Detalhe da pesquisa
1.
Towards the biogeography of prokaryotic genes.
Nature;
601(7892): 252-256, 2022 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-34912116
2.
SPIRE: a Searchable, Planetary-scale mIcrobiome REsource.
Nucleic Acids Res;
52(D1): D777-D783, 2024 Jan 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-37897342
3.
Critical Assessment of Metagenome Interpretation: the second round of challenges.
Nat Methods;
19(4): 429-440, 2022 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-35396482
4.
eggNOG 6.0: enabling comparative genomics across 12 535 organisms.
Nucleic Acids Res;
51(D1): D389-D394, 2023 01 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-36399505
5.
proGenomes3: approaching one million accurately and consistently annotated high-quality prokaryotic genomes.
Nucleic Acids Res;
51(D1): D760-D766, 2023 01 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-36408900
6.
Impact of antibiotics on gut microbiome composition and resistome in the first years of life in low- to middle-income countries: A systematic review.
PLoS Med;
20(6): e1004235, 2023 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-37368871
7.
proGenomes2: an improved database for accurate and consistent habitat, taxonomic and functional annotations of prokaryotic genomes.
Nucleic Acids Res;
48(D1): D621-D625, 2020 01 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-31647096
8.
A distinct lineage of giant viruses brings a rhodopsin photosystem to unicellular marine predators.
Proc Natl Acad Sci U S A;
116(41): 20574-20583, 2019 10 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-31548428
9.
eggNOG 5.0: a hierarchical, functionally and phylogenetically annotated orthology resource based on 5090 organisms and 2502 viruses.
Nucleic Acids Res;
47(D1): D309-D314, 2019 01 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-30418610
10.
Diel cycling and long-term persistence of viruses in the ocean's euphotic zone.
Proc Natl Acad Sci U S A;
114(43): 11446-11451, 2017 10 24.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-29073070
11.
Genomic variation landscape of the human gut microbiome.
Nature;
493(7430): 45-50, 2013 Jan 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-23222524
12.
proGenomes: a resource for consistent functional and taxonomic annotations of prokaryotic genomes.
Nucleic Acids Res;
45(D1): D529-D534, 2017 01 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-28053165
13.
Siderophore-based microbial adaptations to iron scarcity across the eastern Pacific Ocean.
Proc Natl Acad Sci U S A;
113(50): 14237-14242, 2016 12 13.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-27911777
14.
Integration of multi-omics data of a genome-reduced bacterium: Prevalence of post-transcriptional regulation and its correlation with protein abundances.
Nucleic Acids Res;
44(3): 1192-202, 2016 Feb 18.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-26773059
15.
eggNOG 4.5: a hierarchical orthology framework with improved functional annotations for eukaryotic, prokaryotic and viral sequences.
Nucleic Acids Res;
44(D1): D286-93, 2016 Jan 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-26582926
16.
Metabolic dependencies drive species co-occurrence in diverse microbial communities.
Proc Natl Acad Sci U S A;
112(20): 6449-54, 2015 May 19.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-25941371
17.
Enterotypes of the human gut microbiome.
Nature;
473(7346): 174-80, 2011 May 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-21508958
18.
Country-specific antibiotic use practices impact the human gut resistome.
Genome Res;
23(7): 1163-9, 2013 Jul.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-23568836
19.
Accurate and universal delineation of prokaryotic species.
Nat Methods;
10(9): 881-4, 2013 Sep.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-23892899
20.
Metagenomic species profiling using universal phylogenetic marker genes.
Nat Methods;
10(12): 1196-9, 2013 Dec.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-24141494