Phylogeny and structural insights of lipase from Halopseudomonas maritima sp. nov., isolated from sea sand / Filogenia y conocimientos estructurales de la lipasa de Halopseudomonas maritima sp. nov., aislado de la arena del mar

A Gram-negative, aerobic bacterial strain RR6T was isolated from the sea sand to produce lipase and proposed as a novel species of Halopseudomonas. The optimum growth occurred at 28–37 °C, and the pH was 6.0–8.0. The optimum growth occurred at 3.0 -6.5% (w/v) NaCl. The major cellular fatty acids were C10:0 3OH, C12:0, C16:1 ω7c/16:1 ω6c, 18:1 ω7c and/or 18:1 ω6c, and C16:0. The predominant polar lipids were phosphatidylglycerol, diphosphatidylglycerol, phosphatidylethanolamine, phosphatidylcholine, unidentified phospholipid, and unidentified lipids. The genome is 3.93 Mb, and the G + C content is 61.3%. The 16S rRNA gene sequences shared 99.73–99.87% sequence similarity with the closely related type strains of Halopseudomonas. The average nucleotide identity and average amino acid identity of strain RR6T with reference type strains were below 95–96%, and the corresponding in-silico DNA–DNA hybridization values were below 70%. Strain RR6T clustered with Halopseudomonas gallaeciensis V113T and Halopseudomonas pachastrellae CCUG 46540 T in the phylogenetic tree. Further, lipase produced by this bacterium belongs to α/β hydrolase lipase family and exhibits structural similarity to the lactonizing lipase. Based on the polyphasic analysis, the new isolates RR6T represent a novel species of Halopseudomonas for which Halopseudomonas maritima sp. nov. is proposed. The type strain is RR6T (= NBRC 115418 T = TBRC 15628 T).(AU)

Infección por Oerskovia turbata / Oerskovia turbata infection

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Impact of a stewardship program on bacteraemia in adult inpatients / Impacto del programa de intervención en bacteriemia en pacientes adultos

Background. Bloodstream infections (BSIs) are associated with considerable morbidity and mortality among inpatients. The aim of this study was to evaluate the impact of a stewardship program on clinical and antimicrobial therapy-related outcomes in patients with bacteraemia. Methods. Single-centre, before-and-after quasi-experimental study in adult inpatients. Over 1 January 2013 to 31 June 2013 all patients aged 18 years or older with a bacteraemia (interven-tion group, N=200) were compared to a historical cohort (1 Janu-ary 2012 to 31 December 2012) (control group, N=200). Results. Following blood culture results and adjusting for potential confounders, the stewardship program was associated with more changes to antibiotic regimens (adjusted odds ratio [ORa]: 4.6, 95% CI 2.9, 7.4), more adjustments to antimicrobial therapy (ORa: 2.4, 95% CI 1.5, 3.8), and better source control in the first five days (ORa 1.6, 95% CI: 1.0, 2.7). In the subgroup that initially received inappropriate empiric treatment (n=138), the intervention was associated with more antibiotic changes (OR: 3.9, 95% CI: 1.8, 8.5) and a better choice of definitive antimicrobial therapy (OR 2.3 95% CI: 1.2, 4.6). There were also more antibiotic changes in the subgroups with both Gram-negative (OR: 2.8, 95% CI: 1.6, 4.9; n=217) and Gram-positive (OR: 4.6, 95% CI: 1.8, 9.9; n=135) bacteraemia among those receiving the intervention, while the Gram-positive subgroup also received more appropriate definitive antimicrobial therapy (OR: 3.9, 95% CI: 1.8, 8.8). Conclusion. The stewardship program improved treatment of patients with bacteraemia and appropriateness of therapy (AU)

Introducción. Las bacteriemias están asociadas con una elevada morbilidad y mortalidad en pacientes hospitalizados. El objetivo del estudio fue evaluar el impacto de un programa de intervención clínica y de terapia antimicrobiana en pacientes con bacteriemia. Material. Estudio en un centro tipo cuasi-experimental pre y post-intervención en pacientes adultos hospitalizados. Desde 1 enero 2013 a 31 junio 2013, todos los pacientes mayores de 18 años en los que se identificaba una bacteriemia (grupo de intervención) se compararon con una cohorte histórica de bacteriemia (1 enero 2012 a 31 diciembre 2012) (grupo control). Resultados. Se incluyeron 200 pacientes en cada grupo. Después de ajustar por los posibles factores de confusión y tras conocer el resultado de los hemocultivos, el grupo de intervención tuvo más cambios de antibióticos (Odds ratio ajustada [ORa]: 4,6, intervalo de confianza [IC] 95%: 2,9-7,4), mayor adecuación del tratamiento antibiótico (ORa: 2,4, IC 95%: 1,5-3,8) y mayor control de la infección en los primeros cinco días (ORa 1,6, IC 95%: 1,0-2,7). En el subgrupo de pacientes que seguían un tratamiento inadecuado cuando se identificó el microorganismo en el hemocultivo (n =138), la intervención se asoció con un mayor cambio de antibiótico (OR: 3,9, IC 95%: 1,8-8,5) y una mejor elección final del antibiótico (OR: 2.3; IC 95%: 1.2-4.6). En el subgrupo de bacteriemia por gramnegativos (n=217), el programa de intervención en bacteriemia se asoció con un mayor cambio de antibiótico (OR: 2,8; IC 95%: 1,6-4,9) y en el subgrupo de bacteriemia por microorganismos grampositivos (n=135), el programa de intervención indujo un mayor cambio en el uso de antibióticos (OR: 4,6, IC 95%: 1,8-9,9) y una mejor elección final del tratamiento (OR: 3,9; 95% CI: 1,8-8,8). Conclusión. El programa de intervención en bacteriemia mejoró el tratamiento de los pacientes con bacteriemia y la adecuación del mismo (AU)

Papel de ceftazidima/avibactam en la terapéutica de las infecciones intraabdominales complicadas / Role of ceftazidime/avibactam in the therapy of complicated intraabdominal infections

Las infecciones intraabdominales complicadas son infecciones mixtas en las que predominan los bacilos gramnegativos, particularmente las enterobacterias, y que requieren cirugía inmediata con limpieza del foco de infección combinada con el tratamiento antimicrobiano adecuado. Este objetivo es cada vez más difícil de alcanzar con los antibióticos disponibles, en la medida que aumentan las resistencias, particularmente de los bacilos gramnegativos. Por ello, la aprobación de ceftazidima/avibactam, que destaca por su amplia actividad frente a los bacilos gramnegativos multirresistentes, incluidas las enterobacterias productoras de betalactamasas de espectro extendido de las clases A y C y de carbapenemasas, es bienvenida. Con los datos disponibles de 2 ensayos clínicos pivotales que incluyen a 1.058 pacientes con infecciones intraabdominales complicadas y la limitada experiencia postautorización, y con el fin de optimizar el uso de este nuevo antibiótico dentro del marco autorizado, se considera justificado su empleo como tratamiento empírico de las infecciones intraabdominales complicadas, junto con metronidazol, en 2 circunstancias: la primera, y por ahora más común, cuando exista riesgo de que estén causadas por enterobacterias productoras de betalactamasas de espectro extendido, para reducir la presión sobre los carbapenémicos y aumentar la diversificación terapéutica y, la segunda, cuando la sospecha etiológica sean enterobacterias productoras de carbapenemasas tipo KPC. Se considera también justificado el empleo de este antibiótico, como primera opción, en el tratamiento dirigido de las infecciones intraabdominales complicadas causadas por bacilos gramnegativos sensibles a él y resistentes al resto de betalactámicos y, como alternativa, en las infecciones intraabdominales complicadas causadas por bacilos gramnegativos solo sensibles a carbepenemas o por enterobacterias productoras de betalactamasas de espectro extendido (AU)

Complicated intra-abdominal infections (CIAIs) are mixed infections in which gram-negative bacilli (GNB) predominate, particularly enterobacteria, and require immediate surgery with drainage of infection foci, combined with appropriate antimicrobial treatment. This goal is increasingly difficult to achieve with the antibiotics available, as resistance increases, particularly for GNB. Therefore, the approval of ceftazidime/ avibactam, which stands out for its wide activity against multiresistant GNBs, including enterobacteria producing extended spectrum beta-lactamases (ESBL) of classes A and C, and carbapenemases, is welcome. With the available data, two pivotal clinical trials involving 1058 patients with CIAIs, and limited postauthorization experience, and in order to optimize the use of this new antibiotic, within the authorized framework, their use as an empirical treatment of the CIAIs, together with metronidazole, under two circumstances. The first, and at present more common, risk of being caused by ESBL-producing enterobacteria, to reduce the pressure on carbapenems and to increase therapeutic diversification, and the second when the etiological suspicion are KPC-producing Enterobacteriaceae. The use of this antibiotic, as a first option, is also justified in the targeted treatment of CIAIs caused by ceftazidime/avibactamsusceptible GNB and resistant to the rest of beta-lactams and, alternatively, in CIAIs caused by GNB alone susceptible to carbepenems or by ESBL-producing enterobacteria (AU)

Papel de ceftazidima/avibactam en poblaciones escasamente representadas en los ensayos clínicos / Role of ceftazidime/avibactam in populations poorly represented in clinical trials

Ceftazidima/avibactam es la combinación de una cefalosporina de tercera generación con actividad antipseudomónica -ceftazidima- con un nuevo inhibidor de las betalactamasas -avibactam-, con capacidad para inhibir betalactamasas de espectro extendido, AmpC y carbapenemasas, con la excepción de las metalobetalactamasas. Su uso está aprobado para infecciones complicadas del tracto urinario, infecciones intraabdominales complicadas y neumonía nosocomial, incluida la asociada a ventilación mecánica, fundamentalmente las causadas por bacterias gramnegativas multirresistentes cuando no existen otras alternativas. Desafortunadamente, muchos de los pacientes que con estas indicaciones se podrían beneficiar del uso de esta nueva combinación antibiótica en la práctica clínica, no han sido suficientemente representados en los ensayos clínicos pivotales. Es el caso de los pacientes pediátricos, o con insuficiencia renal grave, los pacientes críticamente enfermos o incluso aquellos con infecciones graves, cuya causa confirmada es un pató- geno multirresistente. También es posible encontrarse con pacientes con otro tipo de infecciones (p. ej., bacteriemia asociada a catéter, infecciones complicadas de piel y partes blandas, infección de pie diabético, etc.) causadas por microorganismos multirresistentes con escasas o nulas opciones terapéuticas al margen de ceftazidima/avibactam. En este contexto, las características farmacocinéticas de la combinación, así como su actividad microbiológica, hacen que, en un ámbito muy controlado, su uso fuera de indicación (off label) sea a priori la mejor opción. De hecho, la forma más segura de preservar la utilidad de esta combinación en el futuro sería garantizar su buen uso en el momento actual. Por otro lado, una herramienta que podría a ayudar a identificar la verdadera utilidad de esta combinación en la práctica clínica podría ser el diseño y puesta en marcha de un registro de utilización. Todo ello, sin olvidar la necesidad de diseñar y desarrollar ensayos clínicos que incluyan a las poblaciones insuficientemente representadas (AU)

Ceftazidime/avibactam is the combination of a third-generation cephalosporin with antipseudomonal activity -ceftazidime- with a new beta-lactamase inhibitor -avibactam- with the ability to inhibit extended-spectrum betalactamases (ESBL), AmpC and carbapenemases, with the exception of metallobeta-lactamases. Its use is approved for complicated urinary tract infections, complicated intra-abdominal infections and nosocomial pneumonia including ventilator-associated pneumonia, mainly those caused by multidrug-resistant Gram-negative bacteria when no other alternative is available. Unfortunately, many of the patients with these indications that could benefit from the use of this new antibiotic combination in clinical practice have not been adequately represented in the pivotal clinical trials. This is the case of paediatric patients or those with severe renal impairment, critically ill patients or with serious infections caused by confirmed multiresistant pathogens. It is also possible to find patients with other infections (e.g., catheter-related bloodstream infection, complicated skin and soft tissue infection or diabetic foot infection) caused by multiresistant microorganisms with few or no therapeutic options except ceftazidime/avibactam. Furthermore, in very controlled situations, off-label use is the best option due to the pharmacokinetic and microbiological characteristics of this combination. In fact, the safest way to preserve the activity of ceftazidime/avibactam in the future is by preserving correct use at the present time. Additionally, a strategy that could help to identify the true value of this combination in clinical practice could be to design and implement a registry of its use. It is important not to forget the need to design and develop clinical trials involving underrepresented populations (AU)

Traqueobronquitis por Elizabethkingia meningoseptica en una paciente portadora de traqueostomía / Tracheobronchitis by Elizabethkingia meningoseptica in a patient with tracheostomy

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Infección relacionada con catéter venoso / Venous catheter-related infections

La infección relacionada con los catéteres venosos centrales supone un aumento sustancial de morbimortalidad en los pacientes que los portan. En el momento actual, el incremento de bacterias multirresistentes, la reciente aparición de nuevos antibióticos y el desarrollo de nuevas guías de tratamiento hacen necesario su constante estudio. El objetivo de esta revisión es definir de forma breve conceptos epidemiológicos y patogénicos, para profundizar en las medidas preventivas y terapéuticas de dicho tipo de infección. Se aportan aspectos prácticos ante distintos escenarios clínicos como el sellado antibiótico del catéter venoso central y la retirada o mantenimiento del catéter(AU)

Central venous catheter-related infections can lead to a substantial increase in morbidity and mortality in patients. Nowadays, with the increase in multi-resistant bacteria, the recent appearance of new antibiotics, and the development of new treatment guidelines, means that this has to be constantly reviewed. The objective of this review is to briefly define the epidemiological and pathogenic concepts and to look in detail at the preventive and therapeutic measures of this type of infection. Practical aspects are presented of different clinical situations such as, antibiotic-lock of the central venous catheter, and the withdrawal or maintenance of the catheter(AU)

Aminoglucósidos / Aminoglycosides

Los aminoglucósidos permanecen como una clase de antimicrobianos de uso habitual y eficaz en la práctica clínica. A pesar de que existen diversos mecanismos de resistencia continúan siendo activos frente a gran parte de los bacilos gramnegativos aerobios. En la actualidad, aunque pueden utilizarse en monoterapia en las infecciones urinarias, se utilizan fundamentalmente en combinación con betalactámicos en infecciones graves por bacilos gramnegativos. Los conocimientos sobre los parámetros farmacocinéticos y farmacodinámicos han sugerido su uso en monodosis, cuya eficacia ha sido similar a la administración en multidosis en diversos estudios, los cuales también han demostrado una tendencia a menor toxicidad. Entre los efectos adversos, la nefrotoxicidad y la ototoxicidad requieren una vigilancia cuidadosa durante su administración (AU)

Queratitis por Acanthamoeba sp. en paciente que no utiliza lentes de contacto / Acanthamoeba sp. keratitis in a patient not wering contact lenses

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Bacteriemia por CDC EF-4 / CDC EF-4 bacterimia

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