Detalhe da pesquisa
1.
Insane in the vembrane: filtering and transforming VCF/BCF files.
Bioinformatics;
39(1)2023 01 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-36519840
2.
VISPR-online: a web-based interactive tool to visualize CRISPR screening experiments.
BMC Bioinformatics;
22(1): 344, 2021 Jun 24.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-34167459
3.
A Bayesian model for single cell transcript expression analysis on MERFISH data.
Bioinformatics;
35(6): 995-1001, 2019 03 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-30875429
4.
Full-length de novo viral quasispecies assembly through variation graph construction.
Bioinformatics;
35(24): 5086-5094, 2019 12 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-31147688
5.
VIPER: Visualization Pipeline for RNA-seq, a Snakemake workflow for efficient and complete RNA-seq analysis.
BMC Bioinformatics;
19(1): 135, 2018 04 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-29649993
6.
Cancer evolution, mutations, and clonal selection in relapse neuroblastoma.
Cell Tissue Res;
372(2): 263-268, 2018 May.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-29478075
7.
Rust-Bio: a fast and safe bioinformatics library.
Bioinformatics;
32(3): 444-6, 2016 Feb 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-26446134
8.
SimLoRD: Simulation of Long Read Data.
Bioinformatics;
32(17): 2704-6, 2016 09 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-27166244
9.
CRISPR-DO for genome-wide CRISPR design and optimization.
Bioinformatics;
32(21): 3336-3338, 2016 11 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-27402906
10.
Bioconda: sustainable and comprehensive software distribution for the life sciences.
Nat Methods;
15(7): 475-476, 2018 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-29967506
11.
A Bayesian model for single cell transcript expression analysis on MERFISH data.
Bioinformatics;
35(13): 2347, 2019 Jul 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-30358813
12.
Snakemake-a scalable bioinformatics workflow engine.
Bioinformatics;
34(20): 3600, 2018 10 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-29788404
13.
Identifying transcriptional miRNA biomarkers by integrating high-throughput sequencing and real-time PCR data.
Methods;
59(1): 154-63, 2013 Jan.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-23098880
14.
Pancreatic cancer acquires resistance to MAPK pathway inhibition by clonal expansion and adaptive DNA hypermethylation.
Clin Epigenetics;
16(1): 13, 2024 01 16.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-38229153
15.
Neoadjuvant nivolumab with or without relatlimab in resectable non-small-cell lung cancer: a randomized phase 2 trial.
Nat Med;
2024 Apr 30.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-38689060
16.
Next-generation RNA sequencing reveals differential expression of MYCN target genes and suggests the mTOR pathway as a promising therapy target in MYCN-amplified neuroblastoma.
Int J Cancer;
132(3): E106-15, 2013 Feb 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-22907398
17.
MiR-137 functions as a tumor suppressor in neuroblastoma by downregulating KDM1A.
Int J Cancer;
133(5): 1064-73, 2013 Sep 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-23400681
18.
Snakemake--a scalable bioinformatics workflow engine.
Bioinformatics;
28(19): 2520-2, 2012 Oct 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-22908215
19.
A virally encoded GPCR drives glioblastoma through feed-forward activation of the SK1-S1P1 signaling axis.
Sci Signal;
16(798): eade6737, 2023 08 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-37582160
20.
Detection and Validation of Circular DNA Fragments Using Nanopore Sequencing.
Front Genet;
13: 867018, 2022.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-35711922