Resumo
ABSTRACT: The German Shepherd dog breed is the most popular breed globally and in Brazil. The study of the population structure through pedigree information is an essential tool to understand the history of the Brazilian German Shepherd dog breed. This study evaluated the status of genetic diversity and population structure of the Brazilian German Shepherd dog breed. The pedigree included a total of 77,938 animals born between 1970 and 2014. The average generation interval in this population was 3.91 years. Considering the reference population, 2,183 founders were identified. Approximately 3% of the genetic diversity of the current population (2010-2014) was lost, most of which was due to genetic drift. The effective population size was relatively small, and the pedigree showed bottlenecks indicating a loss of genetic diversity in this breed. These results indicated the need to adopt measures against the excessive increase in inbreeding and monitor effective population size to minimize genetic diversity loss.
RESUMO: A raça Pastor Alemão é uma das raças mais populares no mundo e no Brasil. O estudo da estrutura populacional por meio de informações de pedigree é uma ferramenta essencial para o entendimento da história dessa raça no Brasil. Objetivou-se com o estudo avaliar o status da diversidade genética e da estrutura populacional de cães da raça Pastor Alemão. O pedigree incluiu um total de 77.938 animais nascidos entre 1970 e 2014. O intervalo médio de geração nesta população foi de 3,91 anos. Considerando a população de referência, foram identificados 2.183 fundadores. Cerca de 3% da diversidade genética da população atual (2010-2014) foi perdida, a maior parte devido à deriva genética. O tamanho efetivo da população foi relativamente pequeno e o pedigree apresentou gargalos indicando uma perda de diversidade genética nesta raça. Esses resultados indicam a necessidade de adoção de medidas contra o aumento excessivo da endogamia e do monitoramento do tamanho efetivo da população para minimizar a perda de diversidade genética.
Resumo
The German Shepherd dog breed is the most popular breed globally and in Brazil. The study of the population structure through pedigree information is an essential tool to understand the history of the Brazilian German Shepherd dog breed. This study evaluated the status of genetic diversity and population structure of the Brazilian German Shepherd dog breed. The pedigree included a total of 77,938 animals born between 1970 and 2014. The average generation interval in this population was 3.91 years. Considering the reference population, 2,183 founders were identified. Approximately 3% of the genetic diversity of the current population (2010-2014) was lost, most of which was due to genetic drift. The effective population size was relatively small, and the pedigree showed bottlenecks indicating a loss of genetic diversity in this breed. These results indicated the need to adopt measures against the excessive increase in inbreeding and monitor effective population size to minimize genetic diversity loss.
A raça Pastor Alemão é uma das raças mais populares no mundo e no Brasil. O estudo da estrutura populacional por meio de informações de pedigree é uma ferramenta essencial para o entendimento da história dessa raça no Brasil. Objetivou-se com o estudo avaliar o status da diversidade genética e da estrutura populacional de cães da raça Pastor Alemão. O pedigree incluiu um total de 77.938 animais nascidos entre 1970 e 2014. O intervalo médio de geração nesta população foi de 3,91 anos. Considerando a população de referência, foram identificados 2.183 fundadores. Cerca de 3% da diversidade genética da população atual (2010-2014) foi perdida, a maior parte devido à deriva genética. O tamanho efetivo da população foi relativamente pequeno e o pedigree apresentou gargalos indicando uma perda de diversidade genética nesta raça. Esses resultados indicam a necessidade de adoção de medidas contra o aumento excessivo da endogamia e do monitoramento do tamanho efetivo da população para minimizar a perda de diversidade genética.
Assuntos
Animais , Cães , Linhagem , Variação Genética , Cães/genéticaResumo
The objectives were to analyze the genealogical information of Gyr (GY) and Nelore (NL) cattle from Costa Rica. Analyzed: pedigree integrity (GY, 13272; NL, 18153); number of complete, maximum traced and equivalent complete generations; inbreeding (FI); generation interval (GI) through four selection routes; average additive genetic ratio (AGR); effective number of founders (fe); effective number of ancestors (fa); effective population size (Ne). The analysis was performed with the ENDOG software. The maximum proportion of unknown parents, grandparents, and great-grandparents was 18.6%, 39.9%, and 59.3%, respectively. The average FI for NL was 8.87% and 2.85% in GY. The average consanguineous population (%) and FI was 53.9 and 16.5% in NL, 28.9 and 9.9% in GY. The average and maximum values of AGR for NL were 3.5 and 12.8, 1.4 and 5.6 in GY. The fe and fa for NL were 65.0 and 38.0, in GY 145.7 and 59.0. The Ne indicated increases in FI in the range of 1 to 2% in GY, for NL greater than 2%, with a status of care to monitor the evolution of F and AGR and their possible implications in genetic improvement. The GI ranged from 6.3 to 7.9 years with a general average of 6.9 years. These results show a summary of the genetic and reproductive management those breeders have carried out.
Os objetivos foram analisar as informações genealógicas de bovinos Gir (GY) e Nelore (NL) da Costa Rica. Foram considerados: integridade do pedigree (GY, 13272; NL, 18153); número de gerações completas, máximas traçadas e equivalentes completas; endogamia (FI); intervalo de geração (GI) por meio de quatro rotas de seleção; razão genética aditiva média (AGR); número efetivo de fundadores (fe); número efetivo de ancestrais (fa); tamanho efetivo da população (Ne). A análise foi realizada com o software ENDOG. A proporção máxima de pais, avós e bisavós desconhecidos foi de 18,6%, 39,9% e 59,3%, respectivamente. O FI médio para NL foi de 8,87% e 2,85% no GY. A média da população consanguínea (%) e FI foi de 53,9 e 16,5% em NL, 28,9 e 9,9% em GY. Os valores médios e máximos de AGR para NL foram 3,5 e 12,8, 1,4 e 5,6 no GY. Os fe e fa para NL foram 65,0 e 38,0, no GY 145,7 e 59,0. O Ne indicou aumentos de FI na faixa de 1 a 2% no GY, para NL superiores a 2%, com status de cuidado para acompanhar a evolução de F e AGR e suas possíveis implicações no melhoramento genético. O IG variou de 6,3 a 7,9 anos com média geral de 6,9 anos. Esses resultados mostram um resumo do manejo genético e reprodutivo realizado por esses criadores.
Assuntos
Animais , Bovinos , Linhagem , Bovinos/classificação , Costa RicaResumo
Genealogical data comprised 45,711 animals born between 1901 and 2016, with 48,127 animals in the pedigree file. Population structure was analyzed in terms of pedigree completeness, individual inbreeding coefficient (F), generation interval (L), rate of inbreeding (ΔF), effective population size (Ne), effective number of founders (ff), and effective number of ancestors (fa). The herd initially consisted of 13 bulls and 14 cows, and there were variations in the number of selected bulls and cows throughout the analyzed period, with 2,575 bulls, 13,691 cows, and 45,711 births recorded at the end of 2016. In total, 48.81% of the cows had only one progeny. Most dams (47.59%) were between three and seven years old, with a mean L in the population of 7.9 years. According to the results, 52.75% of the cows, 44.92% of the bulls, and 63.71% of the calves of the Guzerat breed in the northern region of Brazil showed some degree of inbreeding, with small-magnitude coefficients (0.56, 0.83, and 0.71% for cows, bulls, and calves, respectively). This fluctuation did not hinder the genetic evolution of the herd in the region. The effective population size does not seem to compromise the maintenance of genetic variability in the breed.
Os dados genealógicos compreenderam 45.711 animais nascidos entre 1901 e 2016, com 48.127 animais no arquivo de pedigree. A estrutura populacional foi analisada em termos de completude de pedigree, coeficiente de endogamia individual (F), intervalo de geração (L), taxa de endogamia (ΔF), tamanho efetivo da população (Ne), número efetivo de fundadores (ff) e número efetivo de ancestrais (fa). O rebanho consistia inicialmente de 13 touros e 14 vacas, e houve variações no número de touros e vacas selecionados ao longo do período analisado, com 2.575 touros, 13.691 vacas e 45.711 nascimentos registrados no final de 2016. No total, 48,81% das vacas tiveram apenas uma progênie. A maioria das barragens (47,59%) tinha entre três e sete anos, com média de L na população de 7,9 anos. De acordo com os resultados, 52,75% das vacas, 44,92% dos touros e 63,71% dos bezerros da raça Guzerá na região Norte do Brasil apresentaram algum grau de endogamia, com coeficientes de pequena magnitude (0,56, 0,83 e 0,71% para vacas, touros e bezerros, respectivamente). Essa flutuação não impediu a evolução genética do rebanho na região. O tamanho efetivo da população não parece comprometer a manutenção da variabilidade genética na raça.
Assuntos
Animais , Bovinos , Linhagem , Variação Genética , Endogamia/estatística & dados numéricos , BrasilResumo
This study analyzed the Sardo Negro breed pedigree (41,521 animals registered from 1958 to 2019) to determine its structure, evolution, and genetic variability (GV). The population genetic parameters evaluated were effective number of founders (fe) and ancestors (fa), pedigree integrity, additive genetic relationship (AGR); number of complete generations (NCG), maximum generations traced (NMGT), and equivalent complete generations (NECG); effective population size (Ne), inbreeding coefficient (F), and generation interval (GI). The average GI was 7.45 years. A total of 7,804 founders and 4,856 ancestors were identified for a fe of 185 and a fa of 97. The average and maximum values of NCG, NECG, and NMGT were 1.6 and 5.0, 2.5 and 6.5, 4.3 and 12, with Ne estimates of 15.9, 25.9, and 69.0, respectively. The increase in F, linked to Ne, ranged from 0.72% to 3.1% per generation. The average values for F and AGR were 3.6% and 1.0%, respectively. The proportion of inbred individuals was 32.0%, with F values ranging from 0.01 to 62.2% and an average of 11.3%. The rate of inbred population was 1.3% per year. The annual rate of AGR was 0.04%. For the continuity and projection of the breed, the evolution of F as a function of Ne and the possible implications of the selection schemes must be considered. The genetic variability sustained over time results from the Ne.
Os objetivos deste estudo foram analisar o pedigree (41.521 registros de 1958 a 2019) da raça Sardo Negro para avaliar a estrutura, evolução e variabilidade genética (VG) da população. Os parâmetros genéticos populacionais utilizados foram: número efetivo de fundadores (fe) e ancestrais (fa); integridade do pedigree; relação genética aditiva (RGA); número de gerações completas (NGC), máximo plotado (NGT) e equivalentes (NGE); tamanho efetivo (Ne); consanguinidade (F); intervalo geracional (IG). O IG médio foi de 7,45 anos. Foram identificados 7.804 fundadores e 4.856 ancestrais, para fe 185 e 97 na fa. As médias e máximas para NGC, NGE e NGT foram 1,6 e 5,0, 2,5 e 6,5, 4,3 e 12, com estimativas de Ne 15,9, 25,9 e 69,0, respectivamente. O aumento de F, vinculado ao Ne, ficou na faixa de 0,72% a 3,1% por geração. A média para F 3,6% e 1,0% em RGA; a proporção de consanguíneos foi de 32,0%, com F na faixa de 0,01 a 62,2% e média de 11,3%. A taxa da população consanguínea foi de 1,3% ao ano. No RGA, a taxa ao ano era de 0,04%. Para a continuidade e projeção da raça, deve-se considerar a evolução de F em função de Ne e as possíveis implicações dos esquemas de seleção. A variabilidade genética sustentada ao longo do tempo resulta do Ne.
Assuntos
Animais , Bovinos , Linhagem , Bovinos/genética , Animais Endogâmicos , Variação Biológica da PopulaçãoResumo
The objective of this research was to study the population structure of the Cattle Conservation Nucleos Curraleiro Pé Duro of the Instituto Nacional do Semiárido (NCP_INSA) based on pedigree data. Genealogical information from 338 animals registered in the period from 1991 to 2019 was used. The number of founding animals (Nf), the effective number of founders (fe), effective number of ancestors (fa), inbreeding coefficient (F), and average relatedness coefficient (AR), in addition to Fis, Fit and Fst were estimated. It was possible to identify ancestors up to the third generation, with an increase in information over the generations. Of the total pedigree information evaluated, 90.53% had the identification of the father and mother. The effective size of the population was smaller than those proposed by FAO, suggesting the need to redefine the herd management and genetic management plan strategies, promoting gene flow and breed expansion.(AU)
O objetivo com essa pesquisa foi estudar a estrutura populacional do Núcleo de Conservação de Bovinos Curraleiro Pé-Duro (NCP) do Instituto Nacional do Semiárido (INSA), por meio de dados de pedigree. Utilizaram-se informações genealógicas de 338 animais registrados no período de 1991 a 2019. Foi estimado o número de animais fundadores (Nf), o número efetivo de fundadores (fe), o número efetivo de ancestrais (fa), o coeficiente de endogamia (F) e o coeficiente de parentesco médio (AR), além do Fis, Fit e Fst. Foi possível identificar ancestrais até a terceira geração, com aumento crescente das informações ao longo das gerações. Do total de informações avaliadas, 90,53% possuíam identificação do pai e da mãe. O tamanho efetivo da população foi inferior ao mínimo proposto pela FAO, o que sugere a necessidade de redefinir as estratégias do plano de gestão e de manejo genético do rebanho, de modo a promover fluxo gênico e expansão da raça.(AU)
Assuntos
Animais , Bovinos , Linhagem , Patrimônio Genético , Endogamia/estatística & dados numéricos , BrasilResumo
Studies on genetic composition in fish populations contribute to conservationist practices and inbreeding control in fish stocks. To this end, molecular tools such as microsatellite markers (SSRs) are often used, but they are expensive and time-consuming to develop. A species-specific heterologous marker emerges as an alternative, which can be used in taxonomically related species in a fast way. Our goal was to test SSRs markers of Brachyplatystoma rousseauxi and Pseudoplatystoma punctifer in P. reticulatum in an unprecedented way. For this purpose, DNA was extracted from fragments of the caudal fin of 222 P. reticulatum adults, using a NaCl-based method. Then, DNA samples were amplified by Polymerase Chain Reaction (PCR) using six markers, four from B. rousseauxi (BR38, 47, 51, and 61) and two from P. punctifer (PPU13 and PPU15). Two primers showed non-specific amplification and were disregarded (BR38 and PPU13). In the remaining four primers, the number of alleles per locus varied between two (BR47) to sixteen (BR51), and the average size of alleles was between 142 and 400 bp. Mean effective number of alleles per locus ranged from 10,650 (BR51) to 1,784 (BR47), with null or low-frequency alleles in all studied loci. Observed heterozygosity ranged from 0.299 (BR47) to 0.640 (BR51) and was always lower than the expected heterozygosity. Hardy-Weinberg balance was significant (p < 0.05) in all loci, and inbreeding coefficient (FIS) was always positive. Polymorphic Information Content (PIC) confirmed the efficiency of the markers since they had moderate (BR47) to high levels of information (BR51, BR61, and PPU15). Transferability test showed that the heterologous microsatellite molecular markers, originally for B. rousseauxi and P. punctifer, were efficient in P. reticulatum, producing three primers with high information content. Therefore, these markers can be safely used in future population studies of this species.(AU)
Estudos acerca da composição genética de populações de peixes contribuem para a elaboração de práticas conservacionista, bem como para controle da consanguinidade em estoques de piscicultura. Neste sentido, ferramentas moleculares como os marcadores microssatélites (SSR's) são comumente utilizados, contudo, seu desenvolvimento corresponde a um processo caro e demorado. Surge como alternativa a utilização dos marcadores heterólogos, originalmente desenvolvidos para uma espécie, mas que podem ser utilizados de maneira rápida em outras taxonomicamente relacionadas. O objetivo desta pesquisa foi testar de maneira inédita a utilização de marcadores SSR's de Brachyplatystoma rousseauxi e Pseudoplatystoma punctifer em P. reticulatum. Para tanto, foram extraídas amostras de DNA a partir de fragmentos de nadadeira caudal de 222 indivíduos adultos de P. reticulatum por metodologia a base de NaCl. As amostras foram então amplificadas por Reação em Cadeia da Polimerase (PCR) utilizandose seis marcadores, quatro de B. rousseauxi (BR38, 47, 51 e 61) e dois de P. punctifer (PPU13 e PPU15). Dois primers apresentaram amplificação inespecífica e foram desconsiderados (BR38 e PPU13). Entre os quatro restantes, o número de alelos por locus variou entre dois (BR47) a dezesseis (BR51), com tamanho médio de alelos entre 142 e 400 pb. O número efetivo médio de alelos por locus variou de 10,650 (BR51) à 1,784 (BR47), com alelos nulos ou de baixa frequência presentes em todos os loci estudados. Os valores de heterozigosidade observada variaram de 0,299 (BR47) à 0,640 (BR51), e foram sempre menores que os de heterozigosidade esperada. O Equilíbrio de Hardy-Weinberg foi significativo (P < 0,05) em todos os locus e o coeficiente de endogamia Fis sempre apresentou valores positivos. Os valores de Conteúdo de Informação Polimórfica (PIC) confirmaram a eficiência dos marcadores utilizados, já que possuíram de moderado (BR47) a alto nível de informação (BR51, BR61 e PPU15). O teste de transferibilidade de marcadores moleculares microssatélites heterólogos, originalmente desenvolvidos para B. rousseauxi e P. punctifer em P. reticulatum se mostrou eficiente, produzindo três primers com alto nível de informação, fato que garante sua utilização segura em estudos populacionais futuros voltados à esta espécie.(AU)
Assuntos
Reação em Cadeia da Polimerase , Repetições de Microssatélites , Genética , Peixes-Gato/genética , EndogamiaResumo
ABSTRACT Behavioral observations made on fish have revealed remarkably diverse reproductive strategies, including polygamy by both sexes. Still, to date, most Neotropical species remain unstudied as to whether the observed reproductive behavior in natural populations correlates with their genetic mating systems. Here, we investigated the genetic mating system of a wild population of Prochilodus lineatus settled in the Middle Uruguay River basin. By using sibship reconstruction and parental inference methods based on microsatellites genotypes, we inferred 45 females and 47 males as potential parents of the 87 larvae analyzed. We found evidence supporting polygamous mating in both sexes: while a high percentage of males (44.7%) fertilized the eggs of one female, 55.3% of the inferred males fertilized eggs of up to four females. Likewise, while 44.5% of the inferred females had their eggs fertilized by one only male, 55.5% of females were fertilized by multiple males. The estimated proxy of the effective population size (Nb) was 126, exhibiting moderate to high levels of genetic diversity. The genetic evidence contributed in this study complements earlier behavioral observations of formation of spawning nuclei of aggregating breeders, which may be promoting a polygamous mating strategy in this long-distance migratory fish.
RESUMO Observações do comportamento de peixes neotropicais têm revelado estratégias reprodutivas marcadamente variáveis, incluindo poligamia nos dois sexos. Ainda assim, até então, a correlação entre comportamento reprodutivo observado em populações naturais e sistemas de acasalamento genético permanece pouco explorada para maioria de espécies Neotropicais. Neste estudo investigamos o sistema genético de acasalamento de Prochilodus lineatus em uma população natural estabelecida no Médio rio Uruguai. Utilizando métodos de reconstrução de grupos familiares e inferências parentais baseados em genótipos de microssatélites, inferimos 45 fêmeas e 47 machos como os possíveis parentais das 87 larvas amostradas. Encontramos evidência que permite apoiar a ocorrência de acasalamento poligâmico em ambos os sexos: enquanto uma percentagem alta de machos (44,7%) fertilizou somente uma fêmea, 55,3% dos machos inferidos fertilizaram mais de uma fêmea (até quatro por macho). Da mesma forma, enquanto que 44,5% das fêmeas inferidas tiveram seus ovos fertilizados por apenas um único macho, 55,5% das fêmeas tiveram ovos fertilizados por múltiplos machos. A estimativa do tamanho populacional efetivo (Nb) foi 126, exibindo níveis entre moderados e altos de diversidade genética. A evidência genética que apresentamos nesse estudo complementa observações iniciais da formação de núcleos de desova que podem promover estratégias de acasalamento poligâmico nessa espécie migratória de longa distância.
Resumo
The objective of this study was to evaluate, through data simulation, the impact of restrictions on the maximum number of full- and half-sibs selected for males and females on the level of inbreeding and genetic gain of the herd. Data came from real populations A and B, composed of Pietrain and Landrace breed pigs, respectively. To generate the simulated populations, a Fortran-language simulator was developed using the (co)variances of the breeding values and the productive and reproductive rates obtained from populations A and B. Two data files were created. The first contained the pedigree of the previous 10 years, with 21,906 and 251,343 animals in populations A and B, respectively. The second included breeding values for age to reach 110 Kg body weight, backfat thickness, and feed conversion, for both populations; longissimus dorsi muscle depth, for population A only; and number of live piglets at the 5th day of life per farrowing, for population B only. Three scenarios were simulated with ten generations by varying the restrictions on the number of full- and half-sibs selected for males and females, with 30 replicates per generation and scenario. Regardless of the mating strategy used in a closed production unit, there is an increase in inbreeding levels. Inbreeding increases are larger in populations of smaller effective size. Restrictions on the number of full- and half-sibs selected are effective in reducing increments in inbreeding. Restriction to a maximum of two full-sibs and three half-sibs for males and three full sisters for females provided the highest genetic gains.(AU)
O objetivo deste estudo foi avaliar, por meio de simulação de dados, o impacto das restrições no número máximo de irmãos completos e meios-irmãos selecionados para machos e fêmeas no nível de endogamia e ganho genético do rebanho. Os dados originais são provenientes das populações reais A e B, compostas por suínos da raça Pietrain e Landrace, respectivamente. Para gerar as populações simuladas, foi desenvolvido um simulador em linguagem Fortran utilizando as (co)variâncias dos valores genéticos e as taxas produtivas e reprodutivas obtidas das populações A e B. Dois arquivos de dados foram criados. O primeiro continha o pedigree dos 10 anos anteriores, com 21.906 e 251.343 animais nas populações A e B, respectivamente. O segundo incluiu os valores genéticos para idade para atingir 110 Kg de peso vivo, espessura de toucinho e conversão alimentar, para ambas as populações; profundidade do músculo longissimus dorsi, apenas para a população A; e número de leitões vivos no 5º dia de vida por parto, apenas para a população B. Três cenários foram simulados com dez gerações, variando as restrições quanto ao número de irmãos completos e meios-irmãos selecionados para machos e fêmeas, com 30 repetições por geração e cenário. Independentemente da estratégia de acasalamento utilizada em um núcleo de produção fechada, há aumento nos níveis de endogamia. Aumentos de endogamia são maiores em populações de menor tamanho efetivo. Restrições ao número de irmãos completos e meios-irmãos selecionados são eficazes na redução de incrementos na endogamia. A restrição de no máximo dois irmãos completos, três meios-irmãos para machos e três irmãs completas para fêmeas fornece os maiores ganhos genéticos.(AU)
Assuntos
Animais , Suínos/genética , Endogamia/métodosResumo
Genetic diversity of wild and farmed populations is crucial, both for conservation of fish resources and fish culture development. To infer the genetic diversity and population structure of Streaked prochilod Prochilodus lineatus, individuals were sampled between 2007-2009 from four fish farms and from the Upper Uruguay River Basin, both in southern Brazil. Population structure was identified in both farmed and wild individuals through seven microsatellite loci. Bayesian analysis indicated three main groups, including two from fish farms. Pairwise genetic differentiation showed spatial structure between and within wild and farmed populations; however, the sampling design did not allow testing temporal structure according to isolation-by-time (IBT), which means that populations can breed within the same geographic distribaution, but reproduce at different times. Cultivated individuals presented lower diversity, allelic richness and effective population size, but higher inbreeding rates, compared to wild populations. These characteristics constitute warning signs against indiscriminate restocking of natural Prochilodus lineatus populations, a species sensitive to fragmented habitats, with farmed fish.
A diversidade genética das populações selvagens e cultivadas é crucial, tanto para a conservação dos recursos pesqueiros como para o desenvolvimento da piscicultura. Para inferir a diversidade genética e estrutura populacional do curimba Prochilodus lineatus, indivíduos foram amostrados, entre 2007-2009, em quatro fazendas de peixes e da Bacia do Alto Uruguai, ambas no sul do Brasil. A estrutura populacional foi identificada em indivíduos cultivados e selvagens, através de sete locos microssatélites. A análise bayesiana indicou três grupos principais, incluindo dois grupos oriundos de pisciculturas. A diferenciação genética par-a-par revelou estrutura espacial entre e dentro de populações selvagens e cultivadas; no entanto, o desenho amostral não permitiu testar a estrutura temporal de acordo com o isolamento por tempo (IBT), o que significa que as populações podem reproduzir dentro da mesma distribuição geográfica, mas reproduzir em diferentes momentos. Os indivíduos cultivados apresentaram menor diversidade, riqueza alélica e tamanho efetivo populacional, porém maiores taxas de endogamia, quando comparados às populações selvagens. Estas características constituem sinais de alerta contra o repovoamento indiscriminado de populações naturais de Prochilodus lineatus, uma espécie sensível a habitats fragmentados, com peixes oriundos de pisciculturas.
Assuntos
Animais , Caraciformes/crescimento & desenvolvimento , Caraciformes/genética , Grupos de População Animal/genética , Peixes/crescimento & desenvolvimento , Peixes/genética , Variação GenéticaResumo
Genetic diversity of wild and farmed populations is crucial, both for conservation of fish resources and fish culture development. To infer the genetic diversity and population structure of Streaked prochilod Prochilodus lineatus, individuals were sampled between 2007-2009 from four fish farms and from the Upper Uruguay River Basin, both in southern Brazil. Population structure was identified in both farmed and wild individuals through seven microsatellite loci. Bayesian analysis indicated three main groups, including two from fish farms. Pairwise genetic differentiation showed spatial structure between and within wild and farmed populations; however, the sampling design did not allow testing temporal structure according to isolation-by-time (IBT), which means that populations can breed within the same geographic distribaution, but reproduce at different times. Cultivated individuals presented lower diversity, allelic richness and effective population size, but higher inbreeding rates, compared to wild populations. These characteristics constitute warning signs against indiscriminate restocking of natural Prochilodus lineatus populations, a species sensitive to fragmented habitats, with farmed fish.(AU)
A diversidade genética das populações selvagens e cultivadas é crucial, tanto para a conservação dos recursos pesqueiros como para o desenvolvimento da piscicultura. Para inferir a diversidade genética e estrutura populacional do curimba Prochilodus lineatus, indivíduos foram amostrados, entre 2007-2009, em quatro fazendas de peixes e da Bacia do Alto Uruguai, ambas no sul do Brasil. A estrutura populacional foi identificada em indivíduos cultivados e selvagens, através de sete locos microssatélites. A análise bayesiana indicou três grupos principais, incluindo dois grupos oriundos de pisciculturas. A diferenciação genética par-a-par revelou estrutura espacial entre e dentro de populações selvagens e cultivadas; no entanto, o desenho amostral não permitiu testar a estrutura temporal de acordo com o isolamento por tempo (IBT), o que significa que as populações podem reproduzir dentro da mesma distribuição geográfica, mas reproduzir em diferentes momentos. Os indivíduos cultivados apresentaram menor diversidade, riqueza alélica e tamanho efetivo populacional, porém maiores taxas de endogamia, quando comparados às populações selvagens. Estas características constituem sinais de alerta contra o repovoamento indiscriminado de populações naturais de Prochilodus lineatus, uma espécie sensível a habitats fragmentados, com peixes oriundos de pisciculturas.(AU)
Assuntos
Animais , Peixes/crescimento & desenvolvimento , Peixes/genética , Caraciformes/crescimento & desenvolvimento , Caraciformes/genética , Variação Genética , Grupos de População Animal/genéticaResumo
In general, European and North American countries, as well as Australia and New Zealand, have already eradicated or reached good levels of control of brucellosis and tuberculosis in cattle. In the rest of the world, however, the epidemiological situation of these two diseases is frequently poorly understood. In this review article, quantified data on these diseases in the South American countries are presented. Initially, the aspects that led the continent to host 25% of the world cattle population are presented, in addition to the aspects that placed the continent at a prominent position in the international meat market. Subsequently the continent was divided into three country groups, considering the size of the cattle population and how well the epidemiological situation of brucellosis and tuberculosis in cattle is quantified. It is argued that countries that do not generate high-quality quantitative epidemiological data on these diseases have serious limitations in outlining and managing control or eradication strategies. Thus, for successful outcomes, at least methodologies to estimate the prevalence of infected herds should be employed.
De maneira geral, os países da Europa e da América do Norte, além da Austrália e da Nova Zelândia, já erradicaram ou atingiram bons níveis de controle da brucelose e da tuberculose bovinas. Entretanto, no restante do mundo, raramente a situação epidemiológica dessas duas doenças é adequadamente conhecida. Neste artigo de revisão são apresentados dados de quantificação dessas importantes enfermidades nos países da América do Sul. Inicialmente são apresentadas as características que concorreram para que atualmente o continente tenha 25% do efetivo bovino mundial e uma posição de destaque no mercado internacional de carnes. Os países foram então alocados em três grupos, levando em consideração o tamanho da população bovina e a qualidade da quantificação referente à situação epidemiológica da brucelose e da tuberculose bovinas. Argumenta-se que países que não geram dados epidemiológicos quantitativos de alta qualidade em relação a essas doenças têm sérias limitações para traçar estratégias eficazes de combate e são incapazes de realizar a gestão dos processos. Conclui-se que os países que desejam ser exitosos no combate à brucelose e tuberculose bovinas deveriam ao menos utilizar metodologias para estimar a prevalência de focos.
Resumo
This study aims to estimate the zootechnical and economic benchmarks of milk production systems, analyze production scale effects on dairy farming returns, and identify the system components that best represent the total and effective operational costs. We analyzed 22 size, zootechnical and economic performance indexes from 61 dairy farms located in Minas Gerais state, Brazil. The sample of herds were clustered according to three production strata. The results were compared using analysis of variance (normal distribution) and Kruskal-Wallis (non-normal distribution) tests, and post-hoc comparisons were undertaken with Fisher"s least significant difference test. The relationship between some variables was tested using the Pearson correlation test. The production scale was best defined by the number of lactating cows (r=0.96) in comparison to the area (r=0.83). The production scale proved to be a suitable criterion for the analyses between different groups of producers, and it is more easily obtained and probably provides more accurate results. The milk production systems studied presented higher zootechnical indexes than those found in average of Brazilian farms, but lower than international indices or technologically advanced farms from other Brazilian regions. A greater production scale is a desirable condition, although it failed to ensure the economic efficiency of the herds...
Objetivou-se com este estudo estimar índices de desempenho zootécnico e econômico de referência, analisar a influência da escala de produção sobre a rentabilidade da atividade leiteira e identificar os componentes que exerceram maiores representatividades sobre o custo total e operacional efetivo. Foram analisados 22 índices de tamanho, zootécnico e econômico de 61 sistemas de produção de leite, localizados no estado de Minas Gerais, Brasil. Os rebanhos foram agrupados em função de três estratos de produção. Os resultados foram comparados pelos testes de ANOVA (distribuição normal) e Kruskal-Wallis (distribuição não normal), complementados pelo teste de comparação de médias (Fisher"s least significant difference). O relacionamento entre algumas variáveis foi testado usando o teste de correlação de Pearson. A quantidade de vacas em lactação (r=0,96) definiu melhor a escala de produção em comparação à área (r=0,83). A escala de produção mostrou-se um critério adequado para análise entre grupos distintos de produtores, além de obtenção mais simples e, provavelmente, de maior acurácia. Os sistemas de produção de leite estudados apresentaram índices zootécnicos superiores à média de fazendas brasileiras, porém inferiores aos índices internacionais ou de fazendas tecnificadas de outras regiões brasileiras. Maior escala de produção é uma condição desejada, mas não garantiu a...
Assuntos
Animais , Bovinos , Criação de Animais Domésticos/economia , Laticínios/economia , Proteínas do Leite/economia , BrasilResumo
In general, European and North American countries, as well as Australia and New Zealand, have already eradicated or reached good levels of control of brucellosis and tuberculosis in cattle. In the rest of the world, however, the epidemiological situation of these two diseases is frequently poorly understood. In this review article, quantified data on these diseases in the South American countries are presented. Initially, the aspects that led the continent to host 25% of the world cattle population are presented, in addition to the aspects that placed the continent at a prominent position in the international meat market. Subsequently the continent was divided into three country groups, considering the size of the cattle population and how well the epidemiological situation of brucellosis and tuberculosis in cattle is quantified. It is argued that countries that do not generate high-quality quantitative epidemiological data on these diseases have serious limitations in outlining and managing control or eradication strategies. Thus, for successful outcomes, at least methodologies to estimate the prevalence of infected herds should be employed.(AU)
De maneira geral, os países da Europa e da América do Norte, além da Austrália e da Nova Zelândia, já erradicaram ou atingiram bons níveis de controle da brucelose e da tuberculose bovinas. Entretanto, no restante do mundo, raramente a situação epidemiológica dessas duas doenças é adequadamente conhecida. Neste artigo de revisão são apresentados dados de quantificação dessas importantes enfermidades nos países da América do Sul. Inicialmente são apresentadas as características que concorreram para que atualmente o continente tenha 25% do efetivo bovino mundial e uma posição de destaque no mercado internacional de carnes. Os países foram então alocados em três grupos, levando em consideração o tamanho da população bovina e a qualidade da quantificação referente à situação epidemiológica da brucelose e da tuberculose bovinas. Argumenta-se que países que não geram dados epidemiológicos quantitativos de alta qualidade em relação a essas doenças têm sérias limitações para traçar estratégias eficazes de combate e são incapazes de realizar a gestão dos processos. Conclui-se que os países que desejam ser exitosos no combate à brucelose e tuberculose bovinas deveriam ao menos utilizar metodologias para estimar a prevalência de focos.(AU)
Assuntos
Animais , Bovinos , Brucelose Bovina/epidemiologia , Monitoramento Epidemiológico/veterinária , Tuberculose Bovina/epidemiologia , América do Sul/epidemiologiaResumo
The production performance of a livestock herd can be compromised by various diseases. In sheep, maedi-visna (MV) infections, which have a chronic nature, are caused by a virus (maedi-visna virus (MVV)) belonging to the genus Lentivirus of the Retroviridae family. The infection can cause significant economic losses and has considerable health impacts on sheep breeding in production systems. Due to the importance of this disease in sheep flocks, the objective was to conduct a serosurvey of MVV in the states of Ceará (CE), Rio Grande do Norte (RN), Paraíba (PB), and Sergipe (SE). A total of, 3332 serum samples were collected in the four states, 1011 in CE, 931 in RN, 459 in PB, and 931 in SE, with the number of samples proportional to the actual herd size of each state. The samples were analyzed using the agar gel microimmunodiffusion test (AGID). Reproducers were revaluated using western blotting (WB). In addition to this serological survey, we administered an investigative questionnaire to identify possible risk factors that facilitate the introduction and spread of diseases (location, category, sex, breed type, creation system, production, herd size, and association with goats). After analysis of the sera using the AGID test, there was zero prevalence. Revaluating breeders by WB revealed a 5.5% prevalence of MV in the four states studied, with prevalences for the states of CE, RN, Paraiba, and SE of 2.3% (2/88), 10.4% (8/77), 3.6% (1/28), and 4.7% (2/42), respectively, corresponding to 13 breeders containing antibodies to the virus. These findings emphasized that the choice of diagnostic tests is extremely important for the early detection of seropositive animals and thus the prevention of the spread of the virus among herds in the region.(AU)
O desempenho produtivo de um rebanho pode ser comprometido por diversas enfermidades. Em relação aos ovinos, à ocorrência da Maedi - Visna (MV) doença infecciosa, de caráter crônico, causada por um vírus (Maedi-Visna Vírus MVV) pertencente ao gênero Lentivirus da família Retroviridae. A infecção pode causar importantes perdas econômicas e elevados impactos sanitários nos sistemas de produção da ovinocultura. Em virtude da importância desta enfermidade nos rebanhos ovinos, o objetivo do estudo foi realizar um levantamento soroepidemiológico do vírus da Maedi - Visna (MVV) nos estados do Ceará (CE), Rio Grande do Norte (RN), Paraíba (PB) e Sergipe (SE). Para tanto, foram coletadas 3332 amostras de sangue nos quatro estados, sendo 1011 do CE, 931 do RN, 459 da PB e 931 de SE, sendo este número de amostras proporcional ao rebanho efetivo de cada estado. As amostras foram analisadas utilizando o teste de microimunodifusão em gel de ágar (IDGA). Os reprodutores foram reavaliados pela técnica de Western Blot (WB). Associado a esse levantamento sorológico foi aplicado um questionário epidemiológico para identificar possíveis fatores de risco que podem facilitar a introdução e disseminação de enfermidades (localização, categoria, sexo, tipo racial, sistema de criação, produção, tamanho de rebanho e associação com caprinos). Após análise dos soros pelo teste de IDGA foi verificada uma soroprevalência nula nos rebanhos estudados. Os reprodutores reavaliados pelo WB apresentaram uma prevalência geral de 5,5% da MV nos quatro estados estudados, sendo que os estados do Ceará, Rio Grande do Norte, Paraíba e Sergipe apresentaram, 2,3% (2/88), 10,4% (8/77), 3,6% (1/28) e 4,7% (2/42) respectivamente, correspondendo a 13 reprodutores que apresentaram presença de anticorpos. Diante desses resultados, ressalta-se que a escolha dos testes diagnósticos é de extrema importância para que haja uma detecção precoce de animais soropositivos, e assim evitar a...(AU)
Assuntos
Animais , Infecções por Lentivirus/veterinária , Pneumonia Intersticial Progressiva dos Ovinos , Ovinos/virologia , Estudos Soroepidemiológicos , Vírus Visna-MaediResumo
This study aims to estimate the zootechnical and economic benchmarks of milk production systems, analyze production scale effects on dairy farming returns, and identify the system components that best represent the total and effective operational costs. We analyzed 22 size, zootechnical and economic performance indexes from 61 dairy farms located in Minas Gerais state, Brazil. The sample of herds were clustered according to three production strata. The results were compared using analysis of variance (normal distribution) and Kruskal-Wallis (non-normal distribution) tests, and post-hoc comparisons were undertaken with Fisher"s least significant difference test. The relationship between some variables was tested using the Pearson correlation test. The production scale was best defined by the number of lactating cows (r=0.96) in comparison to the area (r=0.83). The production scale proved to be a suitable criterion for the analyses between different groups of producers, and it is more easily obtained and probably provides more accurate results. The milk production systems studied presented higher zootechnical indexes than those found in average of Brazilian farms, but lower than international indices or technologically advanced farms from other Brazilian regions. A greater production scale is a desirable condition, although it failed to ensure the economic efficiency of the herds...(AU)
Objetivou-se com este estudo estimar índices de desempenho zootécnico e econômico de referência, analisar a influência da escala de produção sobre a rentabilidade da atividade leiteira e identificar os componentes que exerceram maiores representatividades sobre o custo total e operacional efetivo. Foram analisados 22 índices de tamanho, zootécnico e econômico de 61 sistemas de produção de leite, localizados no estado de Minas Gerais, Brasil. Os rebanhos foram agrupados em função de três estratos de produção. Os resultados foram comparados pelos testes de ANOVA (distribuição normal) e Kruskal-Wallis (distribuição não normal), complementados pelo teste de comparação de médias (Fisher"s least significant difference). O relacionamento entre algumas variáveis foi testado usando o teste de correlação de Pearson. A quantidade de vacas em lactação (r=0,96) definiu melhor a escala de produção em comparação à área (r=0,83). A escala de produção mostrou-se um critério adequado para análise entre grupos distintos de produtores, além de obtenção mais simples e, provavelmente, de maior acurácia. Os sistemas de produção de leite estudados apresentaram índices zootécnicos superiores à média de fazendas brasileiras, porém inferiores aos índices internacionais ou de fazendas tecnificadas de outras regiões brasileiras. Maior escala de produção é uma condição desejada, mas não garantiu a...(AU)
Assuntos
Animais , Bovinos , Criação de Animais Domésticos/economia , Laticínios/economia , Proteínas do Leite/economia , BrasilResumo
In general, European and North American countries, as well as Australia and New Zealand, have already eradicated or reached good levels of control of brucellosis and tuberculosis in cattle. In the rest of the world, however, the epidemiological situation of these two diseases is frequently poorly understood. In this review article, quantified data on these diseases in the South American countries are presented. Initially, the aspects that led the continent to host 25% of the world cattle population are presented, in addition to the aspects that placed the continent at a prominent position in the international meat market. Subsequently the continent was divided into three country groups, considering the size of the cattle population and how well the epidemiological situation of brucellosis and tuberculosis in cattle is quantified. It is argued that countries that do not generate high-quality quantitative epidemiological data on these diseases have serious limitations in outlining and managing control or eradication strategies. Thus, for successful outcomes, at least methodologies to estimate the prevalence of infected herds should be employed.(AU)
De maneira geral, os países da Europa e da América do Norte, além da Austrália e da Nova Zelândia, já erradicaram ou atingiram bons níveis de controle da brucelose e da tuberculose bovinas. Entretanto, no restante do mundo, raramente a situação epidemiológica dessas duas doenças é adequadamente conhecida. Neste artigo de revisão são apresentados dados de quantificação dessas importantes enfermidades nos países da América do Sul. Inicialmente são apresentadas as características que concorreram para que atualmente o continente tenha 25% do efetivo bovino mundial e uma posição de destaque no mercado internacional de carnes. Os países foram então alocados em três grupos, levando em consideração o tamanho da população bovina e a qualidade da quantificação referente à situação epidemiológica da brucelose e da tuberculose bovinas. Argumenta-se que países que não geram dados epidemiológicos quantitativos de alta qualidade em relação a essas doenças têm sérias limitações para traçar estratégias eficazes de combate e são incapazes de realizar a gestão dos processos. Conclui-se que os países que desejam ser exitosos no combate à brucelose e tuberculose bovinas deveriam ao menos utilizar metodologias para estimar a prevalência de focos.(AU)
Assuntos
Animais , Bovinos , Brucelose Bovina/epidemiologia , Tuberculose Bovina/epidemiologia , Monitoramento Epidemiológico/veterinária , América do Sul/epidemiologiaResumo
This study aimed to investigate the effects of husbandry system on the technical and economic performance of dairy farming. Samples included data from 61 dairy farms from the State of Minas Gerais, Brazil, which were collected between 2002 and 2011. Farms were categorized by type-pasturebased (PB), semi-confinement (SC), and confinement (C)-and technical and economic indexes were compared. In general, the results indicated indexes that are higher than the average for Brazilian farms but lower than those in other countries or technological farms in other Brazilian regions. Milk production was mainly determined by farm size rather than by productivity indexes. Components of the total and effective operational costs that were most significant were feeding followed by labor. The comparative analysis indicated that, although C systems have technical indexes that are superior to those of the PB and SC systems, economic performance was independent of the intensification level. Thus, pasture systems are potentially competitive, provided that the producers are efficient.
Objetivou-se com este estudo investigar o efeito do sistema de criação sobre o desempenho técnico e econômico da atividade leiteira. A amostra incluiu dados reais de 61 rebanhos leiteiros localizados no estado de Minas Gerais, Brasil, durante os anos de 2002 a 2011. As fazendas foram agrupadas em função do nível de intensificação em pasto (PAST), semiconfinamento (SEMI) ou confinamento (CONF) e os índices técnicos e econômicos foram comparados. De forma geral, os resultados mostraram índices técnicos maiores do que a média de fazendas brasileiras, porém inferiores a índices internacionais ou de fazendas tecnificadas de outras regiões do Brasil. A produção de leite foi mais determinada pelo tamanho da fazenda do que pelos índices de produtividade e os itens do custo total e operacional efetivo que tiveram maiores representatividades foram, em ordem decrescente, alimentação e mão de obra. A análise comparativa mostrou que, embora sistemas CONF apresentaram índices técnicos superiores a PAST e SEMI, o desempenho econômico independeu do nível de intensificação. Portanto, sistemas a pasto são potencialmente competitivos, desde que os produtores sejam eficientes.
Assuntos
Feminino , Animais , Bovinos , Animais Domésticos/classificação , Bovinos , Indicadores EconômicosResumo
This study aimed to investigate the effects of husbandry system on the technical and economic performance of dairy farming. Samples included data from 61 dairy farms from the State of Minas Gerais, Brazil, which were collected between 2002 and 2011. Farms were categorized by type-pasturebased (PB), semi-confinement (SC), and confinement (C)-and technical and economic indexes were compared. In general, the results indicated indexes that are higher than the average for Brazilian farms but lower than those in other countries or technological farms in other Brazilian regions. Milk production was mainly determined by farm size rather than by productivity indexes. Components of the total and effective operational costs that were most significant were feeding followed by labor. The comparative analysis indicated that, although C systems have technical indexes that are superior to those of the PB and SC systems, economic performance was independent of the intensification level. Thus, pasture systems are potentially competitive, provided that the producers are efficient.(AU)
Objetivou-se com este estudo investigar o efeito do sistema de criação sobre o desempenho técnico e econômico da atividade leiteira. A amostra incluiu dados reais de 61 rebanhos leiteiros localizados no estado de Minas Gerais, Brasil, durante os anos de 2002 a 2011. As fazendas foram agrupadas em função do nível de intensificação em pasto (PAST), semiconfinamento (SEMI) ou confinamento (CONF) e os índices técnicos e econômicos foram comparados. De forma geral, os resultados mostraram índices técnicos maiores do que a média de fazendas brasileiras, porém inferiores a índices internacionais ou de fazendas tecnificadas de outras regiões do Brasil. A produção de leite foi mais determinada pelo tamanho da fazenda do que pelos índices de produtividade e os itens do custo total e operacional efetivo que tiveram maiores representatividades foram, em ordem decrescente, alimentação e mão de obra. A análise comparativa mostrou que, embora sistemas CONF apresentaram índices técnicos superiores a PAST e SEMI, o desempenho econômico independeu do nível de intensificação. Portanto, sistemas a pasto são potencialmente competitivos, desde que os produtores sejam eficientes.(AU)
Assuntos
Animais , Feminino , Bovinos , Animais Domésticos/classificação , /crescimento & desenvolvimento , Bovinos , Indicadores EconômicosResumo
Ao longo do tempo, estimativas de valores genéticos e estudos de estrutura e diversidade genética das populações animais têm sido realizadas por métodos tradicionais. Utilizando apenas os registros de pedigree era possível obter informações valiosas sobre o potencial produtivo, a história da população e a diversidade genética. Consequentemente, informações de pedigree incorretas ou incompletas podiam reduzir consideravelmente a acurácia das análises. Atualmente, o uso de marcadores tem permitido a correção de informações contidas no pedigree, além de estimar o parentesco entre os animais de forma mais acurada, inclusive na ausência de pedigree. Estimativas mais acuradas de parâmetros populacionais, como endogamia, desequilíbrio de ligação e tamanho efetivo também são possíveis. Com esses parâmetros podemos avaliar a estrutura populacional e a diversidade genética, orientando estratégias de manejo e acasalamento nos rebanhos e na população como um todo. Nesse contexto, nossos objetivos gerais foram: i. Identificar um conjunto de pelo menos 1000 marcadores SNP, presentes nos principais chips comerciais, que permitam com precisão a atribuição de paternidade na raça Gir; ii. Estimar coeficientes de relacionamento em gado Gir com base em marcadores SNP; iii. Estimar coeficientes de endogamia em animais Gir por meio de corridas de homozigose; 4. Estimar tamanho efetivo da população com base no desequilíbrio de ligação em gado Gir. Nós utilizamos a abordagem da razão de verossimilhança para reconstruir o pedigree do gado Gir, a fim de corrigir eventuais erros de anotação e aprofundar as informações contidas nos registros de pedigree. A abordagem provou ser satisfatória, melhorando a profundidade do pedigree e mostrando que ele é bem estabelecido quanto à informações recentes. Os coeficientes de parentesco nos permitiram avaliar a distribuição dos valores para cada categoria do pedigree reconstruído. A estrutura populacional da raça Gir foi analisada por meio do tamanho efetivo, desequilíbrio de ligação e endogamia baseada em corridas de homozigose (ROH). Em que detectamos uma diminuição no tamanho efetivo, e níveis de endogamia, especialmente aqueles baseados em segmentos curtos de ROH, com valores moderados a altos, sugerindo a presença de gargalos no desenvolvimento da população de gado Gir no Brasil. Por outro lado, uma menor porcentagem de ROH residia nas classes de ROH mais longas. O presente estudo fornece informações importantes que podem ser agregadas ao Programa Nacional de Melhoramento do Gir Leiteiro (PNMGL) para aumentar a acurácia e o volume dos registros, além de auxiliar no desenvolvimento de estratégias de manejo de acasalamento.
Over time estimates of genetic values and studies of the structure and genetic diversity of animal populations have been carried out using traditional methods. Using only pedigree records, it was possible to obtain valuable information on their productive potential, history of population and genetic diversity. Consequently, incorrect or incomplete pedigree information could considerably reduce the accuracy of the analyzes. Currently, the use of markers has allowed the correction of information contained in the pedigree, in addition to estimating the relationship between animals more accurately, including in the absence of a pedigree. More accurate estimates of population parameters, such as inbreeding, linkage disequilibrium and effective size are also possible. With these parameters, we can evaluate the population structure and genetic diversity, guiding management and mating strategies in herds and the population as a whole. In this context, our general objectives were i. Identify a set of at least 1000 SNP markers, present in the main commercial chips, that accurately allow parentage assignment to be carried out in Gir breed; ii. Estimate relationship coefficients in Gir cattle based on SNP markers; iii. Estimate the inbreeding coefficients in Gir animals through runs of homozygosity; iv. Estimate the effective population size based on linkage disequilibrium in Gir cattle. We used the likelihood ratio approach to reconstruct the pedigree of Gir cattle, in order to correct any errors in annotation and to deepen the information contained in the pedigree records. The approach proved to be satisfactory, improving the depth of the pedigree and showing that it is well established in terms of recent information. The relationship coefficients allowed us to assess the distribution of values for each relationship category of the reconstructed pedigree. The population structure of the Gir breed was analyzed using effective size, linkage disequilibrium and inbreeding based on runs of homozygosity (ROH). In which a decrease in effective size and levels of inbreeding were detected, especially those based on short segments of ROH, with moderate to high values, suggesting the presence of bottlenecks in the genome of Gir cattle. On the other hand, a lower percentage of ROH resided in the longest ROH classes. The present study provides important information that can be added to the Brazilian Dairy Gir Breeding Program (PNMGL) to increase the accuracy and volume of records, in addition to assisting in the development of mating management strategies.