An extended single-index multiplexed 16S rRNA sequencing for microbial community analysis on MiSeq illumina platforms.

Derakhshani, Hooman; Tun, Hein Min; Khafipour, Ehsan

Derakhshani, Hooman; Tun, Hein Min; Khafipour, Ehsan.

Afiliação

Derakhshani H; Department of Animal Science, University of Manitoba, Winnipeg, Manitoba, Canada.
Tun HM; Department of Animal Science, University of Manitoba, Winnipeg, Manitoba, Canada.
Khafipour E; Department of Animal Science, University of Manitoba, Winnipeg, Manitoba, Canada.

J Basic Microbiol ; 56(3): 321-6, 2016 Mar.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-26426811

Assuntos

Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala/métodos; Microbiota/genética; RNA Ribossômico 16S/genética; Análise de Sequência de RNA/métodos; Sequência de Bases; Análise por Conglomerados; Biologia Computacional/métodos; Código de Barras de DNA Taxonômico/métodos; Primers do DNA; Metagenoma; Dados de Sequência Molecular; Reação em Cadeia da Polimerase; Sensibilidade e Especificidade; Alinhamento de Sequência/métodos

Palavras-chave

Paired-end sequencing; Sequencing coverage; Single-index; Taxonomic classification; V3-V4 hypervariable regions

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: RNA Ribossômico 16S / Análise de Sequência de RNA / Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala / Microbiota Tipo de estudo: Diagnostic_studies Idioma: En Revista: J Basic Microbiol Assunto da revista: MICROBIOLOGIA Ano de publicação: 2016 Tipo de documento: Article País de afiliação: Canadá

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