Thermodynamic analysis of computed pathways integrated into the metabolic networks of E. coli and Synechocystis reveals contrasting expansion potential.

Asplund-Samuelsson, Johannes; Janasch, Markus; Hudson, Elton P

Asplund-Samuelsson, Johannes; Janasch, Markus; Hudson, Elton P.

Afiliación

Asplund-Samuelsson J; Science for Life Laboratory, School of Biotechnology, KTH Royal Institute of Technology, P-Box 1031, 171 21 Solna, Sweden. Electronic address: johannes.asplund.samuelsson@scilifelab.se.
Janasch M; Science for Life Laboratory, School of Biotechnology, KTH Royal Institute of Technology, P-Box 1031, 171 21 Solna, Sweden. Electronic address: markus.janasch@scilifelab.se.
Hudson EP; Science for Life Laboratory, School of Biotechnology, KTH Royal Institute of Technology, P-Box 1031, 171 21 Solna, Sweden. Electronic address: paul.hudson@scilifelab.se.

Metab Eng ; 45: 223-236, 2018 01.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-29278749

Asunto(s)

Simulación por Computador; Escherichia coli; Modelos Biológicos; Synechocystis; Termodinámica; Ciclo del Ácido Cítrico/fisiología; Escherichia coli/genética; Escherichia coli/metabolismo; Glucólisis/fisiología; Consumo de Oxígeno/fisiología; Synechocystis/genética; Synechocystis/metabolismo

Palabras clave

E. coli; Max-min driving force analysis; Network-embedded thermodynamic analysis; Pathway enumeration; Pathway thermodynamics; Synechocystis

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Contexto en salud: 3_ND Problema de salud: 3_neglected_diseases / 3_zoonosis Asunto principal: Termodinámica / Simulación por Computador / Synechocystis / Escherichia coli / Modelos Biológicos Idioma: En Revista: Metab Eng Asunto de la revista: ENGENHARIA BIOMEDICA / METABOLISMO Año: 2018 Tipo del documento: Article

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