Detalhe da pesquisa
1.
Functional landscape of SARS-CoV-2 cellular restriction.
Mol Cell;
81(12): 2656-2668.e8, 2021 06 17.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-33930332
2.
Drugst.One - a plug-and-play solution for online systems medicine and network-based drug repurposing.
Nucleic Acids Res;
2024 May 23.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-38783119
3.
NDEx IQuery: a multi-method network gene set analysis leveraging the Network Data Exchange.
Bioinformatics;
39(3)2023 03 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-36882166
4.
The Minimum Information about a Molecular Interaction CAusal STatement (MI2CAST).
Bioinformatics;
36(24): 5712-5718, 2021 04 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-32637990
5.
Multiscale community detection in Cytoscape.
PLoS Comput Biol;
16(10): e1008239, 2020 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-33095781
6.
ndexr-an R package to interface with the network data exchange.
Bioinformatics;
34(4): 716-717, 2018 02 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-29087446
7.
Network propagation in the cytoscape cyberinfrastructure.
PLoS Comput Biol;
13(10): e1005598, 2017 Oct.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-29023449
8.
NeXO Web: the NeXO ontology database and visualization platform.
Nucleic Acids Res;
42(Database issue): D1269-74, 2014 Jan.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-24271398
9.
State of the Interactomes: an evaluation of molecular networks for generating biological insights.
bioRxiv;
2024 Apr 29.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-38746239
10.
Evaluation of large language models for discovery of gene set function.
ArXiv;
2024 Apr 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-37731657
11.
reguloGPT: Harnessing GPT for Knowledge Graph Construction of Molecular Regulatory Pathways.
bioRxiv;
2024 Jan 30.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-38313267
12.
A foundational atlas of autism protein interactions reveals molecular convergence.
bioRxiv;
2024 Feb 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-38076945
13.
Reverse causal reasoning: applying qualitative causal knowledge to the interpretation of high-throughput data.
BMC Bioinformatics;
14: 340, 2013 Nov 23.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-24266983
14.
Translating desktop success to the web in the cytoscape project.
Front Bioinform;
3: 1125949, 2023.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-37035036
15.
Evaluation of large language models for discovery of gene set function.
Res Sq;
2023 Sep 18.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-37790547
16.
Mapping the common gene networks that underlie related diseases.
Nat Protoc;
18(6): 1745-1759, 2023 Jun.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-36653526
17.
A multi-scale map of protein assemblies in the DNA damage response.
Cell Syst;
14(6): 447-463.e8, 2023 06 21.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-37220749
18.
Drugst.One - A plug-and-play solution for online systems medicine and network-based drug repurposing.
ArXiv;
2023 Jul 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-37332567
19.
Deep distributed computing to reconstruct extremely large lineage trees.
Nat Biotechnol;
40(4): 566-575, 2022 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-34992246
20.
A BioID-Derived Proximity Interactome for SARS-CoV-2 Proteins.
Viruses;
14(3)2022 03 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-35337019