Bioinformatic Identification of Signaling Pathways and Hub Genes in Vascular Dementia

Background: Vascular dementia (VaD) is a prevalent neurodegenerative disease characterized by cognitive impairment due to cerebrovascular factors, affecting a significant portion of the aging population and highlighting the critical need to understand specific targets and mechanisms for effective prevention and treatment strategies. We aimed to identify pathways and crucial genes involved in the progression of VaD through bioinformatics analysis and subsequently validate these findings. Methods: We conducted differential expression analysis, Weighted Gene Co-expression Network Analysis (WGCNA), Gene Ontology (GO), Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) pathway enrichment analysis, and Protein-Protein Interaction (PPI) analysis. We utilized pheochromocytoma 12 (PC12) cells to create an in vitro oxygen-glucose deprivation (OGD) model. We investigated the impact of overexpression and interference of adrenoceptor alpha 1D (ADRA1D) on OGD PC12 cells using TdT-mediated dUTP nick-end labeling (TUNEL), reverse transcription-quantitative polymerase chain reaction (RT-qPCR), western blot (WB), and Fluo-3-pentaacetoxymethyl ester (Fluo-3 AM) analysis. Results: We found 187 differentially expressed genes (DEGs) in the red module that were strongly associated with VaD and were primarily enriched in vasoconstriction, G protein-coupled amine receptor activity, and neuroactive ligand-receptor interaction, mitogen-activated protein kinase (MAPK) signaling pathway, and cell adhesion. Among these pathways, we identified ADRA1D as a gene shared by vasoconstriction, G protein-coupled amine receptor activity, and neuroactive ligand-receptor interaction. The TUNEL assay revealed a significant decrease in PC12 cell apoptosis with ADRA1D overexpression (p < 0.01) and a significant increase in apoptosis upon silencing ADRA1D (p < 0.01). RT-qPCR and WB analysis revealed elevated ADRA1D expression (p < 0.001) ... (AU)

Symbiotic Wolbachia bacteria in coccinellid parasitoids: genetic diversity, horizontal transfer, and recombination / Bacterias simbióticas Wolbachia en parasitoides coccinélidos: diversidad genética, transferencia horizontal y recombinación

Parasitoids, which constitute about 25% of all insects and attack arthropods of virtually all taxa, are considered the most suitable vectors for horizontal transmission of the symbiotic bacterium Wolbachia among insects. The parasitoids studied in this article develop in the larvae and pupae of ladybirds. For the first time, Wolbachia was found in parasitic wasp species of the genus Homalotylus (Hymenoptera: Encyrtidae) and from the subfamily Tetrastichinae (Hymenoptera: Eulophidae). To characterize the Wolbachia strains, six bacterial housekeeping genes were examined and compared with previously published Wolbachia gene sequences. The same bacterial strains were found in all individuals of each species of parasitic wasps collected in different places and at different times, which indicates the absence of contamination and testifies to the heritability of the symbionts in the studied chalcids. No evidence was found that the parasitic wasps were infected with Wolbachia, identical to the symbionts of their ladybirds hosts. We found one Wolbachia strain, wHom-2, which is a product of bacterial recombination from unrelated insects, including ladybirds. The lack of correspondence between the molecular phylogenies of Wolbachia strains and mitochondrial DNA of their hosts indicates horizontal transfers of Wolbachia among parasitic wasps of the genus Homalotylus and from the subfamily Tetrastichinae.(AU)

Análisis del rendimiento de la secuenciación del exoma clínico en hipogonadismo hipogonadotropo congénito teniendo en cuenta el grado de alteración del olfato / Diagnostic yield of clinical exome sequencing in congenital hypogonadotropic hypogonadism considering the degree of olfactory impairment

Introducción: El hipogonadismo hipogonadotropo congénito (HHC) puede presentarse de manera aislada o acompañado de anosmia o de malformaciones congénitas. Más de 30 genes han sido implicados en la patogénesis de HHC; además, se han descrito varios patrones de herencia asociados a esta entidad. La creciente disponibilidad de técnicas de secuenciación masiva (NGS) ha permitido que aumente el rendimiento diagnóstico del estudio de esta patología. Pacientes y métodos: Evaluamos el rendimiento diagnóstico del estudio mediante NGS de pacientes con HHC, usando la secuenciación del exoma clínico filtrado por paneles virtuales. Además, se analizó si el diseño de estos paneles, basándose en la presencia/ausencia de microsmia/anosmia aumentaban este rendimiento diagnóstico. Resultados: Usando un panel virtual compuesto de 34 genes pudimos confirmar el diagnóstico de HHC en cinco de nueve pacientes (55%). En dos de nueve individuos (22%) estudiados se obtuvieron resultados no concluyentes. La ausencia/presencia de microsmia para la elección de genes a estudiar no mejora el rendimiento diagnóstico. Conclusiones: El abordaje del estudio genético de pacientes con HHC puede variar en función de las técnicas disponibles en cada centro, por lo que la sensibilidad del test utilizado variará, dependiendo si se utiliza secuenciación de paneles, exoma clínico o exoma completo. El análisis de todos los genes relacionados con HHC independientemente de la presencia/ausencia de microsmia pareciera el abordaje con mejor rendimiento. (AU)

Introduction: Congenital hypogonadotropic hypogonadism (CHH) can present alone or in association with anosmia or other congenital malformations. More than 30 genes have been identified as being involved in the pathogenesis of CHH with different patterns of inheritance, and the increasing availability of next generation sequencing (NGS) has increased the diagnostic yield. Methods: We analysed the diagnostic yield of NGS in patients with CHH using the clinical exome filtered with virtual panels. We also assessed whether designing panels based on the presence/absence of microsmia increased the diagnostic yield. Results: The use of a 34-gene virtual panel confirmed the diagnosis of CHH in 5 out of 9 patients (55%). In 2 out of 9 (22%), the findings were inconclusive. Applying the presence/absence of microsmia criterion to choose genes for analysis did not improve the diagnostic yield. Conclusions: The approach to the genetic study of patients with CHH varies depending on the resources of each healthcare facility, so the sensitivity of testing may vary substantially depending on whether panels, clinical exome sequencing or whole exome sequencing (WES) are used. The analysis of every genes related to CHH regardless of the presence/absence of microsmia seems to be the best approach. (AU)

ACTN-3 and ECA genes expression do not influence the acute change in muscle mechanical and functional properties in youth handballers / Expresiones de los genes ACTN-3 y ECA no influyen en el cambio agudo de las propiedades musculares mecánicas y funcionales en jugadores juveniles de balonmano

The purpose of this study was to explore the potential relationship between ACTN-3 and ACE gene expression over the change in muscle mechanical and functional properties in youth handballers through a congested tournament. 30 players of the first handball division of Costa Rica participated in this study. The participants played a national tournament during three consecutive days (one match per day). The collection of genetic samples was through a mouth rinse with a 5% sucrose solution before the tournament. PCR tests were used to detect the alleles of the ACE and ACTN3 genes and the product ́s reaction was visualized by electrophoresis. Before and after each match, tensiomyography (TMG) and Countermovement jump (CMJ) tests were used to assess mechanical and functional properties respectively. Descriptive frequency analyses and a one-way analysis of variance of independent groups were the statistics test applied. The results showed that the most prevalent polymorphisms expression was ACTN-3 R-X (56.7%) and ECA I-D (43.3%). No significant differences (p> 0.050) were found between genes expressed in the mechanical responses (contraction time (TC), delay time (TD) and, maximum radial displacement (DM)) of the rectus femoral muscle of the dominant leg neither in performance in the test CMJ. Likewise, there was no significant change (p> 0.050) in muscle mechanical or functional properties post official matches. In conclusion, handball players have the genes ACE and ACTN. Nevertheless, it seems to have no influence of these genes on the mechanical or functional muscles acute responses. More investigations will be needed to explain and understand the real impact of this gene’s expression on muscle performance in handball players.(AU)

El propósito de este estudio fue explorar la relación potencial entre la expresión ACTN-3 y ACE sobre el cambio en las propiedades musculares mecánicas y funcionales de jugadores juveniles de balonmano a través de un torneo congestionado. Participaron 30 jugadores de la primera división de balonmano de Costa Rica. Los participantes jugaron un torneo nacional durante tres días consecutivos. La recolección de muestras genéticas se realizó mediante un enjuague bucal con una solución de sacarosa al 5% antes del inicio del torneo. Pruebas de PCR fueron usadas para detectar los aleros de los genes ACTN-3 y ACE y la reacción del producto fueron visualizadas por electroforesis. Antes y después de cada partido, se utilizaron las pruebas de tensiomiografía (TMG) y de salto contramovimiento (CMJ) para evaluar las propiedades mecánicas y funcionales respectivamente. Las pruebas estadísticas aplicadas fueron análisis descriptivo de frecuencias y un análisis de varianza de una vía para grupos independientes. Los resultados mostraron que la expresión de polimorfismos más prevalente fue ACTN-3 R-X (56,7%) y ECA I-D (43,3%). No se han encontrado diferencias significativas (p> 0,050) entre genes expresados en las respuestas mecánicas (tiempo de contracción (TC), tiempo de retardo (TD) and, máximo desplazamiento radial (DM)) del músculo recto femoral de la pierna dominante ni en el rendimiento en la prueba de CMJ. Asimismo, no hubo cambios significativos (p>0.050) en las propiedades mecánicas o funcionales de los músculos después de los partidos. En conclusión, los jugadores de balonmano tienen los genes ACE y ACTN, sin embargo, parece que estos genes no influyen en las respuestas agudas mecánicas o funcionales de los músculos. Se necesitan más investigaciones para explicar y comprender el impacto real de la expresión de estos genes en el rendimiento muscular de los jugadores de balonmano.(AU)

The KDM6B mutation: Phenotype and clinical characteristics—Report of a case / La mutación KDM6B: fenotipo y características clínicas—Informe de un caso

Introduction: Alterations in the genes of lysine methylation as Lysine-specific demethylase 6B (KDM6B) have been associated with multiple neurodevelopmental disorders. Until now, there are few cases in the literature attributed to KDM6B mutations. This gap may be due to the fact that the exome sequencing technique is still being implemented in routine clinical practice.Material and methods: A case is presented with its clinical and phenotypic characteristics. The sequence exome analysis was done with the Nimblegen SeqCap EZ MedExome capture kit+mtDNA 47Mb. The psychopathological approach from mental health was carried out through individual and family interviews, the Conner's questionnaires, ADHD rating scale, as well as the psychometry.Results: A frameshift variant in the KDM6B gene related to neurodevelopmental disorders with facial and body dysmorphia was obtained. The case was oriented as a neurodevelopmental disorder secondary to a genetic alteration and a comorbid Attention Deficit Hyperactivity Disorder (ADHD).Conclusions: The clinical peculiarities shared by patients identified with the KDM6B mutation, raises the need to recognize it as a particular entity. The possibility of applying the exome sequencing technique to patients with syndromic phenotype and developmental impairment may clarify its etiopathogenesis. It is highly probable that the complexity of these cases requires an approach by a multidisciplinary team that includes genetics, neurology and psychiatry, among other specialties. The coordinated approach is essential to have a comprehensive vision of the case. (AU)

Introducción: Las alteraciones en los genes de metilación de lisina como la desmetilasa 6B de lisina (KDM6B) se han asociado con múltiples trastornos del neurodesarrollo. Hasta ahora, existen pocos casos en la literatura atribuidos a mutaciones del gen KDM6B. Esta brecha puede deberse al hecho de que la técnica de secuenciación del exoma aún está en fase de implementación en la práctica clínica habitual.Material y métodos: Se presenta un caso con características clínicas y fenotípicas. El análisis de secuenciación exómica se realizó con el kit de captura Nimblegen SeqCap EZ MedExome + mtDNA 47Mb. La aproximación psicopatológica desde salud mental se realizó a través de entrevistas individuales, familiares, los cuestionarios Conners, ADHD rating scale, así como la psicometría.Resultados: Se obtuvo una variante de cambio en el gen KDM6B que ha sido relacionado con trastornos del neurodesarrollo con dismorfias faciales y corporales. El caso fue orientado como un trastorno del neurodesarrollo secundario a una alteración genética, un trastorno por déficit de atención e hiperactividad (TDAH).Conclusiones: Las peculiaridades clínicas que comparten los pacientes identificados con la mutación KDM6B, plantea la necesidad de reconocerla como una entidad particular. La posibilidad de aplicar la técnica de secuenciación del exoma a pacientes con fenotipo sindrómico y retraso generalizado en el desarrollo puede aclarar su etiopatogenia. Es muy probable que la complejidad de estos casos requiera el abordaje de un equipo multidisciplinar que incluya genetistas, neurólogos y psiquiatras, entre otras especialidades. El enfoque coordinado es fundamental para obtener una visión integral del caso. (AU)

Radon, Tobacco Exposure and Non-Small Cell Lung Cancer Risk Related to BER and NER Genetic Polymorphisms / El radón, la exposición al tabaco y el riesgo de desarrollar cáncer de pulmón de células no pequeñas en relación con polimorfismos genéticos de BER y NER

Introduction: Tobacco consumption and radon exposure are considered the first and second most common causes of lung cancer, respectively. The aim of this study was to analyze both whether selected genetic polymorphisms in loci that are in DNA repair pathways, are related to non-small-cell lung cancer (NSCLC) and whether they may modulate the association between residential radon exposure and lung cancer in both smokers and never smokers.Methods: A multicentre, hospital-based, case–control study with 826 cases and 1201 controls was designed in a radon-prone area. Genotyping was determined in whole blood and residential radon exposure was measured in participants’ dwellings.Results: Attending to tobacco exposure, the variant in the gene NBN (rs1805794) was associated with lung cancer in never smokers (OR 2.72; 95%1.44–5.2) and heavy smokers (OR 3.04; 95%CI 1.21–7.69). The polymorphism with the highest lung cancer association was OGG1 (rs125701), showing an OR of 8.04 (95%CI 1.64–58.29) for its homozygous variant genotype in heavy smokers. Attending to indoor radon exposure (>200Bq/m3), rs1452584, for its homozygous variant genotype, showed the highest association (OR 3.04 (95%CI 1.15–8.48).Conclusion: The genes analyzed seem to have no association with the fully adjusted model, but they might modulate lung cancer association when different categories of tobacco consumption are considered (i.e. heavy smokers). This association may similarly be elevated for those individuals having high indoor radon exposures, though at a minor extent. (AU)

Introducción: El consumo de tabaco y la exposición al radón se consideran la primera y la segunda causa más frecuentes de cáncer de pulmón, respectivamente. El objetivo de este estudio fue analizar si determinados polimorfismos genéticos en los loci que forman parte de la cascada de reparación del ADN se asocian con el cáncer de pulmón de célula no pequeña, y también si es posible que modifiquen la asociación entre la exposición al radón en el hogar y el cáncer de pulmón tanto en fumadores como en no fumadores.Métodos: Se diseñó un estudio multicéntrico hospitalario de casos y controles con 826 casos y 1.201 controles en un área proclive a la presencia de radón. Se determinó el genotipo en sangre y se midió la exposición al radón en el lugar de residencia de los participantes.Resultados: Analizando la exposición al tabaco, la variante del gen NBN (rs1805794) se asoció con el cáncer de pulmón en no fumadores (OR 2,72; IC 95% 1,44-5,2) y grandes fumadores (OR 3,04; IC 95% 1,21-7,69). El polimorfismo con mayor asociación con el cáncer de pulmón fue OGG1 (rs125701), con una OR de 8,04 (IC 95% 1,64-58,29) para la variante genotípica en homocigosis en grandes fumadores. En cuanto a la exposición al radón en interiores (>200Bq/m3), rs1452584 en homocigosis mostró la asociación más fuerte (OR 3,04; IC 95% 1,15-8,48).Conclusión: Los genes que se analizaron no muestran asociación con el modelo completamente ajustado, pero podrían modificar la asociación con el cáncer de pulmón cuando se consideran diferentes categorías de consumo de tabaco (esto es, grandes fumadores). Esta asociación podría aumentar de forma similar en aquellos individuos que están expuestos al radón en interiores, aunque en menor medida. (AU)

El género no está en los genes / Gender is not in genes

No disponible

Osteogénesis imperfecta causada por mutación en los genes COL1A1, CRTAP y LEPRE1. Estudio de 2casos / Osteogenesis imperfecta caused by COL1A1, CRTAP and LEPRE1 mutations. Report of 2cases

No disponible

Descubrimiento y manipulación de los Genes. Conexión con la Biología y la Medicina / Discovery and handling of Genes. Connetions with Biology and Medicine

En esta revisión se analiza el avance que han experimentado los conocimientos biológicos como consecuencia del descubrimiento y manipulación de los genes, las interacciones de la genética y la medicina, y las perspectivas de la edición genómica

This review analyses the advances of biological knowledge derived from the discovery and handling of genes, the connections between genetics and medicine and the perspectives of genomic editing

Identificación de nuevos genes candidatos para la retinopatía en diabéticos tipo 2. Estudio Valencia sobre Retinopatía Diabética (EVRD). Informe n.° 3 / Identification of new candidate genes for retinopathy in type 2 diabetics. Valencia Study on Diabetic Retinopathy (VSDR). Report number 3

OBJETIVO: Identificar genes implicados en los mecanismos patogénicos de la retinopatía diabética no proliferante, como estrés oxidativo, alteración de la matriz extracelular y/o apoptosis, para valorar el riesgo de desarrollo de la misma en una población de diabéticos tipo2 (DM2). MATERIAL Y MÉTODOS: Estudio de casos y controles en 81 participantes del Estudio Valencia sobre Retinopatía Diabética (EVRD), de ambos sexos y con edades comprendidas entre los 25 y 85 años, clasificados en: 1) grupo DM2 (n = 49), con RD (+RD; n = 14) y sin RD (−RD; n = 35), y 2)grupo control (GC; n=32). Se realizó entrevista personal, examen oftalmológico estandarizado y extracción de sangre que se procesó para analizar el ADN y determinar la expresión de: TP53, MMP9 y SLC23A2 en todos los participantes. El programa estadístico utilizado fue el SPSS v22.0. RESULTADOS: Los genes TP53 y MMP9 aumentaron su expresión en el grupo DM2 respecto al GC, aunque solo de manera significativa el gen MMP9 (TP53: 10,40 ± 1,20 vs. 8,23 ± 1,36, p = 0,084; MMP9: 1,45 ± 0,16 vs. 0,95 ± 0,16, p = 0,036) y el gen SLC23A2 disminuyó significativamente sus niveles en DM2 vs. GC (5,58 ± 0,64 vs. 11,66 ± 1,90, p = 0,026). Al subdividir el grupo DM2 según presencia de retinopatía, la expresión de los genes TP53, MMP9 y SLC23A2 mostró diferencias significativas entre los grupos DM2−RD, DM2+RD y GC (TP53: 9,95 ± 1,47 vs. 11,52 ± 2,05 vs. 8,23 ± 1,36, p = 0,038; MMP9: 1,47 ± 0,20 vs. 1,41 ± 0,27 vs. 0,95 ± 0,16, p = 0,021; SLC23A2: 5,61 ± 0,77 vs. 5,51 ± 1,21 vs. 11,66 ± 1,90, p = 0,018). CONCLUSIONES: Los genes reguladores de apoptosis (TP53) e integridad de la matriz extracelular (MMP9) podrían estar implicados en la susceptibilidad para el desarrollo/progresión de la RD, así como el gen SLC232A2 (transportador del ácido ascórbico) puede comportarse como protector del riesgo de padecer/progresar en la retinopatía

OBJECTIVE: To identify genes involved in the pathogenic mechanisms of non-proliferative diabetic retinopathy (NPDR), among which include oxidative stress, extracellular matrix changes, and/or apoptosis, in order to evaluate the risk of developing this retinal disease in a type2 diabetic (DM2) population. MATERIAL AND METHODS: A case-control study was carried out on 81 participants from the Valencia Study on Diabetic Retinopathy (VSDR) of both genders, with ages 25-85 years. They were classified into: (I) DM2 group (n = 49), with DR (+DR; n = 14) and without DR (-DR; n = 35), and (II) control group (GC; n = 32). The protocols included a personal interview, standardised ophthalmological examination, and blood collection (to analyse the DNA for determining the gene expression (TP53, MMP9, and SLC23A2) in the study groups. Statistical analyses were performed using the SPSS v22.0 program. RESULTS: The TP53 and MMP9 genes showed a higher expression in the DM2 group compared to the GC, although the difference was only significant for the MMP9 gene (TP53: 10.40 ± 1.20 V. 8.23 ± 1.36, P = .084; MMP9: 1.45 ± 0.16 vs. 0.95 ± 0.16, P = .036), and the SLC23A2 gene showed a significant lower expression in the DM2 vs CG (5.58 ± 0.64 vs. 11.66±1.90, P=.026). When sub-dividing the DM2 group according to the presence of retinopathy, the expression of the TP53, MMP9 and SLC23A2 genes showed significant differences between the DM2−RD, DM2+RD and GC groups (TP53: 9.95 ± 1.47 vs. 11.52 ± 2.05 vs. 8.23 ± 1.36, P = .038; MMP9: 1.47 ± 0.20 vs. 1.41 ± 0.27 vs. 0.95 ± 0.16, P = .021; SLC23A2: 5.61 ± 0.77 vs. 5.51 ± 1.21 vs. 11.66 ± 1.90, P = .018). CONCLUSIONS: Genes involved in extracellular matrix integrity (MMP9) and/or apoptosis (TP53), could be considered potential markers of susceptibility to the development/progression of NPDR. Interestingly, the SLC232A2 gene (ascorbic acid transporter) can be considered a protector of the risk of the development/progression of the retinopathy

Edad cronológica y edad biológica / No disponible

La edad cronológica no es siempre coincidente con la edad biológica, concepto establecido para valorar, tras alcanzar la edad adulta, la velocidad a la que se lleva a cabo el proceso de envejecimiento, el periodo más largo en la vida del ser humano y que determina la longevidad de cada individuo. La necesidad de tener marcadores que determinen esa edad biológica ha sido un reto desde hace años. Nuestro grupo ha comprobado como determinadas funciones de las células inmunitarias no sólo son importantes indicadores de salud, también de edad biológica y predictores de longevidad. La causa de los cambios que sufre el sistema inmunitario al envejecer, lo que constituye la inmunosenescencia, es la misma que afecta a los otros sistemas del organismo, un estrés oxidativo, que tiene lugar conjuntamente con un estrés inflamatorio. La teoría de la oxidación-inflamación del envejecimiento, propuesta por nosotros, además de sugerir ese hecho contempla la implicación del sistema inmunitario en la velocidad a la que cada individuo envejece. Se ha comprobado que los sujetos que alcanzan gran longevidad, como los centenarios, tienen unos leucocitos con menor oxidación e inflamación y funcionan mejor que los de personas de setenta. Por su parte aquellos sujetos adultos que tienen leucocitos más oxidados, presentan prematura inmunosenescencia y muestran una esperanza de vida menor. Se proponen una serie de estrategias de estilo de vida (nutrición, ejercicio, relaciones sociales,..) para mejorar el estado redox y la función inmunitaria y consecuentemente alcanzar una mayor longevidad saludable (AU)

Chronological age is not always coincident with biological age, a concept established to assess, after reaching adulthood, the speed at which the aging process is carried out, the longest period in human life and which determines The longevity of each individual. The need to have markers that determine that biological age has been a challenge for years. Our group has verified how certain functions of immune cells are not only important health indicators, also biological age and predictors of longevity. The cause of the changes that the immune system undergoes in aging, which constitutes the immunosenescence, is the same that affects to the other systems of the organism, an oxidative stress, that takes place together with an inflammatory stress. The theory of oxidation-inflammation of aging, proposed by us, in addition to suggesting that fact contemplates the implication of the immune system in the speed at which each individual ages. It has been proven that subjects who achieve great longevity, such as centenarians, have leukocytes with less oxidation and inflammation and work better than those of seventy. On the other hand, those adult subjects who have more oxidized leukocytes, present premature immunosenescence and show a shorter life expectancy. A series of lifestyle strategies (nutrition, exercise, social relationships, etc.) are proposed to improve redox status and immune function and consequently achieve greater longevity (AU)

Mecanismos epigenéticos en el desarrollo de la memoria y su implicación en algunas enfermedades neurológicas / Epigenetic mechanisms in the development of memory and their involvement in certain neurological diseases

Introducción: Hoy en día se acepta que el sistema nervioso central adulto posee una enorme flexibilidad morfofuncional que le permite realizar procesos de remodelación estructural aún después de haber alcanzado su desarrollo y maduración. Además del enorme número de genes que participan en el desarrollo de la memoria, los diferentes mecanismos epigenéticos conocidos también han sido involucrados en procesos de modificación neuronal normal y patológica y, por ende, en los mecanismos de desarrollo de la memoria. Desarrollo: Este trabajo fue llevado a cabo a través de una sistemática revisión de las bases de datos de publicaciones biomédicas sobre los aspectos genéticos y epigenéticos que participan en la función sináptica y la memoria. Conclusiones: La activación de la expresión génica, en respuesta a estímulos extrínsecos, ocurre también en células nerviosas diferenciadas. La actividad neuronal induce formas específicas de plasticidad sináptica que permiten la formación y almacenamiento de la memoria a largo plazo. Los mecanismos epigenéticos tienen un papel crucial en los procesos de modificación sináptica y en la formación y desarrollo de la memoria. Alteraciones en estos mecanismos producen déficit cognitivo y de memoria en padecimientos neurodegenerativos (enfermedad de Alzheimer y Huntington) así como en trastornos del desarrollo neurológico (síndrome de Rett, X-frágil y esquizofrenia). Los resultados obtenidos en diferentes modelos muestran, sin embargo, un escenario promisorio con tratamientos potenciales para algunos de estos padecimientos

Introduction: Today, scientists accept that the central nervous system of an adult possesses considerable morphological and functional flexibility, allowing it to perform structural remodelling processes even after the individual is fully developed and mature. In addition to the vast number of genes participating in the development of memory, different known epigenetic mechanisms are involved in normal and pathological modifications to neurons and therefore also affect the mechanisms of memory development. Development: This study entailed a systematic review of biomedical article databases in search of genetic and epigenetic factors that participate in synaptic function and memory. Conclusions: The activation of gene expression in response to external stimuli also occurs in differentiated nerve cells. Neural activity induces specific forms of synaptic plasticity that permit the creation and storage of long-term memory. Epigenetic mechanisms play a key role in synaptic modification processes and in the creation and development of memory. Changes in these mechanisms result in the cognitive and memory impairment seen in neurodegenerative diseases (Alzheimer disease, Huntington disease) and in neurodevelopmental disorders (Rett syndrome, fragile X, and schizophrenia). Nevertheless, results obtained from different models are promising and point to potential treatments for some of these diseases

Modelo predictivo multiparamétrico del estatus axilar en pacientes con cáncer de mama: carga tumoral total y perfil molecular. Estudio multicéntrico / A multiparametric predictive model of axillary status in patients with breast cancer: total tumoral load and molecular signature. A multicenter study

Objetivo. El objetivo de nuestro estudio es evaluar el impacto combinado de cada uno de los perfiles moleculares del cáncer de mama, subrogados inmunohistoquímicamente junto con la carga tumoral total del ganglio centinela como predictores de afectación metastásica en los ganglios axilares no centinela. Material y métodos. Se incluyeron 373 pacientes de carcinoma infiltrante de mama con ganglio centinela metastásico y linfadenectomía axilar, procedentes de seis hospitales españoles. Se aplicaron los criterios de ST Gallen para definir el perfil molecular. Se realizó un análisis multivariante para definir diferentes modelos predictivos y se estudiaron las distribuciones de densidad de probabilidad de la carga tumoral para cada perfil molecular en los casos con axila metastásica y no metastásica en los ganglios no centinela. Resultados. Hubo un 66% de linfadenectomías axilares metastásicas. Se obtuvieron 7 modelos predictivos cuyas áreas bajo la curva ROC oscilaron entre 0,65 y 0,77. El mejor modelo fue el basado en la carga tumoral total, tipo histológico, diámetro tumoral, grado, invasión linfovascular, perfil molecular y número total de ganglios centinela. Las mayores diferencias de densidad de probabilidad de la carga tumoral total se producen entre las distribuciones de casos positivos y negativos de los perfiles moleculares BH, TN y HER2. Conclusión. La inclusión del perfil molecular en el modelo mejora el área bajo la curva ROC, especialmente si se incluye también el número total de cganglios centinela. Se observan diferencias entre los distintos perfiles moleculares para el valor predictivo de la carga tumoral total (AU)

Objective. To evaluate the combined impact of each of the immunohistochemically surrogated molecular signatures (PM) of breast cancer subtype along with the total tumor load (CTT) of the sentinel node (SN) as a predictor of non-SN metastatic involvement. Methods. We included 373 patients diagnosed with infiltrating breast cancer with metastatic SN who underwent subsequent axillary lymph node dissection (ALND) from six hospitals. The surrogate MS for each case was defined as per ST Gallen definitions. A multivariate analysis was conducted to estimate the predictive model and normal kernel functions to fit the density distributions of the total tumoral load for each molecular signatures. Results. Metastatic involvement of the axillary lymph node was identified in 66% of the patients. We obtained seven different predictive models with an area under curve (AUC) ranging from 0.65 to 0.77. The best model was based on the CTT, histological type, tumor size, stage, lymphatic invasion, MS, and the total number of SN. The greatest differences in the density functions of the CTT were found in the PM for positive and negative cases of the BH, TN and HER2 subtypes. Conclusions. The inclusion of PM in the multivariate model improved the AUC, especially when the total number of sentinel nodes were included. Differences were observed in the impact of the CTT among the different smolecular profiles subtypes (AU)

Cirugía reductora de riesgo en el cáncer de mama / Risk-reducing surgery in breast cancer

Objetivo. Revisión de la bibliografía sobre la mastectomía profiláctica contralateral a nivel de riesgos y costes, así como su probable efecto en la supervivencia. Material y método. Se realizó una estrategia de búsqueda bibliográfica de mastectomía profiláctica con los siguientes descriptores: cirugía reductora de riesgo, cáncer de mama, incidencia, complicaciones, supervivencia libre de enfermedad, supervivencia global, mortalidad por cáncer de mama y costes. Resultados. Existe una tendencia general al aumento de la mastectomía profiláctica como cirugía reductora de riesgo contralateral en el cáncer de mama. Los principales factores que influyen en este proceso son: edad joven, raza blanca, estadio inicial de la enfermedad, expresión de receptores hormonales, uso de la RMN, nivel educacional alto, acceso a la reconstrucción, historia familiar de cáncer de mama y/o susceptibilidad genética para la mutación BRCA 1 y 2. Esta cirugía puede presentar comorbilidades que pueden dar lugar a reintervenciones y/o retraso del tratamiento adyuvante, además de la probabilidad de un impacto psicosocial al influir en variables como la imagen corporal y la sexualidad. La mastectomía profiláctica podría reducir el riesgo de cáncer de mama contralateral favoreciendo la simetría pero sin beneficios evidentes en la supervivencia. Las mejoras en el tratamiento adyuvante han favorecido la supervivencia de este tipo de pacientes con una tendencia a una menor proporción de cánceres de mama contralaterales. En pacientes portadoras de mutación BRCA 1/2 la mastectomía profiláctica contralateral ha resultado coste-efectiva. Conclusiones. La mastectomía profiláctica parece reducir el riesgo de aparición de cáncer de mama contralateral pero no está exenta de complicaciones. Es necesario un proceso de toma de decisiones donde se facilite una información realista de la cirugía, de la enfermedad individual de la paciente y de la posibilidad de un consejo genético (AU)

Objective. To conduct a literature review of contralateral prophylactic mastectomy in unilateral breast cancer as risk reducing surgery and its probable effect on survival. Material and method. We performed a systematic search of the literature on prophylactic mastectomy by using the following keywords risk reducing surgery, breast cancer, incidence, complications, disease-free survival, overall survival, mortality due to breast cancer, and costs. Results. There is a general trend to increased use of contralateral prophylactic mastectomy to reduce the risk of contralateral breast cancer. The main factors influencing this process are young age, Caucasian race, early-stage breast cancer, estrogen receptor positivity, the use of magnetic resonance imaging at diagnosis, high educational level, access to immediate breast reconstruction, and family history of breast cancer and/or genetic testing for the BRCA 1 and BRCA 2 mutations. This surgery may have complications, which can lead to reoperation and/or delay adjuvant therapy and may also have a psychosocial impact, influencing body image and sexuality. Mastectomy may reduce the risk of contralateral breast cancer, favoring symmetry, but with no apparent survival benefit. Improvements in adjuvant treatments have improved survival in these patients with a lower proportion of contralateral breast cancers. Contralateral prophylactic mastectomy is clearly cost-effective in patients carrying the BRCA 1/2 mutation. Conclusion. Prophylactic mastectomy appears to reduce the risk of contralateral breast cancer, although this procedure should be reconsidered because it is not free of complications. Realistic information on the intervention and the disease, as well as genetic counseling, are required for proper decision-making (AU)

Association between TGFBR2 gene polymorphisms and congenital heart defects in Han Chinese population / Asociación entre polimorfismos del gen TGFBR2 y defectos congénitos del corazón en la población China Han

Background: Transforming growth factor-β receptor II (TGFBR2) is a key component of TGF-β signaling pathway. TGFBR2 can be detected in the generation of heart. The mouse embryos of TGFBR2 gene knockout exhibited congenital heart defects. Methods: We conducted a case-control study to investigate the association between TGFBR2 gene polymorphisms and congenital heart defects in Han Chinese population. 125 patients with congenital heart defects and 615 unrelated controls were recruited. Two tagging single nucleotide polymorphisms (tagSNPs) in 5' upstream of TGFBR2 gene (rs6785358, -3779A/G; rs764522, -1444C/ G) were selected and genotyped by polymerase chain reaction (PCR)-restriction fragment length polymorphism (RFLP) assay. Results: A significant difference was seen in the distribution of genotypes between patients with congenital heart defects and controls for SNP rs6785358 (P=0.043). For SNP rs6785358 the carrier of the G allele (AG/GG genotype) showed a significantly higher risk of congenital heart defects compared with AA homozygotes (OR=1.545, 95% CI: 1.013-2.356). Further analysis by sex stratification indicated that individuals carrying G allele (AG/GG genotype) for SNP rs6785358 have a higher susceptibility to congenital heart defects (OR=2.088, 95%CI: 1.123-3.883, P=0.019) in males, but not females (OR=1.195, 95%CI: 0.666-2.146, P=0.55). No statistical significance was detected in the distribution of genotypes and allele frequencies for SNP rs764522 between patients and controls. Conclusion: Our result suggested that SNP rs6785358 of TGFBR2 gene was associated with increased risk of congenital heart defects in Han Chinese men and further research would be warranted (AU)

Antecedentes: Factor de crecimiento transformante β receptor II (TGFBR2) es un componente clave de la via de señalización de TGF - β.TGFBR2 puede ser detectado en la generación de corazón. Los embriones de ratón de TGFBR2 gene knockout mostraron defectos congénitos del corazon. Métodos: Hemos realizado un estudio de casos y controles para investigar la asociación entre polimorfismos del gen TGFBR2 y defectos congénitos del corazón en la población china han. 125 pacientes con defectos congénitos del corazón y 615 unrelated controles fueron reclutados. Marcado de dos polimorfismos de nucleótido único (tagsnps) en 5 'aguas arriba del gen TGFBR2 (rs6785358, - 3779a / g; rs764522, - 1444c / g) fueron seleccionados y genotipados por reacción en cadena de la polimerasa (PCR) - polimorfismos de longitud de fragmentos de restricción (RFLP) de ensayo. Resultados: Se observó una diferencia significativa en la distribución de genotipos entre pacientes con defectos congénitos del corazón y controles para SNP rs6785358 (P = 0043). La SNP rs6785358 el porteador del alelo G (AG / GG genotipo) mostraron un importante crecimiento y mayor riesgo de defectos congénitos del corazón en comparación con AA homocigotos (OR = 1.545, IC del 95%:1.013-2.356). Más análisis por sexo estratificación indicó que los individuos con alelo G (AG / GG genotipo) para SNP rs6785358 tienen una mayor susceptibilidad a defectos congénitos del corazón (OR = 2.088, IC del 95%: 1.123-3.883, p = 0.019) en machos, pero no en las mujeres (OR = 1.195, IC del 95%: 0.666-2.146, p = 0.55). No hay significación estadística fue detectado en la distribución de los genotipos y frecuencias de alelos de SNP rs764522 entre pacientes y controles. Conclusión: Nuestros resultados sugieren que el SNP rs6785358 de gen TGFBR2 se asoció con un mayor riesgo de defectos congénitos del corazón en los chinos han hombres y más investigación estaría justificada (AU)

Síndrome Schinzel-Giedion: nueva mutación en SETBP1 / Schinzel-Giedion syndrome: A new mutation in SETBP1

El síndrome Schinzel-Giedion (SSG) (#MIM 269150) es una enfermedad genética infrecuente, caracterizada por dismorfia cráneo-facial específica, anomalías congénitas múltiples y discapacidad intelectual grave. La mayoría de los pacientes fallece en los primeros años de vida. Se debe a mutaciones en el gen SETBP1, habiéndose descrito a la fecha un reducido número de pacientes con confirmación molecular. Presentamos a un paciente de 4 años con SSG asociado a la mutación c.2608G>T (p.Gly870Cys) en el gen SETBP1, no descrita previamente. Se revisan las características clínicas de esta enfermedad y su diagnóstico diferencial. Los rasgos dismórficos son muy característicos en el SSG. Su reconocimiento clínico es fundamental para alcanzar un diagnóstico precoz, planificar un correcto seguimiento y ofrecer asesoramiento genético familiar adecuado. A la fecha, este es el decimoséptimo paciente ublicado con mutación en el gen SETBP1, primero en España, contribuyendo a ampliar el conocimiento clínico y molecular de esta entidad

Schinzel-Giedion syndrome (SGS) (#MIM 269150) is a rare genetic disorder characterized by very marked craniofacial dysmorphism, multiple congenital anomalies and severe intellectual disability. Most affected patients die in early childhood. SETBP1 was identified as the causative gene, but a limited number of patients with molecular confirmation have been reported to date. The case is reported of a 4 and a half year-old male patient, affected by SGS. SETBP1 sequencing analysis revealed the presence of a non-previously described mutation: c.2608G>T (p.Gly870Cys). The clinical features and differential diagnosis of this rare condition are reviewed. Dysmorphic features are strongly suggestive of SGS. Its clinical recognition is essential to enable an early diagnosis, a proper follow-up, and to provide the family with genetic counseling. To date, this is the seventeenth SGS patient published with SETBP1 mutation, and the first in Spain, helping to widen clinical and molecular knowledge of the disease

Expression analysis of tumor-related genes involved in critical regulatory pathways in schwannomas

PURPOSE: Gene expression array analysis is providing key data on the potential candidate genes and biological pathways involved in schwannoma origin and development. In this way we performed expression array studies on tumor-related genes in schwannomas. METHODS: The GE Array Q Series HS-006 (SuperArray, Bethesda, MD, USA) was used to determine the expression levels of 96 genes corresponding to 6 primary biological regulatory pathways in a series of 23 schwannomas. RESULTS: We identified 15 genes down-regulated, primarily corresponding to signal transduction functions, and 26 genes up-regulated, most frequently involving cell adhesion functions. CONCLUSIONS: In addition to the NF2 inactivation (considered as an early step), variations of other biological regulatory pathways might play a key role in schwannoma (AU)