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FIS activates glnAp2 in Escherichia coli: role of a DNA bend centered at -55, upstream of the transcription start site.

Huo, Yi-Xin; Nan, Bei-Yan; You, Cong-Hui; Tian, Zhe-Xian; Kolb, Annie; Wang, Yi-Ping.

FEMS Microbiol Lett ; 257(1): 99-105, 2006 Apr.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-16553838

RESUMEN

A binding site for the Escherichia coli nucleoid binding protein FIS (factor for inversion stimulation) was identified upstream of a sigma54-dependent promoter, glnAp2. The binding and bending center of FIS is positioned at -55 with respect to the transcription start site (+1). Binding of FIS at this site activates the transcription of glnAp2 both in vivo and in vitro. Furthermore, we substituted the FIS-mediated DNA bending with other protein (cAMP receptor protein or integration host factor)-mediated DNA bending, without changing the position of the bending center. In vitro transcription assays indicated that all DNA bends centered at -55 activate transcriptional initiation of glnAp2, especially when linear templates were used.

Asunto(s)

ADN Bacteriano/metabolismo , Escherichia coli/metabolismo , Factor Proteico para Inverción de Estimulación/metabolismo , Regulación Bacteriana de la Expresión Génica , Glutamato-Amoníaco Ligasa/metabolismo , Secuencia de Bases , ADN Bacteriano/química , ADN Bacteriano/genética , Elementos de Facilitación Genéticos , Escherichia coli/genética , Proteínas de Escherichia coli/genética , Proteínas de Escherichia coli/metabolismo , Factor Proteico para Inverción de Estimulación/genética , Glutamato-Amoníaco Ligasa/química , Glutamato-Amoníaco Ligasa/genética , Datos de Secuencia Molecular , Conformación de Ácido Nucleico , Regiones Promotoras Genéticas , Transcripción Genética

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