Estudo de associação do SNP1058240 no gene GATA3 com a hanseníase / SNP1058240 association study in GATA 3 gene with leprosy

RESUMO

A hanseníase é uma patologia causada pelo Mycobacterium leprae, bacilo que infecta macrófagos e células de Schwann, gerando lesões cutâneas e comprometendo nervos periféricos. Ocupa importante papel nas ações do Ministério da Saúde, uma vez que o Brasil está em segundo lugar no ranking mundial em número de casos da doença. Estudos prévios indicaram associação da região cromossômica 10p13 com a hanseníase paucibacilar. O gene GATA3, localizado na região 10p15, é assim um candidato posicional e funcional para a associação com a hanseníase, já que induz a resposta Th2 que é permissiva para a replicação do M. leprae. O polimorfismo genético rs10905284 no gene GATA3, já associado à hanseníase per se na população brasileira, está localizado em um intron próximo à região 3’UTR e a apenas 1220pb do polimorfismo rs1058240, que está em um sítio de ligação de microRNA. Assim, o objetivo do presente trabalho foi investigar a associação do SNP rs1058240 no gene GATA3 com a hanseníase per se aplicando um estudo de associação baseado em população. Para tanto, 1.785 indivíduos de duas amostras caso-controle foram incluídas no desenho do estudo 835 indivíduos de Rondonópolis-MT e 950 do Estado de São Paulo. A análise de regressão logística univariada, com e sem ajuste para as co-variáveis sexo e etnia, demonstrou que o alelo rs1058240 não está associado à hanseníase per se ou suas formas clínicas na população de Rondonópolis. Respeitando o desenho proposto inicialmente, a investigação da população do estado de São Paulo não foi realizada. A análise de desequilíbrio de ligação (LD) demonstrou que o polimorfismo rs1058240 não está em LD com o previamente associado à hanseníase (rs10905284). Assim, concluímos que o polimorfismo rs1058240 no gene GATA3 não está associado à hanseníase, e que o efeito observado para o rs10905284 é independente do polimorfismo avaliado neste estudo...

ABSTRACT

Leprosy is a disease caused by Mycobacterium leprae that infects macrophages and Schwann cells that leads to cutaneous injuries and compromises peripheral nerves. It plays an important role in the Brazilian Health Ministry actions, since Brazil ranks second in the worldwide rank in numbers of cases. Ligation studies have indicated an association of chromosomal region 10p13 to clinical forms of leprosy. The GATA3 gene at chromosomal region 10p15 is a functional and positional candidate gene for leprosy susceptibility. It induces Th2 immune response, which favors M. leprae replication. The rs10905284 genetic polymorphism, located in an intron of GATA3 and close to the 3’UTR region was associated to leprosy per se. It is 1,220bp from another polymorphism, rs1058240, which is in a microRNA binding site. Thus, our aim was to investigate if the rs1058240 polymorphism is associated to leprosy per se through a population-based association study. Therefore, 1,785 individuals from two case-control samples were included in the design: 835 individuals from Rondonópolis-MT and 950 from São Paulo state. The logistic regression models analysis did not point association between rs1058240 polymorphism and leprosy. The linkage disequilibrium (LD) analysis demonstrated that these markers are not in LD. We conclude that rs1058240 polymorphism is not associated to leprosy and that the effect of rs10905284 is independent...