Surpassing limits of static RNA modification analysis with dynamic NAIL-MS.

Reichle, Valentin F; Kaiser, Steffen; Heiss, Matthias; Hagelskamp, Felix; Borland, Kayla; Kellner, Stefanie

Reichle, Valentin F; Kaiser, Steffen; Heiss, Matthias; Hagelskamp, Felix; Borland, Kayla; Kellner, Stefanie.

Afiliación

Reichle VF; LMU Munich, Faculty of Chemistry and Pharmacy, Department of Organic Chemistry, Butenandtstr. 5, 81377 Munich, Germany.
Kaiser S; LMU Munich, Faculty of Chemistry and Pharmacy, Department of Organic Chemistry, Butenandtstr. 5, 81377 Munich, Germany.
Heiss M; LMU Munich, Faculty of Chemistry and Pharmacy, Department of Organic Chemistry, Butenandtstr. 5, 81377 Munich, Germany.
Hagelskamp F; LMU Munich, Faculty of Chemistry and Pharmacy, Department of Organic Chemistry, Butenandtstr. 5, 81377 Munich, Germany.
Borland K; LMU Munich, Faculty of Chemistry and Pharmacy, Department of Organic Chemistry, Butenandtstr. 5, 81377 Munich, Germany.
Kellner S; LMU Munich, Faculty of Chemistry and Pharmacy, Department of Organic Chemistry, Butenandtstr. 5, 81377 Munich, Germany. Electronic address: stefanie.kellner@cup.lmu.de.

Methods ; 156: 91-101, 2019 03 01.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-30395967

Asunto(s)

Adenosina/análogos & derivados; Citidina/análogos & derivados; Marcaje Isotópico/métodos; Espectrometría de Masas/métodos; Procesamiento Postranscripcional del ARN; ARN Mensajero/química; ARN de Transferencia/química; Adenosina/química; Adenosina/metabolismo; Isótopos de Carbono; Citidina/química; Citidina/metabolismo; Escherichia coli/genética; Escherichia coli/metabolismo; Células HEK293; Humanos; Hidrólisis; Metilmetanosulfonato/química; Isótopos de Nitrógeno; ARN Mensajero/genética; ARN Mensajero/metabolismo; ARN de Transferencia/genética; ARN de Transferencia/metabolismo; Saccharomyces cerevisiae/genética; Saccharomyces cerevisiae/metabolismo; Transcriptoma

Palabras clave

Demethylation; Epitranscriptome; LC-MS/MS; Nucleic acid isotope labeling coupled mass spectrometry (NAIL-MS); tRNA damage repair; tRNA modification

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Contexto en salud: 3_ND Problema de salud: 3_neglected_diseases / 3_zoonosis Asunto principal: Espectrometría de Masas / ARN Mensajero / ARN de Transferencia / Adenosina / Procesamiento Postranscripcional del ARN / Citidina / Marcaje Isotópico Límite: Humans Idioma: En Revista: Methods Asunto de la revista: BIOQUIMICA Año: 2019 Tipo del documento: Article País de afiliación: Alemania

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