Searching for plant-derived antivirals against dengue virus and Zika virus.

BACKGROUND: The worldwide epidemics of diseases as dengue and Zika have triggered an intense effort to repurpose drugs and search for novel antivirals to treat patients as no approved drugs for these diseases are currently available. Our aim was to screen plant-derived extracts to identify and isolate compounds with antiviral properties against dengue virus (DENV) and Zika virus (ZIKV). METHODS: Seven thousand plant extracts were screened in vitro for their antiviral properties against DENV-2 and ZIKV by their viral cytopathic effect reduction followed by the 3-(4,5-dimethylthiazol-2-yl)-2,5-diphenyltetrazolium bromide (MTT) method, previously validated for this purpose. Selected extracts were submitted to bioactivity-guided fractionation using high- and ultrahigh-pressure liquid chromatography. In parallel, high-resolution mass spectrometric data (MSn) were collected from each fraction, allowing compounds into the active fractions to be tracked in subsequent fractionation procedures. The virucidal activity of extracts and compounds was assessed by using the plaque reduction assay. EC50 and CC50 were determined by dose response experiments, and the ratio (EC50/CC50) was used as a selectivity index (SI) to measure the antiviral vs. cytotoxic activity. Purified compounds were used in nuclear magnetic resonance spectroscopy to identify their chemical structures. Two compounds were associated in different proportions and submitted to bioassays against both viruses to investigate possible synergy. In silico prediction of the pharmacokinetic and toxicity (ADMET) properties of the antiviral compounds were calculated using the pkCSM platform. RESULTS: We detected antiviral activity against DENV-2 and ZIKV in 21 extracts obtained from 15 plant species. Hippeastrum (Amaryllidaceae) was the most represented genus, affording seven active extracts. Bioactivity-guided fractionation of several extracts led to the purification of lycorine, pretazettine, narciclasine, and narciclasine-4-O-ß-D-xylopyranoside (NXP). Another 16 compounds were identified in active fractions. Association of lycorine and pretazettine did not improve their antiviral activity against DENV-2 and neither to ZIKV. ADMET prediction suggested that these four compounds may have a good metabolism and no mutagenic toxicity. Predicted oral absorption, distribution, and excretion parameters of lycorine and pretazettine indicate them as candidates to be tested in animal models. CONCLUSIONS: Our results showed that plant extracts, especially those from the Hippeastrum genus, can be a valuable source of antiviral compounds against ZIKV and DENV-2. The majority of compounds identified have never been previously described for their activity against ZIKV and other viruses.

Molecular profiling of drug resistant isolates of Mycobacterium tuberculosis in the state of Santa Catarina, southern Brazil.

Drug resistance is a global threat and one of the main contributing factors to tuberculosis (TB) outbreaks. The goal of this study was to analyse the molecular profile of multidrug-resistant TB (MDR-TB) in the state of Santa Catarina in southern Brazil. Fifty-three MDR Mycobacterium tuberculosis clinical isolates were analysed by spoligotyping and a partial region of the rpoB gene, which is associated with rifampicin resistance (RMP-R), was sequenced. Some isolates were also distinguished by their mycobacterial interspersed repetitive units (MIRU). S531L was the most prevalent mutation found within rpoB in RMP-R isolates (58.5%), followed by S531W (20.8%). Only two MDR isolates showed no mutations within rpoB. Isolates of the Latin American Mediterranean (LAM) family were the most prevalent (45.3%) found by spoligotyping, followed by Haarlem (9.4%) and T (7.5%) families. SIT106 was found in 26.4% of isolates and all SIT106 isolates typed by MIRU-12 (5 out of 14) belong to MIT251. There was a high correlation between the S531W mutation and the LAM family mainly because all SIT2263 (LAM9) isolates carry this mutation. Among isolates with the S531W mutation in rpoB MIRU demonstrates a cluster formed by four isolates (SIT2263 and MIT163) and very similar profiles were observed between eight of the nine isolates. Better characterisation of TB isolates may lead to new ways in which to control and treat TB in this region of Brazil.

RAP1 GTPase overexpression is associated with cervical intraepithelial neoplasia.

RAP1 (RAS proximate 1), a small GTP-binding protein of the RAS superfamily, is a putative oncogene that is highly expressed in several malignant cell lines and types of cancers, including some types of squamous cell carcinoma. However, the participation of RAP1 in cervical carcinogenesis is unknown. We conducted a cross-sectional study of paraffin-embedded cervical biopsies to determine the association of RAP1 with cervical intraepithelial neoplasia (CIN). Standard and quantitative immunohistochemistry assessment of RAP1 expression in fixed tissue was performed on 183 paraffin-embedded cervical biopsies that were classified as normal or non-dysplastic mucosa (NDM) (n = 33); CIN grade 1 (n = 84) and CIN grade 2/3 (n = 66). A gradual increase in RAP1 expression in NDM < CIN 1 < CIN 2/3 (p<0.001) specimens was observed and was in agreement with the histopathologic diagnosis. A progressive increase in the RAP1 expression levels increased the risk of CIN 1 [odds ratio (OR) = 3.50; 95% confidence interval (CI) 1.30-10.64] 3.5 fold and the risk of CIN 2/3 (OR = 19.86, 95% CI 6.40-70.79) nearly 20 fold when compared to NDM. In addition, stereotype ordinal regression analysis showed that this progressive increase in RAP1 expression more strongly impacted CIN 2/3 than CIN 1. Our findings suggest that RAP1 may be a useful biomarker for the diagnosis of CIN.

Molecular profiling of drug resistant isolates ofMycobacterium tuberculosis in the state of Santa Catarina, southern Brazil

Drug resistance is a global threat and one of the main contributing factors to tuberculosis (TB) outbreaks. The goal of this study was to analyse the molecular profile of multidrug-resistant TB (MDR-TB) in the state of Santa Catarina in southern Brazil. Fifty-three MDR Mycobacterium tuberculosisclinical isolates were analysed by spoligotyping and a partial region of therpoB gene, which is associated with rifampicin resistance (RMP-R), was sequenced. Some isolates were also distinguished by their mycobacterial interspersed repetitive units (MIRU). S531L was the most prevalent mutation found within rpoBin RMP-R isolates (58.5%), followed by S531W (20.8%). Only two MDR isolates showed no mutations withinrpoB. Isolates of the Latin American Mediterranean (LAM) family were the most prevalent (45.3%) found by spoligotyping, followed by Haarlem (9.4%) and T (7.5%) families. SIT106 was found in 26.4% of isolates and all SIT106 isolates typed by MIRU-12 (5 out of 14) belong to MIT251. There was a high correlation between the S531W mutation and the LAM family mainly because all SIT2263 (LAM9) isolates carry this mutation. Among isolates with the S531W mutation in rpoB MIRU demonstrates a cluster formed by four isolates (SIT2263 and MIT163) and very similar profiles were observed between eight of the nine isolates. Better characterisation of TB isolates may lead to new ways in which to control and treat TB in this region of Brazil.

Caracterização imunocitoquímica da expressão da proteína RAP1 em blocos de células escamosas provenientes de citologia cervical em meio líquido

O diagnóstico precoce acurado do câncer cervical, relevante problema de saúde pública no mundo e no Brasil, pela citologia oncótica (Teste de Papanicolaou), é muito prejudicado pela subjetividade e variabilidade dos resultados falsos negativos e falsos positivos do método, particularmente diante de células escamosas atípicas(ASC). Recentes inovações técnicas, como citologia em meio líquido e imunocitoquímica com biomarcadores de proliferação celular, aumentaram a expectativa de melhorias no rastreamento do câncer cervical. No entanto, a aplicabilidade destas inovações nos estágios mais iniciais de atipia e displasias epiteliais permanecem incertas. Assim, considerando resultado prévio do nosso grupo de pesquisa, que identificou a proteína RAP1 como biomarcador diagnóstico da displasia cervical, este trabalho tem como objetivo caracterizar a expressão da proteína RAP1, comparativamente à expressão dos biomarcadores p16 e Ki-67, por imunocitoquímica, em blocos de células escamosas cervicais para possível aplicabilidade na triagem do câncer do colo do útero. Para tal, 34 amostras, 27 pacientes com diagnóstico de alterações celulares benignas (ACB) e 7 pacientes com diagnóstico de ASC foram coletadas na unidade Jenny Faria do Hospital das Clínicas da UFMG. Os resultados indicaram que 85% das amostras de blocos celulares foram satisfatórias para análise morfológica e a técnica reproduziu os principais parâmetros citopatológicos da citologia convencional.

Em relação a sua utilização para diagnóstico, o bloco de células apresentou sensibilidade de 38,46%,especificidade de 90,47% e uma variabilidade interobservador com taxa de concordância de aproximadamente 30% para os grupos ACB e ASC. A expressão da proteína RAP1 foi positiva na maioria das amostras do grupo “ACB” (15/27 ou55,56%) e resultado negativo na maioria das amostras do grupo “ASC” (4/7 ou 57,14%) com sensibilidade de 16,66%, especificidade de 75, %. As reações imunocitoquímicas das proteínas p16 e Ki-67 demonstraram, em ambos os grupos,apresentaram predomínio absoluto ou totalidade de resultados negativos. O DNA de HPV foi detectado em 9 (33,33%) das 27 amostras do grupo ACB e em 4 (57,14%)das 7 amostras do grupo ASC. O HPV-16 foi detectado nas 4 amostras do grupoASC. Nas amostras do grupo ACB foram detectados os HPV-16, em 5 amostras,HPV-58, em 2 amostras, HPV-45, em 1 amostra e HPV-66 em 1 amostra.Observamos inexistência de relação entre a presença do HPV e a expressão imunocitoquímica de RAP1 em ambos os grupos. Em conclusão, os blocos de células podem complementar o teste de Papanicolaou na triagem do câncer do colo uterino e a expressão da proteína RAP1 está aumentada em células cervicais em ambiente inflamatório, associado ou não à presença de HPV.

Caracterização imunocitoquímica da expressão da proteína RAP1 em blocos de células escamosas provenientes de citologia cervical em meio líquido

O diagnóstico precoce acurado do câncer cervical, relevante problema de saúde pública no mundo e no Brasil, pela citologia oncótica (Teste de Papanicolaou), é muito prejudicado pela subjetividade e variabilidade dos resultados falsos negativos e falsos positivos do método, particularmente diante de células escamosas atípicas (ASC). Recentes inovações técnicas, como citologia em meio líquido e imunocitoquímica com biomarcadores de proliferação celular, aumentaram a expectativa de melhorias no rastreamento do câncer cervical. No entanto, a aplicabilidade destas inovações nos estágios mais iniciais de atipia e displasias epiteliais permanecem incertas. Assim, considerando resultado prévio do nosso grupo de pesquisa, que identificou a proteína RAP1 como biomarcador diagnóstico da displasia cervical, este trabalho tem como objetivo caracterizar a expressão da proteína RAP1, comparativamente à expressão dos biomarcadores p16 e Ki-67, por imunocitoquímica, em blocos de células escamosas cervicais para possível aplicabilidade na triagem do câncer do colo do útero. Para tal, 34 amostras, 27 pacientes com diagnóstico de alterações celulares benignas (ACB) e 7 pacientes com diagnóstico de ASC foram coletadas na unidade Jenny Faria do Hospital das Clínicas da UFMG. Os resultados indicaram que 85% das amostras de blocos celulares foram satisfatórias para análise morfológica e a técnica reproduziu os principais parâmetros citopatológicos da citologia convencional. Em relação a sua utilização para diagnóstico, o bloco de células apresentou sensibilidade de 38,46%, especificidade de 90,47% e uma variabilidade interobervador com taxa de concordância de aproximadamente 30% para os grupos ACB e ASC. A expressão da proteína RAP1 foi positiva na maioria das amostras do grupo "ACB" (15/27 ou 55,56%) e resultado negativo na maioria das amostras do grupo "ASC" (4/7 ou 57,14%) com sensibilidade de 16,66%, especificidade de 75, %. As reações imunocitoquímicas das proteínas p16 e Ki-67 demonstraram, em ambos os grupos, apresentaram predomínio absoluto ou totalidade de resultados negativos. O DNA de HPV foi detectado em 9 (33,33%) das 27 amostras do grupo ACB e em 4 (57,14%) das 7 amostras do grupo ASC. O HPV-16 foi detectado nas 4 amostras do grupo ASC. Nas amostras do grupo ACB foram detectados os HPV-16, em 5 amostras, HPV-58, em 2 amostras, HPV-45, em 1 amostra e HPV-66 em 1 amostra. Observamos inexistência de relação entre a presença do HPV e a expressão imunocitoquímica de RAP1 em ambos os grupos. Em conclusão, os blocos de células podem complementar o teste de Papanicolaou na triagem do câncer do colo uterino e a expressão da proteína RAP1 está aumentada em células cervicais em ambiente inflamatório, associado ou não à presença de HPV

Caracterização imunocitoquímica da expressão da proteína RAP1 em blocos de células escamosas provenientes de citologia cervical em meio líquido / Immunocytochemistry characterization of expression of RAP1 protein in squamous cell blocks from cervical cytology in liquid medium

O diagnóstico precoce acurado do câncer cervical, relevante problema de saúde pública no mundo e no Brasil, pela citologia oncótica (Teste de Papanicolaou), é muito prejudicado pela subjetividade e variabilidade dos resultados falsos negativos e falsos positivos do método, particularmente diante de células escamosas atípicas(ASC). Recentes inovações técnicas, como citologia em meio líquido e imunocitoquímica com biomarcadores de proliferação celular, aumentaram a expectativa de melhorias no rastreamento do câncer cervical. No entanto, a aplicabilidade destas inovações nos estágios mais iniciais de atipia e displasias epiteliais permanecem incertas. Assim, considerando resultado prévio do nosso grupo de pesquisa, que identificou a proteína RAP1 como biomarcador diagnóstico da displasia cervical, este trabalho tem como objetivo caracterizar a expressão da proteína RAP1, comparativamente à expressão dos biomarcadores p16 e Ki-67, por imunocitoquímica, em blocos de células escamosas cervicais para possível aplicabilidade na triagem do câncer do colo do útero. Para tal, 34 amostras, 27 pacientes com diagnóstico de alterações celulares benignas (ACB) e 7 pacientes com diagnóstico de ASC foram coletadas na unidade Jenny Faria do Hospital das Clínicas da UFMG. Os resultados indicaram que 85% das amostras de blocos celulares foram satisfatórias para análise morfológica e a técnica reproduziu os principais parâmetros citopatológicos da citologia convencional...

Em relação a sua utilização para diagnóstico, o bloco de células apresentou sensibilidade de 38,46%,especificidade de 90,47% e uma variabilidade interobservador com taxa de concordância de aproximadamente 30% para os grupos ACB e ASC. A expressão da proteína RAP1 foi positiva na maioria das amostras do grupo “ACB” (15/27 ou55,56%) e resultado negativo na maioria das amostras do grupo “ASC” (4/7 ou 57,14%) com sensibilidade de 16,66%, especificidade de 75, %. As reações imunocitoquímicas das proteínas p16 e Ki-67 demonstraram, em ambos os grupos,apresentaram predomínio absoluto ou totalidade de resultados negativos. O DNA de HPV foi detectado em 9 (33,33%) das 27 amostras do grupo ACB e em 4 (57,14%)das 7 amostras do grupo ASC. O HPV-16 foi detectado nas 4 amostras do grupoASC. Nas amostras do grupo ACB foram detectados os HPV-16, em 5 amostras,HPV-58, em 2 amostras, HPV-45, em 1 amostra e HPV-66 em 1 amostra.Observamos inexistência de relação entre a presença do HPV e a expressão imunocitoquímica de RAP1 em ambos os grupos. Em conclusão, os blocos de células podem complementar o teste de Papanicolaou na triagem do câncer do colo uterino e a expressão da proteína RAP1 está aumentada em células cervicais em ambiente inflamatório, associado ou não à presença de HPV...