade de solo.(AU)

Nutrição de ruminantes com uso do feno de capim elefante amonizado / Ruminant nutrition with the uso of hay of elephant grass ammonized

Objetivou-se avaliar as características químicas e nutricionais do feno de capim elefante amonizado com diferentes níveis de ureia (0,0; 0,5; 1,0; 1,5 e 2,0% da matéria seca). O delineamento experimental foi o inteiramente casualizado e a estimativa dos coeficientes de regressão foi feita através do teste T de Student (5% de significância). Os dados também foram submetidos à análise multivariada, utilizando a distância de Gower e o método UPGMA de agrupamento, além disso, foram submetidos à análise de componentes principais. O aumento das doses de ureia não alterou os teores de matéria seca, hemicelulose e material mineral do feno de capim elefante. Houve redução das frações fibrosas com o aumento das doses de ureia, contudo, houve aumento linear dos teores de digestibilidade da matéria seca (DMS), proteína bruta, nutrientes digestíveis totais (NDT) e nitrogênio amoniacal. Observou-se, através da análise multivariada, que os carboidratos não fibrosos, NDT e DMS, foram as variáveis que mais contribuíram com os resultados observados para o tratamento com 2,0% de ureia. Através da análise de Cluster, foi possível visualizar a formação de dois grupos, sendo o primeiro formado pela utilização de2,0% de ureia, que se destacou na composição bromatológica do feno de capim elefante, e o segundo grupo pelas demais doses de ureia, divididos em dois subgrupos. Em conclusão, entre as doses estudadas, recomenda-se a adição de 2,0% de ureia ao capim elefante desidratado, pois altera beneficamente a composição nutricional do feno de capim elefante, principalmente os componentes da fração fibrosa.

The objective of this study was to evaluate the chemical and nutritional characteristics of ammonized elephant grass hay with different levels of urea (0.0, 0.5, 1.0, 1.5 e 2.0% of dry matter). The experimental design was completely randomized and the regression coefficients were estimated using the Student's T test (5% significance).The data were also submitted to multivariate analysis using the Gower distance and the UPGMA method of grouping, in addition, they were subjected to principal component analysis. There was a reduction in fibrous fractions with an increase in urea doses, however, there was a linear increase in the contents of digestibility of drymatter (DDM), crude protein, total digestible nutrients (TDN) and ammoniacal nitrogen. It was observed through multivariate analysis that non-fibrous carbohydrates, TDN and DDM were the variables that most contributed to the results observed for the treatment with 2.0% urea. Through the Cluster analysis it was possible to visualize the formation of two groups, the first formed by the use of 2.0% urea, which stood out in the bromatological composition of elephant grass hay and the second group by the other doses of urea, divided into two subgroups. Thus, it is possible to conclude that among the studied doses, the addition of 2.0% urea to the dehydrated elephant grass is recommended, as it beneficially alters the nutritional composition of elephant grass hay, mainly the components of the fibrous fraction.

Nutrição de ruminantes com uso do feno de capim elefante amonizado / Ruminant nutrition with the uso of hay of elephant grass ammonized

Objetivou-se avaliar as características químicas e nutricionais do feno de capim elefante amonizado com diferentes níveis de ureia (0,0; 0,5; 1,0; 1,5 e 2,0% da matéria seca). O delineamento experimental foi o inteiramente casualizado e a estimativa dos coeficientes de regressão foi feita através do teste T de Student (5% de significância). Os dados também foram submetidos à análise multivariada, utilizando a distância de Gower e o método UPGMA de agrupamento, além disso, foram submetidos à análise de componentes principais. O aumento das doses de ureia não alterou os teores de matéria seca, hemicelulose e material mineral do feno de capim elefante. Houve redução das frações fibrosas com o aumento das doses de ureia, contudo, houve aumento linear dos teores de digestibilidade da matéria seca (DMS), proteína bruta, nutrientes digestíveis totais (NDT) e nitrogênio amoniacal. Observou-se, através da análise multivariada, que os carboidratos não fibrosos, NDT e DMS, foram as variáveis que mais contribuíram com os resultados observados para o tratamento com 2,0% de ureia. Através da análise de Cluster, foi possível visualizar a formação de dois grupos, sendo o primeiro formado pela utilização de2,0% de ureia, que se destacou na composição bromatológica do feno de capim elefante, e o segundo grupo pelas demais doses de ureia, divididos em dois subgrupos. Em conclusão, entre as doses estudadas, recomenda-se a adição de 2,0% de ureia ao capim elefante desidratado, pois altera beneficamente a composição nutricional do feno de capim elefante, principalmente os componentes da fração fibrosa.(AU)

The objective of this study was to evaluate the chemical and nutritional characteristics of ammonized elephant grass hay with different levels of urea (0.0, 0.5, 1.0, 1.5 e 2.0% of dry matter). The experimental design was completely randomized and the regression coefficients were estimated using the Student's T test (5% significance).The data were also submitted to multivariate analysis using the Gower distance and the UPGMA method of grouping, in addition, they were subjected to principal component analysis. There was a reduction in fibrous fractions with an increase in urea doses, however, there was a linear increase in the contents of digestibility of drymatter (DDM), crude protein, total digestible nutrients (TDN) and ammoniacal nitrogen. It was observed through multivariate analysis that non-fibrous carbohydrates, TDN and DDM were the variables that most contributed to the results observed for the treatment with 2.0% urea. Through the Cluster analysis it was possible to visualize the formation of two groups, the first formed by the use of 2.0% urea, which stood out in the bromatological composition of elephant grass hay and the second group by the other doses of urea, divided into two subgroups. Thus, it is possible to conclude that among the studied doses, the addition of 2.0% urea to the dehydrated elephant grass is recommended, as it beneficially alters the nutritional composition of elephant grass hay, mainly the components of the fibrous fraction.(AU)

Blood typing and haematological analysis of domestic feline donors / Tipagem sanguínea e análise hematológica de felinos domésticos doadores de sangue

Blood typing is critical to avoid adverse reactions to transfusions. Felines have three blood-types: A, B, and AB and have natural alloantibodies the opposite blood type, in addition to the Mik type described recently. The presence of alloantibodies is important in the selection of blood donors in order to minimize the occurrence of transfusion reactions, and blood typing is essential in this context. This study aimed to identify blood types and perform a haematological analysis of feline blood donor candidates. Sixty clinically healthy felines of different races, weighing more than four kilograms, and ranging from one to eight years old, were evaluated. After clinical evaluation, blood samples were collected for hemogram and blood typing with the LabTest A+B® immunochromatographic test. All cats had a haematocrit level within normal range (mean: 34.12%), six (10%) presented with leucocytosis and 24 (40%) with thrombocytopenia, reinforcing the importance of haematological monitoring of blood donor animals. Regarding blood typing, all domestic felines selected as blood donors had type A blood. This is the first study on frequencies of feline blood types performed in the region.(AU)

A tipagem sanguínea é fundamental para evitar reações adversas a transfusões. Os felinos possuem três tipos sanguíneos, A, B e AB, onde o felino apresenta a presença de aloanticorpos naturais contra o tipo sanguíneo que não possui, além do tipo Mik descrito recentemente. A presença de aloanticorpos é importante no que se refere à seleção de doadores de sangue com vista a minimizar ocorrência de reações transfusionais, sendo, primordial a realização de tipagem sanguínea nesta espécie. O estudo objetivou identificar os tipos sanguíneos e a análise hematológica de felinos candidatos doadores de sangue. Foram avaliados 60 felinos, de diferentes raças, peso superior a quatro quilogramas, faixa etária de um a oito anos e clinicamente saudáveis. Após avaliação clínica amostras sanguíneas foram coletadas para hemograma e tipagem sanguínea com o teste imunocromatográfico LabTest A+B®. Todos os felinos apresentaram nível de hematócrito dentro da normalidade (média 34,12%), seis (10%) apresentaram leucocitose e 24 (40%) trombocitopenia, reforçando a importância de acompanhamento hematológico de animais doadores de sangue. Quanto à tipagem sanguínea, todos os felinos domésticos selecionados como doadores de sangue apresentaram tipo sanguíneo A, sendo este o primeiro estudo sobre as frequências dos tipos sanguíneos felino realizado na região.(AU)

Blood typing in positive DEA 1 dogs: comparative analysis between immunochromatography, hemagglutination and flow cytometry / Tipificação sanguínea em cães AEC 1 positivo: análise comparativa entre a imunocromatografia, hemoaglutinação e citometria de fluxo

Blood typing techniques have been improved to ensure greater safety for transfusion procedures. Typification for the DEA 1 antigen through flow cytometry should offer more reliability to routine immunohematology in donor and recipient dogs. Currently, the DEA 1 group is starting to be an autosomal dominant allelic system with the DEA 1 negative type and its variations of positivity. The present study investigated the DEA 1 antigen using the techniques of immunochromatography, hemagglutination and flow cytometry. Among the positive animals for the DEA 1 group, typified by flow cytometry, medium intensities of fluorescence were found, which are indicative of weak, moderate and strong antigenicity. This enabled the division of the DEA 1 group into weak positive, moderate positive and strong positive. The blood typing techniques for the DEA 1 group by flow cytometry, agglutination and immunochromatography had positive (Spearman r=0.70) and statistically significant (p>0.0001) correlations.(AU)

As técnicas de tipificação sanguínea vêm sendo aperfeiçoadas para garantir maior segurança aos procedimentos transfusionais. A tipificação para o antígeno AEC 1 com o emprego da citometria de fluxo poderá oferecer mais confiabilidade à rotina da imunohematologia em cães doadores e receptores. Na atualidade, o grupo AEC 1 passou a ser denominado como um sistema alélico autossômico dominante com o tipo AEC 1 negativo e suas variações de positividade. O presente trabalho comparou os resultados de três técnicas utilizadas para a pesquisa do antígeno AEC 1: cromatografia; hemoaglutinação e citometria de fluxo. Dentro dos indivíduos positivos para o grupo AEC 1, tipificados pela citometria de fluxo, foram encontradas intensidades médias de fluorescência indicadoras de antigenicidade fraca, moderada e forte, podendo-se dividir o grupo AEC 1 em positivo fraco, positivo moderado e positivo forte. As técnicas de tipificação sanguínea para o grupo AEC 1 por cromatografia, hemoaglutinação e citometria de fluxo apresentaram correlação positiva (Spearman r=0,70) e estatisticamente significativa (p<0,0001).(AU)

Blood typing in positive DEA 1 dogs: comparative analysis between immunochromatography, hemagglutination and flow cytometry / Tipificação sanguínea em cães AEC 1 positivo: análise comparativa entre a imunocromatografia, hemoaglutinação e citometria de fluxo

Blood typing techniques have been improved to ensure greater safety for transfusion procedures. Typification for the DEA 1 antigen through flow cytometry should offer more reliability to routine immunohematology in donor and recipient dogs. Currently, the DEA 1 group is starting to be an autosomal dominant allelic system with the DEA 1 negative type and its variations of positivity. The present study investigated the DEA 1 antigen using the techniques of immunochromatography, hemagglutination and flow cytometry. Among the positive animals for the DEA 1 group, typified by flow cytometry, medium intensities of fluorescence were found, which are indicative of weak, moderate and strong antigenicity. This enabled the division of the DEA 1 group into weak positive, moderate positive and strong positive. The blood typing techniques for the DEA 1 group by flow cytometry, agglutination and immunochromatography had positive (Spearman r=0.70) and statistically significant (p>0.0001) correlations.(AU)

As técnicas de tipificação sanguínea vêm sendo aperfeiçoadas para garantir maior segurança aos procedimentos transfusionais. A tipificação para o antígeno AEC 1 com o emprego da citometria de fluxo poderá oferecer mais confiabilidade à rotina da imunohematologia em cães doadores e receptores. Na atualidade, o grupo AEC 1 passou a ser denominado como um sistema alélico autossômico dominante com o tipo AEC 1 negativo e suas variações de positividade. O presente trabalho comparou os resultados de três técnicas utilizadas para a pesquisa do antígeno AEC 1: cromatografia; hemoaglutinação e citometria de fluxo. Dentro dos indivíduos positivos para o grupo AEC 1, tipificados pela citometria de fluxo, foram encontradas intensidades médias de fluorescência indicadoras de antigenicidade fraca, moderada e forte, podendo-se dividir o grupo AEC 1 em positivo fraco, positivo moderado e positivo forte. As técnicas de tipificação sanguínea para o grupo AEC 1 por cromatografia, hemoaglutinação e citometria de fluxo apresentaram correlação positiva (Spearman r=0,70) e estatisticamente significativa (p<0,0001).(AU)

Marcadores moleculares e descritores morfo-agronômicos na avaliação da diversidade genética de bucha (Luffa cylindrica) / Molecular markers and morpho-agronomic descriptors in the assessment genetic diversity of bucha (Luffa cylindrica)

O estudo da diversidade de Luffa cylindrica pode permitir triagens específicas para diferentes aplicações, visando uso e o melhoramento da espécie. Dados moleculares e de trinta descritores morfo-agronômicos foram utilizados em análises multivariadas na caracterização de 24 acessos de bucha provenientes de sete Estados brasileiros. Os resultados obtidos demonstraram que os acessos em estudo possuem ampla variabilidade potencial para todos os caracteres morfo-agronômicos analisados. Os caracteres que mais contribuíram para a divergência entre os acessos foram o comprimento dos frutos (62,32%) e a circunferência apical dos frutos (19,70%). Marcadores AFLP foram eficientes em agrupar os acessos de bucha provenientes de diferentes regiões brasileiras e apresentaram 66,8% de polimorfismo. O agrupamento obtido a partir da análise conjunta dos dados moleculares e morfo-agronômicos separou os acessos em quatro grupos e foi concordante com a análise bayesiana de agrupamento na separação dos acessos coletados no Norte com aqueles prospectados nas demais regiões brasileiras.

The study of the diversity of Luffa cylindrica may allow specific screening for different applications, aiming at the use and improvement of the species. Molecular data and thirty morpho-agronomic descriptors were used in multivariate analyzes to characterize 24 bushing accessions from seven Brazilian states. The results showed that the accessions under study have a wide potential variability for all the morpho-agronomic characters analyzed. The characters that most contributed to the divergence between the accessions were the fruit length (62.32%) and the apical circumference of the fruits (19.70%). AFLP markers were efficient in grouping the bushing access from different Brazilian regions and showed 66.8% of polymorphism. The clustering obtained from the joint analysis of molecular and morpho-agronomic data separated the accessions into four groups and was consistent with the Bayesian cluster analysis in the separation of accessions collected in the North with those prospected in the other Brazilian regions.