Detalhe da pesquisa
1.
Petabase-scale sequence alignment catalyses viral discovery.
Nature;
602(7895): 142-147, 2022 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-35082445
2.
Critical Assessment of Metagenome Interpretation: the second round of challenges.
Nat Methods;
19(4): 429-440, 2022 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-35396482
3.
MGnify: the microbiome sequence data analysis resource in 2023.
Nucleic Acids Res;
51(D1): D753-D759, 2023 01 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-36477304
4.
Hi-C metagenomics facilitate comparative genome analysis of bacteria and yeast from spontaneous beer and cider.
Food Microbiol;
121: 104520, 2024 Aug.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-38637082
5.
BiosyntheticSPAdes: reconstructing biosynthetic gene clusters from assembly graphs.
Genome Res;
29(8): 1352-1362, 2019 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-31160374
6.
coronaSPAdes: from biosynthetic gene clusters to RNA viral assemblies.
Bioinformatics;
38(1): 1-8, 2021 12 22.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-34406356
7.
MGnify: the microbiome analysis resource in 2020.
Nucleic Acids Res;
48(D1): D570-D578, 2020 01 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-31696235
8.
CDSnake: Snakemake pipeline for retrieval of annotated OTUs from paired-end reads using CD-HIT utilities.
BMC Bioinformatics;
21(Suppl 12): 303, 2020 Jul 24.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-32703166
9.
SPAligner: alignment of long diverged molecular sequences to assembly graphs.
BMC Bioinformatics;
21(Suppl 12): 306, 2020 Jul 24.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-32703258
10.
Correction to: CDSnake: Snakemake pipeline for retrieval of annotated OTUs from paired-end reads using CD-HIT utilities.
BMC Bioinformatics;
21(1): 362, 2020 Aug 19.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-32814545
11.
metaSPAdes: a new versatile metagenomic assembler.
Genome Res;
27(5): 824-834, 2017 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-28298430
12.
Comparative genomics uncovers the prolific and distinctive metabolic potential of the cyanobacterial genus Moorea.
Proc Natl Acad Sci U S A;
114(12): 3198-3203, 2017 03 21.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-28265051
13.
hybridSPAdes: an algorithm for hybrid assembly of short and long reads.
Bioinformatics;
32(7): 1009-15, 2016 04 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-26589280
14.
A Maldiisotopic Approach to Discover Natural Products: Cryptomaldamide, a Hybrid Tripeptide from the Marine Cyanobacterium Moorea producens.
J Nat Prod;
80(5): 1514-1521, 2017 05 26.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-28448144
15.
Sequencing rare marine actinomycete genomes reveals high density of unique natural product biosynthetic gene clusters.
Microbiology (Reading);
162(12): 2075-2086, 2016 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-27902408
16.
The Phormidolide Biosynthetic Gene Cluster: A trans-AT PKS Pathway Encoding a Toxic Macrocyclic Polyketide.
Chembiochem;
17(2): 164-73, 2016 Jan.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-26769357
17.
Assembling short reads from jumping libraries with large insert sizes.
Bioinformatics;
31(20): 3262-8, 2015 Oct 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-26040456
18.
A novel uncultured heterotrophic bacterial associate of the cyanobacterium Moorea producens JHB.
BMC Microbiol;
16(1): 198, 2016 08 30.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-27577966
19.
ExSPAnder: a universal repeat resolver for DNA fragment assembly.
Bioinformatics;
30(12): i293-301, 2014 Jun 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-24931996
20.
Spongosine production by a Vibrio harveyi strain associated with the sponge Tectitethya crypta.
J Nat Prod;
78(3): 493-9, 2015 Mar 27.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-25668560