Chromosome-level de novo assembly of Coprinopsis cinerea A43mut B43mut pab1-1 #326 and genetic variant identification of mutants using Nanopore MinION sequencing.

Xie, Yichun; Zhong, Yiyi; Chang, Jinhui; Kwan, Hoi Shan

Xie, Yichun; Zhong, Yiyi; Chang, Jinhui; Kwan, Hoi Shan.

Afiliación

Xie Y; School of Life Sciences, The Chinese University of Hong Kong, Shatin, New Territories, Hong Kong Special Administrative Region.
Zhong Y; School of Life Sciences, The Chinese University of Hong Kong, Shatin, New Territories, Hong Kong Special Administrative Region.
Chang J; School of Life Sciences, The Chinese University of Hong Kong, Shatin, New Territories, Hong Kong Special Administrative Region; The Hong Kong Polytechnic University Shenzhen Research Institute, Shenzhen, China.
Kwan HS; School of Life Sciences, The Chinese University of Hong Kong, Shatin, New Territories, Hong Kong Special Administrative Region. Electronic address: hoishankwan@cuhk.edu.hk.

Fungal Genet Biol ; 146: 103485, 2021 01.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-33253902

Asunto(s)

Agaricales/genética; Cromosomas Fúngicos/genética; Genes del Tipo Sexual de los Hongos/genética; Genoma Fúngico/genética; Variación Genética; Genoma Mitocondrial/genética; Anotación de Secuencia Molecular; Mutación/genética; Secuenciación Completa del Genoma; Proteínas Activadoras de ras GTPasa/genética

Palabras clave

Coprinopsis cinerea; Genetic variant calling; Genome assembly; High-molecular-weight genomic DNA isolation; Nanopore sequencing

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Cromosomas Fúngicos / Genoma Fúngico / Agaricales / Genes del Tipo Sexual de los Hongos Tipo de estudio: Diagnostic_studies / Prognostic_studies Idioma: En Revista: Fungal Genet Biol Asunto de la revista: GENETICA / MICROBIOLOGIA Año: 2021 Tipo del documento: Article

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