Efecto de una combinación nutritiva y selectiva con sustratos cromogénicos para diagnóstico de cocos grampositivos / Effect of a selective nutrient combination of chromogenic substrates for diagnosis of Grampositive cocci

INTRODUCCIÓN: la reemergencia de infecciones por bacterias grampositivas y el aumento de su patogenicidad, requiere de un diagnóstico microbiológico rápido y certero. En BioCen se desarrolló una composición cromogénica para el aislamiento, cultivo y diferenciación rápida y presuntiva de microorganismos grampositivos por medio de reacciones cromogénicas específicas, donde las bacterias gramnegativas se encuentran inhibidas de manera parcial o total. OBJETIVO: evaluar el efecto de la combinación de bases nutritivas, inhibidores selectivos y sustratos cromogénicos para aumentar la selectivad y capacidad diferencial para especies de los géneros Enterococcus, Streptococcus y Staphylococcus de importancia clínica. MÉTODOS: se evaluaron 21 cepas microbianas de la American Type Culture Collection y 24 aislamientos clínicos de Streptococcus, Enterococcus y Staphylococcus y otros microorganismos gramnegativos. Se evaluaron diferentes combinaciones de bases nutritivas, acetato de talio, ácido nalidíxico y sustratos cromogénicos para la promoción del crecimiento y diferenciación de las bacterias grampositivas. Se evaluó la funcionalidad microbiológica y se le determinaron los parámetros de calidad diagnóstica. RESULTADOS: la combinación de bases nutritivas permitió el desarrollo de los microorganismos grampositivos, en 24 h y su diferenciación por reacciones cromogénicas específicas. El crecimiento de los microorganismos gramnegativos fue inhibido por la acción del acetato de talio (0,014 g·L-1) y ácido nalidíxico (0,008 g·L-1), excepto Proteus mirabilis y Pseudomonas aeruginosa, cuyas características morfológicas no interfieren en la diferenciación de los microorganismos diana. La sensibilidad, especificidad y exactitud diagnósticas fueron del 100 %. CONCLUSIÓN: la combinación de las bases nutritivas, los inhibidores selectivos y los sustratos cromogénicos permitió el desarrollo y diferenciación de especies de los microorganismos evaluados. La inoculación en el medio cromogénico de microorganismos diana y no diana y la diferenciación de aquellas cepas donde se detectó color similar de las colonias por medio de pruebas complementarias rápidas, le confirió al medio elevadas sensibilidad, especificidad y exactitud diagnóstica.

INTRODUCTION: reemergence of Grampositive bacteria infections and the rise of their pathogenicity require a quick and accurate microbiological diagnosis. BioCen has developed a chromogenic composition for isolation, culturing and rapid and presumptive differentiation of gram-positive microorganisms through specific chromogenic reactions in which the inhibition of gramnegative bacteria is partial or total. OBJECTIVE: to evaluate the effect of a combination of nutrient bases, selective inhibitors and chromogenic substrates to increase the selectivity and differential capacity to detect Enterococcus, Streptococcus and Staphylococcus species of clinical importance. METHODS: twenty one microbial strains from the American Type Culture Collection and 24 clinical isolates of Enterococcus, Streptococcus and Staphylococcus and of other gramnegative microorganisms were evaluated. Various combinations of nutrient bases, thallium acetate, nalidixic acid and chromogenic substrates were also assessed for the promotion, growth and differentiation of grampositive bacteria. The microbiological functionality was evaluated whereas the diagnostic quality parameters were determined. RESULTS: the combination of nutrient bases allowed the development of grampositive microorganisms in 24 hours and their differentiation through specific chromogenic reactions. The growth of gramnegative microorganisms was inhibited by the thallium acetate (0.014 g·L-1) and nalidixic acid (0,008 g·L-1) except for Proteus mirabilis and Pseudomonas aeruginosa whose morphological characteristics do not interfere with differentiation of target microorganisms. Sensitivity, specificity and accuracy for diagnosis were 100 %. CONCLUSIONS: the combination of nutrient bases, selective inhibitors and chromogenic substrates allowed the development and differentiation of the evaluated microorganism species. The inoculation of target and non-target microorganisms in the chromogenic medium and the differentiation of those strains where a similar color of the colonies was detected by means of supplementary rapid tests provided the medium with high diagnostic sensitivity, specificity and accuracy.

Digestive tract microbiota in healthy volunteers

PURPOSE: The aim of this study was to standardize the methods of sample collection of mucus from the digestive tract and to determine the microbiota in healthy volunteers from Brazil, collecting samples from the mouth, esophagus, stomach, duodenum, jejunum, ileum, colon, and rectum. METHODS: Microbiota of selected healthy volunteers from the oral cavity (n=10), the esophagus (n=10), the upper digestive tract (n=20), and the lower digestive tract (n=24) were evaluated through distinct collection methods. Collection methods took into account the different sites, using basic scraping and swabbing techniques, stimulated saliva from the oral cavity, irrigation-aspiration with sterile catheters especially designed for the esophagus, a probe especially designed for upper digestive tract, and a special catheter for the lower digestive tract. RESULTS: (i) Mixed microbiota were identified in the oral cavity, predominantly Gram-positive aerobic and anaerobic cocci; (ii) transitional flora mainly in the esophagus; (iii) Veillonella sp, Lactobacillus sp, and Clostridium sp in the stomach and duodenum; (iv) in the jejunum and upper ileum, we observed Bacteroides sp, Proteus sp, and Staphylococcus sp, in addition to Veillonella sp; (v) in the colon, the presence of "nonpathogenic" anaerobic bacteria Veillonella sp (average 10(5) UFC) indicates the existence of a low oxidation-reduction potential environment, which suggests the possibility of adoption of these bacteria as biological markers of total digestive tract health. CONCLUSIONS: The collection methods were efficient in obtaining adequate samples from each segment of the total digestive tract to reveal the normal microbiota. These procedures are safe and easily reproducible for microbiological studies.

OBJETIVO: Padronizar os métodos de coleta do muco do trato digestivo e determinar a microbiota, em voluntários saudáveis no Brasil, coletando amostras da boca, esôfago, estômago, duodeno, jejunos e íleo, cólons e reto. MÉTODOS: A microbiota de voluntários saudáveis foi avaliada através de diferentes métodos de coleta: cavidade oral (n=10 voluntários), do esôfago (n=10), do trato digestivo alto (n=20) e do trato digestivo baixo (n=24). Métodos de coleta foram adotados em cada sítio restrito, usando derramar saliva, técnica de esfregar a mucosa e saliva estimulada da cavidade oral, irrigação-aspiração, cateteres específicos designados para o esôfago, sonda especial para o trato digestivo alto e cateteres especiais para o trato digestivo baixo. RESULTADOS: Identificados: (i) na cavidade oral, microbiota mista, predominando cocos aeróbios e anaeróbios Gram positivos; (ii) no esôfago, flora transitória; (iii) no estômago e duodeno, Veillonella sp, Lactobacillus sp and Clostridium sp; (iv) no jejuno e íleo proximal, Bacteróides sp, Proteus sp and Staphilococcus sp, além da Veillonella sp ; (v) no colon, foi revelada a presença "não patogênica" da bactéria anaeróbica Veillonella sp numa concentração média de 10(5) unidades formadoras de colônia, indicando um meio de baixo potencial de oxido-redução e a possibilidade de se conceituar esta bactéria como um marcador biológico do trato digestivo total em sadios. CONCLUSÃO: Estes métodos de coleta foram considerados eficientes para obtenção adequada de amostra em cada segmento do trato digestivo total para caracterizar a microbiota normal. Estes procedimentos são seguros e facilmente reprodutível para estudo microbiológico.

Atividade antimicrobiana in vitro de quinupristina/dalfopristina para cocos gram-positivos isolados de cinco centros brasileiros: resultado do estudo de vigilância L-SMART / Antimicrobial in vitro activity of quinupristin/dalfopristin against gram-positive cocci isolated from 5 Brazilian centers: results from the local smart (L-SMART) surveillance study

Há alguns anos tem-se verificado um aumento progressivo da resistência de alguns cocos gram-positivos a determinados antimicrobianos. Este aumento da resistência tem sido observado principalmente no ambiente hospitalar, e as bactérias mais comumente envolvidas são os Staphylococcus spp. e os Enterococcus spp. Devido a este fato, novos antimicrobianos são avaliados para o tratamento de infecções causadas por estas cepas multirresistentes. A associação quinupristina/dalfopristina (Q/D), também conhecida como Synercid©, é um antibacteriano da classe das estreptograminas, de uso endovenoso, composto por dois derivados semi-sintéticos da pristanamicina. A combinação das estreptograminas B e A na razão de 30:70 tem atividade antimicrobiana voltada para cocos gram-positivos, como Staphylococcus spp., Streptococcus spp., incluindo S. pneumoniae e Enterococcus faecium, sendo o E. faecalis habitualmente resistente. Neste estudo foi avaliada atividade in vitro de Q/D e outros oito antimicrobianos frente a 631 amostras de cocos gram-positivos isoladas de cinco centros brasileiros, complementadas com outras 20 cepas de E. faecium resistentes à vancomicina, provenientes dos Estados Unidos. Para a avaliação da sensibilidade aos antimicrobianos foi determinada a concentração inibitória mínima (MIC) pelo método do Etest (AB Biodisk, Solna, Suécia) e as cepas testadas foram: Staphylococcus aureus (n=267), Staphylococcus coagulase negativo (n=131), Streptoccus pneumoniae (n=130), Streptococcus beta-hemolíticos (n=28), Enteroccus faecalis (n=44) e E. faecium (n=51). A Q/D demonstrou excelente atividade contra Staphylococcus spp., independente de serem sensíveis ou resistentes à oxacilina. Para S. pneumoniae, a Q/D apresentou igualmente uma ótima atividade, inclusive para as cepas com resistência intermediária ou total para penicilina. Entre as cepas de E. faecium sensíveis à vancomicina, o MIC 90 de Q/D obtido foi de 3µg/ml, sendo que 45 por cento das cepas testadas foram sensíveis e 55 por cento apresentaram sensibilidade intermediária à associação. Desta forma, pode-se afirmar que a associação. Desta forma, pode-se afirmar que a associação Q/D representa uma nova opção para o tratamento endovenoso de infecções causadas por cocos gram-positivos, principalmente para as cepas multiresistentes, sendo também uma alternativa ao uso de glicopeptídeos

Atividade in vitro da cefepima em comparação com outras cefalosporinas de amplo espectro contra amostras clínicas de 18 hospitais brasileiros / In vitro activity of cefepime in comparisiom with others cephalosporins of extended-spectrum agaisnt clinical amostra of 18 brazilians hospitals

INTRODUÇÄO: A cefepima é uma cefalosporina de quarta geraçäo lançada recentemente tanto no Brasil quanto nos Estados Unidos. Trabalhos internacionais têm mostrado que esse composto apresenta maior potência tanto contra bacilos gram-negativos quanto cocos gram-positivos aeróbios, quando comparada com as cefalosporinas de terceira geraçäo. OBJETIVO: Avaliar a atividade antimicrobiana da cefepima em comparaçäo com ceftazidima, ceftriaxona, cefotaxima e imipenem em amostras clínicas isoladas em hospitais brasileiros. MATERIAL E MÉTODOS: Foram estudadas 982 amostras clínicas coletadas durante o periódo de dezembro de 1995 a março de 1996. Foi incluída apenas 1 amostra por paciente. As amostras foram testadas através do método de E test seguindo as recomendaçöes do National Commitee for Clinical Laboratory Standards (NCCLS). RESULTADOS: O espectro de ação da cefepima foi superior àquele apresentado pelas outras cefalosporinas de amplo espectro tanto contra bacilos Gram-negativos quanto contra cocos Gram-positivos. A superioridade da cefepima foi mais evidente contra Enterobacter sp. (MIC90, 2µg/ml), Serratia sp. (MIC90, 2µg/ml) e S. aureus sensível à oxacilina (MIC90,3µg/ml). Contra P. aeruginosa, a cefepima (MIC90, 16µg/ml) foi somente um pouco mais ativa que a ceftazidima (MIC90, 32µg/ml) e 8 a 16 vezes mais ativa que a ceftriaxona ou a cefotaxima (MIC90, > 256 µg/ml). DISCUSSÄO: Nossos resultados mostram que bactérias hospitalares, especialmente bacilos Gram-negativos, apresentam altas taxas de resistência às cefalosporinas no Brasil. Porém, uma parte dessas amostras multirresistentes permanecem sensíveis à cefepima

Screening and isolation of anti-Fusarium moniliforme compounds producing microorganisms from soil and corn

Fusarium moniliforme, fitopatógeno cosmopolita de milho, é responsável pela produçäo de micotoxina recentemente descoberta, denominada fumonisima. Com a finalidade de avaliar a inibiçäo de F. moniliforme, 34 antagonistas isolados de 60 amostras de solo e de 20 amostras de milho foram testados contra F. moniliforme 113F, produtor de fumonisina. O extrato bruto foi preparado com a cultura de microrganismos selecionados em caldo infuso de cérebro e coraçäo (BHI) e concentrados, adicionando-se etanol na proporçäo 1:1. A presença de organismos inibidores de F.moniliforme ocorreu em 29 amostras de solo, obtendo-se 36 microrganismos antagonistas. Referente ao milho, 15 amostras apresentaram microrganismos inibidores, permitindo o isolamento de 15 antagonistas. A caracterizaçäo destes 51 isolados demonstrou que 5 consistiram de leveduras, 3 cocos Gram-positivos , 3 cocos Gram-negativos e 40 bacilos Gram positivos, destacando-se a predominância do último grupo. Todos os 51 isolados