SPOTlight: seeded NMF regression to deconvolute spatial transcriptomics spots with single-cell transcriptomes.

Elosua-Bayes, Marc; Nieto, Paula; Mereu, Elisabetta; Gut, Ivo; Heyn, Holger

Elosua-Bayes, Marc; Nieto, Paula; Mereu, Elisabetta; Gut, Ivo; Heyn, Holger.

Afiliación

Elosua-Bayes M; CNAG-CRG, Centre for Genomic Regulation (CRG), Barcelona Institute of Science and Technology (BIST), Barcelona, Spain.
Nieto P; CNAG-CRG, Centre for Genomic Regulation (CRG), Barcelona Institute of Science and Technology (BIST), Barcelona, Spain.
Mereu E; CNAG-CRG, Centre for Genomic Regulation (CRG), Barcelona Institute of Science and Technology (BIST), Barcelona, Spain.
Gut I; CNAG-CRG, Centre for Genomic Regulation (CRG), Barcelona Institute of Science and Technology (BIST), Barcelona, Spain.
Heyn H; Universitat Pompeu Fabra (UPF), Barcelona, Spain.

Nucleic Acids Res ; 49(9): e50, 2021 05 21.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-33544846

Asunto(s)

RNA-Seq/métodos; Análisis de la Célula Individual/métodos; Animales; Encéfalo/metabolismo; Carcinoma Ductal Pancreático/genética; Carcinoma Ductal Pancreático/metabolismo; Humanos; Ratones; Neoplasias Pancreáticas/genética; Neoplasias Pancreáticas/metabolismo; Programas Informáticos

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Análisis de la Célula Individual / RNA-Seq Tipo de estudio: Evaluation_studies / Prognostic_studies Límite: Animals / Humans Idioma: En Revista: Nucleic Acids Res Año: 2021 Tipo del documento: Article País de afiliación: España

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