Expone el caso clínico de un paciente de 37 años, de sexo masculino, con serología positiva para el VIH-1 y diarrea crónica, en el cual se identificó el Enterocytozoon bieneusi a través de las técnicas recomendadas para su diagnóstico. Enumera las especies identificadas de microsporidias asociadas a patologías en humanos, tanto intestinales como extraintestinales. El caso presentado constituiría la primera identificación fidedigna de una microsporidia en la Argentina por lo que se recomienda buscar estos patógenos a través de las técnicas de diagnóstico recomendadas en pacientes con SIDA y diarrea crónica o compromiso de la vía biliar en forma de colangitis