[How do 2'-O-methylations within Human Immunodeficiency Virus type 1 (HIV-1) genome regulate its replication?] / Effets de la 2'-O-méthylation de l'ARN génomique du VIH-1 sur la réplication virale.

The genomic RNA of HIV-1 is modified by epitranscriptomic modifications, including 2'-O-methylations, which are found on 17 internal positions. These methylations are added by the cellular methyltransferase FTSJ3, and have pro-viral effects, since they shield the viral genome from the detection by the innate immune sensor MDA5. In turn, the production of interferons by infected cells is reduced, limiting the expression of interferon-stimulated genes (ISGs) with antiviral activities. Moreover, 2'-O-methylations protect the HIV-1 genome from its degradation by ISG20, an interferon-induced exonuclease. Conversely, these methylations also exhibit antiviral effects, as they impede reverse-transcription in vitro or in quiescent cells, which are known to contain low nucleotide concentrations. Altogether, these observations suggest a balance between the proviral effect of 2'-O-methylations, related to the protection of the viral genome from detection by MDA5 and degradation by ISG20, and the antiviral effect, associated with the negative impact of 2'-O-methylations on the viral replication. These findings pave the way for further optimization of therapeutic RNA, by selective methylation of specific nucleotides.

Title: Effets de la 2'-O-méthylation de l'ARN génomique du VIH-1 sur la réplication virale. Abstract: Les ARN du virus de l'immunodéficience humaine sont décorés par des marques épitranscriptomiques, dont des 2'-O-méthylations internes. Ces marques ajoutées par une enzyme cellulaire, FTSJ3, sont des marqueurs du « soi ¼. Elles ont des effets proviraux en protégeant l'ARN viral de la détection par le senseur de l'immunité innée MDA5, et en limitant sa dégradation par l'exonucléase cellulaire ISG20, induite par l'interféron. Ces méthylations ont également un effet antiviral, dans la mesure où elles perturbent la rétrotranscription du génome ARN du virus, in vitro et dans des cellules quiescentes. Un équilibre subtil existe donc entre les effets proviraux et antiviraux des 2'-O-méthylations, assurant ainsi une réplication optimale du virus. Ces découvertes ouvrent des perspectives d'optimisation des ARN thérapeutiques à effet antiviral, par la méthylation sélective de certains nucléotides.

Detección de VPH y expresión: de p53 en carcinoma de cabeza y cuello / HPV detection and expression: of p53 in head and neck carcinoma

El cáncer de cabeza y cuello ha sido frecuentemente asociado al abuso en el consumo del alcohol y tabaco, aunque existe un bajo porcentaje de casos que no presenta una historia de alcohol y/o tabaco conocida. Esto ha llevado a considerar la exposición a otros factores de riesgo como por ejemplo el virus de papiloma humano. Actualmente los oncólogos evalúan distintos marcadores oncogénicos, entre ellos la proteína p53, lo cual les permite realizar el pronóstico y diagnóstico más preciso. El objetivo de este estudio fue evaluar la infección de virus de papiloma humano en pacientes con carcinoma de células escamosas de cabeza y cuello mediante reacción de cadena polimerasa, así como la detección de p53 por inmunohistoquímica. De 30 muestras evaluadas, 12 (40 por ciento) resultaron positivas para la detección viral, de éstas el 58 por ciento correspondía virus de papiloma humano tipo 11 (de bajo riesgo oncogénico), siendo la cavidad bucal la localización anatómica más afectada por la presencia del genoma viral. El p53 fue encontrado en 50 por ciento, siendo la orofaringe la localización anatómica con mayor positividad para dicho marcador.

The head and neck cancer has been frequently associated with the alcohol and tobacco abuse consume, although there are a low percents of cases that have not an alcohol and tobacco history know. This has made to consider another risks exposure factors how for example, the human papilloma virus. At present the oncologist evaluate different oncogenic markers inside them like the p53, this permit to them realize a better prediction and the prognostic. The objective of this study was evaluating the human papilloma virus infection in the patients with diagnostic of head and neck carcinoma using the polymerase reaction chain, such as the detection of the p53 by the immunohistochemistry procedure. Of the 30 evaluated samples 12 (40 %) of them result positive to the human papilloma viral detection, of these the 58 % correspond to the human papilloma virus type 11 (low oncogenic risk), been the oral cavity the anatomic localization most affected by the viral genome presence. The p53 has been finding in the 50 %, the orofaringe was the anatomic localization who has most positive to the marker.

Vírus da leprose dos citros: sequenciamento completo do genoma, diversidade genética e avaliação de genes potencialmente relacionados com patogenicidade / Citrus leprosis virus: genome sequencing, genetic diversity and evaluation of pathogenicity related genes

A partir das primeiras sequências genômicas do Cil V-C (Citrus leprosis virus ­tipo citoplasmático) através de bibliotecas de cDNA provenientes do produto da replicação viral (dsRNA) (locali, 2002), foi possível concluir o seqüenciamento completo do seu genoma. As informações obtidas possibilitaram caracterizá-lo como um vírus de genoma constituído por ssRNA (mais), bipartido (menos 14 Kb), contendo no RNA 1 duas ORFs, uma delas codificadora de uma poliproteína com três domínios envolvidos com replicase viral e um relacionado com protease. No RNA 2, foram detectadas quatro ORFs, uma delas codificadora da proteína de movimento. Foram identificadas caudas poli A nas extremidades 3 dos dois RNAs, bem como a presença de uma sequência conservada de nucleotídeos (GAUAAAUCU) nas extremidades 5 dos dois RNAs, sugerindo a presença de uma estrutura Cap. As informações até então conhecidas sobre o vírus associado à leprose dos citros e aos ácaros do gênero Brevipalpus os relacionavam à família Rhabdoviridae. Entretanto, através de análises estruturais e organizacionais do genoma do CilV-C ficou evidente que o vírus apresenta alguns (poucos) domínios conservados com membros de vários gêneros e famílias de fitovírus, mas não com rhabdovírus. Através de análises filogenéticas e associando estas informações às características morfológicas do virion, além dos efeitos citopáticos e sintomas induzidos por esses vírus em seus hospedeiros, sugerimos que o CilV-C seja considerado o membro-tipo de um novo gênero de vírus, denominado Cilevirus. Foi possível também determinar com segurança que ele não pertence a família Rhabdoviridae, como proposto anteriormente. Essas informações permitiram uma análise comparativa entre regiões genômicas do CilV-C com as de outros vírus transmitidos por Brevipa/pus (VTBs), entre eles, Orchid fleck virus - OFV, Coffee ringspot virus - CoRSV, e Ligustrum ringspot virus - LigRSV.