Diversidade molecular do v�rus da imunodeficiencia humana tipo 1 no estado da Bahia / Molecular diversity of human immunodeficiency virus type 1 in the state of Bahia

RESUMO

A an�lise de sequ�ncias gen�micas � uma forma poderosa para se estudar a diversidade do HIV-1 e sua expans�o nas popula��es, al�m de ser crucial para dar suporte � vigil�ncia epidemiol�gica e ao desenvolvimento de terapias e vacinas eficazes. Neste estudo foram geradas sequ�ncias dos genes gag e env do HIV-1 de 61 pacientes infectados em Salvador e do pol de 58 pacientes de Feira de Santana, Bahia, Brasil. A bioinform�tica foi utilizada para subtipar, genotipar as muta��es de resist�ncia, determinar a press�o seletiva e predizer o uso de coreceptor. Em Salvador, 92,6% das amostras foram do subtipo B e 7,4% foram recombinantes BF1. Em Feira de Santana, 67,2% foram do subtipo B, 6,9% F1, 1,7% C e 24,1% BF1. Onze (19,0%) destes isolados apresentaram muta��es de resist�ncia. Pacientes infectados pelo B tinham em m�dia 0,4 muta��es de resist�ncia e nenhuma muta��o deste tipo foi observada em BF1. Com base na caracteriza��o da al�a V3 do gene env em 43 amostras de Salvador, foram encontradas 18,2% de variantes brasileiras (B'-GWGR), 46,5% de GPGR e 34,9% de GXGX. O tempo m�dio de diagn�stico positivo foi de 13 anos para o subtipo B' e 9 anos para o subtipo B (GPGR + GXGX). Setenta e seis por cento destes v�rus fazem uso do coreceptor CCR5, enquanto 24% foram classificados como capazes de usar o CXCR4. Encontramos uma associa��o entre o subtipo B' e um maior tempo em anos de diagn�stico positivo para HIV-1. As preval�ncias de subtipo B' e de recombinante B/F1 em Salvador foram menores do que as encontradas em estudos anteriores na Bahia e no Brasil, por outro lado, em Feira de Santana foi encontrada uma alta preval�ncia de B/F1.(AU)