Detalhe da pesquisa
1.
HIV-1 virological synapse formation enhances infection spread by dysregulating Aurora Kinase B.
PLoS Pathog;
19(7): e1011492, 2023 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-37459363
2.
Alternative splicing liberates a cryptic cytoplasmic isoform of mitochondrial MECR that antagonizes influenza virus.
PLoS Biol;
20(12): e3001934, 2022 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-36542656
3.
Neural networks to learn protein sequence-function relationships from deep mutational scanning data.
Proc Natl Acad Sci U S A;
118(48)2021 11 30.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-34815338
4.
An approachable, flexible and practical machine learning workshop for biologists.
Bioinformatics;
38(Suppl 1): i10-i18, 2022 06 24.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-35758797
5.
Bayes optimal informer sets for early-stage drug discovery.
Biometrics;
79(2): 642-654, 2023 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-35165892
6.
Evaluating Scalable Supervised Learning for Synthesize-on-Demand Chemical Libraries.
J Chem Inf Model;
63(17): 5513-5528, 2023 09 11.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-37625010
7.
Inferring signaling pathways with probabilistic programming.
Bioinformatics;
36(Suppl_2): i822-i830, 2020 12 30.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-33381832
8.
Lag penalized weighted correlation for time series clustering.
BMC Bioinformatics;
21(1): 21, 2020 01 16.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-31948388
9.
Open collaborative writing with Manubot.
PLoS Comput Biol;
15(6): e1007128, 2019 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-31233491
10.
Predicting kinase inhibitors using bioactivity matrix derived informer sets.
PLoS Comput Biol;
15(8): e1006813, 2019 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-31381559
11.
Integrated systems biology analysis of KSHV latent infection reveals viral induction and reliance on peroxisome mediated lipid metabolism.
PLoS Pathog;
13(3): e1006256, 2017 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-28257516
12.
Network inference reveals novel connections in pathways regulating growth and defense in the yeast salt response.
PLoS Comput Biol;
13(5): e1006088, 2018 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-29738528
13.
Learning Drug Functions from Chemical Structures with Convolutional Neural Networks and Random Forests.
J Chem Inf Model;
59(10): 4438-4449, 2019 10 28.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-31518132
14.
Practical Model Selection for Prospective Virtual Screening.
J Chem Inf Model;
59(1): 282-293, 2019 01 28.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-30500183
15.
Ten quick tips for deep learning in biology.
PLoS Comput Biol;
18(3): e1009803, 2022 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-35324884
16.
Studying and modelling dynamic biological processes using time-series gene expression data.
Nat Rev Genet;
13(8): 552-64, 2012 Jul 18.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-22805708
17.
Network-Based Interpretation of Diverse High-Throughput Datasets through the Omics Integrator Software Package.
PLoS Comput Biol;
12(4): e1004879, 2016 Apr.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-27096930
18.
Linking the signaling cascades and dynamic regulatory networks controlling stress responses.
Genome Res;
23(2): 365-76, 2013 Feb.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-23064748
19.
Multitask learning of signaling and regulatory networks with application to studying human response to flu.
PLoS Comput Biol;
10(12): e1003943, 2014 Dec.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-25522349
20.
Identifying proteins controlling key disease signaling pathways.
Bioinformatics;
29(13): i227-36, 2013 Jul 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-23812988