Characterizing the properties of bisulfite sequencing data: maximizing power and sensitivity to identify between-group differences in DNA methylation.

Seiler Vellame, Dorothea; Castanho, Isabel; Dahir, Aisha; Mill, Jonathan; Hannon, Eilis

Seiler Vellame, Dorothea; Castanho, Isabel; Dahir, Aisha; Mill, Jonathan; Hannon, Eilis.

Afiliação

Seiler Vellame D; College of Medicine and Health, University of Exeter, Royal Devon and Exeter Hospital, Exeter, EX2 5DW, UK. ds420@exeter.ac.uk.
Castanho I; College of Medicine and Health, University of Exeter, Royal Devon and Exeter Hospital, Exeter, EX2 5DW, UK.
Dahir A; Department of Pathology, Beth Israel Deaconess Medical Center, 330 Brookline-Avenue, Boston, Massachusetts, USA.
Mill J; Harvard Medical School, Boston, Massachusetts, USA.
Hannon E; College of Medicine and Health, University of Exeter, Royal Devon and Exeter Hospital, Exeter, EX2 5DW, UK.

BMC Genomics ; 22(1): 446, 2021 Jun 15.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-34126923

Assuntos

Metilação de DNA; Sulfitos; Epigenômica; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala; Reprodutibilidade dos Testes; Análise de Sequência de DNA

Palavras-chave

Bisulfite sequencing; DNA methylation; Epigenetics; Power; RRBS; Read depth; Sample size

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Sulfitos / Metilação de DNA Tipo de estudo: Diagnostic_studies / Prognostic_studies Idioma: En Revista: BMC Genomics Assunto da revista: GENETICA Ano de publicação: 2021 Tipo de documento: Article País de afiliação: Reino Unido

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