Fast Open Modification Spectral Library Searching through Approximate Nearest Neighbor Indexing.

Bittremieux, Wout; Meysman, Pieter; Noble, William Stafford; Laukens, Kris

Bittremieux, Wout; Meysman, Pieter; Noble, William Stafford; Laukens, Kris.

Afiliação

Bittremieux W; Department of Mathematics and Computer Science , University of Antwerp , 2020 Antwerp , Belgium.
Meysman P; Biomedical Informatics Network Antwerpen (biomina) , 2020 Antwerp , Belgium.
Noble WS; Department of Genome Sciences , University of Washington , Seattle , Washington 98195 , United States.
Laukens K; Department of Mathematics and Computer Science , University of Antwerp , 2020 Antwerp , Belgium.

J Proteome Res ; 17(10): 3463-3474, 2018 10 05.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-30184435

Assuntos

Bases de Dados de Proteínas; Peptídeos/metabolismo; Proteômica/métodos; Ferramenta de Busca/métodos; Algoritmos; Biologia Computacional/métodos; Células HEK293; Humanos; Biblioteca de Peptídeos; Peptídeos/química; Processamento de Proteína Pós-Traducional; Reprodutibilidade dos Testes; Software; Espectrometria de Massas em Tandem; Fatores de Tempo

Palavras-chave

approximate nearest neighbors; mass spectrometry; open modification searching; post-translational modifications; proteomics; spectral library

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Peptídeos / Bases de Dados de Proteínas / Proteômica / Ferramenta de Busca Tipo de estudo: Prognostic_studies Limite: Humans Idioma: En Revista: J Proteome Res Assunto da revista: BIOQUIMICA Ano de publicação: 2018 Tipo de documento: Article País de afiliação: Bélgica

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