Caracterización de aislamientos de Klebsiella pneumoniae doble productores de carbapenemasas en un hospital universitario / Phenotypic and genotypic characterization of double carbapenemase producing Klebsiella pneumoniaeisolates in a University Hospital

La emergencia de aislamientos de Klebsiella pneumoniaedoble productores de carbapenemasas (KPC y NDM) es una de las consecuencias de la pandemia causada por SARS-CoV-2 que ha causado un impacto significativo en las tasas de resistencia a los antimicrobianos en las infecciones intrahospitalarias por esta enterobacteria. Estos aislamientos representan un desafío para los servicios de salud, por su detección y caracterización y posterior tratamiento. En este trabajo se describen los aislamientos portadores de KPC y NDM recuperados durante 2022 aislados de distintas muestras clínicas de pacientes internados en un hospital universitario de la Ciudad de Buenos Aires, se los caracteriza fenotípicamente y genotípicamente como portadores de ambas carbapenemasas y se destaca la excelente actividad in vitro de la combinación ceftazidima-avibactam y aztreonam en el tratamiento de estas infecciones en donde las alternativas terapéuticas estarían limitadas a antibióticos no ß-lactámicos con porcentajes de resistencia que superan el 70%

The emergence of double-carbapenemase (KPC and NDM) producing Klebsiella pneumoniae isolates is one of the consequences derived from the SARS CoV-2 pandemic, which has caused significant impact on the antimicrobial resistance rates in hospital acquired infections. These isolates represent a real challenge for Health Services due to their difficult detection and characterization and subsequent treatment. In the present work we describe the double carbapenemase producing isolates recovered during the year 2022 from clinical samples belonging to hospitalized patients at a University Hospital in Buenos Aires city, we report their phenotypic and genotypic characterization and the excellent "in vitro" activity of the ceftazidime-avibactam-aztreonam combination in the treatment of infections in which the therapeutical options are restricted to non ß- lactamic antimicrobials which hold resistance rates higher than 70%

Conhecimento dos profissionais de saúde sobre precauções específicas / Knowledge of health professionals about specific precautions / Conocimiento de profesionales de la salud sobre precauciones específicas

Objetivo: apresentar um diagnóstico situacional sobre o conhecimento dos profissionais de saúde sobre precauções específicas. Métodos: estudo transversal, realizado em um hospital filantrópico mineiro, com 127 profissionais de saúde de nível superior. Para a coleta de dados, utilizou-se o instrumento "Conhecimento dos profissionais de saúde sobre Precauções Específicas" com 29 questões de múltipla escolha, distribuídas em cinco eixos temáticos. Para a análise dos dados, foram executados procedimentos descritivos e diferentes testes estatísticos. Resultados: a média geral de acertos das questões foi 64,7%. O eixo temático "Acomodação e estrutura" apresentou mediana de acertos (43,6%) significativamente menor (p<0,001) que os demais eixos. O eixo "Cadeia epidemiológica de transmissão de microrganismos" apresentou mediana de 60% e os eixos "Cuidado com ambiente" e "Comunicação" tiveram mediana de 66,7%. A maior mediana de acertos ocorreu no eixo "Equipamento de proteção individual (80%)". Conclusão: a assertividade foi baixa em todos os eixos temáticos, o que pode comprometer a qualidade e a segurança da assistência prestada. Assim, verifica-se a necessidade de promover ações educativas com estratégias inovadoras, sensibilizando estes profissionais quanto à adesão dessas medidas de precaução. (AU)

Objective: to present a situational diagnosis about the knowledge of health professionals about specific precautions. Methods: cross-sectional study, conducted in a philanthropic hospital in Minas Gerais, with 127 health professionals of higher education. For data collection, was used the instrument "Knowledge of health professionals on Specific Precautions" with 29 multiple choice questions, distributed in five thematic axes. Descriptive procedures and different statistical tests were performed for the analysis of the data. Results: the overall average number of correct answers was 64.7%. The thematic axis "Accommodation and structure" presented a significantly lower median number of correct answers (p<0.001) than the other axes. The axis "Epidemiological chain of transmission of microorganisms" presented a median of 60% and the axes "Environment Care" and "Communication" had a median of 66.7%. The highest median of correct answers occurred in the axis "Personal protective equipment (80%)". Conclusion: assertiveness was low in all thematic axes, which can compromise the quality and safety of the care provided. Thus, there is a need to promote educational actions with innovative strategies, sensitizing these professionals about the adoption of these precautionary measures. (AU)

Objectivo: presentar un diagnóstico situacional sobre el conocimiento de los profesionales de la salud sobre precauciones específicas. Métodos: estudio transversal realizado en un hospital filantrópico de Minas Gerais, con 127 profesionales de la salud de nivel superior. Para la recopilación de datos, se utilizó el instrumento "Conocimiento de los profesionales de la salud sobre Precauciones Específicas", con 29 preguntas objetivas de múltiple elección, distribuidas en cinco ejes temáticos. Para el análisis de los datos, se realizaron procedimientos descriptivos y diferentes pruebas estadísticas. Resultados: la media general de respuestas correctas fue del 64,7%. El eje temático "Acomodación y estructura" mostró una mediana de respuestas correctas (43,6%) significativamente menor (p<0,001) que los otros ejes. El eje "Cadena epidemiológica de transmisión de microorganismos" tuvo una mediana del 60% y los ejes "Cuidado del medio ambiente" y "Comunicación" tuvieron una mediana del 66,7%. La mediana más alta de respuestas correctas se dio en el eje "Equipo de protección personal (80%)". Conclusión: el asertividad fue baja en todos los ejes temáticos, lo que puede comprometer la calidad y la seguridad de la atención prestada. Así, se comprueba la necesidad de promover acciones educativas con estrategias innovadoras, sensibilizando a estos profesionales en cuanto a la aplicación de las medidas de precaución. (AU)

Aislamiento y confinamiento: La otra pandemia en el ámbito social / Isolation and lockdown: The other pandemic in the social sphere / Isolamento e confinamento: A outra pandemia na esfera social

Introducción: El aislamiento y el confinamiento son medidas de alto impacto social que, a nivel mundial y en mayor o menor grado de intensidad, han provocado cambio, temporales o permanentes, respecto a la forma en que se realizan las interacciones sociales. Objetivo: realizar un estudio en el ámbito de lo doméstico y de las modificaciones externas que obligaron a un encierro drástico en la población colombiana en los primeros meses de la pandemia por la COVID-19. Materiales y métodos: Se realizó un estudio con enfoque cualitativo a partir de la aplicación de entrevistas en profundidad a 45 participantes residentes en la ciudad de Bucaramanga, Colombia, logrando la reconstrucción de rutas de vida para evaluar el momento más drástico del encierro de la población. Resultados: Desde los hallazgos, se resalta la capacidad de asimilación de las fuertes medidas de confinamiento, la colectivización de las justificaciones más legitimadas desde el discurso médico y la construcción de medidas de autocuidado constituidas en el ámbito de lo doméstico como lugar y espacio relacional clave para enfrentar la incertidumbre social frente a la ausencia de respuestas efectivas para el control del contagio y de la enfermedad. Conclusión: El drástico encierro de la población colombiana a partir de las medidas transitorias, conlleva una alta incertidumbre de los grupos familiares, pero también una respuesta generalmente positiva.

Introduction: Isolation and confinement are measures of high social impact that ­worldwide and to a greater or lesser degree of intensity­ have brought about temporary or permanent changes in how social interactions are conducted. Objective: To conduct a study on the domestic sphere and the external modifications that forced a drastic lockdown in the Colombian population during the first months of the COVID-19 pandemic. Materials and Methods: A qualitative study was carried out by conducting in-depth interviews with 45 participants living in the city of Bucaramanga, Colombia, reconstructing life pathways to evaluate the most drastic moment in the population's lockdown. Results: From the findings, the ability to assimilate strong lockdown measures, the collectivization of the medical discourse's most legitimate justifications, and the construction of self-care measures in the domestic sphere ­a key place and relational space to face social uncertainty in the absence of effective responses to control contagion and disease­ are highlighted. Conclusion: The drastic lockdown of the Colombian population due to the transitory measures entailed a high level of uncertainty for family groups but also a generally positive response.

Introdução: Isolamento e confinamento são medidas de alto impacto social que, em todo o mundo e em maior ou menor grau de intensidade, têm causado mudanças temporárias ou permanentes na forma como as interações sociais são realizadas. Objetivo: realizar um estudo no âmbito doméstico e as modificações externas que forçaram um confinamento drástico na população colombiana nos primeiros meses da pandemia de COVID-19. Materiais e Métodos: Realizou-se um estudo com abordagem qualitativa a partir da aplicação de entrevistas em profundidade a 45 participantes residentes na cidade de Bucaramanga, Colômbia, realizando a reconstrução de rotas de vida para avaliar o momento mais drástico do confinamento de a população. Resultados: A partir dos achados, destaca-se a capacidade de assimilação das medidas de confinamento forte, a coletivização das justificativas mais legítimas do discurso médico e a construção de medidas de autocuidado constituídas na esfera doméstica como lugar e espaço relacional fundamental. enfrentam a incerteza social na ausência de respostas eficazes para controlar o contágio e a doença. Conclusão: O confinamento drástico da população colombiana como resultado das medidas transitórias acarreta um alto grau de incerteza para os grupos familiares, mas também uma resposta geralmente positiva.

Evaluation of COVID-19 Patient Safety Compared to Non-COVID-19 Patients and Predisposing Factors of Nursing Errors / Evaluación de la seguridad del paciente con COVID-19 en comparación con pacientes sin COVID-19 y factores predisponentes de los errores de enfermería / Avaliação da segurança do paciente com covid-19 em comparação com o paciente sem covid-19 e fatores predisponentes de erros de enfermagem

Objetivo: o objetivo deste estudo foi determinar a segurança em pacientes internados com covid-19 em comparação com os que não tinham covid-19 e encontrar fatores predisponentes de erros de enfermagem segundo a percepção de enfermeiros. Materiais e método: trata-se de pesquisa descritivo-comparativa, que utilizou dados de pesquisas com 800 enfermeiros em oito hospitais iranianos em 2021, com base em três questionários com alta confiabilidade e validade, elaborados por pesquisadores, que incluíam dados sociodemográficos, índices de segurança do paciente e fatores predisponentes de erros de enfermagem. Os dados coletados foram analisados com ANOVA, teste t independente e software SPSS22. Resultados: as pontuações médias de segurança dos pacientes com e sem covid-19 foram 3,42 ± 0,17 e 3,74 ± 0,06, respectivamente. As maiores diferenças em segurança do paciente foram atribuídas às dimensões de controle de infecções (0,66) e queda do paciente (0,56). As causas mais comuns dos erros de enfermagem estiveram relacionadas com o aspecto gerencial (2,67 ± 1,39) e os fatores predisponentes mais comuns dos erros de enfermagem foram a alta carga de trabalho, a baixa proporção de enfermeiros por paciente e a fadiga. Conclusões: os pacientes com covid-19 têm menor segurança do que os que não apresentam a doença. Além disso, a gestão inadequada e a alta carga de trabalho levam a erros de enfermagem. Portanto, as autoridades devem elaborar estratégias adequadas para reduzir a carga de trabalho dos profissionais de saúde e melhorar a segurança do paciente, em especial daqueles com covid-19.

Objetivos: el presente estudio tuvo como objetivo determinar la seguridad en pacientes hospitalizados con covid-19 en comparación con los que no tenían covid-19 y encontrar factores predisponentes de errores de enfermería según la percepción de los enfermeros. Métodos: esta investigación descriptiva-comparativa empleó datos de encuestas de 800 enfermeros en ocho hospitales iraníes en 2021 mediante tres cuestionarios con alta confiabilidad y validez elaborados por investigadores que incluían datos sociodemográficos, indicadores de seguridad del paciente y factores predisponentes de errores de enfermería. Los datos recopilados se analizaron mediante ANOVA, prueba t independiente y el software SPSS22. Resultados: las puntuaciones medias de seguridad de los pacientes con y sin covid-19 fueron 3,42 ± 0,17 y 3,74 ± 0,06, respectivamente. Las mayores diferencias en seguridad del paciente se atribuyeron a las dimensiones de control de infecciones (0,66) y caída del paciente (0,56). Por otra parte, las causas más comunes de los errores de enfermería estuvieron relacionadas con el aspecto gerencial (2,67 ± 1,39), y los factores predisponentes más comunes de los errores de enfermería fueron la alta carga de trabajo, la baja proporción de enfermeros por pacientes y la fatiga. Conclusiones: los pacientes con covid-19 tienen menor seguridad que los que no presentan la enfermedad. Además, la gestión inadecuada y la alta carga de trabajo conducen a errores de enfermería. Por lo tanto, las autoridades deben diseñar estrategias adecuadas para reducir la carga de trabajo de los enfermeros y mejorar la seguridad del paciente, en especial en aquellos con covid-19.

Objectives: The present study aims to determine Patient Safety in hospitalized patients with COVID-19 compared to non-COVID-19 ones and find predisposing factors of nursing errors according to nurses' perceptions. Methods: This descriptive-comparative research employed data from 800 nurses in eight Iranian hospitals in 2021 using three researcher-made questionnaires of sociodemographic, patient safety indicators, and predisposing factors of nursing errors, with high reliability and validity. The collected data were analyzed using ANOVA, independent t-test, and the SPSS22 software. Results: The mean patient safety scores in patients with and without COVID-19 were 3.42 ± 0.17 and 3.74 ± 0.06, respectively. The highest differences in patient safety were attributed to infection control (0.66) and patient fall (0.56) dimensions. The most common causes of nursing errors were related to management (2.67 ± 1.39), and the most common predisposing factors of nursing errors were high workload, low ratio of nurses to patients, and fatigue. Conclusions: COVID-19 patients have lower safety than non-COVID ones. Also, improper management and high workload lead to nursing errors. Therefore, the authorities must devise appropriate strategies to reduce the nurses' workload and improve patient safety, especially in COVID-19 patients.

Lineamientos técnicos para el seguimiento del aislamiento domiciliar y atención ambulatoria de casos sospechosos y confirmados por COVID-19 (Tercera Edición) / Technical guidelines for monitoring home isolation and outpatient care for suspected and confirmed cases of COVID-19 (Third Edition)

Los presentes Lineamientos pretenden establecer las disposiciones para el seguimiento del aislamiento domiciliar, manejo ambulatorio de casos sospechosos y confirmados COVID-19, para reducir la transmisibilidad y contribuir a garantizar la protección de los familiares, convivientes, trabajadores de la salud y de toda la población

These Guidelines aim to establish the provisions for monitoring home isolation, outpatient management of suspected and confirmed COVID-19 cases, to reduce transmissibility and help ensure the protection of family members, cohabitants, health workers and the entire population

Reducción del periodo de aislamiento de casos confirmados de COVID-19 / Reducción del período de aislamiento de casos confirmados de COVID-19

ANTECEDENTES: Este informe se efectúa en atención a la solicitud de la Jefatura del Instituto Nacional de Salud. El objetivo es brindar la evidencia disponible sobre el efecto de la reducción del periodo de aislamiento de los casos confirmados de COVID-19 sobre la transmisión del SARS-CoV-2. Pregunta PICO: ¿En los casos confirmados de COVID-19, cuál es el efecto de la reducción del periodo de aislamiento sobre la transmisión del SARS-CoV-2? Criterios de elegibilidad: Los criterios de selección de los estudios fueron los siguientes: Ensayos clínicos aleatorizados o revisiones sistemáticas que reporten resultados para al menos uno de los desenlaces en casos confirmados de SARS-CoV-2. En ausencia de resultados para alguno de los desenlaces, se considerará los resultados de estudios de modelos matemáticos o normas sanitarias de otros países. Estudios publicados en idioma inglés y español. Se excluyeron cartas al editor, revisiones narrativas, estudios preclínicos (estudios in vitro o en modelos animales), artículos de opinión y manuscritos no revisados por pares. Métodos para la búsqueda e identificación de la evidencia: Los estudios fueron identificados a partir de las siguientes fuentes: Plataforma Living Overview of the Evidence (L·OVE) de la Fundación Epistemonikos (https://www.epistemonikos.org/en/), búsqueda al 10 de enero de 2022. Bases de datos electrónicas: MEDLINE/Pubmed, Embase y Cochrane Library (búsqueda al 10 de enero de 2022). Páginas web institucionales de los ministerios de salud de otros países (búsqueda al 10 de enero de 2022). Este informe constituye un reporte breve, la selección y extracción de los datos fue realizada por un solo revisor y no se efectuó una evaluación de riesgo de sesgo de los estudios identificados. RESULTADOS: No se encontraron revisiones sistemáticas, ECA o estudios clínicos que evalúen el efecto de la reducción del tiempo de aislamiento de los casos confirmados de COVID-19 sobre la transmisión del SARS-CoV-2. En cambio, se encontró una publicación que evaluó el efecto de la reducción del aislamiento sobre la transmisión del SARS- CoV-2, a través de simulaciones estadísticas. La población consistió en datos simulados de personas infectadas por SARS-CoV-2; la intervención que se evaluó fue la evaluación diagnóstica con pruebas moleculares (RT-PCR) y antigénicas (ambas pruebas fueron analizadas con diferentes niveles de sensibilidad), así como la cuarentena (con escenarios de 14 días o menos). Los desenlaces fueron la transmisibilidad del SARS-CoV-2, medido a través del riesgo de transmisión residual postcuarentena (PQTR, por sus siglas en inglés). Uno de los supuestos asumidos en el modelo fue que el número reproductivo R0 tiene una distribución normal con media de 2.10. Los resultados de las simulaciones mostraron que la evaluación diagnóstica disminuye significativamente el PQTR. En el caso de personas que se realizan una prueba molecular con una sensibilidad de 95% antes de salir de la cuarentena de 14 días, el PQTR disminuye de 0.12% a 0.006%. En cambio, el PQTR disminuye a 0.09% con una cuarentena de 10 días y con prueba molecular antes de salida. El estudio menciona también que las cuarentenas deben prolongarse si las pruebas diagnósticas tienen menor sensibilidad; por ejemplo, con una prueba diagnóstica con una sensibilidad de 80%, se necesitará de una cuarentena de 11 días. Aunque se realizaron numerosas y repetidas simulaciones sistemáticas para evaluar la efectividad de las medidas sanitarias, una limitación del estudio consiste en la modelación estadística que no contempla interacciones sociales no aleatorias. CONCLUSIONES: El objetivo de la nota técnica fue sintetizar información sobre el efecto de la disminución del periodo de aislamiento en casos confirmados de COVID-19 sobre la transmisibilidad del SARS-CoV-2. No se encontraron estudios clínicos, ECA o revisiones sistemáticas que hayan evaluado el efecto de la disminución del periodo de aislamiento sobre la transmisibilidad del SARS-CoV-2. Se encontró un modelo estadístico que mostró que el riesgo de transmisión residual postcuarentena se reduce de 0.12% a 0.006% con una cuarentena de 14 días y se reduce a 0.09% con una cuarentena de 10 días, cuando se realiza una prueba diagnóstica (prueba molecular con sensibilidad mayor de 95%) antes de la salida de la cuarentena. Las cuarentenas se pueden prolongar cuando las pruebas diagnósticas tienen menor sensibilidad. El Sistema Nacional de Salud del Reino Unido recomienda un periodo de cuarentena por 10 días completos para los casos confirmados de COVID-19 y las personas que estuvieron en contacto cercano. Si hay inicio de síntomas durante la cuarentena, se cuentan 10 días adicionales desde el día de inicio de síntomas. El CDC de Estados Unidos establece el aislamiento para casos confirmados de COVID-19, independientemente de presencia de sintomatología o estado de vacunación. El aislamiento dura 5 días completos (día cero es el día de diagnóstico y el día 1 es el primer día de aislamiento), si no hay síntomas durante este periodo. Luego la persona debe usar una mascarilla bien ajustada por otros 5 días cuando esté cerca de otras personas, tanto dentro como fuera del domicilio. Si los síntomas no se resuelven, el aislamiento persiste hasta el día que la persona no tiene fiebre durante 24 horas sin usar antipiréticos. Los países de Europa como España, Portugal, Francia redujeron sus periodos de cuarentena a 7 días. En Alemania la cuarentena se reduce hasta 10 días y se puede disminuir hasta 7 días, si hay una prueba molecular o de antígenos negativa. Los países de América Latina como Argentina y Colombia disminuyeron el periodo de cuarentena a 7 días.

Studies on the enzymatic specificity of diguanylate cyclases domains and the production of new second messengers / Estudos na especificidade enzimática de diguanilato ciclases e na produção de novos segundos mensageiros

In the first chapter, studies on substrate recognition and enzymatic activity of GGDEF domains are presented. Many proteins containing GGDEF domains are diguanylate cyclases (DGCs, EC 2.7.7.65), enzymes that catalyze the conversion of 2 GTP molecules into the second messenger c-di-GMP in prokaryotes. This molecule is primarily implicated in the transition between motile and sessile lifestyles, as well several other phenotypes. Redundancy and diversity of GGDEF domain sequences in many bacterial genomes raises the possibility that other enzymatic functions may yet be discovered. To test this hypothesis, i) the effect of point mutations on the structure and enzymatic activity of GGDEF domains is analyzed, ii) the enzymatic specificity of wild-type GGDEF domains from different proteins is also tested, and iii) when non-canonical products are detected, enzymatic models are studied to understand its preferential production. The principal results obtained from these studies are as follows. Seven mutants of the DGC PleD (a GGDEF containing-protein from Caulobacter crescentus) were constructed and the crystallographic structure of two of them was solved, showing that they are unlikely to bind the guanine moiety in its active site. Additionally, five mutants of XAC0610, another DGC from Xanthomonas citr, were constructed and their substrate specificities were evaluated. None of those mutants were able to use ATP as a substrate. Finally, seven different GGDEF domain-containing DGCs from different sources were expressed and purified and their enzymatic specificities were tested with several nucleotide triphosphates. One enzyme, GSU1658 from Geobacter sulfurreducens was particularly promiscuous and shown to produce c-di-GMP, c-di-AMP, c-di-IMP, c-di-2´dGMP, cGAMP, c-GIMP, and c-AIMP. Interestingly, XAC0610 was able to recognize 2´dGTP as substrate. Analysis of enzyme kinetics of XAC0610 in presence of 2´dGTP and/or GTP showed the preferential formation of the hybrid linear product pppGp2´dG. The second chapter present studies on cyanide metabolism in Bacillus with focus on the cyanide dihydratase of Bacillus safensis. Cyanide is widely used in industries due to its high affinity for metals. This same ability confers potent toxicity to this compound. Thus, industries must reduce the cyanide concentration from wastewater before its final disposal. Physical, chemical, and biological methods have been developed to achieve this goal, but knowledge about metabolic pathways and the biology of enzymes involved in cyanide degradation is still scarce. Here, the isolation of a Bacillus safensis strain from mine tailings in Peru is described. Classification of this strain was done through a comparative analysis of 132 core genomes of strains from the Bacillus pumilus group. Sequence analysis determined that a cyanide dihydratase (CynD, EC 3.5.5.1)) encoded in the genome of the isolated strain was likely the enzyme responsible for cyanide degradation. Confirmation of the cyanide degrading activity of CynD from this strain was achieved by cloning, expression and purification of the enzyme and its enzymatic characterization. CynD from this strain was active up to pH 9 and oligomerization patterns analyzed by SEC-MALS and electron microscopy showed that the enzyme forms large helical structures at pH 8 and smaller structures at higher pHs. Finally, we show that CynD expression is strongly induced in the presence of cyanide. The last two years of graduate studies were carried out in the context of the COVID-19 pandemic. Thanks to the large amount of publicly available genomic data, we were able to carry out studies on the worldwide dynamics of the spread of SARS-CoV-2 mutants forms. In the first year of the pandemic, genomic classification of 171,461 genomes showed the presence of five major haplotypes based on nine mutations. The worldwide distribution and the temporal evolution of frequency of these haplotypes was carefully analyzed. All the haplotypes were identified in the six regions analyzed (South America, North America, Europe, Asia, Africa, and Oceania); however, the frequency of each of them was different in each of these regions. As of September 30, 2020, haplotype 3 (or operational taxonomic unit 3, OTU_3) was the most prevalent in four regions (South America, Asia, Africa, and Oceania). OTU_5 was the most prevalent in North America and OTU_2 in Europe. Temporal dynamics of the haplotypes showed that OTU_1 became nearly extinct after 8 months of pandemic (November 2020). Other OTUs are still present in different frequencies all around the world, while currently generating new variants. Based on their temporal dynamics, a classification scheme of 115 SARS-CoV-2 mutations identified from 1,058,020 SARS-COV-2 genomes was also performed. Three types of temporal dynamics of mutations were identified: i) High-Frequency mutations are characterized by a rapid increase in frequency upon its appearance, ii) medium and iii) low-frequency mutations maintain mid or low-frequencies for several months and can be region-specific. Finally, we performed a correlation analysis of the effective reproduction number (Rt) of SARS-CoV-2 harboring the high-frequency mutation N501Y with the level of control measures adopted in specific jurisdictions. We show that Rt is negatively correlated with the level of control measures in eight of the nine countries analyzed. This negative correlation was similar when we analyzed the Rt of SARS-CoV-2 not-harboring N501Y. Thus, the control measures likely diminish the Rt of both SARSCoV-2 wild-type and N501Y

O presente trabalho está dividido em três capítulos sobre linhas de pesquisa diferentes desenvolvidas pelo autor durante o período de doutorado No primeiro capítulo, são apresentados estudos relacionados ao reconhecimento estrutural de substratos e análise enzimática de domínios GGDEF com atividade diguanilato ciclase (EC 2.7.7.65). As proteínas contendo domínios GGDEF estão relacionados à produção enzimática do segundo mensageiro c-di-GMP, a partir de duas moléculas de GTP, em procariotos. Esta molécula está principalmente envolvida na transição entre os estilos de vida móveis e sésseis, bem como vários outros fenótipos. Redundância e diversidade de sequências de domínio GGDEF aumentam a possibilidade de que outras funções enzimáticas ainda possam ser descobertas. Para testar esta hipótese, i) o efeito de mutações pontuais na estrutura e atividade enzimática dos domínios GGDEF é analisado, ii) a especificidade enzimática de domínios GGDEF de enzimas diferentes também é testada e iii) quando produtos não canônicos são detectados, modelos enzimáticos são estudados para entender sua produção preferencial. Como resultados mais importantes, sete mutantes do PleD (uma proteína contendo GGDEF) foram construídos e a estrutura cristalográfica de dois delas foi resolvida, mostrando que é improvável que eles liguem à porção guanina em seu sítio ativo. Além disso, cinco mutantes da proteína XAC0610 de Xanthomonas citri foram construídos e sua capacidade de usar ATP ou GTP como substrato foi avaliada. Nenhum desses mutantes foi capaz de usar ATP como substrato. Finalmente, sete outras proteínas contendo GGDEF foram purificadas e sua especificidade enzimática foi avaliada com vários trifosfatos de nucleotídeos. Uma enzima promíscua chamada GSU1658 mostrou produzir c-di-GMP, c-di-AMP, c-di-IMP, c-di-2´dGMP, c-GAMP, cGIMP e c-AIMP. Curiosamente, o XAC0610 foi capaz de reconhecer 2´dGTP como substrato. A análise da cinética enzimática de XAC0610 na presença de 2´dGTP e GTP mostrou a formação preferencial do produto linear híbrido pppGp2´dG. O segundo capítulo aborda estudos sobre o metabolismo do cianeto em Bacillus com foco na cianeto dihidratase de Bacillus safensis. O cianeto é amplamente utilizado nas indústrias devido à sua alta afinidade com os metais. Esta mesma capacidade confere toxicidade potente a este composto. Assim, as indústrias têm que reduzir a concentração de cianeto das águas residuais antes de sua disposição final. Métodos físicos, químicos e biológicos têm sido desenvolvidos para atingir esse objetivo, mas o conhecimento sobre as vias metabólicas e a biologia das enzimas envolvidas na degradação do cianeto ainda é escasso. Aqui, é descrito o isolamento de uma cepa de Bacillus safensis de rejeitos de minas no Peru. A classificação desta cepa foi feita através de uma análise comparativa de 132 core genomes de cepas do grupo de Bacillus pumilus. Em seguida, determinamos que uma cianeto dihidratase (CynD, EC 3.5.5.1) codificada no genoma da cepa isolada era provavelmente a enzima responsável pela degradação do cianeto. A confirmação da atividade degradante de cianeto de CynD desta cepa foi feita por clonagem, expressão e purificação da enzima e realização de caracterização enzimática. O CynD desta cepa é ativo até pH 9 e os padrões de oligomerização analisados por SEC-MALS mostraram que a enzima forma longas estruturas helicoidais em pH 8 e estruturas menores enquanto o pH aumenta. Finalmente, foi demonstrado que a expressão de CynD é fortemente induzida na presença de cianeto. Os últimos dois anos do doutorado foram realizados no contexto da pandemia COVID- 19. Vários laboratórios se dedicaram a gerar conhecimento para ajudar no combate à pandemia. Nesta situação e graças à grande quantidade de dados genômicos disponíveis publicamente, estudos sobre a dinâmica das mutações do SARS-CoV-2 foram realizados. No primeiro ano da pandemia, a classificação genômica de 171.461 genomas mostrou a presença de cinco haplótipos principais com base em nove mutações. A distribuição mundial e a mudança de frequência desses haplótipos foram analisadas cuidadosamente. Todos os haplótipos foram identificados nas seis regiões analisadas (América do Sul, América do Norte, Europa, Ásia, África e Oceania); no entanto, a frequência de cada um deles foi diferente em cada uma dessas regiões. Em 30 de setembro de 2020, o haplótipo 3 (ou unidade taxonômica operacional 3, OTU_3) era o mais prevalente em quatro regiões (América do Sul, Ásia, África e Oceania). OTU_5 foi o mais prevalente na América do Norte e OTU_2 na Europa. A dinâmica temporal dos haplótipos mostrou que OTU_1 parece perto da extinção após 8 meses de pandemia (novembro de 2020). Outros OTUs ainda estão presentes em diferentes frequências em todo o mundo, mesmo atualmente gerando novas variantes. Com base em sua dinâmica temporal, um esquema de classificação de 115 mutações SARS-CoV-2 identificadas a partir de 1.058.020 genomas SARS-COV-2 também foi feito. Três tipos de dinâmica temporal de mutações foram identificados: i) Mutações de alta frequência, ii) mutações de média frequência e iii) mutações de baixa frequência. Finalmente, foi analisada a correlação do número de reprodução efetiva (Rt) do SARS-CoV-2 que contém a mutação de alta frequência N501Y com o nível de medidas de controle, mostrando que seu Rt está negativamente correlacionado com o nível de medidas de controle em oito dos nove países analisados. Esta correlação negativa foi semelhante quando foi analisado o Rt de SARS-CoV-2 sem a mutação N501Y. Assim, as medidas de controle provavelmente diminuirão o Rt de SARS-CoV-2 tipo selvagem e N501Y

Repercussões das Políticas Nacionais de Controle da Hanseníase no Maranhão: registros históricos, artigos, relatos de experiências e narrativas / Repercussions of National Leprosy Control Policies in Maranhão: historical records, articles, experience reports and narratives

No final dos anos 40, a ciência descobria o tratamento para a hanseníase, medicamentos para a cura e interrupção do contágio, o que também viabilizou o fim do isolamento de indivíduos em leprosários nos anos subsequentes. Os avanços científicos, contudo, não impediram que o Brasil chegasse ao século XXI com regiões endêmicas de hanseníase. Em parte, a sociedade atual não trata o problema com preocupação, comporta-se, em geral, como se a doença tivesse sido eliminada, quando é fato que o Brasil ocupa a segunda posição entre os países com maior número de casos da doença, perdendo apenas para a Índia. A endemia hansênica é silenciada e faz novas vítimas, como se falar pouco a fizesse desaparecer, junto com os doentes. Também há de se convir que as gerações atuais precisaram conhecer e enfrentar diversos tipos de vírus, surtos, epidemias e pandemia. A hanseníase não detém o mesmo status de preocupação. A doença acomete os mais vulneráveis, geralmente os pobres, residentes em regiões isoladas. O assunto ganha pouco destaque na grande mídia e cabe, portanto, aos profissionais de saúde e ao poder público ofertarem os esclarecimentos devidos sobre a doença e o seu tratamento. Este livro é uma ferramenta histórica e traz visibilidade ao enfrentamento e aos avanços recentes no combate à hanseníase no Maranhão. O árduo trabalho tem alcançado resultados elogiosos e o reconhecimento de organizações brasileiras e internacionais. Com expectativa, desejo que a leitura dos fatos narrados neste material desperte maior interesse sobre o combate à hanseníase, de modo a garantir que o Maranhão e o Brasil estejam livres da doença ainda nesta geração.

Identification of new human mesenchymal stem cell biomarker by aptamers / Identificação de novos biomarcadores de células tronco mesenquimais de origem humana por meio de aptâmeros

Stem cells are undifferentiated cells that can be distinguished from others by their ability to self-renew and to differentiate into new specific cell types. Mesenchymal stem cells (MSC) are adult stem cells that can be obtained from different sources, such as adipose tissue, bone marrow, dental pulp, and umbilical cord. They can either replicate, originating new identical cells, or differentiate into cells of mesodermal origin and from other germ layers. MSC have been studied as new tools for regenerative therapy. Although encouraging results have been demonstrated, MSC-based therapies still face a great barrier: the difficulty of isolating these cells from heterogeneous environments. MSC are currently characterized by immunolabelling through a set of multiple surface membrane markers, including CD29, CD73, CD90 and CD105, which are also expressed by other cell types. Hence, the present work aimed to identify new specific biomarkers for the characterization of human MSC using DNA aptamers produced by the SELEX (Systematic Evolution of Ligands by EXponential Enrichment) technique. Our results showed that MSC from different origins bound to DNA candidate aptamers, that is, DNA or RNA oligonucleotides selected from random libraries that bind specifically to biological targets. Aptamer-bound MSC could be isolated by fluorescenceactivated cell sorting (FACS) procedures, enhancing the induction of differentiation into specific phenotypes (chondrocytes, osteocytes and adipocytes) when compared to the whole MSC population. Flow cytometry analyses revealed that candidate aptamers bound to 50% of the MSC population from dental pulp and did not present significant binding rates to human fibroblasts or lymphocytes, both used as negative control. Moreover, immunofluorescence images and confocal analyses revealed staining of MSC by aptamers localized in the surfacemembrane of these cells. The results also showed internal staining of human monocytes by our investigated aptamers. A non-specific control aptamer (CNTR APT) obtained from the random pool was then utilized to compare the specificity of the aptamers bound to the analyzed non-apoptotic cells, showing no staining for MSC. However, 40% of the monocytes bound to the CNTR APT. Normalized data based on the cells bound to candidate aptamers compared to those bound to the CNTR APT, revealed a 10 to 16-fold higher binding rate for MSC against 2-fold for monocytes. Despite its low specificity, monocyte-aptamer binding occurs probably due to the expression of shared markers with MSC, since monocytes are derived from hematopoietic stem cells and are important for the immune system ability to internalize/phagocyte external molecules. Given that, we performed a pull-down assay followed by mass spectrometry analysis to detect which MSC-specific protein or other target epitope not coexpressed by monocytes or the CNTR APT would bind to the candidate aptamer. Distinguishing between MSC and monocyte epitopes is important, as both cells are involved in immunomodulatory effects after MSC transplantations. ADAM17 was found to be a target of the APT10, emerging as a possible biomarker of MSC, since its involvement in the inhibition of the TGF signaling cascade, which is responsible for the differentiation of MSC. Thus, MSC with a higher stemness profile should overexpress the protein ADAM17, which presents a catalytic site with affinity to APT10. Another target of Apt 10 is VAMP3, belonging to a transmembrane protein complex that is involved in endocytosis and exocytosis processes during immune and inflammatory responses. Overall, proteins identified as targets of APT10 may be cell surface MSC biomarkers, with importance for MSC-based cell and immune therapies

Células tronco são células indiferenciadas que podem ser distinguidas de outros tipos celulares por meio da habilidade de se auto renovarem e de se diferenciarem em novos tipos celulares. Células tronco mesenquimais (MSC) são células tronco adultas encontradas em diferentes tecidos como tecido adiposo, polpa de dente e cordão umbilical. Estas células podem se autodividir em células idênticas ou se diferenciarem em células de origem mesodermal. Estas células têm sido estudadas em novas aplicações que envolvem terapia regenerativas. Embora resultados encorajadores tenham sido demonstrados, terapias que utilizam MSC ainda encontram uma grande barreira: a dificuldade no isolamento destas células a partir de um ambiente heterogêneo. MSC são caracterizadas por populações positivas em ensaios de imunomarcação para os epítopos membranares CD29, CD73, CD90 e CD105, presentes também em outros tipos celulares. Assim, o presente trabalho tem o objetivo de identificar novos biomarcadores de MSC de origem humana, utilizando aptâmeros de DNA produzidos pela técnica SELEX (Systematic Evolution of Ligands by EXponential Enrichment) como ferramenta. Nossos resultados mostraram que MSC de diferentes origens ligam-se a aptâmeros (oligonucleotídeos de DNA ou RNA que atuam como ligantes específicos de alvos moleculares) de DNA candidatos que atuam no isolamento de MSC por meio da técnica FACS de separação celular, promovendo uma maior indução de diferenciação em células específicas (condrócitos, osteócitos e adipócitos) comparada com a população total de MSC. Análises de citometria de fluxo mostraram que os aptâmeros candidatos se ligam a 50% das MSC de polpa de dente e não apresentam taxa de ligação significante para fibroblastos e linfócitos de origem humana - utilizados como controles negativo. Além domais, imagens de imunofluorescência e confocal mostraram ligação na superfície da membrana de MSC e a marcação interna de monócitos a estes aptâmeros. Portanto, um aptâmero controle (CNTR APT) foi utilizado para comparar a especificidade dos aptâmeros ligados a células viáveis, mostrando a não ligação deste aptâmero a MSC. Porém, 40% da população de monócitos ligou-se ao CNTR APT. Uma normalização baseada na comparação entre as taxas de ligação entre células ligadas com aptâmeros candidatos e o aptâmero controle gerou uma taxa de especificidade entre 10-16 vezes maior para MSC contra 2,5 vezes para os monócitos. Deste modo, embora os resultados tenham mostrado uma taxa de ligação entre monócitos e aptâmeros, as MSC ligadas aos aptâmeros candidatos possuem uma maior taxa de especificidade devido a uma maior presença de antígenos que são expressos em ambas as células. Um ensaio de Pull Down seguido de espectrometria de massas foi utilizado para a identificação de biomarcadores que se ligariam aos aptâmeros candidatos, e que não seriam co-expressos por monócitos e por antígenos ligados ao aptâmero controle. Deste modo, a proteína ADAM17 foi identificada nas amostras de APT10 ligadas às MSC. Tal proteína está relacionada à inibição de uma cascata de sinalização da família de proteínas TGF, responsável pela diferenciação de MSC. Assim, MSC com maior potencial tronco deveriam expressar ADAM17 em maior quantidade. Tal proteína apresenta um sítio catalítico que demonstra interagir com o APT10, de acordo com predição Docking entre proteína e DNA. Foi identificada também, a proteína VAMP3, que pertence a um complexo proteico transmembranar responsável pelos processos de endocitose e exocitose, e que podem ter um papel importante na liberação de citocinas e outras moléculas relacionadas às respostas imune e inflamatórias. Deste modo, o APT10 identificou proteínas importantes que devem estar relacionas com a melhora de imunoterapias que utilizam MSC

Adesão aos cuidados domésticos de casos suspeitos de Covid-19 em isolamento domiciliar / Adherence to home care of suspected COVID -19 cases in home isolation / Adherence to home care of suspected COVID -19 cases in home isolation

Objetivo: Analisar a associação entre as características sociodemográficas e a adesão aos cuidados domésticos de casos suspeitos de Covid-19 em isolamento domiciliar. Método: Estudo transversal, analítico. A coleta de dados ocorreu em unidade mista de saúde do Ceará, com 50 participantes suspeitos de Covid-19. Aplicou-se formulário de caracterização sociodemográfica, clínica e de avaliação dos cuidados em relação ao isolamento domiciliar. Para análise estatística, foram utilizados os testes Mann-Whitney e a razão de verossimilhança. Os princípios éticos das pesquisas com seres humanos foram seguidos. Resultados: A maioria dos homens (57,9%; p = 0,010) e das pessoas que conheciam alguém, pessoalmente, que teve/tem diagnóstico de Covid-19 (92,1%; p = 0,040) evitou aglomerações; 65,4% dos participantes com companheiro (a) descartaram o lixo adequadamente (p = 0,047); e 81,6% das pessoas com menor escolaridade aderiram à lavagem de roupas pessoais, de cama e toalhas com sabão comum e água (p = 0,043). Conclusão e implicações para a prática: As características sociodemográficas influenciaram a adesão a cuidados específicos, como evitamento de aglomerações, tratamento de lixo contaminado e lavagem de roupas pessoais, de cama e toalhas. Os cuidados domiciliares precisam ser mais enfatizados em consultas e pelos veículos de divulgação

Objective: To analyze the association between sociodemographic characteristics and adherence to home care of suspected COVID-19 cases in home isolation. Method: This is a cross-sectional, analytical study, and data collection took place in a health unit in Ceará, with 50 suspected COVID-19 participants. A sociodemographic, clinical characterization, and care evaluation form regarding home isolation was applied. For statistical analysis, the Mann-Whitney and likelihood ratio tests were used. The ethical principles of research with human beings were followed. Results: Most men (57.9%; p = 0.010) and people who personally knew someone diagnosed with COVID-19 (92.1%; p = 0.040) avoided crowded places, 65.4% of the participants with a partner discarded the garbage properly (p = 0.047), and 81.6% of people with less education adhered to washing personal clothes, bedding, and towels with common soap and water (p = 0.043). Conclusions and implications for practice: Sociodemographic characteristics influenced adherence to specific care, such as avoiding crowded places, treating contaminated waste, and washing personal clothes, bedding, and towels. Home care needs to be more emphasized in consultations and by means of dissemination

Objetivo: Analizar la asociación entre características sociodemográficas y adhesión a la atención domiciliaria de casos sospechosos de Covid-19 en aislamiento domiciliario. Método: Estudio transversal, analítico. La recolección de datos se llevó a cabo en una unidad de salud mixta en Ceará, con 50 participantes sospechosos de Covid-19. Se aplicó una forma de caracterización y evaluación sociodemográfica y clínica de los cuidados en relación al aislamiento domiciliario. Para el análisis estadístico se utilizaron pruebas de Mann-Whitney y de razón de verosimilitud. Se siguieron los principios éticos de la investigación con seres humanos. Resultados: La mayoría de los hombres (57,9%; p=0,010) y las personas que conocían a alguien personalmente que tenía/tiene un diagnóstico de Covid-19 (92,1%; p=0,040) evitaron los clusters; el 65,4% de los participantes con pareja (a) descartó la basura correctamente (p=0,047); el 81,6% de las personas con menor nivel educativo se adhirió a lavar la ropa personal, la ropa de cama y las toallas con agua y jabón común (p=0,043). Conclusión e implicaciones para la práctica: Las características sociodemográficas influyeron en la adhesión a cuidados específicos, como evitar aglomeraciones, tratar residuos contaminados y lavar ropa, sábanas y toallas personales. Es necesario hacer más hincapié en la atención domiciliaria en las consultas y mediante la difusión de información

Do isolamento à cogestão: a gestão autônoma da medicação (GAM) com familiares / From isolation to co-management: autonomous medication management (GAM) with family members / Del aislamiento a la cogestión: gestión autónoma de la medicación (GAM) con miembros de la familia

Este artigo apresenta a experiência de pesquisa-intervenção participativa da Gestão Autônoma da Medicação (GAM) com familiares. A GAM, de origem canadense, procura discutir criticamente o uso da medicação psiquiátrica de modo a fomentar a autonomia dos usuários desses medicamentos. No Brasil, o chamado projeto GAM-BR realizou a tradução, adaptação e validação do instrumento utilizado nesta abordagem, o Guia GAM. Seguimos as indicações teórico-práticas da abordagem enativa e empregamos a metodologia da cartografia, em especial a técnica da entrevista cartográfica. Como um projeto participativo, a validação do Guia contou com usuários e trabalhadores dos serviços de saúde mental brasileiros (Caps) como copesquisadores. A realização de um grupo com familiares de usuários na etapa de validação do Guia foi uma inovação na GAM-BR que possibilitou a inclusão desse grupo fundamental para a discussão acerca do tratamento medicamentoso. Podemos destacar dois efeitos processuais desse trabalho com familiares: a promoção de deslocamentos de ponto de vista e a promoção de corresponsabilização. Tais efeitos sugerem perspectivas para a GAM e para o trabalho em saúde mental, em um horizonte de inclusão e composição entre diferentes perspectivas.(AU)

This article presents the participatory research-intervention experience of Autonomous Medication Management (GAM) with family members. The GAM, a Canadian project, seeks to critically discuss the use of psychiatric medication to foster the autonomy of users of these drugs. In Brazil, the so-called GAM-BR project translated, adapted, and validated the instrument used in this approach, the GAM Guide. We follow the theoretical-practical indications of the enactive approach and employ the cartography methodology, in particular the cartographic interview technique. As a participatory project, the validation of the Guide included users and workers of the Brazilian mental health services (CAPS) as co-researchers. The creation of a group with family members of users in the validation phase was an innovation in GAM-BR that enabled the inclusion of this fundamental group for the discussion about drug treatment. We can highlight two processual effects of this work with family members: the promotion of displacements of points of view and the promotion of co-responsibility. These effects suggest perspectives for GAM and the work in mental health, in a horizon of inclusion and composition between different perspectives.(AU)

Este artículo presenta la experiencia participativa de intervención-investigación de la Gestión Autónoma de la Medicación (GAM) con miembros de la familia. La GAM es una guía que procede de Canadá y busca discutir críticamente el uso de medicación psiquiátrica para fomentar la autonomía de sus usuarios. En Brasil, el proyecto llamado GAM-BR realizó la traducción, adaptación y validación del instrumento utilizado en este enfoque, la Guía GAM. Se siguieron las indicaciones teóricas y prácticas del enfoque enactivo, y se utilizó la metodología de la cartografía, especialmente la técnica de entrevista cartográfica. Como proyecto participativo, la validación de la Guía incluyó a usuarios y a trabajadores brasileños de los centros de atención a salud mental (CAPS) como coinvestigadores. La creación de un grupo con familiares de usuarios en la etapa de validación de la Guía fue una innovación en GAM-BR por incluir a este grupo de fundamental importancia en la discusión sobre el tratamiento farmacológico. Es posible señalar dos efectos procesales de este trabajo con miembros de la familia: la promoción de los desplazamientos de perspectivas y la promoción de la corresponsabilización. Estos efectos sugieren perspectivas para GAM y el trabajo en salud mental, en un horizonte de inclusión y composición entre diferentes perspectivas.(AU)

Detección de SARS-CoV-2 en contactos estrechos asintomáticos de casos confirmados por diagnóstico molecular, provincia de Buenos Aires, Argentina / Detection of SARS-CoV-2 in asymptomatic close contacts of cases confirmed by molecular diagnosis, Buenos Aires province, Argentina

Resumen La detección de SARS-CoV-2 y su implicancia en el diagnóstico de COVID-19 han sido muy debatidas en la pandemia. El objetivo de este estudio fue evaluar el costo/beneficio de la detección de SARS-CoV-2 en contactos estrechos asintomáticos (CE) mediante el uso de distintas pruebas de diagnóstico molecular. Se estudiaron 51 CE de personas con diagnóstico de SARS-CoV-2 confirmado por RTqPCR, clasificadas por el umbral de ciclos (Ct) (<20, entre 20 y 30 y >30) en hospitales públicos de la provincia de Buenos Aires. Del total de contactos estudiados el 15,7% resultó confirmado para SARS-CoV-2; no hubo contactos positivos de casos con Ct>30. La cantidad de contactos positivos de casos con Ct<20 fue significativamente mayor que la de casos con Ct>20. Las muestras con Ct<20 se asociaron a una carga viral estimada de entre uno a cuatro órdenes de magnitud de diferencia con los rangos de Ct>20. Un 13,7% de contactos positivos fueron casos con Ct<20. De las muestras positivas confirmadas por PCR, correspondientes a la semana epidemiológica 1 de 2021 (SE1), sólo un 19,35% correspondían a muestras con Ct<20 y un 50,7% con Ct entre 20 y 30. Estos datos muestran un incremento de sólo un 3,7% de casos detectados. El esfuerzo por parte del sistema de salud pública para esta estrategia, con bajo poder predictivo, puede tener un efecto negativo para el cumplimiento del aislamiento de los contactos y podría generar una demora en los resultados de los casos sospechosos, sin aportar significativamente en el control de la pandemia.

Abstract The detection of SARS-CoV-2 and its implication in the diagnosis of COVID-19 have been highly debated in the pandemic. The objective of this study was to evaluate the cost/benefit of detecting SARS-CoV-2 in asymptomatic close contacts (CC) using different molecular diagnostic tests. A total of 51 CC of people with a diagnosis of SARS-CoV-2 confirmed by RTqPCR, classified by the cycle threshold (Ct) (<20, between 20 and 30 and >30), were studied in public hospitals in the Province of Buenos Aires. Of the total contacts studied, 15.7% were confirmed for SARS-CoV-2; there were no positive contacts of cases with Ct>30 positive. The number of positive contacts of cases with Ct<20 was significantly higher than that of cases with Ct>20. Samples with Ct<20 were associated with an estimated viral load of one to four orders of magnitude difference with Ct ranges >20. A total of 13.7% of positive close contacts were from cases with Ct<20. When studying positive samples with confirmed diagnosis by PCR, corresponding to 1 epidemiological week of 2021 (EW1), only 19.35% corresponded to samples with Ct<20 and 50.7% with Ct between 20 and 30. From these data it is shown that with the CC test only 3.7% of the cases were detected. The effort by the public health system for this strategy, with low predictive power, may have a negative effect on the fulfillment of the isolation of contacts and could generate a delay in the results of suspected cases, without contributing significantly to controlling the pandemic.

Resumo A detecção do SARS-CoV-2 e seu envolvimento no diagnóstico da COVID-19 têm sido muito discutidos durante a pandemia. O objetivo desse estudo foi avaliar a relação custo/benefício na detecção de SARSCoV- 2 em casos de contatos próximos assintomático (CP), por meio do uso de diferentes testes de diagnóstico molecular. Foram estudados 51 casos de CP de pessoas com diagnóstico de SARS-CoV-2 confirmado pelo RTqPCR, sendo classificados pelo limiar de ciclos (Ct) (<20, entre 20 e 30 e >30), em hospitais públicos da província de Buenos Aires. Do total de contatos estudados, 15,7% foram confirmados para SARS-CoV-2, não houve contatos positivos de casos com Ct>30. O número de contatos positivos de casos com Ct<20, foi significativamente maior que os casos com Ct>20. As amostras com Ct<20 foram associadas a uma carga viral estimada de uma a quatro ordens de magnitude de diferença com os intervalos de Ct>20. Dos casos positivos, 13,7% foram com Ct<20. Das amostras positivas confirmadas por PCR, correspondentes à semana epidemiológica 1 de 2021 (SE1), apenas 19,35% correspondiam a amostras com Ct>20 e 50,7% com Ct entre 20 e 30. Esses dados mostram incremento de apenas 3,7% de casos detectados. O esforço por parte do sistema de saúde pública para essa estratégia, com baixo poder preditivo, pode ter um efeito negativo no cumprimento do isolamento dos contatos e poderia gerar uma demora nos resultados dos casos suspeitos, sem contribuir significativamente para o controle da pandemia.

Sistema para la Gestión de Personas Aisladas: solución informática para el Centro de Aislamiento UCI-MINSAP / Sistema para la Gestión de Personas Aisladas: IT solution for the Isolation Center UCI-MINSAP

La aplicación Sistema para la Gestión de Personas Aisladas (SGPA-UCI) fue desarrollada para informatizar el proceso de ingreso, pruebas de PCR y egreso de personas aisladas en el centro de aislamiento instalado en la Universidad de las Ciencias Informáticas (UCI), como parte del enfrentamiento a la Covid-19 en Cuba. Para el desarrollo de la aplicación se utilizó Symfony como framework de desarrollo y para el monitoreo de los datos, se diseñaron tableros con el empleo de Grafana. La solución informática facilitó la gestión de más de 10 mil personas aisladas en el centro de aislamiento, en un período de aproximadamente 6 meses, obteniendo los datos primarios de las personas y facilitando el proceso de ingreso, preparación de PCR, procesamiento de resultados recibidos y proceso de egreso. El sistema para la gestión de personas aisladas permitió el proceso de seguimiento a las personas en el centro de aislamiento UCI-MINSAP durante el enfrentamiento a la pandemia Covid-19(AU)

The System for the Management of Isolated Persons (SGPA-UCI) application was developed to computerize the process of admission, PCR tests and discharge of isolated people in the isolation center created in the University of Computer Sciences (UCI), as part of the confrontation with Covid-19 in Cuba. For the development of the application, Symfony was used as a development framework and for data monitoring, dashboards were designed using Grafana. The computer solution simplified the management of more than 10 thousand people isolated in the isolation center, in a period of approximately 6 months, obtaining the primary data of the people and facilitating the process of admission, preparation of PCR, processing of received results and exit process. The system for the management of isolated people allowed the process of monitoring people in the UCI-MINSAP isolation center during the confrontation with the Covid-19 pandemic(AU)

Percepciones del personal sanitario sobre el manejo familiar del aislamiento social infantil durante la COVID-19 / Perceptions of Health Personnel on Family Management of Children's Social Isolation during COVID-19

Introducción: La propagación del nuevo coronavirus responsable de la COVID-19, amenaza la vida de millones de infantes, por lo cual, en la mayoría de los países, los niños han sido confinados en sus casas, lo que favorece de manera proporcional su protección. En sentido general, la familia no ha mostrado preparación para manejar con calidad la convivencia permanente de los niños en casa y se manifiestan violaciones del aislamiento físico de los menores. Objetivo: Analizar las percepciones del personal de salud sobre el cuidado y protección familiar de los niños a través del aislamiento social. Métodos: Se realizó un estudio de tipo exploratorio bajo un diseño transversal descriptivo, en el Consejo Popular 26 de Julio del municipio Holguín en el periodo comprendido entre diciembre de 2020 y mayo de 2021. Se aplicó una encuesta al personal sanitario (n = 17) asociado a las pesquisas en dicha área de salud. Resultados: Se identificaron fortalezas y debilidades en la atención médica a las familias con niños en la zona estudiada. El 100 por ciento de los participantes identificaron las pesquisas como una excelente herramienta para la promoción del cumplimiento del aislamiento de los pequeños. Según el criterio del 96,1 por ciento de los encuestados ocurrieron violaciones en el distanciamiento físico infantil en el área de salud seleccionada. Conclusiones: La familia tiene un rol primordial en el cumplimiento del confinamiento de los pequeños, a la vez, tiene la responsabilidad de lograr calidad en este proceso. No obstante, se evidencia la violación del distanciamiento infantil como resultado de la indisciplina familiar, que incrementa la vulnerabilidad de la infancia(AU)

Introduction: The spread of the new coronavirus responsible for COVID-19 threatens the lives of millions of infants, for which, in most countries, children have been confined to their homes, which proportionally favors their protection. In general terms, the family has not shown preparation to handle with quality the permanent coexistence of the children at home and there are violations of the physical isolation of the minors. Objective: To analyze the perceptions of health personnel about the family care and protection of children through social isolation. Methods: An exploratory study was carried out under a descriptive cross-sectional design, in 26 de Julio People´s Council in Holguín municipality from December 2020 to May 2021. A survey was applied to health personnel (n = 17) associated with the investigations in said health area. Results: Strengths and weaknesses in medical care for families with children in the studied area were identified. One hundred percent of the participants identified the studies as an excellent tool for promoting compliance with the isolation of children. According to the criteria of 96.1percent of the respondents, violations of children's physical distancing occurred in the selected health area. Conclusions: The family has a fundamental role in the fulfillment of the isolation of the children and, at the same time, it is committed to achieving quality in this process. However, the violation of childhood distancing is evident as a result of family indiscipline, which increases the vulnerability of childhood(AU)

Percepciones del enfermero en el cuidado del paciente con aislamiento de contacto infectado por Klebsiella Pneumoniae carbapenemasa / Perceptions of the nurse in the care of the patient with isolation of contact infected by Klebsiella Pneumoniae carbapenemase

La percepción como concepto es el proceso mediante el cual la conciencia integra los estímulos sensoriales sobre objetos, hechos o situaciones y los transforma en experiencia útil. El presente trabajo fue una investigación cualitativa de tipo fenomenológico, cuyo objetivo principal es analizar cuáles son las percepciones del enfermero en el cuidado del paciente con aislamiento de contacto infectado por Klebsiella Pneumoniae Carbapenemasa. Los participantes fueron los enfermeros del internado general y de la unidad de terapia intensiva. El análisis de datos se realizó a través de la transcripción de las entrevistas resaltando puntos fuertes y relacionándolos entre ellos para poder obtener dimensiones y características comunes. Los participantes firmaron un consentimiento informado en donde se les solicito permiso para la grabación. Los hallazgos se organizaron en 3 dimensiones: percepción emocional del enfermero que se expresa en el miedo, la incertidumbre y la necesidad de conocimiento, el apoyo entre colegas como medio para afrontar las emociones y la igualdad y comprensión a la hora de brindar cuidado al paciente aislado por Klebsiella Pneumoniae carbapenemasa. Percepción empática que se evidencia en la empatía del personal de enfermería frente al paciente con aislamiento de contacto por Klebsiella Pneumoniae carbapenemasa. Comportamiento en la relación enfermero-paciente expresa la importancia del conocimiento y evidencia como el actuar de enfermería mejora a través de la adquisición del mismo logrando mejora en la calidad de atención brindando seguridad y confianza, no solo al paciente, sino a su propio equipo. Conclusión: Los servicios de enfermería necesitan brindar un acompañamiento con orientación desde un primer momento al enfermero que brinda cuidado al paciente con aislamiento por Klebsiella Pneumoniae carbapenemasa[AU]

Summary: perception as a concept is the process by which consciousness integrates sensory stimuli on objects, events or situations and transforms them into useful experience. The present work was a qualitative phenomenological investigation, the main objective of which is to analyze the perceptions of the nurse in the care of the patient with contact isolation infected by Klebsiella Pneumoniae Carbapenemasa. The participants were the nurses from the general boarding school and the intensive care unit. The data analysis was carried out through the transcription of the interviews, highlighting strong points nd relating them to each other in order to obtain common dimensions and characteristics. The participants signed an informed consent requesting permission for the recording. The findings were organized in 3 dimensions: emotional perception of the nurse that is expressed in fear, uncertainty and the need for knowledge, support among colleagues as a means to face emotions, and equality and understanding when providing care to the patient. isolated by Klebsiella Pneumoniae carbapenemasa. Empathic perception that is evidenced in the empathy of the nursing staff towards the patient with contact isolation due to Klebsiella Pneumoniae carbapenemase. Behavior in the nurse-patient relationship expresses the importance of knowledge and evidence of how nursing actions improve through the acquisition of it, achieving an improvement in the quality of care, providing security and confidence, not only to the patient, but to their own team. Conclusion: Nursing services need to provide guidance with guidance from the first moment to the nurse who provides care to the patient with Klebsiella Pneumoniae carbapenemasa isolation[AU]

A percepção como conceito é o processo pelo qual a consciência integra estímulos sensoriais em objetos, eventos ou situações e os transforma em experiências úteis. O presente trabalho foi uma investigação qualitativa fenomenológica, cujo objetivo principal é analisar as percepções do enfermeiro no cuidado ao paciente com isolamento de contato infectado por Klebsiella Pneumoniae Carbapenemasa. Os participantes foram os enfermeiros do internato geral e da unidade de terapia intensiva. A análise dos dados foi realizada por meio da transcrição das entrevistas, destacando os pontos fortes e relacionando-os entre si a fim de obter dimensões e características comuns. Os participantes assinaram um termo de consentimento livre e esclarecido solicitando permissão para a gravação. Os achados foram organizados em 3 dimensões: percepção emocional do enfermeiro que se expressa no medo, incerteza e necessidade de conhecimento, apoio entre os colegas como forma de enfrentar as emoções e igualdade e compreensão no cuidado ao paciente. Isolado por Klebsiella Pneumoniae carbapenemasa. Percepção empática que se evidencia na empatia da equipe de enfermagem para com o paciente com isolamento de contato por Klebsiella Pneumoniae carbapenemase. O comportamento na relação enfermeiro-paciente expressa a importância do conhecimento e da evidência de como a ação de enfermagem se aprimora por meio de sua aquisição, alcançando uma melhoria na qualidade da assistência, proporcionando segurança e confiança, não só ao paciente, mas à própria equipe. Conclusão: Os serviços de enfermagem precisam fornecer orientações com orientações desde o primeiro momento ao enfermeiro que presta cuidados ao paciente com isolamento de Klebsiella Pneumoniae carbapenemasa[AU]

Manifestaciones orales y disfunción olfativa y gustativa en el síndrome respiratorio agudo severo por corona virus 2 (VIRUS SARS-COV-2): una revisión sistemáticaA / Oral Manifestations and Olfactory and Gustatory Dysfunction in Severe Acute Respiratory Syndrome Corona Virus 2 (SARSCov-2 Virus) Disease: A Systematic Review

La enfermedad del corona virus 2 del síndrome respiratorio agudo severo (virus SARS-CoV-2) apareció por primera vez en diciembre de 2019 en Wuhan, China, y desde entonces se ha extendido rápidamente por todo el mundo. Desde entonces, el brote de esta grave enfermedad viral se ha convertido en una amenaza global para la humanidad. El diagnóstico precoz y el aislamiento son las medidas más importantes necesarias para prevenir su propagación. La evidencia anecdótica reciente ha sugerido manifestaciones orales con o sin deterioro olfativo y gustativo en asociación con la enfermedad por coronavirus (COVID-19). La enzima convertidora de angiotensina-2 (ECA-2) se expresa en la mucosa oral en grandes cantidades y, por tanto, puede contribuir a las primeras manifestaciones de esta enfermedad viral mortal. Las manifestaciones bucales de la enfermedad por coronavirus pueden presentarse en forma de lesiones ulcerativas irregulares en relación con diferentes partes de la cavidad oral y, en particular, en relación con la mucosa adherida en la región del paladar duro, así como inflamación y posterior atrofia de las diversas papilas de la lengua. La disfunción olfativa y gustativa asociada también puede conducir a una pérdida parcial y / o incluso completa de la capacidad para oler y saborear en las primeras etapas del inicio de la enfermedad. La evidencia también ha sugerido la presencia de ácido nucleico del SARS-CoV-2 en la saliva humana, lo que la convierte en portadora de la enfermedad viral infecciosa y ayuda en su diagnóstico. Hemos buscado sistemáticamente la base de datos médica para el mismo y hemos revisado toda la literatura disponible hasta el 29 de junio de 2020

Severe acute respiratory syndrome corona virus 2 (SARS-CoV-2 virus) disease had first appeared in December 2019 in Wuhan, China and has been spreading quickly throughout the world since then. Since then, the outbreak of this severe viral disease has become a global threat to humanity. An early diagnosis and isolation are the most significant measures required to prevent its spread. Recent anecdotal evidence has suggested oral manifestations with or, without olfactory and gustatory impairment in association with corona virus disease (COVID-19). Angiotensin converting enzyme-2 (ACE-2) is expressed in oral mucosa in large amounts and can, thus, contribute in the early manifestations of this deadly viral disease. The oral manifestations of corona virus disease can occur in the form of irregular ulcerative lesions in relation to different parts of the oral cavity and particularly, in relation to the attached mucosa in the hard palate region as well as inflammation and subsequent, atrophy of the various tongue papilla. The associated olfactory and gustatory dysfunction can, also, lead to partial and/or, even a complete loss of the ability to smell and taste in the early stages of the disease onset. Evidence has, also, suggested the presence of SARS-CoV-2 nucleic acid in human saliva making it the carrier of the infectious viral disease as well as aiding in its diagnosis. We have systemically searched medical database for the same and have reviewed all the literature available up to 29th of June 2020.

Comportamiento de la covid-19 en Matanzas, a cien días de la pandemia en Cuba / COVID-19 behavior in Matanzas at 100 days of pandemic in Cuba

RESUMEN Introducción: la pandemia cambió el mundo y también el comportamiento de la provincia de Matanzas en los primeros cien días desde que apareció el primer caso en Cuba. Objetivo: caracterizar los factores sociodemográficos y clínico-epidemiológicos de los 207 pacientes confirmados con covid-19 en la provincia de Matanzas. Materiales y métodos: es una investigación descriptiva, longitudinal. Se estudió el comportamiento de los 207 pacientes positivos por covid-19 en la provincia de Matanzas. Los datos se tomaron a partir del 11 de marzo de 2020, fecha en que aparecen los primeros casos en Cuba, hasta el 18 de junio, en que se cumplieron cien días de la pandemia. Se analizaron factores sociodemográficos, como edad, sexo y lugar de convivencia, y factores clínico-epidemiológicos, como comorbilidades y fuente de infestación de los pacientes positivos. Resultados: predominaron los casos activos en los municipios Matanzas y Cárdenas, con dominio del sexo femenino y de las edades entre 40 y 59 años. La forma más frecuente de contagio fue la interna, y predominó el número de pacientes recuperados. Las comorbilidades de mayor incidencia en las muertes de pacientes de covid fueron la hipertensión arterial y la diabetes mellitus. Conclusiones: durante los primeros cien días de la pandemia en Cuba, el comportamiento varió en la provincia de Matanzas, motivado por los eventos de transmisión local abiertos en el territorio (AU).

ABSTRACT Introduction: the pandemic changed the world and also behavior in the province of Matanzas at 100 days from the first case in Cuba. Objective: to characterize socio-demographic and clinical-epidemiological factors of the 207 COVID-19-confirmed patients in the province of Matanzas. Materials and methods: this is a longitudinal, descriptive research where the behavior of the 207 COVID-19-positive patients found in the province of Matanzas was studied. Data were collected beginning from March 11, 2020, when the first cases ocurred in Cuba and until June 18, when it turned 100 days with the presence of cases infected with COVID-19. The authors analyzed socio-demographic factors, such as age, sex, living place, and clinical-epidemiological factors such as positive-patients comorbidities and infection source. Results: active cases predominated in the municipalities of Matanzas and Cardenas, with predominance of females and 40-59 years ages; the most frequent infection form was the internal one; recovered patients predominated, and as death causes prevailed several comorbidities such as arterial hypertension and diabetes mellitus. Conclusions: during the first 100 days of epidemic in Cuba, the behavior varied in the province due to the local transmission events opened in the territory (AU).