Occurrence and genetic characteristics of Giardia duodenalis in donkeys in Xinjiang, China.

Giardia duodenalis is a common enteric parasite in humans and animals. To examine the occurrence and genetic characteristics of Giardia in donkeys in Xinjiang, China, 758 fecal samples from donkeys were collected, and Giardia was screened via PCR at the SSU rRNA gene. A total of 17.0% (129/758) of samples tested positive for Giardia, with the infection rate in large-scale farm and domestic donkeys being 21.4% (124/580) and 2.8% (5/178), respectively; the infection rates in <1-year-old and ≥1-year-old donkeys were 19.3% (72/374) and 12.7% (41/323), respectively. Three Giardia assemblages were identified, with assemblage B (n = 102) as the prevalent assemblage, followed by assemblage A (n = 23) and assemblage E (n = 4). Of the 129 Giardia-positive isolates, 40, 34 and 59 sequences were obtained at the bg, gdh and tpi genes, respectively. Twenty-one isolates successfully allowed multilocus genotyping (MLG), with four novel assemblage A MLGs, named MLG-AI-1 (n = 1), MLG-AI-2 (n = 1), MLG-AI-3 (n = 1), and MLG-AI-4 (n = 1) and three novel assemblage B MLGs, named MLG-B1 (n = 1), MLG-B2 (n = 14), and MLG-B3 (n = 1). Moreover, two isolates formed two MLG-mixed sequences. The results suggest that donkeys are commonly infected with Giardia in Xinjiang, and there is genetic diversity and host adaptability among the isolates.

Title: Présence et caractéristiques génétiques de Giardia duodenalis chez les ânes du Xinjiang, Chine. Abstract: Giardia duodenalis est un parasite entérique courant chez les humains et les animaux. Pour étudier la présence et les caractéristiques génétiques de Giardia chez les ânes du Xinjiang, en Chine, 758 échantillons fécaux d'ânes ont été collectés et Giardia a été criblé par PCR du gène de l'ARNr SSU. Au total, 17,0 % (129/758) des échantillons ont été testés positifs pour Giardia. Le taux d'infection, respectivement chez les ânes des élevages à grande échelle et domestiques, étaient de 21,4 % (124/580) et 2,8 % (5/178). Les taux chez les ânes de < 1 an et ≥ 1 an étaient respectivement de 19,3 % (72/374) et 12,7 % (41/323). Trois assemblages de Giardia ont été identifiés, l'assemblage B (n = 102) étant l'assemblage prédominant, suivi de l'assemblage A (n = 23) et de l'assemblage E (n = 4). Sur les 129 isolats positifs pour Giardia, 40, 34 et 59 séquences ont été obtenues respectivement au niveau des gènes bg, gdh et tpi. Vingt et un isolats ont permis du génotypage multilocus (MLG), avec quatre nouveaux MLG de l'assemblage A, nommés MLG-AI-1 (n = 1), MLG-AI-2 (n = 1), MLG-AI-3 (n = 1) et MLG-AI-4 (n = 1) et trois nouveaux MLG de l'assemblage B, nommés MLG-B1 (n = 1), MLG-B2 (n = 14) et MLG-B3 (n = 1). De plus, deux isolats formaient deux séquences MLG mélangés. Les résultats suggèrent que les ânes sont couramment infectés par Giardia au Xinjiang, et qu'il existe une diversité génétique et une adaptabilité à l'hôte parmi les isolats.

Molecular characterization of Cryptosporidium spp. and Giardia duodenalis in pet dogs in Xinjiang, China.

Cryptosporidium spp. and Giardia duodenalis are opportunistic zoonotic protozoa transmitted through several routes. In this study, a total of 604 fecal samples were collected from pet dogs in Xinjiang, China to detect the presence of Cryptosporidium spp. and G. duodenalis by PCR amplification of the small subunit (SSU) rRNA gene. The incidence rate of Cryptosporidium spp. or G. duodenalis was 5.3% (32/604). Among the collection sites, a higher number of Cryptosporidium spp. or G. duodenalis positive dogs were detected in Hotan (9.9%, 21/213) and Shihezi (9.8%, 4/41) were higher than those in Aksu (4.5%, 1/22), Urumqi (2.1%, 4/191), and Korla (1.5%, 2/137). Among the sources, dogs in pet shops (7.4%, 19/256) showed a significantly higher incidence rate than those in pet hospitals (3.0%, 4/134) and pet kennels (2.3%, 5/214). When the data were examined by age, dogs < 1 year of age (6.1%, 28/459) were more likely to be infected by Cryptosporidium spp. or G. duodenalis than older (≥ 1 year) dogs (2.8%, 4/145). No significant differences were observed when animals were grouped by sex (5.0%, 14/278 for males; 5.5%, 18/326 for females). Sequence analysis revealed that the Cryptosporidium spp. (n = 10) in dogs were identified as C. canis. The G. duodenalis detected belonged to assemblages A (n = 1), C (n = 14), and D (n = 7). Among the identified 22 G. duodenalis isolates, eight samples were subtyped according to ß-giardin (bg) and the results were consistent with the identified assemblages. To our knowledge, this is the first report of Cryptosporidium spp. and G. duodenalis infections in domesticated canines in Xinjiang, China. The C. canis and G. duodenalis assemblage A identified in pet dogs in the present study were previously associated with infections in humans, indicating the potential for zoonotic transmission.

Molecular detection and genotyping of Enterocytozoon bieneusi in pet dogs in Xinjiang, Northwestern China.

Enterocytozoon bieneusi is an obligate intracellular parasitic fungi that infects a wide range of mammalian hosts. However, the literature is lacking information regarding the presence and diversity of E. bieneusi genotypes in domesticated dogs in Northwestern China. Fecal samples from 604 pet dogs were obtained in 5 cities (Urumqi, Korla, Hotan, Aksu, and Shihezi) in Xinjiang. Screening for E. bieneusi was performed, and isolates were genotyped via nested-PCR amplification of the internal transcribed spacer (ITS) of nuclear ribosomal DNA. The infection rate of E. bieneusi was 6.3% (38/604). The prevalence of E. bieneusi infections in adult animals (>1 year, 10.3%, 15/145) was higher than that in younger (≤1 year) dogs (5.0%, 23/459), which was statistically significant (p = 0.021). No significant difference was observed between the different collection sites or between sexes. Eight distinct genotypes were identified, including 5 known genotypes (PtEb IX, EbpC, D, CD9, and Type IV) and 3 novel genotypes (CD11, CD12, CD13). The most prevalent was genotype PtEb IX, being observed in 50.0% (19/38) of the samples, followed by EbpC (31.6%, 12/38), D (5.3%, 2/38), and the remaining genotypes (CD9, Type IV, CD11, CD12, and CD13) were observed in 1 sample (2.6%, 1/38) each. These findings suggest that genotypes PtEb IX and CD9 are canine host-adapted, and likely pose little risk of zoonotic transmission. Moreover, known zoonotic genotypes EbpC, D, and Type IV represent a public health concern and should undergo further molecular epidemiological investigation.

TITLE: Détection moléculaire et génotypage d'Enterocytozoon bieneusi chez les chiens de compagnie au Xinjiang, nord-ouest de la Chine. ABSTRACT: Enterocytozoon bieneusi est un champignon intracellulaire, parasite obligatoire, qui infecte un large éventail d'hôtes mammifères. Cependant, la littérature manque d'informations concernant la présence et la diversité des génotypes d'E. bieneusi chez les chiens domestiques dans le nord-ouest de la Chine. Des échantillons fécaux de 604 chiens de compagnie ont été obtenus dans 5 villes (Urumqi, Korla, Hotan, Aksu et Shihezi) au Xinjiang. Le dépistage d'E. bieneusi a été effectué et les isolats ont été génotypés par amplification PCR nichée de l'espaceur transcrit interne (ITS) de l'ADN ribosomique nucléaire. Le taux d'infection d'E. bieneusi était de 6,3 % (38/604). La prévalence des infections à E. bieneusi chez l'adulte (> 1 an, 10,3 %, 15/145) était plus élevée que chez les chiens plus jeunes (≤ 1 an) (5,0 %, 23/459), ce qui était statistiquement significatif (p = 0,021). Aucune différence significative n'a été observée entre les différents sites de collecte ou entre les sexes. Huit génotypes distincts ont été identifiés, dont 5 connus (PtEb IX, EbpC, D, CD9, Type IV) et 3 nouveaux (CD11, CD12, CD13). Le plus répandu était le génotype PtEb IX, observé dans 50,0 % (19/38) des échantillons, suivi par EbpC (31,6 %, 12/38), D (5,3 %, 2/38) et les génotypes restants (CD9, Type IV, CD11, CD12 et CD13) ont été observés dans 1 échantillon (2,6 %, 1/38) chacun. Ces résultats suggèrent que les génotypes PtEb IX et CD9 sont adaptés à l'hôte canin et présentent probablement un faible risque de transmission zoonotique. De plus, les génotypes zoonotiques connus EbpC, D et Type IV représentent un problème de santé publique et nécessitent une enquête épidémiologique moléculaire plus approfondie.