Detalhe da pesquisa
1.
Multiplatform analysis of 12 cancer types reveals molecular classification within and across tissues of origin.
Cell;
158(4): 929-944, 2014 Aug 14.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-25109877
2.
An open protocol for modeling T Cell Clonotype repertoires using TCRß CDR3 sequences.
BMC Genomics;
24(1): 349, 2023 Jun 26.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-37365517
3.
svpluscnv: analysis and visualization of complex structural variation data.
Bioinformatics;
37(13): 1912-1914, 2021 07 27.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-33051644
4.
Pan-cancer transcriptional signatures predictive of oncogenic mutations reveal that Fbw7 regulates cancer cell oxidative metabolism.
Proc Natl Acad Sci U S A;
115(21): 5462-5467, 2018 05 22.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-29735700
5.
Addendum: The Cancer Cell Line Encyclopedia enables predictive modelling of anticancer drug sensitivity.
Nature;
565(7738): E5-E6, 2019 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-30559381
6.
Valection: design optimization for validation and verification studies.
BMC Bioinformatics;
19(1): 339, 2018 Sep 25.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-30253747
7.
Germline contamination and leakage in whole genome somatic single nucleotide variant detection.
BMC Bioinformatics;
19(1): 28, 2018 01 31.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-29385983
8.
Combining tumor genome simulation with crowdsourcing to benchmark somatic single-nucleotide-variant detection.
Nat Methods;
12(7): 623-30, 2015 Jul.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-25984700
9.
Modeling gene-wise dependencies improves the identification of drug response biomarkers in cancer studies.
Bioinformatics;
33(9): 1362-1369, 2017 05 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-28082455
10.
The Cancer Cell Line Encyclopedia enables predictive modelling of anticancer drug sensitivity.
Nature;
483(7391): 603-7, 2012 Mar 28.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-22460905
11.
ATARiS: computational quantification of gene suppression phenotypes from multisample RNAi screens.
Genome Res;
23(4): 665-78, 2013 Apr.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-23269662
12.
Drug susceptibility prediction against a panel of drugs using kernelized Bayesian multitask learning.
Bioinformatics;
30(17): i556-63, 2014 Sep 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-25161247
13.
Improving breast cancer survival analysis through competition-based multidimensional modeling.
PLoS Comput Biol;
9(5): e1003047, 2013.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-23671412
14.
Reverse engineering of regulatory networks in human B cells.
Nat Genet;
37(4): 382-90, 2005 Apr.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-15778709
15.
An open protocol for modeling T Cell Clonotype repertoires using TCRß CDR3 sequences.
Res Sq;
2023 Feb 16.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-36824803
16.
Integrated biochemical and computational approach identifies BCL6 direct target genes controlling multiple pathways in normal germinal center B cells.
Blood;
115(5): 975-84, 2010 Feb 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-19965633
17.
ChIP-on-chip significance analysis reveals large-scale binding and regulation by human transcription factor oncogenes.
Proc Natl Acad Sci U S A;
106(1): 244-9, 2009 Jan 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-19118200
18.
Identifying the proteins to which small-molecule probes and drugs bind in cells.
Proc Natl Acad Sci U S A;
106(12): 4617-22, 2009 Mar 24.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-19255428
19.
A harmonized meta-knowledgebase of clinical interpretations of somatic genomic variants in cancer.
Nat Genet;
52(4): 448-457, 2020 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-32246132
20.
PEG10 is a c-MYC target gene in cancer cells.
Cancer Res;
66(2): 665-72, 2006 Jan 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-16423995