Detalhe da pesquisa
1.
A generic framework for hierarchical de novo protein design.
Proc Natl Acad Sci U S A;
119(43): e2206111119, 2022 10 25.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-36252041
2.
SBILib: a handle for protein modeling and engineering.
Bioinformatics;
39(10)2023 10 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-37796837
3.
Macromolecular modeling and design in Rosetta: recent methods and frameworks.
Nat Methods;
17(7): 665-680, 2020 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-32483333
4.
Bottom-up de novo design of functional proteins with complex structural features.
Nat Chem Biol;
17(4): 492-500, 2021 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-33398169
5.
RosettaSurf-A surface-centric computational design approach.
PLoS Comput Biol;
18(3): e1009178, 2022 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-35294435
6.
Boosting subdominant neutralizing antibody responses with a computationally designed epitope-focused immunogen.
PLoS Biol;
17(2): e3000164, 2019 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-30789898
7.
SPServer: split-statistical potentials for the analysis of protein structures and protein-protein interactions.
BMC Bioinformatics;
22(1): 4, 2021 Jan 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-33407073
8.
Modeling Immunity with Rosetta: Methods for Antibody and Antigen Design.
Biochemistry;
60(11): 825-846, 2021 03 23.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-33705117
9.
Preclinical development of a humanized chimeric antigen receptor against B cell maturation antigen for multiple myeloma.
Haematologica;
106(1): 173-184, 2021 01 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-31919085
10.
CDK2-dependent activation of PARP-1 is required for hormonal gene regulation in breast cancer cells.
Genes Dev;
26(17): 1972-83, 2012 Sep 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-22948662
11.
rstoolbox - a Python library for large-scale analysis of computational protein design data and structural bioinformatics.
BMC Bioinformatics;
20(1): 240, 2019 May 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-31092198
12.
On the mechanisms of protein interactions: predicting their affinity from unbound tertiary structures.
Bioinformatics;
34(4): 592-598, 2018 02 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-29028891
13.
Rosetta FunFolDes - A general framework for the computational design of functional proteins.
PLoS Comput Biol;
14(11): e1006623, 2018 11.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-30452434
14.
Bispecific light T-cell engagers for gene-based immunotherapy of epidermal growth factor receptor (EGFR)-positive malignancies.
Cancer Immunol Immunother;
67(8): 1251-1260, 2018 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-29869168
15.
Amyloid-ß Peptide Nitrotyrosination Stabilizes Oligomers and Enhances NMDAR-Mediated Toxicity.
J Neurosci;
36(46): 11693-11703, 2016 11 16.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-27852777
16.
Targeting Importin-α7 as a Therapeutic Approach against Pandemic Influenza Viruses.
J Virol;
89(17): 9010-20, 2015 Sep.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-26085167
17.
InteractoMIX: a suite of computational tools to exploit interactomes in biological and clinical research.
Biochem Soc Trans;
44(3): 917-24, 2016 06 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-27284060
18.
ArchDB 2014: structural classification of loops in proteins.
Nucleic Acids Res;
42(Database issue): D315-9, 2014 Jan.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-24265221
19.
Frag'r'Us: knowledge-based sampling of protein backbone conformations for de novo structure-based protein design.
Bioinformatics;
30(13): 1935-6, 2014 Jul 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-24603983
20.
iLoops: a protein-protein interaction prediction server based on structural features.
Bioinformatics;
29(18): 2360-2, 2013 Sep 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-23842807