pyComBat, a Python tool for batch effects correction in high-throughput molecular data using empirical Bayes methods.

Behdenna, Abdelkader; Colange, Maximilien; Haziza, Julien; Gema, Aryo; Appé, Guillaume; Azencott, Chloé-Agathe; Nordor, Akpéli

Behdenna, Abdelkader; Colange, Maximilien; Haziza, Julien; Gema, Aryo; Appé, Guillaume; Azencott, Chloé-Agathe; Nordor, Akpéli.

Afiliação

Behdenna A; Epigene Labs, Paris, France. abdelkader@epigenelabs.com.
Colange M; Epigene Labs, Paris, France.
Haziza J; Epigene Labs, Paris, France.
Gema A; Epigene Labs, Paris, France.
Appé G; University of Edinburgh, Edinburgh, UK.
Azencott CA; Epigene Labs, Paris, France.
Nordor A; MINES ParisTech, CBIO-Centre for Computational Biology, PSL Research University, 75006, Paris, France.

BMC Bioinformatics ; 24(1): 459, 2023 Dec 07.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-38057718

Assuntos

Biologia Computacional; Software; Teorema de Bayes; Biologia Computacional/métodos; RNA-Seq

Palavras-chave

Batch effects; Bayesian statistics; Open source; Transcriptomics

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Software / Biologia Computacional Idioma: En Revista: BMC Bioinformatics Assunto da revista: INFORMATICA MEDICA Ano de publicação: 2023 Tipo de documento: Article País de afiliação: França

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