Detalhe da pesquisa
1.
A cross-study analysis of drug response prediction in cancer cell lines.
Brief Bioinform;
23(1)2022 01 17.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-34524425
2.
FUN-PROSE: A deep learning approach to predict condition-specific gene expression in fungi.
PLoS Comput Biol;
19(11): e1011563, 2023 Nov.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-37971967
3.
Structured sequences emerge from random pool when replicated by templated ligation.
Proc Natl Acad Sci U S A;
118(8)2021 02 23.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-33593911
4.
Time-dependent heterogeneity leads to transient suppression of the COVID-19 epidemic, not herd immunity.
Proc Natl Acad Sci U S A;
118(17)2021 04 27.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-33833080
5.
Fine-scale diversity of microbial communities due to satellite niches in boom and bust environments.
PLoS Comput Biol;
18(12): e1010244, 2022 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-36574450
6.
Modeling microbial cross-feeding at intermediate scale portrays community dynamics and species coexistence.
PLoS Comput Biol;
16(8): e1008135, 2020 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-32810127
7.
Evidence for a multi-level trophic organization of the human gut microbiome.
PLoS Comput Biol;
15(12): e1007524, 2019 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-31856158
8.
Family-specific scaling laws in bacterial genomes.
Nucleic Acids Res;
45(13): 7615-7622, 2017 Jul 27.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-28605556
9.
Predicting tumor cell line response to drug pairs with deep learning.
BMC Bioinformatics;
19(Suppl 18): 486, 2018 Dec 21.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-30577754
10.
Diversity, Stability, and Reproducibility in Stochastically Assembled Microbial Ecosystems.
Phys Rev Lett;
120(15): 158102, 2018 Apr 13.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-29756882
11.
Onset of natural selection in populations of autocatalytic heteropolymers.
J Chem Phys;
149(13): 134901, 2018 Oct 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-30292218
12.
Recombinant transfer in the basic genome of Escherichia coli.
Proc Natl Acad Sci U S A;
112(29): 9070-5, 2015 Jul 21.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-26153419
13.
Large-scale atlas of microarray data reveals the distinct expression landscape of different tissues in Arabidopsis.
Plant J;
86(6): 472-80, 2016 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-27015116
14.
DREISS: Using State-Space Models to Infer the Dynamics of Gene Expression Driven by External and Internal Regulatory Networks.
PLoS Comput Biol;
12(10): e1005146, 2016 Oct.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-27760135
15.
Diversity Waves in Collapse-Driven Population Dynamics.
PLoS Comput Biol;
11(9): e1004440, 2015 Sep.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-26367172
16.
Universal distribution of component frequencies in biological and technological systems.
Proc Natl Acad Sci U S A;
110(15): 6235-9, 2013 Apr 09.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-23530195
17.
Spontaneous emergence of autocatalytic information-coding polymers.
J Chem Phys;
143(4): 045102, 2015 Jul 28.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-26233165
18.
Evolutionary capacitance and control of protein stability in protein-protein interaction networks.
PLoS Comput Biol;
9(4): e1003023, 2013 Apr.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-23592969
19.
Topology of protein interaction network shapes protein abundances and strengths of their functional and nonspecific interactions.
Proc Natl Acad Sci U S A;
108(10): 4258-63, 2011 Mar 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-21368118
20.
Emergence of catalytic function in prebiotic information-coding polymers.
Elife;
122024 Mar 26.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-38530342