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Census of the viral metagenome within an activated sludge microbial assemblage.
Parsley, Larissa C; Consuegra, Erin J; Thomas, Stephen J; Bhavsar, Jaysheel; Land, Andrew M; Bhuiyan, Nadia N; Mazher, Mustafa A; Waters, Robert J; Wommack, K Eric; Harper, Willie F; Liles, Mark R.
Appl Environ Microbiol ; 76(8): 2673-7, 2010 Apr.
Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-20154108

RESUMEN

The viral metagenome within an activated sludge microbial assemblage was sampled using culture-dependent and culture-independent methods and compared to the diversity of activated sludge bacterial taxa. A total of 70 unique cultured bacterial isolates, 24 cultured bacteriophages, 829 bacterial metagenomic clones of 16S rRNA genes, and 1,161 viral metagenomic clones were subjected to a phylogenetic analysis.


Asunto(s)
Bacterias/clasificación , Bacterias/genética , Biodiversidad , Metagenoma , Aguas del Alcantarillado/virología , Virus/clasificación , Virus/genética , Bacterias/aislamiento & purificación , Bacteriófagos/clasificación , Bacteriófagos/genética , Bacteriófagos/aislamiento & purificación , Análisis por Conglomerados , ADN Bacteriano/química , ADN Bacteriano/genética , ADN Viral/química , ADN Viral/genética , Datos de Secuencia Molecular , Filogenia , ARN Ribosómico 16S/genética , Análisis de Secuencia de ADN , Cultivo de Virus , Virus/aislamiento & purificación
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