Detalhe da pesquisa
1.
Towards a qualitative theory of the interruption of eating behavior change.
J Theor Biol;
581: 111731, 2024 03 21.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-38211891
2.
MERRIN: MEtabolic regulation rule INference from time series data.
Bioinformatics;
38(Suppl_2): ii127-ii133, 2022 09 16.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-36124795
3.
A detailed map of coupled circadian clock and cell cycle with qualitative dynamics validation.
BMC Bioinformatics;
22(1): 240, 2021 May 11.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-33975535
4.
Computational discovery of dynamic cell line specific Boolean networks from multiplex time-course data.
PLoS Comput Biol;
14(10): e1006538, 2018 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-30372442
5.
Necessary and sufficient conditions for protocell growth.
J Math Biol;
73(6-7): 1627-1664, 2016 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-27091567
6.
Cell cycle progression is regulated by intertwined redox oscillators.
Theor Biol Med Model;
12: 10, 2015 May 29.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-26022743
7.
Dynamical properties of Discrete Reaction Networks.
J Math Biol;
69(1): 55-72, 2014 Jul.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-23722628
8.
Reconciling qualitative, abstract, and scalable modeling of biological networks.
Nat Commun;
11(1): 4256, 2020 08 26.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-32848126
9.
Publisher Correction: Reconciling qualitative, abstract, and scalable modeling of biological networks.
Nat Commun;
11(1): 4900, 2020 Sep 24.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-32973140
10.
Algorithms for the Sequential Reprogramming of Boolean Networks.
IEEE/ACM Trans Comput Biol Bioinform;
16(5): 1610-1619, 2019.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-31056515
11.
Reduction of Qualitative Models of Biological Networks for Transient Dynamics Analysis.
IEEE/ACM Trans Comput Biol Bioinform;
15(4): 1167-1179, 2018.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-28885158
12.
Prediction of Mutations to Control Pathways Enabling Tumor Cell Invasion with the CoLoMoTo Interactive Notebook (Tutorial).
Front Physiol;
9: 787, 2018.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-30034343
13.
The CoLoMoTo Interactive Notebook: Accessible and Reproducible Computational Analyses for Qualitative Biological Networks.
Front Physiol;
9: 680, 2018.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-29971009
14.
Identification of bifurcation transitions in biological regulatory networks using Answer-Set Programming.
Algorithms Mol Biol;
12: 19, 2017.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-28736575
15.
Qualitative dynamics semantics for SBGN process description.
BMC Syst Biol;
10(1): 42, 2016 06 16.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-27306057
16.
Reconstructing dynamic molecular states from single-cell time series.
J R Soc Interface;
13(122)2016 09.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-27605167
17.
The Redox Status of Cancer Cells Supports Mechanisms behind the Warburg Effect.
Metabolites;
6(4)2016 Oct 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-27706102