RESUMO
Public molecular databases are fundamental tools for modern taxonomic studies whose usefulness rely on the soundness of the data within them. Here, we study potential errors that can arise along the data pipeline from sampling, specimen identification and molecular processing (digestion, amplification and sequencing) to the submission of sequences to these databases by using the DNA sequences of Hydrachnidia (Acari, Parasitengona) as a case study. Our results indicate that molecular information is available for only about 3% of the Hydrachnidia species known to date; yet, within this small percentage, errors are present in almost 5% of the species analyzed (0.5% of the sequences and almost 11% of the genera). This study underscores the scarcity of genetic data available for Hydrachnidia, but also that the proportion of errors in DNA sequences is relatively small. Even so, it highlights the danger associated with using DNA sequences from public databases, particularly for species identification, and reinforces the need for greater quality control measures and/or protocols to avoid an intensification of errors in the (post) genomics era. Finally, our study emphasizes that potential errors may also reveal cryptic diversity within a species.
Assuntos
Ácaros , Animais , Código de Barras de DNA Taxonômico , Ácaros/genética , FilogeniaRESUMO
Names in taxonomy have seven different and important properties, some due to their existence in the context of classifications. Names confer or facilitate individuation, information storage and retrieval, and set theories of relationships, explanatory power, testable predictions, conceptual power, and language. No other way of naming in science is so powerful. And this is possible because taxonomic naming is done with full consideration of the theoretical specification of empirical data (characters) and their correspondence among taxa via homology statements. Since Darwin and Hennig, sets of homologous characters distributed among taxa allow precise hypotheses of a genealogical relationship, and this relationship is reflected in the way naming results in a classification.
RESUMO
El objetivo de este estudio fue comparar la presencia de anticuerpos anti-B2glicoproteína I (anti-B2GPI) con las pruebas convencionales de laboratorio de anticuerpos anticardiolipina (aCL) y anticoagulante lúpico, y con las manifestaciones clínicas del síndrome antifosfolípido (SAF).Se incluyeron en el estudio 80 mujeres con SAF; 35 de ellas de la consulta de Reumatología y las otras 45 con historia de aborto recurrente espontáneo (ARE); 5 mujeres de la consulta de Reumatología sin SAF, 27 mujeres con ARE, sin SAF y un grupo control de 20 mujeres sanas en edad reproductiva. Se investigaron la presencia de anticuerpos IgG e IgM anticardiolipina (aCL) e IgG anti-B2GPI por la técnica de ELISA, y el anticoagulante lúpico por la determinación del tiempo parcial de tromboplastina activado. Adicionalmente, se registraron las manifestaciones clínicas asociadas al SAF.De las pacientes con SAF, 25.7 por ciento del grupo de Reumatología (9/35) y 4.4 por ciento de las pacientes con ARE (2/45) fueron positivas para anticuerpos anti-?2GPI, mientras que ninguna de las mujeres sin SAF, ni de las mujeres del grupo control, fue positiva. La asociación entre la presencia de anti-B2GPI y los anticuerpos IgG e IgM aCL mostró una diferencia significativa en los títulos de 3+ (altamente positivos) en contraste con los individuos negativos para anti-B2GPI. La positividad del anticoagulante lúpico también se correlacionó con la presencia de anticuerpos anti-B2GPI. No hubo diferencia significativa entre las diversas manifestaciones clínicas del SAF y la presencia de dichos anticuerpos.En conclusión, la determinación de anticuerpos anti-B2GPI tiene una alta especificidad en pacientes con SAF pero no se asoció con ninguna manifestación clínica en particular.
El objetivo de este estudio fue comparar la presencia de anticuerpos anti- ß2glicoproteína I (anti-ß2GPI) con las pruebas convencionales de laboratorio de anticuerpos anticardiolipina (aCL) y anticoagulante lúpico, y con las manifestaciones clínicas del síndrome antifosfolípido (SAF). Se incluyeron en el estudio 80 mujeres con SAF; 35 de ellas de la consulta de Reumatología y las otras 45 con historia de aborto recurrente espontáneo (ARE); 5 mujeres de la consulta de Reumatología sin SAF, 27 mujeres con ARE, sin SAF y un grupo control de 20 mujeres sanas en edad reproductiva. Se investigaron la presencia de anticuerpos IgG e IgM anticardiolipina (aCL) e IgG anti-ß2GPI por la técnica de ELISA, y el anticoagulante lúpico por la determinación del tiempo parcial de tromboplastina activado. Adicionalmente, se registraron las manifestaciones clínicas asociadas al SAF. De las pacientes con SAF, 25.7% del grupo de Reumatología (9/35) y 4.4% de las pacientes con ARE (2/45) fueron positivas para anticuerpos anti- ß2GPI, mientras que ninguna de las mujeres sin SAF, ni de las mujeres del grupo control, fue positiva. La asociación entre la presencia de anti-ß2GPI y los anticuerpos IgG e IgM aCL mostró una diferencia significativa en los títulos de 3+ (altamente positivos) en contraste con los individuos negativos para anti-ß2GPI. La positividad del anticoagulante lúpico también se correlacionó con la presencia de anticuerpos anti-ß2GPI. No hubo diferencia significativa entre las diversas manifestaciones clínicas del SAF y la presencia de dichos anticuerpos. En conclusión, la determinación de anticuerpos anti-ß2GPI tiene una alta especificidad en pacientes con SAF pero no se asoció con ninguna manifestación clínica en particular