Genetic Variants in Folate and Cobalamin Metabolism-Related Genes in Nonsyndromic Cleft Lip and/or Palate

ABSTRACT

The aim of this study was to evaluate the association of the polymorphisms in TCN2 (rs1801198) gene and in MTRR (rs1801394) gene with nonsyndromic cleft lip and/or palate (NSCL/P) in a Brazilian population. Genomic DNA was extracted from buccal cells. The polymorphisms in TCN2 (rs1801198) and MTRR (rs1801394) genes were genotyped by carrying out real-time PCR and Taqman assay. Chi-square test was used to determine the association between genotype and allele frequencies with NSCL/P and NSCL/P subgroups (cleft lip only, cleft lip and palate, and cleft palate only). Eight hundred and sixty seven unrelated individuals (401 cases with NSCL/P and 466 individuals without cleft) were evaluated. Genotype distributions of TCN2 and MTRR polymorphisms were in Hardy-Weinberg equilibrium. The TCN2 polymorphic genotype GG was identified in 16.7% of the NSCL/P group and in 14.1% of the non-cleft group (p>0.05). Similarly, the frequency of MTRR genotype (GG) was similar in NSCL/P group (15.5%) and control group (17.8%) (p>0.05). Multivariate analysis showed an association between MTRR and the subgroup that the mother smoked during pregnancy (p=0.039). Our findings did not demonstrate an association between TCN2 polymorphisms and NSCL/P, however suggests an association between MTRR and NSCL/P etiology.

RESUMO

Resumo O objetivo desse estudo foi avaliar a associação entre os polimorfismos no gene TCN2 (rs1801198) e no gene MTRR (rs1801394) com fissura de lábio e/ou palato não sindrômica (NSFL/P) em uma população brasileira. DNA genômico foi extraído de células bucais. Os polimorfismos nos genes TCN2 (rs1801198) e MTRR (rs1801394) foram genotipados através do PCR em tempo real pelo método Taqman. O teste do qui-quadrado foi utilizado para determinar a associação entre a frequência alélica e genotípica e NSFL/P e nos subtipos (fissura de lábio, fissura de lábio com palato e fissura de palato). Oitocentos e sessenta e sete indivíduos não aparentados (401 casos com NSFL/P e 466 indivíduos sem fissura) foram avaliados. A distribuição dos genótipos dos polimorfismos de TCN2 e MTRR estavam em equilíbrio de Hardy-Weinberg. O genótipo polimórfico GG do gene TCN2 foi identificado em 16,7% do grupo com NSFL/P e em 14,1% do grupo sem fissura (p>0,05). Da mesma forma, a freqüência do genótipo GG do gene MTRR foi bastante semelhante entre o grupo com NSFL/P (15,5%) e o grupo controle (17,8%). A análise multivariada mostrou associação entre o gene MTRR e o subgrupo que apresentou tabagismo materno durante a gestação (p=0,039). Nossos resultados mostraram que não há associação entre os polimorfismos nos genes TCN2 e NSFL/P, entretanto sugerem uma associação entre MTRR e a etiologia de NSFL/P.