Variations in heterochromatin content reveal important polymorphisms for studies of genetic improvement in garlic (Allium sativum L.)

Abstract Allium sativum L. is an herb of the Alliaceae family with a specific taste and aroma and medicinal and nutraceutical properties that are widely marketed in several countries. Brazil is one of the largest importers of garlic in the world, despite of its production is restricted and limited to internal consumption. Thus, explore the genetic diversity of commercial garlic conserved at germplasm banks is essential to generate additional genetic information about its economically important crop. A suitable tool for this purpose is the cytogenetic characterisation of these accessions. This study aimed to characterise the cytogenetic diversity among seven accessions of garlic from a Germplasm Bank in Brazil. The karyotypes were obtained by conventional staining and with chromomycin A3 (CMA) and 4,6-diamidino-2-phenylindole (DAPI) fluorochromes. All accessions analysed showed chromosome number 2n = 16, karyotype formula 6M+2SM, symmetrical karyotypes, reticulate interphase nuclei, and chromosomes with uniform chromatin condensation from prophase to metaphase. The fluorochromes staining showed differences in the amount and distribution of heterochromatin along the chromosomes and between accessions studied. Based on the distribution pattern of these small polymorphisms, it was possible to separate the seven accessions into three groups. It was also possible to differentiate some of the accessions individually. One of the results obtained showed a heteromorphic distension of the nucleolar organiser region observed on the chromosome pairs 6 or 7 with peculiar characteristics. It was suggested for example, that the heteromorphic block of heterochromatin (CMA+++/DAPI-) on chromosome 6 of the Branco Mineiro Piauí accession can be used as a marker to identify this genotype or may be associated with some character of economic interest.

Resumo Allium sativum L. é uma erva da família Alliaceae com sabor e aroma específicos e propriedades medicinais e nutracêuticas amplamente comercializada em diversos países. O Brasil é um dos maiores importadores de alho do mundo, apesar da sua produção ser restrita e limitada ao consumo interno. Assim, explorar a diversidade genética do alho comercial conservado em bancos de germoplasma é essencial para fornecer informações genéticas adicionais acerca dessa cultura economicamente importante. Uma ferramenta adequada para esse fim é a caracterização citogenética desses acessos. Este estudo teve como objetivo caracterizar a diversidade citogenética entre sete acessos de alho de um Banco de Germoplasma no Brasil. Os cariótipos foram obtidos por coloração convencional e com os fluorocromos de cromomicina A3 (CMA) e 4,6-diamidino-2-fenilindol (DAPI). Todos os acessos analisados apresentaram número cromossômico 2n = 16, fórmula cariotípica 6M + 2SM, cariótipos simétricos, núcleos reticulados em intérfase e cromossomos com condensação uniforme da cromatina da prófase para a metáfase. A coloração com fluorocromos mostrou diferenças na quantidade e distribuição de heterocromatina ao longo dos cromossomos e entre os acessos estudados. Com base no padrão de distribuição desses pequenos polimorfismos, foi possível separar os sete acessos em três grupos. Também foi possível diferenciar individualmente alguns dos acessos. Um dos resultados obtidos mostrou distensão heteromórfica da região organizadora nucleolar observada nos pares dos cromossomos 6 ou 7 com características peculiares. Foi sugerido, por exemplo, que o bloco heteromórfico de heterocromatina (CMA +++ / DAPI-) no cromossomo 6 do acesso Branco Mineiro Piauí pode ser usado como um marcador para identificar esse genótipo ou pode estar associado a algum caráter de interesse econômico.

Diagnosis of transmissible venereal tumors in bitches - platelet indices are a remarkable marker?

Background: Hematological analyses are seen as more preferred laboratory analyses in canine transmissible venereal tumor studies. There is no information about the availability of platelets and their indices in routine practice in canine transmissible venereal tumor cases. Taking this as a starting point, this study analyzed the usefulness of platelet indices in dogs with transmissible venereal tumor in clinical laboratory diagnosis as well as examined the relationship between white blood cells, red blood cells, platelets (PLT), main platelet volume (MPV), platelet distribution width (PDW), plateletcrit (PCT), and the ratio of main platelet volume to platelets (MPV/PLT). Materials, Methods & Results: In the study, a total of 42 bitches of various breeds were used. Nineteen healthy bitches were used as a control group, and the others 23 with cTVT as a study group. Metastasis was not observed in any of the bitches involved in the study. History, clinical findings, and cytological examinations were evaluated for the diagnosis of cTVT. In animals with hemorrhagic discharge and neoplastic lesions, a vaginal cytological examination was performed. Typical TVT cells with large nuclei and intracytoplasmic vacuoles were observed in the vaginal cytological examinations, and the diagnosis of TVT was made. Healthy bitches (19) and those with TVT (23) were 39.16 5.37 months and 47.61 5.14 months old, respectively. From all animals, 2 mL blood samples were collected from V. cephalica to evaluate PIs in the complete blood count (CBC). Collected blood samples were analyzed using an automated hematology analyzer. As a result of the analysis, WBC, RBC, HGB, HCT, MCV, MCHC, RDW, PLT, MPV, PDW, PCT, and MPV/PLT data were obtained. Mild leukocytosis, an increase in PLT, and a decrease in MCV and MPV/PLT were determined in the study group compared to the control group. Cut-off values in CBC of bitches with TVT were determined as WBC: 13.35 (sensitivity: 78%; specificity: 90%); MCV: 67 (sensitivity: 57%; specificity: 95%); PLT: 315.50 (sensitivity: 65%; specificity: 74%); and MPV/PLT: 0.028 (sensitivity: 78%; specificity: 58%). In CBC analyses, a strong negative correlation between PLT and MPV/PLT was detected in both groups. Discussion: Canine transmissible venereal tumors are common in both stray and pet dogs. It is naturally transferred from animal to animal during mating by live tumor cells. This tumor can commonly affect the external genitalia and internal organs in some cases. It generally has the look of cauliflower, and its surface is ulcerated, inflammatory, hemorrhagic, and infectious. More preferred laboratory analyses are complete blood count and blood chemistry analysis in cTVT for to evaluate the success of treatments. Platelet indices have been investigated in many diseases such as endotoxemia, chronic enteropathy, mammary tumor, parvoviral enteritis, septic peritonitis, lymphoma, pyometra, visceral leishmaniasis, and babesiosis in dogs. There is no information available for either diagnostic or prognostic use of the PIs in canine TVT cases. Ultimately, in light of the presented study's results, platelet indices, especially PLT and the MPV/PLT ratio, seem to be notable laboratory markers in terms of easy accessibility and low-cost assessment techniques in canine transmissible venereal tumor cases. New data, however, should be established by a thorough follow-up study using a larger sample size and addressing its usefulness as a diagnostic or prognostic marker in canine transmissible venereal tumors.

Variations in heterochromatin content reveal important polymorphisms for studies of genetic improvement in garlic (Allium sativum L. ) / Conteúdo de heterocromatina revela polimorfismos importantes para o melhoramento genético do alho (Allium sativum L. )

Abstract Allium sativum L. is an herb of the Alliaceae family with a specific taste and aroma and medicinal and nutraceutical properties that are widely marketed in several countries. Brazil is one of the largest importers of garlic in the world, despite of its production is restricted and limited to internal consumption. Thus, explore the genetic diversity of commercial garlic conserved at germplasm banks is essential to generate additional genetic information about its economically important crop. A suitable tool for this purpose is the cytogenetic characterisation of these accessions. This study aimed to characterise the cytogenetic diversity among seven accessions of garlic from a Germplasm Bank in Brazil. The karyotypes were obtained by conventional staining and with chromomycin A3 (CMA) and 4,6-diamidino-2-phenylindole (DAPI) fluorochromes. All accessions analysed showed chromosome number 2n = 16, karyotype formula 6M+2SM, symmetrical karyotypes, reticulate interphase nuclei, and chromosomes with uniform chromatin condensation from prophase to metaphase. The fluorochromes staining showed differences in the amount and distribution of heterochromatin along the chromosomes and between accessions studied. Based on the distribution pattern of these small polymorphisms, it was possible to separate the seven accessions into three groups. It was also possible to differentiate some of the accessions individually. One of the results obtained showed a heteromorphic distension of the nucleolar organiser region observed on the chromosome pairs 6 or 7 with peculiar characteristics. It was suggested for example, that the heteromorphic block of heterochromatin (CMA+++/DAPI-) on chromosome 6 of the "Branco Mineiro Piauí" accession can be used as a marker to identify this genotype or may be associated with some character of economic interest.

Resumo Allium sativum L. é uma erva da família Alliaceae com sabor e aroma específicos e propriedades medicinais e nutracêuticas amplamente comercializada em diversos países. O Brasil é um dos maiores importadores de alho do mundo, apesar da sua produção ser restrita e limitada ao consumo interno. Assim, explorar a diversidade genética do alho comercial conservado em bancos de germoplasma é essencial para fornecer informações genéticas adicionais acerca dessa cultura economicamente importante. Uma ferramenta adequada para esse fim é a caracterização citogenética desses acessos. Este estudo teve como objetivo caracterizar a diversidade citogenética entre sete acessos de alho de um Banco de Germoplasma no Brasil. Os cariótipos foram obtidos por coloração convencional e com os fluorocromos de cromomicina A3 (CMA) e 4,6-diamidino-2-fenilindol (DAPI). Todos os acessos analisados ​​apresentaram número cromossômico 2n = 16, fórmula cariotípica 6M + 2SM, cariótipos simétricos, núcleos reticulados em intérfase e cromossomos com condensação uniforme da cromatina da prófase para a metáfase. A coloração com fluorocromos mostrou diferenças na quantidade e distribuição de heterocromatina ao longo dos cromossomos e entre os acessos estudados. Com base no padrão de distribuição desses pequenos polimorfismos, foi possível separar os sete acessos em três grupos. Também foi possível diferenciar individualmente alguns dos acessos. Um dos resultados obtidos mostrou distensão heteromórfica da região organizadora nucleolar observada nos pares dos cromossomos 6 ou 7 com características peculiares. Foi sugerido, por exemplo, que o bloco heteromórfico de heterocromatina (CMA +++ / DAPI-) no cromossomo 6 do acesso "Branco Mineiro Piauí" pode ser usado como um marcador para identificar esse genótipo ou pode estar associado a algum caráter de interesse econômico.

Variations in heterochromatin content reveal important polymorphisms for studies of genetic improvement in garlic (Allium sativum L) / Conteúdo de heterocromatina revela polimorfismos importantes para o melhoramento genético do alho (Allium sativum L)

Allium sativum L. is an herb of the Alliaceae family with a specific taste and aroma and medicinal and nutraceutical properties that are widely marketed in several countries. Brazil is one of the largest importers of garlic in the world, despite of its production is restricted and limited to internal consumption. Thus, explore the genetic diversity of commercial garlic conserved at germplasm banks is essential to generate additional genetic information about its economically important crop. A suitable tool for this purpose is the cytogenetic characterisation of these accessions. This study aimed to characterise the cytogenetic diversity among seven accessions of garlic from a Germplasm Bank in Brazil. The karyotypes were obtained by conventional staining and with chromomycin A3 (CMA) and 4,6-diamidino-2-phenylindole (DAPI) fluorochromes. All accessions analysed showed chromosome number 2n= 16, karyotype formula 6M+2SM, symmetrical karyotypes, reticulate interphase nuclei, and chromosomes with uniform chromatin condensation from prophase to metaphase. The fluorochromes staining showed differences in the amount and distribution of heterochromatin along the chromosomes and between accessions studied. Based on the distribution pattern of these small polymorphisms, it was possible to separate the seven accessions into three groups. It was also possible to differentiate some of the accessions individually. One of the results obtained showed a heteromorphic distension of the nucleolar organiser region observed on the chromosome pairs 6 or 7 with peculiar characteristics. It was suggested for example, that the heteromorphic block of heterochromatin (CMA+++/DAPI-) on chromosome 6 of the "Branco Mineiro Piauí" accession can be used as a marker to identify this genotype or may be associated with some character of economic interest.

Allium sativum L. é uma erva da família Alliaceae com sabor e aroma específicos e propriedades medicinais e nutracêuticas amplamente comercializada em diversos países. O Brasil é um dos maiores importadores de alho do mundo, apesar da sua produção ser restrita e limitada ao consumo interno. Assim, explorar a diversidade genética do alho comercial conservado em bancos de germoplasma é essencial para fornecer informações genéticas adicionais acerca dessa cultura economicamente importante. Uma ferramenta adequada para esse fim é a caracterização citogenética desses acessos. Este estudo teve como objetivo caracterizar a diversidade citogenética entre sete acessos de alho de um Banco de Germoplasma no Brasil. Os cariótipos foram obtidos por coloração convencional e com os fluorocromos de cromomicina A3 (CMA) e 4,6-diamidino-2-fenilindol (DAPI). Todos os acessos analisados apresentaram número cromossômico 2n = 16, fórmula cariotípica 6M + 2SM, cariótipos simétricos, núcleos reticulados em intérfase e cromossomos com condensação uniforme da cromatina da prófase para a metáfase. A coloração com fluorocromos mostrou diferenças na quantidade e distribuição de heterocromatina ao longo dos cromossomos e entre os acessos estudados. Com base no padrão de distribuição desses pequenos polimorfismos, foi possível separar os sete acessos em três grupos. Também foi possível diferenciar individualmente alguns dos acessos. Um dos resultados obtidos mostrou distensão heteromórfica da região organizadora nucleolar observada nos pares dos cromossomos 6 ou 7 com características peculiares. Foi sugerido, por exemplo, que o bloco heteromórfico de heterocromatina (CMA +++ / DAPI-) no cromossomo 6 do acesso “Branco Mineiro Piauí” pode ser usado como um marcador para identificar esse genótipo ou pode estar associado a algum caráter de interesse econômico.

Variations in heterochromatin content reveal important polymorphisms for studies of genetic improvement in garlic (Allium sativum L) / Conteúdo de heterocromatina revela polimorfismos importantes para o melhoramento genético do alho (Allium sativum L)

Allium sativum L. is an herb of the Alliaceae family with a specific taste and aroma and medicinal and nutraceutical properties that are widely marketed in several countries. Brazil is one of the largest importers of garlic in the world, despite of its production is restricted and limited to internal consumption. Thus, explore the genetic diversity of commercial garlic conserved at germplasm banks is essential to generate additional genetic information about its economically important crop. A suitable tool for this purpose is the cytogenetic characterisation of these accessions. This study aimed to characterise the cytogenetic diversity among seven accessions of garlic from a Germplasm Bank in Brazil. The karyotypes were obtained by conventional staining and with chromomycin A3 (CMA) and 4,6-diamidino-2-phenylindole (DAPI) fluorochromes. All accessions analysed showed chromosome number 2n= 16, karyotype formula 6M+2SM, symmetrical karyotypes, reticulate interphase nuclei, and chromosomes with uniform chromatin condensation from prophase to metaphase. The fluorochromes staining showed differences in the amount and distribution of heterochromatin along the chromosomes and between accessions studied. Based on the distribution pattern of these small polymorphisms, it was possible to separate the seven accessions into three groups. It was also possible to differentiate some of the accessions individually. One of the results obtained showed a heteromorphic distension of the nucleolar organiser region observed on the chromosome pairs 6 or 7 with peculiar characteristics. It was suggested for example, that the heteromorphic block of heterochromatin (CMA+++/DAPI-) on chromosome 6 of the "Branco Mineiro Piauí" accession can be used as a marker to identify this genotype or may be associated with some character of economic interest.(AU)

Allium sativum L. é uma erva da família Alliaceae com sabor e aroma específicos e propriedades medicinais e nutracêuticas amplamente comercializada em diversos países. O Brasil é um dos maiores importadores de alho do mundo, apesar da sua produção ser restrita e limitada ao consumo interno. Assim, explorar a diversidade genética do alho comercial conservado em bancos de germoplasma é essencial para fornecer informações genéticas adicionais acerca dessa cultura economicamente importante. Uma ferramenta adequada para esse fim é a caracterização citogenética desses acessos. Este estudo teve como objetivo caracterizar a diversidade citogenética entre sete acessos de alho de um Banco de Germoplasma no Brasil. Os cariótipos foram obtidos por coloração convencional e com os fluorocromos de cromomicina A3 (CMA) e 4,6-diamidino-2-fenilindol (DAPI). Todos os acessos analisados apresentaram número cromossômico 2n = 16, fórmula cariotípica 6M + 2SM, cariótipos simétricos, núcleos reticulados em intérfase e cromossomos com condensação uniforme da cromatina da prófase para a metáfase. A coloração com fluorocromos mostrou diferenças na quantidade e distribuição de heterocromatina ao longo dos cromossomos e entre os acessos estudados. Com base no padrão de distribuição desses pequenos polimorfismos, foi possível separar os sete acessos em três grupos. Também foi possível diferenciar individualmente alguns dos acessos. Um dos resultados obtidos mostrou distensão heteromórfica da região organizadora nucleolar observada nos pares dos cromossomos 6 ou 7 com características peculiares. Foi sugerido, por exemplo, que o bloco heteromórfico de heterocromatina (CMA +++ / DAPI-) no cromossomo 6 do acesso “Branco Mineiro Piauí” pode ser usado como um marcador para identificar esse genótipo ou pode estar associado a algum caráter de interesse econômico.(AU)

Supering Apis mellifera (Hymenoptera, Apidae) beehives impairs honey production and biomarker genes

For honey production, beekeepers add one or more supers to the hives to allow honeybees to store their products. However, the increase in hive space can affect the social and health organization in the colony, promoting stress. This study assessed the management of honey production, physicochemical honey properties, population development, and forages immune system gene expression patterns to be used as biomarker for monitoring beekeeping welfare. The treatments comprised 40 beehives divided in four treatments. Treatment 1 - control, supers added according to storage necessity. Treatments 2, 3, and 4 presented two, three, and four supers at the beginning of the experiment, respectively. T1 presented greater honey production (39.4 % increased). No difference in open brood area in the colonies was observed and honey properties and only T2 showed closed brood area higher than the other treatments. Foragers from T4 showed higher catalase and defensin gene expression at the middle-end experiment. Thus, the increasing internal space at the beginning of honey season can affect honey production and immune system of foragers. Catalase and defensin can be used as biomarkers for monitoring honey production welfare.

TGF-ß1 and CD68 immunoexpression in capsules formed by textured implants with and without mesh coverage: a study on female rats

Purpose: To evaluate fibrosis formation and number of macrophages in capsules formed around textured implants without and with mesh coverage. Methods: Fibrosis was analyzed through transforming growth factor-beta 1 (TGF-ß1) immunomarker expression and the number of macrophages through CD68 percentage of cells in magnified field. Sixty female Wistar rats were distributed into two groups of 30 rats (unmeshed and meshed). Each group was then subdivided into two subgroups for postoperative evaluation after 30 and 90 days. The p value was adjusted by Bonferroni lower than 0.012. Results: No difference was observed in fibrosis between meshed and unmeshed groups (30 days p = 0.436; 90 days p = 0.079) and from 30 to 90 days in the unmeshed group (p = 0.426). The meshed group showed higher fibrosis on the 90th day (p = 0.001). The number of macrophages was similar between groups without and with mesh coverage (30 days p = 0.218; 90 days p = 0.044), and similar between subgroups 30 and 90 days (unmeshed p = 0.085; meshed p = 0.059). Conclusions: In the meshed group, fibrosis formation was higher at 90 days and the mesh-covered implants produced capsules similar to microtextured ones when analyzing macrophages. Due to these characteristics, mesh coating did not seem to significantly affect the local fibrosis formation.

Digestibility of diets with passion fruit by-product estimated through external and internal markers in dairy heifers

This study examined the influence of the external markers chromium oxide (CO), titanium dioxide (TD), isolated, purified and enriched lignin (LIPE®) and isolated, purified, enriched lignin in nanoparticles (NANOLIPE®) as well as the internal markers indigestible dry matter (iDM), indigestible neutral detergent fiber (iNDF) and indigestible acid detergent fiber (iADF) in diets with inclusion of passion fruit by-product for dairy heifers on the estimation of fecal output and nutrient digestibility. Sixteen Holstein × Zebu crossbred heifers at an average live weight of 363 ± 28 kg were randomly distributed in a completely randomized design where they received diets in which Tifton 85 (Cynodon sp.) hay was replaced with passion fruit by-product (0, 12, 24 and 36%, as-fed basis). The CO, LIPE®, NANOLIPE® and iNDF markers did not differ from the total collection method (p > 0.05) in the estimation of fecal output and nutrient digestibility. The TD and iDM markers overestimated, while iADF underestimated fecal output. Under the presented conditions, we recommend using the CO, LIPE®, NANOLIPE® and iNDF markers to estimate fecal output and nutrient digestibility in diets with inclusion of passion fruit by-product for dairy heifers.(AU)

Digestibility of diets with passion fruit by-product estimated through external and internal markers in dairy heifers

This study examined the influence of the external markers chromium oxide (CO), titanium dioxide (TD), isolated, purified and enriched lignin (LIPE®) and isolated, purified, enriched lignin in nanoparticles (NANOLIPE®) as well as the internal markers indigestible dry matter (iDM), indigestible neutral detergent fiber (iNDF) and indigestible acid detergent fiber (iADF) in diets with inclusion of passion fruit by-product for dairy heifers on the estimation of fecal output and nutrient digestibility. Sixteen Holstein × Zebu crossbred heifers at an average live weight of 363 ± 28 kg were randomly distributed in a completely randomized design where they received diets in which Tifton 85 (Cynodon sp.) hay was replaced with passion fruit by-product (0, 12, 24 and 36%, as-fed basis). The CO, LIPE®, NANOLIPE® and iNDF markers did not differ from the total collection method (p > 0.05) in the estimation of fecal output and nutrient digestibility. The TD and iDM markers overestimated, while iADF underestimated fecal output. Under the presented conditions, we recommend using the CO, LIPE®, NANOLIPE® and iNDF markers to estimate fecal output and nutrient digestibility in diets with inclusion of passion fruit by-product for dairy heifers.

Sequence analysis of the internal transcribed spacer 2 (ITS2) region of rDNA for identifying Trichogramma species and evaluating genetic diversity / Análise de sequência do rDNA da região espaçadora do transcrito interno 2 (ITS2) para identificar espécies de Trichogramma e avaliar a diversidade genética

Species of Trichogramma Westwood, 1833 (Hymenoptera: Trichogrammtidae) are frequently used as biological control agents against Lepidoptera, but practical application of these egg endoparasitoids are complicated because of their complex taxonomy. This study aimed to compare sequences of internal transcribed spacer regions of ribosomal DNA (ITS2-rDNA) of Trichogramma accessions with those deposited in GenBank in order to access the reliability of the ITS2 as a barcode for discriminating species and evaluating the genetic diversity. ITS2-rDNA sequences obtained from seventeen specimens of Trichogramma confirmed previous identifications based on morphological characteristics. Multiple sequence alignment revealed the existence of highly conserved regions in ITS2 sequences while the neighbour-joining dendrogram indicated that the specimens formed three clusters comprising T. manicobai and T. marandobai (group I), T. galloi (group II) and T. pretiosum (group III). The ITS2 marker was shown to be a powerful DNA barcode for discriminating Trichogramma species and could be used to complement the morphological approach.(AU)

Espécies de Trichogramma Westwood, 1833 (Hymenoptera: Trichogrammatidae) são freqüentemente usadas como agentes de controle biológico contra Lepidoptera, esses endoparasitóides de ovos apresentam taxonomia complexa, o que dificulta sua aplicação prática. Este estudo teve como objetivo comparar seqüências de regiões espaçadoras internas transcritas de DNA ribossômico (ITS2-rDNA) de acessos de Trichogramma com aquelas depositadas no GenBank, a fim de avaliar a confiabilidade do ITS2 barcode para discriminar espécies e avaliar a diversidade genética. As seqüências de ITS2-rDNA obtidas de dezessete espécimes de Trichogramma confirmaram identidades anteriores com base em características morfológicas. O alinhamento de múltiplas sequências revelou a existência de regiões altamente conservadas nas sequências ITS2, enquanto o dendrograma indicou que os espécimes formavam três grupos compreendendo T. manicobai e T. marandobai (grupo I), T. galloi (grupo II) e T. pretiosum (grupo III). O marcador ITS2 mostrou ser um poderoso DNA barcode para discriminar espécies de Trichogramma podendo ser usado como complemento da abordagem morfológica.(AU)

Acute phase protein response and clinical application in Veterinary Medicine / Resposta das proteínas de fase aguda e sua aplicação clínica em Medicina Veterinária

Acute phase proteins (APP) are the group of blood proteins that the synthesis happens in a quick and intense manner in response to external or internal challenges, such as infection, inflammation, surgical trauma or stress. These proteins have been used as biomarkers of inflammation, infection and trauma in human medicine, but have been relatively under-utilised in the context of veterinary medicine due to the unknown diagnostic possibilities. The purpose of this paper is to update the knowledge about APPs in veterinary medicine, reviewing results from different studies suggesting possible clinical applicability of APP measurement as a valuable tool for veterinary diagnostic and prognostic.

As proteínas da fase aguda (PFA) são um grupo de proteínas presentes no sangue, as quais a síntese ocorre de forma rápida e intensamente em resposta a desafios externos ou internos, como infecção, inflamação, trauma cirúrgico ou estresse. Essas proteínas têm sido usadas como biomarcadores de inflamação, infecção e trauma na medicina humana, mas tem sido relativamente subutilizadas no contexto da medicina veterinária devido às possibilidades de diagnóstico desconhecidas. O objetivo deste artigo é atualizar o conhecimento sobre PFAs em medicina veterinária, revisando resultados de diferentes estudos que sugerem uma possível aplicabilidade clínica da mensuração de PFAs como uma valiosa ferramenta para o diagnóstico e prognóstico veterinário.

Acute phase protein response and clinical application in Veterinary Medicine / Resposta das proteínas de fase aguda e sua aplicação clínica em Medicina Veterinária

Acute phase proteins (APP) are the group of blood proteins that the synthesis happens in a quick and intense manner in response to external or internal challenges, such as infection, inflammation, surgical trauma or stress. These proteins have been used as biomarkers of inflammation, infection and trauma in human medicine, but have been relatively under-utilised in the context of veterinary medicine due to the unknown diagnostic possibilities. The purpose of this paper is to update the knowledge about APPs in veterinary medicine, reviewing results from different studies suggesting possible clinical applicability of APP measurement as a valuable tool for veterinary diagnostic and prognostic.(AU)

As proteínas da fase aguda (PFA) são um grupo de proteínas presentes no sangue, as quais a síntese ocorre de forma rápida e intensamente em resposta a desafios externos ou internos, como infecção, inflamação, trauma cirúrgico ou estresse. Essas proteínas têm sido usadas como biomarcadores de inflamação, infecção e trauma na medicina humana, mas tem sido relativamente subutilizadas no contexto da medicina veterinária devido às possibilidades de diagnóstico desconhecidas. O objetivo deste artigo é atualizar o conhecimento sobre PFAs em medicina veterinária, revisando resultados de diferentes estudos que sugerem uma possível aplicabilidade clínica da mensuração de PFAs como uma valiosa ferramenta para o diagnóstico e prognóstico veterinário.(AU)

Sequence analysis of the internal transcribed spacer 2 (ITS2) region of rDNA for identifying Trichogramma species and evaluating genetic diversity

Abstract Species of Trichogramma Westwood, 1833 (Hymenoptera: Trichogrammtidae) are frequently used as biological control agents against Lepidoptera, but practical application of these egg endoparasitoids are complicated because of their complex taxonomy. This study aimed to compare sequences of internal transcribed spacer regions of ribosomal DNA (ITS2-rDNA) of Trichogramma accessions with those deposited in GenBank in order to access the reliability of the ITS2 as a barcode for discriminating species and evaluating the genetic diversity. ITS2-rDNA sequences obtained from seventeen specimens of Trichogramma confirmed previous identifications based on morphological characteristics. Multiple sequence alignment revealed the existence of highly conserved regions in ITS2 sequences while the neighbour-joining dendrogram indicated that the specimens formed three clusters comprising T. manicobai and T. marandobai (group I), T. galloi (group II) and T. pretiosum (group III). The ITS2 marker was shown to be a powerful DNA barcode for discriminating Trichogramma species and could be used to complement the morphological approach.

Resumo Espécies de Trichogramma Westwood, 1833 (Hymenoptera: Trichogrammatidae) são freqüentemente usadas como agentes de controle biológico contra Lepidoptera, esses endoparasitóides de ovos apresentam taxonomia complexa, o que dificulta sua aplicação prática. Este estudo teve como objetivo comparar seqüências de regiões espaçadoras internas transcritas de DNA ribossômico (ITS2-rDNA) de acessos de Trichogramma com aquelas depositadas no GenBank, a fim de avaliar a confiabilidade do ITS2 barcode para discriminar espécies e avaliar a diversidade genética. As seqüências de ITS2-rDNA obtidas de dezessete espécimes de Trichogramma confirmaram identidades anteriores com base em características morfológicas. O alinhamento de múltiplas sequências revelou a existência de regiões altamente conservadas nas sequências ITS2, enquanto o dendrograma indicou que os espécimes formavam três grupos compreendendo T. manicobai e T. marandobai (grupo I), T. galloi (grupo II) e T. pretiosum (grupo III). O marcador ITS2 mostrou ser um poderoso DNA barcode para discriminar espécies de Trichogramma podendo ser usado como complemento da abordagem morfológica.

Mastitis in the transition period: identification of potential blood markers / Mastite no período de transição: identificação de potenciais marcadores no sangue

This study identified potential blood markers associated with mastitis in dairy cows under different dry therapies during the transition period, using a logistic regression model. Thirty-four Holstein dairy cows were divided into three groups: untreated controls (13 cows, 42 quarters); animals that received an antimicrobial at drying-off (10 cows, 40 quarters); and animals that were administered an internal teat sealant at drying-off (11 cow, 44 quarters). Blood and quarter milk samples were collected 60 days before the expected day of calving, on the day of calving, and three, seven, 15, 21, and 30 days after calving. Milk samples were submitted for bacteriological analysis and somatic cell count. Blood samples were collected for analyses of the following: the erythrogram and leucogram; plasm fibrinogen concentration; hepatic and renal functions; metabolic profile; serum calcium and phosphorous levels; total serum protein and albumin concentrations. The concentration of total serum proteins was associated with a high somatic cell count. Similarly, the concentrations of total serum proteins and triglycerides were associated to milk bacteriological positive samples during the transition period. Thus, the occurrence of mastitis in dairy cows during the transition period was greater in animals that showed higher concentrations of serum total proteins and triglycerides, in contrast to the use of dry cow therapy.(AU)

O presente estudo identificou potenciais marcadores sanguíneos associados tanto à mastite, durante o período de transição em vacas leiteiras submetidas à antimicrobianoterapia, quanto à utilização do selante interno de teto na secagem por modelo de regressão logística. Trinta e quatro vacas da raça Holandesa foram divididas em três grupos experimentais, a saber: 13 animais (42 quartos mamários) que não receberam tratamento na secagem; 10 animais (40 quartos mamários) tratados por via intramamária com uma bisnaga do antimicrobiano para vaca seca à base de cefalônio anidro após a última ordenha em cada quarto mamário; e 11 animais (44 quartos mamários) que receberam, por via intramamária, uma bisnaga de selante à base de subnitrato de bismuto após a última ordenha em cada quarto mamário. As amostras de leite e sangue foram coletadas 60 dias antes da data prevista do parto, na secagem, e no dia do parto e após três, sete, 15 e 21 dias após o parto. As amostras de leite foram utilizadas para o exame microbiológico e a determinação da contagem de células somáticas. As amostras de sangue foram utilizadas para determinação do eritrograma, leucograma, fibrinogênio plasmático, funções hepáticas e renais, perfil metabólico, proteína total e albuminas séricas e concentração sérica de cálcio e fósforo. A concentração total de proteínas séricas foi associada à alta contagem de células somáticas. Similarmente, a concentração total de proteínas séricas e triglicérides foi associada ao isolamento de patógenos causadores de mastite nas amostras de leite durante o período de transição. Desse modo, conclui-se que vacas leiteiras com concentrações séricas maiores de proteína total e triglicérides têm maior chance de apresentar mastite durante o período de transição; em contraste, o uso da antimicrobianoterapia de vaca seca reduz esse risco.(AU)

Mastitis in the transition period: identification of potential blood markers / Mastite no período de transição: identificação de potenciais marcadores no sangue

This study identified potential blood markers associated with mastitis in dairy cows under different dry therapies during the transition period, using a logistic regression model. Thirty-four Holstein dairy cows were divided into three groups: untreated controls (13 cows, 42 quarters); animals that received an antimicrobial at drying-off (10 cows, 40 quarters); and animals that were administered an internal teat sealant at drying-off (11 cow, 44 quarters). Blood and quarter milk samples were collected 60 days before the expected day of calving, on the day of calving, and three, seven, 15, 21, and 30 days after calving. Milk samples were submitted for bacteriological analysis and somatic cell count. Blood samples were collected for analyses of the following: the erythrogram and leucogram; plasm fibrinogen concentration; hepatic and renal functions; metabolic profile; serum calcium and phosphorous levels; total serum protein and albumin concentrations. The concentration of total serum proteins was associated with a high somatic cell count. Similarly, the concentrations of total serum proteins and triglycerides were associated to milk bacteriological positive samples during the transition period. Thus, the occurrence of mastitis in dairy cows during the transition period was greater in animals that showed higher concentrations of serum total proteins and triglycerides, in contrast to the use of dry cow therapy.(AU)

O presente estudo identificou potenciais marcadores sanguíneos associados tanto à mastite, durante o período de transição em vacas leiteiras submetidas à antimicrobianoterapia, quanto à utilização do selante interno de teto na secagem por modelo de regressão logística. Trinta e quatro vacas da raça Holandesa foram divididas em três grupos experimentais, a saber: 13 animais (42 quartos mamários) que não receberam tratamento na secagem; 10 animais (40 quartos mamários) tratados por via intramamária com uma bisnaga do antimicrobiano para vaca seca à base de cefalônio anidro após a última ordenha em cada quarto mamário; e 11 animais (44 quartos mamários) que receberam, por via intramamária, uma bisnaga de selante à base de subnitrato de bismuto após a última ordenha em cada quarto mamário. As amostras de leite e sangue foram coletadas 60 dias antes da data prevista do parto, na secagem, e no dia do parto e após três, sete, 15 e 21 dias após o parto. As amostras de leite foram utilizadas para o exame microbiológico e a determinação da contagem de células somáticas. As amostras de sangue foram utilizadas para determinação do eritrograma, leucograma, fibrinogênio plasmático, funções hepáticas e renais, perfil metabólico, proteína total e albuminas séricas e concentração sérica de cálcio e fósforo. A concentração total de proteínas séricas foi associada à alta contagem de células somáticas. Similarmente, a concentração total de proteínas séricas e triglicérides foi associada ao isolamento de patógenos causadores de mastite nas amostras de leite durante o período de transição. Desse modo, conclui-se que vacas leiteiras com concentrações séricas maiores de proteína total e triglicérides têm maior chance de apresentar mastite durante o período de transição; em contraste, o uso da antimicrobianoterapia de vaca seca reduz esse risco.(AU)

Sequence analysis of the internal transcribed spacer 2 (ITS2) region of rDNA for identifying Trichogramma species and evaluating genetic diversity

Abstract Species of Trichogramma Westwood, 1833 (Hymenoptera: Trichogrammtidae) are frequently used as biological control agents against Lepidoptera, but practical application of these egg endoparasitoids are complicated because of their complex taxonomy. This study aimed to compare sequences of internal transcribed spacer regions of ribosomal DNA (ITS2-rDNA) of Trichogramma accessions with those deposited in GenBank in order to access the reliability of the ITS2 as a barcode for discriminating species and evaluating the genetic diversity. ITS2-rDNA sequences obtained from seventeen specimens of Trichogramma confirmed previous identifications based on morphological characteristics. Multiple sequence alignment revealed the existence of highly conserved regions in ITS2 sequences while the neighbour-joining dendrogram indicated that the specimens formed three clusters comprising T. manicobai and T. marandobai (group I), T. galloi (group II) and T. pretiosum (group III). The ITS2 marker was shown to be a powerful DNA barcode for discriminating Trichogramma species and could be used to complement the morphological approach.

Resumo Espécies de Trichogramma Westwood, 1833 (Hymenoptera: Trichogrammatidae) são freqüentemente usadas como agentes de controle biológico contra Lepidoptera, esses endoparasitóides de ovos apresentam taxonomia complexa, o que dificulta sua aplicação prática. Este estudo teve como objetivo comparar seqüências de regiões espaçadoras internas transcritas de DNA ribossômico (ITS2-rDNA) de acessos de Trichogramma com aquelas depositadas no GenBank, a fim de avaliar a confiabilidade do ITS2 barcode para discriminar espécies e avaliar a diversidade genética. As seqüências de ITS2-rDNA obtidas de dezessete espécimes de Trichogramma confirmaram identidades anteriores com base em características morfológicas. O alinhamento de múltiplas sequências revelou a existência de regiões altamente conservadas nas sequências ITS2, enquanto o dendrograma indicou que os espécimes formavam três grupos compreendendo T. manicobai e T. marandobai (grupo I), T. galloi (grupo II) e T. pretiosum (grupo III). O marcador ITS2 mostrou ser um poderoso DNA barcode para discriminar espécies de Trichogramma podendo ser usado como complemento da abordagem morfológica.

Evaluation of internal markers as determinants of fecal dry matter output and digestibility in feedlot sheep / Avaliação de marcadores internos como determinantes da excreção fecal de matéria seca e da digestibilidade em ovinos confinados

This study aimed to evaluate the fecal recovery of the internal markers indigestible dry matter (iDM), indigestible neutral detergent fiber (iNDF), and indigestible acid detergent fiber (iADF) and to compare them as estimators of the fecal dry matter output (FDMO) and digestibility of the dry matter (DM) with values observed in total feces collection in trials with feedlot sheep. For this, 82 sampling units from two experiments were evaluated. Internal markers were quantified in the feed supplied, orts, and feces. The recovery of the markers was determined by the comparison of the amount of marker consumed and excreted. Fecal dry matter output and digestibility were determined based on the amount of marker consumed and on its concentration in the feces through individual collections directly from the rectum of the animals, with values compared with those observed in the total feces collection from orthogonal contrasts. The mean bias, the concordance correlation coefficient, and the mean squared prediction error were also evaluated. For all statistical procedures, the critical level of probability for type-I error was fixed at 0.05. The marker iDM showed complete fecal recovery (100.03%) and was efficient in estimating FDMO (482.9 g day-1) and DM digestibility (542 g kg-1) as compared with the values observed in the total feces collection (454.7 g day-1 and 561 g kg-1 for FDMO and DM digestibility,respectively). The iNDF and iADF markers did not show complete recovery in the feces and were noteffective in the estimate of FDMO and DM digestibility.(AU)

O objetivo deste trabalho foi avaliar a recuperação fecal dos marcadores internos matéria seca indigestível (MSi), fibra em detergente neutro indigestível (FDNi) e fibra em detergente ácido indigestível (FDAi) e compará-los como estimadores da excreção fecal de matéria seca (EFMS) e digestibilidade da matéria seca com os valores observados na coleta total de fezes em ensaios com ovinos confinados. Para isso, foram avaliadas 82 unidades amostrais de dois experimentos. Os indicadores internos foram quantificados no alimento fornecido, sobras e fezes. A recuperação dos marcadores foi determinada pela comparação da quantidade de marcador consumido e excretado. A EFMS e a digestibilidade da matéria seca foram determinadas com base na quantidade de marcador consumido e na sua concentração nas fezes. Os valores preditos com a utilização dos marcadores foram comparados aos observados na coleta total de fezes a partir de contrastes ortogonais. Também foram avaliados o viés médio, o coeficiente de concordância da correlação e o quadrado médio do erro de predição. Para todos os procedimentos estatísticos, o nível crítico de probabilidade para o erro de tipo I foi fixado em 0,05. O marcador MSi mostrou recuperação fecal completa (100,03%) e foi eficiente na estimativa da EFMS (482,9 g dia-1) e digestibilidade da MS (542 g kg-1) em comparação aos valores observados na coleta total de fezes (454,7g dia-1 e 561 g kg-1, respectivamente). Os marcadores FDNi e FDAi não demonstraram recuperaçãocompleta nas fezes e não foram eficazes na estimativa da EFMS e digestibilidade da MS.(AU)

Digestibility markers of sheep diets containing hydrolyzed sugarcane-top hay / Indicadores de digestibilidade de dietas para ovinos contendo feno de ponta de canade-açúcar hidrolisado

This experiment evaluated the correlation between the estimates of fecal digestibility and dry matter digestibility (DMD) and nutrients obtained using internal (indigestibles dry materiDM, neutral detergent fiber-iNDF, acid detergent fiber-iADF and acid detergent ligniniADL) and external (chromium oxide-Cr2O3, titanium dioxide-TiO2, and purified and enriched lignin from eucalyptus-LIPE®) markers and the values obtained by the total feces collection method. Twenty uncastrated male sheep, with 29.64±5.53 kg average live weight; approximately 12 months old, were kept in metabolic cages and fed diets containing untreated sugarcane-top hay or sugarcane-top hay hydrolyzed with 3 and 6% urea or 1.5 and 3% calcium oxide (CaO). There was a positive correlation (P<.05) between the fecal production estimated by the markers and via total feces collection, with coefficients higher than 90% for iDM, Cr2O3, and TiO2. The DMD and nutrients estimated with the use of markers was positively correlated (P<.05) with that obtained by total feces collection. Coefficients of correlation for digestibility obtained by total collection were higher than those obtained with Cr2O3, but close to those obtained using TiO2. The coefficient of correlation between the digestibility of protein and fiber fraction estimated with iDM and iNDF and that obtained by total collection was higher than 70%. Internal marker iDM and external markers Cr2O3 and TiO2 are effective in estimating fecal production and DMD and nutrients.(AU)

Avaliou-se a correlação das estimativas de produção fecal e digestibilidade da matéria seca (DMS) e nutrientes obtidas por indicadores internos (matéria seca-MSi, fibra em detergente neutro-FDNi, fibra em detergente ácido-FDAi e lignina em detergente ácido-LDAi indigestíveis) e externos (óxido de cromo-Cr2O3, dióxido de titânio-TiO2 e lignina purificada e enriquecida de eucalipto-LIPE®) com valores obtidos pelo método de coleta total de fezes. Utilizaram-se 20 ovinos, machos, não castrados, com 29,64 ± 5,53 kg de peso vivo médio e aos 12 meses de idade, mantidos em gaiolas metabólicas e alimentados com rações compostas por feno de ponta de cana-de-açúcar não tratado ou hidrolisado com 3 e 6% de ureia ou 1,5 e 3% de óxido de cálcio (CaO). Houve correlação positiva (P<0,05) da produção fecal estimada pelos indicadores com a coleta total de fezes, com coeficientes maiores de 90% para MSi, Cr2O3 e TiO2. A digestibilidade da MS e de nutrientes estimada a partir do uso de indicadores correlacionou-se positivamente com a obtida pela coleta total de fezes. Maiores coeficientes de correlação foram obtidos para a digestibilidade por coleta total em relação ao Cr2O3, com valores aproximados aos obtidos para TiO2. Quanto aos indicadores internos MSi e FDNi, a digestibilidade da proteína e fração fibrosa apresentou coeficiente de correlação com a digestibilidade por coleta total superior a 70%. O indicador interno MSi e os externos Cr2O3 e TiO2 são eficazes na estimativa da produção fecal e digestibilidade da MS e nutrientes.(AU)

Digestibility markers of sheep diets containing hydrolyzed sugarcane-top hay / Indicadores de digestibilidade de dietas para ovinos contendo feno de ponta de canade-açúcar hidrolisado

This experiment evaluated the correlation between the estimates of fecal digestibility and dry matter digestibility (DMD) and nutrients obtained using internal (indigestibles dry materiDM, neutral detergent fiber-iNDF, acid detergent fiber-iADF and acid detergent ligniniADL) and external (chromium oxide-Cr2O3, titanium dioxide-TiO2, and purified and enriched lignin from eucalyptus-LIPE®) markers and the values obtained by the total feces collection method. Twenty uncastrated male sheep, with 29.64±5.53 kg average live weight; approximately 12 months old, were kept in metabolic cages and fed diets containing untreated sugarcane-top hay or sugarcane-top hay hydrolyzed with 3 and 6% urea or 1.5 and 3% calcium oxide (CaO). There was a positive correlation (P<.05) between the fecal production estimated by the markers and via total feces collection, with coefficients higher than 90% for iDM, Cr2O3, and TiO2. The DMD and nutrients estimated with the use of markers was positively correlated (P<.05) with that obtained by total feces collection. Coefficients of correlation for digestibility obtained by total collection were higher than those obtained with Cr2O3, but close to those obtained using TiO2. The coefficient of correlation between the digestibility of protein and fiber fraction estimated with iDM and iNDF and that obtained by total collection was higher than 70%. Internal marker iDM and external markers Cr2O3 and TiO2 are effective in estimating fecal production and DMD and nutrients.

Avaliou-se a correlação das estimativas de produção fecal e digestibilidade da matéria seca (DMS) e nutrientes obtidas por indicadores internos (matéria seca-MSi, fibra em detergente neutro-FDNi, fibra em detergente ácido-FDAi e lignina em detergente ácido-LDAi indigestíveis) e externos (óxido de cromo-Cr2O3, dióxido de titânio-TiO2 e lignina purificada e enriquecida de eucalipto-LIPE®) com valores obtidos pelo método de coleta total de fezes. Utilizaram-se 20 ovinos, machos, não castrados, com 29,64 ± 5,53 kg de peso vivo médio e aos 12 meses de idade, mantidos em gaiolas metabólicas e alimentados com rações compostas por feno de ponta de cana-de-açúcar não tratado ou hidrolisado com 3 e 6% de ureia ou 1,5 e 3% de óxido de cálcio (CaO). Houve correlação positiva (P<0,05) da produção fecal estimada pelos indicadores com a coleta total de fezes, com coeficientes maiores de 90% para MSi, Cr2O3 e TiO2. A digestibilidade da MS e de nutrientes estimada a partir do uso de indicadores correlacionou-se positivamente com a obtida pela coleta total de fezes. Maiores coeficientes de correlação foram obtidos para a digestibilidade por coleta total em relação ao Cr2O3, com valores aproximados aos obtidos para TiO2. Quanto aos indicadores internos MSi e FDNi, a digestibilidade da proteína e fração fibrosa apresentou coeficiente de correlação com a digestibilidade por coleta total superior a 70%. O indicador interno MSi e os externos Cr2O3 e TiO2 são eficazes na estimativa da produção fecal e digestibilidade da MS e nutrientes.

Análise das sequências de genes marcadores evolutivos dos gêneros Prevotella e Megasphaera na classificação de organismos ruminais

Com a busca constante pela melhoria da eficiência produtiva da bovinocultura, influenciada tanto pela necessidade do aumento da produção em menores áreas como pela pressão para a diminuição dos impactos ambientais, é imprescindível que tenhamos um melhor entendimento acerca dos processos que ocorrem no ambiente ruminal. A presente tese objetivou, por meio de análises filogenéticas de gêneros bacterianos ruminais, gerar conhecimento e permitir um melhor entendimento das comunidades microbianas presentes neste rico ambiente. Para tanto, foram realizados estudos com análises filogenéticas utilizando genes marcadores evolutivos de dois gêneros com crescente importância no estudo da microbiologia ruminal, os gêneros Prevotella e Megasphaera. O primeiro estudo mostrou a presença de sequências do gene 16S rRNA de Prevotellas ruminais não cultivadas com forte relação com espécies de Prevotellas não ruminais, indicando origem comum entre essas sequências e facilidade para o desenvolvimento de espécies de Prevotellas com diferentes preferências de substratos de fermentação no rúmen. Além disso, pôde-se verificar que as sequências não cultivadas de Prevotella sp. RML113, RML67, RML125, RML110 e NRCM B1 possuem grande probabilidade de representarem novas espécies dentro do gênero. No segundo estudo foi verificado que o gênero Megasphaera formou um clado profundamente enraizado com o gênero monoespecífico Anaeroglobus, com a formação de pelo menos três clusters internos bem definidos dentro do gênero. Os achados deste trabalho mostram que A. geminatus não é independente do gênero Megasphaera, formando com as outras espécies deste gênero um ramo monofilético suportando a proposição de que A. geminatus deva ser reclassificado como Megasphaera geminata comb. nov. Concluise assim que o uso de análises filogenéticas utilizando genes marcadores evolutivos de microrganismos ruminais se mostra uma ferramenta eficiente para a melhor compreensão das relações que ocorrem na comunidade microbiana do rúmen e os fatores que a afetam.

The search for improving the productive efficiency of the livestock activity, influenced both by the search to increase production in smaller areas and by the pressure to reduce environmental impacts, there is a growing need for us to have a better understanding of the processes that occur in the rumen environment. The present thesis aimed to carry out phylogenetic analyzes of ruminal bacterial genera in order to generate knowledge and allow a better understanding of the microbial communities present in this rich environment. For that, studies with phylogenetic analyzes were carried out using evolutionary marker genes of two genera with increasing importance in the study of ruminal microbiology, the Prevotella and Megasphaera genera. The first study showed that the presence of sequences of the 16S rRNA gene from non-cultured ruminal Prevotellas with a strong relationship with non-ruminal Prevotellas species indicated a common origin between these sequences and demonstrated that this environment facilitates the development of Prevotellas species with different substrate preferences fermentation. In addition, it was possible to verify that the uncultivated sequences of Prevotella sp. RML113, RML67, RML125, RML110 and NRCM B1 have a high probability of representing new species within the genus. In the second study it was found that the genus Megasphaera formed a clade deeply rooted with the monospecific genus Anaeroglobus, with the formation of at least three well-defined internal clusters within the genus. The findings of this work show that A. geminatus is not independent of the genus Megasphaera, forming with the other species of this genus a monophyletic branch supporting the proposition that A. geminatus should be reclassified as Megasphaera geminata comb. nov. It is concluded that the use of phylogenetic analyzes using evolutionary marker genes of ruminal microrganisms proves to be an efficient tool for a better understanding of the relationships that occur in the rumen microbial community and the factors that affect it.