SKESA: strategic k-mer extension for scrupulous assemblies.

Souvorov, Alexandre; Agarwala, Richa; Lipman, David J

Souvorov, Alexandre; Agarwala, Richa; Lipman, David J.

Afiliación

Souvorov A; NCBI/NLM/NIH/DHHS, 8600 Rockville Pike, Bethesda, 20894, MD, USA.
Agarwala R; NCBI/NLM/NIH/DHHS, 8600 Rockville Pike, Bethesda, 20894, MD, USA. agarwala@ncbi.nlm.nih.gov.
Lipman DJ; NCBI/NLM/NIH/DHHS, 8600 Rockville Pike, Bethesda, 20894, MD, USA.

Genome Biol ; 19(1): 153, 2018 10 04.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-30286803

Asunto(s)

Análisis de Secuencia de ADN/métodos; Programas Informáticos; Algoritmos; Emparejamiento Base/genética; Secuencia de Bases; Factores de Tiempo

Palabras clave

Contamination; De-novo assembly; DeBruijn graphs; Illumina reads; Sequence quality

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Programas Informáticos / Análisis de Secuencia de ADN Idioma: En Revista: Genome Biol Asunto de la revista: BIOLOGIA MOLECULAR / GENETICA Año: 2018 Tipo del documento: Article País de afiliación: Estados Unidos

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