Inference of the gene regulatory network acting downstream of CROWN ROOTLESS 1 in rice reveals a regulatory cascade linking genes involved in auxin signaling, crown root initiation, and root meristem specification and maintenance.

Lavarenne, Jérémy; Gonin, Mathieu; Guyomarc'h, Soazig; Rouster, Jacques; Champion, Antony; Sallaud, Christophe; Laplaze, Laurent; Gantet, Pascal; Lucas, Mikaël

Inference of the gene regulatory network acting downstream of CROWN ROOTLESS 1 in rice reveals a regulatory cascade linking genes involved in auxin signaling, crown root initiation, and root meristem specification and maintenance.

Lavarenne, Jérémy; Gonin, Mathieu; Guyomarc'h, Soazig; Rouster, Jacques; Champion, Antony; Sallaud, Christophe; Laplaze, Laurent; Gantet, Pascal; Lucas, Mikaël.

Afiliação

Lavarenne J; UMR DIADE, Université de Montpellier, IRD, 911 Avenue Agropolis, 34394, Montpellier Cedex 5, France.
Gonin M; Centre de Recherches de Chappes, Biogemma, Route d'Ennezat, 63720, Chappes, France.
Guyomarc'h S; UMR DIADE, Université de Montpellier, IRD, 911 Avenue Agropolis, 34394, Montpellier Cedex 5, France.
Rouster J; UMR DIADE, Université de Montpellier, IRD, 911 Avenue Agropolis, 34394, Montpellier Cedex 5, France.
Champion A; Centre de Recherches de Chappes, Biogemma, Route d'Ennezat, 63720, Chappes, France.
Sallaud C; UMR DIADE, Université de Montpellier, IRD, 911 Avenue Agropolis, 34394, Montpellier Cedex 5, France.
Laplaze L; Centre de Recherches de Chappes, Biogemma, Route d'Ennezat, 63720, Chappes, France.
Gantet P; UMR DIADE, Université de Montpellier, IRD, 911 Avenue Agropolis, 34394, Montpellier Cedex 5, France.
Lucas M; UMR DIADE, Université de Montpellier, IRD, 911 Avenue Agropolis, 34394, Montpellier Cedex 5, France.

Plant J ; 100(5): 954-968, 2019 12.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-31369175

Assuntos

Regulação da Expressão Gênica de Plantas; Redes Reguladoras de Genes; Ácidos Indolacéticos/metabolismo; Meristema/metabolismo; Oryza/metabolismo; Raízes de Plantas/genética; Fatores de Transcrição/metabolismo; Perfilação da Expressão Gênica; Regulação da Expressão Gênica de Plantas/efeitos dos fármacos; Ontologia Genética; Redes Reguladoras de Genes/efeitos dos fármacos; Genes Homeobox; Meristema/genética; Oryza/genética; Proteínas de Plantas/metabolismo; Raízes de Plantas/efeitos dos fármacos; Raízes de Plantas/crescimento & desenvolvimento; Plantas Geneticamente Modificadas; Regiões Promotoras Genéticas; Domínios Proteicos/genética; Transdução de Sinais/efeitos dos fármacos; Transdução de Sinais/genética; Fatores de Transcrição/genética; Transcriptoma

Palavras-chave

gene regulation; meristem development; rice; root biology; systems biology; transcriptome analysis

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Oryza / Fatores de Transcrição / Raízes de Plantas / Meristema / Regulação da Expressão Gênica de Plantas / Redes Reguladoras de Genes / Ácidos Indolacéticos Tipo de estudo: Prognostic_studies Idioma: En Revista: Plant J Assunto da revista: BIOLOGIA MOLECULAR / BOTANICA Ano de publicação: 2019 Tipo de documento: Article País de afiliação: França

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